5ER1E

A rational approach to the design of antihypertensives. x-ray studies of complexes between aspartic proteinases and aminoalcohol renin inhibitors
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A Rational Approach to the Design of Antihypertensives. X-Ray Studies of Complexes between Aspartic Proteinases and Aminoalcohol Renin Inhibitors
rcsb
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 73
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1990-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5er1E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5er1E01
4D89A 3HW1A 3RU1A 3T7QA 3UDQA 3TH9A 5P3MA 1MESA 3VYEA 5P7EA 3Q4BA 1AAQA 5OZFA 1PFZA 2NXLA 1ODXA 3Q3TA 2OHLA 5OZEA 2ZDZA 5P55A 3O9IA 5P7OA 5P6ZA 4Y38A 3ZKSA 3QP0A 4GJ5A 1UH9A 3JVYA 2JXRA 5OZ3A 5OZ4A 3NR6A 3D20A 2FLEA 1W6IA 1FQ8A 2IGYA 5P0YA 5P18A 5P82A 3BGBA 2HB3A 1M43A 4ER1E 3KT5A 5B18A 2G22A 5P61A 2QAKA 4J1EA 4YDGA 4J17A 3CMSA 2PWCA 1HTGA 5P62A 4RLDA 2AOGA 3DUYA 3U7SA 1LF2A 3INHA 5P2XA 7UPJA 3LZYA 2VS2A 5P5DA 2ZHTA 1RNEA 2ZHSA 4EJDA 5P71A 1W5YA 1MTBA 2AZ8A 5P4EA 6UPJA 3S43B 5KR2A 4RRNA 2OF0A 2ZJNA 3VEUA 5P39A 4Y4UA 4Y4TA 3NDXA 5P6IA 4F74A 5P2ZA 1SDUA 1AJVA 2I4UA 5P7HA 3OK9A 1SMRA 6APRE 3O9DA 3ECGA 1TW7A 2XFJA 3VF5A 3UDJA 5P2JA 5P3VA 2ASIA 3CKRA 2P8HA 5P5RA 3AIDA 5P1TA 5OYVA 1LS5A 3SA8A 4U8WA 1ZTZA 5P24A 2IRZA 4YCYA 2QD6A 3DCRA 2HB2A 4PZWA 5P86A 5P77A 2FGUA 5C9BA 2AODA 3ZPTA 4NPTA 2F81A 4FCOA 5P7IA 1FB7A 3L5FA 3KN0A 3A2OA 1HPVA 2AOHA 2AQUA 3GI4A 3HDKA 2BPWA 3FIVA 2O4KA 5P3YA 1BXQA 1G6LA 1HSHA 1GKTA 4Y5GA 4Y4DA 1IIQA 5P5YA 2BJUA 3TPJA 3OQDA 1B6JA 5P1UA 5P8FA 1EC2A 5KOSA 4GJ7A 3EKTA 5P2IA 4J54A 4H3FA 4DV9A 5P7LA 4B1CA 5P1EA 4CPUA 4F75A 3EKWA 4Y57A 1GNNA 4HLAA 3CYXA 2XYFA 5P2KA 3O9LB 5JG1A 5P3JA 4Y4AA 1HVIA 3OADA 5P1PA 3TNEA 3PI0A 4LP9A 