5ISJA

Endothiapepsin in complex with chiral chlorinated primary amine fragment
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystallographic Fragment Screening of an Entire Library
rcsb
molecule keywords Endothiapepsin
molecule tags Hydrolase
total genus 84
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2016-03-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5isjA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5isjA01
3OXXA 5P4FA 3OXVA 4QJ2A 1HIVA 5AH6A 4FRSA 5OZVA 3UDJA 4M8YA 5P4AA 5OZ6A 5P64A 2WL0A 2QI4A 5P6FA 8HVPA 4DQEA 4Y4AA 2O4KA 5HE4A 3KDDA 1W5WA 3MSKA 5IVSA 4CP7A 1LYAA 5TOLA 5P0WA 5P2DA 1BVGA 3OAGA 3L5FA 5P68A 3RVIA 1W6IA 3Q70A 3LNKA 3BUFA 1MSNA 4PPHA 4COEA 3GGAA 5P5BA 1EBKC 2AZ8A 4Y38A 4DV9A 4B78A 2ASIA 5P7RA 3LINA 5P23A 3OK9A 5DQ4A 1EC2A 2G1RA 5P39A 5OZ0A 2WF0A 2PWCA 4Y47A 2I4DA 4DJVA 5OZ1A 4DJXA 4EQ0A 1VIJA 2ER7E 5P1WA 2WF4A 4U8WA 5P3MA 3Q6YA 5OZZA 4CPRA 4Y44A 2OHPA 3GI0A 1QBTA 5JODA 5P0PA 5P36A 4R5NA 5I70A 4B1DA 5KR2A 5OYRA 1G35A 2O4SA 3TOGA 3DUYA 5P2ZA 5P5FA 2QD8A 3ZPUA 5I3XA 3MXDA 1D4IA 5CONA 5P2EA 5P87A 3VYDA 4R92A 5P0LA 1G6LA 3OUDA 5P6YA 3R0YA 3OGQA 1B6LA 2O4LA 2ZHVA 4QJ9A 1W5XA 2AZBA 1AIDA 5P8DA 4HA5A 5P12A 1B6KA 4HDPA 3SA4A 2OAHA 5P2NA 5P7LA 3UQUA 4FAEA 1CZIE 3JVYA 1HVSA 1XN2A 4YD5A 5P0YA 7UPJA 2B42A 3OWNA 4NKKA 5P69A 4KE1A 1HPVA 3OTYA 2QI7A 1LYBB 3SA8A 3VV8A 1SBGA 3D1YA 3ER3E 5P37A 4NJUA 1MIQA 3R2FA 1IVPA 1A30A 3OQDA 3F9QA 3K4VA 5P5HA 5JFPA 1EBWA 3K1WA 3OADB 4Y4BA 3OUAA 5P5TA 3EBZA 4EWOA 1OEWA 3WZ7A 5OYXA 4GJ9A 3RTMA 3QROA 2VIJA 2AVQA 3ZKMA 4L6BA 4Z22A 5P7IA 3OU1A 4Y5NA 3HAUA 3O9LA 2R5PA 5I3YA 2NTRA 1SIVA 3NU5A 1T7KA 3TL9A 2CENA 5OZAA 5P3OA 1TQFA 1IDAA 3PLLA 5OZOA 2HC0A 4I0ZA 1TCXA 1UH8A 3OY4A 3ZPTA 2P83A 3WZ8A 3EL9A 1ODXA 4Y35A 1SDVA 1T6GA 5P4HA 