6APRE

Structures of complexes of rhizopuspepsin with pepstatin and other statine-containing inhibitors
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
AGVGTVPMTDYGNDIEYYGQVTIGTPGKKFNLDFDTGSSDLWIASTLCTNCGSGQTKYDPNQSSTYQADGRTWSISYGDGSSASGILAKDNVNLGGLLIKGQTIELAKREAASFASGPNDGLLGLGFDTITTVRGVKTPMDNLISQGLISRPIFGVYLGKAKNGGGGEYIFGGYDSTKFKGSLTTVPIDNSRGWWGITVDRATVGTSTVASSFDGILDTGTTLLILPNNIAASVARAYGASDNGDGTYTISCDTSAFKPLVFSINGASFQVSPDSLVFEEFQGQCIAGFGYGNWGFAIIGDTFLKNNYVVFNQGVPEVQIAPVAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of complexes of rhizopuspepsin with pepstatin and other statine-containing inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RHIZOPUSPEPSIN
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Rhizopus chinensis
total genus 88
structure length 325
sequence length 325
ec nomenclature ec 3.4.23.21: Rhizopuspepsin.
pdb deposition date 1989-08-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 6aprE01
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 6aprE02
5DR8A 2FDEA 3OU1A 2AOFA 4GJ8A 2WEAA 2JJIA 5P5HA 1MSMA 2A1EA 2QHYA 4Y4BA 4QJ2A 5P40A 3FX5A 1EBZA 4YCKA 5P01A 3U71A 4QJ8A 3URIA 3AUPA 6FIVA 3UQXA 3LIZA 3OY4A 4RCDA 4YBFA 4DJQA 3UDJA 5OZWA 4Y3WA 1APUE 2AOIA 5CLMA 1HPXA 2QNQA 1RV7A 5P7TA 4KE0A 3NWXA 5AH7A 4RVIA 2OHRA 3HAUA 3NDUA 2O4NA 4OBDA 4Z4XA 2BPYA 5P4RA 5P5LA 5P63A 5P65A 2P4JA 2PWCA 9HVPA 3EM4A 1XL5A 5P86A 1LYWB 5P6XA 4D89A 4Y3HA 5P7AA 2V16C 4I0DA 5P4GA 4MC9A 4DJXA 2R43A 2G1OA 5P89A 4Y3JA 1PSAA 3K5FA 3DUYA 4TVHA 1BIMA 5P6OA 1LYBA 5P7QA 2UXZA 4PYVA 2WL0A 5P4QA 1HVRA 5P0ZA 2I0DA 2AOGA 3NWQA 5P7IA 4GJ7A 3L5EA 2R5PA 3KFRA 1CMSA 1FF0C 5P4NA 5P0YA 3SACA 2PSGA 3TNEA 3ZKMA 3EM6A 5P6LA 4L1AB 5P3LA 1AZ5A 4YD6A 1QBUA 5P0FA 3R4BA 3BGBA 3INEA 1ODXA 4TRZA 5P22A 5P8QA 2BPXA 2V0ZC 4IVTA 2R3WA 4F76A 5P5JA 5P2KA 2FDPA 5OZVA 4MC2A 2I0AA 5P6HA 1AVFA 3GGUA 2QHZA 2VIEA 4HEGA 1QRPE 