4AA9A

Camel chymosin at 1.6a resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
YLDSQYFGKIYIGTPPQEFTVVFDTGSSDLWVPSIYCKSNVCKNHHRFDPRKSSTFRNLGKPLSIHYGTGSMEGFLGYDTVTVSNIVDPNQTVGLSTEQPGEVFTYSEFDGILGLAYPSLASEYSVPVFDNMMDRHLVARDLFSVYMDRNGQGSMLTLGAIDPSYYTGSLHWVPVTLQQYWQFTVDSVTINGVAVACVGGCQAILDTGTSVLFGPSSDILKIQMAIGATENRYGEFDVNCGNLRSMPTVVFEINGRDYPLSPSAYTSKDQGFCTSGFQGDNNSELWILGDVFIREYYSVFDRANNRVGLAKAI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Camel and Bovine Chymosin: The Relationship between Their Structures and Cheese-Making Properties.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Camelus dromedarius
molecule keywords CHYMOSIN
total genus 84
structure length 313
sequence length 313
ec nomenclature ec 3.4.23.4: Chymosin.
pdb deposition date 2011-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4aa9A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4aa9A01
5P5IA 3S2OA 3FNUA 3WZ8A 3QRVA 4I8WA 2HC0A 2AOIA 4A6BA 1ZSFA 5OZMA 3R0YA 4I12A 2QMDA 4I0DA 5P6ZA 2I4VA 4U8WA 2QK5A 2V0ZC 4L1AA 2I4WA 3L5DA 3EM4A 5P1KA 4RLDA 5EZZA 4FRKA 3UQPA 5P12A 4DJVA 1PROA 4GJ9A 3BGCA 3K5CA 2WF0A 3T7PA 3PLDA 4GZFA 2Z54A 1YTGA 3L5FA 1HPOA 4RCEA 2B7FA 2V13A 3BVAA 1EPRE 4D88A 5P63A 4FM6A 4FSLA 3MXEA 1K6PA 3OHFA 4Y3QA 5P3RA 5P1WA 5P3KA 5P0PA 3UDNA 3OTSA 1GVWA 4Y3AA 5P7MA 2Q55A 2R38A 1GVUA 4Q1WA 3QI1A 4YA8A 5OZQA 5OZBA 2QNQA 3ZKXA 4QJAA 3L58A 3UDHA 4DJYA 3O9GA 3TPPA 3HW1A 4Y43A 5P8FA 5P2WA 4EP3A 1SDTA 3OGPA 3IVIA 1FG8C 4GB2A 3ER3E 3UTLA 4NJUA 5COKA 3KFRA 1EPME 1HSIA 3NDXA 1FF0C 2IKUA 3CICA 3UDYA 5P8HA 2NTRA 5HE4A 2IL2A 4F75A 3PGIA 5P6CA 3TTPA 5P7QA 1CZIE 5P5DA 3VYFA 4TRZA 1FMBA 1HVHA 1DW6C 3OADA 3FKTA 1FQ6A 1SP5A 3VCMA 2HPFA 4Y3GA 5KR0A 1SGUA 3OOZA 2O4SA 2Q64A 3LZUA 4HEGA 5ENMA 5SY2A 2QI6A 4Y3MA 5P6EA 5P7KA 3TKGA 1YT9A 5P48A 3EXOA 5P3EA 5PEPA 4DPFA 5P3SA 4Z50A 5P5QA 3UQRA 5P5ZA 3IN4A 5P4XA 1T7IA 4J0TA 5P6DA 2V10C 3A2OA 5AHAA 5P78A 3MSJA 2V11C 4BFDA 5IE1A 3EC0A 1K6CA 3L59A 3KDCA 3QN8A 5P2EA 3UQWA 2BPVA 3LZVA 3UHLA 5T4SA 1PSNA 3L5EA 5P5GA 4R8YA 1ZLFA 5P4AA 4DPIA 5OZWA 4B1CA 2FS4A 4FS4A 