5KOSA

Discovery of tak-272: a novel, potent and orally active renin in-hibitor
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
337
structure length
331
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of TAK-272: A Novel, Potent, and Orally Active Renin Inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 331
sequence length 337
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2016-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5kosA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5kosA01
3TOHA 3UDQA 3EKYA 4LL3A 4L7HA 3OQFA 1FKNA 3EKPA 3PMUA 2NR6A 4ZIPA 4B77A 4L1AB 3NWQA 3EM4A 5P6YA 2XFIA 2VKMA 3EM3A 4ACUA 5AH9A 2QHYA 1NPWA 4GJ9A 4YOBA 1D4SA 2PK5A 4PZWA 4Y5AA 3UDMA 2Q11A 4AZYA 2G20A 1XN3A 3UQWA 3KYRA 1F34A 5P1MA 2OHNA 3ZOVA 5KOQA 3UQRA 4ZPGA 2AOCA 2I4DA 4YDFA 5P76A 4J0ZA 1HBVA 5P3HA 4PEPA 5P4OA 5P19A 3OK9A 1SIVA 3D1YA 4TVGA 3MXDA 4Y5LA 3H5BA 3SLZA 3T3CA 2PSGA 5P29A 1FF0C 4CPXA 2G21A 3VLBA 5P7JA 1KJ4A 3MXEA 2Z4OA 3H0BA 5AGZA 5P3OA 3EL4A 4QJ8A 1LF2A 2F8GA 5P50A 5P6SA 3VCMA 5P3GA 4S1GA 2Z54A 5P5DA 3BUHA 4B1DA 1RNEA 3OTSA 3JVYA 3SA6A 5P25A 5OZXA 2QNPA 3APPA 4Y3PA 3K1WA 5P5PA 4BFBA 3OAGB 4B78A 4MC6A 4B00A 1VIKA 3VF5A 1ZLFA 5OZGA 1AIDA 2VA7A 4U8WA 2FNSA 4DJQA 4D8CA 2RMPA 4DQBA 5ER2E 5P7MA 2PWRA 4Y3WA 3NU4A 4Y54A 1G35A 2AOGA 5P0GA 5P46A 5P4VA 4L1AA 5P5FA 5IVSA 3OUAA 5OZ3A 1HSIA 5P6BA 5JFPA 4Y5MA 1UPJA 1B11A 3CKRA 4Y56A 3RTHA 3O9EA 5P5CA 3R0WA 5F01A 4ZSRA 4HA5A 5IE1A 5P7WA 5I70A 2Q54A 4ER2E 2MIPA 5OZ9A 3TOFA 1M43A 4ZEAA 3ZMGA 3M9FA 3MSLA 4B70A 4L6BA 5P3RA 3L5EA 5P6IA 3OTYA 2F3KA 3BC4A 4KE0A 1PPME 3S43B 1VIJA 3CMSA 5P70A 2P3CA 4Y45A 5P84A 3SA7A 5P0KA 1LF4A 1LZQA 3WB4A 3OQ7A 4KE1A 3ZKNA 5AHAA 3INHA 4YCYA 2HAHA 3VFAA 5I3WA 3D1XA 2WECA 4GJ6A 2ZHTA 4EJLA 5P24A 4J1EA 4Y3MA 4DFGA 4KUPA 