4ER4E

High-resolution x-ray analyses of renin inhibitor-aspartic proteinase complexes
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High resolution X-ray analyses of renin inhibitor-aspartic proteinase complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 65
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1991-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4er4E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4er4E01
1UH7A 3L5EA 5P4YA 3OU4B 1TW7A 1NPVA 1ZLFA 5P3PA 5EZZA 1FMXA 1ODYA 1D4SA 2NPHA 2NTRA 2FXDA 5ER1E 2PSUA 5P5IA 5P5QA 5P1RA 5P4KA 3VV7A 1ZSFA 2V0ZC 3OUCA 3PJ6A 3TPLA 1LYBB 4FRIA 4I0DA 4NJUA 5OZRA 3INDA 3LPJA 3UDMA 4GJBA 1AZ5A 3QI1A 2VJ7A 5P39A 4B78A 5OZCA 2R3WA 3NUOA 1ODWA 4Y3HA 1HIHA 1HPOA 3R1GB 3GI4A 1LF2A 1XE5A 2QI3A 2G22A 2SAMA 3RU1A 2OHSA 3SM1A 5ISKA 4LXMA 5P7DA 1LYWB 3OY4A 1W5YA 5P8QA 2ZHTA 1M4HA 3HBOA 5P77A 3SA9A 5P38A 1C70A 4YDFA 4CP7A 3SQFA 4Y6MA 3GI6A 1ME6A 4Y3YA 5P1JA 5P0MA 5J25A 3PMUA 3UQXA 1HEGE 3PI5A 4IVSA 5P0XA 2V16C 4I1CA 1IDAA 2FGUA 5COOA 4F73A 5HDZA 1EBYA 4JOOA 1PPLE 1BAIA 2B60A 1D4HA 5P3DA 4Y5LA 2QZLA 5P6AA 2NNKA 2R5QA 2IDWA 5P1CA 1HEFE 1W51A 1HTRB 5SXNA 3EL9A 4Q1NA 3PWWA 1HIVA 3WB4A 6UPJA 5AH8A 4J0ZA 2V00A 2QHCA 3O9LA 5OYXA 4Y47A 3UDJA 3OOZA 1QBTA 1HIIA 2AVVA 4U8WA 3AUPA 1EBWA 5OYSA 3PSUA 5P57A 1W6HA 2R3TA 4DJRA 5B18A 1U8GA 5P1ZA 4HA5A 3SAAA 5OZ3A 2QD7A 2ZJHA 3GGAA 4RCDA 3BXRA 3UDYA 5P7QA 1PPKE 4COEA 4QJ2A 2QI4A 1PSOE 3O9LB 4EPJA 4DJOA 4PYVA 3S85A 2R43A 2JJIA 5P63A 2F3KA 5P54A 5P1OA 1K6PA 3NXEA 1ZPKA 5P5ZA 2QU3A 4L7GA 1FF0C 3D1XA 1AXAA 3EXOA 5P0KA 5P6BA 3BHEA 3JVYA 5OZWA 5P6OA 4YBIA 3CKTA 5CONA 4Y5CA 2WKZA 1KJFA 3O9HA 3PRSA 5OZMA 5P42A 2NXDA 5KQXA 2RSPA 3D20A 4L6BA 3QVCA 4OD9A 5P3WA 4XX3A 4Y3LA 3ZKQA 4GB2A 5P1LA 2WEAA 3G72A 4B72A 4EJ8A 2BJUA 3CIDA 5P07A 4FE6A 5P8LA 1BV9A 5P05A 2WF4A 5P6FA 1UH9A 3RSXA 1T3RA 4RCEA 2VA7A 4YD7A 5ER2E 1SIPA 1GVTA 2CENA 1RL8A 2VNMA 5P8KA 5P79A 3TPJA 3K5DA 4H3GA 1FQ8A 4EHCA 3ZKGA 2O4NA 5OZXA 1ZP8A 1QBSA 5HDVA 2NR6A 