The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
125
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structure length |
125
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Chain Sequence |
SWQTYVDTNLVGTGAVTQAAILGLDGNTWATSAGFAVTPAQGTTLAGAFNNADAIRAGGFDLAGVHYVTLRADDRSIYGKKGSSGVITVKTSKAILVGVYNEKIQPGTAANVVEKLADYLIGQGF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-ray structures of isoforms of the actin-binding protein profilin that differ in their affinity for phosphatidylinositol phosphates.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PROFILIN I
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| molecule tags |
Contractile protein
|
| source organism |
Acanthamoeba castellanii
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| total genus |
34
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| structure length |
125
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| sequence length |
125
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1994-07-29 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2PRF A; 1YPR A; 1F2K A; 5EV0 A; 3NUL A; 3MSH A; 2V8C A; 3U4L P; 4D60 A; 2BTF P; 1FIL A; 3T1R A; 3MS6 A; 2ZL1 A; 4X1L A; 3LEQ A; 1K0K A; 1PFL A; 2JKF A; 5EM0 A; 5FEG A; 1CJF A; 4ESP A; 1HLU P; 2HZ5 A; 3CPT B; 2PAV P; 1J3W A; 4FTX A; 2E8J A; 3CPT A; 3L9K A; 2PBD P; 1VET B; 2JKG A; 1FIK A; 3T1X A; 1SZV A; 1CF0 A; 1PRQ A; 2B95 A; 1VEU B; 1ACF A; 3UB5 P; 3T1S A; 3LGO A; 1CQA A; 1Z09 A; 3KYE A; 5EM1 A; 3L7H A; 3T12 B; 1Y4O A; 1D1J A; 3DAV A; 1VET A; 2V8F A; 1SKO B; 1SKO A; 1G5U A; 5FEF A; 3D9Y A; 3CHW P; 1VEU A; 4FUW A; 1AWI A; 4X25 A; 5EVE A; 1A0K A; 1PNE A; 2ACG A; 2ZL1 B; 3NEC A; 2VK3 A; 3T1Q B; 5FDS A; 4X1M A; 4QWO A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2HF6 A; 4I3A A; 1OME A; 3HLD A; 4JGP A; 3LI8 A; 1PWC A; 4P6Z S; 3O87 A; 5GLB A; 5AQA A; 3NOP C; 1HD8 A; 5FA7 A; 5HDD A; 4LV0 A; 2XEP A; 3ZCZ A; 2J3T C; 4L9E A; 3MKF A; 4ME4 A; 3BRM A; 2OLU A; 4E3M A; 4ZTK A; 2PR6 A; 2UWX A; 1OTE A; 5FAO A; 4GHI A; 2VJW A; 3UDX A; 1BLS A; 4E3L A; 4EWF