The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
|
sequence length |
96
|
structure length |
96
|
Chain Sequence |
METAIITLSKDGRITEWNKKAEQLFGLKKENVLGRRLKDLPDFEEIGSVAESVFENKEPVFLNFYKFGERYFNIRFSPFRNAKTQLLEGVIITIDD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of PAS-linked histidine kinase and the response regulator complex
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Sensor protein
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Thermotoga maritima
|
| total genus |
27
|
| structure length |
96
|
| sequence length |
96
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.13.3: Histidine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-03-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Beta-Lactamase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2VV7 A; 3VE3 A; 3HJI A; 1Y28 A; 3LIB A; 1XJ4 A; 2QKP A; 3UB9 A; 4HP9 A; 5DKL A; 1S4R A; 4KQD A; 3CLO A; 5DKK A; 4NXE A; 3A0V A; 2KX6 A; 2W0N A; 2EA9 A; 3NHQ A; 4LPZ A; 4EXO A; 4EES A; 1XFQ A; 2QJ7 A; 3E4O A; 3A0R A; 1T1B A; 4HJ4 A; 4RQ9 A; 5HDD A; 1ODV A; 3GDI A; 4XT2 A; 4NXG A; 4BBV A; 3FC7 A; 4JGO A; 1GSX A; 2P7J A; 2R78 A; 4JGR A; 3KX0 X; 2K7S A; 1S67 L; 2I9V A; 3UE6 A; 2VV8 A; 5TBM A; 1LSW A; 2PHY A; 1UWP X; 4HIA A; 2WKP A; 1N9L A; 2GJ3 A; 3CWF A; 4JGQ A; 1S66 L; 5G4Y A; 2L1M A; 3NJA A; 3ZQ5 A; 3UB8 A; 3FG8 A; 1OTA A; 1T19 A; 2VEA A; 2QJ5 A; 3LYX A; 1EW0 A; 1XFN A; 5HD3 A; 2OWJ A; 2PD7 A; 1XJ3 A; 3VE4 A; 1X0O A; 4K08 A; 4HJ6 A; 2INW A; 3MFX A; 2QWS A; 3MJQ A; 4H6J B; 4WF0 A; 5F6A A; 4I3A A; 3VOL A; 1TS0 A; 5J4E A; 4I3J A; 4R3A A; 4GHI A; 5IS1 A; 1P97 A; 3C2W A; 3PYP A; 3BY8 A; 2JN7 A; 2YKH A; 1WA9 A; 4EER A; 1OTE A; 4NXF A; 2WKQ A; 4GS9 B; 2V9A A; 3MR0 A; 3H82 B; 5HSQ A; 1OT6 A; 1DP6 A; 2OWH A; 1T18 A; 2V0U A; 3LUQ A; 4LRX C; 4PKY A; 2A24 B; 4LRZ E; 1T1C A; 3B33 A; 4F3L A; 3IS2 B; 3F1P A; 2W27 A; 4HNB A; 4EQ1 A; 4E04 A; 3OLO A; 1D06 A; 2WKR A; 2PR5 A; 4B9O A; 1DP9 A; 1KOU A; 4HOI A; 3NOP C; 3EWK A; 4EEP A; 1DP8 A; 2D02 A; 3E4P A; 3CAX A; 5F5Y A; 2L0W