5KOSA

Discovery of tak-272: a novel, potent and orally active renin in-hibitor
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
337
structure length
331
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of TAK-272: A Novel, Potent, and Orally Active Renin Inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 331
sequence length 337
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2016-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5kosA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5kosA01
4PPHA 5P5LA 5P2QA 3IXKA 3SFCA 3T7QA 5IVTA 2QNNA 4A6CA 1RL8A 3FNSA 5DR1A 5P5HA 5KOQA 1SDVA 3UFNA 5OYWA 1EEDP 5P1BA 1HPSA 4FRJA 5F01A 3VCMA 1PFZA 2WEDA 4D89A 3TL9A 1YTGA 1C6YA 1B6KA 4Y5GA 1FQ6A 2VS2A 3S7LA 3UDQA 3O9CA 5P2CA 2R9BA 4FRSA 3O9LB 1K2CA 3K5FA 4Y6MA 5P8VA 5P3SA 4IVSA 3U71A 2I4VA 3CIDA 4YHQA 5P27A 1ZLFA 3O9IA 2BJUA 5P1WA 3T7PA 5P71A 1IZDA 5OYUA 3K4VA 3IXOA 1RV7A 6FIVA 5DGUA 3FNTA 1MTRA 4U7QA 4J1IA 5P15A 3DV1A 4H3JA 5OYYA 1T7JA 3OQDA 4Y3RA 4B78A 5P00A 4M8XA 1IBQA 1GKTA 1ZTZA 4FM8A 5HU1A 1MT8A 1ZSFA 5P8QA 3LIXA 4U8WA 3OHHA 3PSUA 5P8LA 5P2ZA 3D1XA 3OUDA 4K4RA 4Y50A 4Y5EA 2PSGA 5P3OA 2FGUA 2IENA 4FLGA 4LL3A 4GJ9A 1BDQA 4RLDA 3I7EA 5OZ7A 3O9FA 2FNTA 2I0AA 1FB7A 3EKTA 5P3HA 1TW7A 5P5YA 1IIQA 5HE5A 4MC6A 2CEMA 5OYZA 4FL8A 3N4LA 3NXNA 4LXMA 2AZ8A 4DJWA 5P2GA 5P23A 3UQPA 2VA5A 4J0YA 3PVKA 2P3AA 5P3TA 4HVPA 4YCKA 3NYGA 4BFDA 1B11A 4QJ6A 3Q3TA 1HVKA 4E43A 1GNNA 2ZHSA 2QCIA 4OBZA 1M0BA 5P6CA 5P8HA 4CPTA 1LYWB 2FLEA 4OBJA 1K2BA 4Y45A 1HTFA 3UQRA 3IAWA 1BVGA 3KN0A 1UH9A 4RROA 5P1NA 1SGUA 1BXQA 1NPVA 2OHNA 4DV9A 2A4FA 5P5ZA 5P05A 2Q3KA 3Q5HA 5DQCA 1XN3A 2Q63A 4QLHA 4DQGA 3SPKA 1W5YA 4RZ1A 1KJ4A 4OC6B 4ZPFA 1ER8E 2FIVA 1K1TA 3H5BA 2VJ7A 4Y4BA 1YM4A 5P5XA 5P49A 3GGVA 3FIVA 1ZP8A 3CMSA 3QRVA 4GMIA 4ZSRA 4AA9A 1AJXA 2WL0A 1T3RA 4FIVA 3LIVA 5P4ZA 5P5IA 5I3WA 3QAAA 3QRSA 3KMXA 4FSEA 5P3JA 5P7HA 5P53A 5P8CA 2ZJLA 4NJVA 5P2MA 2ZJIA 5P4JA 5P2KA 1RPIA 3OGQA 3DCRA 1RNEA 3OTYA 4J0ZA 3WZ6A 4K4PA 5P0MA 5P8AA 