5P6EA 5P25A 1DW6C 5P7QA 2HIZA 4F75A 4RCEA 1MEUA 5P50A 2IGYA 3OAGB 4RCFA 3UQRA 1E82E 2AOGA 3NWQA 5KQXA 4Y37A 3SA3A 3L5DA 3WB5A 2VJ9A 5P57A 5P1LA 4FRKA 5P3QA 4M8XA 4Z4XA 5P8BA 5OZRA 5P60A 4OBGA 4FSLA 5OZ5A 5P6JA 1FGCC 3OGPA 5P1FA 5P38A 2ZJMA 1HVHA 5P1EA 5KQFA 2WEDA 3QIHA 1LYWA 4LXMA 5P7WA 5OZUA 1A8GA 5P5PA 4I1CA 3K5FA 3EKVA 5BS4A 3EC0A 1SH9A 4I0IA 4DJRA 5P8PA 3S56A 2O4NA 5P42A 5P3FA 5P4BA 1AJVA 4AA8A 3L38A 2P3AA 3HZCA 4CPUA 3AIDA 4Y4XA 3EXOA 4JPCA 1QBRA 2I0AA 2B7FA 4Y45A 1HEGE 3URIA 4RVJA 5P22A 5P31A 2G1NA 5P6QA 5HU0A 5P61A 5P1YA 5P6TA 5P3LA 4RRNA 5P3WA 5P7YA 3PWMA 1HHPA 3KFSA 3TKGA 5P5AA 1RNEA 5P11A 3NSHA 1HSHA 2H6SA 3VYEA 2RMPA 5P3PA 2QHYA 4YOAA 4Y50A 2QAKA 4Y4TA 4HEGA 1FQ4A 5P1DA 5J25A 4H3GA 5P14A 5P54A 5P2GA 3UCBA 3VV6A 2WEBA 1QRPE 2B8LA 4ZIPA 5P6IA 9HVPA 3VV7A 5DR1A 3IXOA 5P66A 4PZWA 4J5JA 5P4GA 1SMRA 5P8RA 4I8WA 1ZJ7A 4U7QA 3QRSA 4GB2A 1DPJA 3SO9A 4K8SA 2VA7A 3O9LB 4YD7A 1YM2A 3NDUA 3NDWA 5P6CA 5P6XA 2OHSA 1T6EX 1ZLFA 2FGUA 2AOEA 5P32A 4CPXA 3D91A 3OXWA 4FS4A 2IKOA 4AMTA 3QBHA 4J0VA 5P6AA 5SY2A 1QBUA 1LZQA 3FSMA 4RCDA 5SZ9A 3TPPA 4YDGA 2FXDA 3PSYA 4RRSA 5AHBA 3L59A 3SAAA 1HVRA 5SXNA 4GYEA 3Q4BA 4AA9A 2QI0A 3SABA 4Y3RA 5IVRA 4HLAA 5OZLA 3ECGA 1SP5A 3HW1A 3PHVA 1SMEA 2P3BA 2BPWA 1HVIA 4GJAA 4J55A 5P1TA 5P5GA 5OZMA 1OEXA 4FIVA 4K4RA 4EXHA 5P3XA 1FQ5A 5OZCA 2BQVA 5P40A 4FAFA 1ENTE 4HDFA 1EC0A 3L5CA 3K5CA 5DGWA 4JECA 4I0JA 5P3ZA 4TVGA 5P0BA 5P33A 4Q1YA 1UPJA 1BWBA 2J9JA 5P4OA 4MC2A 4TRYA 2Q15A 3HLOA 3LPIA 1LYWB 5B18A 2VNNA 3O9EA 4EP3A 5P4YA 3ZOVA 5P8EA 5P7NA 2SAMA 1APTE 4GJBA 5P4KA 2Z4OA 4RVXA 2QMGA 5P17A 5P1NA 2MIPA 4RYGA 1K2CA 5P5NA 3UDHA 5P3NA 2QI3A 3PBZA 4EP2A 2B60A 3PLDA 5P2YA 5P1GA 3O9FA 3SPKA 4YHQA 5P80A 4YD6A 5P2MA 4A4QA 5BRYA 1IZDA 3IN4A 4Y4WA 4B05A 1META 4D8CA 5IE1A 1RV7A 5P6HA 