5KR0A 5P08A 5P8NA 3TLHA 4EXHA 1FG8C 5P62A 4X7IA 1NSOA 3LPKA 5P1BA 4GJ5A 2F80A 2IENA 5P0RA 5P8GA 3S7MA 5P0LA 3UDQA 3FSMA 3UDRA 2BPYA 3RTMA 3EL4A 5P3KA 5P6SA 1MVPA 2QMDA 4FM8A 5P1TA 3VF5A 3EKWA 1HWRA 5P6WA 1FIVA 1TCWA 4OBJA 4Y58A 4CPWA 1YM2A 1FG6C 5P1WA 5P6VA 5P87A 2APRA 4ZSRA 4GJ9A 5P6PA 2QZXA 3WZ8A 3OXXA 1HVHA 3BUHA 3O9AA 1E80E 3URJA 5P2WA 3EKXA 5KQFA 3QN8A 3CKRA 3VF7A 3UFLA 1HSIA 2ZHRA 2AVMA 3IAWA 1TZSA 5P5YA 1W50A 1WBMA 5P2BA 3U7SA 2OHRA 4I11A 5P4CA 5P83A 1Z8CA 4ZPGA 4Y3MA 2HPFA 3UDKA 2UPJA 3LPIA 3O9EA 4FM6A 1BWBA 1D4KA 4YD3A 4Q1YA 4LC7A 3FNTA 5P4SA 4FSLA 3EKTA 3DV5A 1IZDA 3DV1A 4Y5BA 5HTZA 3ST5A 1ZSRA 5P8FA 3FIVA 2J9JA 1HVJA 3OQDA 5P28A 4ZSPA 5P01A 3OWNA 5P2RA 3SLZA 5OZ2A 2HPEA 4HDPA 3IVIA 2XYFA 5P8SA 2HAHA 2O40A 5IVSA 4FAEA 3KDCA 5P8CA 4ER2E 1CPIA 3QRMA 5P45A 3TNEA 1IDBA 1WKRA 2IL2A 5AH9A 3ZMGA 4I0EA 3OU1A 3O9BA 2ZJJA 3OAGA 4RYGA 5OYWA 3PBDA 4YD5A 5P4WA 3L3AA 2ER7E 4LXAA 5P37A 5P5DA 5OZ4A 2I1AA 1YM4A 3JVWA 5P2FA 1AJVA 1SBGA 5P5GA 3ZKNA 5P0VA 3K1WA 4OBZA 2OHKA 5P3MA 1W6IA 5P02A 4H3JA 4DPFA 5IE1A 4I12A 3U71A 5P5JA 3OUAA 5P5CA 2ER6E 5P44A 1PSNA 4DUSA 5P2AA 4FIVA 2ZHUA 2F81A 3OAGB 5AH6A 2CEJA 2FS4A 2WHHA 3OXCA 5P6HA 4CPSA 1IZIA 2HB3A 4F75A 1FQ6A 5P5BA 2QAKA 2ZGAA 3PSYA 1META 3S43A 1SDTA 4Y3JA 5I70A 5P2QA 5P3RA 3U6AA 3IXKA 4OBDA 3ZKMA 5KOSA 1IVQA 3LITA 1BXOA 4OBZB 5P7VA 4U7VA 2QHZA 4B1DA 2WEZA 5P61A 5P3IA 1EPQE 5P50A 1MESA 2QK5A 2HB4A 1ZBGA 2QZKA 4MC6A 5HCTA 3S53A 3NU9A 2AZBA 2PSVA 4PPHA 5P32A 3EKVA 4DJPA 3Q70A 4HLAA 5JODA 2IKOA 3HD8A 4ZEAA 2QHYA 1K6VA 5OZEA 1A9MA 5OYVA 3EMYA 2Q11A 5P1NA 3I7EA 4Y5MA 3EKQA 2ZJIA 3QRSA 4R91A 4XKXA 3RSVA 4MC9A 3NUJA 4ZPFA 5KQZA 4K4RA 2JYSA 5P5XA 4Y4BA 2QMPA 2NNPA 5SY2A 3NDUA 3S8IA 2PH6A 4H3FA 3VF3A 3K4VA 5HDUA 3PWRA 2BPZA 3H0BA 4Q1WA 5P11A 2OHUA 4EWOA 3MWSA 5P70A 5P0DA 2AIDA 5P2GA 4NPUA 3TKWA 3O9IA 3IXOA 3KA2A 2EWYA 4DQFA 4PHVA 5I3XA 5AH7A 3HAUA 2AOHA 4J1CA 5P5AA 2BKTA 3EKPA 5P0AA 4Z4XA 2VIJA 5P5LA 4ER1E 4JP9A 4K8SA 3BVAA 2AOJA 4XX4A 3VLBA 5DGUA 1HVKA 3HW1A 5P0QA 