A; 3UME A; 3P7N A; 5G4Z A; 1DRM A; 5EFW A; 1TS8 A; 4R38 A; 1UWN X; 1S1Y A; 5J3W A; 1MZU A; 1LT0 A; 4R6L A; 4HH2 A; 4HQA A; 1T1A A; 5DJU A; 2PR6 A; 4DJ2 A; 5AVE A; 5HDS A; 3T50 A; 4XT2 B; 3F1O A; 5AVF A; 1OTB A; 3RH8 B; 2V1B A; 2Z6D A; 3SW1 A; 1P0Z A; 4LLO B; 4BBU A; 5J7E A; 1OTD A; 3LID A; 3IBR A; 1D7E A; 3F1N A; 4HHD A; 5HDC A; 2JHE A; 1NWZ A; 5KIZ A; 5TBM B; 3HJK A; 2VV6 A; 3H7W A; 3C8C A; 3ULF A; 4DJ3 A; 2L4R A; 3MQQ A; 4L9F A; 4HP4 A; 4I39 A; 3UB6 A; 3RTY A; 1OT9 A; 1F9I A; 2H28 A; 4HH3 A; 2HV1 A; 5HWW A; 2OOL A; 2Z6C A; 2YKF A; 4EEU A; 4WLA A; 5IU1 A; 3NOU C; 4LRY C; 3D72 A; 2PDR A; 4L9G A; 1G28 A; 3G6O A; 1S1Z A; 4WUJ A; 4EW7 A; 5F69 A; 4I3I A; 4GHI B; 1GSV A; 1LSV A; 1XJ6 A; 1JNU A; 1OTI A; 2ZBB A; 3K3C A; 4GW9 A; 3GEC A; 3A0S A; 2ZOI A; 3MXQ A; 3LI8 A; 4F3L B; 4HJ3 A; 3F1P B; 1LL8 A; 2B02 A; 1GSW A; 3ICY A; 4NXB A; 4MN5 A; 3LI9 A; 3LIE A; 1N9O A; 1V9Z A; 4GCZ A; 2D01 A; 2V0W A; 4KUO A; 4M4X A; 3NOT C; 4KUK A; 3H9W A; 4HI4 A; 2J80 A; 3BWL A; 3UB7 A; 5I5L A; 1XJ2 A; 3LIC A; 1TS6 A; 2V1A A; 1UGU A; 4H6J A; 5DJT A; 3PHY A; 4WL9 A; 2VLG A; 5HWT A; 3BY9 A; 5F68 A; 4I5S A; 5HD5 A; 4L9E A; 2PD8 A; 3F1O B; 3E4Q A; 3EEH A; 4PKY G; 2BAS A; 2QHK A; 1LSX A; 4MN6 A; 5HZH A; 2ZOH A; 2PYR A; 4YWZ A; 3LIA A; 2KDK A; 1N9N A; 4GS9 A; 1OJG A; 4HY8 A; 3F1N B; 4EET B; 5A8B A; 5HWV A; 1BYW A; 3H82 A; 4WN5 A; 1OJ5 A; 3MQO A; 4R70 A; 4I38 A; 2A24 A; 3LIF A; 1TS7 A; 4BBT A; 1V9Y A; 3H7W B; 3IS2 A; 1VB6 A; 3UMD A; 2PYP A; 4JGP A; 2CMN A; 1F98 A; 3K3D A; 2M1C A; 1S4S A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4DDY A; 2PU2 A; 3LIB A; 1ONG A; 1XJ4 A; 4X56 A; 3S7P A; 4GB7 A; 4KQD A; 4IJG A; 5DKK A; 1G5U A; 1MWU A; 4KZ8 A; 4OPY A; 3IXH A; 2Y4A A; 4XXR A; 3E4O A; 4P6Z M; 3ITA A; 4X1L A; 3BLM A; 4R1G A; 5BOH A; 5AQ9 A; 5F82 A; 3ZHH A; 4MBF A; 4MDZ A; 5A92 A; 4E3N A; 4XT2 A; 1K25 A; 4ESP A; 3IXB A; 4BBV A; 3FC7 A; 2IWB A; 3IQA A; 4JGO A; 4O8G A; 1GSX A; 1K54 A; 4DE3 A; 2R78 A; 5FEG A; 1LI0 A; 2QZ6 A; 3KX0 X; 1S67 L; 1O7E A; 1CEF A; 5FAQ A; 4ID4 A; 3PTE