4APRE

Structures of complexes of rhizopuspepsin with pepstatin and other statine-containing inhibitors
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
AGVGTVPMTDYGNDIEYYGQVTIGTPGKKFNLDFDTGSSDLWIASTLCTNCGSGQTKYDPNQSSTYQADGRTWSISYGDGSSASGILAKDNVNLGGLLIKGQTIELAKREAASFASGPNDGLLGLGFDTITTVRGVKTPMDNLISQGLISRPIFGVYLGKAKNGGGGEYIFGGYDSTKFKGSLTTVPIDNSRGWWGITVDRATVGTSTVASSFDGILDTGTTLLILPNNIAASVARAYGASDNGDGTYTISCDTSAFKPLVFSINGASFQVSPDSLVFEEFQGQCIAGFGYGNWGFAIIGDTFLKNNYVVFNQGVPEVQIAPVAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of complexes of rhizopuspepsin with pepstatin and other statine-containing inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Rhizopus chinensis
molecule keywords RHIZOPUSPEPSIN
total genus 88
structure length 325
sequence length 325
ec nomenclature ec 3.4.23.21: Rhizopuspepsin.
pdb deposition date 1989-08-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4aprE01
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4aprE02
4MC1A 4HEGA 5APRE 5P3EA 5P6UA 4FRSA 3S45A 4B05A 4ACXA 2QZWA 2NXDA 4D88A 4DVFA 5P4KA 4HVPA 5P6FA 3NU3A 2WF1A 5P2MA 4Y4EA 5OZPA 4Y57A 4B77A 4FM8A 4EP2A 3HAWA 4Y41A 2VIEA 4UPJA 1FQ7A 3QP0A 1MUIA 4PEPA 2R43A 2P3BA 3LPJA 3EM6A 4M8XA 5JFUA 1ODYA 5P85A 5P1PA 1RL8A 2WF0A 5P1QA 4FGXA 1HEGE 3HLOA 5P8CA 2Q63A 2WECA 4Y38A 4PZWA 3S8IA 5P1GA 4DJYA 4J54A 2AVSA 1GVWA 1FQ5A 4Y4AA 4GB2A 5P2QA 2AOGA 5P8OA 3ECGA 3L3AA 1LYAB 3VYFA 5P6OA 1BILA 4B70A 5P4NA 1FG8C 3BHEA 3G70A 3LIVA 1HEFE 4AZYA 1QBRA 5P32A 5P20A 1LF3A 3DK1A 5P2VA 4YOBA 3KFNA 5P0PA 5B18A 3UDMA 4QGIA 4WTUA 5P70A 2OHTA 1B6PA 5COKA 3OQAA 5P10A 2IS0A 1FQ4A 5KQYA 3BUGA 4OD9A 5P4BA 1W50A 3NLSA 3K4VA 3EM3A 4IVTA 3TL9A 1YM2A 3FV3A 5P0CA 4EJ8A 3H0BA 3CKRA 4R91A 5P0MA 4I0GA 5EZXA 2R3TA 1FQ6A 5P5AA 1A9MA 4RZ1A 1C6YA 1Z1HA 4Y4TA 4Q1NA 5P4TA 2VKMA 4Y5AA 1BIMA 3OTYA 1W6IA 1T6GA 3N3IA 5OZNA 4LXAA 3IA9A 2V10C 2HC0A 