5T4SA

Novel approach of fragment-based lead discovery applied to renin inhibitors
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
339
structure length
334
Chain Sequence
TLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Novel approach of fragment-based lead discovery applied to renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 334
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2016-08-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5t4sA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5t4sA01
3OGQA 4APRE 3KDCA 5P5NA 5DR3A 3OK9A 5P6XA 5P3ZA 4PYVA 3S7LA 3GGAA 5P58A 2V10C 4ER4E 5JODA 3BRAA 4EJKA 1IZEA 1NH0A 2VIJA 2QU3A 5COPA 4Y5MA 4A6BA 2J9JB 1EBYA 1MT7A 5DQ1A 4TRWA 5P29A 1W51A 3SA6A 3UDNA 3HZCA 4Y5GA 4B05A 5HD0A 4Y44A 5P5LA 2BPXA 5P6JA 1HRNA 1G35A 4D88A 5P5VA 3QP0A 4I0EA 4ZPGA 5P46A 3VYFA 3G72A 5P4TA 4Z2ZA 3NWXA 3F9QA 5AGZA 5P3DA 3JVWA 4ZLSA 5P1AA 4LXKA 1TCXA 2QK5A 3QRMA 3ZPUA 1FIVA 3VCMA 2HB4A 1PPLE 5P35A 1HVHA 3I8WA 3INFA 4J0VA 5P45A 4GJ6A 2QHZA 1B6JA 1HWRA 4YCYA 1QBSA 2R9BA 4NPUA 5P44A 4LP9A 5P4CA 1FEJC 4K4PA 4DVFA 2P83A 3OADB 4YOBA 5P19A 3G6ZA 5I70A 4K4RA 2WKZA 5P3TA 3LZVA 5P09A 2G26A 2ZJJA 2HC0A 3I2LA 1VIKA 5P6WA 1YG9A 1BWAA 4LXMA 1TSQA 4A4QA 4DJOA 5P5KA 3SA8A 5P6AA 2G69A 1MTRA 5P2FA 2F3FA 4RCDA 5P6LA 3CIBA 4FCOA 1HVRA 2AIDA 5P0EA 4YD3A 5P8VA 2B7FA 1ZP8A 4FGXA 5OZTA 5P1UA 1W6HA 1ZLFA 3LIYA 1APVE 2FXDA 1CZIE 5P8FA 6UPJA 4U7VA 5OYRA 5P0XA 2V11C 2OHNA 4RYCA 4FE6A 4QJ8A 5P2XA 1FLHA 4HA5A 1F7AA 3OAGB 2G94A 3HBOA 5P12A 5P11A 5OZVA 5P3NA 5P39A 3ZKIA 5P6QA 3EKPA 2QCIA 1GVXA 3OQDA 1W5WA 5P22A 2Z4OA 1HPXA 5P33A 3U6AA 3ZOVA 1MIQA 3PLLA 4Y3JA 1K2CA 4H3IA 4KB9A 1QDMA 1HEGE 5P4PA 4Y39A 4E43A 2B8VA 3BXRA 3R0YA 2QD8A 1BDLA 4NJVA 5P65A 5P6UA 3ZLQA 2B8LA 5P4UA 3PEPA 4TVGA 4L7HA 1HTGA 