5KOSA

Discovery of tak-272: a novel, potent and orally active renin in-hibitor
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
337
structure length
331
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery of TAK-272: A Novel, Potent, and Orally Active Renin Inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 331
sequence length 337
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2016-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5kosA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5kosA01
3T7QA 1ZSFA 1GVTA 3GGXA 4HDPA 1FQ4A 3QROA 5DR0A 1SMRA 1BILA 5ER1E 4Z22A 3OXCA 5P74A 4ZPFA 5P44A 4Y47A 2QZLA 4H3GA 3CYXA 4ZSQA 5P3HA 3UDQA 5P5UA 5HCTA 1HVRA 4NPUA 4OC6A 4Y9WA 1YTJA 3IVIA 1DAZC 1XL2A 4J1EA 5P2TA 1ZJ7A 4DUSA 2G1SA 4B00A 4CPXA 2AOJA 3PBZA 1GKTA 3SPKA 5DR8A 5P8JA 1HSGA 2WF3A 5P4GA 4D85A 4L1AB 5P1ZA 1TCXA 4Y3DA 1ZAPA 3Q6YA 3N4LA 4DV9A 1W50A 3T7PA 4OBJA 4Y36A 5P2HA 1W6HA 1B5FA 5P1CA 1A8KA 2AZCA 5OZJA 5P4JA 3IGBA 4H3IA 4PZXA 1AZ5A 5P62A 5OZUA 1RL8A 5P0NA 1IZDA 5P5YA 5P3RA 2NR6A 5P4SA 4EP3A 6APRE 1GVXA 1NPVA 2FLEA 4OD9B 3IXKA 4Y3MA 5OYSA 4GJ7A 3BUHA 4HZTA 4CP7A 3OAGB 4IVSA 3QVCA 1AXAA 2ZHUA 2ZHVA 4R8YA 5P7KA 5P64A 4FM7A 4FRJA 5OYYA 5AH6A 1MEUA 1FQ8A 4Y3PA 4AA9A 5P8EA 3HBOA 1VIJA 3CIBA 4TRZA 2Q15A 2OHSA 5P3AA 1HWRA 4FAFA 1MT8A 4WY1A 1B6JA 5P3TA 3K4VA 4AA8A 4JP9A 4LAPA 2BB9A 1EBWA 1E82E 4MC9A 3SA6A 4B70A 5P1KA 2AVMA 5P4TA 1BXOA 3UQWA 3OWNA 4Y38A 5P8TA 3K1WA 3INDA 5P1HA 3GI4A 4OBHA 2UXZA 5P5FA 3D1XA 4F73A 2R38A 1BIMA 3EKWA 2HM1A 3DOXA 2CEJA 3OQDA 2A1EA 3MXDA 5P71A 4YBFA 2APRA 5P7MA 2G69A 4Y45A 2FIVA 3HZCA 4DI2A 4FCOA 4Y4ZA 4YOAA 1LV1A 4YDFA 4Y3LA 3UTLA 4F76A 2Q5KA 5P01A 3H5BA 1MESA 2ZJIA 1HIVA 5P2RA 1XE6A 1D4KA 4ACUA 3OU3A 4QJAA 4Y51A 3LITA 4OBZB 5P5JA 4I11A 5P0LA 2OHQA 3PSYA 2ZGAA 