A; 2O9C A; 2VV8 A; 5EVI B; 1NZO A; 3IF5 A; 3ZG8 B; 1LSW A; 1ZTU A; 4HIA A; 4ZAM A; 4NK3 A; 2DMW A; 2ZQC A; 4Y13 A; 4GN2 A; 1TDG A; 1PFL A; 2LB9 A; 4EBL A; 1S66 L; 4CLC C; 4BLM A; 3MZE A; 3R4K A; 4BL3 A; 3UB8 A; 2ZC4 B; 3KO6 A; 3FG8 A; 2FFY A; 1T19 A; 2W1T A; 2QJ5 A; 4B4Z A; 2O9B A; 4OH0 A; 1YLW A; 1XX2 A; 1I5Q A; 2H5S A; 1G68 A; 2WKI A; 4Y15 A; 2PD7 A; 4UA6 A; 4ZRR A; 1XJ3 A; 3A3I A; 4MEZ A; 2HDR A; 2X01 A; 3DTM A; 1VQQ A; 1X0O A; 3PBN A; 2QWS A; 4UAA A; 5F1G A; 4I3A A; 1ZG6 A; 1TS0 A; 2Z2L B; 1ES3 A; 2OSU A; 5IS1 A; 3UY6 A; 4UHU A; 4OON A; 1VHM A; 1L0D A; 1H0M A; 4DXC A; 1TDL A; 1F2K A; 1MY8 A; 5GLB A; 4WZ4 A; 4ZTK A; 4KZ5 A; 4OQG A; 1OT6 A; 1DP6 A; 1T18 A; 1WYB A; 4WYY A; 3LUQ A; 4LRX C; 3IT9 A; 2A24 B; 1T1C A; 3B33 A; 4F3L A; 4L0L A; 2W27 A; 1PI5 A; 4EQ1 A; 4X68 A; 3OLO A; 3S7Q A; 2WKR A; 4B9O A; 1XGI A; 5A93 A; 2C6W B; 1KOU A; 3OZH A; 3T4O A; 1GCE A; 3NC8 A; 3C7U A; 4X6T A; 5F1F A; 5G4Z A; 1LLB A; 4UA9 A; 2WYX A; 1TS8 A; 1UWN X; 5EVI D; 4D2O A; 5EOE A; 3NDG A; 1BLP A; 1JTD A; 4XUZ A; 4HES A; 4HH2 A; 5DFY A; 3KSG A; 4RYE A; 4LV0 A; 2XA7 S; 3LEQ A; 1DJC A; 1PYY A; 3LGO A; 4DE1 A; 4IED A; 3ZNT A; 3F1O A; 4BEN A; 2WKH A; 2VK3 A; 3NUL A; 5KSC A; 3BFD A; 4LLO B; 3T4Q A; 2Y8H A; 4PPR A; 3V3S A; 5J7E A; 1TF1 A; 3DTE A; 1ES4 A; 3F1N A; 3W4P A; 2V8F A; 4G3W A; 4EU0 A; 3V67 A; 1NWZ A; 1YLP A; 5KIZ A; 1IEL A; 5TBM B; 1CJF A; 2Y2M A; 3H7W A; 1IYQ A; 3ZYT A; 5CX7 A; 3C8C A; 3ULF A; 4L9F A; 4HBT A; 4I39 A; 2EXB A; 2JBF A; 1OT9 A; 3CZD A; 4S2I A; 4N92 A; 1NY0 A; 3V5M A; 2OV5 A; 2HDS A; 3IXG A; 4Y0O A; 4JXG A; 5HWW A; 3ZG5 A; 1BT5 A; 4EEU A; 1SHV A; 4FH2 A; 3T4J A; 1GA9 A; 4CLC A; 2ZL1 A; 1AXB A; 4CLC D; 3Q7Z A; 3O88 A; 2HZ5 A; 4EBP A; 5F69 A; 1YM1 A; 3WS2 A; 1KVM A; 1LSV A; 2XLN A; 4KZB A; 1NLZ A; 3OPR A; 3A3E A; 3M6B A; 4IUK A; 4MBH A; 1JNU A; 3DWZ A; 3K3C A; 1GA0 A; 2CC1 A; 1FSY A; 3HLB A; 2ZOI A; 3MXQ A; 3HLD A; 4BJP A; 3BFF A; 5CTM A; 4MMN A; 3PAG A; 4QWO A; 5HAQ A; 1Y54 A; 1GSW A; 4NXB A; 3MZF A; 5L2F A; 3IF6 B; 2NUP C; 4MBK A; 2R9X A; 4GCZ A; 1VET A; 2D01 A; 2ZQ8 A; 3CJM A; 4KUO A; 5M19 A; 1E3U D; 1SDE A; 1FR6 A; 1YAX A; 3NEC A; 3H9W A; 3HLC A; 3PBQ A; 4BQM A; 4ARZ B; 3UB7 A; 1RGY A; 5I5L A; 1MBL A; 4Y2F A; 1XJ2 A; 4JF4 A; 5M1A A; 1MWR A; 5HAI A; 2I72 A; 2QYB A; 1UGU A; 5U47 A; 5DVA A; 1H8Z A; 3BY9 A; 3CUE C; 4I5S A; 4N9K A; 4YOF A; 3QP8 A; 3DWK A; 4X25 A; 3MFD A; 3C7V A; 3EGD C; 1LSX A; 4P6B A; 2B18 A; 3GMW A; 3LEZ A; 4ME4 A; 1K4E A; 1S6R A; 4JXW A; 3H82 A; 4WN5 A; 1ONH A; 3EQV A; 3G4P A; 4KZ9 A; 3T1Q B; 3A3F A; 3N8R A; 1Z09 A; 3T4T A; 2HF6 A; 3IS2 A; 3UMD A; 1VB6 A; 2EFX A; 2PYP A; 4JGP A; 3WS4 A; 1K6R A; 2IWD A; 5D3O A; 4A5R A; 2HGV A; 1MKM A; 5HPF A; 5CER A; 2BG1 A; 3D3O A; 3HLF A; 1G6O A; 5CEC A; 2VV7 A; 2XD1 A; 3HJI A; 3LY3 A; 3DAV A; 2DCF A; 5CHJ A; 5GHX A; 4R3J A; 1N4O A; 3GSG A; 4NXE A; 4EWF A; 3DTI A; 1W7F A; 3A0V A; 1YMS A; 1NXY A; 1AWI A; 3FWL A; 3BW6 A; 4UA7 A; 2ZQ9 A; 4EXO A; 3G2Y A; 5E2E A; 4O0P A; 3A0R A; 1T1B A; 4HJ4 A; 4RQ9 A; 2JE5 A; 4YFM A; 1RGZ A; 1KE0 A; 2Y2K A; 2VGJ A; 3LR3 A; 2WZZ A; 3GDI A; 3FKW A; 4E6W A; 2P74 A; 2ZQ7 A; 4KZ4 A; 3D4F A; 3UPO A; 5EOO A; 2W3G A; 4NET A; 3CHW P; 3KYE A; 3ZFZ A; 2P7J A; 3Q81 A; 1PZO A; 4R4S A; 2VGK A; 1XPB A; 3LFV A; 2XDM A; 2ZC6 B; 2I9V A; 2KLI A; 4PM9 A; 3UE6 A; 1CI8 A; 1NLY A; 4LV3 A; 3ZVW A; 3BLS A; 2WKE A; 3C4O A; 4XUX A; 3Q7V A; 5AJG A; 4DXB A; 1HZO A; 3O3V A; 3ZGA B; 2G7U A; 3HL9 A; 3UB5 P; 3G31 A; 4KZ3 A; 1KGE A; 3MKE A; 1Z6F A; 1DJA A; 3ZQ5 A; 2XA7 M; 3IXD A; 1ERQ A; 2WZX A; 1OTA A; 3PBT A; 4CJN A; 3TOI A; 2XSS A; 2VEA A; 2O0Y A; 3LYX A; 3QNC A; 3SS4 A; 1BSG A; 4G3K A; 1BLH A; 3M2J A; 3TRC A; 2A3U A; 4X69 A; 3GVB A; 3ZG0 A; 1FIK A; 2ZC5 B; 2OWJ A; 2XEP A; 5HAR A; 2ZD8 A; 5HAP A; 3VE4 A; 2INW A; 4MLL A; 5EVI C; 4H6J B; 4WF0 A; 2ACG A; 3VOL A; 5CGS A; 4Y7P A; 5J4E A; 4I3J A; 2XD5 A; 4NEE D; 3UNW A; 3CI6 A; 4OPR A; 1PIO A; 3MF0 A; 1WA9 A; 1YSP A; 4NXF A; 1YLZ A; 2WKQ A; 2W3F A; 3MR0 A; 3OPH A; 1F5M A; 3E2K A; 3S1Y A; 3HRE A; 4GJ4 A; 4B93 A; 2OWH A; 2Q9M A; 2V0U A; 5CTN A; 3CUE A; 3IWQ A; 1CEG A; 3CPT B; 2XFS A; 