5ER1E

A rational approach to the design of antihypertensives. x-ray studies of complexes between aspartic proteinases and aminoalcohol renin inhibitors
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A Rational Approach to the Design of Antihypertensives. X-Ray Studies of Complexes between Aspartic Proteinases and Aminoalcohol Renin Inhibitors
rcsb
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 73
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1990-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5er1E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5er1E01
2VIYA 4U7VA 1ME6A 3OTSA 3Q5HA 4XX4A 1W6HA 4J54A 2XFKA 3BXRA 5P1ZA 1FGCC 5KR2A 5P5LA 3QVCA 3NU6A 1C70A 3MXEA 4D83A 5P7WA 5P87A 3OADA 5OYWA 3F9QA 3BVBA 4ZSMA 5P7LA 4B05A 1AVFA 3NDUA 3O9CA 1MPPA 4DJVA 5P1WA 3NU5A 4COEA 1TZSA 5P0BA 5P6MA 4D89A 2P3CA 3EKPA 4DVFA 4Y4AA 1A8KA 2Q15A 4PZXA 5HDVA 4J0YA 5P6EA 2O40A 3HLOA 4FAEA 5P48A 4EP3A 5P0QA 5P37A 5P67A 1YTHA 4FRJA 1YM2A 5P7SA 3NUOA 1ER8E 4DJQA 4Y4GA 1T7IA 5P3LA 5P0GA 2HS1A 4CMSA 5P4TA 1E80E 5IE1A 1HIHA 3K5GA 2V00A 2ER9E 3KM4A 1KJ7A 2ER0E 4Y3XA 3VV8A 2H6SA 2BB9A 1MUIA 1BBSA 5P2WA 4APRE 3MSLA 5P69A 3OY4A 2J9JB 2G24A 4MC6A 2G1OA 4QJ8A 5FIVA 4Y3HA 4ZPEA 3WSJA 1FF0C 5P82A 2PK6A 4X7IA 1EC1A 5P3OA 1AM5A 3JW2A 1PSOE 4Y4XA 5AH6A 4E43A 4Y3SA 5P0UA 2IRZA 1IZHA 1IVPA 2WF2A 4DJYA 5P7VA 4ZE6A 5P6YA 2F3FA 5AH9A 2XYFA 3OADB 5P3KA 3RSXA 4LAPA 5IVRA 3QPJA 4I1CA 5JFUA 3L5FA 1GVTA 5P3TA 1VIKA 2Q5KA 1DP5A 5DR1A 4EJKA 4DQGA 2PQZA 3K1WA 2R9BA 2WHHA 4Z22A 4HA5A 1M4HA 5P20A 5P60A 3VFAA 2I0AA 1FLHA 4YA8A 3APPA 5P1QA 1PPLE 3CKTA 3D20A 1IZEA 5HE5A 5P4QA 3SPKA 4DQBA 5OZGA 2Z4OA 4J0TA 3PGIA 3S2OA 3OXVA 1ODWA 3ZKMA 5P2VA 5P43A 5P29A 1FQ8A 1KJGA 2B42A 2RMPA 5P14A 4JOOA 3OQ7A 1BWAA 3T3CA 3SM1A 2AVMA 3LINA 3EL9A 4TVHA 1PPME 4Y3AA 1OHRA 5P4MA 3KF0A 1C6ZA 3MSKA 5P8FA 3LNKA 3Q4BA 4A6BA 2ZDZA 4BEKA 4B1CA 5P4FA 2QAKA 2QI6A 5P2DA 4FSEA 2OHQA 4YDGA 4RVIA 1XE6A 5P5SA 2WF3A 4Y3GA 2B7FA 5P81A 5P1AA 2CENA 2R5PA 3KDBA 5P4XA 5P6QA 1GNOA 