4RYGA

Renin in complexed with n-({(3s,4s)-4-[(benzylsulfonyl)amino]pyrrolidin-3-yl}methyl)-4-methoxy-3-(3-methoxypropoxy)-n-(propan-2-yl)benzamide inhibitor
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
339
structure length
336
Chain Sequence
TLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title trans-(3S,4S)-Disubstituted pyrrolidines as inhibitors of the human aspartyl protease renin. Part I: Prime site exploration using an amino linker.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Renin
total genus 89
structure length 336
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2014-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4rygA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4rygA01
5P68A 5P70A 1FG8C 5DGUA 4COEA 5P5LA 4B78A 4OD9B 1AAQA 1FQXA 5HTZA 3LNKA 2QZKA 3L5DA 3PB5A 4YOAA 3CYXA 1BDRA 3D1XA 3PWWA 5P5RA 3OHHA 4Y5LA 1DAZC 5P7IA 3KM4A 3NYGA 3DOXA 3S53A 5CONA 3LZYA 3SA9A 5ENMA 4NJVA 3SO9A 4YE3A 1ZSRA 1BWAA 4AUCA 4HA5A 5P1OA 1KJGA 3PEPA 5P1JA 3ZKGA 4DQHA 2AZ9A 4X2LA 3PSYA 5DQCA 4APEA 3ZPSA 2HC0A 5AHCA 1KZKA 5P10A 5P1VA 5KR8A 5P5OA 4Q1WA 3QROA 5P2DA 1F7AA 1HXBA 4I0GA 5TOLA 3QRSA 3O9HA 5P37A 5P0WA 5P4HA 2R5PA 5P6PA 3OGQA 5P2LA 1HSHA 5P0SA 3MSLA 5KQFA 1HTEA 3FNSA 4CPUA 1IDAA 2WF3A 5P71A 3KFRA 3UQXA 2IKOA 2WF1A 1BDQA 2APRA 2Q54A 1YT9A 3HLOA 3UPJA 3GGXA 2AOEA 4ACUA 2QD8A 5P0QA 4RCEA 2ZE1A 1EPPE 5P6NA 1SIPA 5DR4A 3QVIA 4ER1E 2OHRA 1CZIE 3H5BA 5P28A 3SKGA 2OHSA 3GI6A 5P4TA 3PBZA 2IENA 2CEMA 5P17A 5E5KA 5P3IA 4GYEA 3LZUA 3FNTA 5P49A 3AIDA 4TVHA 4Y4XA 5P3VA 1A30A 1SIVA 4WY1A 3NU3A 5DR8A 3D1ZA 1EEDP 3OUDA 2ZJHA 3QBHA 5OZRA 5OZGA 1IZHA 3SACA 5P7EA 1HVSA 5P31A 4JECA 2ZJKA 4DUSA 4GIDA 4PHVA 3S43A 5I3XA 1HTGA 3PM4A 3UQPA 4Y4EA 2XFJA 4Y44A 5P4WA 3Q70A 2WEAA 2J9KA 3TOFA 5P6ZA 5P1LA 1ZSFA 5P8RA 2OAHA 2HAHA 1MPPA 1TW7A 3OUCA 3OQKA 1G35A 3O9DA 3PGIA 5P7YA 4Y3TA 2P3BB 4Q1NA 1GVUA 2BPZA 2G21A 2SAMA 3I6OA 4I0JA 3MSKA 5P5HA 5P5JA 2PH6A 2QI5A 3IN3A 1BXQA 4Y37A 5HU1A 5KQZA 5P47A 3EKXA 1W6IA 5J25A 2V11C 1LF3A 2OHNA 4YCYA 2QHZA 