1OME A; 2HDU A; 4PMA A; 3R7W B; 4C3Q A; 3DBA A; 1D06 A; 2Y2L A; 2C5W B; 3P01 A; 1J3W A; 2VA0 A; 4HOI A; 4EEP A; 1M40 A; 2D02 A; 3E4P A; 3QHY A; 3CAX A; 4Q0J A; 5F5Y A; 3WS1 A; 2H10 A; 3L7H A; 5EE8 A; 3UME A; 2Y59 A; 5FQI A; 2W3E A; 2J9P A; 5EFW A; 5A90 A; 3GRJ A; 4IBR A; 4RX3 A; 4R38 A; 3NIA A; 5EV0 A; 5DF7 A; 4P85 A; 1MWS A; 4R6L A; 3HCY A; 1PZP A; 4ZJ3 A; 2JKT M; 1NZU A; 1T1A A; 3HLE A; 1L2S A; 4DJ2 A; 5AVE A; 5HDS A; 5EM0 A; 5AVF A; 1OTB A; 2V1B A; 3SW1 A; 2ZQA A; 1K0K A; 2PU4 A; 2EX8 A; 4N1H A; 3SS5 A; 3T4S A; 1D7E A; 2O9A A; 4HHD A; 5KMW A; 5HDC A; 3RJU A; 5FQQ A; 5CGX A; 4LV1 A; 2J9O A; 3HJK A; 3T1R A; 3MQ0 A; 1K38 A; 5CHU A; 1K55 C; 1BZA A; 1RP5 A; 4OQ0 A; 4ZJ1 A; 2OAQ 1; 3FZC A; 4KG6 A; 3MQQ A; 3O5Y A; 4E6X A; 3KYZ A; 3JVV A; 2VZW A; 4HP4 A; 3UB6 A; 3RTY A; 3CIT A; 4U3T A; 4S2L A; 4HH3 A; 5IT5 A; 5JYP A; 5G18 A; 2EX9 A; 2GX5 A; 3PAE A; 5EEC A; 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4PM5 A; 2Q9N A; 1H8M A; 1L0E A; 2ZC7 A; 1Y28 A; 3QP2 A; 2FFF B; 2HDQ A; 4WM9 A; 3UB9 A; 4HP9 A; 4ZJ2 A; 4QPR A; 5GLC A; 2GNX A; 1FOF A; 5DKL A; 1KE3 A; 2PRF A; 1IOU A; 2V8C A; 4Q0I A; 4OLG A; 1NYM A; 1K57 A; 3EQU A; 3ITB A; 4YNR A; 2EA9 A; 1K55 A; 5K5B A; 1GHM A; 4LPZ A; 4EES A; 4LV2 A; 2QJ7 A; 2ZMV A; 4E3L A; 4RA7 A; 5FDH A; 1YPR A; 3KSI A; 1W63 Q; 1YLJ A; 4Y17 A; 1CK3 A; 2ZQD A; 1ODV A; 2X71 A; 3UE0 A; 3VOZ A; 2FZ0 A; 4NXG A; 2VGL S; 1DJB A; 4U0T A; 3E2L A; 4WBG A; 5C5K A; 1E3U A; 2VX8 A; 4QU3 A; 3PR6 A; 4JGR A; 2K7S A; 3HLG A; 5HFO A; 3K2N A; 4ZBE A; 3QP5 A; 3VP0 A; 4EBN A; 5TBM A; 4DMZ A; 4JXS A; 5EM1 A; 4IVI A; 5DTT A; 2WKP A; 3FPV A; 1N9L A; 2GJ3 A; 3N7W A; 4JXV A; 3CMZ A; 1IFQ A; 2Y2N A; 2L1M A; 4QJG A; 4S2M A; 3V3R A; 4S2P A; 3G32 A; 1FR1 A; 4AFI A; 3S7N A; 4EUZ A; 3OPP A; 1KGF A; 1EW0 A; 1XGJ A; 2PBY A; 2ZM2 A; 1C3B A; 2W3D A; 2Y2G A; 3IX8 A; 5GLD A; 4PM7 A; 4OP5 A; 1ZG4 A; 4E3K A; 4GD8 A; 4K08 A; 4QY5 A; 3MFX A; 4FUW A; 2XR0 A; 3HVF A; 3ZVT A; 3A3J A; 1VEU B; 3FPW A; 2IWC A; 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