4XX4A

Renin in complex with (4s)-4-isopropyl-4-methyl-6-oxo-1-(3-(2-oxo-4-phenylpyrrolidin-1-yl)benzyl)tetrahydropyrimidin-2(1h)-iminium
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
339
structure length
339
Chain Sequence
TLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Iminopyrimidinones: a novel pharmacophore for the development of orally active renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Renin
total genus 91
structure length 339
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2015-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4xx4A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4xx4A01
5OYZA 4RRSA 3EM6A 3ZKSA 4APEA 2BKSA 1WKRA 5P1OA 4J0ZA 3TOFA 5P18A 2VKMA 3KMYA 5P4XA 3EL5A 5P5VA 1IZDA 3HZCA 4ER1E 1SDTA 5OZQA 3QBFA 4CP7A 4GYEA 4RCEA 4H3FA 3F9QA 4CPQA 3KA2A 5P2UA 3FSMA 5ER1E 1APUE 5P8DA 4ZSPA 3UDRA 5P3SA 4DJPA 1EPRE 5OYVA 4B72A 5P62A 1W5YA 3IA9A 4RRNA 5KR0A 3ZOVA 4FGXA 1EC1A 5P3WA 3UQXA 5OZDA 4OBDA 3C9XA 5P8TA 3QVIA 3SACA 1ZSRA 4I8ZA 4E43A 4ZIPA 2FGUA 3PRSA 3QN8A 3T7QA 1A30A 3D3TA 4WY6A 3UQUA 3Q5HA 1SP5A 2QD7A 1IZEA 3RSXA 2P3BA 2HC0A 2B42A 4YOAA 4COEA 5P5GA 4U8WA 3I7EA 4RVIA 5P4NA 2PSVA 2A1EA 1UPJA 4BFBA 3OU4B 3EMYA 4Z50A 2IS0A 4EXHA 1GNMA 1HTGA 5P2VA 3K5DA 2NXMA 3SA4A 4J1FA 4ZLSA 1TSUA 5P6OA 2R43A 3VF7A 2AOJA 5AHAA 1HPXA 1MT8A 3R0YA 3R0WA 2QNNA 4J5JA 2AZBA 3LPKA 3SAAA 4FE6A 3VFAA 3Q70A 1MIQA 1BAIA 4LP9A 4RYGA 1SBGA 1TCXA 1W51A 5APRE 3PHVA 4D83A 2VIEA 2J9JB 3O9LB 1LF3A 3QPJA 3OY4A 3UDHA 3R2FA 4GZFA 3LHGA 1E80E 3BVBA 1BDQA 1DIFA 5OZNA 2G94A 2IQGA 3BRAA 2F3FA 2ZHUA 5P23A 2ZJJA 3OADA 1SIVA 3QP0A 1M43A 1MRWA 5P5CA 3OUDB 1T7KA 2IL2A 4L6BA 3FNSA 4Q1YA 5HDVA 1EC2A 3LPIA 2V10C 5OZVA 2G20A 1GNOA 5F00A 4B1EA 5OZCA 3VYDA 4I1CA 3MXDA 1EEDP 5P0RA 4DQCA 2HPFA 7UPJA 1QRPE 3Q4BA 5P0AA 4Y5PA 5AH6A 