2QI5A 5OYQA 1QDMA 1EBZA 4EWOA 1W6IA 5P2SA 3EKWA 3CYWA 1GKTA 4DJWA 1EPPE 4I0FA 3O9LB 3NR6A 3DJKA 4YD4A 5ENKA 2G1RA 4OBHA 1EPNE 3L5EA 2AOFA 1PPKE 1B6JA 5P51A 5P6AA 6APRE 1ZPAA 4EHCA 1MT8A 1SGUA 4Y43A 5P4YA 4JP9A 5P59A 1CZIE 1AXAA 1SIVA 3UDJA 3PVKA 4Q1XA 4GJ6A 4Y3WA 3GGXA 5P0FA 5BRYA 5HE7A 3I7EA 4Y5BA 5P72A 4Q1NA 5P1BA 5P7IA 5IVTA 1LF3A 5P44A 3INDA 5P0SA 2ER6E 2OAHA 4Q1YA 5P7QA 4L7GA 5KR1A 3QS1A 3T6IA 4Y3QA 3EL1A 4FAFA 1EC0A 4U8WA 2BKTA 2IGYA 3D3TA 3NU9A 3SA7A 2WF1A 2ZJMA 4FM6A 5P12A 2FIVA 5P5BA 4MC9A 4LL3A 3NDTA 3LIZA 4BFBA 4GYEA 4QJ2A 3BHEA 5OYSA 2UPJA 3EM6A 4DFGA 5P42A 3TH9A 5OZLA 5P3YA 5P4OA 1BV9A 5UPJA 5HTZA 2ZHTA 3TKWA 4FM7A 3PLDA 1FQ4A 1K1UA 2QI4A 4GJ7A 4A4QA 2OHUA 3PLLA 1XE5A 4LHHA 5P71A 3VLBA 2G22A 4Y4JA 1C6XA 4Q1WA 5P3BA 4FE6A 3NU3A 5JFPA 1IIQA 4XX3A 3KFPA 2I1AA 2QHCA 1JLDA 2QI3A 5AHCA 1FMUA 5P0WA 3LPIA 5P5UA 3UFNA 2I4DA 2B7ZA 1BXOA 4ZSRA 2QI7A 1T3RA 2QNQA 1U8GA 3VYEA 2PH8A 2FDDA 1D4LA 1HTFA 1HTGA 1BVEA 4I8ZA 5P3ZA 5P2BA 2ZJLA 3VFBA 5OYVA 4H3FA 5KQXA 4Y4TA 5P6HA 1PSAA 1RQ9A 4TRWA 1HEGE 2IS0A 5P19A 3PJ6A 2G20A 4PEPA 2VIJA 4Y58A 4LBTA 3ZMGA 2P8HA 2P83A 1M43A 1GVXA 2HB4A 5P0AA 1N49A 5KAOA 5P70A 5P7FA 3ZKNA 3NU4A 3OQKA 4HEGA 5P7HA 1XS7D 3OXWA 5P6JA 1NPWA 4JECA 3FNTA 3VF3A 5OZDA 5P5MA 1TCWA 2HAHA 2FLEA 3CIBA 2OHRA 3HW1A 5OYZA 2QNNA 4Y4EA 3A2OA 3SA4A 5P7PA 2FMBA 2O4PA 4Y39A 2IGXA 4Y37A 5P10A 5P41A 2BJUA 4J1IA 4B0QA 5P63A 5P8LA 1HVCA 3QBHA 5P1RA 5P78A 4J5JA 4DPIA 3SQFA 2QU3A 4L1AA 5P22A 3URLA 1HPVA 5P8OA 5P5RA 3UFLA 4FRSA 5HE4A 5BWYA 1E82E 3IXKA 2PC0A 2CEMA 5P39A 2FNSA 1APWE 2AVSA 1ODXA 1DPJA 4I0IA 3OOTA 5P5YA 4BFDA 5P8RA 4ZSPA 1LYBA 4HZTA 5P7MA 5DQCA 1MT7A 5P3MA 3TNEA 5CLMA 4EQ0A 4Y4BA 5KOQA 1BDQA 3OGQA 1D4IA 3UQPA 2QHYA 3OAGA 3DCKA 1HSGA 2VIEA 3O9IA 1DMPA 1APVE 1UPJA 4I0ZA 3IA9A 4Y3PA 5F01A 5P5QA 1B6MA 5P4HA 3DV1A 3PWRA 1HPXA 3OU1B 3PMYA 2QHZA 2RSPA 5P4WA 4BELA 1YTJA 3LZUA 5OZ5A 1YTIA 5P6BA 3U71A 5OZQA 4CPWA 2QZXA 4Y4DA 1BWBA 3DOXA 3QVIA 3KMXA 3FV3A 2J9KA 5OZ3A 4Y35A 3NUJA 1OD1A 1RNEA 4X2LA 2QMFA 5P8VA 1ENTE 