5T4SA 3O9GA 2VNNA 1T7JA 7HVPA 1E82E 4KB9A 1QDMA 4Y4AA 2VIEA 4AZYA 4A4QA 4GMIA 4ACXA 3VYEA 1K2CA 3C9XA 3H5BA 2ZJMA 1SMEA 4DVFA 3KDDA 5P0CA 2OHMA 3QAAA 3DOXA 1SH9A 1SGZA 4BFBA 3VYFA 1PROA 5P7SA 1CZIE 5P5HA 1YTGA 2AVQA 3OTYA 5P6NA 3URLA 4RYCA 4QLHA 4Y3NA 5OZJA 4Y43A 1HVRA 5P4AA 2PH8A 2ZHSA 2BPXA 4KUPA 4Y3AA 5P69A 4Y41A 3UQRA 4OBFA 1FGCC 3PVKA 4LP9A 2Q15A 1RNEA 3KMYA 2VA6A 3QP0A 5P04A 6APRE 2AODA 5P6MA 3ZKXA 4DQHA 5P1GA 2P3DA 2NXLA 1A94A 2Q54A 3ER3E 5P15A 4Z22A 3HDKA 4DJUA 1EPRE 3T7PA 1EBKC 3MSKA 5OZBA 1EPNE 3OQKA 2PQZA 1MEUA 5CLMA 4Y5GA 5P2HA 4J17A 4AA8A 4PEPA 2AOGA 3D3TA 3Q4BA 5P29A 5P4BA 5P3HA 1NPAA 1FQ7A 4LAPA 4B70A 1QBUA 1PSAA 2I4UA 3EC0A 2RKFA 3WB5A 1EEDP 1FEJC 3KDBA 2HB2A 2V11C 3NU4A 1T6EX 2PMAA 3N3IA 2AOCA 5P6YA 3WSJA 2H6TA 5P8DA 1YG9A 2Z54A 4Y3PA 1ZJ7A 3L5DA 2G69A 4Y4XA 5P6QA 4GZFA 1GNOA 1D4LA 5P24A 5P6DA 5P7UA 4F74A 3TOHA 2ZJNA 1GNMA 5SY3A 3D91A 1LF4A 3SO9A 3DCRA 3T6IA 1UH8A 5P2YA 5P0FA 1QS8A 3ZL7A 3TOGA 1MPPA 4YCTA 3TTPA 4ZSMA 3S45A 4U7QA 3BGCA 3SM2A 2I0DA 2I4XA 5ENMA 3TPPA 2AQUA 2IS0A 2P83A 4DJWA 4HZTA 1YT9A 1M0BA 5P1KA 1B6LA 3FKTA 4BELA 3GGXA 3QVIA 4XXSA 5C9FA 3QROA 5OZFA 4DFGA 4Y39A 5P4RA 3OHHA 3A2OA 5P49A 3OUDA 1FQ5A 4HDBA 3KT2A 5DR7A 4BFDA 3PB5A 3LHGA 4TVGA 3IXJA 3LIQA 5P46A 4TVHA 5P4VA 1RQ9A 5P1FA 1GVVA 3HLOA 4Y3WA 1TQFA 5DQ2A 5P56A 3SA6A 2B8LA 5P7EA 5P7XA 5P73A 3CYXA 1MSNA 3T7XA 3AIDA 3PLLA 1EPLE 1EC3A 5I3VA 4Y4UA 5P7CA 4RGHA 4DQEA 3I25A 4FRKA 3LZSA 4Y4TA 4CPQA 5P80A 2FLEA 3OXVA 5P35A 5P8PA 2AZ9A 2XFIA 2V10C 1M43A 3OUBA 3ECGA 3SKGA 3VYDA 3OQAA 5P47A 1ZAPA 3IGBA 3FNUA 4D85A 5AHBA 4FS4A 1XE6A 3O9FA 5P74A 4I0ZA 3UHLA 3GI5A 3VCMA 4NJTA 4OD9B 5P76A 4Y35A 2I4QA 3EL1A 5PEPA 3PLDA 1HHPA 1YTHA 2PYMA 4I10A 5OZDA 5P51A 3O9CA 5HD0A 3L59A 3I8WA 2XFKA 1BVEA 4PZXA 3INFA 5OZGA 2QI0A 3I6OA 4R8YA 5P4JA 4B1EA 1HRNA 3PGIA 3BC4A 3SPKA 5P5WA 1A8GA 4OBHA 1IVPA 2P4JA 5P8BA 1TSUA 2QZWA 3NU6A 3VFAA 3LZYA 4FGXA 1G2KA 1IZHA 1MT9A 5P0HA 1BVGA 5P67A 4EJLA 4Y4WA 2WEBA 4FSEA 5OYRA 3DCKA 1T6GA 3KF0A 4CPTA 1MRXA 