4BFBA 4Q5MA 1EC1A 5CLMA 3ZMGA 5OYXA 3O9CA 4Y35A 5P68A 2QHCA 2J9KA 5P7GA 2AOIA 4PEPA 1FF0C 5P65A 2VA6A 3UPJA 3RSVA 2G1SA 3OHFA 1GVVA 1FQ7A 1AZ5A 4J0PA 5P10A 4Y58A 5HE5A 1ER8E 1TCXA 1UH7A 1EPME 5P09A 5P2VA 5OYTA 5P89A 3ZL7A 5P66A 5P1XA 2IEOA 3KFSA 2VNNA 3VG1A 3OXCA 1GVTA 2AVQA 2I4DA 5P3HA 3GGAA 3N3IA 4J0ZA 5HDXA 2PC0A 2V12C 3RVIA 3DK1A 4Y5BA 4TVHA 1LYAB 3OAGA 5P5QA 1EAGA 1TZSA 3MSKA 5P7WA 3VLBA 2OHKA 3K5GA 2QU2A 3FX5A 3KDDA 4CMSA 2RKFA 1HVSA 3UTLA 1RQ9A 1EC3A 5P8AA 3L59A 3SM1A 5P79A 5OZGA 2ER7E 2G1YA 1B5FA 3D1YA 3L3AA 2AVMA 1HPOA 5P76A 4GB2A 3SQFA 1Q9PA 5OYSA 4NJVA 1K6CA 1MERA 5P0NA 2WEAA 2QHZA 1T7JA 3SACA 4Y45A 3SA5A 5DQCA 4Z50A 4AMTA 3KA2A 3L5BA 3LIZA 5DPZA 1WKRA 1ODWA 6FIVA 3O9BA 2OHQA 5P78A 1AVFA 1BDRA 4Y4ZA 4EYRA 4RCFA 4AUCA 5OZWA 2IKOA 4M8XA 5P0MA 2FIVA 4Q1WA 4J1KA 5DQ1A 4YCTA 4GJ9A 4RYGA 5P31A 1BILA 4CPWA 4J1HA 5P3LA 1YT9A 2HPEA 4MC9A 5P0IA 1IDAA 3BUGA 1A8GA 1FEJC 4QJ9A 4RVJA 1GNOA 3ER5E 4K9HA 4H1EA 3NU6A 4ZLSA 3PMUA 1SDTA 1APUE 4Y3JA 4IVSA 5P5TA 4AZYA 5P0RA 3PM4A 5KQXA 5P3XA 4CP7A 3ZKQA 1DPJA 3UHLA 4YOBA 5DGWA 3I2LA 4CKUA 5F01A 2PWRA 2QI6A 3LZVA 2WHHA 5P5CA 3UQXA 5P63A 5P4HA 3R4BA 4ZIPA 1CZIE 3I8WA 5P3NA 5P53A 3EM3A 4YD3A 1ZPKA 2NNKA 5P1LA 5P6TA 4J1IA 5P17A 5P6BA 1J71A 1WBKA 2CENA 3QROA 1D4YA 1NPVA 2RKGA 2WL0A 5OZAA 4YD4A 5P3WA 1RPIA 3S45A 3S2OA 4DH6A 1XN2A 5P1JA 2ER6E 5P5PA 1BAIA 5P0OA 5P0ZA 4MC6A 3ZKGA 5P0FA 4DJUA 5P0LA 5P5OA 4DJYA 5P3GA 3APRE 3F9QA 3EC0A 2Q11A 3NDUA 5P5JA 2G20A 3PLLA 3L38A 4TRYA 4HA5A 4J1FA 5P7NA 5KAOA 5ENKA 4GJ6A 1EPRE 4DQFA 2AOCA 4Y44A 2G1RA 3EKPA 5APRE 5FIVA 1KJHA 2G21A 3VUCA 5P3AA 3K5FA 2FDEA 3QVCA 4TRWA 3VSWA 3EKXA 2HS2A 4JP9A 5P1IA 4Y5NA 4LHHA 5P1QA 3OTYA 2JE4A 4DJXA 5P2GA 5OZ0A 5P2BA 4Y3WA 2FNSA 2HB4A 5AH6A 1HHPA 4RGHA 4Y41A 2Q54A 5P3BA 4Y48A 2P3DA 4U7QA 3K1WA 2VA7A 4Z22A 5T4SA 5E5KA 