1GVTA 4J0ZA 2AZBA 5P2IA 5P7TA 3PWRA 4YD4A 5OZUA 1LZQA 3QVCA 2QHCA 4DJOA 1GVUA 3SKGA 1BDRA 4HDPA 4MC9A 3OHFA 7UPJA 4DQGA 2NPHA 5P8JA 3K5GA 5OYRA 3SQFA 3RU1A 3KFPA 2QD6A 5P63A 4Y5KA 3PGIA 6FIVA 3PMYA 5PEPA 5P4AA 3KDCA 5P60A 1HTGA 3QPJA 1T7KA 1ZPKA 3OU1B 4K4PA 3AIDA 3NU4A 3OXCA 3SM2A 2I0AA 4F76A 1FF0C 4FM7A 5P2WA 5OZBA 4QJAA 1D4YA 5P1RA 3URJA 5DGUA 4Y45A 1HVRA 3SAAA 4I1CA 3OUDA 3NUJA 5P01A 2V13A 1YTIA 3Q6YA 2IQGA 2IDWA 3HW1A 5P34A 3BXSA 4DJPA 5IVQA 4U8WA 1WKRA 5COOA 4I0EA 1TSUA 4CP7A 4JPCA 4GJCA 2IEOA 2HM1A 4FSEA 1BDLA 5P0WA 5AH7A 2P3BB 3CYWA 3GI4A 1GNMA 2IGXA 5AH6A 5P1VA 5P5PA 3TH9A 1FMUA 5P6HA 2Q11A 5KR2A 2J9JA 2PYMA 3T6IA 5KR8A 2AOJA 4J0PA 4EJKA 5P3DA 1M0BA 3EKPA 3B80A 5P7VA 5P7FA 5P5CA 5P13A 5P56A 3PI0A 4EWOA 1PPKE 5CONA 4GJBA 2RMPA 4OBFA 2V12C 1UPJA 5AHBA 5P26A 4OBKA 5OYVA 1SP5A 5P7UA 1LYBB 4YHQA 3BGCA 1D4JA 4GJDA 4DV9A 2QU3A 1DMPA 4NPTA 3EBZA 3U6AA 1D4SA 2WF3A 3A2OA 5P4SA 2QMDA 4CPRA 2BKSA 2HPEA 3F9QA 2UY0A 5P1BA 3QBFA 5P7XA 3O9CA 3EL4A 2PQZA 4OD9B 2A1EA 2F80A 2QCIA 4QJ2A 1SBGA 3OGQA 4YDFA 4RYCA 4LL3A 4DUSA 2P4JA 4A6CA 3ER3E 5P09A 2ZJHA 5P0IA 3KDDA 2BB9A 3UQRA 5KOSA 4Y4ZA 1FKNA 1HVKA 5P1WA 1PSOE 5P6ZA 5P48A 3JW2A 5P8VA 2G69A 4WY1A 5P1OA 1HSGA 1HVJA 3OHHA 4Y47A 1C6ZA 1HRNA 9HVPA 4LC7A 4DPFA 4GJ5A 5AHAA 2WHHA 1AAQA 2H6TA 1F34A 4APEA 2QP8A 1K2CA 4DQEA 3PCZA 2FDDA 5P5RA 3PM4A 3RTHA 3ZKIA 5P8UA 5I70A 1RQ9A 1IBQA 3VV6A 4DH6A 2QHZA 5DGWA 1HPOA 3RTNA 2HS1A 3GGUA 5OZGA 4AUCA 2IKOA 4Y4GA 5P35A 2Q5KA 2HPFA 4Z50A 1EPPE 4FLGA 1E81E 5P2KA 4Y3XA 4PYVA 4QJ7A 5ER2E 4EQJA 4K8SA 4ER1E 4CPTA 2Q15A 1IDAA 4GJ6A 1EBWA 1W6HA 3CKTA 4M8YA 2IGYA 2FGUA 4FCOA 1J71A 4YD6A 3KFSA 1C6XA 3OQ7A 1BV9A 4H3FA 3EKXA 3S43A 5P3PA 3BGBA 3ZKXA 1EBZA 5P7WA 5P5UA 5P0ZA 3K5FA 3C9XA 4DPIA 5OZJA 2FS4A 5P2XA 5P31A 3L5DA 4Y4DA 4DJXA 5E5JA 2G24A 1K2BA 1TSQA 2IRZA 5P8TA 2PK6A 4Y4UA 5P5GA 1GVVA 1CZIE 1BWBA 3PWWA 3Q70A 4YD3A 4FRJA 3IVIA 