5P6CA 1KJFA 1YT9A 4Y3NA 1LV1A 5P4XA 4I8WA 4GJ5A 5P1TA 5P4PA 3SA4A 1YM2A 3AIDA 3OAGA 4FCOA 2UXZA 4L7GA 5P2VA 2BKSA 3KDBA 2Q15A 1A30A 1EBZA 2IGYA 5P0MA 3ZKQA 5P1JA 5P53A 2VJ6A 3S7MA 3B80A 2F81A 2AOHA 2WEDA 3HLOA 5P8RA 3QROA 4DJXA 4HDPA 3L5DA 1APUE 3VF7A 5P1EA 5E5JA 3OQAA 5P3FA 3BRAA 5P49A 5OZ4A 5P45A 3PGIA 2ER9E 2F3EA 2O4KA 3KF0A 4J1FA 3KDDA 3SA9A 1OEXA 1XE6A 1ZTZA 5P5ZA 5P6MA 1WBMA 1W50A 7UPJA 4R91A 1EAGA 4RYGA 1QRPE 2WF1A 3RU1A 5P40A 2AVVA 1QDMA 3I25A 2J9JA 4GJ7A 1EC2A 3L38A 3HAUA 5P71A 3UFLA 4Y5EA 5P82A 2QD8A 2NMZA 5P0YA 3S43A 1IBQA 1T6GA 5DQ4A 1B5FB 4J0TA 3OQKA 1C70A 3OOTA 3TPPA 2O40A 3D1ZA 5P1CA 2HB4A 3UDHA 5P5QA 4ZLSA 1FG6C 3TLHA 5P0VA 4TRYA 3ZKGA 4K4QA 2RKFA 4YD3A 5HTZA 1APVE 4K9HA 4YBFA 4Y4DA 5HDVA 5P5BA 4DQCA 4J1KA 5P38A 1IVQA 2WF4A 4DQGA 2I1AA 3NU6A 4J55A 5P2IA 4COEA 5ENKA 3QIHA 3LITA 3I6OA 5P6WA 5P80A 3WZ8A 5P5XA 3OU4A 4Y50A 1HVKA 5C9DA 2JXRA 3TNEA 3PI5A 5HE4A 3O9DA 4Y57A 5P30A 1IZIA 1G0VA 4QJ7A 5P4YA 4HDFA 4DJYA 1T7IA 4Y43A 4RCFA 5P3SA 3FV3A 1FQXA 1D4JA 1YTHA 3TPRA 5P16A 1QBRA 5JODA 5P6UA 5P7UA 5P1AA 3L3AA 3GGUA 1FQ8A 5KOSA 4AA9A 2WF2A 4MC9A 4JPCA 3RVIA 1D4KA 2ZGAA 4J0YA 1HPVA 5P7EA 4Y3ZA 3UDRA 5P3DA 2PYNA 1ODYA 1B5FA 1SBGA 2NXMA 3R4BA 5HCOA 3EKVA 5P8MA 1AXAA 3K5FA 3PSUA 4J1CA 2IEOA 4Y4ZA 2VNNA 1HVHA 2QHZA 5IVRA 4DJUA 4DJPA 5P0JA 1K6VA 1BBSA 5P3NA 3QS1A 1HWRA 1K2CA 2IS0A 3VV7A 3TPJA 3OU1B 3OXCA 5P7YA 5FIVA 4U7VA 5OZ7A 2ZJLA 3G70A 2EWYA 2QD6A 5P74A 5OYTA 5P2FA 2QZXA 5OZZA 5P4JA 1MUIA 5ISKA 1D4YA 3OHFA 5P4HA 4EQ0A 3CKPA 3TKGA 1GKTA 4PZXA 4H3JA 5P2UA 4OBFA 5P27A 5P8UA 3URJA 4N00A 2ZHRA 4Y4JA 3PBZA 1EPLE 4GJ8A 3DOXA 5KR2A 3O99A 4ZPFA 4APEA 4A6CA 2PH6A 1XS7D 1MSMA 5P63A 4LXMA 4CPWA 2HIZA 4K8SA 5P5TA 4L7JA 3O9CA 4DI2A 1ENTE 5P88A 3IXKA 5P0UA 5P55A 2FNTA 4D88A 4FE6A 1SDUA 4EJDA 5ISJA 1CZIE 5P0RA 4Y3FA 