5P7MA 3BRAA 4Y4XA 4MC2A 4OBHA 4OBZB 3K4VC 4TRZA 4I0GA 5J25A 1B6KA 1K6VA 5KQZA 4FAEA 3HVGA 2R3WA 5P1DA 5P1AA 3BXSA 4I0JA 2WKZA 5DR3A 3UFNA 5P4JA 5P8TA 4Z4XA 5AHCA 1LZQA 4YBIA 3MWSA 2ER9E 2R9BA 3L5CA 2I1AA 3AUPA 2QZWA 3TPLA 1FQ6A 2J9JB 2VIZA 3BUFA 2WECA 5P85A 1C6YA 4DI2A 5OZVA 3OTSA 2ZJLA 5P8UA 5HE7A 1PSNA 3BXRA 5P3KA 1PPME 2ZJMA 5P51A 1FQ5A 5OZZA 3T3CA 3G72A 3TOFA 4YD6A 3PWRA 5DR8A 7HVPA 5P6AA 4Y39A 4Y54A 5P83A 2FXEA 3IVIA 4A6BA 3QS1A 5P8VA 1XE5A 1WBMA 4ACXA 4HEGA 5P4QA 1W50A 3LIXA 5P13A 4B72A 5HCTA 4FIVA 5P4RA 4YBFA 3UDPA 5P7RA 4ER4E 5P64A 2PYNA 2PSGA 1F7AA 4QLHA 2V13A 5BS4A 5P0GA 5P5KA 1XN3A 4YD5A 2FNTA 1HTRB 4I0ZA 3SFCA 5P6EA 2Z4OA 5SY3A 5P48A 2I4QA 2B7ZA 5OYZA 1PSOE 4OD9B 5P07A 2AIDA 5P2SA 4EQJA 3OU1A 5P5IA 5P47A 3PWWA 5COKA 4I11A 3VYDA 2PYMA 3R1GB 4R5NA 2H6TA 4FE6A 1IZDA 4GIDA 5P6MA 1YM4A 3BVBA 2O4NA 4DQGA 2PSUA 3T6IA 4J0YA 1HIHA 2VIYA 2ZJKA 5I3WA 1AXAA 1IBQA 1E81E 2OHSA 3VV6A 1FFIC 4XXSA 2R3TA 5P4OA 5P8HA 1FFFC 2FGVA 3INDA 4F73A 5P7QA 1UPJA 3KFPA 5IVSA 3PBDA 3Q5HA 2BPZA 5P70A 2V00A 5P19A 5P1BA 5P6WA 1FLHA 5DQ2A 4RCEA 2WF2A 3GI6A 5OZKA 4Y37A 4DJVA 2G26A 5HTZA 5P1KA 5P50A 4OC6A 1MT9A 4HVPA 2QI0A 5P3PA 5P5GA 3CIDA 3NUOA 1KJFA 1M4HA 4L7GA 4LC7A 1KJ7A 3R0YA 2ZHUA 5P5UA 3SKFA 3TKGA 5P3CA 4R93A 4Y3NA 5P4TA 5P4VA 2PH8A 3UDYA 3Q6YA 2Z54A 3DOXA 3HAUA 2QI4A 5OZDA 4L1AA 5UPJA 1EBZA 5AGZA 3QBFA 2WJOA 3S85A 2QI3A 5P30A 3PRSA 2Q15A 1HEFE 4A4QA 3ZKXA 4D88A 3CICA 4X2LA 5C9FA 5P5LA 1EPNE 5P1FA 1BIMA 5P0PA 5P36A 2CEMA 2Q64A 3KFRA 2WF1A 3UDHA 1SH9A 1TSQA 1MVPA 5P5ZA 4XX3A 4I8WA 2BB9A 5P8OA 1K1UA 1IZHA 3K5DA 5P54A 4K4RA 1BXOA 2BPYA 4RCDA 5P26A 5P6FA 5OZBA 2BKSA 1HOSA 5I70A 4ZE6A 3ZKNA 4Y56A 2H6SA 1QDMA 4B00A 5DR0A 5P4BA 4I1CA 2UXZA 2QCIA 3OQFA 4ZSPA 5HDUA 3OQKA 3WZ7A 1FIVA 5P7KA 4OBKA 5P6DA 5OZUA 3PCWA 5P4DA 1QBSA 4L7JA 5KR1A 3IXKA 