3QRSA 4EYRA 1SMEA 2WF0A 3PB5A 5P2BA 5P80A 3BUFA 3M9FA 2QP8A 5P28A 2QZWA 2O4PA 5P69A 5BRYA 4Y54A 3OTSA 3FNUA 4M8XA 5P7GA 3UDNA 3PI5A 5P42A 4Y3JA 5P6SA 4EWOA 4FS4A 3WSJA 5IVRA 5APRE 3LIVA 4J0PA 4DJVA 1W6IA 3UDPA 3UPJA 1SDUA 3EL5A 5P2LA 3O9FA 3LIZA 3AUPA 2AQUA 4Y5PA 1LYBB 2ER7E 4FIVA 3I7EA 1FF0C 2B7ZA 4CKUA 1NPAA 1Z1RA 3Q3TA 3UCBA 5OZ4A 2HS2A 4JPCA 2ZE1A 3HDKA 3ZPTA 1HVIA 1K2CA 5P35A 4YCYA 4Z4XA 2BKSA 2QD6A 4Y6MA 4D83A 4Y3TA 5P0CA 5P0ZA 3O9GA 4Y3AA 2FNSA 4FGXA 3F9QA 1KJHA 5P2AA 3O99A 2IKOA 5P6XA 4RYCA 4DJUA 3K4VC 4I0DA 3WZ6A 5P48A 3TPLA 1ODWA 3CICA 5P8OA 2RKFA 3VF3A 4Y5MA 4XX4A 3OQ7A 1HSHA 4DJQA 2G27A 5P1FA 5P5ZA 4ZLSA 2QAKA 4Y4DA 2QMFA 4RYGA 5P7UA 1F7AA 5C9DA 2FDEA 5P68A 5P13A 4K8SA 4Q1XA 5P22A 2FXEA 1PSNA 4I8WA 3S45A 2BPXA 2I4XA 3OQAA 3KF0A 5P8QA 5P5IA 5OZYA 4Y4GA 5P6OA 3OUCA 4Y39A 5ENMA 5P31A 3LPKA 3PLDA 5P0GA 3TPPA 2JYSA 5P1PA 2WF4A 1NPWA 4Y3QA 3A2OA 3O9LB 1AJVA 3ZLQA 1BDLA 3NXNA 1EPNE 2ZJHA 2HB3A 4EJKA 4I0GA 5P6FA 1FKNA 1HVSA 3FX5A 4GJCA 1UPJA 1HPVA 4ZSRA 3NDXA 3NWXA 5I70A 1DMPA 5P0WA 5P6BA 5P84A 5DR3A 1WBMA 5HVPA 5P7RA 5KR8A 1U8GA 4DH6A 5OZAA 1IZHA 1HSIA 1NH0A 5OZNA 3NYGA 1HVKA 1T6GA 3Q5HA 2VNNA 4EJDA 3D3TA 5P4QA 5P8MA 4L1AA 5P4HA 3MSKA 2ASIA 3INHA 3NUOA 5P3VA 2V0ZC 2I0DA 5F01A 5P47A 5OYWA 5P5HA 3S8IA 1MIQA 2OHKA 3S7LA 4EQ0A 3MSJA 5OYTA 5P79A 5CONA 2AOFA 3NU5A 3VYEA 4Y3NA 3BXSA 2G21A 3EMYA 5P5BA 1B6MA 3IXJA 4OD9A 2P3CA 5P3EA 3OUDB 4EJ8A 4PHVA 5P8RA 3VCMA 1HTRB 2ZHTA 3SLZA 5P7EA 3OAGA 5P43A 3G6ZA 1N49A 5P0KA 5P11A 2I1AA 4ZPEA 1HEFE 5P52A 3UDHA 4Y3HA 4U8WA 1OEXA 5P2JA 5P27A 1BXQA 4JECA 4B1EA 3INEA 3DM6A 4R93A 5OZ9A 3NLSA 4ZEAA 4GIDA 4FM8A 5EZXA 5P8CA 7HVPA 1KJ7A 5P0BA 5BWYA 3SAAA 3CKPA 4ZSPA 5P3XA 2F8GA 2PH8A 2VKMA 1BV9A 4LXKA 5P1SA 4J0TA 3OXXA 6FIVA 1K6PA 1K2BA 5P14A 3L58A 1ZBGA 5P1OA 2BPWA 5P7YA 5J25A 