2R3WA 5P2IA 3IXJA 3UQWA 1IZIA 1QS8A 1HIIA 1HTEA 1TCXA 3R4BA 4L1AB 3HAUA 5P45A 2WEDA 3OXCA 2Q64A 3K4VA 2VS2A 1HWRA 2HB2A 2O4NA 4R92A 5P8UA 5P02A 2AZ9A 1FG8C 4H3JA 3U6AA 1RV7A 1HVIA 1SP5A 1ZAPA 3OQAA 3D1XA 1A94A 5OZVA 3VYFA 3QRVA 3H5BA 4M8YA 5P6WA 4LP9A 1LYBB 1HVLA 3S7LA 3EBZA 5DQ5A 2V13A 5HDUA 5P0NA 7HVPA 4YD3A 5P2NA 3T11A 5P5GA 2AOHA 3HBOA 4JPCA 1DW6C 2R8NA 3PEPA 2WJOA 3WB5A 3OAGB 5P5XA 5P5AA 2QCIA 4DQEA 3O99A 4I0DA 2IDWA 5P1UA 5P8NA 5P5ZA 4D8CA 3UDQA 4ACUA 1SMRA 5P7RA 3URIA 1F34A 4LXKA 2OHPA 5P3HA 4DH6A 1HPSA 2QI1A 2VJ9A 4EJLA 5P2QA 5P4UA 1MSNA 1CPIA 3UDKA 4KE1A 5F00A 2QZLA 2HS2A 3QRMA 5P08A 3UF3A 2G1SA 1MEUA 1YTGA 1FFIC 3EL4A 4YOAA 5P40A 2A4FA 1Q9PA 2ZJHA 3FNUA 4Q5MA 5P6SA 5P62A 1B11A 2OHTA 5P5OA 5P0DA 1AAQA 2QMPA 3QRSA 2H6TA 3GI5A 3SA8A 3OQFA 3OOZA 5DQ1A 3GW5A 2P4JA 4OBFA 3EKYA 1ZBGA 1MT9A 2FGVA 3EKXA 4YOBA 2AQUA 4Y3LA 2V0ZC 1EPME 4AMTA 5OZCA 2Z54A 1IDBA 4QJAA 4RZ1A 3UDRA 2RKFA 5P4GA 3PSGA 1MESA 3BXSA 4Y5KA 4N00A 5P0HA 1BV7A 5P2RA 5ER2E 5P7KA 4HDBA 4DV9A 5JG1A 3PB5A 1FFFC 1IBQA 5P4EA 5EZXA 4IVSA 1PROA 2I4VA 4B1DA 2BQVA 3NDXA 1HTRB 5P4DA 1A30A 1FQ6A 5COKA 4J1EA 5P8PA 1BDLA 2G1NA 1IVQA 4B00A 1LYWA 3ECGA 3T7PA 1UH8A 1EEDP 4L6BA 3ZOVA 5KR0A 5OZXA 1ZP8A 3IXOA 6UPJA 5DR7A 5SY2A 2VJ6A 1EAGA 5P66A 4S1GA 5P8BA 4GJ9A 2VKMA 1T6EX 5P8KA 3IAWA 2F3KA 3QI1A 3CYXA 3PBZA 5P5WA 1XL2A 1SBGA 1TW7A 2PSVA 4Y48A 2IL2A 3GGVA 1FG6C 3D91A 5P3GA 3UDMA 5P4IA 5P0MA 2RENA 3PCWA 4I0JA 5OZJA 1EC2A 2G21A 3RTMA 1BIMA 3L5BA 1LF2A 1MTBA 2AOCA 2NXMA 1K6TA 5P1NA 1TSUA 1IZDA 4ER4E 3ZPTA 4Z2ZA 1QBSA 3KN0A 3SKGA 3DV5A 4PHVA 3SFCA 5HCOA 4OBKA 1HEFE 4J1HA 2FGUA 3UDPA 3WZ8A 5P1FA 5HU1A 3N3IA 3K5DA 3VYDA 2BKSA 2OHKA 4Y51A 1BVGA 5CONA 5P3JA 1D4KA 5P05A 5P32A 5DGUA 1GVUA 2MIPA 3APRE 4OBZA 5P55A 4TRZA 5P4LA 2NMYA 1PSNA 2ASIA 3KT2A 5AH8A 4EPJA 3OU3A 3QAAA 3GI4A 2BPZA 5DR3A 2QMDA 3KT5A 1LYWB 5P8EA 1B6PA 1K6PA 5OZYA 1SGZA 1RPIA 5P4BA 4F74A 5I3XA 4LC7A 3PI0A 3O9FA 4WTUA 2Q11A 3EKVA 3GGUA 5HDZA 4J0VA 5KQFA 2QZWA 2G1YA 4HDFA 2QD6A 3I25A 5P3CA 3EM4A 4XXSA 1YX9A 5P6OA 