The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
37
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sequence length |
125
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structure length |
125
|
Chain Sequence |
SWQTYVDTNLVGTGAVTQAAIIGHDGNTWATSAGFAVSPANGAALANAFKDATAIRSNGFELAGTRYVTIRADDRSVYGKKGSAGVITVKTSKAILIGVYNEKIQPGTAANVVEKLADYLIGQGF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
PROFILIN II
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| publication title |
A Comparative Structural Analysis of Profilins
rcsb |
| source organism |
Acanthamoeba castellanii
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| molecule tags |
Structural protein
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| total genus |
37
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| structure length |
125
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| sequence length |
125
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-05-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4X1L A; 2E8J A; 1AWI A; 1SKO B; 5EV0 A; 3MSH A; 4D60 A; 1FIL A; 3T1X A; 1CJF A; 5EVE A; 1VEU B; 3T1Q B; 2HZ5 A; 2ZL1 B; 3CPT B; 1SKO A; 1ACF A; 1SZV A; 3DAV A; 2JKF A; 1VET A; 3NUL A; 1Z09 A; 2B95 A; 1VEU A; 2ZL1 A; 2VK3 A; 3CPT A; 5FEF A; 1VET B; 4X25 A; 3D9Y A; 4QWO A; 3T12 B; 1J3W A; 1A0K A; 1D1J A; 1F2K A; 3KYE A; 2PBD P; 3T1S A; 2BTF P; 5FDS A; 1G5U A; 4FTX A; 5EM0 A; 5FEG A; 3LEQ A; 1CF0 A; 3L9K A; 1CQA A; 3L7H A; 3U4L P; 4ESP A; 1PNE A; 3T1R A; 1Y4O A; 4X1M A; 3LGO A; 3UB5 P; 2JKG A; 1K0K A; 1HLU P; 2PAV P; 2PRF A; 2V8F A; 3NEC A; 1PRQ A; 2V8C A; 1PFL A; 5EM1 A; 1YPR A; 3MS6 A; 1FIK A; 3CHW P; 4FUW A; 2ACG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3LR5 A; 1K54 A; 2WKQ A; 2L0W A; 1LSX A; 5GLD A; 3H7W A; 1SCW A; 2ZC7 A; 2XFS A; 2A2L A; 1N9L A; 1NXY A; 4RYE A; 3MKE A; 4JGO A; 3B33 A; 1TS6 A; 5AQ7 A; 1U60 A; 5AVE A; 1VEU B; 3JVU A; 4KQD A; 4R70 A; 4ZBE A; 1IOU A; 2HJE A; 4BL3 A; 1F5M A; 2Z6D A; 4EBN A; 1ZG4 A; 3VE3 A; 4WMC D; 3PYP A; 2PR5 A; 3KO6 A; 5E2H A; 4EET B; 