4EJ8A 1SH9A 4Z50A 5IVSA 3VG1A 3S53A 2Q54A 1A30A 3RTNA 5P03A 5P7PA 3CICA 2G20A 3ST5A 1FF0C 4LBTA 4YCTA 1HXBA 5P17A 3L5CA 5P2KA 5P7BA 2ANLA 3OUDA 5APRE 5COOA 5P7UA 2PQZA 5OZGA 3PI0A 3VF5A 3IXOA 5OZIA 1F34A 1ER8E 4J1HA 2OHPA 1DP5A 2Q3KA 3VV7A 4KE0A 2IDWA 4AA8A 5OZMA 3C9XA 1ZSRA 2VA6A 4YBIA 2Q63A 4I0ZA 3VLBA 4JPEA 1EPLE 1FQ8A 1K6TA 2Z54A 3NR6A 5P5QA 4GB2A 5P49A 4ZSQA 1ZTZA 5DR7A 5DGWA 1KJGA 3FSMA 4BFBA 5P1CA 2PC0A 3LIZA 3MSKA 1EC0A 3IAWA 5B18A 5P38A 1M0BA 2WEBA 5P8MA 5IE1A 1HOSA 3S54A 4CPRA 1LV1A 5P01A 5HE5A 5P6VA 3H0BA 4HDPA 4Y3ZA 3UFLA 5I3XA 4PZXA 4NJUA 5P1QA 2OHMA 3TNEA 4RLDA 4YE3A 5P6BA 4ZSMA 2HB3A 2O4SA 5P1MA 3T7QA 4YDFA 3MSLA 2CENA 3QRSA 2VNNA 1RL8A 3KMXA 5P20A 4QJ6A 4EJDA 3APPA 2I4XA 4NJTA 1ZJ7A 1IVQA 2PSVA 1GNNA 3OHFA 3FX5A 5P6GA 5P8AA 3BUHA 2NMYA 1DW6C 5P3EA 5BS4A 5ISKA 5OZNA 3PRSA 2WF1A 5HU0A 5P7FA 1B5FB 2FNTA 4I12A 4Y3SA 2G1SA 1GVVA 3TLHA 1ZBGA 3SACA 3CYWA 5P2QA 5C9FA 1E5OE 5P31A 4GJDA 4Y6MA 5AH6A 5P36A 5P77A 2QNNA 1KJ4A 9HVPA 5P7VA 2A4FA 2ZJNA 4OBZA 5HE7A 2QI7A 5P6SA 3PMYA 5P0FA 3QVIA 5P81A 3FNTA 2XYFA 3NU5A 1EEDP 5P7WA 2CEJA 3N4LA 4Y45A 1HIIA 1UPJA 2V13A 5OZUA 2BPVA 4RVXA 5P5GA 3WSJA 5DGUA 5IVQA 5P3FA 1LF3A 4Y56A 4XX4A 4R93A 1B6MA 4CPQA 1BXQA 2WEZA 5P0KA 1OEXA 4Y51A 2IL2A 5P2BA 2OF0A 4Y41A 4PPHA 3URIA 5KR0A 4Y3DA 4NPTA 5P80A 3IN3A 4GJCA 4FRKA 4DJPA 2XFJA 4HEGA 3KT2A 5OZ9A 5OYUA 5P0AA 2AZBA 1SP5A 5P5SA 2AOIA 4I0GA 3SA9A 1UH8A 3OU1B 5P32A 1NSOA 5P28A 3PWRA 5P4LA 2IENA 1D4JA 3OQAA 5P7AA 5P55A 4Y3HA 2Q5KA 5P3IA 5OZLA 5CONA 3SA5A 5DPZA 1U8GA 3Q5HA 4HZTA 2NXMA 2JE4A 3O9AA 1GVTA 3PMUA 4Y4EA 2B42A 2H6SA 5P5TA 4QJ9A 5P86A 3LNKA 4Y4WA 3S43A 2QMGA 6APRE 2AZ9A 1DMPA 3OWNA 1MEUA 1HSIA 4RRNA 1A9MA 3BUFA 5P2UA 3DUYA 1E80E 4Y3EA 1BDRA 1BDQA 3JVYA 4EYRA 2F8GA 3ZKXA 1EAGA 5P7LA 5P52A 2QNPA 1SIPA 1W5VA 2Q11A 3TPRA 