5P1KA 3QI1A 2VKMA 5P6SA 5I3VA 4GJAA 1HHPA 3OU4A 4OBJA 3LIZA 2R43A 5P00A 1FQ8A 3IVIA 5P6LA 3T7XA 1ME6A 4CPSA 5E5JA 5P4XA 2B7ZA 4LXMA 5OYUA 2I4QA 5P29A 4J0VA 4F76A 3WB5A 3INFA 3EM3A 5P0IA 1T7IA 4EQ0A 3L5EA 1DPJA 3ZOVA 3LINA 5HDXA 3OOZA 4GMIA 5P27A 4DQBA 5P4PA 1XE5A 5AHBA 1RNEA 3VG1A 4TRZA 2RKFA 3AUPA 4D83A 4Q1YA 3SABA 1HSGA 4J1HA 2Q63A 5P1RA 2P8HA 5HDUA 4Y53A 4CPTA 2UY0A 5BRYA 3NLSA 1W5XA 3R2FA 4Y3GA 4EYRA 4J55A 4BFDA 4RGHA 1BXOA 4KB9A 1EBYA 2FLEA 4PEPA 1IVPA 4FAEA 1HRNA 3IXOA 5P74A 4ZLSA 2UPJA 5HCTA 5P5YA 3SM1A 4K4PA 5P18A 4Y3SA 5P64A 4Z2ZA 3UDHA 2VIEA 5P7AA 1ZP8A 3L58A 4FM6A 2NPHA 4A4QA 1B6LA 1W5YA 2F80A 5P38A 4Y3QA 3DK1A 4MC1A 5P76A 5DR0A 4PZWA 3EKQA 5P7LA 4OBDA 3VYFA 5P1UA 5HE4A 2ZHVA 5ISJA 2IGXA 2NMYA 3LIQA 5P4UA 3LPJA 2FXDA 4Y50A 5P1MA 5P1FA 5P0MA 2I0AA 2IL2A 2QI0A 2VJ6A 5P0UA 5SY3A 1PSNA 2WEDA 5P8LA 3T7QA 2WF0A 5OZWA 2BPWA 3FIVA 2ZHUA 3NDWA 1M43A 5P14A 4HDPA 4Y36A 4NJUA 1D4LA 4Y43A 4H3JA 5IVRA 5P42A 2ZHRA 3OADB 2WEZA 2QCIA 1LEEA 5OZ2A 2BBBA 4Y5KA 4R93A 1EPQE 5P35A 5OZ5A 4OBZA 5HCOA 5P1CA 3BRAA 5P3NA 4D88A 3KN0A 2IQGA 3EKWA 1TZSA 4LP9A 3BGBA 4R91A 4NKKA 5P2XA 1PPKE 5OZ1A 2VS2A 1A8GA 3Q6YA 4L1AA 2QHYA 5P2BA 5P7XA 4DJYA 4U7VA 5P08A 7UPJA 5P6MA 1SDUA 5P50A 2AOIA 2VJ9A 2OHTA 4B72A 3URJA 1BILA 4A6CA 5HE5A 1MERA 5P89A 5P8TA 3TTPA 5OZFA 2O4NA 1LYAB 2I1AA 5JG1A 3QN8A 5P7PA 1MT9A 3CYWA 2ER9E 3OHFA 4J0ZA 1TSUA 4OC6B 2JJJA 2O4KA 1YM4A 1FFIC 4RCFA 2P3CA 3BVAA 2ZJLA 3SA4A 3IXJA 4DPFA 3UDKA 4JPCA 5P07A 3OGPA 5P44A 4ER4E 1ZLFA 1A8KA 2Q3KA 3EM4A 3ECGA 3O9IA 5OZIA 3U6AA 2AOJA 3QP0A 4YOBA 1GVXA 5P6AA 2I4XA 4FSEA 5P4DA 2EWYA 5P36A 2R9BA 1MVPA 5P4EA 1SDTA 3G72A 5P5SA 5HU0A 2AOFA 2VIZA 5I70A 2ASIA 1HSIA 2WF4A 4CPWA 4J54A 5OYQA 5P3BA 5P3MA 3LITA 4ZE6A 2QI3A 5P8UA 5P2EA 1G0VA 5P8IA 5P03A 4Y3NA 5P1QA 4JPEA 5P3QA 2G1OA 3S85A 2Q11A 3DUYA 3VF7A 3VLAA 2NXMA 1XN3A 3DM6A 1IZIA 3R1GB 1HTFA 4DJUA 1E80E 2V12C 1LS5A 3CKRA 5P05A 4OD9A 3WB4A 5OYYA 2ANLA 3LIVA 3BC4A 5P4YA 3IA9A 3SA5A 5P6FA 5P33A 4RLDA 4J17A 4D89A 2WL0A 2Z4OA 5P88A 1MTBA 1W6HA 1YTIA 4HDBA 3QRVA 1A94A 3HAWA 