4ZEAA

Endothiapepsin in complex with fragment b91
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
330
structure length
328
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structures of endothiapepsin-fragment complexes from crystallographic fragment screening using a novel, diverse and affordable 96-compound fragment library.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endothiapepsin
molecule tags Hydrolase
total genus 81
structure length 328
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2015-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4zeaA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4zeaA01
2QK5A 5P64A 1MPPA 4LXMA 1G2KA 4CPSA 5SY2A 5P5IA 3VV7A 5P8QA 3OUCA 2O4SA 4QJ2A 4ZPEA 5KAOA 5P6IA 2JJJA 2ZDZA 5P1UA 1AAQA 4QJ8A 3PEPA 5EZZA 2AZBA 4FAFA 3K5DA 4U7QA 4Y3AA 3WZ7A 1SDVA 3UDMA 5P5CA 2A4FA 5P6YA 3OADA 2NMYA 5P3QA 5P7WA 3IN3A 3R4BA 5P1VA 2Q54A 4COEA 3ST5A 4D88A 2ZJJA 5P7SA 5P2GA 3EL4A 3DV1A 2VNNA 4YCYA 1MTBA 4Y5MA 4J1HA 2WEBA 5P0WA 3B7VA 5OZXA 3PSUA 3ZKNA 5COOA 5DQCA 2ZJMA 4CPWA 5P3AA 2HM1A 5P7HA 1OEWA 2O4LA 3NYGA 2FGVA 1BAIA 1BIMA 2FMBA 5P4JA 4GJ9A 2QZLA 1K6VA 4H3GA 1DMPA 3LINA 5P2CA 1KJ4A 5ER2E 2V0ZC 5F01A 1BV7A 2VJ6A 4LAPA 5P1SA 2V11C 5DR4A 4D83A 3OAGB 3VUCA 2R5QA 5P3SA 5ENKA 3UDNA 5P3ZA 3O9LA 2IRZA 1IIQA 5P05A 1XL5A 4J17A 3LHGA 1QBRA 3SO9A 4Y5GA 2P3BB 5P53A 1FQ7A 2P4JA 5P5GA 3TNEA 5COPA 4R95A 3LNKA 5P5DA 3LIZA 3KN0A 5P11A 4GB2A 5P5XA 4WY6A 3ZMGA 3CMSA 4Y45A 5P2MA 1G35A 3PI5A 3SQFA 3O9LB 3APPA 1HHPA 2FDDA 5P8PA 6APRE 3IA9A 1EPNE 5P29A 5P0YA 5P2SA 5P6MA 1APVE 3N3IA 4HLAA 2ZJNA 5P38A 4J1EA 1K6CA 2IGYA 3D1ZA 5P2HA 2FLEA 2V13A 1LYBA 1TCXA 3NWQA 2V10C 3VFAA 2A1EA 4LXAA 4FRJA 1FQXA 1DAZC 3WZ8A 4EP3A 1RV7A 5P4TA 4M8YA 4EWOA 2O4KA 3TTPA 1RPIA 2CEMA 1IDBA 2WEZA 1T6EX 3S8IA 4E43A 4DVFA 1HIHA 