3OU1B 5P3JA 5P3XA 5P65A 4OBZA 4I0IA 5OYXA 5P30A 3ZMGA 5UPJA 4FIVA 4ACUA 4YD4A 5I70A 5TOLA 1EPME 1IIQA 2AOFA 3VSWA 4PZXA 3EC0A 4DUSA 4ZE6A 4BEKA 2HB2A 2PH6A 4IVTA 2UPJA 4Y5GA 3QI1A 5P5EA 2Z4OA 5E5JA 5IVRA 5JFUA 4RCFA 3FKTA 4YD3A 5P1GA 2OHUA 2QI6A 5P42A 1F34A 3OGQA 3NLSA 1DP5A 1QBRA 3GI5A 3O9HA 4GJDA 5P89A 5AGZA 3TPRA 3EKQA 5JODA 1HPVA 2I0DA 2PSUA 2O40A 5P4ZA 4I10A 4Y3XA 5P5UA 5P2IA 4MC6A 3NYGA 1FF0C 1OEXA 5P3NA 4QLHA 4CPRA 3OQ7A 5B18A 1G35A 1RQ9A 4Y38A 3OAGB 5P3IA 5P1JA 5P2BA 4QJ9A 4I0FA 5P0XA 2R5PA 5P02A 2VS2A 4KUPA 4YBIA 4JPEA 1XDHA 5P7JA 4K4QA 5P1WA 5OZ2A 1FG8C 4U7VA 4Y57A 4D85A 4HE9A 3PGIA 2PWCA 4Y3DA 3HAUA 2V12C 1ZTZA 1QBUA 3OOZA 5HDUA 5P8MA 5OZ9A 5P76A 4MC2A 4PYVA 5P6KA 3S45A 1AZ5A 5P2JA 1W50A 1GNNA 4NPUA 1HIVA 3IGBA 4CMSA 5P08A 5P2DA 5P87A 5OZYA 5P6IA 2QZLA 5P6SA 3HVPA 2I1AA 1FGCC 3AUPA 3CYWA 3O9IA 2CEMA 3S43B 5P0DA 1MERA 2IDWA 3OXWA 1XE5A 4B78A 3U6AA 2WEAA 2B7ZA 2XFIA 5P4PA 4DQGA 5P7RA 4YCTA 4EWOA 2VJ9A 4Y47A 5KOSA 3SM1A 2F3EA 1SIPA 5P7LA 3LPJA 3PLLA 1UH8A 3HD8A 2FXDA 5DQ1A 2I4WA 4Y3AA 4GJ5A 4Y4BA 4OC6A 5P16A 1HXBA 2JJIA 4Y43A 5P56A 1KJ7A 3O9EA 5OZ5A 3TOHA 3VLBA 1UH7A 2F3KA 4DPFA 5P00A 5P1HA 1LF2A 4Y3YA 5P1IA 2AQUA 5P1TA 5P0OA 5P5QA 4DJVA 5KQZA 2NR6A 3GGUA 3RTMA 2HS2A 2I0AA 4U7QA 4WTUA 3NSHA 4LXAA 2PWRA 3DOXA 1QBSA 1MEUA 3O9BA 1W6IA 4NKKA 1UH9A 4J0VA 3ZKNA 2FDEA 5P3QA 3B80A 3UDKA 5E5KA 3IN3A 2BPVA 5P22A 2QAKA 5I3XA 4L7JA 3LIZA 3EM3A 5IS4A 4XX3A 3UTLA 2P3AA 1HSGA 4RLDA 2FXEA 2AODA 5P7FA 5P5XA 4TVGA 3KMXA 2WECA 2OF0A 5P8HA 5P8QA 3VFBA 1NPVA 2HS1A 1HVHA 2O4KA 3L5BA 3QRSA 1LYWA 4Y39A 4GJ6A 3VYFA 4Y53A 4I12A 3HW1A 5P7TA 2FNSA 1FQXA 4CPSA 5OYQA 5P5PA 4Y4DA 5P3HA 1HVJA 2ZYEA 1Q9PA 2QMFA 3INHA 5I3VA 4L7HA 5P1QA 2BPYA 4Y3EA 5P71A 2RMPA 1IZIA 1DMPA 4D89A 1SDUA 1B5FA 1APTE 1N49A 3LZUA 3TL9A 4D88A 2R5QA 1YT9A 3ZKXA 5P70A 1PSOE 