2QMFA 4N00A 4Z4XA 5P7FA 1Q9PA 2IKUA 2PSVA 3NU9A 2Q15A 5P01A 5P6OA 5P7KA 1BV9A 5P26A 4Y4DA 4Z50A 4J5JA 1YM2A 5OZCA 5KAOA 4Y39A 2QD6A 2AVSA 1K2BA 2B8VA 4I1CA 2G1NA 2HM1A 5BWYA 3ZKNA 3KYRA 5T4SA 1LV1A 3WSJA 2R8NA 5P52A 3D91A 5P0LA 5P0TA 5P3CA 5P16A 4WTUA 3RSVA 3WZ8A 2AVQA 3KDCA 3TPJA 3INHA 1D4IA 4Y5NA 1SGZA 2VIYA 4YD6A 5P0ZA 2ER6E 5P5ZA 2ZJIA 4ZIPA 5P30A 3N3IA 1ZAPA 5P2NA 3HZCA 4EWOA 4ZPEA 5P7DA 3TLHA 3L38A 3EL9A 5P04A 5OZ7A 5OZJA 5P4MA 1BWBA 2OHUA 5SZ9A 5P3GA 3TNEA 2G26A 4Y3EA 4BELA 5P53A 1QRPE 5P5NA 4R8YA 1YTGA 5P5IA 2F3KA 5AH6A 3PWMA 3RTMA 4Y47A 5P09A 5P79A 2R3TA 1WBKA 4NPTA 1SBGA 4ZSPA 2QMDA 2I0DA 4Y5EA 3VSXA 1OEWA 4Y3HA 2QMPA 4Y4AA 5P0AA 5P7CA 3CKTA 5P8KA 4Y6MA 1RQ9A 3R4BA 5F01A 4KE0A 3VCMA 5OZYA 3D20A 1UH9A 4Y4BA 2I4UA 3KMYA 5P5UA 4YBFA 2FMBA 1AIDA 2IRZA 3N4LA 5ENKA 4ZPFA 4I8ZA 1RPIA 2P3DA 3OAGB 3SA6A 5P66A 3OQDA 1J71A 5P1TA 1B6JA 2P3BA 3ZKXA 3ZPTA 4AZYA 1NH0A 4MC9A 3UDPA 5P2VA 3OWNA 1NPVA 2BKSA 5P5TA 4EJ8A 4I8WA 3IVHA 9HVPA 1HVRA 6UPJA 1XL2A 2JE4A 4K8SA 1W5VA 1T7KA 4ER2E 5P5FA 2WEBA 4B0QA 2JXRA 1GVTA 1M4HA 5P46A 3ZKQA 3EMYA 4GJCA 3QIHA 5P3XA 4EXHA 1FKNA 8HVPA 1ZTZA 4J1FA 5P2OA 5DR3A 4B77A 1HIIA 5HDZA 2G20A 2RMPA 4ZEAA 5P48A 2Q64A 2ZJMA 1B6PA 1XDHA 4B1EA 2AZBA 4Y4ZA 3D1YA 1BVGA 1MUIA 1T3RA 2QP8A 2AOHA 4DQFA 4KUPA 5P58A 5P0HA 5P2ZA 1PSOE 1BIMA 4H3GA 2PH8A 5P4VA 5OZZA 3BHEA 1EBWA 1Z1RA 2NXDA 2QNQA 3UDJA 5P6GA 4B05A 4MC2A 5P3RA 1NSOA 5SY2A 4Y3DA 3VYEA 3R0WA 5P24A 5P8VA 3PSGA 5KR0A 4GJ5A 5P5KA 3M9FA 4AA9A 2AVVA 1AJVA 2F81A 4B70A 4FRKA 5I3WA 5KQXA 1VIKA 2HIZA 2WHHA 5OZ9A 3OXVA 5JFUA 5P2MA 2A1EA 1AXAA 5P5MA 5EZZA 4DJXA 2MIPA 3BVBA 1IDBA 3CKPA 3F9QA 4F73A 4Y3WA 2BB9A 4DJOA 2XYEA 1BBSA 1XL5A 3PI0A 1MESA 2CENA 1PPME 5P2JA 2OHLA 4RRSA 5P2UA 3OQ7A 5P69A 2XYFA 3T3CA 3FSMA 3OY4A 5P57A 1LYWB 2NNKA 5OZQA 5P19A 1ZPKA 4YD3A 5P0GA 5P2YA 2ZJNA 4APRE 3OADA 4FS4A 5P1BA 4NPUA 1DMPA 3G70A 5P2CA 1E5OE 3NDUA 2G94A 1YTJA 1T7JA 3S45A 4RZ1A 2V13A 5AH8A 1B6KA 1IIQA 4YA8A 4M8XA 5P34A 3BGCA 5P3DA 5P59A 3HBOA 4J1EA 5P60A 4QJAA 1ZBGA 5AGZA 3HAUA 1UPJA 2ZJJA 3INEA 5CLMA 