4AMTA

Crystal structure at 2.6a of human prorenin
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
378
structure length
349
Chain Sequence
TTFKRIFLKRMPSIRESLKERGVDMARLGPEILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The Crystal Structure of Prorenin
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords RENIN
total genus 84
structure length 349
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2012-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
A PF07966 A1_Propeptide A1 Propeptide
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4amtA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4amtA01
5HE7A 5P7QA 5P2EA 2QHCA 3OAGA 4Y38A 2PSVA 4PZXA 4PZWA 4YDGA 4GJBA 1EAGA 3PCZA 1ER8E 1Z1HA 3SKGA 3DV5A 2BPXA 4GJ8A 4YHQA 5P7HA 5P3JA 3ZKSA 7UPJA 5P6FA 5P16A 2QNPA 3G72A 5P4WA 2FXEA 3RTMA 3O9LB 2PSUA 4ZPFA 4CMSA 3HAUA 1EC3A 5P4OA 2O4PA 3DV1A 2F3FA 4FRKA 1HVJA 2XYFA 4EJKA 5OZGA 2B7ZA 3SM2A 4Y35A 2SAMA 4HDPA 1AM5A 4Y4BA 5P8MA 4DV9A 2WEAA 1UH7A 4LBTA 4Q5MA 5OYXA 3NYGA 3OTYA 3LIVA 2AOHA 3FIVA 2R3TA 3EKPA 5P6KA 2I0DA 2HPEA 5P3RA 3DCKA 2QZWA 3WZ6A 1LYBB 1FGCC 2FMBA 3LZYA 5P0UA 2HS2A 2QAKA 5P1TA 5P6OA 4PHVA 3NU5A 1MTBA 3S85A 4J54A 5P8HA 1MPPA 2HB3A 4DJPA 3A2OA 3UQPA 3IXJA 4Y3WA 2ZE1A 5HDXA 1FQ4A 4K9HA 3SA4A 1MEUA 5P32A 5P60A 3VYFA 2Q55A 5P6XA 2VA7A 2VA5A 2JJIA 3OAGB 4B1CA 4Y5GA 3VSWA 5KR8A 5P2HA 2VIYA 3CIBA 4U8WA 2QNQA 2OHRA 5P2MA 2P3DA 5P6JA 2AVSA 5P52A 4GJ6A 2HS1A 1E80E 1HTRB 2QK5A 3UF3A 4GJ9A 1BVEA 4APEA 2FS4A 2RMPA 1HPSA 5P1SA 4HDFA 3GI4A 5P05A 3TTPA 5DQ1A 3CMSA 5P4CA 3TNEA 3I25A 5DQ2A 2QI5A 2OHKA 5P01A 3IGBA 3URJA 1D4SA 1BIMA 4Y36A 2RSPA 2P83A 3OHFA 5OYQA 2OAHA 5DGWA 3RVIA 5AH6A 3KYRA 5ISJA 3OK9A 5P0DA 2Q3KA 3PSUA 2CEMA 5HDZA 2R5PA 2G27A 4GJDA 3SAAA 3B7VA 2O4SA 1PSNA 5OYUA 2RKFA 4LAPA 5P2NA 1YTIA 4YA8A 4LL3A 6UPJA 2PYMA 5P2TA 1FB7A 3R4BA 4R93A 4Y57A 1T3RA 2FDDA 1G35A 3PMYA 3IAWA 4Y4EA 5P83A 4I0EA 3S7LA 3TH9A 4B1EA 3ZPTA 5ISKA 5P7DA 3IVIA 4I0ZA 3NUJA 5P4SA 4YOBA 4MC1A 5P0LA 3N3IA 4RZ1A 2F8GA 4Y47A 4ZEAA 