5APRE

Structures of complexes of rhizopuspepsin with pepstatin and other statine-containing inhibitors
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
AGVGTVPMTDYGNDIEYYGQVTIGTPGKKFNLDFDTGSSDLWIASTLCTNCGSGQTKYDPNQSSTYQADGRTWSISYGDGSSASGILAKDNVNLGGLLIKGQTIELAKREAASFASGPNDGLLGLGFDTITTVRGVKTPMDNLISQGLISRPIFGVYLGKAKNGGGGEYIFGGYDSTKFKGSLTTVPIDNSRGWWGITVDRATVGTSTVASSFDGILDTGTTLLILPNNIAASVARAYGASDNGDGTYTISCDTSAFKPLVFSINGASFQVSPDSLVFEEFQGQCIAGFGYGNWGFAIIGDTFLKNNYVVFNQGVPEVQIAPVAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of complexes of rhizopuspepsin with pepstatin and other statine-containing inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RHIZOPUSPEPSIN
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Rhizopus chinensis
total genus 89
structure length 325
sequence length 325
ec nomenclature ec 3.4.23.21: Rhizopuspepsin.
pdb deposition date 1989-08-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5aprE01
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5aprE02
2HB4A 3Q4BA 4KUPA 3SA6A 5P3CA 1ZP8A 4H3IA 3HAWA 3PB5A 3R4BA 4JPEA 4HDFA 5P2KA 5P7IA 2Q3KA 3OQFA 4OBFA 5P4WA 5OZKA 4Y3HA 1AJVA 1GVXA 3SA8A 3AUPA 3OXVA 2ASIA 5OZSA 3UTLA 1C6XA 5OZEA 1BVGA 4I0FA 1EC1A 3TPLA 1LYAB 2I4VA 3ZLQA 5P1RA 2P3CA 2Q54A 3UCBA 4PPHA 3H0BA 4ZLSA 3TPJA 2CEJA 1E81E 4OBGA 5P4UA 4CKUA 2BPVA 4CPSA 5KQFA 5P0VA 5P8AA 5P73A 5BWYA 5ENKA 1HTGA 5HU0A 4BFDA 1ODYA 3SABA 4Y5BA 2QP8A 2ER7E 1ZPAA 4Y56A 3URIA 5P6CA 2XFJA 5P00A 2QHZA 5DGUA 3HW1A 2G26A 4GJ7A 4MC2A 3K4VC 4OC6B 5P81A 1UH8A 5P5AA 3OK9A 3PI5A 1J71A 1K2BA 3OOZA 3ZKGA 4WY1A 3ZKSA 1B5FA 2OHTA 2A1EA 4TVHA 4Z4XA 3UQXA 4DJOA 3CKPA 2ZJJA 3OAGA 3TOHA 5P1KA 1YM4A 1XN2A 2R3TA 5P0GA 1EPOE 4Y3WA 5P5QA 4J55A 3RTHA 2WF3A 5P1JA 2AOJA 5P57A 5P5EA 5P8FA 5P6HA 1HBVA 9HVPA 4Z50A 3DV5A 5P58A 4EQ0A 3MSLA 3U71A 4DJQA 3NU5A 1C70A 5P5DA 1BV7A 4RCFA 4CP7A 5P8SA 4FRSA 4L6BA 