2J9O A; 4Q0J A; 2ZL1 A; 4MBH A; 3V5M A; 3OPL A; 5CTM A; 5CX7 A; 1STZ A; 2WKE A; 4HP9 A; 2W1T B; 1XJ3 A; 3T4Q A; 1SDE A; 1CEG A; 1H0M A; 3IHA A; 1ERQ A; 3NY4 A; 1E4D A; 1IYP A; 4EQ1 A; 3MBZ A; 3KSI A; 3ISG A; 2PBD P; 5HSQ A; 2WKH A; 2J80 A; 1N9N A; 4FTX A; 5HX9 A; 3ZDJ A; 2C5W B; 4F3L A; 4X69 A; 4N1H A; 2B18 A; 1DP9 A; 4YFM A; 1PW8 A; 1V9Y A; 4ZJ3 A; 2OAQ 1; 4X1M A; 1JVJ A; 5CEC A; 1YAX A; 2FFF B; 1BZA A; 3FC7 A; 4HOI A; 4I3A A; 5AVF A; 1YT4 A; 4R1G A; 2HV1 A; 1K0K A; 3F1N B; 3IX4 A; 4IUK A; 4P87 A; 1TVF A; 3R7W A; 2XA7 M; 3MQ0 A; 1W7F A; 4ZJ1 A; 5A92 A; 4E3N A; 5FL3 A; 3T4O A; 3C4O A; 3MSH A; 2X02 A; 3O5Y A; 2H28 A; 5FAO A; 3Q82 A; 1OT9 A; 5C5K A; 5M18 A; 3OC2 A; 3HLB A; 4P0M A; 4Y0O A; 2JKT I; 4CLC B; 1FSY A; 1YSP A; 4S2M A; 1YLT A; 2Z2M B; 3DW0 A; 4U0T A; 2XD1 A; 3W4Q A; 5FQQ A; 4OQ0 A; 3SH7 A; 4EQI A; 3HLD A; 4OPY A; 3HJI A; 2EX8 A; 2K7S A; 3E2L A; 5FQI A; 4HH3 A; 2H5S A; 5L8M A; 3SZT A; 2LB9 A; 4GB7 A; 3TRC A; 1YLY A; 1NRJ A; 1J3W A; 1LI9 A; 5EVI C; 2Y2K A; 3HUO A; 3N7W A; 1K6S A; 4XUZ A; 2A24 B; 2HDR A; 4LLO B; 3ITA A; 3BY9 A; 2KOI A; 4P6Z S; 3CIT A; 4OON A; 3ZFZ A; 3NOT C; 3RTY A; 2PDR A; 4R3B A; 3LGO A; 2C6W B; 1GHM A; 1UGU A; 2V0W A; 1LI0 A; 2FH5 A; 1NYM A; 1W8Y A; 3A0S A; 3TOI A; 5AQB A; 3MZE A; 1YSQ A; 4KZ9 A; 1PZP A; 4Y0T A; 2I9V A; 2WK0 A; 1KE3 A; 2CC1 A; 4MNR A; 2W1R A; 1OTB A; 4GHI B; 1MY8 A; 5JYO A; 3ULF A; 3NI9 A; 5FSR A; 4C3Q A; 3FKV A; 3LY4 A; 5CHU A; 4BD1 A; 2XLN A; 3TG9 A; 4QU3 A; 4BQM A; 1NZU A; 4E3O A; 2IWC A; 3LUQ A; 5CED A; 3OPH A; 3E0Y A; 4Y0U A; 3WS4 A; 2NUT C; 2Y2Q A; 2ZQD A; 1ES2 A; 2Y2H A; 2DMW A; 3MJQ A; 3QP5 A; 4MN7 A; 2OOL A; 1IYO A; 2W3E A; 1K56 D; 1FR6 A; 4UA9 A; 4B88 A; 3NIA A; 5EOO A; 5J8X A; 5FAQ A; 1HTZ A; 3SS5 A; 3MXS A; 4ARZ A; 1BUE A; 2XGN A; 4DE1 A; 5KSC A; 4PKY G; 3VE4 A; 3V50 A; 4CPK A; 3ZNY A; 3V67 A; 1MPL A; 4ZRR A; 1G5U A; 1NRF A; 2P74 A; 5FQK A; 5FAT A; 1BLP A; 4R4S A; 4LRZ E; 3F1O A; 3UPO A; 3LEZ A; 4UA7 A; 4XT2 A; 3T4L A; 1I5Q A; 3P09 A; 3QNB A; 4F3L B; 4DRT A; 2L4R A; 4RX3 A; 3UPP A; 3G32 A; 3CG5 A; 5CGX A; 3ZYT A; 2B02 A; 3BFF