4DXB | Genus

Total Genus 208

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	208
sequence length	637
structure length	637
Chain Sequence	KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHWGSGGGHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGSATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Sugar binding protein, hydrolase
source organism	Escherichia coli
publication title	Structure of an Engineered beta-Lactamase Maltose Binding Protein Fusion Protein: Insights into Heterotropic Allosteric Regulation. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Maltose-binding periplasmic protein, Beta-lactamase TEM chim
total genus	208
structure length	637
sequence length	637
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.5.2.6: Beta-lactamase.
pdb deposition date	2012-02-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01547	SBP_bac_1	Bacterial extracellular solute-binding protein
A	PF13354	Beta-lactamase2	Beta-lactamase enzyme family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.190.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2	Periplasmic binding protein-like II	4dxbA02
3.40.190.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2	Periplasmic binding protein-like II	4dxbA01
3.40.710.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Beta-lactamase	DD-peptidase/beta-lactamase superfamily	4dxbA03

3BFDA 3IO4A 3MVZA 3V8XB 1II5A 3VXCA 2G2WA 4X55A 2GHAA 4Y0OA 1FR6A 3WS2A 4U21A 3SS3A 4C3QA 4ELOA 5E2GA 2XXVA 3MVWA 1KGFA 3G2YA 3LCEA 5H8NB 4IEDA 4ZDXA 1SBPA 4KR5A 1Y1ZA 4OPYA 1UIVA 3MZ1A 3UK4A 5JTYB 2F34A 3C32A 4OKPA 3QK6A 2KLFA 4NF8B 1Q2QA 4OPRA 2W7YA 2EXBA 1S0WA 4S2KA 2WK0A 5A93A 5FAPA 3U1OA 2ZLYA 3HREA 1MG1A 4DZ1A 4JF5A 2I4CA 5U47A 4WEDA 2ESNA 1R9QA 5HAPA 2Y55A 2WGWA 2QSXA 3FVNA 3CR9A 1TDGA 2F6PA 1YT4A 4EDPA 3MKFA 3PV0E 5DF9A 4ID4A 2PT2A 4S2PA 1A40A 1Y4TA 3PAEA 5EHMA 3O6GA 3H6VA 1DPEA 2DS9A 3C7VA 5FHMA 1FTMA 1I69A 1IEJA 4ESWA 1ESUA 2Q9TA 4OERA 2PVUA 3RUMA 1I6BA 1XVYA 3M6BA 1MY4A 1URDA 2IWDA 4ZJ2A 4G68B 2Y2KA 1LL5A 2XD3A 2HDQA 3Q1FA 2V3TA 4UA6A 2HZKA 3TSGA 1UTBB 3S9EA 3PD9A 4EQ9A 4P0GA 1NFTA 4OTEA 2UVHA 1PW8A 4YZZA 4POWA 1ZTYA 3MFDA 2H10A 