1EPOE 3OHFA 5P7NA 5P77A 1ODWA 4Y47A 3L5CA 1BV7A 4HLAA 2XYFA 4TRYA 5P1OA 4Y5BA 3EMYA 1YX9A 3CICA 4GJBA 5P4MA 3BUFA 2J9KA 2XFKA 5KQZA 1KJ4A 5P4XA 4GJ5A 1NSOA 5JFUA 1EPNE 4J0TA 3NUOA 4BFBA 2FNSA 3PM4A 3QBFA 4YD5A 3IN3A 4DFGA 5F00A 3ZKXA 5P07A 1TZSA 1EEDP 3IN4A 4J1IA 4GJCA 4CP7A 5AGZA 2AQUA 4FSLA 3ZPTA 4F73A 3K5DA 4OBJA 5P61A 5P5GA 1PPME 5P4SA 2G1NA 5COOA 3NDXA 2QZKA 1T6EX 2Q63A 4KB9A 3NXNA 4U7VA 4J0VA 5P6EA 4FLGA 5P25A 3PWRA 4GIDA 1HPOA 1DAZC 1Z1RA 2ZJJA 5P3OA 5HVPA 5I3WA 1AAQA 4QJAA 5P2FA 5P0DA 3KDBA 2BJUA 1HVJA 1KJGA 5P3SA 5OZTA 1ZPKA 4Q1NA 4I10A 3TTPA 5P8TA 5P20A 4AA9A 2XFJA 4L7JA 4A4QA 3URLA 2G26A 1HEFE 4H3FA 5P2NA 1SGZA 4FS4A 5P8HA 4Y44A 5P58A 1LEEA 1HWRA 3S8IA 4MC1A 5P2SA 3OADB 3K4VA 4PPHA 5J25A 1PPLE 1N49A 2VIZA 3VV7A 3VF3A 3OXCA 1KJHA 4EXHA 4J1FA 4LL3A 5P8DA 5P6ZA 4CKUA 3S54A 4EJ8A 2I4WA 5OZNA 3SA7A 4FM6A 3ST5A 5P5PA 3L3AA 1YTHA 4FCOA 1FFIC 4GJ6A 5P6GA 1XN2A 1GNMA 2PQZA 1VIJA 5P1TA 5OYVA 5P18A 3TOHA 4J1EA 2IDWA 3URJA 4DH6A 3FKTA 4HDBA 4K4RA 3RU1A 3QRMA 4Y4XA 5P8SA 5P74A 5FIVA 5P4VA 5F01A 2BB9A 1BWBA 5P4LA 4DQHA 3EKXA 5DQCA 5P5RA 2PK5A 3SA8A 2VIYA 4Y3NA 5P1MA 3VV6A 3U6AA 4N00A 3T7XA 3OU1B 5P0EA 1SIVA 3O9EA 3PGIA 3VG1A 4APEA 5KR0A 3QI1A 5P8CA 1D4YA 2BPVA 1KJ7A 4BFDA 3SA3A 2NNKA 4TVGA 3WSJA 3ZLQA 4GMIA 5OZ5A 2IEOA 1T3RA 4PHVA 3LPIA 4L7HA 5OZLA 2O40A 2V00A 3QBHA 4J1HA 1E81E 2IQGA 3HAWA 1C6YA 5P4IA 5P2JA 5P3JA 2ZJMA 4YDGA 1M0BA 1GNNA 5P6YA 4EJKA 1HXWA 3K4VC 4Y50A 5AH9A 2ZHTA 5P8RA 4B00A 1K1TA 3S53A 1ZTZA 2G69A 1LYBB 4HA5A 3KT5A 1PSNA 2ANLA 1TW7A 4JPCA 2WECA 3APPA 2AZCA 3OTSA 3UPJA 5OZEA 5P2LA 3VLAA 5P5MA 5HD0A 7HVPA 5P7JA 2AIDA 1G6LA 4YDFA 4Y3SA 1HOSA 5P7KA 2VS2A 4ZIPA 4R95A 5P35A 1GVXA 5P3YA 1K1UA 5P3WA 4A6CA 4J1KA 3D3TA 4Y5EA 1D4KA 1W5VA 1IDAA 2QU3A 5P6IA 5P84A 4XX3A 1PSOE 5OZZA 4Y4AA 5P7DA 1MUIA 5DR7A 4Z50A 1K6CA 2ZJNA 5P45A 5P26A 3N4LA 5P59A 1K6VA 1T7JA 2R8NA 2QI7A 3NU6A 5P8NA 1ZJ7A 5P8LA 4X7IA 