3ZKNA 1T3RA 4X7IA 5OYXA 5SY3A 5OZ5A 5P4RA 3RU1A 4TRYA 5P35A 3CIDA 3HBOA 4RYGA 5P2IA 1BDLA 4ER1E 3QVIA 1AM5A 4ZPEA 5P0SA 3GGAA 2JYSA 4Y39A 5BWYA 4COEA 5J25A 1ODWA 3SA7A 5IVQA 3SLZA 5KR2A 5AH6A 3EKTA 5P7PA 4Y44A 4Y3HA 1C70A 4APRE 2AOGA 1G6LA 2I4XA 1XN3A 3TOGA 5HD0A 5P2OA 4QJ8A 5P6AA 4YD6A 2G94A 7HVPA 5CLMA 2AODA 5P1PA 5P37A 1G0VA 3KMXA 5OZHA 4CPSA 1UH7A 5AH7A 1MT9A 3DCRA 4PZXA 1SGZA 4YCKA 4H3IA 3TL9A 1BXQA 4Y9WA 5OZOA 5F00A 5P7CA 5F01A 5P4UA 2PK5A 2WF4A 4YD7A 1HVKA 5P1IA 1KJ4A 5P4JA 2UXZA 4DQHA 3IA9A 1WBKA 5P0OA 2IGXA 2AOFA 3T11A 4B0QA 4R93A 1BDQA 2OHLA 1SMRA 5P0NA 5P5UA 2ZJJA 5P1OA 3NUOA 2OHUA 4MC9A 3RTMA 3OU4A 3TOFA 2Z4OA 5DQ4A 2G21A 5P2AA 3PI5A 2ZHRA 4NKKA 3HVGA 1HPXA 1EEDP 2QD7A 2QP8A 4Y56A 2QCIA 3SA3A 5P85A 3KFNA 5COPA 2BKTA 4ER2E 4Z22A 2NMYA 5DQCA 1G35A 3SA9A 3K4VC 1BXOA 5P2YA 1EPLE 5P1TA 4Y38A 5P4KA 3DM6A 3H0BA 3QAAA 4Y4ZA 1IBQA 4JPCA 2HPEA 5P1LA 4HVPA 2G1RA 5P3VA 5P13A 5P6BA 4DJOA 5P54A 2QZXA 2ZJMA 2RKFA 3BUHA 3EKPA 3LITA 1EC0A 3FNSA 4GJCA 1E5OE 1HXWA 5P3BA 5P0ZA 4JP9A 4Y57A 5P7UA 4DH6A 5P3MA 3ER5E 4GJAA 4DJRA 2B7ZA 4ZSMA 3CYWA 2AVMA 4HLAA 5AHBA 2NMZA 3OQKA 2P3AA 2AOCA 2WEZA 5P52A 3VF5A 2PH8A 3ZKGA 5P27A 2G27A 4DJXA 4UPJA 4OBDA 1WBMA 2PK6A 2Q63A 4YD3A 4F76A 3UFNA 2BPWA 3IXKA 1HVRA 4Y41A 1BWBA 3T3CA 3K5FA 3NSHA 5P08A 4CKUA 1HVCA 5P1UA 1RPIA 2G1YA 3KDDA 4I0HA 5OYVA 2EWYA 2G20A 5OZ4A 5P4BA 4CPTA 5DGUA 3L38A 1GNMA 1G2KA 3G6ZA 3VF7A 4ACUA 1HOSA 3LIYA 5P3JA 4DJUA 4DV9A 1FB7A 1IVPA 1SDVA 1ODXA 1XL5A 2PC0A 5P1MA 1NPWA 1NPAA 5DR3A 2FLEA 4QJ9A 3O9BA 5P5NA 2HM1A 2ZJLA 5OZFA 4Y4TA 4AA9A 5P75A 3EKVA 2BKSA 3WZ6A 4Y3DA 4Y45A 1TZSA 2AVVA 5P0WA 4OD9A 3UCBA 2WL0A 3O9HA 4OBFA 3L5BA 5P2UA 4Y3XA 5P7VA 4YBIA 3DK1A 4Y51A 1GVXA 1KJ7A 3APPA 3U71A 1META 4B1EA 3VLAA 4L1AB 2WF2A 2RMPA 1FQ4A 2UY0A 2CEMA 2QD8A 2R43A 1K2CA 1RNEA 3S7MA 5KOQA 4EJKA 5DGWA 3LIQA 4Y5PA 5P7HA 3EL9A 1ER8E 2XYFA 2B60A 2IEOA 3BHEA 3NUJA 2QMGA 2B42A 5P0EA 4Y5CA 5IVSA 5P3AA 3WZ7A 4L7GA 1LV1A 4L7HA 1LYAA 5OZXA 1EC3A 5P7NA 1LZQA 4Y48A 1EPQE 3VYEA 2R5PA 4B77A 1APTE 5KQZA 3IVHA 5P3TA 1QBUA 1PPLE 5P8LA 5P6LA 2AZCA 4APEA 4B05A 