2I1AA 3RU1A 4FSEA 4Y3FA 4Y4BA 4MC2A 3LIVA 5P7KA 3DOXA 5AHCA 3K5FA 3L5FA 4GMIA 3K1WA 1C6XA 5P7HA 4Y3TA 2QZLA 3NU4A 5DR4A 5OYXA 2NMZA 2QP8A 2VIYA 2ER6E 3UCBA 5P0QA 3APRE 4HDBA 2QMPA 2VJ7A 3FKTA 1SMRA 5P0HA 2R38A 5OZBA 5P7JA 5P0MA 5P2YA 2R5PA 5OYSA 4ZEAA 3K5CA 5OZCA 5P6TA 1C6ZA 1LF2A 4YD4A 1SGUA 1PSOE 4R5NA 2V0ZC 2VA5A 2RKGA 5P1LA 2JJIA 1XL5A 2BPYA 5KQYA 1SMEA 5JFUA 1KJ7A 1LYAA 3UQXA 5P2ZA 4HVPA 3PWMA 2IS0A 5AHAA 5P2EA 7UPJA 4LC7A 4DJQA 1AJXA 3OTYA 5P3HA 1G6LA 3M9FA 2QI4A 2MIPA 4AZYA 5P0JA 5P25A 3EM4A 1B6LA 3Q4BA 1W5XA 1HVSA 3WB5A 2HB2A 2OHKA 5P8BA 1YM4A 2UPJA 3SQFA 2AOGA 2WECA 5P07A 4Y53A 5P3PA 5P7DA 1ODWA 5C9DA 5P0TA 4F74A 1GKTA 3Q3TA 3EL0A 5P0SA 4IVTA 3UPJA 1HSGA 4DPIA 4GIDA 3UQRA 3A2OA 1YTHA 3SPKA 3NXEA 3IVIA 8HVPA 4QLHA 5P56A 1BBSA 4ZSPA 1GVUA 4B72A 5P3WA 5OZ8A 2AOHA 3KDBA 5OZEA 4B00A 1ODYA 2FLEA 3VFAA 1LF4A 1BAIA 2UY0A 6FIVA 3NU9A 3INHA 2ASIA 4DPFA 3KFNA 2G27A 5HCOA 1M43A 4B0QA 1QBUA 5HCTA 1TW7A 5P72A 2QZXA 5TOLA 3WB4A 5P8PA 5P5JA 5OZ5A 2QZWA 2AVQA 2QI0A 2EWYA 2B7ZA 3QBHA 3PB5A 3PM4A 1G0VA 5P8UA 3HW1A 5P8KA 3ER3E 1LZQA 3LINA 4JP9A 3MWSA 3TPLA 2VIZA 2O4NA 2QD7A 5P0LA 2V00A 5P4AA 1EC1A 3RVIA 5ER2E 5P4GA 3KYRA 4D89A 4J1EA 4YA8A 1IIQA 3G70A 5P6ZA 1OHRA 5P2JA 2ZYEA 4D8CA 3LPIA 2AVMA 3CYXA 4OD9B 1IVPA 5P4MA 3OQKA 4DQEA 3O9HA 2VA7A 4GJ5A 4Y9WA 4L1AB 5ENKA 1HVLA 5P05A 5P2GA 4Y4TA 1BVEA 4GJ8A 3CMSA 4DJRA 2RMPA 2IEOA 4GJAA 5OYQA 1M4HA 1ZSFA 3SM1A 3WZ6A 3RTMA 2OHQA 2I0DA 3NDUA 3DK1A 2IGXA 2P3CA 1Z1RA 1MRWA 5F00A 1EBZA 2P3AA 1C70A 1B11A 4FIVA 1G2KA 5IVRA 3HAUA 4L7JA 5P15A 3SKGA 3KN0A 2ZJMA 5P5AA 1RPIA 4NKKA 3GW5A 5P3YA 4Y4UA 2HS2A 3R1GB 3EKVA 4RROA 1MUIA 3TOHA 4GJBA 5P3MA 3SA7A 5P1DA 5P71A 3KMYA 4MC6A 4ZPEA 3UQPA 2FMBA 3OHHA 3EKXA 1HVIA 5P5DA 4Y3QA 3PBDA 2NXLA 1ODXA 2BB9A 5P42A 4DI2A 5OZ1A 4WTUA 4CP7A 5JFPA 5T4SA 