2PWRA 1OD1A 3I25A 3TPLA 3OOZA 2QP8A 5P5VA 3S7MA 4I0GA 1MT7A 4Y58A 5P2BA 1OEWA 3K5GA 4I1CA 2VJ7A 5DGWA 2ZHRA 4GJ9A 1AXAA 2AVMA 4A6BA 3VSWA 2O4KA 1UH8A 3EL9A 4OD9A 3ZKNA 1EPRE 1FQ4A 1HPSA 4XXSA 3QAAA 5P5FA 5P4WA 1IZHA 5P0SA 3OOTA 5P6UA 4J0YA 3NU4A 3O9LA 2V10C 3BVAA 2OHKA 1LS5A 4ZEAA 4EXGA 4DV9A 1F7AA 4B72A 5P53A 3OWNA 1W5WA 1SIPA 2ER0E 5P5BA 2PK6A 4CPUA 3VEUA 2HS1A 3S7LA 3UDPA 3CKRA 4Q1WA 1KZKA 2B7FA 4Y3YA 3FNUA 4BEKA 3LHGA 4QLHA 4I8ZA 2JJJA 1E82E 1HIVA 3Q5HA 1MSNA 5B18A 5P4DA 4YE3A 5P0CA 4Y39A 4OBFA 1CPIA 5P38A 5I3YA 1EAGA 1MPPA 5OYSA 5P46A 1DW6C 2IKUA 1HVLA 3MXDA 1UH7A 3UFNA 4COEA 2QMPA 2H6SA 3KM4A 3PVKA 4Y41A 3RTNA 4J0ZA 4S1GA 1RQ9A 3SA4A 3LIYA 4Y3PA 4Y4JA 1C6ZA 3LZYA 6APRE 4RZ1A 2HPEA 5P1UA 3UHLA 1FKNA 5SZ9A 4FRKA 4J55A 5OZUA 1ZLFA 1DIFA 2G22A 3RSXA 5C9FA 3L59A 3EKWA 1APWE 3OXVA 1ZBGA 5P23A 3OUCA 4NJUA 3S85A 2FNTA 3Q4BA 3TH9A 4Y3TA 4Y5KA 4DQBA 5UPJA 1MVPA 3D1YA 2ZE1A 4RRSA 3KN0A 3HZCA 5CONA 5P78A 4AUCA 3UF3A 1MRXA 2BPZA 1MT8A 1HPVA 4BELA 5P54A 4HDFA 5P3VA 4YA8A 3BXSA 5SY2A 5HE5A 3KMXA 5OZAA 1XE5A 4I0ZA 5KR8A 3Q3TA 1HEGE 5DQ2A 3G72A 3LPKA 1HTGA 1HVHA 3ECGA 5KR2A 5P08A 1FEJC 3QRSA 2AZBA 3F9QA 3LZUA 3DM6A 3UCBA 4R5NA 2I4DA 2IGYA 1FIVA 1HVIA 5P0NA 2QNPA 4Y9WA 1BVGA 3INFA 3SAAA 2VA7A 5P1FA 3EKYA 5P7PA 2R5QA 4CPSA 2RKFA 1FQXA 3R1GB 3U7SA 5P8UA 3VFBA 3L5DA 5P88A 4K4QA 2RENA 5P0UA 5P4UA 3KDDA 5P3IA 4DJRA 5DR3A 5P2TA 1OHRA 5P2OA 6UPJA 1AJVA 5P5SA 2QNNA 3OHHA 5P0RA 5OZXA 3IXJA 3GGXA 4DI2A 3TL9A 3VF7A 2P83A 4F74A 3EL4A 2AVVA 1SGUA 1PFZA 2IGXA 4OBKA 3S43A 5OZKA 3CYWA 5ER1E 2P3DA 5PEPA 3FSMA 3OQAA 4M8YA 5P69A 4J54A 2O4LA 4QJ7A 5P2ZA 3PSGA 2QD6A 5P3TA 2QAKA 3ER3E 5OZ6A 2CENA 5EZXA 1MEUA 3OGPA 2VA5A 3UDHA 2FXDA 5P7GA 1U8GA 4Y5PA 5P15A 5P4FA 5P5WA 5OZPA 4E43A 5OZ4A 4LXMA 2I4UA 3VLBA 5P03A 5P7YA 5P82A 5COPA 3ZPUA 5ER2E 3KDCA 5P3QA 3KT2A 3O99A 3EKTA 5P3FA 4X2LA 1EBYA 1HTRB 2VJ9A 3L5BA 3SKFA 1DMPA 4OD9B 4YCYA 