4DQEA 1YTIA 3KF0A 2BBBA 3BUFA 4J1IA 1CPIA 1KJFA 2ZHTA 5P6XA 1XE5A 5DR4A 1IZDA 3D1YA 5P59A 3TPJA 2AOEA 2G24A 2VA7A 3OXVA 5AH8A 3EL1A 3ST5A 3Q6YA 3U6AA 2G1NA 4GJ7A 3OADB 4PYVA 1ZJ7A 5P8DA 3NU3A 1W5XA 2G1OA 2VJ7A 1FIVA 1MSNA 2JXRA 5P5RA 4B70A 3JVYA 5P1SA 1VIJA 3HZCA 5KR8A 4TVHA 5P2FA 4QJ2A 1BILA 4B00A 5HCTA 1MESA 5P2VA 3LZSA 4Q5MA 2RENA 2WJOA 2PWRA 3FNTA 4I0FA 5OZ8A 5P4EA 1GKTA 5IVTA 4CPXA 1W51A 5P02A 2R3WA 1VIKA 2VNMA 5P0JA 5P0QA 4H3JA 1BV9A 1W50A 5P43A 1FMUA 3PRSA 2BB9A 5P57A 3QVCA 3C9XA 5HCOA 5I3WA 5P8EA 4Y47A 4RRNA 2FDDA 4PEPA 5P0XA 4DFGA 3D3TA 4Y5KA 5P28A 2FIVA 3I25A 4FCOA 4Q1YA 5P42A 2A4FA 2F3FA 5P1YA 2ZE1A 4H3FA 1SIVA 1TQFA 2OHPA 5P0UA 1RQ9A 1MT7A 3QPJA 4Y4EA 2QU2A 4GJBA 5P44A 4YDGA 4KE0A 5P7GA 4AZYA 3PJ6A 3F9QA 4Y4WA 4ZE6A 4EP2A 2ANLA 5P4TA 1LYWA 4Z2ZA 4BELA 4ZPFA 2VA6A 3GW5A 3OQDA 5P47A 5P38A 5DQ1A 4K4QA 5ER2E 4CPWA 5P4ZA 2QI0A 4FSEA 5DPZA 5P5CA 4Q1XA 3HAWA 3URIA 5P2TA 4K8SA 3UF3A 2O4KA 1FG6C 3Q5HA 4Y5BA 4Y5LA 5P0RA 3NLSA 4Y35A 4K9HA 1FGCC 3VV8A 5OZ2A 5P0HA 5P2QA 1LS5A 5OZRA 1DPJA 1TCXA 3SABA 4EQ0A 3VYDA 1OEWA 2H6SA 5P2GA 2O4NA 5P8JA 5P05A 3I7EA 5I70A 2ER9E 5P5YA 3O9AA 2MIPA 4Y3ZA 2J9JA 3OU4B 4RVIA 1A8KA 4ZSPA 2OAHA 4D85A 3FSMA 2OHMA 1D4SA 3RVIA 2CENA 3FV3A 1ZPKA 3ECGA 2QI3A 2PMAA 4JECA 3NXEA 3LZYA 3O99A 3TPLA 1Z1HA 5P5PA 3T7QA 1XN2A 3PBZA 1IZEA 4MC2A 5CONA 2AZ8A 3ZKQA 4B72A 5P2JA 3S43A 5OZCA 5P3DA 5P72A 5P81A 2O4LA 4Y36A 2WECA 1U8GA 3QROA 3KFPA 2IENA 2FDPA 5P36A 5P3WA 4DJQA 5P6GA 5P1AA 4Y4UA 3IXOA 1B6MA 5HE7A 2I0AA 3B80A 4GJ6A 1APVE 3Q3TA 5P0YA 5P70A 1KJHA 3HD8A 4RVXA 5P0IA 2WEDA 5P3CA 5P04A 3SACA 4FM8A 3D1XA 4RZ1A 1MPPA 3UFLA 1LF4A 5P29A 4LAPA 3PI0A 1FQ5A 3PSYA 1K2BA 5OZDA 4EHCA 4Y3LA 1GVTA 5P7JA 3ZKSA 5P1DA 3NWQA 1B6LA 4OBHA 3OTYA 1HTFA 4HE9A 2QAKA 4CMSA 4YD5A 5P3PA 5P6QA 1ODYA 5OZSA 5P8SA 1N49A 4GYEA 5BRYA 3PBDA 3PSGA 4MC1A 4NPUA 4YOAA 4EJDA 1MRXA 3AIDA 1QDMA 2VA5A 3Q70A 1DMPA 4YDFA 4AUCA 3SM2A 2HB4A 3LHGA 7UPJA 1FLHA 5P32A 3EKWA 4MC6A 5P4YA 1W5VA 3S8IA 4Y4JA 2CEJA 3APRE 2ZYEA 5E5KA 1OEXA 3T7XA 1IZIA 4EJLA 2ER0E 2VIZA 4FL8A 3ZPTA 5P1VA 1YM4A 4Y3WA 3OXXA 3UDRA 5BS4A 2FMBA 2VIYA 3OWNA 1M0BA 4OD9B 2G1SA 3BRAA 5P8KA 3GI5A 1B5FA 4DI2A 1MT8A 2APRA 5OYWA 1RL8A 1C6YA 2O40A 2Q11A 3NWXA 5OZZA 3NDTA 4F74A 4FM7A 2IRZA 3BXRA 5P2BA 5HDUA 1W5WA 5P4NA 2JJJA 3TNEA 5P6MA 1AJXA 3B7VA 1MERA 4Y4XA 5P0CA 2BPZA 2WF1A 3RTNA 4DQBA 5P4SA 1MTRA 5P0GA 2FXDA 4IVTA 4CPQA 3L3AA 3SFCA 5P3NA 3LIVA 1D4HA 2G69A 4U7QA 1HEFE 3PWRA 2QMPA 1FMXA 3ZLQA 1LYAB 1MTBA 5P0VA 3BXSA 4I10A 3OUAA 5I3VA 5P6OA 3DCKA 5P31A 5P0BA 5APRE 3NU9A 3S54A 3R1GB 3PM4A 4FIVA 4WY1A 3VV7A 1XL2A 5OZEA 1BV7A 1HXBA 5OZIA 1MIQA 4Y4AA 1MRWA 5OZ6A 3LIZA 2R9BA 3ZMGA 2J9KA 3UDPA 1HPVA 3QBFA 5P88A 5C9DA 2I1AA 2OF0A 4DJPA 2O4PA 4J5JA 4Y37A 1E81E 4ACXA 3BUGA 4J17A 1ZSRA 4LXKA 5P1ZA 3KYRA 5P4IA 4GJDA 3R2FA 2R8NA 2V12C 2VNNA 3UDJA 4J1KA 3GGVA 4Y5AA 2VKMA 5OYQA 5P62A 4OBKA 4DVFA 2ZJIA 2PSVA 3TKWA 5OZ3A 5P8CA 1W6HA 5OZJA 5P4PA 3INFA 1ME6A 1D4LA 5P0LA 5P6FA 1B6KA 2ZJKA 5P8TA 4EPJA 4R91A 4RCDA 1AVFA 3S56A 1HIHA 2AIDA 2Q3KA 1D4JA 3KN0A 1PSAA 4DQGA 5P1NA 1EC1A 3INEA 4JPEA 1Z8CA 2WKZA 5P6WA 3IAWA 5OZNA 5P45A 5P4HA 2QMFA 3HLOA 3QP0A 4EJ8A 4I0ZA 5P4DA 5EZXA 3NYGA 4EXHA 5P58A 3KA2A 4QJ7A 4M8YA 3DV5A 3VFAA 2NXDA 5P6TA 1HVJA 1AJVA 5P5EA 4RRSA 2QI1A 5P2XA 5P77A 1HVSA 3VF3A 4GJ5A 3LPKA 5P8AA 3EKXA 1K1UA 1GVVA 3SKGA 2ER7E 4OBZB 4PZWA 5KQYA 5OZ9A 5P8MA 1LYBA 4K4PA 5P69A 3T6IA 5P4QA 1F7AA 1LYWB 3PMYA 5DR8A 3TOHA 5P3GA 4LHHA 3CMSA 5OZTA 3SA5A 3KMYA 5P5KA 1Q9PA 4YBFA 5P15A 1C6ZA 1LEEA 1BVGA 3EL4A 4OBJA 3SA6A 5P1BA 4FE6A 5P71A 1WKRA 2V00A 5OYRA 2SAMA 2B8LA 2R5QA 2NXLA 1Z1RA 5P4MA 2NXMA 2VS2A 5P3OA 5P2HA 3FX5A 5P41A 4D89A 5P7RA 3FIVA 3VV6A 4ZEAA 3GI6A 1KJGA 1IDAA 4RCFA 3QRSA 1FQXA 2OHRA 3TLHA 2VIEA 5OZUA 5OZLA 1OD1A 5P2KA 1GNOA 1NH0A 4OBGA 5P6SA 1EPNE 4I8ZA 3HAUA 5P5TA 3CKTA 4E43A 5OYSA 2NNKA 3N4LA 2JJIA 5P61A 5P86A 1EPPE 3NDUA 2J9JB 3NXNA 3VFBA 3O9CA 4Y54A 5P79A 2F80A 2QZLA 2ZGAA 1APUE 3G72A 5P5JA 3WB4A 5P5WA 5OZ0A 1HSGA 3NU4A 4YCYA 3QRMA 5OYYA 3PLLA 5P2MA 5P24A 5HDVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P5I A;  3S2O A;  3FNU A;  3WZ8 A;  3QRV A;  4I8W A;  2HC0 A;  2AOI A;  4A6B A;  1ZSF A;  5OZM A;  3R0Y A;  4I12 