A; 3GMW A; 4PPR A; 5MC7 A; 3QP6 A; 2PAV P; 1XKZ A; 2ZC5 B; 4OOL A; 3NJA A; 4EW7 A; 3M2J A; 2ACG A; 2Y2J A; 2E8J A; 4E04 A; 3IF6 B; 1L0F A; 2UV0 E; 1W5D A; 1DRM A; 3FPW A; 4S2L A; 5J4E A; 1TS7 A; 4L9E A; 4PM9 A; 4QY6 A; 4JBF A; 3PR6 A; 4WZ5 C; 3FZC A; 5IS1 A; 1KDW A; 2VGJ A; 3ZNT A; 1VQQ A; 1W8Q A; 3IBR A; 2Y8H A; 4S2N C; 5KIZ A; 1D06 A; 1AXB A; 2P9V A; 1ES5 A; 1GSW A; 3N8L A; 1OTE A; 1VET A; 3AGD A; 3KX0 X; 3HLE A; 4JLF A; 5A93 A; 1VEU A; 4KUK A; 4MCW A; 4G3K A; 3S4X A; 1VM1 A; 4JXW A; 5G4Y A; 4DE0 A; 4OLG A; 3ITB A; 1XA1 A; 1CI8 A; 2VGL S; 1HZO A; 1T1C A; 3IT9 A; 5HPF A; 3EQU A; 2WKI A; 1P9W A; 2W1T A; 5F6A A; 1JTG A; 1K55 C; 3L9K A; 4ESP A; 3UE1 A; 2VV6 A; 4BBV A; 1Y54 A; 3C4P A; 4GW9 A; 5HFO A; 1L3L A; 5DTT A; 4EU0 A; 1F9I A; 4O8G A; 2INW A; 1LSV A; 3IQA A; 4N1X A; 3VV4 A; 3BEC A; 2ZMV A; 3BJN A; 5HW3 A; 1L0D A; 3P7N A; 3LIB A; 3PHY A; 3MXR A; 4BL2 A; 4PM6 A; 4R38 A; 2EWW A; 2YKF A; 1XJ6 A; 3ZG0 A; 1ES3 A; 1K54 C; 2ZM0 A; 3F1N A; 3A3I A; 5EV0 A; 3UDF A; 1T18 A; 3VSL A; 1OTI A; 5HDD A; 4OPQ A; 2Y4A A; 3N6I A; 3PXP A; 3N8S A; 4GOG A; 5GL9 A; 4DJ2 A; 1FR1 A; 4WM9 A; 3CPT B; 2QYB A; 5E2F A; 4H6J A; 2XSS A; 1ACF A; 1RP5 A; 2L1M A; 4WF0 A; 4BMW A; 4S2O A; 1Z09 A; 3ZQ5 A; 3QHY A; 3KSF A; 5EEC A; 4CLC A; 1MC0 A; 4KZ7 A; 3CUE A; 3B47 A; 4X25 A; 2V20 A; 3D9Y A; 4E6X A; 1NYY A; 2O9C A; 3MKF A; 3DTI A; 5A90 A; 2PU4 A; 2KDK A; 1JWV A; 2QJ5 A; 4HBT A; 1JNU A; 5FDS A; 4Y5F A; 2BAS A; 2BG1 A; 4WYY A; 2V9A A; 4JF6 A; 3NCK A; 5HDS A; 1TS8 A; 5FI2 A; 5FI7 A; 2QPN A; 3T4S A; 3F1O B; 3KYQ A; 1HD8 A; 1P97 A; 4NXF A; 5HD5 A; 4XT2 B; 3IXB A; 2EX2 A; 5FQ9 A; 4AFI A; 2J3T D; 4HQA A; 2XQZ A; 5F83 A; 5DJU A; 2JKG A; 1XPB A; 5DTK A; 3ZVW A; 3FV7 A; 3LIE A; 1K57 A; 3ZG5 A; 4OOM A; 2WGI A; 4GLQ A; 5F68 A; 4EUZ A; 2HDU A; 4KZ8 A; 4UEY A; 3RXX A; 1TDL A; 2H0T A; 3C30 A; 3RH8 B; 3JVV A; 5BOH A; 1XFQ A; 5KZH A; 4PKY A; 1E3U A; 5F1F A; 3S7N A; 3CMZ A; 4GHI A; 1O7E A; 2JKR I; 5F82 A; 4GD8 A; 1LLB A; 2PYR A; 3FYZ A; 1M6K A; 1JTD A; 1S0W A; 1FCO A; 3IH8 A; 5CXW A; 2P9V B; 2PU2 A; 1VET B; 3UB9 A; 1JWP A; 2K31 A; 4KZB