4DXB | Genus

Total Genus 208

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	208
sequence length	637
structure length	637
Chain Sequence	KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHWGSGGGHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGSATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structure of an Engineered beta-Lactamase Maltose Binding Protein Fusion Protein: Insights into Heterotropic Allosteric Regulation. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Maltose-binding periplasmic protein, Beta-lactamase TEM chim
molecule tags	Sugar binding protein, hydrolase
source organism	Escherichia coli
total genus	208
structure length	637
sequence length	637
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.5.2.6: Beta-lactamase.
pdb deposition date	2012-02-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01547	SBP_bac_1	Bacterial extracellular solute-binding protein
A	PF13354	Beta-lactamase2	Beta-lactamase enzyme family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.190.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2	Periplasmic binding protein-like II	4dxbA02
3.40.190.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2	Periplasmic binding protein-like II	4dxbA01
3.40.710.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Beta-lactamase	DD-peptidase/beta-lactamase superfamily	4dxbA03

2O68A 4X56A 1PBPA 4JXSA 3ZG8B 3G4PA 1ES4A 5G18A 1LB8A 4QSEA 3CG3A 4C0RA 3T9VA 1HSEA 4OH0A 4EQ9A 1S6RA 3TSGA 1IQ7A 4L0LA 4S2KA 5A5XB 2XXUA 2QMXA 1LCTA 1H5XA 5HL1A 3S9NC 3HO7A 4IBXA 4EV4A 3VOYA 4EDPA 3HLCA 5EVIA 4MLVA 1Z6FA 3HSTA 1E3UD 4B88A 1H8YA 2H25A 2GFEA 3SEVA 4S2LA 3GBAA 1MY1A 2WYXA 2O6AA 3MVWA 1B3FA 2GH9A 3G3GA 1ZG6A 1VR5A 3VLVA 4XUXA 3WS2A 1R6ZA 5FAQA 4PETA 5CEBA 3N94A 1N3WA 2QS4A 2NXOA 4JXWA 1RP5A 3SS5A 5F83A 2GHBA 4GRKA 4U1ZA 4C1TA 1PB7A 4GXAA 4B4ZA 2W7YA 4EQ7A 1IYPA 2O69A 4Q8RA 1KE0A 2Y2GA 1ZU0A 1MQHA 3O6GA 4UA9A 1DOTA 3AGFA 2ZQ8A 1GA9A 3CFXA 3HPIA 4OZ9A 5H8HA 2XXVA 5KDTB 4YMAA 1H76A 5EVIB 2Y2JA 3W4OA 4GOGA 2VD3A 4QD4A 1XVYA 4OOMA 3FVKA 3H6WA 5EVID 1K57C 5FI7A 4BD1A 1Q35A 1PWGA 3TEPA 4YKJA 2QS3A 3IOVA 1VQQA 2Y2QA 3SEWA 3IX1A 4WMCD 5FAOA 4OETA 