3O9CA 3QPJA 1T6GA 5P39A 4Y54A 2QI3A 5JFPA 1LZQA 4NJUA 4CP7A 3TL9A 3LZYA 4F75A 1T3RA 5P2DA 4GZFA 5P14A 5KOQA 1BVEA 4Y4BA 3D20A 2AOHA 2AVOA 2I4DA 5P2YA 3BRAA 4YD6A 5P4GA 2PSGA 3CKPA 1HOSA 5P7EA 5P0VA 1SGZA 4TVHA 3S45A 3O9HA 5HVPA 4A4QA 5P3XA 5P4SA 2AOGA 5P5EA 3KMXA 2AODA 5P8GA 2OHKA 5P1PA 1YTGA 1D4KA 3ZPUA 1HVKA 1GVXA 1SP5A 4YD7A 4F74A 3NUJA 3SPKA 5P80A 1GNOA 1BXOA 4YE3A 3PB5A 1QBSA 2XFJA 2HPFA 2BPWA 3VV6A 4Y3RA 2P3DA 1YTIA 3UDKA 5B18A 3OTYA 3WZ6A 3EKPA 5P04A 1YT9A 3WB5A 4AUCA 4FCOA 2FNTA 3UQRA 3FNTA 4Y50A 2IDWA 5OZIA 3OY4A 1HVSA 4Y57A 3M9FA 3PVKA 3WB4A 3DM6A 5KR0A 1N49A 3EC0A 5P88A 2AOJA 3SFCA 1BWAA 5P4DA 4B1CA 3VYFA 5P7MA 3VSXA 3PWWA 1AIDA 5P1LA 4HVPA 5HE5A 1MTRA 4MC1A 4FRSA 2Z4OA 5P7JA 3SACA 4YD4A 4Y6MA 2Z54A 3SABA 4FAEA 1HVIA 2QHCA 5P0FA 5OZTA 5P3IA 3TPPA 2G27A 4I10A 2ANLA 3Q6YA 2B60A 4DJXA 1ZPAA 5IVTA 3LIYA 4I0DA 1D4JA 1EC3A 5P5ZA 5P4AA 3TPJA 2UXZA 2OAHA 5HDXA 5P34A 2WL0A 2R8NA 3INEA 5SY3A 2NPHA 1FEJC 3NU3A 5AHCA 1DP5A 5AHAA 5P77A 2PSUA 1LEEA 3VEUA 5P2OA 1W6HA 5KQZA 1AJVA 4Y3NA 4I0JA 4OC6A 4FSLA 1NPVA 3K1WA 4Y3HA 1AM5A 1HVJA 5P07A 3OGPA 1BWBA 5P0MA 3CIBA 4ZSQA 4Y3JA 3OUAA 4JPEA 3SA4A 5P0AA 1B6KA 4Y3FA 2QZWA 3LPJA 3PSGA 2WJOA 5OZLA 3I8WA 3VV8A 4Z4XA 5OZ6A 5P8RA 5P2FA 4K4RA 2FNSA 3FSMA 4ZPGA 3BXRA 5P1RA 1HTRB 3UDQA 4EXGA 5P4HA 3MSJA 4MC2A 4Y3WA 5P1TA 5P2IA 1KJ7A 2PWCA 1UH7A 4R92A 5DR1A 2Q11A 4CKUA 5P4MA 1HTEA 5OZRA 4RVXA 5OZJA 3TKWA 5OYTA 3KDDA 3JW2A 1ZAPA 4DQGA 3DJKA 5P2UA 5P2BA 3U71A 5HU1A 4A6BA 7UPJA 5P2RA 5P4OA 1LYWA 1SDUA 1OEXA 5P5PA 5IVRA 1W50A 3INHA 4Y3DA 3EM4A 4RGHA 1HTGA 4YBFA 1B6JA 3UQUA 3URIA 4YOAA 1LYWB 3ZPSA 5DQ4A 3GI6A 5P3YA 2O4NA 5P74A 4RROA 1C6ZA 3MXEA 5P71A 2R38A 3QP0A 4AMTA 5P6OA 4DPFA 2F3EA 3VF3A 3QRMA 4Y3YA 3EKQA 3Q70A 5P3LA 3UQWA 2G1SA 4Y3QA 2UPJA 2NR6A 5P40A 1F34A 1YTJA 5P0KA 4APEA 3NDWA 5KR8A 5OZ2A 4UPJA 