2QMGA 5OZRA 1AJXA 5P1MA 2Q3KA 4CPQA 3EKYA 5AH8A 3FKTA 5KOQA 4FGXA 5P0VA 5P38A 2WEBA 1DW6C 4LL3A 4Y5LA 2QNNA 5P75A 1TQFA 1PSAA 5OZPA 1FMXA 4ZPFA 4QGIA 5AH7A 1YTJA 5P72A 4LXMA 1DIFA 2AZCA 4B1EA 2B7FA 1XE6A 4EJLA 5P7TA 1MRWA 1QBUA 1D4SA 5P32A 3WZ8A 4WY6A 3INEA 3EBZA 4BEKA 3VSXA 2F80A 5P7VA 3QRVA 1E5OE 2P3BA 5OZOA 5P7PA 3O99A 5P5AA 1BDQA 4D83A 3FNUA 5P03A 5P4YA 4EP3A 3IAWA 4Y4JA 2QK5A 5E5JA 4NJSA 3ZPUA 1EPOE 4Y5CA 1BWBA 1SIPA 2R38A 4Y5MA 5P3OA 5P40A 8HVPA 4YE3A 1G35A 5P8LA 4J0VA 1XDHA 4B0QA 3I7EA 1SDVA 3SM2A 5P43A 1YM2A 3SKGA 3IVHA 4Y51A 4B1DA 5BRYA 5DQ5A 3QBHA 4A6CA 5SXNA 2I4WA 2NTRA 4Y3FA 5BWYA 5P4ZA 4Y3XA 4EXGA 3LNKA 4QJ2A 5P7SA 2AOEA 2IDWA 3EKVA 5IS4A 5KR8A 1META 2PH6A 4J55A 1JLDA 4KB9A 2OHTA 2QZXA 2VJ9A 1LEEA 5P8BA 3D1XA 3PI5A 1KJGA 3KDBA 4DQEA 5HU0A 3D3TA 5P80A 2HIZA 3DV5A 1T7IA 2EWYA 1E82E 2ZE1A 3PVKA 3FNTA 4NJUA 3IGBA 3NDTA 3OQAA 3HLOA 1W5VA 3HVPA 5P4GA 5P6JA 5P88A 4AA8A 1APTE 4RRSA 5P2NA 5P0EA 4HDFA 3S43A 3L58A 3PLDA 5P1OA 3OU4B 5ER1E 5P05A 5P69A 4TVGA 4XX4A 2FS4A 5I3XA 3VF3A 5P0DA 2WF4A 5P4WA 1OHRA 4I0EA 3PSUA 3WB4A 2OHUA 4Y3EA 4Y5AA 2ZGAA 1HPSA 1IDBA 3S8IA 4Y3RA 5P6HA 5P5VA 3VLAA 3NWXA 3M9FA 2ER0E 3FNSA 5P1WA 3APPA 4FLGA 4LXAA 1QS8A 2G27A 2F3EA 3IXOA 5P7ZA 4Y4BA 5P6SA 1LV1A 5P5FA 1SGZA 4R8YA 2ANLA 4I0FA 1MSMA 1LYBB 4NPUA 5P6UA 5OZNA 1IVQA 2B42A 4FSLA 2VKMA 5P8NA 4Y3YA 5P0CA 3EL0A 1HVRA 2FXDA 3QI1A 2AVVA 4Y6MA 4I0HA 5P84A 5COOA 3IN4A 5OYUA 2XFKA 2IS0A 3PMYA 2ZJIA 4XKXA 4GZFA 5P60A 1ZLFA 1Z1HA 2OHMA 1A9MA 1SGUA 2P4JA 1BV7A 5P5XA 3NSHA 5JFUA 1B6MA 2O4LA 3O9LA 5P08A 5P7FA 5P46A 3N4LA 3PHVA 4DJWA 5OZMA 3HZCA 4FRKA 4F76A 2VA5A 2WEZA 3S53A 3VV7A 4DJOA 5P5EA 3EL4A 5P3ZA 1ZJ7A 4K4PA 3KMYA 4L7HA 5P00A 4I12A 3DJKA 5P8QA 1FMUA 1G2KA 5OZ6A 4S1GA 5HE4A 2VJ7A 3UQUA 3B80A 5P2OA 1ME6A 2HPFA 2AOFA 2ZHVA 1LYWA 5COPA 3OXWA 1MTRA 