2PK5A 2PWRA 1A8KA 3LITA 5P26A 1GVWA 1FFFC 3PRSA 4Y5PA 5P27A 5P4NA 4ZSMA 3T3CA 3D1ZA 5OZRA 4EXGA 4Y4ZA 4H3FA 5P4ZA 5P75A 1FMUA 1GVTA 3EM4A 3ZPUA 3AIDA 4J0ZA 4BFDA 2WF4A 5P39A 2OHMA 5P3BA 4CPQA 4AUCA 1OD1A 4B78A 5OZZA 5P84A 1ZPAA 4A6CA 4BFBA 3VFAA 2VIJA 5SZ9A 1HRNA 1A8GA 4PYVA 1HVSA 1SH9A 5P5SA 1FEJC 5OYYA 3T7QA 5ER2E 5P5XA 2APRA 3HZCA 3UDKA 4OC6A 5AGZA 2OF0A 5P02A 5P7KA 1FMXA 3D3TA 4DQFA 4IVSA 5P79A 4YD6A 3PEPA 2FNTA 2QCIA 4B72A 4CPWA 3KF0A 1DAZC 5P0GA 3K4VC 5P1HA 5KR0A 3FV3A 2QMDA 3O9EA 3UQXA 5P56A 1GKTA 3OQFA 4Q1XA 5P5RA 3OQDA 1VIJA 4Y3FA 5P85A 5P1GA 4H3IA 1NH0A 3LPKA 5P2IA 3VEUA 2P3CA 2B7FA 1LF2A 5OZTA 5TOLA 1HIVA 3OUAA 5P1PA 1SDUA 3PLDA 2I4DA 1MVPA 3QN8A 1ZP8A 1TQFA 1SBGA 4K4RA 1YTJA 4QJ6A 2IDWA 4CPUA 2UY0A 1AJXA 5P1CA 3DK1A 4GB2A 3RTNA 4Y3MA 5P0IA 2I4QA 5P6HA 2FLEA 1DIFA 3LIZA 4LP9A 5P06A 3NWQA 5P7WA 1FQ5A 1WKRA 1IBQA 3EL4A 1LYWA 3KN0A 4RYCA 1T6EX 4I0FA 2FGUA 5P51A 4DJUA 2IRZA 3KM4A 1FQ6A 5P3MA 5P2QA 2ZJLA 1HPOA 4JP9A 5P3PA 5P1LA 2BPYA 5P64A 4OD9A 3WZ7A 3OUBA 2NNPA 5SXNA 2PYNA 1HSGA 4OC6B 1EBWA 5P49A 1W5VA 4ZPGA 4Z50A 5P8EA 4M8YA 5P0VA 4Y3XA 2ZHVA 4AA8A 1MSMA 4DPFA 3EKXA 1BDRA 3NR6A 5COOA 3L5EA 3AUPA 4Y4GA 5P2UA 5KAOA 1NPWA 3HAWA 3PI5A 3S53A 5P7UA 1BAIA 5P12A 5AH7A 2AZCA 4FRJA 4GJ7A 5P8SA 4RYGA 5OYVA 4NJVA 5HD0A 3SPKA 1VIKA 2QHZA 5P10A 5P6PA 5P3FA 4TRZA 5P4HA 5P8VA 3BUHA 5DQ5A 3S45A 3KMXA 3LPIA 4HDBA 1U8GA 4Y3YA 5OZ5A 5P57A 5P4PA 5P15A 4DFGA 3LPJA 3LZVA 5P2LA 5P3EA 1K2BA 3SM1A 3VUCA 5P5VA 1PFZA 5HDVA 4COEA 1UPJA 1APWE 5P8JA 2VIEA 5P8CA 2UPJA 2F3KA 1K6PA 1QBSA 1LYWB 3JW2A 3L5FA 2VA6A 5P0AA 2NPHA 3LINA 1LF4A 2ZHRA 4Z4XA 1MTRA 4HEGA 2BJUA 3FNTA 3PBDA 4EXHA 2ZJIA 3NXNA 5P29A 5P40A 1D4IA 2IL2A 5P58A 4ER1E 5P5OA 5OZ6A 5P7MA 5P14A 2FNSA 5P0KA 4ACXA 3PBZA 3K5CA 2J9JA 4OD9B 3S8IA 4I11A 3KDBA 4EJDA 1HVIA 1HBVA 1HVHA 2OHNA 1PSOE 2AOJA 4YCYA 5P0NA 4Y4JA 4ZSPA 2P3BA 3IVHA 4OBHA 2AIDA 2A4FA 5P41A 5HTZA 2G1SA 5DQCA 5P2CA 3S43A 5P7JA 5P3OA 3NLSA 3O99A 5P1EA 1HEFE 5IVQA 5P4TA 5P28A 2I4VA 4Y39A 4FLGA 4CPXA 1GVUA 4RVIA 1TSQA 3ZL7A 4EP3A 