4J0PA 4EQJA 8HVPA 3L59A 5OZ1A 5P4VA 3HVPA 4I11A 5HE4A 5P7ZA 2P3CA 5P0RA 6UPJA 4K4QA 1EAGA 5P6HA 3OQKA 5P0GA 5P87A 3D1XA 2G1NA 3ZKGA 5P6ZA 5I3XA 3PMUA 5JG1A 1HEFE 5P86A 2G69A 2ASIA 1MSMA 3KDCA 7HVPA 5P10A 3EXOA 3PLDA 5T4SA 4PEPA 1PPME 5P5VA 2NNKA 4L6BA 5ISJA 5P0TA 2Q3KA 4DH6A 2IENA 2HC0A 2BB9A 5P6FA 4RCDA 4LL3A 3PBDA 5CLMA 4YHQA 3LZUA 5P8VA 5OZBA 3ECGA 3AIDA 1XDHA 5P0SA 1EC1A 4Y5KA 1M4HA 4K8SA 4LP9A 1TSUA 4GJBA 4FL8A 5P6QA 3C9XA 5HCOA 3BGBA 3OOZA 2I4QA 5P7BA 4Y4WA 5OYZA 1YM2A 1PSNA 3FKTA 4BFDA 4Y39A 3SLZA 5P2JA 2ZJHA 2RMPA 3QRSA 4PZWA 4PYVA 1FQ8A 5P75A 5P8JA 4ZIPA 4B78A 3GGVA 2R43A 5P0HA 5F00A 4Y53A 4Y3XA 2AOCA 5ENMA 2HIZA 2AVMA 5SZ9A 3KF0A 5UPJA 5P6CA 5P5UA 3TPLA 5OZ7A 3EL0A 3IVHA 4JOOA 4IVSA 1PROA 3EM3A 2R3WA 2BKSA 5P6BA 4GJ5A 1J71A 2FDEA 3DOXA 3PGIA 4L1AB 4Q1NA 5DR3A 5P3HA 5P24A 4FRKA 4Y38A 1PPKE 5OYQA 1W5WA 1DPJA 1HPXA 2ER0E 5P7IA 4A6CA 5OZNA 5P20A 3NXNA 2G1OA 3IAWA 3MWSA 4Y5CA 5P6RA 3BVAA 2I4VA 1IVQA 3Q4BA 3NU9A 2QNNA 3VF7A 4B0QA 5P8TA 3L5BA 1IZDA 2Q15A 3OU3A 3EBZA 3OAGA 5P35A 3UPJA 4APRE 5P4KA 3RSVA 4ER4E 5P6WA 1BBSA 3O9DA 2FIVA 4Y4AA 4S1GA 4NJTA 2SAMA 2VA6A 1ODXA 4Q1WA 4KE0A 1VIKA 3QBHA 3KM4A 4ER2E 3K4VA 5HDZA 1JLDA 2QAKA 5OZVA 2P3BA 1KJHA 1HXWA 4HDPA 5P4QA 3ZKQA 3I25A 4JECA 2P8HA 1FG6C 3TLHA 5P51A 5OYVA 5P1MA 4Y5NA 1B6PA 4BELA 1EPQE 3HVGA 3OXXA 4RVIA 2IL2A 5P5LA 3T11A 3Q5HA 2O40A 5P2VA 4GJ7A 1WBKA 5P7GA 3IGBA 5P3WA 5P5OA 3RSXA 3BUFA 1TQFA 2Q64A 3S54A 5DPZA 3S56A 5OZGA 5P0PA 2BPYA 2WEDA 4H3IA 3QN8A 5P6GA 3O9IA 3OGQA 2VIZA 3L5CA 3VSWA 5OZAA 3SM1A 1FLHA 1A94A 1UPJA 3CIDA 2AOEA 3QI1A 1RQ9A 3KT2A 1AZ5A 2ZE1A 4D8CA 4IVTA 5P6UA 1KZKA 2IS0A 5P25A 1T7JA 4RYGA 5P7CA 2VA5A 1A30A 1QRPE 4ZSMA 4LXKA 3EM6A 2IKUA 1EBWA 3K5GA 3UDHA 4ZSPA 5OZKA 2FDPA 4MC9A 4RYCA 4FLGA 2OHQA 4FS4A 5P8AA 3F9QA 1HVRA 4QLHA 3O9FA 4J54A 4OBFA 5P4IA 5P6XA 2IGXA 