5P78A 5P7FA 3HW1A 4PYVA 2O4NA 5P86A 1BWAA 1W5WA 4GB2A 1PROA 3QBFA 1EC1A 3MWSA 4PHVA 2OHQA 3KT2A 5P2GA 2PSVA 5P31A 3HZCA 4OBHA 1HIIA 1RL8A 4RRSA 1RQ9A 1PSOE 5P1IA 4I11A 3TOGA 4ZSMA 5HCTA 4RYCA 5P42A 5P3BA 4Y5GA 1GNNA 1HVJA 5OZIA 4XX3A 1BDQA 2G1RA 3T6IA 5CLMA 5P2RA 1HTEA 1C6ZA 2Q5KA 2BPXA 5HE5A 2SAMA 3KMYA 2ZHVA 1T3RA 2AOJA 5P2OA 4DV9A 4Y36A 1MTRA 1SGUA 5P4ZA 4Z2ZA 2WF3A 3IGBA 4YE3A 4F73A 5DPZA 3TH9A 4FSEA 3UF3A 4TVHA 3VYEA 5P33A 2ZHSA 5P7CA 5P6QA 5P6JA 5P6VA 3I7EA 2G22A 5IS4A 4DJVA 5P6NA 2AZBA 3Q4BA 3VFBA 1B6PA 3O9GA 4HZTA 1NPAA 1PFZA 2OHMA 5P15A 1HIVA 4Y3JA 4OBZB 4Y3RA 5P8JA 2NXDA 1K6TA 5CONA 2XFJA 1APWE 2Q3KA 5P4RA 5P0WA 5P5IA 5P8AA 4WY6A 5P7GA 4HVPA 3IAWA 3VUCA 3EXOA 4HLAA 5KQXA 2WJOA 5P3CA 2QCIA 3O9AA 3PLDA 5P1FA 5P0LA 5P3XA 2ER6E 2QI4A 5P0TA 5OZDA 2AVSA 4RLDA 5P3AA 3KM4A 3ZLQA 1D4LA 3UFNA 3MSKA 2ZJKA 3S56A 1FMUA 2ZJIA 3NYGA 1BDRA 1IVPA 1IDBA 3ST5A 4BELA 5P4GA 2OHTA 5P5JA 3ZKXA 2P3BA 2I0AA 5P4EA 4KB9A 3UDNA 5P73A 5P6HA 4GZFA 5HDXA 4OBDA 3VSXA 2ZJHA 5P5KA 5P4IA 4JECA 5P2ZA 2PWCA 2FDPA 3IVIA 3PSGA 3VYDA 3UDPA 5P0BA 4FRJA 5P5RA 4CKUA 5P17A 2O4SA 5P4KA 5P1SA 1LYAB 3G6ZA 4MC2A 5OZTA 2HS2A 2APRA 4LHHA 1RV7A 4CPRA 4AA8A 5P5LA 1YG9A 5P8OA 3UQPA 3LZUA 4YD5A 3PMYA 5P48A 5P72A 4DJRA 1MIQA 1SDVA 3GI0A 3QRVA 2HPFA 3PCWA 5P2LA 4M8XA 1MVPA 4Y4UA 3UQXA 2G27A 5C9FA 3O9BA 3OU3A 5P8CA 3NU9A 3NXNA 4Y53A 1HPOA 2ER0E 3PBDA 1HPXA 2RSPA 1A8GA 2BBBA 3KN0A 7HVPA 4Y3LA 1A8KA 1EPPE 4Y3SA 5P7DA 5P87A 4YD6A 3Q70A 1W6HA 3O9LB 5SY2A 5P7LA 1G6LA 1Z1RA 5OZ5A 5SY3A 3UDKA 2PC0A 1MPPA 3VG1A 1KZKA 5P6EA 2XYFA 4GJCA 2QI7A 5T4SA 3SACA 5P2NA 2Q64A 4J54A 4XXSA 3PLLA 3LINA 2R5PA 5HE7A 1HRNA 2JE4A 3L5FA 3OHHA 5P1GA 5P62A 1C6YA 5AHBA 3ZPSA 9HVPA 4LAPA 2FXEA 4B0QA 5P41A 3BUGA 5P3TA 5P5MA 5AH6A 3BXSA 4H3FA 3WSJA 2NNKA 3EC0A 1ZPAA 5P4SA 5P7PA 