4FS4A 3I2LA 3PHVA 5PEPA 4TRWA 5P1IA 5P6TA 2QMPA 5P5PA 3NU3A 5P03A 3G70A 5IVSA 5P7GA 3I8WA 5P4GA 1AAQA 5HVPA 4AA9A 2FDPA 5P0PA 4CP7A 5COKA 5OZ9A 5P6ZA 1D4LA 3EKTA 5P44A 1TSUA 5P1WA 5P1XA 3Q70A 4Y3ZA 4R95A 1D4JA 5P45A 5P0XA 3ZMGA 4I0GA 3VLBA 2OHLA 5P11A 3S56A 2B60A 1SDVA 5P6UA 3HD8A 5P5FA 5ER1E 5P33A 5P4EA 5OZEA 4Y4TA 3MXDA 5P1DA 4Y3GA 3OU3A 3ZKQA 2Q15A 4DJVA 4QJ2A 1PSAA 1HTGA 1ME6A 3U71A 3L38A 3TOGA 3ST5A 4RVXA 1ODXA 2XYEA 4FRIA 3TOFA 3H5BA 2XFKA 2J9JB 4GYEA 5KQYA 5P3GA 5P38A 5HCTA 5OZLA 4Y58A 3MSJA 1NSOA 2I4WA 1SMRA 1ENTE 3VF5A 5EZXA 2P3BB 5DGUA 3JVYA 4L7JA 2IGYA 4IVTA 3VV8A 3QRVA 3S43B 4FCOA 3ZKGA 2OHUA 1CZIE 2V16C 5P4VA 3K5GA 3APPA 3QRMA 4Y3EA 4J17A 3ZKIA 3PMUA 1ZBGA 4OBFA 1IZIA 1MT8A 3I7EA 4J1EA 5P74A 3UHLA 5KQFA 1EC1A 1HVKA 4DQBA 5SY2A 4HE9A 2I1AA 1AZ5A 1WBMA 5OYTA 1W6IA 2AVMA 2F80A 3VG1A 4J0YA 1NPVA 5P69A 5P0MA 5P7FA 5AHBA 2V11C 5P35A 3ZKMA 5JFPA 2QNNA 3OQ7A 1XN2A 5P5WA 2I4UA 1BWBA 5P67A 5P3IA 1EPPE 5OYSA 5P8OA 1FKNA 4Y4UA 2R8NA 3G6ZA 4ZIPA 2WF2A 4APRE 5P3TA 3SA7A 2G69A 5P76A 5I3YA 5P55A 5P8KA 3VYEA 5CLMA 5OYRA 5P17A 4JOOA 4Y44A 5P24A 5P2YA 5OYZA 3INHA 4HVPA 2O4LA 1BVGA 5P2DA 5P0OA 2AOFA 5OZSA 2ER7E 5P1YA 3U7SA 3ZKXA 2G20A 5P4JA 2QMGA 1B5FA 3QAAA 3R0YA 4JECA 2IENA 1TCXA 3CKTA 3C9XA 1D4KA 4DUSA 1APUE 4Y48A 5P0SA 3O9IA 4Y9WA 3PWWA 2QD7A 3MWSA 2H6TA 2G1OA 2PQZA 2QZXA 1G6LA 5OZ2A 4I10A 4KB9A 3GGAA 3FX5A 3O9BA 5P62A 2AZ9A 3IXOA 2QMFA 5P5QA 3OQAA 5P2BA 3SQFA 4FSLA 3PJ6A 5OZQA 1T7JA 5P8DA 3OOTA 5I3VA 5P3UA 2IQGA 1DW6C 3IN4A 4D85A 2QD8A 4FSEA 3CICA 2R3WA 1XS7D 5OZBA 4I1CA 3PLLA 1HSIA 4J1CA 3KFNA 4U7VA 5P5GA 2VNNA 1CMSA 1FF0C 3SA6A 1F34A 1FLHA 1HVCA 3GGVA 4JPEA 4B00A 3LZUA 4XKXA 1FG6C 2OHQA 3L5CA 8HVPA 3O9GA 3PSYA 5P2GA 5P1JA 1WBKA 5P0BA 5P34A 5P4LA 4FE6A 4LXKA 4EP2A 1BV9A 3PWMA 1IDAA 5P36A 1EC2A 3BUGA 4R5NA 5P3ZA 1TCWA 3SA8A 1GVVA 5P88A 1YG9A 2G26A 5P3KA 4KUPA 3BGBA 5P6MA 4FRSA 2IKOA 1B5FB 4R91A 4MC2A 4Y3SA 4L7HA 4PPHA 3UPJA 5P6GA 5P22A 5P1KA 1LS5A 4TVGA 1XN3A 5P0EA 1M43A 1LEEA 4FM6A 5P8AA 3VSXA 3UDMA 3EBZA 1HXWA 4Q1WA 4FGXA 