4DQFA 4K8SA 1C6XA 2BBBA 2OHKA 3IXJA 4Y5LA 2I4DA 5P88A 2QHZA 1PSOE 4A6BA 3R1GB 3VYFA 1F7AA 3EL0A 3O9HA 2ZJMA 5I3XA 4GJAA 5P1FA 1HTEA 4YE3A 5P40A 4L7JA 4I10A 5OZ0A 3SA6A 5P14A 4D8CA 5P2DA 2HPEA 5P7RA 1NH0A 4GJ5A 3SA5A 1HXBA 5P64A 4COEA 1EAGA 1LF4A 5P2EA 4MC9A 5P3GA 5P8SA 3MSLA 2HB4A 1DP5A 4Y4AA 3ZPUA 5AH6A 2WF2A 3OQKA 5HCOA 3CKRA 1EC3A 6UPJA 5OZIA 1FMBA 4GJBA 2R3WA 2IDWA 1QDMA 4YD6A 3UQXA 4F76A 3S7MA 1AXAA 2Q64A 1OEWA 5P0YA 3QVCA 3NU3A 1HVHA 4I0HA 5P52A 5P7JA 3D1YA 2PQZA 5OYVA 3BUHA 2OHSA 1FQ4A 5P7XA 1K6PA 2EWYA 3ZL7A 5P4CA 3VEUA 2AOCA 2QU2A 2F3KA 5P38A 1C70A 1ZAPA 4I0FA 1SDUA 2FXDA 5P6KA 1HRNA 5OYQA 5P68A 4ER2E 2JXRA 3INFA 4JP9A 3M9FA 3UF3A 5P86A 5P4AA 2J9JA 4R92A 1PPLE 5P4VA 3MSKA 3Q70A 2B8VA 5COKA 1F34A 2F80A 1YTIA 1W5VA 5ENKA 4JPEA 1DMPA 2VKMA 5KQXA 1KZKA 1K6TA 4H3GA 2Q54A 1ZJ7A 4I12A 5P39A 5P6EA 3KFNA 5P3EA 2ZHUA 1BILA 2NXMA 2BPVA 5P78A 5P6IA 3OXCA 2OHRA 4JECA 5P26A 4M8YA 5P41A 4LXKA 1B6JA 1IZHA 3TNEA 2RKGA 5P7QA 4S1GA 1EPOE 3EKXA 2G1SA 5ISKA 3NDWA 5P0BA 3URLA 5FIVA 5P36A 5P5CA 4Y4UA 1LYBB 3O9AA 5P4LA 1FQ5A 5P1OA 5P8RA 5P1HA 1KJGA 5P0PA 5OZNA 5I3YA 3PCZA 2PK6A 3T6IA 3HAWA 3LPIA 5OZQA 5P8OA 5I3VA 3BXRA 3S45A 3CICA 5P33A 4Z4XA 4TVHA 5P0IA 4EP2A 5COPA 3NLSA 1APUE 3GW5A 1GVWA 4J1HA 4DI2A 5P6XA 1SMEA 2P3DA 3PWRA 5P6GA 3VF3A 2R38A 3NUJA 5P3BA 2HIZA 1DIFA 5DQ1A 3OXWA 2Z54A 5BS4A 2NXLA 4Y3MA 2PYNA 4Y4ZA 2BKTA 5P1MA 5P3WA 2AZBA 5P7FA 1FG6C 5AHCA 1AM5A 5P1DA 3K4VC 5HVPA 2AOFA 4OD9A 1CPIA 1EBWA 5P0JA 4TRZA 4Y47A 4DPIA 5P54A 2WEZA 3T11A 4YA8A 4WTUA 4FAEA 1FQ8A 3PLLA 1HWRA 2ZJNA 4GB2A 3L5BA 2J9KA 5DR4A 3QN8A 3OXVA 5HDXA 1HVRA 4MC2A 3EMYA 4R91A 1LYAB 5P4BA 5P3FA 3PBDA 3A2OA 3QS1A 5P0EA 3MSJA 2HB2A 3L58A 1K6VA 3PI5A 2QD6A 5IS4A 5P2RA 3KMYA 2OHPA 2AOGA 2F8GA 4FCOA 2G1YA 1TCXA 3GI6A 4L1AA 5P55A 3TPJA 4YD3A 1FFIC 5P2NA 3EM3A 5KR0A 3K5CA 3ZKSA 3IVHA 3INHA 4DJUA 5P2SA 5P4GA 5P31A 2ASIA 4YDFA 5P1RA 1MRXA 3S8IA 3UDPA 3EL5A 4X2LA 1BWBA 5P4EA 3S56A 1IVQA 1EBKC 4ZSQA 5P37A 5P5BA 3NR6A 2IKUA 3TTPA 1ZPKA 5OZFA 4Y5PA 3PMYA 