A; 1J3W A; 1ES3 A; 1M6K A; 3FYZ A; 1PI5 A; 3SS4 A; 2P9V B; 4E3K A; 1CI9 A; 2B95 A; 1EW0 A; 4O8G A; 5DTS A; 5J8X A; 2A49 A; 1Z09 A; 1I2W A; 5HDC A; 3D4F A; 2EFX A; 1YLZ A; 2K7S A; 4UAA A; 1H3Q A; 2AVX A; 2WGW B; 3QP4 A; 4S2O A; 3W4Q A; 3ICY A; 2H28 A; 1XJ4 A; 2V8F A; 3C7V A; 5M19 A; 1IOU A; 4U0T A; 2ZC3 B; 3UME A; 2J80 A; 1YLY A; 1TS8 A; 3VFH A; 2VGJ A; 5HSQ A; 3OPH A; 4X25 A; 2NUP C; 3Q82 A; 3LUQ A; 5CTM A; 4KZB A; 4KZ5 A; 4X53 A; 3NIA A; 2DRW A; 2FZ0 A; 3NUL A; 4I39 A; 2V8C A; 5CXW A; 5M1A A; 2GZA A; 1EWZ A; 3KSH A; 4AFI A; 2W3H A; 3JVV A; 2BAS A; 5F68 A; 3GV9 A; 4NET A; 5M18 A; 2KX6 A; 2WZZ A; 2R9X A; 4L9G A; 1SKF A; 5FEG A; 2ZMF A; 1FCM A; 2ZQA A; 3UN7 A; 2HZ5 A; 4FTX A; 1LI9 A; 3AGD A; 5G18 A; 2J3W A; 3BY8 A; 3KO6 A; 4XXR A; 3GQZ A; 4QPR A; 1NLZ A; 1OTD A; 2VGK A; 4E6X A; 1CF0 A; 4JXW A; 1TDL A; 1VEU B; 3UB5 P; 1I2S A; 1LL5 A; 2BG1 A; 3HLE A; 3R7W A; 3R4K A; 1VM1 A; 4C3Q A; 4S2P A; 4D2O A; 4DE2 A; 2MJ6 A; 1NY0 A; 4R4S A; 4BBT A; 1OPX A; 1FR1 A; 3F1P B; 1W63 Q; 1L0D A; 4LPZ A; 1T1C A; 5D3O A; 3NCK A; 3MF0 A; 1DP9 A; 1YLJ A; 3IXH A; 4G3V A; 5L07 A; 3S1Y A; 4IBX A; 3NEC A; 1V9Z A; 4K0X A; 5FL3 A; 5DFY A; 2J9P A; 3FC7 A; 3VMA A; 1JWZ A; 3MQQ A; 4C75 A; 5A93 A; 2HJE A; 4L9F A; 2BLS A; 1XGI A; 5IU1 A; 1FOF A; 4IUK A; 3UB8 A; 1W63 M; 3T1R A; 1K56 D; 3CWF A; 3LEZ A; 4EES A; 3F1O A; 4OLD A; 4Y17 A; 1MWU A; 5J3W A; 2ZOI A; 4EUZ A; 3GR2 A; 5E2H A; 4Y0U A; 3IX8 A; 4JGQ A; 4OON A; 4CPK A; 1DP8 A; 4Z9Q A; 4HOI A; 4ID4 A; 3BFG A; 2O9B A; 5FQJ A; 3VP0 A; 3BEB A; 1ESU A; 4BBU A; 4YOF A; 2P9V A; 3PBO A; 2PU2 A; 5CGS A; 2XGN A; 3B42 A; 1I5Q A; 3G2Y A; 5FAP A; 1BUL A; 4IVK A; 3UPO A; 2XR0 A; 5I94 A; 1ZTU A; 4JGR A; 3LIC A; 3BFF A; 3VP3 A; 3LR4 A; 3G31 A; 4DF6 A; 1BZA A; 1Y4O A; 2JKT M; 1W8Q A; 4OQI A; 4X69 A; 3KX0 X; 2I72 A; 4S2I A; 1SKO B; 2HDU A; 1OT9 A; 2ZC7 A; 3RH8 B; 1BUE A; 2QWS A; 4Y15 A; 4B88 A; 2WKP A; 2ZM8 A; 4E3I A; 5DKK A; 2H0Y A; 4RX3 A; 3DWZ A; 4B4X A; 4OP8 A; 5J4E A; 4R38 A; 2GDN A; 2VK3 A; 3MKE A; 5HL6 A; 3PBT A; 3C4O A; 3S4X A; 1M40 A; 4N1X A; 2XK1 A; 2EWV A; 4Q0H A; 5JYO A; 3OPL A; 1PW1 