3ILTB 4GXSB 1NL5A 3G35A 2XX8A 3K2DA 5LOMA 4IVKA 3G3JA 2WUQA 4U4XA 1B7HA 1LI9A 4WEDA 1P1UA 2DYXA 3VVFA 5H8HB 2DWIA 2Z2MB 2V25A 1K6RA 4YMBA 1E4DA 1A99A 3PBTA 4ZJ2A 3MWBA 4KPTA 2PU4A 3C4OA 5KSCA 1URGA 4KQPA 3O88A 5DVAA 1IEMA 4PM5A 5GHZA 3UPNA 3IR1A 3ZG9B 3OD7A 3IOUA 3IAZA 3KN3A 4LCMA 4I8CA 4LV2A 5HX9A 3TTKA 4YINA 4E3KA 1NZUA 1PWCA 4JXGA 3OPLA 2DXRA 3TCFA 1TDGA 1I69A 1YAEA 1M5FA 4KD5A 1N84A 1LBCA 5L2FA 1Y20A 4KCDA 4WKMA 1MQGA 2DOJA 3T9XB 4ZECA 4RX3A 3Q07A 4ND9A 5ICQA 2WKHA 3MZFA 1BLSA 3FVOA 1XXMA 3A3JA 4U0XA 4LATA 4DE3A 4R6YA 4ESXA 4G2ZA 3IWOA 1IIWA 4DE0A 3EHUA 3VXCA 2Y55A 1TXFA 1ZC2A 3PV0E 3TKDA 4YKKA 2CZLA 2FFFB 4DZ1A 5EVLA 4A5RA 2H9BA 5K2XA 1L2SA 1NY0A 3M2KA 4OEVA 2Q8JA 3Q25A 2H4IA 3PPPA 4Q30B 1K57A 3FYZA 3K6UA 1IXHA 2F34A 4F3BA 4NK3A 5HW3A 3IB1A 1YLWA 2G2UA 3GV9A 2F78A 3HUMA 4NWCA 2V3UA 3CFZA 2I4BA 2DRWA 2EXAA 1GCEA 3TG9A 1H44A 4ESWA 1XS5A 2LAOA 5L9MA 3GZGA 5EPHA 4EBPA 4JDFA 2ABHA 2YPNA 3RJUA 5FQ9A 5DF7A 4N92A 5B70A 3CSBA 3HL9A 4XKPA 1PWDA 2F7BA 4KFQA 3WS1A 1SCWA 4QHCA 2DNSA 4YKIA 1XP4A 2XLNA 4KZ9A 3T9UA 5E2HA 1YM1A 1DPPA 5HAPA 4R2BA 2RL3A 1ALQA 3ZNTA 4E0XA 4JWOA 1CEGA 3MFDA 1EROA 3WAFA 2F97A 3OO7A 4H67A 3O9PA 1GV8A 3UE3A 2ZQAA 3K02A 2PYYA 2EX2A 4R1GA 2P0SA 4POXA 4DDSA 2O84X 4UA8A 5KCJA 1FTJA 3O86A 4FIMA 2IWBA 2UWXA 4DKIA 4PFUA 5A92A 3HLFA 3HN0A 1B5HA 1B3LA 4OKPA 5FAPA 5CTNA 4EQIA 2DE2A 3PAGA 4MBFA 2I49A 1M5DA 2DSFA 2ZMBA 1FTLA 3GR2A 4ZEKA 5HFOA 4E0WA 2IWCA 3WAEA 4K0WA 5H8SA 4FCFA 4R6KA 4IO6A 4IO2A 1DJAA 2Q9NA 1B0HA 1MH4A 1UQWA 4IO3A 3MKFA 4C6YA 4N6PA 4U22A 4P0GA 4E6WA 4LA9A 3ITAA 4UA6A 2PBWA 2DQVA 1ZMGA 5KCJB 2HDRA 1RCJA 1QUJA 4EXKA 1TVFA 2J9OA 1MQDA 2ZMAA 3S9EA 3SOIA 4NF8B 4JBZA 4NF6A 3U92A 3OPPA 5E2FA 3RY3A 1FOFA 1SVXB 3GXAA 4OYVA 5AQ7A 3KN7A 4QFPA 1URDA 1S50A 3EHTA 4R72A 2HDUA 3PAEA 1QJMA 4IEDA 3UA8A 2XR0A 3TCHA 1I6AA 1SI0A 2ZQ7A 2G2WA 5FDHA 2O7IA 3MPKA 1BTJA 4NWDA 4LVQA 3K00A 4OESA 1T0KA 3L6HA 1Y54A 2ZD8A 4HESA 4K0XA 1OLCA 3CI8A 2Y59A 1QUIA 1MY8A 4NF6B 2O1MA 5AE4A 4TQUQ 4ZDXA 1A54A 1XGIA 3CR9A 3BFDA 3VP1A 3MVYA 3PBRA 2DWAA 3IL1B 3M2JA 5AA1A 1B2HA 1QW0A 3TDJA 3H3GA 1Y3QA 3IJOB 2V93A 2GRVA 4E6XA 3ZVWA 4NE4A 3P09A 4OXVA 4MFIA 1MXYA 4FSFA 4UA7A 1JWVA 1NYMA 5J1DA 4F1YA 3S4XA 2Y2MA 2RINA 