2I4DA 5OZAA 4KE0A 1HEFE 5SZ9A 2J9KA 4D8CA 2QI0A 2B7FA 5HCOA 4Y5EA 5P78A 1PROA 4RROA 6APRE 1B11A 3R1GB 5P0KA 5P38A 2QZXA 2QI3A 5P3GA 2V13A 3PWWA 4Y3LA 3MXEA 4Y3MA 5P7DA 4FM7A 3PCZA 5OZRA 5P84A 1YTIA 2G27A 2A4FA 3I8WA 1HTFA 5P4FA 1BVGA 1MTBA 5P4IA 4OBHA 4NJSA 5DR8A 2R3TA 4FM6A 5COKA 4I0GA 2HIZA 5P63A 2AZ9A 2OHQA 4F76A 1LYAB 5HE7A 3PBZA 1FQ7A 5P44A 2O4SA 4APRE 1D4IA 5P1YA 3INFA 5P40A 1D4YA 4Y3HA 5P34A 1FQ4A 1SGUA 3M9FA 4LXKA 5P4AA 4DJUA 5P2ZA 1PPKE 2ZHVA 1OD1A 5OZ0A 1CMSA 5P67A 1AAQA 2QI1A 2BPXA 2VIJA 4GJBA 5P4MA 5P66A 2QI5A 1MT7A 3D1YA 5P15A 3ZKGA 1GVXA 3KFSA 5P7ZA 1TSQA 3EKWA 1PPME 5P4HA 4YDGA 1EAGA 3IAWA 3FNTA 1QBTA 1ZSFA 4XKXA 5P3UA 4K8SA 5P68A 4Y5LA 2OHSA 2PC0A 5P6YA 1XN2A 1FKNA 4J1CA 5OZMA 1T7JA 5P51A 2P8HA 4NJVA 1DW6C 4JP9A 4YE3A 5P5BA 5AH8A 5ENMA 3VF3A 1XL5A 3S8IA 5P4DA 4AZYA 3HLOA 2NNKA 3OTYA 2QZWA 3TKWA 5I3WA 3ZKMA 5OZ6A 4F75A 5OZFA 1A8GA 5OZHA 5P0WA 1HSHA 5P2GA 5P1AA 4A6CA 4Z22A 2WHHA 5P1MA 5P6EA 1LS5A 4EXGA 3OUCA 5J25A 5P1KA 2G24A 4HEGA 3IXKA 1C6YA 1YTGA 3CKRA 5P06A 5P2HA 5P6TA 4QJ7A 2QHYA 4Y3PA 1XL2A 5IE1A 3OGPA 1EPOE 3LZSA 4Y4ZA 5P0LA 3K4VC 5P86A 5P8UA 5P4QA 5P5MA 4DQEA 5HTZA 1EC0A 1ZAPA 2CENA 3NUOA 2AVMA 1Z1RA 3ZKQA 5P53A 3O9AA 3SPKA 1A94A 5ER2E 5KQXA 3NWXA 3OU3A 4TRWA 5P19A 4L1AA 1YX9A 4DVFA 4I0HA 3SFCA 1M0BA 3EKTA 1FQ8A 5P8EA 5P1UA 1APWE 4DJYA 5P09A 5P6CA 1B6KA 3KFNA 5P6HA 4GJ9A 4NJTA 3PJ6A 5DR7A 5P6UA 4I0DA 1AVFA 3INDA 3L38A 3LIXA 5P7IA 3NDWA 4NJUA 3DV5A 3D1ZA 5OYTA 4FAEA 2QK5A 1D4KA 3ZPUA 2AOEA 5P2EA 4F74A 4X2LA 4DQBA 2PMAA 4ER2E 4DH6A 2PK5A 3GI6A 4J17A 1YM2A 4Y54A 1BIMA 3UQPA 4HDBA 4Y3FA 2VJ6A 5P43A 5DQ5A 3U71A 3PMUA 4L7GA 2ZJKA 5DQCA 4EJLA 5P0HA 1D4JA 4Y58A 2QI4A 3NU4A 3SKFA 5P2NA 5P7BA 4FRSA 3UDJA 2QMPA 1NSOA 4DV9A 1G6LA 1W5VA 2G1NA 1M4HA 4OBGA 3KN0A 4ZSQA 5P1LA 1FFFC 4AUCA 2AOIA 3I25A 4K9HA 5P60A 5P8SA 