3TKWA 3EL1A 5P67A 4KE1A 1EEDP 2NMZA 5P32A 5PEPA 4LHHA 4DQEA 1YT9A 4FRIA 2OHRA 4YDGA 2Z4OA 5AHCA 2WHHA 2P83A 1YM4A 4Y5AA 3UFNA 4YD6A 3UQPA 3KM4A 1IVPA 5P1VA 5COOA 4Y5LA 1IZEA 3TL9A 5JODA 1TSUA 5OZOA 2G26A 3EKXA 3CKRA 5SXNA 1C70A 1PPKE 4BFBA 2QHYA 2BPZA 3S85A 5P7IA 3UDMA 2H6TA 5P2EA 4NJSA 1MERA 4OBZA 2QNPA 2JXRA 1RQ9A 1BBSA 1ODYA 4HE9A 4LXMA 2CEMA 3K5GA 1IDBA 1EPQE 5P77A 3PWWA 5ENKA 4L7HA 5P34A 3CMSA 3PEPA 4GJ9A 5HDVA 1IIQA 4FAEA 1A8GA 6UPJA 3APRE 5SY2A 2VIYA 5P56A 5P3ZA 2WKZA 3VG1A 3OQKA 3NDUA 3HVPA 3WB5A 1OD1A 4DQGA 4X7IA 5P7CA 5P8FA 5HTZA 1ME6A 3NU6A 3DV1A 5P1TA 4A6CA 4D89A 5IVQA 2PQZA 1K6TA 4RZ1A 4Y5KA 1HEGE 5OZHA 3LIQA 4CMSA 5P45A 5P4ZA 4Y3ZA 2ZHSA 3U7SA 5DQ5A 5ISKA 1FIVA 5P88A 2Q54A 3S2OA 3PMYA 5P89A 1MTRA 5P0QA 5P18A 5ER2E 2HAHA 1Q9PA 2AODA 5P6RA 4ACXA 3TOFA 1MVPA 2WEDA 5P24A 3PSGA 4DJRA 3PJ6A 2BJUA 2RENA 5P4WA 1D4SA 1EBYA 1YTGA 4K9HA 5P4OA 4AMTA 2BPYA 4A6BA 5OZ2A 1MRWA 5P3KA 1META 3TPJA 3UQRA 4KUPA 4YCTA 1F34A 2QZXA 1MPPA 4D88A 5OZSA 5P2UA 1B11A 3GGAA 4CPUA 3GI0A 2FNTA 3L5DA 1ZSRA 3BUGA 1LS5A 3OUAA 5KOQA 1QRPE 4I1CA 4NKKA 3ER5E 2OHLA 1FFFC 5DQ1A 2NXDA 5AH8A 2QD8A 1AAQA 3S43B 4Y37A 3O9LA 3I8WA 3OXVA 3EKVA 5P51A 1C6ZA 3FNTA 5P3UA 3ZKQA 5P5DA 1IDAA 3VFAA 3SA4A 1MSNA 1W5VA 1KJ4A 1SIVA 4Y43A 5OZKA 4GZFA 1IBQA 5P60A 2ZHRA 4MC1A 3QI1A 5OZIA 1LYAB 5P4IA 5P17A 5P57A 2P3AA 3VF5A 1LEEA 2OHNA 3PHVA 3NDWA 4Q5MA 1PSAA 5P1DA 1K6CA 3O9DA 5P6YA 4BELA 2QNQA 1DW6C 5P0OA 4QJ7A 1BDRA 3OGPA 1HOSA 4I12A 3OGQA 5P5VA 4EJLA 5P7VA 4WTUA 5P36A 4B0QA 4RVJA 1ZP8A 2JE4A 2G20A 1GNOA 5P5XA 4RRNA 3QBHA 1GVVA 3DK1A 2R43A 2WF2A 3G72A 1APTE 3QBFA 3SABA 1FEJC 2Z54A 3L5BA 4Q1WA 3OUDA 3DJKA 3RSXA 1GVUA 3S53A 1WBKA 4CPRA 1UH7A 2HIZA 4Y3WA 2AIDA 1SIPA 5P0UA 5P4MA 1D4YA 3TOHA 4Y35A 5I3YA 4R95A 4NPTA 1M4HA 2AOEA 2O4SA 5I3WA 3BHEA 3L5FA 