4IVTA 4ER2E 3S43B 5P10A 4OBZB 1JLDA 1HVKA 4OD9B 2XYFA 2R5QA 5P6DA 5P7XA 5P15A 4DUSA 2Q55A 1MRXA 2BPYA 3UDPA 3ZKXA 3AUPA 5P7BA 2QP8A 3IXJA 3IGBA 2VA5A 5P5EA 3UFNA 1NSOA 4TVHA 2HPFA 5P0NA 5P0JA 1ZPKA 5C9FA 2APRA 2UXZA 3EM4A 1AAQA 2PYNA 3IA9A 3GW5A 1HPXA 3S8IA 2Q11A 5P5VA 5P2WA 3K5GA 5P3CA 3PWRA 2UY0A 4DI2A 3O9CA 5P4MA 4GJ7A 3RSXA 1CPIA 4JP9A 2G94A 2O4PA 4RYCA 1FEJC 5P4UA 5P78A 2F80A 2R8NA 1HEFE 5P30A 5OYUA 2V10C 2Q3KA 1YTHA 1BAIA 1FG6C 7HVPA 5DR3A 5C9BA 5OZBA 5P4QA 1FMBA 4B1CA 1HXBA 2I4VA 3CIBA 2F3EA 3KYRA 3S54A 3UFLA 5KOQA 2I4QA 5P7KA 5E5KA 2BPZA 4J1HA 3SKFA 1MT7A 4YD4A 2VIZA 3EKWA 4ACXA 5P04A 4CPTA 3NYGA 3NR6A 4NJTA 2V0ZC 3QVCA 5P1IA 5P53A 5ER1E 3SACA 4APRE 2ZHSA 3UQPA 5ER2E 5P4SA 4OBJA 5P0KA 2HB3A 4DQCA 1FQ7A 4GZFA 5P6KA 3TH9A 3PM4A 5P70A 3QAAA 3T6IA 1ZP8A 1MSMA 5P7HA 2ZGAA 4Y4UA 5P8OA 1T3RA 3BVBA 3MSLA 3LIQA 3NXNA 3HBOA 3VSWA 4KB9A 5T4SA 3VYFA 3DCRA 4Y4EA 2VIYA 4RZ1A 1AXAA 3TOFA 3DM6A 5P34A 3OQ7A 4CKUA 3MWSA 2AZCA 2FDPA 5OZ7A 2AOHA 1YTIA 1ME6A 3NU9A 3OHHA 1T7JA 3LZYA 4FE6A 5P3DA 5P63A 1XDHA 3G70A 1D4HA 1PSOE 2R9BA 3PI0A 2Q63A 2G22A 1M43A 5HDXA 5P2IA 4R93A 4IVSA 3ZPSA 4Y3GA 5P89A 5P6ZA 1K6PA 5P8MA 2R3TA 3OU4A 5P0MA 5P83A 4BFBA 5OZKA 1W5VA 2ZJJA 2QNQA 2A1EA 2VJ6A 2R3WA 1HVLA 5P4NA 2NPHA 4Y56A 3OQKA 3G6ZA 3QI1A 3K5DA 3ZKGA 3BXSA 4ZEAA 4NPTA 4R91A 2P4JA 1ZBGA 1E81E 3O9AA 5P0SA 1BDQA 1GNMA 4DJQA 3OTSA 5P1JA 3VLAA 5P8VA 4EJ8A 2V00A 4D88A 4J1KA 1A94A 4UPJA 5P8GA 2OF0A 4FL8A 2ZJHA 4PHVA 4PZXA 3U6AA 4LXKA 1SIPA 3LIXA 3DV1A 1XL2A 3PSGA 5DQ1A 5E5JA 3PCZA 3PCWA 1EPPE 3BGBA 1EC1A 5P4VA 5P5WA 4YDFA 3WSJA 4Y54A 4Y3YA 1IIQA 3CKPA 2V16C 4F73A 5P5CA 5P0UA 5COOA 2JXRA 5P7CA 1LV1A 4H3FA 3PVKA 5P88A 4FGXA 5HDZA 4J17A 5P6VA 3NWXA 1D4YA 1WKRA 1XE5A 4FCOA 4NJVA 3QVIA 2QNPA 1HPSA 4Y43A 4QGIA 3PSUA 5P5RA 1ZSRA 