5AH8A 3TKWA 3LIXA 4GYEA 5P27A 1K6PA 3R0YA 2NNPA 1WBKA 4Y3QA 3CIBA 5P17A 1W5YA 3QN8A 3VV8A 4Y3EA 4Y4GA 4YBIA 5P2MA 3CIDA 5P8IA 4AA8A 3O9LB 3OQFA 2I1AA 3SA9A 5P0OA 4Y5CA 3WB4A 5P56A 2AOEA 2NMYA 1IVPA 5P7XA 1IVQA 5P14A 4DJYA 3AIDA 5P16A 3Q70A 1ODYA 5DQ1A 5P8GA 4Y38A 3D1ZA 3H0BA 5DQ4A 1A8KA 1EC1A 4FRIA 4K4PA 4H3GA 2B60A 1MT9A 3QS1A 5HDXA 3DOXA 3DK1A 4HVPA 1YT9A 1BVEA 5P6CA 5P8EA 2OHQA 4CPWA 5P7LA 1LZQA 4HE9A 3CKPA 4DQGA 4EJDA 5ENKA 1MRWA 1TSQA 1BDLA 2H6TA 4APRE 4D85A 2NXDA 5P44A 2OHMA 2ZHSA 5P85A 4Y35A 4LP9A 1BBSA 5P2HA 1B11A 2JYSA 1MTBA 2Z4OA 3HDKA 3QPJA 3PI5A 4YD3A 5P83A 5P4BA 2ER7E 3GGVA 3KA2A 4YCTA 2FLEA 5DPZA 5P2EA 2JXRA 2AVQA 4NJSA 5E5JA 1FQ6A 1MERA 4L6BA 5P75A 2R3TA 4EJLA 1J71A 5DGUA 4I12A 2QZLA 4WY1A 3FIVA 3HD8A 4OC6B 5T4SA 5P13A 1D4LA 5OZ2A 4FM7A 5OZIA 3I6OA 5P32A 5P60A 1BXQA 4DJUA 5P0AA 2G20A 4CPRA 1GVUA 1IDBA 3NLSA 4Y4WA 4CPTA 2WF1A 3UDYA 3PSUA 3G6ZA 3TPJA 1UPJA 4Y3GA 3BUHA 4OBGA 4U8WA 2P3BA 2AODA 2FMBA 5P43A 1NPWA 1AIDA 2SAMA 3QRVA 5P3GA 4JP9A 2ZJHA 4ZSPA 1IBQA 2B7ZA 1LF3A 2HB2A 4EYRA 5P3NA 1ZSFA 4I0FA 3UFLA 1NH0A 5P6BA 5P1CA 1HSIA 2Q3KA 4L7GA 3ZKIA 5P30A 3BGCA 5P6SA 1IZIA 5P7RA 5HDZA 5OZCA 4PZWA 3PBDA 5OZOA 4R92A 4GZFA 5P1RA 5HE7A 5AHCA 5BWYA 1NPVA 2Q55A 1QBTA 4ZPGA 1QBSA 1FQ8A 4Y3LA 5OZ8A 5P8KA 1SDVA 4KE1A 2HC0A 5OZMA 5P5IA 3KMYA 4GJAA 1B6LA 5P09A 1ZPAA 2QI0A 1FG6C 5OZ3A 1EC2A 2WF2A 5OZSA 4WTUA 4ER2E 1B6JA 2V12C 3S43B 2QI3A 3O9DA 5JG1A 4ZLSA 2WJOA 2VNMA 2F8GA 5P5YA 4GJDA 5P7VA 2VKMA 3NU9A 1LF4A 4Y4TA 4HDPA 5OYWA 1BWAA 5P7EA 4Y36A 1C70A 5P6FA 5P28A 3HVPA 2RMPA 2NXLA 3WZ7A 3TPPA 5P2AA 5AHBA 3NU3A 1PPKE 3WZ8A 4NPTA 5P7FA 5P1AA 5P0HA 1DP5A 5KOSA 5P10A 3ZKSA 5P55A 3VYEA 3EBZA 4Y3XA 5P3HA 2APRA 3PHVA 5P34A 1AJXA 2FS4A 3D91A 5P51A 5P42A 3PSYA 3NXEA 2O4SA 5P62A 4M8XA 2IKOA 5P36A 5IVSA 2HIZA 2QCIA 4Y4EA 4Y3AA 1YM4A 1HSHA 5OZJA 5P1SA 1ME6A 5P47A 4J5JA 3VCMA 2RKGA 2QMFA 3TKGA 4FRSA 3L38A 2FIVA 1HVSA 