A; 2EX6 A; 3DWK A; 1YQS A; 3UN7 A; 3T12 B; 4KG6 A; 4HHD A; 1J9M A; 3C2W A; 5HWT A; 5TBM B; 2OAP 1; 3V3S A; 4H8R A; 3H9W A; 5GLA A; 4EXO A; 3SOI A; 4UQI S; 4B9O A; 4OH0 A; 2BLS A; 3N8R A; 3L7H A; 3S22 A; 2W3H A; 1XP4 A; 4HI4 A; 1UWN X; 4YWZ A; 4JF4 A; 3E2K A; 3A3D A; 3MFX A; 2PR6 A; 3BQ8 A; 2PD8 A; 4G3V A; 3HLG A; 3LID A; 1HLU P; 4IVK A; 1SDN A; 1YPR A; 4NXB A; 4EV4 A; 5TGF A; 5M1A A; 3Q1F A; 4FUW A; 4O01 A; 1IKI A; 5CGW A; 4PMA A; 1SKO B; 4HJ3 A; 3OPR A; 1GA9 A; 4RA7 A; 3RFB A; 2Y79 A; 1O07 A; 2X01 A; 3A0R A; 3ZG9 B; 1YLP A; 4MEZ A; 4LEN A; 4WEJ A; 3PAG A; 3OLO A; 1ZTU A; 3NOU C; 4JXV A; 2WZZ A; 3CAX A; 1Z6F A; 3IF6 A; 3Q07 A; 4HEF A; 5E2E A; 1TF1 A; 3LR3 A; 4H6J B; 3K2N A; 4Y15 A; 5D3O A; 1PWC A; 5AJG A; 3QP2 A; 1BLC A; 3IF5 A; 3O86 A; 4ZAM A; 4Q0H A; 5F5Y A; 1DJC A; 2ZC6 B; 3UNW A; 5CRF A; 2X71 A; 4GN2 A; 3ZVT A; 5DVA A; 4LV3 A; 1WA9 A; 4BBT A; 2P04 A; 2HP5 A; 2JHE A; 3G2Z A; 3PBR A; 1Q2P A; 3GEC A; 3D4F A; 2JCH A; 3NBL A; 4LRX C; 2JKR M; 3C5A A; 3BW6 A; 1JWZ A; 3ZG8 B; 3KSH A; 2D02 A; 4NXE A; 2GDN A; 3OBF A; 1BUL A; 2HJ9 C; 1RGY A; 4HY8 A; 3EGX C; 2J7V A; 2ZC4 B; 3GR2 A; 2O99 A; 3H82 A; 2JE5 A; 3LO7 A; 1OT6 A; 1ESI A; 2WUQ A; 1C3B A; 4II7 A; 1BYW A; 3BFE A; 4D60 A; 4OP8 A; 4RQ9 A; 4EUV A; 4UA6 A; 4NK3 A; 1NZO A; 4IJG A; 2OLU A; 5L09 A; 1CJF A; 4JPM A; 5HL6 A; 4I5S A; 3S7O A; 3T4T A; 3CWF A; 1W79 A; 4QB8 A; 2Z6C A; 1P9R A; 3WWX A; 2QMI A; 1LT0 A; 5EVI D; 3E4P A; 5GHY A; 3HUM A; 1XJ4 A; 2HF6 A; 3CJM A; 4P6B A; 3HBR A; 5EE8 A; 2PBY A; 2B95 A; 2WAD A; 5GLB A; 3UB8 A; 4L9G A; 2ZQ8 A; 3IX3 A; 3CPT A; 4EWF A; 3EWK A; 4ME4 A; 2Y2L A; 4EES A; 3HUN A; 1TD5 A; 3PBS A; 3F1P B; 3MZD A; 3IWO A; 4L9F A; 2D01 A; 3UY6 A; 2QHK A; 3OPP A; 1F2K A; 1NLY A; 2Y91 A; 2VGL M; 4WEL A; 3S7Q A; 1BLH A; 5HD3 A; 3G35 A; 2NUP C; 2Y2P A; 3D72 A; 4JXG A; 4E3J A; 3ZHH A; 3UO9 A; 1IFQ A; 1KOU A; 2EX9 A; 2XA7 S; 3VFF A; 4Q8I A; 3DWZ A; 4KQR A; 3G4P A; 2XRO A; 2M7V A; 1EI5 A; 1MZU A; 1S67 L; 3GQZ A; 3C38 A; 1PNE A; 4YNR A; 2ZMF A; 4LV1 A; 5A91 A; 1VHM A; 4LGW A; 3ZG7 B; 1XXM A; 3TSG A; 3EGD C; 3I7J A; 5KSH A; 5DKL