1FQ5A 1TCWA 5P84A 1FQ4A 4ZSQA 2ZYEA 3U71A 4FIVA 3KDDA 4R95A 3O9LA 3MSJA 3BUGA 4CKUA 2G69A 3DCKA 1QBSA 1MSMA 1AM5A 5P3SA 5COOA 2F8GA 6APRE 1EPOE 5P15A 5P2GA 5P6BA 3KDBA 3EC0A 2B8LA 1LYAA 3NXNA 4FM8A 4LAPA 4HZTA 3MXDA 3SAAA 5HDVA 2Q55A 2JYSA 3LPIA 4OC6A 1TCXA 1WBMA 2F3EA 5OYRA 1PFZA 4TRYA 2AVOA 5P1EA 3L3AA 5P87A 1GVWA 4E43A 1F34A 5OZ3A 3PI5A 4K4QA 3K5DA 5P7WA 1EPNE 1TSQA 4FCOA 5P0RA 4I0ZA 3ST5A 2QK5A 3OOTA 4YD5A 2ZHTA 5ISKA 1KJ4A 3CICA 4Y4GA 3UHLA 5P1DA 3GI5A 3Q4BA 4F75A 2WJOA 4FM7A 3GGUA 5P3YA 3LZVA 3O99A 5C9FA 3A2OA 5P12A 2J9JB 4YD4A 5P2KA 4QJ8A 1E81E 1APTE 1JLDA 2QD7A 1MT7A 4RYCA 4OBFA 5P6HA 1DW6C 3OUAA 3LIYA 3KFSA 4Y5GA 5P5VA 5OZMA 1HVCA 3UFLA 2QI6A 2NNPA 3GI4A 4Q5MA 5P7JA 3APPA 5OZBA 4Y9WA 3RVIA 1B5FB 5OYSA 4F74A 3RTNA 2XFKA 2WF2A 5DGWA 5P20A 3CIBA 6FIVA 4YDGA 3BUHA 5P7TA 1OEXA 4Y3YA 1K1UA 1HVIA 5P2HA 1APVE 4Y4UA 5OYWA 5OZ4A 5P3LA 1YTHA 5IE1A 4OBGA 2G24A 2RKGA 4RVXA 4ZSMA 3L5BA 2P83A 3SA3A 3KFNA 5P43A 5P3PA 3QVCA 4Y3PA 1WKRA 3HDKA 5P4SA 4I0EA 4H3IA 3ZKSA 2AZ8A 5P8AA 4GJ9A 5KOQA 1FEJC 3I7EA 4DI2A 1FMBA 5P8NA 5P1HA 3SPKA 4RROA 2BPYA 3QBFA 3OU3A 5P8SA 4A6BA 4DV9A 1GKTA 1SP5A 1HVJA 5P5BA 2IGYA 3O9CA 5P5WA 3TPPA 1SGUA 4Y5AA 4DJWA 4RYGA 5OZAA 5OZ6A 5P1GA 2AVMA 5P0YA 1BAIA 5P5AA 1HIVA 1HIHA 3OTSA 1KJFA 4RVJA 1BVEA 1XE6A 1ODYA 4EXGA 1HEFE 1HVHA 1K2CA 3UQUA 3ER5E 1K6VA 4EQJA 5P6CA 5EZXA 5P8BA 5P22A 3K4VA 5P5XA 3B80A 1HXWA 1NPWA 4Y3XA 2PSUA 4CPQA 5OZEA 2OHPA 4J1IA 5P2RA 5P3TA 4NJTA 4PPHA 3L5FA 1HPXA 5OZVA 2QAKA 2PYNA 4GJ8A 2PWRA 3OUBA 3URLA 2PWCA 2CEJA 4U8WA 3EL1A 5KR2A 5P3EA 3PCZA 5P2FA 5P73A 4GJDA 4FRJA 4I0IA 4XXSA 5P4BA 1FLHA 1SMRA 3NUJA 3NSHA 3GI0A 5P1XA 5C9BA 5P7QA 4X7IA 3PCWA 5KQYA 5P7OA 5P7GA 4EPJA 5P32A 3DJKA 5P45A 3H0BA 3BXSA 4RRNA 2O4PA 4Y38A 5P0DA 4B1CA 5C9DA 1K6CA 5P6JA 1MIQA 1EC3A 1QDMA 4Y5MA 3KA2A 3BXRA 5P6UA 3URIA 4BEKA 1EAGA 5P13A 5P2WA 2QZWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P68 A;  5P70 A;  1FG8 C;  5DGU A;  4COE A;  5P5L A;  4B78 A;  4OD9 B;  1AAQ A;  1FQX A;  5HTZ A;  3LNK A;  2QZK A;  3L5D A;  3PB5 A;  4YOA A;  