4XX3A 4CPXA 4B1CA 4Y3JA 5P0GA 1AAQA 2WF3A 4JOOA 3NU4A 3QRMA 5OZAA 2IL2A 5P8PA 2AVOA 5JFUA 3UQWA 5P6MA 5P6JA 4RVJA 5CONA 5P69A 2G22A 4H3IA 5P1SA 2G24A 7UPJA 5OZ6A 2V12C 4HA5A 5P0KA 3ER5E 5P8MA 5P6TA 5P45A 5P58A 3UQUA 1FEJC 1A8KA 3LINA 1G35A 3KM4A 4Y4XA 4F73A 5P17A 4ZLSA 3DUYA 3R0YA 1W6HA 4Y48A 3S53A 2QI1A 4Q1WA 3OQ7A 3ZPSA 3NWXA 4OBDA 5P66A 2BB9A 4XXSA 1U8GA 3I25A 2OHQA 5P6WA 4ZPGA 1WKRA 4J5JA 4R93A 1B5FB 1ME6A 5P01A 1BDLA 3GI5A 4CPRA 3ER3E 3PJ6A 2ZJKA 2QMGA 5P3IA 4Z2ZA 1KJ7A 5P63A 1WBKA 2PSUA 4I8WA 1QBRA 5P2TA 3NU5A 3SM1A 2IEOA 4B1DA 1MSNA 5P62A 1AJVA 3VFBA 4EJLA 4ZPEA 2B8LA 5OZZA 1MT9A 2MIPA 4Y5KA 5P4KA 5P1UA 1XS7D 1HVCA 5P1ZA 3TPRA 2QI0A 3VG1A 1AIDA 3N3IA 2I4QA 5P29A 5P7PA 3WZ8A 1OHRA 3O9LA 5P0DA 2Q15A 4L6BA 3LZVA 2G1NA 4H3FA 3ZLQA 5P1IA 3BHEA 4I0GA 5P13A 3UDKA 5P59A 5P7WA 5P0VA 5OZ1A 1FF0C 5P07A 1E5OE 1W51A 3EL1A 5OZGA 3SKFA 1MVPA 5OZ4A 3OHFA 5P6QA 4OBKA 5SY3A 3TPLA 4XKXA 5IE1A 3K5DA 5P5NA 4TVGA 3DOXA 2BPXA 3KFSA 5P2XA 5P8IA 4B0QA 3FSMA 2WEAA 1A8GA 5HDUA 2G21A 3GGAA 3OK9A 5P4QA 5P4IA 5KQZA 1LV1A 4EQJA 5OZ5A 2V16C 3RTHA 4Y3FA 1HEGE 5P44A 1NPAA 1W5XA 3S85A 4FE6A 4RCFA 1IDBA 1B6MA 3VSXA 2QI5A 1D4KA 5P0AA 9HVPA 3IVIA 1EPRE 1MUIA 3B7VA 5P11A 5OYSA 3OOZA 5OZOA 3EKVA 3NWQA 2NR6A 3FNUA 3HZCA 5HE7A 4B77A 1D4IA 4ER1E 2QAKA 1APVE 4EQ0A 1VIJA 1RQ9A 3HVPA 4NPTA 3QPJA 4YBIA 2P3CA 2B7ZA 2OHTA 2APRA 3CKPA 5E5KA 1DAZC 5P3VA 2V00A 1BAIA 5P20A 2FNSA 4CKUA 2JE4A 3OU3A 5DGWA 3KDBA 3CIBA 3KT2A 2PK5A 3SLZA 5P6VA 5P5QA 1T6GA 1A94A 3G6ZA 5P8GA 2G27A 4NJTA 4LP9A 2WF1A 4Q5MA 3BC4A 4TRWA 3TOGA 1XDHA 2FS4A 4B72A 4J0TA 4Y4GA 3SAAA 5P6NA 3SACA 1MRWA 2ZDZA 3HLOA 3R0WA 5P80A 3EKPA 3SA7A 3KF0A 3OUAA 4FRIA 4KB9A 1IZIA 1Q9PA 5P5PA 1NPWA 5P1QA 4DVFA 4U7VA 2R3TA 2P3BA 4Y53A 3VLBA 3URIA 5P5SA 3GGXA 3LPJA 1W50A 4Y4EA 5P51A 3VFAA 1QS8A 2AZ9A 5P4RA 5P04A 2VA6A 4HLAA 3BXSA 5P35A 3AUPA 4NJSA 4DPFA 2ER7E 4HDPA 4QGIA 4YOAA 3R2FA 2PH6A 1N49A 1XL2A 4YD7A 5BRYA 3IN4A 5P61A 2WJOA 5P1KA 5P6YA 2RMPA 3NDXA 2B7FA 2JJJA 4Y5AA 3PM4A 5P0WA 2ER0E 4Q1XA 