3OHHA 3SFCA 4Y3EA 5P2GA 2I4QA 3GI6A 4YD7A 4X2LA 3QN8A 5P46A 5P6DA 5DR7A 3SKFA 4DQBA 2PWCA 4J1CA 5P6GA 4CPQA 4LP9A 3NUJA 4B77A 2JJJA 4E43A 2WF1A 1VIKA 3OU1B 5HD0A 4Y4BA 5P1LA 3TPRA 4NJUA 5P0YA 1M43A 3EXOA 4BFDA 5P05A 2BPVA 4Y58A 1E80E 1KJGA 5P37A 1Z8CA 4WY6A 2B60A 1EBKC 4TVGA 2V13A 1D4LA 5P6CA 5HU0A 5P2VA 1TSQA 4QJ2A 3O9HA 3URIA 4I0FA 3BVAA 4FRSA 5P3DA 5P10A 3NU4A 1PSOE 2ZJJA 4A4QA 2NXMA 4Y3FA 4YD3A 1A30A 4FLGA 4YD4A 4J0VA 5OZ5A 1IZIA 5OZDA 3C9XA 4R91A 9HVPA 3OK9A 1YG9A 5OZ6A 3NXEA 3GW5A 4B72A 4Y53A 4FE6A 4PEPA 1HVLA 5P08A 5P7LA 4GJBA 5E5JA 3LZUA 5OZBA 2VA7A 3JW2A 5P1WA 5P3MA 4YHQA 2AVSA 5OZPA 2J9JB 1TCWA 4RCEA 1AM5A 5P66A 5P4DA 1FQ5A 3B7VA 4Y50A 5AHAA 4DJPA 5P0EA 5P1JA 1TQFA 2ZJKA 1PFZA 5DPZA 3KDDA 3SO9A 2QNNA 1APVE 2NNPA 3LZVA 1B6KA 2NMYA 5HDZA 4J0YA 1HTEA 1XE5A 5P3OA 5P6HA 3T6IA 2EWYA 2OHMA 5P7DA 3ZOVA 5P5WA 2QI5A 2WL0A 5P7PA 4TVHA 2XYFA 5P8NA 3WZ8A 5P0VA 2HPEA 3L5CA 5P8AA 4Y5NA 1QS8A 5P09A 4LXAA 5P2ZA 5P7TA 3DUYA 4XKXA 5AGZA 5HE5A 2V11C 3PBDA 5P5RA 4Y5BA 1HXWA 3LINA 3VFBA 3PWMA 3PCWA 1YX9A 3OXWA 2XFJA 4R5NA 4ZPGA 2IGXA 4OC6B 4N00A 2SAMA 5OZ0A 5P8SA 3ZKIA 3ZPUA 5DQ2A 1FG8C 4EPJA 1K1UA 5HDUA 4M8YA 1EC1A 1FQXA 2I4UA 4RRSA 4KE0A 5P3JA 2RMPA 3GGUA 4QJ6A 3R0YA 5P8KA 5P0TA 5P5QA 3SM1A 4B1CA 4Y4XA 5IVTA 2Q55A 2PK6A 3EKQA 4J0ZA 5P87A 3LHGA 3NU9A 4Y3SA 1EPME 2WJOA 3BVBA 3SA7A 4K4PA 5P70A 5P06A 5E5KA 1EAGA 4Y5EA 5P1QA 5P7AA 1MRXA 2QU3A 1BWAA 3PRSA 5KR2A 1BV7A 4Y3RA 1FG6C 3OY4A 3EM6A 5P7QA 5P72A 5P0MA 5OZ3A 1HBVA 5P81A 3SA8A 3VV7A 2PYNA 4MC2A 2XFKA 5OZVA 1EC2A 4TRWA 1HIHA 2RSPA 1LYAA 1MT7A 5C9BA 3EM4A 5P8GA 3HW1A 3B80A 3SA5A 2QCIA 4Y48A 2B7FA 2Q11A 5P25A 5P59A 2QI3A 3UDJA 5OYZA 3RTMA 2G1NA 4OBGA 4FL8A 4U7QA 3NWQA 5P3QA 3KFRA 4XXSA 5P8VA 5OZ7A 4RCFA 2BQVA 1XN3A 5I3XA 5OZQA 1FGCC 1QBRA 1T7IA 3TKGA 2G94A 2IRZA 2I0AA 