5P41A 3S56A 3UDRA 1ZSFA 4FSLA 1ZSRA 1NSOA 5DQ5A 5P50A 4TRWA 4H1EA 3TOHA 2J9JB 2VA7A 5P4XA 4Y36A 2QI3A 1KJGA 2PH6A 3PWMA 2ZJNA 2OF0A 3VYEA 5P1LA 5BRYA 8HVPA 1IZDA 3MSLA 3NYGA 5P6AA 3SA4A 1YG9A 2G1YA 5P3YA 2PSVA 3NWXA 5DR3A 4B78A 1A94A 2BJUA 5OZKA 5P2RA 5P7AA 1EPOE 1BDQA 3MWSA 3R2FA 1K1UA 4ZLSA 1G35A 1RPIA 1SIPA 2ZHUA 2VJ9A 1BVEA 3HD8A 3OAGB 4FL8A 5P6LA 5P69A 4R93A 1APTE 2JJIA 5P64A 1AJXA 3K1WA 2QMPA 2WEZA 3TOGA 4WY6A 4Z22A 5OZ0A 1UH7A 4B72A 5OZYA 3LIYA 4RVJA 5KOQA 1QBTA 1XL2A 3VV8A 5P8BA 3ER5E 2FNTA 5P7KA 2NMYA 5OZVA 3NU6A 5DR8A 3MSJA 5P39A 5I3VA 3T7QA 4I0IA 3U7SA 5P4IA 2HAHA 4EP3A 3Q4BA 3NU9A 3LZUA 5ER1E 5P03A 2WEDA 5P89A 5OYWA 3EL0A 1IVPA 3ZKSA 2P3AA 1QBUA 4J0VA 3D1ZA 5P5MA 1NH0A 4CPWA 4I8ZA 3NUOA 2I0DA 3GGXA 5P53A 5HU1A 1RNEA 4CMSA 1PROA 3ZPTA 3UDYA 1TW7A 3VEUA 4Y53A 2AOHA 4DFGA 2G20A 4GIDA 5OZ8A 4E43A 2ER7E 3UDNA 3KMXA 3OXVA 5SY2A 3LHGA 5P33A 5P2DA 3OUCA 3T7PA 4Y37A 5P2ZA 2QNNA 2PSGA 4L7HA 5P2BA 5P1SA 1YX9A 2P3CA 1ER8E 2R5QA 3PLLA 5P83A 2QMFA 4J1KA 3PHVA 5J25A 3L38A 1EBYA 5P72A 3MXDA 4RCFA 3NR6A 1D4IA 3VF3A 5C9DA 3NDUA 3L58A 4Q5MA 6APRE 4Y3QA 5P4RA 3LIXA 3EKQA 5OZZA 1PFZA 2RENA 1M4HA 1PPLE 3S43B 1EAGA 5P36A 4U7VA 5P11A 4X7IA 5P1CA 1IZHA 3UDKA 5OYXA 1XE5A 4Y3NA 1LF4A 3BVBA 4Y3ZA 1WBKA 2QHYA 2QNPA 4EPJA 3LPKA 1EPLE 1SDUA 3M9FA 3GI0A 4CPQA 3VLAA 3EL1A 5HTZA 5HE4A 5OYQA 1KJ7A 4I0JA 4Y39A 3LINA 4OBZA 4ZE6A 2FMBA 3PRSA 5HDVA 5OZ9A 4LP9A 2ZJLA 3ZLQA 4GYEA 5P5FA 3KM4A 4BFDA 3IAWA 5P05A 1DAZC 4Y4BA 3FIVA 4I0FA 5P3HA 1YTGA 2BQVA 5P6BA 1LYBA 4Y58A 4ACUA 4YBIA 4U7QA 5P7JA 2O40A 4L6BA 5AHCA 2R8NA 3EKWA 1K6PA 1ZLFA 3VUCA 1YTJA 1B11A 1FQ8A 5P3QA 4YCYA 3TPPA 3DM6A 4YD5A 2P83A 1PSAA 3KF0A 4Y35A 1T7JA 2CEJA 3BUFA 4QJ6A 1ZJ7A 2UXZA 3ZKNA 2ZDZA 3OXWA 2F3KA 4Y3WA 3WSJA 2ZHSA 4L7GA 1OEWA 5T4SA 5P51A 4YCKA 1KJFA 1MVPA 1NPVA 5P4JA 2JE4A 4HZTA 5OYUA 4B1EA 3G72A 5P2YA 2AVOA 4Y5EA 3G6ZA 4ZIPA 3D20A 5P04A 1OD1A 5P4GA 