4RLDA 5P7YA 1ZSFA 2QD7A 5P58A 4I8WA 3QBFA 5P6FA 1OEXA 2Q63A 3M9FA 4LXAA 2V10C 1QRPE 2O4KA 2I4QA 5P1KA 5P8CA 5P03A 5IVSA 3KFSA 5P1DA 3OUCA 3D1YA 5P6DA 2AZBA 5P3IA 4YCTA 5P31A 2WECA 5AGZA 2ZJNA 5P0PA 5P06A 3PI5A 4A6CA 4I0GA 3OQDA 4L7JA 3TKGA 4FCOA 5I70A 3VV6A 4EXHA 5OZ7A 5OZ0A 1D4SA 3DK1A 2FDPA 7UPJA 2IEOA 3K5FA 5OZ2A 3PCZA 5P11A 5P65A 3DUYA 1W5YA 4OBZB 5OZOA 3NWQA 1QBTA 5P1YA 4AZYA 2EWYA 4DQCA 4DQHA 5P80A 4B70A 5HVPA 2WF0A 2WL0A 2NNPA 2OHSA 4B1EA 3UQUA 5C9BA 3L58A 2NPHA 5P5HA 4K4RA 5P3WA 5P0TA 1YM4A 4RROA 5P50A 3S56A 3HDKA 2AOJA 3R0YA 4Y3RA 3KYRA 1WKRA 4QLHA 5P5KA 3MSJA 5P6RA 1FMXA 5KR8A 5T4SA 2B8VA 4GB2A 5P8QA 5P2OA 1M0BA 3LIVA 2I4UA 3L5DA 5P2CA 5P2MA 5OZ9A 5OZPA 4Z50A 3I8WA 5P7DA 3BRAA 4Y5GA 4FRIA 4Y3EA 1YT9A 2Q55A 5SXNA 5P4CA 1XL5A 2PMAA 5P0ZA 3SLZA 2VA6A 2NMZA 2QU2A 2HB3A 1MTRA 3UPJA 4KUPA 5P0OA 3WB4A 5OYXA 1SDUA 3FIVA 3ZKQA 3RU1A 5P2KA 2XFJA 3FX5A 3HAWA 3OHFA 3SA6A 3SA3A 5P25A 3SACA 2HPFA 4AA8A 4I11A 3DCRA 5P6ZA 5P5FA 1HIVA 5P07A 2NXLA 3TPPA 2V12C 1T7JA 4I10A 5DR8A 2P3BA 1KJHA 5P73A 5P3SA 3VLAA 2VA5A 5OZFA 5P5CA 5J25A 1NH0A 2BPXA 5P1OA 5P2UA 4DPFA 4Y4WA 3IVHA 4FIVA 2PWRA 2WEBA 3GI6A 3OGPA 1D4HA 1VIJA 4QGIA 4YE3A 5P17A 3OUDA 1KJFA 3S85A 4DJOA 3BUHA 4WY1A 4GJAA 3NWXA 3KFNA 5P6GA 3AUPA 2ZHRA 5P3FA 2JXRA 3LIXA 1W5VA 5B18A 5P7NA 4RVJA 1Z8CA 4CPTA 5P89A 3UDNA 3CKRA 5DQ4A 4NJVA 2F8GA 2PSUA 5P3XA 2WF4A 3OTYA 4FSLA 5IS4A 3VG1A 3TTPA 4EQJA 4YCKA 5P2FA 4QJ7A 3CICA 3PWWA 2NXDA 1AIDA 5P3NA 5P4SA 3GI0A 5P75A 2PSGA 4YD5A 5P4AA 2QZKA 3O9BA 1HHPA 1W5XA 9HVPA 5ISJA 3SM2A 1K6VA 1IDAA 1MRWA 2JJIA 5P1GA 2B8LA 5OYRA 2ZHSA 5P1VA 4YBFA 5P5TA 5P3PA 5P7AA 1FEJC 3VUCA 1NSOA 1TSQA 3D1ZA 1HVRA 5DR0A 5P57A 5P7XA 2NNKA 5P79A 4J17A 1LEEA 1FMBA 3L59A 2QP8A 4XKXA 2QMGA 3OUDB 1SDVA 3HD8A 3UQRA 1MVPA 3O9DA 8HVPA 5P2AA 4GIDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2VIY A;  4U7V A;  1ME6 A;  3OTS A;  3Q5H A;  4XX4 A;  1W6H A;  4J54 A;  2XFK A;  3BXR A;  5P1Z A;  1FGC C;  5KR2 A;  5P5L A;  3QVC A;  3NU6 A;  1C70 A;  3MXE A;  4D83 A;  