5P1MA 1DAZC 5P31A 4KE1A 5FIVA 5P3BA 4J55A 5OZTA 2FDPA 3R0WA 2G27A 2G1RA 5P3UA 2B42A 2RMPA 1HVCA 1JLDA 5P8TA 4YCKA 5P7TA 5P6IA 5F01A 4ZPEA 1W5WA 1T7KA 4YA8A 2ZJKA 3L5BA 1HVSA 5AHAA 3DJKA 1VIJA 2BKSA 3KYRA 4Y4JA 1HTGA 5KR2A 3QBFA 5P4XA 1APUE 5P3QA 2HS1A 3VSWA 3PCWA 4DJXA 1MTBA 3FV3A 3NLSA 4Y3EA 1BDQA 4AUCA 4RLDA 1IZEA 5P7HA 1QRPE 3TOFA 3N4LA 4TRWA 5OYYA 3QPJA 2VKMA 4TRZA 2NXMA 1W5XA 1D4JA 3S54A 5P4PA 1OHRA 5COPA 5P1XA 2ANLA 3ZPTA 3B7VA 5APRE 1D4IA 5P17A 5P7BA 2PSGA 5P68A 1E81E 3SACA 4DV9A 1C6YA 3RVIA 4YOAA 5E5JA 4DJQA 2WECA 4LHHA 5P0JA 2Q63A 5P2TA 4EYRA 4MC2A 2WL0A 5P12A 5P78A 5P4IA 4OC6A 5P22A 1GVUA 2J9JB 3SA3A 1FFIC 1IBQA 3OQ7A 4R92A 4Q1XA 3EL5A 4J0TA 2I0AA 2P3CA 4Y44A 5P81A 4JECA 4D88A 4UPJA 2FDEA 4RVJA 3UQWA 5OZKA 1EC2A 9HVPA 2G94A 5P58A 1NH0A 5P7AA 2ZDZA 3L5FA 3EM6A 1Z1HA 1APWE 4GJDA 3ZPSA 1A8KA 1AJXA 5P5TA 2OHTA 5OZOA 5P82A 1EC1A 1B6PA 3VLAA 3L58A 5P2EA 2ZJLA 1BWAA 2QMGA 5P8JA 1GVXA 3OU1B 2J9KA 5P2JA 3T3CA 4BEKA 5P0BA 5P7GA 3VG1A 5P7LA 5P30A 5ISJA 1MIQA 1HSGA 5P7IA 5P6GA 3VV8A 2WF3A 5TOLA 5I3WA 5OZLA 3HZCA 3RTHA 1F34A 5UPJA 2I4DA 1FLHA 5KAOA 3UPJA 2PWRA 5P6XA 4B0QA 5P19A 4WY6A 2QI1A 4QJ6A 1LV1A 1B11A 5HE7A 3S43B 3Q3TA 4WTUA 3BUFA 4NPTA 3NU3A 1FQXA 5P3YA 2BBBA 4Y57A 5P27A 5P7WA 5DQ5A 4EP3A 4Y3FA 1MSMA 5DR4A 4I0IA 5P5FA 5P52A 1VIKA 3F9QA 2FNTA 4PZWA 2AZ8A 2BQVA 4HDFA 3TH9A 4K4PA 3CYWA 5P4MA 5P6EA 1YTJA 1F7AA 5OZQA 4D8CA 4Y3TA 2F3EA 4RROA 3MXEA 4H1EA 5HE4A 5P66A 4JPEA 4I8ZA 4CMSA 4EQJA 5P5SA 1EBZA 2BPVA 3SA5A 5P8MA 5P0UA 3KM4A 5P3AA 5P89A 3IN3A 5HU0A 2IRZA 1SGUA 4APEA 5P3LA 5HU1A 1K1TA 5P09A 2Z4OA 2P3BA 3EKYA 3OADA 2QCIA 4CKUA 2ZE1A 4Y56A 5KR8A 4H3IA 3G70A 5P4GA 3ZKSA 2CEMA 5P23A 5P25A 4EXGA 7UPJA 3GW5A 5P7YA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UH7 A;  3L5E A;  5P4Y A;  3OU4 B;  1TW7 A;  1NPV A;  1ZLF A;  5P3P A;  5EZZ A;  1FMX A;  1ODY A;  1D4S A;  2NPH A;  2NTR A;  2FXD A;  5ER1 E;  2PSU A;  5P5I A;  5P5Q A;  5P1R A;  5P4K A;  3VV7 A;  1ZSF A;  2V0Z C;  3OUC A;  3PJ6 A;  3TPL A;  