3FNUA 5P5HA 2MIPA 3D1XA 4GJ7A 4DQCA 4A6BA 3QROA 3QRSA 5P8AA 1ME6A 2NR6A 4YD7A 5P7CA 5P6VA 2G1RA 1FFFC 1SGZA 2NXLA 4D83A 2WL0A 2OHNA 4Y51A 5P8RA 5P3SA 5P3RA 4J1CA 5P5KA 3DV1A 2Z54A 4Y5CA 2SAMA 7HVPA 2AZ9A 5P74A 1NPWA 3KT2A 1QBSA 1HWRA 2V00A 3UCBA 5IVSA 1EBKC 3NXNA 5P1MA 1M43A 1BXOA 4EXGA 4Y4JA 4J17A 3HAUA 1KJ4A 3B7VA 2FDEA 1HVCA 3VV7A 2PMAA 3VSWA 4Y56A 3ZMGA 5OZOA 1Z1RA 1NPAA 5P73A 2O4KA 4KE0A 5P81A 4NJTA 4Y9WA 4JP9A 1MT7A 3KDBA 4TVGA 4JOOA 1HPXA 3LIQA 1HVIA 4FRKA 3OTSA 5P6PA 3OADA 4RVIA 1LF2A 1WBMA 1BWAA 3O9EA 5P57A 2I4VA 5P3FA 2VA5A 3PVKA 3D1YA 2FGVA 1MRWA 3OGPA 5P6CA 3U71A 2HIZA 2VNNA 1EEDP 5P66A 5P8QA 1LEEA 5OZHA 2Z4OA 3RSXA 3UTLA 1TZSA 1HIHA 1HHPA 2O4SA 2WEAA 2B60A 3PSUA 5TOLA 4FM6A 3QS1A 5ISKA 2FXEA 5P3GA 5F01A 5P6MA 5OZAA 5P00A 5IVTA 2AVMA 4YE3A 4OBZB 5P5NA 1AM5A 2AQUA 5P4VA 3WZ7A 1K6CA 4RRNA 2I4XA 5P4QA 2AOEA 2RKFA 5P5OA 2HB2A 5P7BA 3SA7A 3LITA 5IS4A 2OHPA 2B8VA 5P45A 1XDHA 4J0TA 2NNKA 1GVXA 5P0OA 4DJWA 3KMYA 2QZLA 3T11A 5P2JA 5OZEA 1MSMA 5P1KA 2OHUA 5P0EA 4XKXA 1T6EX 5DR1A 4CPXA 3OAGA 4H3GA 2I4QA 3IXOA 1KZKA 2FXDA 2OHKA 3UDHA 2Q55A 4YCTA 3GW5A 1UH8A 4I8WA 5P6TA 5OYSA 5BS4A 3CICA 5AH8A 4NJVA 2RSPA 5OZ2A 5P7OA 1HTRB 4B00A 5OZSA 5OZRA 5P6IA 5P27A 5EZZA 1SIVA 1BV7A 5P0JA 4DJRA 3PLDA 4K4RA 5OZLA 4ER4E 5P1NA 5P07A 3KA2A 4APRE 4Y3TA 1EPME 2O4NA 4BFBA 4OBJA 1W5WA 3VYDA 1SDTA 5P44A 3QBHA 3R0WA 1HSHA 3URIA 4J1HA 3O9HA 5P84A 1ODXA 4RLDA 3MXEA 5P2FA 2QI7A 5KQZA 1DPJA 5CLMA 2G1OA 2NXMA 4RRSA 3BC4A 2NTRA 5DR0A 4TRYA 3ZOVA 5P23A 3SPKA 2QI5A 3EL9A 3VF7A 1PPME 2I1AA 4FAEA 4R8YA 5P80A 4RCDA 4FAFA 3PEPA 5P3JA 2ANLA 5P7LA 2B42A 1Z8CA 4OBHA 4I0HA 4Y4WA 3I25A 1PSNA 4ZSQA 4AA9A 4CPSA 3D91A 5P1DA 5C9BA 1OHRA 3KN0A 3BVAA 1YT9A 5P4YA 5P5TA 1EC1A 4ZPGA 2BPWA 2HB4A 2CENA 3S7MA 1CMSA 2ER0E 5P8SA 5P3NA 5P4LA 4Y6MA 5P6NA 2VNMA 5FIVA 4OBDA 3S7LA 4L1AA 1YTHA 2VS2A 3FX5A 5P2UA 4JPEA 2F8GA 5P8DA 1XS7D 5P1ZA 3UQWA 