1Q9PA 1MT8A 4YDGA 5P7AA 3LPKA 3LIVA 5P5FA 2WKZA 2QD6A 4DQCA 1FB7A 4DQHA 1BV9A 4RCEA 5P23A 1FQ5A 4XXSA 5P2EA 2PH8A 2R3TA 5P5AA 3KFPA 1B6LA 4CPQA 4CMSA 1VIJA 2F8GA 1C70A 4Y43A 5P2WA 1OHRA 4DJWA 2ZHVA 5P4LA 1ZJ7A 4NJSA 5COKA 3SAAA 1FQ6A 2JYSA 3MXDA 5P8NA 1BVGA 4GMIA 4Z2ZA 3OU4B 1C6YA 2P3AA 5HTZA 5P1BA 4DI2A 1UH9A 5C9BA 3CICA 4QJAA 4RRSA 3IN4A 4YBIA 5P0IA 3HZCA 4RZ1A 2QCIA 1APUE 3ZKXA 5P03A 4Y3EA 2QMDA 3B80A 4K9HA 3VLAA 3O9AA 1MSNA 1SMRA 3D1YA 1LYAB 4NJVA 5OYUA 4NKKA 5P59A 4B77A 5P4UA 5AGZA 1ER8E 4DQFA 1HVCA 3CKRA 3OQFA 2WHHA 5OYRA 3CKTA 5P82A 1XS7D 2WEAA 5PEPA 3PBZA 5OZ0A 3VLBA 4J0VA 4Y3PA 4N00A 2I0DA 1G0VA 3QBFA 5P46A 5P3EA 1K2BA 4H3FA 5EZXA 5P3DA 4DV9A 3FIVA 3O99A 5P1CA 1HPOA 4B72A 3OK9A 5P84A 2OHRA 5P4FA 1HVHA 1RL8A 2G1RA 1EPOE 4CPRA 3UQXA 2PQZA 2PK5A 5OZ5A 5P67A 5C9DA 2QI1A 5P8HA 2G22A 3KMYA 3PMYA 5IVSA 3WSJA 2R9BA 2ZJKA 1KJFA 3ZOVA 4AA9A 5P4BA 2AVQA 2BKTA 5P19A 5P18A 5P08A 1MRXA 1YG9A 1EBKC 1YX9A 3NDUA 5OZ3A 5BWYA 4J1IA 4CPXA 5P8DA 5P8FA 5P0JA 5P63A 4Y5AA 3PCZA 5P8MA 3JVYA 4PHVA 5P13A 4QJ9A 4Z50A 1GVWA 1HSGA 3QRVA 5P37A 2NXMA 2PYNA 4KE1A 5P00A 5DR8A 5P7XA 5P50A 3DK1A 5P09A 3A2OA 2AQUA 1W5VA 4EJ8A 3T3CA 5P8OA 5AH8A 3S7MA 5P6SA 1K6PA 3ZLQA 2NXLA 2ZJLA 2B8VA 3EKXA 3QS1A 3RVIA 3VF5A 2QZXA 2QMFA 5OZQA 4TRYA 3OQAA 1APTE 4Y37A 2CEJA 5P0UA 4EPJA 5P6PA 5P28A 2G24A 4FIVA 5P32A 2VJ7A 2G20A 5P4EA 2AZ8A 4FGXA 4YDFA 4OBHA 4Y4EA 4ZEAA 5OZUA 3VG1A 5P3KA 5APRE 5DQ5A 3EL9A 4U7VA 5HU0A 2B7ZA 2HB3A 5P60A 2QI6A 2HB4A 1EC2A 1SGUA 1U8GA 2XFKA 5OZPA 4ACXA 1T7IA 4YA8A 3SA3A 5P16A 1NPAA 2F80A 5P1DA 5P3TA 4Y4JA 3G6ZA 3GI0A 4FM7A 4XKXA 5HCTA 1K1TA 2IQGA 3ER5E 3PLLA 1ODYA 1E80E 2VIEA 4LBTA 3TH9A 4EYRA 3OQDA 5P06A 1HTFA 4HA5A 4J1KA 5I3VA 2IKOA 4I0IA 3HDKA 4Y48A 5P0OA 5BS4A 3S7LA 4RVJA 5OZSA 5P36A 4FM8A 4M8XA 5AH7A 5P6NA 2AIDA 3ZKIA 4R91A 4Y5BA 2PYMA 