5P6VA 2QI4A 5P06A 4ZE6A 3FNTA 3T7QA 5DR4A 2HB3A 1DPJA 5P3ZA 1B5FB 4RYGA 1UH9A 2Q11A 4Q1XA 5P29A 5P2QA 2IS0A 3ZL7A 5P2GA 5I70A 1FMBA 5P3MA 2J9JB 5P5XA 2R9BA 4FRJA 4DQEA 2OF0A 5OZBA 2Q64A 3SPKA 5P0IA 1BDQA 2WF0A 5P6MA 1HVKA 3UDRA 2FGVA 2ZGAA 2WEZA 1W6HA 3SO9A 5P0BA 4FE6A 1BDRA 2QD7A 5IVRA 2BBBA 2PH6A 4Y3ZA 4B1DA 2WKZA 5P6PA 1C6XA 4RCFA 1AM5A 5P02A 5AH6A 3K1WA 3PI0A 5P80A 3ZKGA 5P7BA 1FMXA 4Y5MA 1EC0A 5P8PA 3OQDA 1IIQA 3PLLA 5P4ZA 1FQ7A 4Y4UA 5HDVA 5P3AA 3PMUA 5P5CA 2PC0A 2AVOA 4GB2A 1YTIA 1IZEA 5ISJA 5P0GA 4Y4ZA 2OHUA 2QI1A 3CYXA 2Q5KA 4FM8A 4I8WA 3MSKA 4PZXA 5P5NA 2IENA 2QI5A 3DCKA 1EPPE 5P3UA 3BHEA 4Y5AA 2ZJLA 2G1RA 2I4VA 4XKXA 4OC6A 2QI6A 3PMYA 4I0JA 5P8OA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5DR8 A;  2FDE A;  3OU1 A;  2AOF A;  4GJ8 A;  2WEA A;  2JJI A;  5P5H A;  1MSM A;  2A1E A;  2QHY A;  4Y4B A;  4QJ2 A;  5P40 A;  3FX5 A;  1EBZ A;  4YCK A;  5P01 A;  3U71 A;  4QJ8 A;  3URI A;  3AUP A;  6FIV A;  3UQX A;  3LIZ A;  3OY4 A;  4RCD A;  4YBF A;  4DJQ A;  3UDJ A;  5OZW A;  4Y3W A;  1APU E;  2AOI A;  5CLM A;  1HPX A;  2QNQ A;  1RV7 A;  5P7T A;  4KE0 A;  3NWX A;  5AH7 A;  4RVI A;  2OHR A;  3HAU A;  3NDU A;  2O4N A;  4OBD A;  4Z4X A;  2BPY A;  5P4R A;  5P5L A;  5P63 A;  5P65 A;  2P4J A;  2PWC A;  9HVP A;  3EM4 A;  1XL5 A;  5P86 A;  1LYW B;  5P6X A;  4D89 A;  4Y3H A;  5P7A A;  2V16 C;  4I0D A;  5P4G A;  4MC9 A;  4DJX A;  2R43 A;  2G1O A;  5P89 A;  4Y3J A;  1PSA A;  3K5F A;  3DUY A;  4TVH A;  1BIM A;  5P6O A;  1LYB A;  5P7Q A;  2UXZ A;  4PYV A;  2WL0 A;  5P4Q A;  1HVR A;  5P0Z A;  2I0D A;  2AOG A;  3NWQ A;  5P7I A;  4GJ7 A;  3L5E A;  2R5P A;  3KFR A;  1CMS A;  1FF0 C;  5P4N A;  5P0Y A;  3SAC A;  2PSG A;  3TNE A;  3ZKM A;  3EM6 A;  5P6L A;  4L1A B;  5P3L A;  1AZ5 A;  4YD6 A;  1QBU A;  5P0F A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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