5P19A 2AVOA 1AIDA 5P7SA 2P3BB 1LF3A 7UPJA 5F00A 5P5KA 5OZTA 4PZWA 2NTRA 4DPFA 2IDWA 1T3RA 2VJ7A 5AH9A 3I25A 5UPJA 3PMUA 2ZJMA 3MXEA 4Y41A 2IKUA 3QRMA 5CLMA 3HD8A 3NR6A 5DGWA 2O40A 2V16C 3QVIA 1FQ6A 2H6SA 2V00A 1QDMA 2VJ9A 4I0JA 5KQXA 5P7OA 3O9EA 1FMBA 5P4RA 2F3FA 4I0ZA 3PLLA 5P2IA 2Q64A 4Y4UA 1GNNA 4ER4E 5P4YA 3QRVA 5P2DA 3ZPSA 4DQCA 1XS7D 3S56A 5P20A 4HDBA 4DJXA 1HPXA 5HDXA 3OU1A 3PCZA 2NXLA 4Q1NA 2IENA 3RVIA 3O9IA 8HVPA 5P38A 5P83A 2WECA 1BAIA 3CKTA 1LYWB 4HDFA 3HLOA 5KR1A 5P2NA 4R92A 2R9BA 5P6QA 3UDKA 4GB2A 5P2YA 3U71A 1UH9A 4GJAA 5P4FA 5P7FA 3FIVA 4Y4WA 5P26A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3T7Q A;  1ZSF A;  1GVT A;  3GGX A;  4HDP A;  1FQ4 A;  3QRO A;  5DR0 A;  1SMR A;  1BIL A;  5ER1 E;  4Z22 A;  3OXC A;  5P74 A;  4ZPF A;  5P44 A;  4Y47 A;  2QZL A;  4H3G A;  3CYX A;  4ZSQ A;  5P3H A;  3UDQ A;  5P5U A;  5HCT A;  1HVR A;  4NPU A;  4OC6 A;  4Y9W A;  1YTJ A;  3IVI A;  1DAZ C;  1XL2 A;  4J1E A;  5P2T A;  1ZJ7 A;  4DUS A;  2G1S A;  4B00 A;  4CPX A;  2AOJ A;  3PBZ A;  1GKT A;  3SPK A;  5DR8 A;  5P8J A;  1HSG A;  2WF3 A;  5P4G A;  4D85 A;  4L1A B;  5P1Z A;  1TCX A;  4Y3D A;  1ZAP A;  3Q6Y A;  3N4L A;  4DV9 A;  1W50 A;  3T7P A;  4OBJ A;  4Y36 A;  5P2H A;  1W6H A;  1B5F A;  5P1C A;  1A8K A;  2AZC A;  5OZJ A;  5P4J A;  3IGB A;  4H3I A;  4PZX A;  1AZ5 A;  5P62 A;  5OZU A;  1RL8 A;  5P0N A;  1IZD A;  5P5Y A;  5P3R A;  2NR6 A;  5P4S A;  4EP3 A;  6APR E;  1GVX A;  1NPV A;  2FLE A;  4OD9 B;  3IXK A;  4Y3M A;  5OYS A;  4GJ7 A;  3BUH A;  4HZT A;  4CP7 A;  3OAG B;  4IVS A;  3QVC A;  1AXA A;  2ZHU A;  2ZHV A;  4R8Y A;  5P7K A;  5P64 A;  4FM7 A;  4FRJ A;  5OYY A;  5AH6 A;  1MEU A;  1FQ8 A;  4Y3P A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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