5P65A 5PEPA 5P6NA 3NUJA 4Y3PA 3KA2A 4LAPA 5P08A 5OZ3A 2BPVA 4H1EA 4NPUA 5P7AA 5P3AA 3FNUA 5P6RA 5DR4A 1EPNE 2IKUA 4J1CA 5P1AA 1F34A 4FM8A 5OYWA 3TPJA 3VLBA 2JJIA 1LEEA 2VNMA 1KZKA 3SLZA 3S2OA 1W51A 4ER1E 5IVQA 2NNPA 3EKXA 4I10A 5P2LA 3CMSA 5P2KA 3R0WA 4WY1A 1HRNA 1Z1HA 5P4RA 5P4WA 1EPQE 1LYAB 5P24A 1A8KA 4YOBA 1FFIC 3WB4A 3S85A 3R1GB 5P0RA 1FMUA 5P0CA 5P4CA 3OQFA 2QK5A 3EM6A 3QPJA 5OZHA 4GMIA 1BV7A 4LHHA 5P3RA 3L58A 3FIVA 5KQZA 5COKA 5P1ZA 4DJPA 3INFA 5P82A 3TLHA 4EHCA 3OU4B 3SKGA 1NPAA 4L1AA 5P7MA 3OUBA 5I3VA 5APRE 4FLGA 4ZLSA 4DJWA 5P75A 2QD6A 4QJ7A 2G26A 2XFKA 2VKMA 3QRMA 2F8GA 3TKWA 2BJUA 5P56A 3FV3A 3PJ6A 5I3WA 1HVJA 4ACUA 4B72A 5ENKA 2Q64A 3BXRA 3OUDB 3T11A 1AJXA 5P7EA 4Y3MA 2IS0A 5AHAA 2G69A 3A2OA 1FFFC 1K1TA 5P8TA 4YD3A 5AH8A 5OZGA 2EWYA 5P3SA 2QMDA 2OHQA 3B80A 1TCWA 2ER6E 4Y5GA 3KT5A 4Y57A 5JG1A 3KDCA 4Q1NA 3T7QA 1D4JA 5P0GA 4PYVA 5P3GA 4D83A 4RVIA 4I0FA 4FRJA 4OC6A 3FX5A 2I4WA 5P5UA 2AZ9A 4TRWA 5P0ZA 3C9XA 2OHRA 5P86A 4Y3HA 3NDTA 5P4DA 4Y58A 1BDRA 3OOTA 1HBVA 5OZTA 5P4IA 3EL4A 3ZKSA 3OU1B 5OZFA 1SDTA 2G24A 5F00A 2P3DA 2WECA 2A4FA 2PC0A 1CMSA 4LXAA 3APRE 3CYXA 5DGUA 3ZKQA 1TSQA 5P6WA 4MC9A 1OHRA 4Y5MA 4Y3AA 1A9MA 5P2XA 1ZAPA 3UQXA 3CKTA 3Q3TA 5OYQA 3FKTA 5P4XA 1SGUA 1K6VA 3O9IA 1LF3A 1T7IA 3KF0A 5P77A 3OUCA 2HPEA 5P0DA 5ISJA 4XXSA 2H6TA 2XYEA 2ZJLA 2QZXA 5P6MA 4J54A 1B5FA 4GIDA 2RKGA 3DK1A 1W6HA 2ZJNA 4GJ6A 5CLMA 1KJFA 5KQYA 1PPKE 3BRAA 4GJ5A 1DP5A 2BBBA 4FRIA 4Y5CA 2HB2A 5P06A 1K1UA 2R43A 1HWRA 3B7VA 3O9BA 3UDQA 4Y5KA 5P8KA 2PSUA 3SM2A 2HS1A 3KFRA 4XX3A 3WZ6A 4EXGA 1HIHA 1NPWA 4I8ZA 2ZJIA 2JJJA 4L1AB 5P02A 2PK6A 4H3IA 5HD0A 5P2QA 2O40A 5P1OA 4Y4DA 5P8AA 2PMAA 5P3VA 4I11A 4B1EA 4Y41A 1QBSA 4EJLA 3OU3A 3UPJA 2QI5A 3KDBA 1B6MA 5OYYA 1FG8C 3GGUA 4X7IA 3DCKA 5DPZA 1HVCA 4JPEA 3QN8A 