2HS2A 2V0ZC 5P7SA 2QU2A 3OADB 4IVSA 2BPZA 5P7ZA 2ASIA 4CKUA 4NJSA 1D4KA 5IE1A 2V16C 3QAAA 5P6YA 1META 1E5OE 3R1GB 2I4DA 3FNSA 5P7RA 5P6WA 5OZ7A 4ER2E 3S2OA 1ZTZA 1W51A 5HDZA 5P6XA 5P7NA 4EJLA 3GI5A 1FLHA 5JG1A 3VLBA 2FIVA 3SKFA 2AOIA 4GMIA 3INHA 3OU4A 4ZEAA 4DJQA 1A8GA 3PI5A 5P61A 5P0VA 5P52A 4RROA 3QN8A 3SFCA 2QZKA 2G1SA 2ER9E 3BRAA 2BPYA 3EXOA 5P6RA 4Y3FA 3INDA 1EPNE 3EL5A 5OZTA 2APRA 5P4MA 5P6DA 1HIVA 2QZXA 3INFA 5P1HA 3Q5HA 3WZ6A 4ZPEA 4S1GA 3UQXA 1F7AA 4J1IA 1GKTA 2AOFA 5P0FA 3KT5A 1ZAPA 2AZ8A 3KYRA 1HSIA 1W5VA 4Y5PA 5P22A 2WKZA 4PHVA 3D3TA 4J5JA 3HVPA 5P7IA 1T7IA 1EPQE 3OQKA 2BPXA 1YM4A 5OZXA 5P0QA 3O9LA 1SMEA 2RKGA 2Q64A 1OEXA 1LV1A 3HDKA 3L59A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4MC1 A;  4HEG A;  5APR E;  5P3E A;  5P6U A;  4FRS A;  3S45 A;  4B05 A;  4ACX A;  2QZW A;  2NXD A;  4D88 A;  4DVF A;  5P4K A;  4HVP A;  5P6F A;  3NU3 A;  2WF1 A;  5P2M A;  4Y4E A;  5OZP A;  4Y57 A;  4B77 A;  4FM8 A;  4EP2 A;  3HAW A;  4Y41 A;  2VIE A;  4UPJ A;  1FQ7 A;  3QP0 A;  1MUI A;  4PEP A;  2R43 A;  2P3B A;  3LPJ A;  3EM6 A;  4M8X A;  5JFU A;  1ODY A;  5P85 A;  5P1P A;  1RL8 A;  2WF0 A;  5P1Q A;  4FGX A;  1HEG E;  3HLO A;  5P8C A;  2Q63 A;  2WEC A;  4Y38 A;  4PZW A;  3S8I A;  5P1G A;  4DJY A;  4J54 A;  2AVS A;  1GVW A;  1FQ5 A;  4Y4A A;  4GB2 A;  5P2Q A;  2AOG A;  5P8O A;  3ECG A;  3L3A A;  1LYA B;  3VYF A;  5P6O A;  1BIL A;  4B70 A;  5P4N A;  1FG8 C;  3BHE A;  3G70 A;  3LIV A;  1HEF E;  4AZY A;  1QBR A;  5P32 A;  5P20 A;  1LF3 A;  3DK1 A;  5P2V A;  4YOB A;  3KFN A;  5P0P A;  5B18 A;  3UDM A;  4QGI A;  4WTU A;  5P70 A;  2OHT A;  1B6P A;  5COK A;  3OQA A;  5P10 A;  2IS0 A;  1FQ4 A;  5KQY A;  3BUG A;  4OD9 A;  5P4B A;  1W50 A;  3NLS A;  3K4V A;  3EM3 A;  4IVT A;  3TL9 A;  1YM2 A;  3FV3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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