3U93A 3N8LA 2WGVA 1FW0A 1B51A 4KYEA 2EFUA 4F19A 2P2AA 3D4FA 1US5A 5EECA 3NCKA 4LQ2A 3B3XA 3O3VA 1BIYA 3MAMA 5CI5A 1OQHA 4LV0A 3VFHA 4RA7A 5AA4A 4KZ3A 2IEEA 2H0YA 1ES5A 2AIXA 2J7VA 1LAHE 4XKQA 4OENA 4NMYA 1B3HA 3OSRA 3T22A 4G68C 1DSNA 2I3VA 1PC3A 3IH9A 1DJBA 1P99A 3V5MA 3SKPA 1JETA 2WAFA 3HUNA 1USYE 2Z23A 4WYYA 4OLDA 3IORA 1FQDA 4Q5TA 3MC2A 2EFXA 4X69A 3ZKLA 2X7QA 1ZTYA 4KCCA 2D3IA 2Q9MA 1FCOA 2RCAA 5CC2A 2ZNSA 5AA4B 4IO4A 1PB8A 5H8QA 3UDXA 3UE0A 1MWTA 4IO5A 1JVYA 4FATA 3RGYA 4C1UA 4TLLB 4R0QA 4RYAA 4C3QA 3TQWA 1PEBA 2AL5A 1II5A 1NRFA 4ONYA 3QK6A 1XHYA 2XDMA 3TOIA 3C4PA 2PMSA 3EHSA 1SYIA 1AOVA 1WDNA 4GF8A 4KYSA 1LCFA 1IYSA 2C5WB 4GDBA 2XXPA 3N8RA 1YLZA 1USYH 3HLEA 2E1SA 3IOTA 2XD2A 2OWSA 3Q7VA 3MVXA 3IH8A 4BDMA 3Q81A 3W4QA 4OHNA 3C7UA 4X6TA 4MH5A 4ZEFA 3GMWA 3V50A 4C75A 3IK6B 5H8QB 3PBQA 3M6BA 1FCMA 3RPWA 1LFHA 4XKNA 4OFJA 3BFGA 3BFEA 2ZC6B 3UK4A 5CEDA 2OJTA 3FD3A 1HVBA 4F2QA 4GL8A 3UIFA 1Y3PA 2ZYKA 3IJXB 1VFEA 1Y9UA 4MF3A 3LO7A 2RCBA 3SH9A 3EQ1A 3CZDA 3LEZA 3HLWA 4JF5A 4GVOA 3Q7VB 1EWZA 4G8NA 4R73A 4OOLA 1QVSA 4CPKA 1MXOA 1LBBA 4JB7A 4G68A 3RT6B 1DJCA 5HARA 4OOYA 1BULA 1A8FA 4LQ5A 1GVCA 1LFGA 5FHOA 3K01A 4U4SA 1ES2A 4OWDA 1IXGA 2A5TA 2P1SA 4KZBA 1VFDA 2XHDA 4F3PA 3PUXE 4QSCA 4ZE9A 1JEUA 3IT9A 5I56A 1B1XA 3OSQA 2VOZA 3B6QA 3MBZA 4QY6A 4JSOA 5AA3A 5KZTA 5CTMA 1ZJLA 1N04A 1SI1A 3A09A 4EBLA 1NNFA 3FXRA 1O63A 4G68B 3PBNA 4LV3A 3O28A 2XFSA 4JF6A 1UIUA 2B3BA 2G29A 3HV1A 4QHQA 3E3KA 2A5TB 4JSDA 3USDA 4H1XA 2H5YA 3G3KA 1YMXA 4FAJA 1KVMA 1JQFA 3OO6A 5I56B 4FH2A 1FTOA 4JWXA 3ISGA 2DVZA 2Z2LB 3CIJA 1ERMA 4P87A 1LLBA 3OXNA 5FI2A 3GRJA 1MBLA 3HHFA 1N76A 1VE4A 1K38A 4F31B 3DP4A 2H99A 3C33A 4GDNA 4XXUA 2REJA 3PUYE 3N7WA 2WADA 3ZDJA 3OO8A 3MP8A 1K54C 1SW5A 3V89B 2Y2LA 3BFFA 1P1WA 1MPDA 4S2IA 5FTIA 2HPBA 3LBSA 2XX9A 1Q2QA 4GIZA 2P74A 1MPLA 2Y84A 3RLFE 2X26A 4QJGA 3MZ1A 1JWPA 3PUWE 4OPQA 3H6VA 1NYYA 2PT2A 2V84A 4NTLA 2FNCA 5CGWA 2OLUA 5AQAA 1HSLA 2VD2A 3OCLA 4FJPA 1ONGA 4UACA 3I7JA 3G3FA 3UPOA 1O7TA 3Q26A 5BUUA 3DP8A 4MBKA 1A8EA 4NEDA 1URSA 3EQVA 1MY4A 4E3LA 1NH7A 4U3TA 5DTKA 3SEXA 4G8MA 1BKAA 2H0TA 5EUAA 4G77A 1L0DA 3HREA 4FECA 2E8IA 1G68A 3M8UA 1W79A 3LSXA 1FQEA 3D4CA 1OMEA 2Z8FA 5F1QA 1IXIA 3R7XA 4P11A 