4Y35A 3I25A 4CPUA 5P4KA 5P66A 4JPCA 4LAPA 5P3OA 5P7RA 1D4HA 2PK5A 3CKPA 3NSHA 4S1GA 1XDHA 3HDKA 3L5EA 1FMBA 2WEAA 5P1OA 2QHCA 1Z8CA 4YDGA 4FAEA 4RVJA 5P34A 2PSUA 4Y5AA 3ZL7A 2CEMA 1DAZC 4ER1E 4FSLA 2WJOA 1HHPA 5IVTA 3QI1A 5HE4A 5P1WA 3VF3A 1MTBA 5P6YA 1HTEA 3IVHA 4DQHA 4F76A 3GI6A 3URJA 1Q9PA 4MC9A 3UDYA 3KFRA 3ZKMA 4OC6A 5OYYA 4GJ9A 2PH8A 2OHSA 3BC4A 5P1FA 5P5YA 5P4HA 3D1YA 5P5HA 5P89A 1K6VA 3HD8A 1QRPE 1XE5A 5I3WA 2XFKA 3L59A 1CMSA 1HTRB 1EPQE 5P8OA 2QD6A 1LS5A 3PGIA 2B60A 1E82E 5P0PA 5P27A 2IGYA 2BBBA 5P18A 1HVKA 3SM2A 1CPIA 3TPJA 1DPJA 3LIXA 5P6DA 5P30A 4J1IA 3S7MA 4Y4DA 2A1EA 5P1TA 5AHBA 3OQFA 1MSNA 1OEWA 5P5ZA 2P3BA 1BWBA 1SDVA 2O4LA 1XE6A 4DJWA 3EL1A 2PMAA 3L5DA 2NXDA 3PSYA 5OZFA 5DQ2A 5KQFA 2R3WA 4Y4ZA 5P5MA 5P7XA 2AODA 4Q1YA 1XN2A 2HS1A 4FL8A 1B6KA 2G24A 2HPFA 3H5BA 3LZYA 3OU1A 2IQGA 1TQFA 4FRJA 5P3JA 1B6PA 2QHYA 3HAWA 1PSNA 1T6EX 3TOGA 4QJAA 3Q6YA 1LYBA 2F3EA 3D3TA 3O9LA 3QROA 4KE1A 5P6HA 3OU3A 1HSHA 5DQ5A 5P63A 4J0ZA 1MSMA 4XXSA 5DQ4A 5OZQA 5P50A 1A94A 2IKUA 3O9FA 5I3VA 5OZAA 2BPZA 3EBZA 4CPSA 3PI5A 3DM6A 4Y5CA 5P1VA 3PWWA 5P8CA 5P53A 4H3GA 3O9BA 5P4OA 5P2AA 5P6FA 5P88A 3LZUA 3VFBA 5ER1E 1QBTA 5P0ZA 4EQJA 1WBKA 3EKQA 4BELA 4DQCA 4YOAA 5P1RA 5P5UA 5P3GA 5P5OA 1HVJA 2ZJKA 5P06A 1EPRE 5P7YA 4TRYA 5OZ2A 3TKGA 3QAAA 5KOQA 1EBKC 1K1UA 3OUDB 5SZ9A 4FM6A 3Q70A 4Y47A 3INEA 1BXOA 2NR6A 3KDDA 3OU4A 5C9BA 4B78A 4I0JA 2WEDA 3I6OA 5KR2A 4J1FA 3U7SA 4DJUA 5OZ7A 3EXOA 3OXXA 2I4VA 3L3AA 4M8XA 4RVIA 3NLSA 5P5BA 3ZPTA 5KQZA 1APTE 5P0NA 1PFZA 3ZKQA 5DR8A 3OY4A 4J5JA 4JOOA 1FFIC 5P1BA 2ZHSA 3S2OA 1AVFA 1FQ7A 4Q1XA 5P4YA 1QBRA 4Y4GA 2ZJLA 5OZHA 5P59A 5P8QA 5P4BA 4D85A 1IBQA 4UPJA 5P6MA 1QS8A 1FQ4A 1NPVA 3QVCA 4YHQA 1MPPA 2ZHUA 5P3XA 2RSPA 1E81E 1OD1A 2JXRA 3LIQA 4TRZA 4Y36A 4FRSA 2BPWA 2AVVA 5P5XA 1HIVA 4I1CA 3OUCA 