5DR0A 2NTRA 2G1RA 5P7SA 3NU4A 5P2AA 5P6YA 4FIVA 4HZTA 3QVIA 2ZJNA 3EXOA 1B6PA 4H3JA 1LF3A 5BRYA 5P0QA 5F00A 3SACA 5OZVA 6FIVA 1BILA 3BXRA 5P4BA 5OZYA 5IE1A 2AOCA 2ER0E 1HIHA 4Y50A 2O40A 5P5ZA 3Q6YA 2AVVA 4EJ8A 3T6IA 1FQXA 3EM3A 4Y3LA 4AMTA 4GJCA 2JE4A 4ZSQA 5P6RA 2ZHUA 1K1UA 3DCRA 5P82A 1UH9A 2BBBA 1PPLE 4J0VA 4Y3AA 5P1MA 3N4LA 4DJRA 5AH8A 5P5JA 4J1HA 3VV6A 1B11A 4FAFA 3TKWA 3UDQA 4TRYA 1B6LA 3MSKA 5HCOA 3PB5A 3UQWA 2QZKA 4Y3DA 4DQHA 5ENMA 2QU2A 1KJFA 3ZKNA 2ZGAA 3UDNA 2WHHA 2QD6A 2ZDZA 5OZKA 5P08A 1B6JA 4L7GA 2V0ZC 3R1GB 1W5YA 3KT5A 2JYSA 3K4VA 5P4AA 5P30A 1JLDA 1KJ7A 5DR3A 3KFRA 5OZXA 3HVGA 5P4XA 5P3SA 1BXQA 1ZJ7A 5P42A 5P5BA 5P72A 1BXOA 5P86A 5P4MA 3KFPA 5P1RA 2PK6A 2AZBA 3FNUA 5P1BA 2NMYA 4X7IA 3PSGA 1IVQA 4WY1A 3MXEA 5AHAA 3O9CA 4CPTA 3DUYA 4J55A 4E43A 4WY6A 4QLHA 5P2OA 4Y6MA 4DH6A 2H6SA 5I70A 5OZ3A 1SIPA 4GMIA 2ZHSA 4YD5A 4YD4A 4K4QA 3UDRA 3UQRA 4Y4AA 3UDPA 2ER9E 3NU9A 2QP8A 1KJ4A 3M9FA 5HU0A 1Z8CA 2NMZA 2BPVA 1EPOE 1C6XA 5JODA 4EWOA 4RRNA 5JFUA 1W6HA 4ZSRA 1RV7A 5P19A 5P4DA 2HB4A 5P81A 5P18A 3T7XA 3EKWA 1N49A 1DMPA 5P25A 3CYXA 3SLZA 3VLAA 5P2SA 5P8FA 5P7RA 2NR6A 4A6BA 1EPME 4OBGA 3FKTA 1KZKA 4OBDA 3LZSA 1E82E 3TPLA 4QJ9A 2QHYA 2HM1A 3NUOA 5KR1A 5P1ZA 5P7ZA 5P1VA 4J0TA 5F01A 1QRPE 2O4KA 4B1DA 2R9BA 2QZLA 3JVWA 4YD7A 1C6YA 5OZ7A 3URLA 2WECA 5P78A 1SDTA 4OBJA 2ZJKA 2V12C 5P1UA 5P59A 1AJVA 4DQCA 1YX9A 3PM4A 5P89A 4D8CA 2QI0A 3K1WA 4J1IA 1OHRA 5P6DA 3EKVA 2G21A 2O4NA 2IGXA 1DP5A 3GGUA 3D91A 5P4QA 1Q9PA 3R0WA 2Z4OA 4DVFA 5P65A 4Q1NA 3SA5A 5P23A 1SGUA 2B8VA 3BRAA 2AODA 1G2KA 1A30A 5P04A 5OZOA 4DJYA 2BQVA 2HAHA 3KT2A 3QI1A 1YM2A 5P80A 5P6EA 2Q5KA 5P4UA 3ECGA 1IIQA 4L1AA 1EBYA 1ZPKA 2HC0A 4Y4DA 2WF1A 4Y3TA 5P7OA 3L5DA 5P2WA 1XDHA 3S7MA 4RGHA 3TPRA 1APVE 3EKYA 3KDCA 3IA9A 2G1YA 3WB4A 5CONA 1LYAA 1K6TA 5P73A 4H3GA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5HE7 A;  5P7Q A;  5P2E A;  2QHC A;  3OAG A;  4Y38 A;  2PSV A;  4PZX A;  4PZW A;  4YDG A;  4GJB A;  1EAG A;  3PCZ A;  1ER8 E;  1Z1H A;  3SKG A;  3DV5 A;  2BPX A;  