1XL5A 3BVAA 2PMAA 5P2YA 1C6ZA 1GNMA 2RSPA 4APEA 3TTPA 1OEXA 4EQ0A 1MPPA 3CKTA 5P37A 2FMBA 2HM1A 3R2FA 5P4PA 3URJA 1C70A 1LYAA 2NNPA 2BKTA 3NU5A 4I0DA 4YHQA 3EL1A 3NU3A 2WF0A 3PCZA 5JODA 3IN3A 5P2CA 2V0ZC 5P8SA 2B8LA 1SMEA 5I3VA 5P2TA 4U7VA 2QU3A 2IGXA 3CYWA 1Z1RA 4EJKA 3VV8A 3LIYA 3H0BA 3UF3A 5P8PA 2G94A 4Y3DA 5P57A 5P2HA 1GVUA 2IQGA 4DQBA 2JJIA 1E80E 3C9XA 5P1HA 4HDBA 3PBZA 4HDPA 1W5WA 4Y3MA 4FRIA 3U6AA 5P1YA 5P3IA 3SPKA 3VFBA 1MIQA 1K6PA 5P04A 1EPLE 4ZEAA 3QRSA 5TOLA 5P2RA 3S7LA 4IVTA 2R43A 5P3FA 5P74A 5KR0A 1HRNA 3ZKIA 4Z2ZA 3RTNA 4ZSRA 3HD8A 2ZJHA 5P4XA 5P7UA 3VFAA 3SO9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4D89 A;  3HW1 A;  3RU1 A;  3T7Q A;  3UDQ A;  3TH9 A;  5P3M A;  1MES A;  3VYE A;  5P7E A;  3Q4B A;  1AAQ A;  5OZF A;  1PFZ A;  2NXL A;  1ODX A;  3Q3T A;  2OHL A;  5OZE A;  2ZDZ A;  5P55 A;  3O9I A;  5P7O A;  5P6Z A;  4Y38 A;  3ZKS A;  3QP0 A;  4GJ5 A;  1UH9 A;  3JVY A;  2JXR A;  5OZ3 A;  5OZ4 A;  3NR6 A;  3D20 A;  2FLE A;  1W6I A;  1FQ8 A;  2IGY A;  5P0Y A;  5P18 A;  5P82 A;  3BGB A;  2HB3 A;  1M43 A;  4ER1 E;  3KT5 A;  5B18 A;  2G22 A;  5P61 A;  2QAK A;  4J1E A;  4YDG A;  4J17 A;  3CMS A;  2PWC A;  1HTG A;  5P62 A;  4RLD A;  2AOG A;  3DUY A;  3U7S A;  1LF2 A;  3INH A;  5P2X A;  7UPJ A;  3LZY A;  2VS2 A;  5P5D A;  2ZHT A;  1RNE A;  2ZHS A;  4EJD A;  5P71 A;  1W5Y A;  1MTB A;  2AZ8 A;  5P4E A;  6UPJ A;  3S43 B;  5KR2 A;  4RRN A;  2OF0 A;  2ZJN A;  3VEU A;  5P39 A;  4Y4U A;  4Y4T A;  3NDX A;  5P6I A;  4F74 A;  5P2Z A;  1SDU A;  1AJV A;  2I4U A;  5P7H A;  3OK9 A;  1SMR A;  6APR E;  3O9D A;  3ECG A;  1TW7 A;  2XFJ A;  3VF5 A;  3UDJ A;  5P2J A;  5P3V A;  2ASI A;  3CKR A;  2P8H A;  5P5R A;  3AID A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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