5P2VA 3OQDA 4PZWA 1PPLE 3R0WA 3VYEA 4ZPFA 3S43B 1AXAA 2ZHRA 3S53A 3CYWA 3NLSA 1D4JA 3KN0A 1FG8C 5P7WA 2AOHA 5P26A 3DV1A 2PSUA 5I3YA 1AZ5A 4OBHA 1F34A 5P11A 5P8BA 1NSOA 4LXKA 1MRXA 3KT2A 4B1EA 2Q55A 4OD9A 1W51A 4FSEA 1PSNA 2QD6A 5P1BA 4S1GA 4EJDA 5P1QA 4NJVA 4NPUA 2QHCA 3ZKNA 2BPZA 4DQEA 3IN3A 1DAZC 1YT9A 4R91A 3ECGA 1GVUA 2OAHA 4ZPGA 4DPIA 2V0ZC 5KR8A 2UXZA 1HTFA 1PROA 4TRZA 3SACA 4H3GA 4L7HA 4B78A 4YD7A 4DJPA 1MRWA 3O9IA 5P2XA 3UHLA 5P68A 3I8WA 1XL2A 1B6MA 3OXCA 4YHQA 4Y5EA 4QJ2A 1PSOE 3UF3A 4FRJA 5P5ZA 3QROA 3UDNA 3EL9A 3OU4A 1AJXA 5OZ5A 4B05A 3U7SA 4Y3NA 3EC0A 2OHUA 1EBKC 3PCZA 3FNTA 3KMYA 1T7IA 3I2LA 5P3OA 5KQYA 3QRVA 1SMEA 5P8TA 3UDKA 1TZSA 3VEUA 4Y5AA 5P5OA 4DJUA 2F81A 3PRSA 5P5PA 1EAGA 3OUAA 5HDXA 5P36A 5OZNA 4I0ZA 3PVKA 5P8EA 1MIQA 3ZMGA 5F00A 3JVWA 1W5WA 3PMYA 4J5JA 2QI7A 4Y48A 2O4PA 1GNMA 3PEPA 5P6ZA 3TTPA 3KA2A 1HPVA 2NXDA 5P6JA 5OZWA 1E5OE 1XE6A 5P5XA 1LYBB 4L1AB 3LZSA 4Y3PA 2PYMA 4X7IA 4Z22A 4Y54A 4FE6A 5OZIA 4GMIA 4I0GA 3VV7A 1RL8A 5P75A 5P3IA 4RYCA 5AH6A 3QBFA 4Y43A 3KYRA 2ZDZA 5P8DA 1D4LA 3ZPUA 1T6GA 3NUJA 1HVKA 4R92A 5JG1A 2QNPA 3OU1B 3SFCA 4Q1XA 4FIVA 5P72A 4Y4XA 2OHPA 4RCEA 2AOEA 2O4SA 4GJ9A 5P46A 3JW2A 4Y5MA 3TOFA 1UH9A 3EKYA 5P0HA 3IN4A 2AZCA 5P4ZA 1TSQA 4EP2A 1HEGE 5P0EA 5COOA 3PHVA 4K4PA 2AZ9A 2P83A 4B77A 4I0IA 3SO9A 4Y39A 2WEAA 3EL4A 4FGXA 5P1LA 2FXEA 4J0ZA 5DQ4A 4R93A 4I0DA 5P6EA 5P6SA 1ODXA 1FFIC 4EYRA 5P18A 3NXEA 3BXSA 3C9XA 1HIHA 2BBBA 4GJDA 5P0RA 5P4IA 5P5WA 3L5EA 2I4XA 1HEFE 3S8IA 5KOSA 2WKZA 2VIZA 2BPXA 2V13A 5P5UA 2WF4A 4HDBA 2QU2A 3EKTA 4Y3GA 1YTJA 5P1VA 2HS1A 3OHFA 5P6XA 5P8VA 3QS1A 5P24A 1K2CA 1TW7A 2VA5A 5P3VA 1IZIA 1GKTA 3F9QA 4J0YA 5P0NA 4J54A 5P25A 3VF3A 5P5KA 1B6KA 5COKA 3LNKA 5P7YA 3APPA 1MSMA 5DR3A 1A94A 3NWXA 5P0YA 5P47A 3B80A 3T3CA 5P5SA 4LXAA 2QI6A 2ZJHA 3U6AA 3IVHA 5DQ5A 4I0JA 2QZKA 1EC2A 5P2CA 3INDA 2QMFA 5P55A 4XXSA 5OZ6A 1AIDA 3GGXA 1QBSA 1KJHA 1BIMA 