3IK6B 1YMSA 3D4CA 1N7XA 3U72A 2XD2A 4ND9A 2H0YA 4S2JA 5AA1A 4PPRA 4IY5A 4EQ7A 1GHIA 5DVIA 3OO8A 4FCFA 3THIA 3K0VA 3SEWA 2Y84A 4C1UA 4ZEKA 5EE8A 1XX2A 3O3VA 3HBRA 2Z8EA 4O3BA 3Q7ZA 4NMYA 3OO7A 1TXFA 3VSLA 3ZSFA 5FSRA 2I58A 1W79A 3LSWA 4ELRA 2J9PA 3NCKA 4U3TA 1Y1MA 4P87A 4I1DA 4DDYA 2F35A 3OMBA 3BECA 4R0QA 4GL0A 3TQLA 2ONKE 4X1DA 1IELA 3CFXA 2ZC7A 1B3GA 4TLMB 3OPRA 1JEUA 1B40A 4BDLA 1XT8A 5HBCA 1PI4A 4LV3A 3MUQA 3S9MC 1QMFA 5DEXB 4OEVA 3ITBA 5H8QB 2G93A 1XXMA 1HSJA 5EVIB 5G18A 1FQAA 2ANJA 3CMZA 1Z7ME 1VFEA 4KG2A 2VD2A 4GD5A 1YAEA 3AGDA 3KGCA 3C5AA 4OESA 3GV9A 4ZE9A 2HDSA 3NDEA 4OOYA 3TMGA 4QHQA 1FQFA 1SW2A 3CI8A 3GRJA 3PBOA 3K2DA 4CPKA 1N84A 4EXLA 3HSTA 3VSKA 3E2KA 4R6KA 2HEUA 5FHNA 4HTGA 4GD6A 1H8YA 3MVYA 2Z8FA 3RTWB 3G3KA 3FVGA 2RKMA 4ZTKA 1ZIUA 2XXWA 4FEDA 3HV1A 5GHYA 4ISUA 3S9NC 3VLUA 4DDDA 1YLTA 4E3NA 4HEFA 3IORA 5EVID 3IAZA 2Z2MB 3ZFZA 2V93A 2IWBA 1QJMA 4OQIA 1AIVA 4GLIA 4EF1A 3G3GA 1MS7A 4Q5TA 1NL5A 1LFGA 4FATA 4K0WA 1W8QA 1TFAA 4OZ9A 5M18A 5CBRA 1B4HA 1ZMGA 4BJPA 3KSJA 1GHPA 5ICQA 1M5DA 1F9BA 4JLFA 1ZG4A 1OLCA 1QW0A 1Y54A 2ZM2A 1LAFE 2ZQAA 5KMWA 4LZ5A 3PMXA 2ZJ9A 5GL9A 2DCFA 1P1QA 2Z8DA 3LY4A 3LR1A 3VP1A 2HAVA 4QFPA 3OXNA 4ZEFA 4DXBA 3FVKA 2ZC4B 3K6VA 3O97A 3HLGA 3QNCA 2XX8A 1CEFA 4ECFA 3KEIA 2QS2A 4PP0A 2HDRA 1Y20A 2H5YA 4KQQA 3K6XA 3EF7A 1GA0A 3R7XA 3HL9A 4EBLA 1VFDA 3UA8A 5TFQA 2VD3A 3ITAA 2EX8A 1FTJA 4LCMA 1HVBA 1I6AA 3T22A 3W4PA 2NVUB 1SHVA 5FQMA 3UN7A 3N26A 1EZPA 3O87A 3S4XA 1E3UD 1KE4A 2JC7A 4X69A 5DF8A 5I56B 2WUQA 3OO9A 3TELA 1KE0A 2X01A 2I0CA 4JF6A 5CMKA 3N94A 4TQUQ 3UE0A 3BFCA 1Q35A 3CG3A 5I59B 2XF3A 3QUJA 1EH3A 4X48A 1DJAA 3SDFA 1E4DA 1B3EA 4GF8A 4PQJA 1EI5A 4YB7A 4X1BA 3VP4A 4KHZE 3PMWA 4F31B 5I2NB 2Q2AA 1K55C 5A5XA 3ZNYA 3O86A 1ES2A 4ZE8A 3H4ZA 3I7JA 5CHMA 3SEXA 2IEEA 1J9MA 4PM8A 4EUOA 3E9XA 1XA7A 2XFTA 3HN0A 4PFTA 1A8FA 1FCNA 3UN6A 4FORA 3I6VA 1BLFA 3EHUA 4ZEDA 4YICA 2J7VA 1MY3A 1D4NA 3RQTA 3CZDA 3HPIA 4ELQA 2ZC3B 4ZS9A 1WVJA 4I62A 1UIUA 2O84X 2I48A 3A3JA 1RYOA 5GLCA 4R74A 1URGA 1XPBA 3HCQA 4NF5B 3RT6B 1SKFA 1BKAA 1R6ZA 4OFLA 1RGZA 4DLDA 1RP5A 3OPLA 5EPHA 5L2FA 3MPKA 4YAHX 3RY3A 4YMBA 2XXXA 3IQAA 4DE0A 3PUYE 3H7MA 1Q1KA 2F78A 2FYIA 4WEPA 3IXHA 1NKXA 4KCDA 3C9HA 