3SESA 3U94A 3E2KA 4X1BA 5DVIA 4OP5A 1J1NA 3PUVE 3QNBA 1K4FA 4ELOA 2UVGA 3EF7A 4QRZA 5TU0A 2EX9A 2WK0A 4O3AA 4TOZA 1J9MA 1MH3A 1ESIA 5A90A 4R4SA 1S7YA 3NC8A 5FQIA 1TFDA 3IXGA 2I0BA 4MNRA 1KDSA 4JPMA 3K1MA 3EN3A 4KR5A 3RNNA 4OEUA 1P1QA 1PW8A 2HQ0A 3MW0A 2GDNA 1K54A 5GHYA 3NIAA 3CG1A 1B32A 3G32A 3G2ZA 1YTVA 3QSLA 2XF3A 5FQQA 4WXJA 3H06B 3QIMA 3LSFB 1PI5A 4PE5B 4X1DA 1TDLA 4OQIA 2VGKA 3T66A 4HS7A 3NI9A 3UN7A 1MPCA 1MDP1 3UP9A 4LUBA 1Q1KA 1B46A 3OEKA 4WEJA 1FSWA 1IUDA 3FATA 1PB9A 1NNTA 3FV7A 3OO9A 3WS4A 3QYTA 2F6GA 5DYHA 4P85A 4IBRA 3PGFA 2HP9A 3G3HA 2QSXA 3GLBA 3Q82A 4PQJA 4OPZA 2R6GE 3ODBA 4ZTKA 2ZXTA 4F1UA 5U47A 4LP2B 4QY5A 2O7UA 4DF6A 1K25A 4F3SA 4BDNA 3THIA 3ZG5A 4OPYA 1JVJA 4IB2A 3FIRA 5JTYA 4ZEIA 3MXRA 2ZJ9A 4GD6A 5DTSA 5TGFA 3ZGAB 1ZIUA 2PBYA 4KG6A 3N6TA 1CI9A 1D9YA 4D2OA 4EUOA 2ZM0A 2ALUA 3GSGA 2UVJA 2BJJX 3KGCA 1CK3A 4ZJ3A 1FCNA 1ESUA 4WZ4A 3DLNA 4DCYA 5A93A 1SW1A 3IXBA 1MM7A 3N5LA 5CMKA 1B3EA 4KG5A 2NVUB 2ZC7A 2PVUA 1XX2A 3RXWA 1H8ZA 3K4UA 4H0WA 2B3FA 3A3CA 3SEUA 4DCXA 4RY1A 1N9BA 1MQJA 4B4XA 5JTYB 2IA4A 3TTNA 5DF8A 3ZNYA 3W9WA 2O51A 2OSUA 1POY1 2PT1A 4KQRA 2ZM2A 2ZNTA 5HAQA 3T96B 3W15C 1TFAA 1O07A 1AL3A 1WODA 5CMBA 1P1OA 3DW0A 4BLAA 5I84A 2ONRA 1CI8A 3FVNA 1N0TA 3BEBA 4YZZA 1WE4A 5I2NA 1PIOA 1XKZA 2J9PA 4H8RA 4PFTA 4R6HA 1QUKA 3A3DA 1KE4A 1DMBA 1G6AA 5E2GA 3OC2A 4N13A 1VM1A 3PU5A 2H10A 4PFWA 1L0EA 3C4MA 1KGGA 4QF9A 4FEBA 5GHXA 5M1AA 1B7ZA 1YCJA 3T9HB 3VVEA 2Y2KA 3TODA 3P7IA 1TWYA 2XGNA 3QNCA 3ZCZA 5J8XA 3TQLA 4ID4A 4WM9A 5M18A 5DEXA 3O87A 2EXBA 4YKPA 2REGA 1RGYA 3G31A 3MUQA 4I62A 5M2VA 1NZOA 4IO7A 3MZDA 1ZBMA 1SW4A 1XA7A 4DDYA 5KMWA 2CMOA 4KI0E 5AQ9A 1FSYA 5I2NB 3LUYA 3T93B 3WRTA 2HDQA 2V2FF 4KYDA 4ECFA 4OMBA 3CRBA 5ITPA 4Z9QA 4AB6A 3KJTA 3WS0A 5L9OA 2ZQDA 1EI5A 3BYDA 3ITBA 1OLAA 4DRTA 1ATGA 3IF5A 1FQFA 3MP6A 2HCAA 2JBFA 4GL0A 3N6IA 5DEXB 3LY3A 5GLCA 3E2LA 1IXCA 2JC7A 3QXMA 4QSDA 4DE1A 4S2NC 3N4IA 4F39A 1Y1MA 3FXUA 3TELA 3K6VA 1US4A 1NFTA 3W8KA 4YFMA 4X9TA 4AQ4A 4G4PA 1UTBA 4ZZEA 5TFQA 2DWHA 2VGQA 3TCGA 4WEPA 2VP1A 2HP5A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4DXBA

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

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