5EZXA 4YBIA 5P0AA 4S1GA 4Y4GA 1G2KA 3PMYA 2HAHA 1MVPA 3T3CA 4EJKA 1GNOA 4B70A 2ZE1A 5P8HA 2FNTA 5P5ZA 4A6BA 3D3TA 3O9DA 1FQXA 3HAWA 2IENA 2PH6A 1D4KA 4Y3ZA 4YCTA 4FSEA 3PGIA 5P13A 3QP0A 1F7AA 5P20A 2QHZA 5P1BA 3GGXA 4Y3QA 3I6OA 5HU1A 2FS4A 4HZTA 4X2LA 1KJGA 4XX4A 3FNTA 1KJ7A 3I8WA 3HVGA 4GJDA 4R95A 3NXEA 4R8YA 4CPSA 3ZL7A 1YX9A 4DPFA 1FB7A 5P5OA 4RGHA 2AOJA 4DJYA 5OYSA 5P2AA 1C6XA 5P79A 3LZVA 5P6LA 5P49A 5P03A 4I0EA 3VEUA 1BILA 2I4UA 5P7JA 1BDLA 2QU2A 5P2JA 4Y5PA 5OZDA 5P2TA 1APWE 1ODYA 1D4LA 1ZPAA 3VFBA 4KE0A 3KM4A 4OBKA 1BXQA 2IQGA 4B00A 4J1EA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3OXX A;  5P4F A;  3OXV A;  4QJ2 A;  1HIV A;  5AH6 A;  4FRS A;  5OZV A;  3UDJ A;  4M8Y A;  5P4A A;  5OZ6 A;  5P64 A;  2WL0 A;  2QI4 A;  5P6F A;  8HVP A;  4DQE A;  4Y4A A;  2O4K A;  5HE4 A;  3KDD A;  1W5W A;  3MSK A;  5IVS A;  4CP7 A;  1LYA A;  5TOL A;  5P0W A;  5P2D A;  1BVG A;  3OAG A;  3L5F A;  5P68 A;  3RVI A;  1W6I A;  3Q70 A;  3LNK A;  3BUF A;  1MSN A;  4PPH A;  4COE A;  3GGA A;  5P5B A;  1EBK C;  2AZ8 A;  4Y38 A;  4DV9 A;  4B78 A;  2ASI A;  5P7R A;  3LIN A;  5P23 A;  3OK9 A;  5DQ4 A;  1EC2 A;  2G1R A;  5P39 A;  5OZ0 A;  2WF0 A;  2PWC A;  4Y47 A;  2I4D A;  4DJV A;  5OZ1 A;  4DJX A;  4EQ0 A;  1VIJ A;  2ER7 E;  5P1W A;  2WF4 A;  4U8W A;  5P3M A;  3Q6Y A;  5OZZ A;  4CPR A;  4Y44 A;  2OHP A;  3GI0 A;  1QBT A;  5JOD A;  5P0P A;  5P36 A;  4R5N A;  5I70 A;  4B1D A;  5KR2 A;  5OYR A;  1G35 A;  2O4S A;  3TOG A;  3DUY A;  5P2Z A;  5P5F A;  2QD8 A;  3ZPU A;  5I3X A;  3MXD A;  1D4I A;  5CON A;  5P2E A;  5P87 A;  3VYD A;  4R92 A;  5P0L A;  1G6L A;  3OUD A;  5P6Y A;  3R0Y A;  3OGQ A;  1B6L A;  2O4L A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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