5P7W A;  5P87 A;  3OAD A;  5OYW A;  3F9Q A;  3BVB A;  4ZSM A;  5P7L A;  4B05 A;  1AVF A;  3NDU A;  3O9C A;  1MPP A;  4DJV A;  5P1W A;  3NU5 A;  4COE A;  1TZS A;  5P0B A;  5P6M A;  4D89 A;  2P3C A;  3EKP A;  4DVF A;  4Y4A A;  1A8K A;  2Q15 A;  4PZX A;  5HDV A;  4J0Y A;  5P6E A;  2O40 A;  3HLO A;  4FAE A;  5P48 A;  4EP3 A;  5P0Q A;  5P37 A;  5P67 A;  1YTH A;  4FRJ A;  1YM2 A;  5P7S A;  3NUO A;  1ER8 E;  4DJQ A;  4Y4G A;  1T7I A;  5P3L A;  5P0G A;  2HS1 A;  4CMS A;  5P4T A;  1E80 E;  5IE1 A;  1HIH A;  3K5G A;  2V00 A;  2ER9 E;  3KM4 A;  1KJ7 A;  2ER0 E;  4Y3X A;  3VV8 A;  2H6S A;  2BB9 A;  1MUI A;  1BBS A;  5P2W A;  4APR E;  3MSL A;  5P69 A;  3OY4 A;  2J9J B;  2G24 A;  4MC6 A;  2G1O A;  4QJ8 A;  5FIV A;  4Y3H A;  4ZPE A;  3WSJ A;  1FF0 C;  5P82 A;  2PK6 A;  4X7I A;  1EC1 A;  5P3O A;  1AM5 A;  3JW2 A;  1PSO E;  4Y4X A;  5AH6 A;  4E43 A;  4Y3S A;  5P0U A;  2IRZ A;  1IZH A;  1IVP A;  2WF2 A;  4DJY A;  5P7V A;  4ZE6 A;  5P6Y A;  2F3F A;  5AH9 A;  2XYF A;  3OAD B;  5P3K A;  3RSX A;  4LAP A;  5IVR A;  3QPJ A;  4I1C A;  5JFU A;  3L5F A;  1GVT A;  5P3T A;  1VIK A;  2Q5K A;  1DP5 A;  5DR1 A;  4EJK A;  4DQG A;  2PQZ A;  3K1W A;  2R9B A;  2WHH A;  4Z22 A;  4HA5 A;  1M4H A;  5P20 A;  5P60 A;  3VFA A;  2I0A A;  1FLH A;  4YA8 A;  3APP A;  5P1Q A;  1PPL E;  3CKT A;  3D20 A;  1IZE A;  5HE5 A;  5P4Q A;  3SPK A;  4DQB A;  5OZG A;  2Z4O A;  4J0T A;  3PGI A;  3S2O A;  3OXV A;  1ODW A;  3ZKM A;  5P2V A;  5P43 A;  5P29 A;  1FQ8 A;  1KJG A;  2B42 A;  2RMP A;  5P14 A;  4JOO A;  3OQ7 A;  1BWA A;  3T3C A;  3SM1 A;  2AVM A;  3LIN A;  3EL9 A;  4TVH A;  1PPM E;  4Y3A A;  1OHR A;  5P4M A;  3KF0 A;  1C6Z A;  3MSK A;  5P8F A;  3LNK A;  3Q4B A;  4A6B A;  2ZDZ A;  4BEK A;  4B1C A;  5P4F A;  2QAK A;  2QI6 A;  5P2D A;  4FSE A;  2OHQ A;  4YDG A;  4RVI A;  1XE6 A;  5P5S A;  2WF3 A;  4Y3G A;  2B7F A;  5P81 A;  5P1A A;  2CEN A;  2R5P A;  3KDB A;  5P4X A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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