1LYB B;  4FRI A;  4I0D A;  4NJU A;  5OZR A;  3IND A;  3LPJ A;  3UDM A;  4GJB A;  1AZ5 A;  3QI1 A;  2VJ7 A;  5P39 A;  4B78 A;  5OZC A;  2R3W A;  3NUO A;  1ODW A;  4Y3H A;  1HIH A;  1HPO A;  3R1G B;  3GI4 A;  1LF2 A;  1XE5 A;  2QI3 A;  2G22 A;  2SAM A;  3RU1 A;  2OHS A;  3SM1 A;  5ISK A;  4LXM A;  5P7D A;  1LYW B;  3OY4 A;  1W5Y A;  5P8Q A;  2ZHT A;  1M4H A;  3HBO A;  5P77 A;  3SA9 A;  5P38 A;  1C70 A;  4YDF A;  4CP7 A;  3SQF A;  4Y6M A;  3GI6 A;  1ME6 A;  4Y3Y A;  5P1J A;  5P0M A;  5J25 A;  3PMU A;  3UQX A;  1HEG E;  3PI5 A;  4IVS A;  5P0X A;  2V16 C;  4I1C A;  1IDA A;  2FGU A;  5COO A;  4F73 A;  5HDZ A;  1EBY A;  4JOO A;  1PPL E;  1BAI A;  2B60 A;  1D4H A;  5P3D A;  4Y5L A;  2QZL A;  5P6A A;  2NNK A;  2R5Q A;  2IDW A;  5P1C A;  1HEF E;  1W51 A;  1HTR B; 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 1QBU A;  1PSA A;  2I4U A;  3EC0 A;  2RKF A;  3WB5 A;  1EED P;  1FEJ C;  3KDB A;  2HB2 A;  2V11 C;  3NU4 A;  1T6E X;  2PMA A;  3N3I A;  2AOC A;  5P6Y A;  3WSJ A;  2H6T A;  5P8D A;  1YG9 A;  2Z54 A;  4Y3P A;  1ZJ7 A;  3L5D A;  2G69 A;  4Y4X A;  5P6Q A;  4GZF A;  1GNO A;  1D4L A;  5P24 A;  5P6D A;  5P7U A;  4F74 A;  3TOH A;  2ZJN A;  1GNM A;  5SY3 A;  3D91 A;  1LF4 A;  3SO9 A;  3DCR A;  3T6I A;  1UH8 A;  5P2Y A;  5P0F A;  1QS8 A;  3ZL7 A;  3TOG A;  1MPP A;  4YCT A;  3TTP A;  4ZSM A;  3S45 A;  4U7Q A;  3BGC A;  3SM2 A;  2I0D A;  2I4X A;  5ENM A;  3TPP A;  2AQU A;  2IS0 A;  2P83 A;  4DJW A;  4HZT A;  1YT9 A;  1M0B A;  5P1K A;  1B6L A;  3FKT A;  4BEL A;  3GGX A;  3QVI A;  4XXS A;  5C9F A;  3QRO A;  5OZF A;  4DFG A;  4Y39 A;  5P4R A;  3OHH A;  3A2O A;  5P49 A;  3OUD A;  1FQ5 A;  4HDB A;  3KT2 A;  5DR7 A;  4BFD A;  3PB5 A;  3LHG A;  4TVG A;  3IXJ A;  3LIQ A;  5P46 A;  4TVH A;  5P4V A;  1RQ9 A;  5P1F A;  1GVV A;  3HLO A;  4Y3W A;  1TQF A;  5DQ2 A;  5P56 A;  3SA6 A;  2B8L A;  5P7E A;  5P7X A;  5P73 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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