5P3YA 1BWBA 1QS8A 2WEBA 5P44A 3PI0A 3K5DA 5OZ2A 4K4PA 5P2JA 1SDTA 4YOAA 5APRE 2P3DA 1M4HA 3NU5A 2OHUA 4Y3QA 1LYAA 3INDA 1PSNA 5OZ8A 2OF0A 3QP0A 3T7XA 1FQ4A 4Y5CA 1FFFC 1IIQA 3AUPA 3PSYA 1EEDP 3ZKMA 5P14A 1HEGE 3PB5A 2I4VA 5OZNA 3QRMA 5P4MA 5P2XA 4YBIA 4J1HA 1D4HA 4LP9A 1HVRA 5P7NA 1AZ5A 1B6MA 4CPSA 5OZPA 2HPEA 5P6DA 3S7LA 5P69A 5EZXA 4TRZA 1QBUA 1BILA 4QJ2A 1BXQA 3BUFA 1DPJA 3KFPA 5P85A 3KFNA 1A9MA 3PWWA 5P2TA 5OZYA 4I0DA 5SXNA 3SPKA 4QJAA 3O9LA 5P54A 5P2CA 2QAKA 4FM8A 3IN3A 4Y5NA 3URIA 2G1SA 3JVWA 5P06A 4J17A 1GVXA 1UH8A 2FGVA 4A4QA 1TW7A 3OADB 1SP5A 3DM6A 5P0QA 4WTUA 1AM5A 1EBYA 3BGCA 3BVAA 3RTNA 4RROA 3GGXA 4LXAA 4PPHA 1HHPA 4X7IA 5P04A 4I0IA 2FMBA 3PWMA 5F00A 3IXOA 3IXJA 4RVIA 2OAHA 2AVMA 5P3QA 4HDBA 1IZDA 4FAFA 2BQVA 5P67A 1KJGA 2QI0A 2P3AA 2B7ZA 1EC3A 4UPJA 1TCXA 1FLHA 2FDDA 2AVQA 2WF0A 5P57A 2AOIA 2ZYEA 3OUCA 1CPIA 2AZCA 4K4RA 5P81A 3LPIA 3HAWA 4Z4XA 3IN4A 1KJ7A 1SH9A 1FFIC 2JJIA 5P09A 5P0IA 4Y44A 1DW6C 3NUOA 3CIBA 3TTPA 4J1IA 3LHGA 4CP7A 3GI6A 2Q63A 5JFUA 5P1VA 3K4VA 1HSGA 5OZ6A 5P2WA 5DR3A 4D85A 6FIVA 1HSHA 3BHEA 5DQ2A 4B1EA 4EQJA 3EL1A 1B6LA 4LBTA 2QI3A 5C9BA 4YCTA 5P8HA 3NXEA 3EKQA 5P8QA 5P4FA 2B8LA 1HIHA 5P60A 3OADA 1PSAA 5HVPA 1Z1HA 1KJHA 3D91A 3HVGA 3BGBA 1B6JA 4Y47A 2ASIA 1Q9PA 4ZE6A 4FM6A 3LIYA 3D20A 4WY1A 1XL2A 5P00A 2PSUA 5P1DA 3WZ7A 5OZFA 5I3XA 3L5BA 2ER7E 3CYXA 3K5GA 3OXVA 3ZPUA 5P11A 3SABA 3FNUA 4YA8A 4EP2A 1ODWA 2WEZA 3I8WA 1TQFA 2CEMA 5P23A 3QVCA 3DV1A 5P12A 4J0VA 5P79A 2FGUA 5P2QA 3S2OA 1MT8A 4YDGA 1APTE 4RRNA 5P6XA 4FRIA 3T11A 1LS5A 2Q55A 5DR4A 2UY0A 3FNSA 4OD9B 5P6KA 3HVPA 1T7KA 4FSLA 3SA8A 4R8YA 4NKKA 1DMPA 4D83A 2O4LA 2WEAA 4Y4TA 1K6PA 1A94A 4Q1WA 4Y41A 3LIXA 1DIFA 3K5CA 5P3JA 5P3IA 4I0HA 3VYFA 1XE5A 5P2SA 2VIJA 3DK1A 5KAOA 4Y3HA 5P2AA 5P3VA 1ZJ7A 1WBKA 4LXKA 5PEPA 2H6SA 3OOZA 