A; 4DE0 A; 3VOY A; 1XXM A; 3A3I A; 3SOI A; 4GB7 A; 2VGL S; 1VB6 A; 3LY4 A; 3BFE A; 1IEL A; 4HH2 A; 2K31 A; 4LV2 A; 3MQ0 A; 1OTB A; 4PMA A; 2ZL1 A; 3O5Y A; 4DMZ A; 3ZVT A; 3E4Q A; 4UA7 A; 3GEC A; 1LHY A; 3OPP A; 4I5S A; 1LSW A; 1GCE A; 5A91 A; 5F1G A; 1T1B A; 5HX9 A; 3O86 A; 4K0W A; 2E8J A; 3P01 A; 2JKR I; 5DFX A; 5AVF A; 3T50 A; 1KDS A; 5HW3 A; 4KG2 A; 5FAS A; 3CI6 A; 4MNR A; 3H82 B; 1T19 A; 3NBL A; 1SZV A; 4LRZ E; 4JF6 A; 4UA6 A; 3M6B A; 4EBP A; 3V50 A; 3K3C A; 3ZQ5 A; 1GA0 A; 3LCE A; 1JTG A; 2W1T B; 4HY8 A; 1YLW A; 4LFU A; 3ZYT A; 4EBN A; 1AXB A; 1K4E A; 2ZQ7 A; 4KZ6 A; 1Q2P A; 2O9A A; 1MY8 A; 4WZ4 A; 5C5K A; 5GL9 A; 2Z2L B; 4QY5 A; 1ZHH B; 2WK0 A; 2CC1 A; 1S0W A; 1RCJ A; 4OOY A; 4ZAM A; 3UE1 A; 4BLM A; 4ZRR A; 3CAX A; 4HH3 A; 5TBM B; 4GKU A; 3PAG A; 4GW9 A; 4EEU A; 4HEF A; 4PPR A; 3LIF A; 3MFX A; 4QHC A; 4EET B; 1TDG A; 2Y8H A; 1CEF A; 2WKR A; 3MSH A; 4RA7 A; 3IF6 A; 3OC2 A; 4O0P A; 3RXW A; 1S6R A; 3GSG A; 4DE1 A; 2ZJ9 A; 4FOF A; 1KE3 A; 1IKI A; 4WBG A; 3PBS A; 1K57 C; 2XA7 S; 4PM7 A; 4OKP A; 2V2F F; 3EEA A; 3ITA A; 3P98 A; 4MCW A; 3MR0 A; 2HP5 A; 1L0G A; 1RP5 A; 1MZU A; 2JE5 A; 4KZ4 A; 3HVF A; 3M2J A; 2PD8 A; 1E4D A; 1TS0 A; 1N9O A; 5A8B A; 4HJ6 A; 3B33 A; 1JNU A; 1IYQ A; 3L9K A; 2VX8 A; 3VFF A; 2Q0O A; 1S67 L; 3V5M A; 5HDS A; 1KGG A; 5CGX A; 4Q0I A; 2NUT C; 3IHB A; 2B18 A; 4FCF A; 4FSF A; 3IBJ A; 3DTM A; 2DCF A; 1F9I A; 1YAX A; 2LB5 A; 1TEM A; 3W8K A; 5EVI B; 2J7V A; 2OAP 1; 5CHU A; 2CMN A; 3CUE A; 3TRC A; 3CIT A; 4FH2 A; 3MFD A; 3IH8 A; 4R3B A; 5U47 A; 4K91 A; 2JKT I; 3BQ8 A; 4WF0 A; 3NDG A; 3GTC A; 2M7U A; 3UE0 A; 1SKO A; 5A90 A; 3LIA A; 2V20 A; 1YT4 A; 4NKP A; 4WZ5 A; 3EWK A; 4KZA A; 3S7Q A; 2VEA A; 3NOT C; 2QPN A; 4Y13 A; 4E3O A; 2Y2M A; 1Z6F A; 5CGW A; 3QHY A; 3F1N A; 3T1Q B; 3ZG8 B; 1N9B A; 3A3D A; 1BTL A; 3QNC A; 3UE3 A; 1DP6 A; 2W1R A; 1XGJ A; 4WN5 A; 2X02 A; 4GS9 B; 1K55 A; 4KUO A; 4WYY A; 1P9R A; 2M7V A; 5EV0 A; 3HLG A; 3Q7V B; 4GD6 A; 4X56 A; 3BWL A; 2EFU A; 1LL9 A; 4Y5F A; 2V9A A; 3I7J A; 3SS5 A; 2QJ7 A; 5HD5 A; 3FPV A; 5DF9 A; 4KQR A; 3O88 A; 3C4P A; 3PR6 A; 1DJA A; 1K0K