2HM1A 5JFPA 4Y44A 3VV6A 3PBDA 4J0TA 5P3ZA 1QS8A 3A2OA 5P41A 4B05A 2QHCA 4LL3A 5P25A 4J55A 5OZKA 4DJXA 2BPWA 6UPJA 4DJOA 2AOGA 5P04A 2XYFA 3FX5A 3MWSA 2P3DA 1META 1G2KA 3SA8A 3SQFA 5P48A 2QI7A 3NU5A 1HVIA 5P3DA 1EC3A 2ZHRA 4Y5AA 1DAZC 1HIIA 3WB5A 5P7UA 5CONA 2FIVA 5CLMA 5P75A 1BWAA 4GJ8A 5P3YA 2ZHSA 4A4QA 5P0TA 1D4LA 4LXMA 2ZJNA 5P1ZA 4Y5MA 2FNTA 4QGIA 2OHTA 5P5OA 3CIBA 1W5WA 1ER8E 3PM4A 3NXEA 4YBFA 3BGCA 5P0QA 4EJKA 4Y3JA 2ER9E 5P3KA 3URIA 1B6JA 4DFGA 3TLHA 4DQHA 5EZZA 3O9FA 3ER5E 3S7MA 2QZKA 5OZJA 2HPEA 4EP2A 4Q1WA 5P33A 5P2WA 4GB2A 1HVRA 4ACXA 1HXWA 2VA5A 5P7PA 4J54A 4TRYA 3OQFA 5P8JA 1LYBA 5P6AA 1MRXA 3UHLA 4HA5A 2VJ7A 4MC9A 3URJA 2R38A 2APRA 1SDVA 5P17A 2ZJHA 4Y35A 3EKXA 1EBKC 3OK9A 5DR0A 3EKVA 2QD8A 4Y4GA 1KJFA 2G1RA 4TRZA 3T6IA 5JG1A 2P3CA 1BXQA 4PZWA 5P5DA 3KDDA 5P5HA 1E81E 4Y4AA 1SGZA 1YG9A 4ZSMA 5P1RA 1LZQA 3JW2A 5P5KA 4Y3GA 2AVOA 4Y4TA 3ST5A 2NMZA 1HVLA 5P2FA 5P7MA 4CPWA 9HVPA 4RGHA 2OHLA 4B77A 5OZWA 2BJUA 3N3IA 2QNQA 1TQFA 1HIHA 5P5WA 5OZGA 5P6RA 2AVVA 5P8NA 4Q1XA 4Y37A 2WF0A 3UPJA 2FLEA 5AHBA 5P7GA 4Y48A 1HTEA 3T7PA 5P64A 4XXSA 3DJKA 4K4PA 5P4JA 1YTJA 4JECA 3UF3A 5P3OA 2P83A 5SY3A 4J1HA 3GGAA 5P73A 1NH0A 1EPPE 4H3GA 2HAHA 3L5EA 1FIVA 2FS4A 4OBKA 3HBOA 1LYAA 2VA7A 3IN4A 5HDXA 5DPZA 2PK6A 1T6GA 2F80A 3PB5A 1XS7D 3VSXA 3PSYA 3OXCA 5ENKA 2ZDZA 3IXOA 1HEGE 5P4YA 1G0VA 3K1WA 5P2XA 1FFIC 3OADB 3RU1A 1FB7A 5P6JA 1T7IA 1FQ5A 1GVVA 2IRZA 3UQWA 1IVQA 1KJHA 5P2OA 5P32A 3OOTA 2BPZA 3S54A 4I11A 5P2TA 3VCMA 3T3CA 4FCOA 5P88A 4Y4UA 2G69A 5P61A 3L58A 5P52A 5P4UA 2IKUA 5P12A 4ZPEA 5P7CA 3D1XA 5OZXA 2AVQA 1MSNA 2AZ8A 3L5DA 4RYCA 4S1GA 5HD0A 5P7XA 2HB3A 3Q6YA 5P39A 4A6BA 3DUYA 5P05A 4RVJA 5P01A 1TZSA 1HHPA 3WB4A 1FMBA 1K6TA 4CKUA 3DK1A 3S56A 2IGYA 5P28A 3TPJA 3U7SA 3NU9A 2I4QA 3PI5A 3PMYA 5P3FA 3LZVA 2PH8A 5P6PA 3KYRA 5P5YA 2NXDA 2ZGAA 