A;  2QMD A;  4I0D A;  5P6Z A;  2I4V A;  4U8W A;  2QK5 A;  2V0Z C;  4L1A A;  2I4W A;  3L5D A;  3EM4 A;  5P1K A;  4RLD A;  5EZZ A;  4FRK A;  3UQP A;  5P12 A;  4DJV A;  1PRO A;  4GJ9 A;  3BGC A;  3K5C A;  2WF0 A;  3T7P A;  3PLD A;  4GZF A;  2Z54 A;  1YTG A;  3L5F A;  1HPO A;  4RCE A;  2B7F A;  2V13 A;  3BVA A;  1EPR E;  4D88 A;  5P63 A;  4FM6 A;  4FSL A;  3MXE A;  1K6P A;  3OHF A;  4Y3Q A;  5P3R A;  5P1W A;  5P3K A;  5P0P A;  3UDN A;  3OTS A;  1GVW A;  4Y3A A;  5P7M A;  2Q55 A;  2R38 A;  1GVU A;  4Q1W A;  3QI1 A;  4YA8 A;  5OZQ A;  5OZB A;  2QNQ A;  3ZKX A;  4QJA A;  3L58 A;  3UDH A;  4DJY A;  3O9G A;  3TPP A;  3HW1 A;  4Y43 A;  5P8F A;  5P2W A;  4EP3 A;  1SDT A;  3OGP A;  3IVI A;  1FG8 C;  4GB2 A;  3ER3 E;  3UTL A;  4NJU A;  5COK A;  3KFR A;  1EPM E;  1HSI A;  3NDX A;  1FF0 C;  2IKU A;  3CIC A;  3UDY A;  5P8H A;  2NTR A;  5HE4 A;  2IL2 A;  4F75 A;  3PGI A;  5P6C A;  3TTP A;  5P7Q A;  1CZI E;  5P5D A;  3VYF A;  4TRZ A;  1FMB A;  1HVH A;  1DW6 C;  3OAD A;  3FKT A;  1FQ6 A;  1SP5 A;  3VCM A;  2HPF A;  4Y3G A;  5KR0 A;  1SGU A;  3OOZ A;  2O4S A;  2Q64 A;  3LZU A;  4HEG A;  5ENM A;  5SY2 A;  2QI6 A;  4Y3M A;  5P6E A;  5P7K A;  3TKG A;  1YT9 A;  5P48 A;  3EXO A;  5P3E A;  5PEP A;  4DPF A;  5P3S A;  4Z50 A;  5P5Q A;  3UQR A;  5P5Z A;  3IN4 A;  5P4X A;  1T7I A;  4J0T A;  5P6D A;  2V10 C;  3A2O A;  5AHA A;  5P78 A;  3MSJ A;  2V11 C;  4BFD A;  5IE1 A;  3EC0 A;  1K6C A;  3L59 A;  3KDC A;  3QN8 A;  5P2E A;  3UQW A;  2BPV A;  3LZV A;  3UHL A;  5T4S A;  1PSN A;  3L5E A;  5P5G A;  4R8Y A;  1ZLF A;  5P4A A;  4DPI A;  5OZW A;  4B1C A;  2FS4 A;  4FS4 A;  3ZKN A;  1T3R A;  4X7I A;  5OYX A;  5SY3 A;  5OZ5 A;  5P4R A;  3RU1 A;  4TRY A;  5P35 A;  3CID A;  3HBO A;  4RYG A;  5P2I A;  1BDL A;  4ER1 E;  3QVI A;  1AM5 A;  4ZPE A;  5P0S A;  3GGA A;  2JYS A;  4Y39 A;  5BWY A;  4COE A;  5J25 A;  1ODW A;  3SA7 A;  5IVQ A;  3SLZ A;  5KR2 A;  5AH6 A;  3EKT A;  5P7P A;  4Y44 A;  4Y3H A;  1C70 A;  4APR E; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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