A; 4CJN A; 1TF1 A; 1W79 A; 3HJK A; 3BFD A; 2JN7 A; 4GLQ A; 5G4Z A; 3RTY A; 3N8R A; 2UV0 E; 4DRT A; 5EEC A; 1HVB A; 1LI0 A; 2WGV A; 3WS1 A; 1K4F A; 2XH9 A; 3G34 A; 3KSF A; 2EX9 A; 2DNS A; 5HAI A; 4MBH A; 4BD1 A; 1GSW A; 4GD8 A; 3EQU A; 3C38 A; 4UEY A; 3T1S A; 5TR7 A; 4DJ3 A; 3IHA A; 3ZVW A; 2HDS A; 3FV7 A; 2I9V A; 3PBN A; 3C2W A; 1OTI A; 5E2F A; 1NLY A; 3SH8 A; 2VA0 A; 3H9W A; 1ERM A; 1W7F A; 4BJP A; 4CLC A; 3DTI A; 1GHM A; 4R0Q A; 3N7W A; 1YMX A; 5TJJ A; 3FG8 A; 4UQI S; 3IF6 C; 4BEN A; 3U2A A; 3DBA A; 4YNR A; 2Y2P A; 5MC7 A; 3AGF A; 1GA9 A; 5EOE A; 4X1M A; 2XD5 A; 1H0M A; 1HZO A; 4PM9 A; 4OVD A; 3Q1F A; 4HBU A; 2JC7 A; 1RGY A; 5AVE A; 4WMC D; 5E2G A; 4PM8 A; 4KQQ A; 4NXF A; 4JPM A; 3S7P A; 2Y79 A; 4B93 A; 3BM6 A; 5G4Y A; 3N8S A; 3MS6 A; 4DXC A; 1YSP A; 4X1L A; 4BWI A; 2WKQ A; 4X55 A; 4OPZ A; 4R70 A; 5CER A; 3ZG0 A; 1PWD A; 4DDS A; 2ZQ9 A; 3BW6 A; 2W3G A; 5IHV A; 3VP2 A; 4KZ7 A; 2QMI A; 4C6Y A; 4QB8 A; 3IT9 A; 4R3J A; 3ZG5 A; 4II7 A; 4ARZ A; 5HPI A; 3D3O A; 3BJN A; 5HFO A; 1VET B; 2XRN A; 1VQQ A; 3H7W B; 3LID A; 3T1X A; 3A0V A; 5FQK A; 1LSV A; 3QP1 A; 3PXP A; 5CTN A; 3LGO A; 1T18 A; 1C3B A; 2C6W B; 4BQM A; 4WLA A; 3TOI A; 3PBR A; 1V9Y A; 1W8Y A; 3IS2 B; 2Y4A A; 5CRF A; 3T4S A; 3G6O A; 3HLC A; 1JWP A; 5AQB A; 3WWX A; 3N4I A; 4ZBE A; 1G5U A; 1PI4 A; 3LY3 A; 1P9W A; 1DRM A; 3BEC A; 1YM1 A; 4JF4 A; 3UE6 A; 2A24 B; 2PYR A; 5GHY A; 4FH4 A; 4OOL A; 2ZMV A; 5DTK A; 4MN5 A; 4EXO A; 2L0W A; 3G2Z A; 3UDF A; 3O3V A; 4P6Z M; 1ES2 A; 3HUN A; 5DKL A; 1ES5 A; 4GS9 A; 2VKS A; 1FCO A; 4GZB A; 4S2K A; 3U4L P; 4UHU A; 1ONG A; 2PHY A; 3TG9 A; 2Q9N A; 3ZFZ A; 2W3E A; 4WUJ A; 3PTE A; 2J8Y A; 4IVI A; 3CJM A; 2GJ3 A; 4EER A; 5I5L A; 2Y2Q A; 2JKF A; 4EQ1 A; 1MPL A; 1DJC A; 2O9C A; 4IJG A; 5CED A; 3E2L A; 1JWV A; 2Y2O A; 2QYB A; 4ZJ2 A; 4GN2 A; 4DDY A; 4KZ9 A; 4EBL A; 4E04 A; 1ZG4 A; 2Y59 A; 5HWT A; 4EQI A; 5J7E A; 2QHK A; 2WAE A; 3EGX C; 2Y91 A; 2H0T A; 1YQS A; 4Y0O A; 3NJA A; 4P87 A; 5FQQ A; 2PYP A; 5GLD A; 3SS3 A; 4F3L B; 4MBF A; 4JGO A; 2WAD A; 3MZF A; 3RXX A; 4XT2 B; 1BLP A; 4XUX A; 1OTA A; 2EWW A; 3D9Y A; 4WM9 