1EEDP 1XS7D 2OHLA 5P45A 4IVTA 5OZPA 4MC6A 3A2OA 1APVE 5HU1A 3TLHA 1YM2A 5ISJA 4YD6A 1FFFC 5P3BA 4D85A 3QRSA 5P8IA 3O9GA 4Q5MA 5P4NA 2G69A 4Y9WA 2B8LA 3Q6YA 2G27A 3EM6A 2HPEA 3NU9A 4LHHA 1GNOA 3OADB 5HE7A 3SA7A 5P5LA 2WECA 3Q5HA 3WB4A 1MESA 2F3FA 4U8WA 4APEA 2B60A 3QVIA 5BRYA 3EKQA 3GI4A 2B8VA 1BV9A 2ZHUA 5HDZA 4NJTA 3OTSA 2QI3A 4RCDA 4Y41A 3QVCA 5P87A 4HLAA 4FAEA 1M0BA 1SMRA 5P0ZA 5P51A 4YOBA 4M8XA 2PSVA 5AH9A 5IE1A 1HSHA 4L7JA 5P4HA 1BILA 1FQ5A 4EHCA 1HVHA 3K5GA 5P22A 2AIDA 4Y3YA 2HB2A 3MSJA 1RV7A 1MT9A 2AVVA 2AZ8A 2QHYA 5P7PA 5P5FA 1WKRA 3NSHA 4DJYA 1D4SA 5F01A 5P4JA 5I3VA 3G72A 4B0QA 2IKUA 4GB2A 1VIKA 2AQUA 4Y57A 2V11C 5DR0A 2I4WA 6FIVA 4GJCA 2F3EA 4QJ6A 1C6YA 5P4KA 5P5TA 4TRWA 1LF3A 3S54A 3FSMA 4QLHA 1EPNE 1ZSFA 2QD8A 3PLDA 4FM8A 3UQRA 1ZBGA 1HVCA 3NU6A 5P17A 3SKGA 3HVGA 2P4JA 3BGBA 5P6AA 5JFUA 1SBGA 5ISKA 1EC0A 5OYQA 5P19A 3SA4A 2QD7A 4Y3RA 5P64A 3BC4A 1U8GA 4RVXA 5P27A 3UDRA 4F75A 4DV9A 2IS0A 5KR1A 3VYFA 2G1SA 3OY4A 1HXWA 3RU1A 2ZHTA 4LXMA 4KE0A 4ZSMA 2QMPA 1QS8A 2OHKA 4DUSA 1FKNA 5CLMA 2ANLA 4DQCA 2OHQA 5FIVA 3OU4B 1NPAA 2QCIA 1EBWA 3D1ZA 4Y45A 4NJSA 1FMXA 2RMPA 5P3PA 3UPJA 4KE1A 2IGYA 3GI6A 2O4KA 2WL0A 5OYXA 1WBKA 5P2WA 5P2FA 2JE4A 5OZHA 5P7HA 5P52A 3KM4A 4EJLA 5P3TA 5P84A 3KFSA 2JYSA 2IGXA 2AOIA 2IKOA 4Y6MA 1MEUA 4Y4UA 2WEDA 3UDQA 3LPJA 5P2RA 2QNQA 2H6TA 5P3ZA 3PI0A 4D8CA 2BPYA 5P3JA 1MTBA 4I8ZA 5P7NA 5P60A 5P70A 5P0PA 5P6UA 3DM6A 1HPOA 4J1EA 3UQWA 5P5IA 5P65A 1BDQA 1FQ6A 5P20A 5B18A 5P07A 5P63A 1FLHA 1ENTE 3LIXA 5AH8A 4H3JA 2PH6A 3HLOA 2Q5KA 4LAPA 5P56A 5APRE 1PSAA 5P4CA 5P6TA 4OBDA 5C9BA 3EMYA 2I4UA 3NU3A 2J9JA 2P3AA 3ZPSA 5P1UA 1HVJA 2B7FA 4ZSRA 5P5NA 3UQPA 2VA6A 3L5BA 2RKGA 5P09A 5P7KA 4Y3TA 2O40A 2P8HA 4DQBA 2R9BA 5SY3A 5J25A 2APRA 2HC0A 2HAHA 3D1YA 1BDRA 2VA7A 1SIVA 5P0AA 3HAUA 4Y3LA 5P5RA 2NPHA 3K5DA 3HZCA 4EPJA 3CMSA 3O9BA 5HDVA 4GJ6A 2FDEA 4FSLA 1KZKA 4Y53A 2OHRA 3PWRA 4B70A 