2I4UA 3SA6A 5P0MA 3NDXA 5KQFA 2NPHA 4R93A 3O9CA 2AOHA 2O4LA 4OD9A 5P1BA 4Q5MA 5P36A 2B60A 4Y4XA 1APVE 5P5NA 5P5IA 3SA7A 1EPNE 4QJ2A 1HBVA 4YOBA 1LEEA 3NDTA 2O4PA 4Y5KA 5P4GA 4B00A 4ER4E 4KB9A 5SY2A 3TH9A 2BB9A 5DR4A 5HE4A 2WKZA 1RNEA 5P3CA 2I4XA 3OUBA 3EKYA 5P1CA 5P7KA 3N4LA 5P8AA 4Y4JA 1ZLFA 5BS4A 4GJAA 1MT9A 1BVEA 1F7AA 3PSUA 3UDYA 5BWYA 2WL0A 2V0ZC 1GVWA 1ZPAA 3K5CA 3EL9A 3H5BA 2G26A 5P79A 5HU0A 5OZEA 5P6FA 5F01A 3SA3A 2G21A 1Z8CA 3EL0A 1VIJA 2MIPA 2G1YA 5P6MA 4F73A 2ZHTA 4BFDA 1HVKA 5P1NA 5P8CA 3PI0A 5P0YA 5P69A 4Y6MA 4N00A 5P5LA 4FM8A 5IVQA 5P4EA 4B70A 5P31A 4YA8A 5P5AA 5P0SA 5OYUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5OYZ A;  4RRS A;  3EM6 A;  3ZKS A;  4APE A;  2BKS A;  1WKR A;  5P1O A;  4J0Z A;  3TOF A;  5P18 A;  2VKM A;  3KMY A;  5P4X A;  3EL5 A;  5P5V A;  1IZD A;  3HZC A;  4ER1 E;  1SDT A;  5OZQ A;  3QBF A;  4CP7 A;  4GYE A;  4RCE A;  4H3F A;  3F9Q A;  4CPQ A;  3KA2 A;  5P2U A;  3FSM A;  5ER1 E;  1APU E;  5P8D A;  4ZSP A;  3UDR A;  5P3S A;  4DJP A;  1EPR E;  5OYV A;  4B72 A;  5P62 A;  1W5Y A;  3IA9 A;  4RRN A;  5KR0 A;  3ZOV A;  4FGX A;  1EC1 A;  5P3W A;  3UQX A;  5OZD A;  4OBD A;  3C9X A;  5P8T A;  3QVI A;  3SAC A;  1ZSR A;  4I8Z A;  4E43 A;  4ZIP A;  2FGU A;  3PRS A;  3QN8 A;  3T7Q A;  1A30 A;  3D3T A;  4WY6 A;  3UQU A;  3Q5H A;  1SP5 A;  2QD7 A;  1IZE A;  3RSX A;  2P3B A;  2HC0 A;  2B42 A;  4YOA A;  4COE A;  5P5G A;  4U8W A;  3I7E A;  4RVI A;  5P4N A;  2PSV A;  2A1E A;  1UPJ A;  4BFB A;  3OU4 B;  3EMY A;  4Z50 A;  2IS0 A;  4EXH A;  1GNM A;  1HTG A;  5P2V A;  3K5D A;  2NXM A;  3SA4 A;  4J1F A;  4ZLS A;  1TSU A;  5P6O A;  2R43 A;  3VF7 A;  2AOJ A;  5AHA A;  1HPX A;  1MT8 A;  3R0Y A;  3R0W A;  2QNN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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