A; 2DRW A; 2WKR A; 3V3R A; 4OPR A; 3CZD A; 5I5L A; 4IVI A; 2W3G A; 3BQA A; 3VOZ A; 3CHW P; 3W2Z A; 4DKI A; 3W4P A; 4WLA A; 2XK1 A; 5DF7 A; 1K6R A; 2XD5 A; 4R0Q A; 2QJ7 A; 3GSG A; 1MWT A; 1S4S A; 3BM6 A; 2IWB A; 4X68 A; 2Q9M A; 1YMX A; 1KE0 A; 2I72 A; 3B3X A; 5E43 A; 4LCM A; 4Y2F A; 2OWJ A; 2OLV A; 1OME A; 4KQQ A; 3DAV A; 1KE4 A; 5FQM A; 1YM1 A; 5U47 A; 4CLC C; 3QNC A; 3MMH A; 3O87 A; 2W27 A; 3CUE C; 3HLW A; 4ETX A; 3M2K A; 4EBP A; 1MKI A; 2QZ6 A; 1PWD A; 4OOY A; 2QWS A; 4GS9 A; 1T1B A; 5FA7 A; 4X53 A; 4HH2 A; 3QP4 A; 4M3K A; 2BTF P; 2LB5 A; 3EEA A; 2V1Z A; 4NXG A; 1CEF A; 1K56 A; 2ZM8 A; 4IUH A; 1PI5 A; 1IEM A; 4EBL A; 1RGZ A; 2V1A A; 2IA2 A; 3UE6 A; 5TBM A; 2YKH A; 5DKK A; 3UB5 P; 4R3J A; 3LY3 A; 3K3D A; 3WRZ A; 2XR0 A; 1F98 A; 4CLC D; 3NHQ A; 1K57 C; 2J3W A; 5EPH A; 1ALQ A; 1CI9 A; 1LSW A; 4WZ4 A; 2DNS A; 4WL9 A; 4E3M A; 5DFY A; 3MQQ A; 2V1B A; 3WS0 A; 4C6Y A; 4E3K A; 3H82 B; 3BLS A; 2P08 A; 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3VFH A; 4KQO A; 3LR0 A; 3NUL A; 1I2S A; 4PM5 A; 5CTN A; 5IU1 A; 3SH9 A; 2EFX A; 3G34 A; 1ESU A; 3GVB A; 2Y2G A; 1GCE A; 4R4R A; 1KGG A; 2ZD8 A; 3IBJ A; 3WRT A; 3G30 A; 4BD0 A; 3DTK A; 4JGR A; 3BY8 A; 1KGF A; 1HVB A; 3KYE A; 1K4F A; 3HCY A; 4Y13 A; 4GS9 B; 2WAE A; 2HP6 A; 4QHC A; 2XH9 A; 1GHI A; 4DXB A; 2Q0O A; 4HES A; 4LPZ A; 3IXG A; 1ZHH B; 4BBU A; 1TEM A; 4OPZ A; 4GDB A; 3F1P A; 3VP4 A; 1RCJ A; 4KZ3 A; 2WGW B; 2RL3 A; 4DN0 A; 3U4L P; 4K08 A; 2W3F A; 4HP4 A; 4NET A; 2B5R A; 1N9O A; 3EOI A; 4LRY C; 3P01 A; 4QPR A; 5EVL A; 4P6Z M; 3BYD A; 4S2I A; 1DY6 A; 1M40 A; 5GLC A; 1MWU A; 2ZJ9 A; 4BJP A; 5HAP A; 3NOP C; 1S6R A; 1DJA A; 1S1Z A; 5FDH A; 2J8Y A; 1NWZ A; 3MFD A; 3M6B A; 3FPV A; 2FFY A; 3T50 A; 2J9P A; 4UAA A; 3VMA A; 2EFU A; 4LFU A; 5F69 A; 1FOF A; 5EVE A; 4K0X A; 2R78 A; 3S7P A; 4NKP A; 1XGI A; 3MR0 A; 5HDC A; 4D2O A; 4GCZ A; 5GHX A; 3E4Q A; 1SZV A; 1YKD A; 1XJ2 A; 1G6O A; 4C75 A; 2JKF A; 4S2J A; 1DJB A; 3DTE A; 2OV5 A; 4JKT A; 1PZO A; 2VK3 A; 2RCX A; 5AQ9 A; 3E98 A; 3HL9 A; 4OQI A; 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