4G8MA 4OFJA 1L0DA 2ZNUA 4BL2A 3U8QA 1B4ZA 1TDLA 1MPDA 4X56A 1Z6FA 3EQVA 3QYTA 1DJBA 4G8HA 1MM6A 1H8ZA 1LBCA 1B7HA 3IOVA 1VSOA 2RC8A 3BFGA 3N8RA 2Y2HA 4OLGA 5CRYA 4MLQA 3A3FA 4FH2A 3TOIA 4OPQA 3W8KA 4GQOA 5EECA 2F36A 3OC2A 4RK9A 2Y4AA 5CBSA 3UDFA 4F22A 3O2AA 2OZZA 3A3IA 4KD5A 1D9VA 2V3QA 2V2FF 2RCXA 1WE4A 2X7QA 4WELA 3IF5A 1I2WA 3C33A 1M5CA 1TFDA 3MP6A 2OLUA 3QUFA 1O63A 1QMEA 4LCLA 2UVIA 1CK3A 3E4RA 1MXYA 3W4QA 4BDOA 1K25A 3C35A 4O3CA 5EYFA 4QY5A 4L0LA 1MPCA 3B6QA 3KSXA 5AA4A 3Q07A 3OPHA 1LLSA 3SS5A 4N13A 5HW3A 1IYPA 4GRKA 3SS4A 1ELJA 4ZDMA 5AA3A 1YQSA 4E0XA 4TOZA 2XK1A 1NMUA 1LCFA 4MH5A 4LENA 1MXOA 1FW0A 1OVBA 2Y7IA 3K01A 3EQUA 3IL1B 5H8SA 1IXHA 2DVCA 2REGA 2XXPA 1MBLA 4GDBA 4BQMA 1A99A 4BL3A 4E3KA 2ZC5B 5FI6A 2P9VB 1D9YA 4BD0A 4H8IA 2XFSA 1ERQA 2ONSA 5D3OA 2HDUA 1EZOA 5JEIA 4OEUA 1POTA 2OLBA 3MQ9A 4YKJA 1IYOA 1N3XA 2XX9A 4WXJA 2ZYMA 1IITA 3FV7A 4A5RA 2OWSA 2XXHA 2DXRA 1EROA 3MPLA 1DSNA 4K91A 1KWHA 3G3FA 4JXIA 2DVZA 5DVFA 1B5JA 2Y2GA 4EV4A 3BRMA 2F7AA 3H03A 4LZ7A 2FNCA 5EUAA 1ZBMA 2UYFA 5DVJA 5J8XA 4Q0CA 4KZAA 3O9PA 3TTNA 2XGNA 4MBFA 3FV1A 4LV0A 2ZC6B 4DXCA 1A55A 1R1NA 4OVDA 4P0IA 1SDXA 4XXUA 3PGFA 5AA2B 3PUWE 1GCEA 2Y2QA 1MQHA 1RKMA 2X26A 2ZQ7A 5JYOA 1DY6A 1B1XA 3OD7A 3SH8A 4C75A 4WZ5A 5CECA 4KZ3A 2XH9A 1T0KA 1YLWA 1MKIA 4R4RA 2I3WA 4R6HA 4R3JA 4BDRA 2GHBA 1LI0A 3H6TA 4X9TA 1JWPA 3G4PA 4RVAA 2GRVA 3HHFA 1JETA 5HAIA 1P1UA 4U2RA 3ZG8B 1IXCA 5E43A 2EXAA 3DTMA 5FASA 2UXAA 1AOVA 3LSLA 4GIZA 3HLCA 5CC2A 3PPNA 4H5FA 4ZJ3A 3VP0A 3BFUA 3IXBA 3KN8A 3FZVA 3K00A 1MXZA 1ESIA 2HCAA 2XD1A 5AA2D 4I8CA 1Q2PA 3IWIA 1O7TA 2XXTA 3IB0A 3PTEA 2DXYA 2QMIA 5CGSA 4KZ7A 5BUUA 4U0TA 1B51A 5FAOA 3UPPA 1DJCA 4OQHA 1US5A 2F97A 2Y2JA 3N5LA 4XUXA 2Y2NA 2HFBA 5E2FA 3WS4A 1RCJA 4D2OA 4LP2B 2Z22A 2WGWB 3G35A 1KE3A 1PBPA 3V39A 3KOSA 4F3GA 3TTKA 4KYDA 1BSGA 4F1YA 5IKBA 1HD8A 4WEKA 5FTHA 3S2VA 4RXLA 1A54A 1PDAA 3FZCA 2PBWA 2OWTA 3ZG7B 3G32A 2CZLA 2CC1A 3VVEA 1FR1A 1LSTA 4CJNA 4JSOA 3FV2A 4R72A 2UYEA 2Z2LB 1SYIA 2NWJA 5HM4B 2ZQCA 1K56A 3IX1A 5H8FA 5GLBA 3GBBA 2F7BA 3BM6A 1JVYA 1MY2A 3MWBA 3CFLA 3FXQA 3QIMA 3UY6A 2XDMA 1SW5A 2WADA 3MZEA 5FQQA 3A3EA 5I57A 3JV9A 3DP6A 4N07A 1SW4A 3MP1A 3PBQA 4Z9QA 2VGQA 4BLAA 3B3XA 4JXVA 5FQJA 