3LINA 5P28A 7HVPA 5AH7A 2P3BB 5DQ2A 3PSGA 5P6YA 4B1CA 3BUFA 5P0DA 1YTGA 4ZSPA 3OGPA 5OYZA 1HWRA 1LZQA 5P7CA 2P3DA 3T6IA 3KFNA 2BPWA 5OZ7A 3K1WA 2ZHSA 1QRPE 5P04A 4EWOA 4H3FA 5JFPA 2Q15A 1HVRA 3EKXA 5COPA 5ER1E 5P30A 4OBKA 5P66A 5P13A 3WZ7A 5P6WA 5AHBA 5P8QA 3VLBA 5P3KA 3FKTA 3PBZA 2QZLA 3IXKA 3ZOVA 3CKTA 5P2ZA 4OBZB 3HVPA 3IA9A 5C9FA 5P3UA 2F80A 5OYVA 5KR0A 5HDUA 3SM2A 5HTZA 3OHHA 3WZ6A 5P6MA 2R3WA 5P4RA 2F3KA 1SP5A 4WY6A 3O99A 1MPPA 1META 1GVWA 1KJFA 2V00A 3BXRA 3PLLA 3ZL7A 2QAKA 3I7EA 1M4HA 5P6OA 4MC9A 1IZEA 2QI4A 3TKGA 1KJ7A 1IZHA 2HB3A 3PSYA 5P7RA 3OQ7A 1ME6A 5P4XA 3OUDA 3IXOA 4FLGA 5P05A 1IBQA 5P0IA 5P0OA 3G70A 5P78A 3OWNA 4Y3FA 2QZXA 2WEBA 4ZE6A 3H5BA 1OEXA 5OZ4A 5P6KA 3T11A 2RSPA 1EC3A 3L5CA 1KJGA 1FF0C 1FMBA 4GYEA 5P08A 2WJOA 2R5PA 2QK5A 3OOTA 5P1YA 5DR7A 4HDPA 3ER3E 4XX3A 1RPIA 1B6JA 5IVRA 1SH9A 5P80A 1LF2A 1HPXA 3EBZA 3GGUA 5P8OA 5I3WA 2I0DA 2NNPA 5P2GA 1FGCC 3NUOA 3FIVA 3L58A 4I1CA 4ZPEA 3CICA 3O9EA 5P2NA 1G0VA 4YD3A 1SDUA 5P0QA 4YDFA 1HVIA 2PC0A 5P38A 4YD5A 3D1XA 2CENA 2QI1A 1LYAA 1TCWA 3VFBA 3KDCA 1B6PA 1HOSA 4CPTA 5P3AA 5P2MA 1W6HA 3VF5A 5P1EA 5P4SA 4I12A 2J9KA 2QZWA 4GJBA 5EZZA 1W5XA 2PWCA 1HHPA 3PM4A 5HVPA 1BAIA 1PPKE 4CPUA 3DK1A 2G1YA 1E80E 1ER8E 5OZUA 2FMBA 3QAAA 3TPRA 1HIVA 2JXRA 4BELA 3KT5A 5DR4A 1MSNA 4DJXA 1LYWB 2F8GA 2FLEA 2B42A 4LL3A 5P3QA 5P4MA 5P7FA 4NKKA 3QPJA 4Z2ZA 1CPIA 3B7VA 2OF0A 5P53A 5P0SA 5P0WA 5P7EA 4OC6A 5HE4A 4EXHA 2MIPA 2FGUA 3O9LB 4Y4TA 3BGCA 3TL9A 5I3XA 1G6LA 5P10A 2BJUA 1SGUA 1DW6C 5P0BA 3RTNA 3ZPTA 2VIEA 1OEWA 4FL8A 1BBSA 5P5GA 1APTE 5P6FA 5P48A 3NR6A 5P0XA 5OZ1A 5AHCA 5P86A 3L3AA 4Y4AA 4HE9A 5P29A 1SDVA 2QU3A 5P1DA 5P6NA 2FXDA 4A6BA 5P4OA 4Y3MA 4R95A 2R43A 2AOFA 3PMUA 4QJ9A 3FX5A 1ZLFA 2ZJNA 3VV8A 1FEJC 2WEZA 4Y3ZA 3QRMA 3NDTA 3FNUA 4ZEAA 4AA8A 4GJ5A 1F7AA 5P3DA 3KDBA 1LS5A 3S43A 5CONA 3T7PA 2BQVA 3VFAA 3R1GB 5P1SA 2PWRA 4X2LA 2G24A 4BFBA 5P3RA 4XKXA 3LZVA 