4GJ8 A;  4YHQ A;  5P7H A;  5P3J A;  3ZKS A;  7UPJ A;  5P6F A;  5P16 A;  2QNP A;  3G72 A;  5P4W A;  2FXE A;  3RTM A;  3O9L B;  2PSU A;  4ZPF A;  4CMS A;  3HAU A;  1EC3 A;  5P4O A;  2O4P A;  3DV1 A;  2F3F A;  4FRK A;  1HVJ A;  2XYF A;  4EJK A;  5OZG A;  2B7Z A;  3SM2 A;  4Y35 A;  2SAM A;  4HDP A;  1AM5 A;  4Y4B A;  5P8M A;  4DV9 A;  2WEA A;  1UH7 A;  4LBT A;  4Q5M A;  5OYX A;  3NYG A;  3OTY A;  3LIV A;  2AOH A;  3FIV A;  2R3T A;  3EKP A;  5P6K A;  2I0D A;  2HPE A;  5P3R A;  3DCK A;  2QZW A;  3WZ6 A;  1LYB B;  1FGC C;  2FMB A;  3LZY A;  5P0U A;  2HS2 A;  2QAK A;  5P1T A;  5P6O A;  4PHV A;  3NU5 A;  1MTB A;  3S85 A;  4J54 A;  5P8H A;  1MPP A;  2HB3 A;  4DJP A;  3A2O A;  3UQP A;  3IXJ A;  4Y3W A;  2ZE1 A;  5HDX A;  1FQ4 A;  4K9H A;  3SA4 A;  1MEU A;  5P32 A;  5P60 A;  3VYF A;  2Q55 A;  5P6X A;  2VA7 A;  2VA5 A;  2JJI A;  3OAG B;  4B1C A;  4Y5G A;  3VSW A;  5KR8 A;  5P2H A;  2VIY A;  3CIB A;  4U8W A;  2QNQ A;  2OHR A;  5P2M A;  2P3D A;  5P6J A;  2AVS A;  5P52 A;  4GJ6 A;  2HS1 A;  1E80 E;  1HTR B;  2QK5 A;  3UF3 A;  4GJ9 A;  1BVE A;  4APE A;  2FS4 A;  2RMP A;  1HPS A;  5P1S A;  4HDF A;  3GI4 A;  5P05 A;  3TTP A;  5DQ1 A;  3CMS A;  5P4C A;  3TNE A;  3I25 A;  5DQ2 A;  2QI5 A;  2OHK A;  5P01 A;  3IGB A;  3URJ A;  1D4S A;  1BIM A;  4Y36 A;  2RSP A;  2P83 A;  3OHF A;  5OYQ A;  2OAH A;  5DGW A;  3RVI A;  5AH6 A;  3KYR A;  5ISJ A;  3OK9 A;  5P0D A;  2Q3K A;  3PSU A;  2CEM A;  5HDZ A;  2R5P A;  2G27 A;  4GJD A;  3SAA A;  3B7V A;  2O4S A;  1PSN A;  5OYU A;  2RKF A;  4LAP A;  5P2N A;  1YTI A;  4YA8 A;  4LL3 A;  6UPJ A;  2PYM A;  5P2T A;  1FB7 A;  3R4B A;  4R93 A;  4Y57 A;  1T3R A;  2FDD A;  1G35 A;  3PMY A;  3IAW A;  4Y4E A;  5P83 A;  4I0E A;  3S7L A;  3TH9 A;  4B1E A;  3ZPT A;  5ISK A;  5P7D A;  3IVI A;  4I0Z A;  3NUJ A;  5P4S A;  4YOB A;  4MC1 A;  5P0L A;  3N3I A;  4RZ1 A;  2F8G A;  4Y47 A;  4ZEA A;  2PK5 A;  2PWR A;  1A8K A;  3LIT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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