A; 5KSC A; 1ERO A; 3DTK A; 4H6J B; 4KG6 A; 3TSG A; 3QP2 A; 5CEB A; 3LO7 A; 5F82 A; 5EOO A; 3LR0 A; 3HBR A; 1IYS A; 4KG5 A; 1SDE A; 4NK3 A; 4QWO A; 2X01 A; 2WGW A; 3C5A A; 5FI6 A; 1YPR A; 3MXR A; 3KSI A; 1E3U A; 2JCH A; 2OOL A; 4JLF A; 3BFC A; 2OSU A; 3GRJ A; 4M4X A; 1MWS A; 1H8Z A; 3IWO A; 3TW8 A; 1L2S A; 1Q2Q A; 4GDN A; 3E98 A; 2PBY A; 4P0M A; 5EFW A; 3LIB A; 4OQG A; 5F5Y A; 2QKP A; 4NXG A; 3WS5 A; 2PAV P; 2P08 A; 1CEG A; 5LBR A; 1XJ3 A; 4GNU A; 5HAR A; 1WYB A; 1BLH A; 4LRX C; 2P7J A; 1IYP A; 2HJ9 C; 4BL3 A; 1O07 A; 3H7W A; 2XDM A; 2GX5 A; 1JVJ A; 5FDH A; 4OQH A; 5EM1 A; 2EXA A; 2A3U A; 1XFQ A; 3OPR A; 5DJT A; 2KLI A; 5CHM A; 1N9N A; 1BYW A; 4B9O A; 4N9L A; 4ETZ A; 1VEU A; 4QD4 A; 1KDW A; 3A3J A; 2ZMA A; 4KQO A; 1PNE A; 4HQA A; 5F69 A; 4HIA A; 3HL9 A; 4GHI B; 5FAT A; 4E6W A; 1E3U D; 1ESI A; 1KGF A; 2W3D A; 2ZLY A; 3F1P A; 4O01 A; 1S4R A; 2E8I A; 2ZQC A; 3C8C A; 1NZU A; 1GHI A; 2G7U A; 5EE8 A; 1LT0 A; 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4IUH A; 4R23 A; 3QP6 A; 2VV6 A; 1Y28 A; 3IXB A; 4HES A; 3VOL A; 5A92 A; 4RYE A; 3DAV A; 5KZH A; 4R6L A; 5JYP A; 3H82 A; 3S7N A; 4YWZ A; 2EA9 A; 4PKY G; 1IEM A; 3WRZ A; 3HUO A; 2QJ5 A; 1NJ4 A; 3W4O A; 2Y2K A; 5EVE A; 1A0K A; 3HCY A; 2W1T A; 1L0F A; 5F1F A; 3FZC A; 4QU3 A; 3F1O B; 1YSQ A; 1ODV A; 2R78 A; 1H8M A; 2PRF A; 3FPW A; 4N1H A; 4CQH A; 4OOM A; 1NXY A; 3V67 A; 2V1B A; 4OQ0 A; 2Z2M B; 4OPY A; 1D7E A; 4E3J A; 5CEC A; 2XA7 M; 5L2F A; 3S22 A; 4Y7P A; 3IWI A; 1K54 A; 3BYD A; 5TBM A; 1IYO A; 3K3D A; 5DVA A; 1MC0 A; 2Y2L A; 4N9K A; 5HWV A; 4I3J A; 2EX8 A; 2OWJ A; 3W4P A; 3Q07 A; 4HBT A; 1XFN A; 2ZOH A; 3ZNY A; 4LEN A; 1WE4 A; 1FR6 A; 1XP4 A; 3IBR A; 4EV4 A; 1TVF A; 1CI8 A; 3B47 A; 5FAQ A; 2HDQ A; 2JKG A; 2WYX A; 5KMW A; 2J9O A; 1UWP X; 1OT6 A; 1SHV A; 2ZBB A; 3M2K A; 3AGE A; 5AJG A; 4QY6 A; 5L10 A; 4DJ2 A; 4IED A; 3CUE C; 3D72 A; 4PM5 A; 2L4R A; 2WKI A; 3IX4 A; 4WEK A; 4LLO B; 5FQ9 A; 3MZE A; 4GDB A; 3KYQ A; 4OLG A; 4A5R A; 2WZX A; 4OPQ A; 2O0Y A; 1LL8 A; 2XF3 A; 3Q7Z A; 1BLC A; 3P09 A; 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