3R0YA 3VSWA 2QI5A 3L59A 4WTUA 1ZPKA 2XYEA 5KAOA 3OU3A 4GJ8A 3PCWA 2FDPA 1YX9A 3SAAA 5UPJA 5OYYA 3WSJA 1VIJA 5P8RA 3WZ8A 5OZYA 2VIYA 5P62A 1FG6C 4Y3XA 3RTMA 1FQ7A 4J1HA 2AZBA 4RVIA 3LHGA 3Q70A 4HZTA 3OGQA 1OD1A 4Q1YA 1FB7A 5P3NA 5P43A 2NNKA 3FV3A 3MXDA 2FDDA 3D20A 1PPME 4Y5PA 3PBDA 3L5FA 1KJ4A 1DPJA 3FNSA 3LZYA 3SM1A 3VSXA 7UPJA 5P1WA 5P2HA 1B5FB 2PK6A 2BKSA 3BVBA 1BVEA 2VNMA 2JJJA 2PH8A 5P1FA 3OAGB 1D4KA 4R5NA 2IEOA 5KR2A 1C6ZA 3G6ZA 3VYDA 2Q63A 5DPZA 3LPIA 4J0TA 1G35A 5P77A 5P1XA 1K6PA 1B11A 4A6CA 5P74A 3SA3A 4YCTA 4Y5NA 3EXOA 1FQXA 4DJRA 1MVPA 3VF7A 5OYWA 1BWAA 2ER0E 4F73A 2VNNA 3S7MA 5P8UA 1EPME 1W6IA 3IGBA 3NDWA 1BXQA 1HRNA 2PMAA 5OZ2A 1BWBA 4RGHA 5BS4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2HB4 A;  3Q4B A;  4KUP A;  3SA6 A;  5P3C A;  1ZP8 A;  4H3I A;  3HAW A;  3PB5 A;  3R4B A;  4JPE A;  4HDF A;  5P2K A;  5P7I A;  2Q3K A;  3OQF A;  4OBF A;  5P4W A;  5OZK A;  4Y3H A;  1AJV A;  1GVX A;  3SA8 A;  3AUP A;  3OXV A;  2ASI A;  5OZS A;  3UTL A;  1C6X A;  5OZE A;  1BVG A;  4I0F A;  1EC1 A;  3TPL A;  1LYA B;  2I4V A;  3ZLQ A;  5P1R A;  2P3C A;  2Q54 A;  3UCB A;  4PPH A;  3H0B A;  4ZLS A;  3TPJ A;  2CEJ A;  1E81 E;  4OBG A;  5P4U A;  4CKU A;  2BPV A;  4CPS A;  5KQF A;  5P0V A;  5P8A A;  5P73 A;  5BWY A;  5ENK A;  1HTG A;  5HU0 A;  4BFD A;  1ODY A;  3SAB A;  4Y5B A;  2QP8 A;  2ER7 E;  1ZPA A;  4Y56 A;  3URI A;  5P6C A;  2XFJ A;  5P00 A;  2QHZ A;  5DGU A;  3HW1 A;  2G26 A;  4GJ7 A;  4MC2 A;  3K4V C;  4OC6 B;  5P81 A;  1UH8 A;  5P5A A;  3OK9 A;  3PI5 A;  1J71 A;  1K2B A;  3OOZ A;  3ZKG A;  4WY1 A;  3ZKS A;  1B5F A;  2OHT A;  2A1E A;  4TVH A;  4Z4X A;  3UQX A;  4DJO A;  3CKP A;  2ZJJ A;  3OAG A;  3TOH A;  5P1K A;  1YM4 A;  1XN2 A;  2R3T A;  5P0G A;  1EPO E;  4Y3W A;  5P5Q A;  4J55 A;  3RTH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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