1XE5A 2RKFA 2F3EA 3HW1A 2G26A 1D4HA 5P5UA 3WB5A 4DJXA 5P30A 4Y3QA 1MSMA 4Y41A 2OAHA 5P5AA 1ZSRA 2UY0A 5P7EA 4EPJA 5SXNA 5P79A 5JODA 4DFGA 1HVLA 4Y5CA 2AOIA 1T6EX 5P2UA 1YM2A 5P3KA 2VJ6A 4YD4A 2QI6A 2UPJA 5P5TA 5P08A 1B6PA 1M43A 6APRE 2OHLA 2HS2A 3TOHA 1META 3UDRA 4Y44A 2B60A 1LF3A 7HVPA 5DR7A 4Y3SA 4YD5A 5HU0A 5T4SA 1FMUA 5P4PA 2AODA 4AZYA 3ZKNA 3OQFA 4ACUA 4FGXA 1ENTE 3OGPA 4FAFA 3MXEA 5P7GA 4Y3XA 2NMZA 5HE4A 5P73A 1IVPA 4J1EA 3MWSA 3Q6YA 2QZWA 4DJVA 5P76A 4DQCA 2HAHA 2I0DA 2O40A 3WZ7A 3Q4BA 3F9QA 4NJUA 2HPFA 3ZKMA 3R4BA 4GIDA 2ZGAA 5APRE 5EZZA 3GI0A 3WB4A 3U6AA 3OADA 5I70A 1MESA 3EBZA 1YG9A 3JVYA 5P7CA 1MT7A 1XL5A 4CPSA 4TRYA 1HOSA 4EXGA 2WKZA 5P5DA 1XE6A 4RCDA 5P7SA 3BUFA 4F74A 5P6BA 5P6DA 4ACXA 1W5WA 5OZKA 4AMTA 1MERA 4EWOA 5HTZA 5P5GA 3UTLA 5OZMA 2PWCA 3SO9A 1HIIA 1HHPA 5OZCA 3WSJA 1UH7A 4D83A 1K6CA 2WHHA 1FG8C 5P06A 3NSHA 5P0LA 2OF0A 1BV9A 5P16A 1EPME 5F00A 5P3LA 1QRPE 5P1VA 2BPYA 4I0ZA 5OYXA 5P70A 5P1AA 3PBZA 1FLHA 2HM1A 4Q1YA 3BGCA 3OOTA 5DR0A 4K4QA 2O4LA 2P83A 4NPUA 4F75A 1HPXA 4LXAA 3TPPA 5KAOA 5P87A 1GNOA 4HDFA 5OZBA 1J71A 5SY2A 4EP3A 3SQFA 4IVTA 4Y3AA 2H6SA 5P34A 3LIYA 3LHGA 3S43A 4DJPA 1EC1A 2G1RA 3ZKIA 4Q1NA 2I1AA 5P6LA 5P0UA 3L5EA 5P1GA 2Q5KA 5P12A 2FGVA 4Y3TA 3EXOA 2F3FA 1EBZA 5COOA 8HVPA 4ER4E 5P10A 2WF0A 3D20A 3UFLA 3URJA 5P67A 2OHUA 1HVIA 1IDAA 4R95A 4FS4A 5P8KA 1HBVA 2PWRA 3BVAA 3FX5A 5OZ9A 5P7AA 5P4SA 3OU1A 5OZHA 4CPWA 3VLAA 4YCTA 5HD0A 4L1AB 4Y51A 3ZKGA 4I0DA 4RVXA 4Y36A 5P83A 2WF4A 2HB3A 5AH8A 3OY4A 5OYRA 1LZQA 1XN2A 4Y3GA 5OZPA 4B1EA 2ZHRA 1BBSA 2OHMA 4OBHA 4QJ9A 2V11C 2CEJA 1SP5A 2XYEA 1LEEA 5P1CA 3PI0A 3LPKA 5P4OA 3RSXA 3RTMA 4LBTA 4RVIA 2O4SA 4XX4A 3T3CA 1HXWA 3OU4B 4PZWA 4PYVA 2O4KA 5P7ZA 3G70A 4Y3PA 2AVQA 3BGBA 1PPKE 2VNMA 4FRKA 1NSOA 4J55A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4PPH A;  5P5L A;  5P2Q A;  3IXK A;  3SFC A;  3T7Q A;  5IVT A;  2QNN A;  4A6C A;  1RL8 A;  3FNS A;  5DR1 A;  5P5H A;  5KOQ A;  1SDV A;  3UFN A;  5OYW A;  1EED P;  5P1B A;  1HPS A;  4FRJ A;  5F01 A;  3VCM A;  1PFZ A;  2WED A;  4D89 A;  3TL9 A;  1YTG A;  1C6Y A;  1B6K A;  4Y5G A;  1FQ6 A;  2VS2 A;  3S7L A;  3UDQ A;  3O9C A;  5P2C A;  2R9B A;  4FRS A;  3O9L B;  1K2C A;  3K5F A;  4Y6M A;  5P8V A;  5P3S A;  4IVS A;  3U71 A;  2I4V A;  3CID A;  4YHQ A;  5P27 A;  1ZLF A;  3O9I A;  2BJU A;  5P1W A;  3T7P A;  5P71 A;  1IZD A;  5OYU A;  3K4V A;  3IXO A;  1RV7 A;  6FIV A;  5DGU A;  3FNT A;  1MTR A;  4U7Q A;  4J1I A;  5P15 A;  3DV1 A;  4H3J A;  5OYY A;  1T7J A;  3OQD A;  4Y3R A;  4B78 A;  5P00 A;  4M8X A;  1IBQ A;  1GKT A;  1ZTZ A;  4FM8 A;  5HU1 A;  1MT8 A;  1ZSF A;  5P8Q A;  3LIX A;  4U8W A;  3OHH A;  3PSU A;  5P8L A;  5P2Z A;  3D1X A;  3OUD A;  4K4R A;  4Y50 A;  4Y5E A;  2PSG A;  5P3O A;  2FGU A;  2IEN A;  4FLG A;  4LL3 A;  4GJ9 A;  1BDQ A;  4RLD A;  3I7E A;  5OZ7 A;  3O9F A;  2FNT A;  2I0A A;  1FB7 A;  3EKT A;  5P3H A;  1TW7 A;  5P5Y A;  1IIQ A;  5HE5 A;  4MC6 A;  2CEM A;  5OYZ A;  4FL8 A;  3N4L A;  3NXN A;  4LXM A;  2AZ8 A;  4DJW A;  5P2G A;  5P23 A;  3UQP A;  2VA5 A;  4J0Y A;  3PVK A;  2P3A A;  5P3T A;  4HVP A;  4YCK A;  3NYG A;  4BFD A;  1B11 A;  4QJ6 A;  3Q3T A;  1HVK A;  4E43 A;  1GNN A;  2ZHS A;  2QCI A;  4OBZ A;  1M0B A;  5P6C A;  5P8H A;  4CPT A;  1LYW B;  2FLE A;  4OBJ A;  1K2B A;  4Y45 A;  1HTF A;  3UQR A;  3IAW A;  1BVG A;  3KN0 A;  1UH9 A;  4RRO A;  5P1N A;  1SGU A;  1BXQ A;  1NPV A;  2OHN A;  4DV9 A;  2A4F A;  5P5Z A;  5P05 A;  2Q3K A;  3Q5H A;  5DQC A;  1XN3 A;  2Q63 A;  4QLH A;  4DQG A;  3SPK A;  1W5Y A;  4RZ1 A;  1KJ4 A;  4OC6 B;  4ZPF A;  1ER8 E;  2FIV A;  1K1T A;  3H5B A;  2VJ7 A;  4Y4B A;  1YM4 A;  5P5X A;  5P49 A;  3GGV A;  3FIV A;  1ZP8 A;  3CMS A;  3QRV A;  4GMI A;  4ZSR A;  4AA9 A;  1AJX A;  2WL0 A;  1T3R A;  4FIV A;  3LIV A;  5P4Z A;  5P5I A;  5I3W A;  3QAA A;  3QRS A;  3KMX A;  4FSE A;  5P3J A;  5P7H A;  5P53 A;  5P8C A;  2ZJL A;  4NJV A;  5P2M A;  2ZJI A;  5P4J A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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