3CYX A;  1BDR A;  3D1X A;  3PWW A;  5P5R A;  3OHH A;  4Y5L A;  1DAZ C;  5P7I A;  3KM4 A;  3NYG A;  3DOX A;  3S53 A;  5CON A;  3LZY A;  3SA9 A;  5ENM A;  4NJV A;  3SO9 A;  4YE3 A;  1ZSR A;  1BWA A;  4AUC A;  4HA5 A;  5P1O A;  1KJG A;  3PEP A;  5P1J A;  3ZKG A;  4DQH A;  2AZ9 A;  4X2L A;  3PSY A;  5DQC A;  4APE A;  3ZPS A;  2HC0 A;  5AHC A;  1KZK A;  5P10 A;  5P1V A;  5KR8 A;  5P5O A;  4Q1W A;  3QRO A;  5P2D A;  1F7A A;  1HXB A;  4I0G A;  5TOL A;  3QRS A;  3O9H A;  5P37 A;  5P0W A;  5P4H A;  2R5P A;  5P6P A;  3OGQ A;  5P2L A;  1HSH A;  5P0S A;  3MSL A;  5KQF A;  1HTE A;  3FNS A;  4CPU A;  1IDA A;  2WF3 A;  5P71 A;  3KFR A;  3UQX A;  2IKO A;  2WF1 A;  1BDQ A;  2APR A;  2Q54 A;  1YT9 A;  3HLO A;  3UPJ A;  3GGX A;  2AOE A;  4ACU A;  2QD8 A;  5P0Q A;  4RCE A;  2ZE1 A;  1EPP E;  5P6N A;  1SIP A;  5DR4 A;  3QVI A;  4ER1 E;  2OHR A;  1CZI E;  3H5B A;  5P28 A;  3SKG A;  2OHS A;  3GI6 A;  5P4T A;  3PBZ A;  2IEN A;  2CEM A;  5P17 A;  5E5K A;  5P3I A;  4GYE A;  3LZU A;  3FNT A;  5P49 A;  3AID A;  4TVH A;  4Y4X A;  5P3V A;  1A30 A;  1SIV A;  4WY1 A;  3NU3 A;  5DR8 A;  3D1Z A;  1EED P;  3OUD A;  2ZJH A;  3QBH A;  5OZR A;  5OZG A;  1IZH A;  3SAC A;  5P7E A;  1HVS A;  5P31 A;  4JEC A;  2ZJK A;  4DUS A;  4GID A;  4PHV A;  3S43 A;  5I3X A;  1HTG A;  3PM4 A;  3UQP A;  4Y4E A;  2XFJ A;  4Y44 A;  5P4W A;  3Q70 A;  2WEA A;  2J9K A;  3TOF A;  5P6Z A;  5P1L A;  1ZSF A;  5P8R A;  2OAH A;  2HAH A;  1MPP A;  1TW7 A;  3OUC A;  3OQK A;  1G35 A;  3O9D A;  3PGI A;  5P7Y A;  4Y3T A;  2P3B B;  4Q1N A;  1GVU A;  2BPZ A;  2G21 A;  2SAM A;  3I6O A;  4I0J A;  3MSK A;  5P5H A;  5P5J A;  2PH6 A;  2QI5 A;  3IN3 A;  1BXQ A;  4Y37 A;  5HU1 A;  5KQZ A;  5P47 A;  3EKX A;  1W6I A;  5J25 A;  2V11 C;  1LF3 A;  2OHN A;  4YCY A;  2QHZ A;  5P1K A;  3QI1 A;  2VKM A;  5P6S A;  5I3V A;  4GJA A;  1HHP A;  3OU4 A;  4OBJ A;  3LIZ A;  2R43 A;  5P00 A;  1FQ8 A;  3IVI A;  5P6L A;  3T7X A;  1ME6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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