5P7HA 4Y3GA 5P7SA 5P28A 3ER5E 5OYVA 2IDWA 5AHCA 5P0ZA 2ZJJA 4ZSPA 2FIVA 4X2LA 5I3YA 3RSVA 5P1XA 5P52A 2BPZA 5I3VA 5OZVA 5P0NA 1AAQA 5P8LA 2QMFA 3C9XA 2BKTA 2P8HA 3T7PA 3Q6YA 1YX9A 5P1OA 4I0GA 3UQUA 5P4TA 5EZZA 5P1BA 1EC0A 5DQCA 2XFKA 4HE9A 3DV5A 2NNPA 5P1ZA 1HXWA 5P8DA 4ER4E 4F74A 3PCZA 5P1YA 5P0EA 3FSMA 3TL9A 4I1CA 5P2MA 5P4AA 2R43A 5P3LA 2B7FA 3URLA 5OYZA 2QD7A 4B05A 3OXWA 3OU1A 3PEPA 3NDXA 5P75A 3VV8A 2G1YA 5P7AA 3LIZA 4AUCA 5P0DA 3L58A 1RPIA 5P1PA 2ZE1A 1FQ5A 4Y3YA 1GVVA 1AJVA 5P5HA 4I0JA 3OGPA 5HD0A 3Q3TA 5P8FA 4EXHA 2CEJA 3O9IA 5P3KA 2H6TA 3FIVA 1EPNE 4YD4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3TOH A;  3UDQ A;  3EKY A;  4LL3 A;  4L7H A;  3OQF A;  1FKN A;  3EKP A;  3PMU A;  2NR6 A;  4ZIP A;  4B77 A;  4L1A B;  3NWQ A;  3EM4 A;  5P6Y A;  2XFI A;  2VKM A;  3EM3 A;  4ACU A;  5AH9 A;  2QHY A;  1NPW A;  4GJ9 A;  4YOB A;  1D4S A;  2PK5 A;  4PZW A;  4Y5A A;  3UDM A;  2Q11 A;  4AZY A;  2G20 A;  1XN3 A;  3UQW A;  3KYR A;  1F34 A;  5P1M A;  2OHN A;  3ZOV A;  5KOQ A;  3UQR A;  4ZPG A;  2AOC A;  2I4D A;  4YDF A;  5P76 A;  4J0Z A;  1HBV A;  5P3H A;  4PEP A;  5P4O A;  5P19 A;  3OK9 A;  1SIV A;  3D1Y A;  4TVG A;  3MXD A;  4Y5L A;  3H5B A;  3SLZ A;  3T3C A;  2PSG A;  5P29 A;  1FF0 C;  4CPX A;  2G21 A;  3VLB A;  5P7J A;  1KJ4 A;  3MXE A;  2Z4O A;  3H0B A;  5AGZ A;  5P3O A;  3EL4 A;  4QJ8 A;  1LF2 A;  2F8G A;  5P50 A;  5P6S A;  3VCM A;  5P3G A;  4S1G A;  2Z54 A;  5P5D A;  3BUH A;  4B1D A;  1RNE A;  3OTS A;  3JVY A;  3SA6 A;  5P25 A;  5OZX A;  2QNP A;  3APP A;  4Y3P A;  3K1W A;  5P5P A;  4BFB A;  3OAG B;  4B78 A;  4MC6 A;  4B00 A;  1VIK A;  3VF5 A;  1ZLF A;  5OZG A;  1AID A;  2VA7 A;  4U8W A;  2FNS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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