3NU6A 1GVUA 1SIPA 3O9EA 5P8SA 1AJXA 1META 2WF3A 2ZHUA 3I7EA 1MEUA 3RU1A 4NPUA 3OHHA 5P1HA 5P1QA 5P27A 3SA9A 5P4ZA 5HDVA 2VIJA 1BDLA 2APRA 5I3YA 1E82E 3N4LA 5C9FA 3LIXA 2NMZA 4Y41A 5P47A 1IZEA 4J1FA 5OYXA 2I0AA 5OZWA 5E5JA 2VIYA 5P1OA 4DJYA 1Z8CA 2ER6E 5P26A 4FSEA 5P1XA 1AVFA 3PCWA 1A8KA 5I70A 2QU2A 3IXJA 3T7PA 5KR1A 1TCWA 4EHCA 3K5FA 5P1AA 2BPVA 4HDBA 4I0GA 2F3KA 3VYDA 3KFRA 5P4NA 4Q1YA 5P02A 5P1ZA 3VCMA 2I4WA 3CYXA 4QGIA 1LS5A 3KFNA 5P3OA 5P4XA 2JE4A 5P54A 1QBUA 1K2CA 3I2LA 3RTMA 5P68A 2HB2A 1UH8A 2UY0A 4Q5MA 4YD5A 5OZYA 1HRNA 4GJDA 1FIVA 3S43A 5FIVA 4EP2A 4DJPA 1BXQA 5P3JA 5P89A 3T7XA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2QK5 A;  5P64 A;  1MPP A;  4LXM A;  1G2K A;  4CPS A;  5SY2 A;  5P5I A;  3VV7 A;  5P8Q A;  3OUC A;  2O4S A;  4QJ2 A;  4ZPE A;  5KAO A;  5P6I A;  2JJJ A;  2ZDZ A;  5P1U A;  1AAQ A;  4QJ8 A;  3PEP A;  5EZZ A;  2AZB A;  4FAF A;  3K5D A;  4U7Q A;  4Y3A A;  3WZ7 A;  1SDV A;  3UDM A;  5P5C A;  2A4F A;  5P6Y A;  3OAD A;  2NMY A;  5P3Q A;  5P7W A;  3IN3 A;  3R4B A;  5P1V A;  2Q54 A;  4COE A;  3ST5 A;  4D88 A;  2ZJJ A;  5P7S A;  5P2G A;  3EL4 A;  3DV1 A;  2VNN A;  4YCY A;  1MTB A;  4Y5M A;  4J1H A;  2WEB A;  5P0W A;  3B7V A;  5OZX A;  3PSU A;  3ZKN A;  5COO A;  5DQC A;  2ZJM A;  4CPW A;  5P3A A;  2HM1 A;  5P7H A;  1OEW A;  2O4L A;  3NYG A;  2FGV A;  1BAI A;  1BIM A;  2FMB A;  5P4J A;  4GJ9 A;  2QZL A;  1K6V A;  4H3G A;  1DMP A;  3LIN A;  5P2C A;  1KJ4 A;  5ER2 E;  2V0Z C;  5F01 A;  1BV7 A;  2VJ6 A;  4LAP A;  5P1S A;  2V11 C;  5DR4 A;  4D83 A;  3OAG B;  3VUC A;  2R5Q A;  5P3S A;  5ENK A;  3UDN A;  5P3Z A;  3O9L A;  2IRZ A;  1IIQ A;  5P05 A;  1XL5 A;  4J17 A;  3LHG A;  1QBR A;  3SO9 A;  4Y5G A;  2P3B B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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