3C7UA 3OELA 4KG5A 3VP2A 2XLNA 2QRYA 2A3UA 3B6WA 3Q28A 1AH5A 4DE2A 2RC9A 1LAHE 1E25A 3BLMA 3GSGA 4HESA 3ZG0A 5KDTA 2Q9NA 1Y9UA 4HS7A 3PBRA 4LV1A 4GVOA 1JNFA 5I94A 5I2KB 4PM7A 4GNUA 5FTIA 4GOTA 3TAJA 5EOOA 3H6WA 1NY0A 4I9DA 3LSFB 5TP9B 4M4GA 2DRWA 4FE8A 2RF1A 2R9XA 2OCUA 1VM1A 1NH7A 4KZ9A 4UHUA 1PB8A 5F1QA 3W9WA 4KENB 4R9FA 3BFFA 4YINA 4NWCA 3TG9A 2WAEA 2QPNA 5KZHA 3UGWA 1OMEA 1PEBA 4Z7EA 1MQGA 4C6YA 3GR2A 2QPQA 4RK2A 4P6BA 5GLDA 3UORA 2Y2OA 5DTKA 5I2KA 3EHTA 2ZD8A 2O51A 4IO3A 1POY1 2X71A 5FA7A 1JW4A 1MM7A 3KOTA 1H5XA 1ZC2A 3A3CA 2Y7RA 4MLLA 5TP9A 1MY8A 1IZ1A 2LAOA 4EBNA 1K4FA 3VVFA 3O29A 4R2FA 4GDNA 3FATA 1MXVA 4H6DA 1CB6A 4X6TA 4PFUA 3CSGA 4L17A 4HW8A 4WMCA 4Y0TA 4YFMA 3R6UA 4MF3A 3RTFB 1YCJA 1K57A 4G77A 5H8HB 3FWLA 1MXUA 4FH4A 2JE5A 1K6SA 1ZLQA 1XGJA 2ZMBA 1CEGA 4R23A 2Q8JA 3TPAA 2XXYA 4RY1A 1BTJA 1MRPA 4C1TA 3PBTA 2XR0A 4ZZAA 4ZAMA 3DW0A 3RJUA 2Y7KA 4N6PA 3ZDJA 5F83A 5A92A 2O1LA 2DE4A 3T9UA 3FKVA 1MQJA 4F2QA 3G30A 3N8LA 3NIAA 3UDIA 2RINA 3MZBA 1PYYA 4X68A 2XHDA 3G7WA 2DYXA 4EXKA 1ES3A 4NF6A 3C4OA 1ONHA 2P0SA 3O88A 5H8HA 2D21A 2B5RA 3S1YA 2HP5A 2Q2CA 3DWKA 2DWAA 4R1GA 3FIRA 3TZAA 3ZKLA 2AIXA 2X7PA 4GFRA 1P1NA 3M6HA 2QS4A 4OQGA 4N9LA 1JQFA 4KQOA 4KZBA 1QULA 4P0MA 3F11A 3RXWA 3TKDA 1IKIA 3C31A 4RYAA 3SH9A 4WM9A 3WRZA 1N04A 4GXAA 3ISGA 5J1DA 4LUBA 5CHUA 3JYIA 3ONMA 1LLBA 3CSBA 1W8YA 4KPTA 4ELPA 1OIBA 1B32A 1DMBA 4GOGA 3WS1A 2H9BA 3FUZA 3LY3A 5EOEA 4KI0E 3DELB 1PWGA 4XXRA 2ZYOA 1G6AA 3Q29A 4O3AA 1WYCA 1LFHA 4RPOA 4H5GA 3EPEA 3RT8A 3S4UA 2HP6A 4AQ4A 1IIWA 4EF2A 2O7IA 2PYYA 5M19A 3PPRA 5L9MA 3OCNA 1DTZA 1FCKA 2J8YA 3ILTB 4XIGQ 3IH9A 3NI9A 3OCLA 3RLFE 3TTLA 3TQWA 5A5XB 4OLDA 3UO9A 3IHBA 1FCMA 2C5WB 1NXYA 1JEVA 2Y7WA 2ZQ8A 1XA1A 2EX6A 4Q30B 4XKNA 4BDQA 4F2OA 1PI5A 2O69A 3TYHA 4DCYA 3DLNA 2H99A 2A5TA 2OV5A 2O6AA 3EQ1A 3FJMA 1L0FA 3BEBA 3U92A 1MPLA 2VOZA 5TPAA 3BFTA 1E3UA 3HLFA 5KCJA 2WKIA 1U60A 3FVOA 3OOAA 3HUNA 1RYXA 4RYEA 4HBTA 1LI9A 4JWXA 4YU0A 3PD8A 4NK3A 4MEZA 3MVXA 3EHSA 3BKIB 2OLVA 3N6UA 4WZ5C 3MBZA 4F1VA 3IB1A 3E2LA 3IH8A 5DTSA 4IBRA 3BLSA 3K1PA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4DXBA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

pfam database annotations