1T7KA 5P5RA 2AZ8A 2G1NA 3TOFA 5P14A 2IKOA 5P5FA 4DQFA 4I8WA 1W50A 4J54A 3NXNA 5P6RA 1GVWA 2HAHA 4Y5BA 1EPOE 1HXWA 3IA9A 5P82A 2QI3A 3NDXA 3LPJA 3LZSA 1YTJA 5DQCA 1IDAA 1MESA 1D4IA 3D20A 5OZ3A 1HVCA 1NPAA 3FIVA 1Z1HA 3QPJA 2WF4A 4ZE6A 3UDPA 5P2TA 5P2IA 5P0GA 4OBZB 5P4FA 5P4IA 3ZPSA 2AZCA 3O9EA 3PSGA 3D91A 5P2HA 3AIDA 3VV8A 4DQGA 2HIZA 2WL0A 2QU2A 3NUJA 4PZWA 2G1YA 1EC3A 1IZHA 4XX3A 4Y43A 3EM3A 1AXAA 2QI5A 4OBHA 5P16A 5OZXA 5P23A 1FG8C 2PSGA 3I7EA 2J9JA 5P8IA 1UH9A 3LHGA 5ISJA 3IN4A 4R8YA 3TKWA 5P1IA 4J0PA 1D4YA 4CPTA 3D1XA 4BEKA 5OZWA 5P37A 2ZDZA 5P5WA 3ZKSA 5BWYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3OGQ A;  4APR E;  3KDC A;  5P5N A;  5DR3 A;  3OK9 A;  5P6X A;  5P3Z A;  4PYV A;  3S7L A;  3GGA A;  5P58 A;  2V10 C;  4ER4 E;  5JOD A;  3BRA A;  4EJK A;  1IZE A;  1NH0 A;  2VIJ A;  2QU3 A;  5COP A;  4Y5M A;  4A6B A;  2J9J B;  1EBY A;  1MT7 A;  5DQ1 A;  4TRW A;  5P29 A;  1W51 A;  3SA6 A;  3UDN A;  3HZC A;  4Y5G A;  4B05 A;  5HD0 A;  4Y44 A;  5P5L A;  2BPX A;  5P6J A;  1HRN A;  1G35 A;  4D88 A;  5P5V A;  3QP0 A;  4I0E A;  4ZPG A;  5P46 A;  3VYF A;  3G72 A;  5P4T A;  4Z2Z A;  3NWX A;  3F9Q A;  5AGZ A;  5P3D A;  3JVW A;  4ZLS A;  5P1A A;  4LXK A;  1TCX A;  2QK5 A;  3QRM A;  3ZPU A;  1FIV A;  3VCM A;  2HB4 A;  1PPL E;  5P35 A;  1HVH A;  3I8W A;  3INF A;  4J0V A;  5P45 A;  4GJ6 A;  2QHZ A;  1B6J A;  1HWR A;  4YCY A;  1QBS A;  2R9B A;  4NPU A;  5P44 A;  4LP9 A;  5P4C A;  1FEJ C;  4K4P A;  4DVF A;  2P83 A;  3OAD B;  4YOB A;  5P19 A;  3G6Z A;  5I70 A;  4K4R A;  2WKZ A;  5P3T A;  3LZV A;  5P09 A;  2G26 A;  2ZJJ A;  2HC0 A;  3I2L A;  1VIK A;  5P6W A;  1YG9 A;  1BWA A;  4LXM A;  1TSQ A;  4A4Q A;  4DJO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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