The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
39
|
sequence length |
125
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structure length |
125
|
Chain Sequence |
SWQAYTDNLIGTGKVDKAVIYSRAGDAVWATSGGLSLQPNEIGEIVQGFDNPAGLQSNGLHIQGQKFMLLRADDRSIYGRHDAEGVVCVRTKQTVIIAHYPPTVQAGEATKIVEQLADYLIGVQY
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Actin-binding protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| publication title |
Structure determination and characterization of Saccharomyces cerevisiae profilin
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PROFILIN
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| total genus |
39
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| structure length |
125
|
| sequence length |
125
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-06-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1J3W A; 2JKG A; 2V8C A; 3DAV A; 2PRF A; 1D1J A; 4FUW A; 1AWI A; 1PNE A; 2E8J A; 1FIK A; 3LGO A; 1VET A; 2BTF P; 3UB5 P; 4QWO A; 3NEC A; 4FTX A; 2ZL1 A; 1SKO A; 2ACG A; 1VEU A; 5EVE A; 1F2K A; 3L7H A; 3LEQ A; 3MS6 A; 3CPT A; 1VET B; 5EM0 A; 2JKF A; 2ZL1 B; 1SKO B; 1A0K A; 1SZV A; 3T12 B; 5FEG A; 1VEU B; 3NUL A; 1CQA A; 5FEF A; 3U4L P; 5EV0 A; 1CJF A; 1FIL A; 5FDS A; 1K0K A; 1ACF A; 4ESP A; 2V8F A; 3MSH A; 3T1S A; 4X1L A; 2PAV P; 3L9K A; 5EM1 A; 1PFL A; 1Z09 A; 1YPR A; 1G5U A; 1PRQ A; 4X1M A; 3KYE A; 2HZ5 A; 3D9Y A; 1Y4O A; 3CPT B; 3T1R A; 3CHW P; 1HLU P; 1CF0 A; 2B95 A; 4X25 A; 3T1Q B; 2VK3 A; 3T1X A; 4D60 A; 2PBD P; #chains in the Genus database with same CATH topology 1J3W A; 3BM6 A; 3V3R A; 1YLT A; 1ZHH B; 3SOI A; 3Q7V B; 1MC0 A; 2CC1 A; 5F68 A; 4P6Z S; 2P9V B; 2ZC3 B; 1H5X A; 5HSQ A; 4ETX A; 3ULF A; 1XJ3 A; 4X68 A; 4PM8 A; 3IX8 A; 5GHY A; 3EEA A; 4R3A A; 3RJU A; 3SW1 A; 2X02 A; 2L1M A; 1NRJ A; 1DJB A; 4L9G A; 2JKR I; 1DP6 A; 1KVL A; 5TR7 A; 4N1X A; 4GHI B; 4S2L A; 1V9Z A; 4BBU A; 3LIC A; 3VSK A; 3GEC A; 5TGF A; 3NC8 A; 1T19 A; 4YIN A; 3LIA A; 3NJA A; 4KZ8 A; 1S4R A; 3SS4 A; 2V20 A; 1K0K A; 3LY3 A; 4XUZ A; 3IXB A; 1BZA A; 5CHJ A; 2PAV P; 3BFC A; 5DTS A; 3UDF A; 4KG2 A; 2K7S A; 1P0Z A; 2GNX A; 1KGE A; 3MZE A; 1LHY A; 1LI0 A; 1P9R A; 4G3V A; 3KSH A; 3F1O A; 4GNU A; 1T18 A; 3Q82 A; 3PBQ A; 2RCX A; 2PDR A; 2ZM0 A; 1H3Q A; 4HY8 A; 1OTE A; 4GDN A; 3LR3 A; 1OT9 A; 3H7W B; 1KGF A; 4WMC D; 2W3D A; 3IBJ A; 2O0Y A; 4Y2F A; 1YLW A; 1L0G A; 1I2S A; 2GDN A; 1K56 D; 1XXM A; 3G4P A; 3LUQ A; 4QU3 A; 1XA1 A; 3VFH A; 3VSL A; 3NDE A; 1UWN X; 2R78 A; 4QY5 A; 4M4X A; 3A3D A; 5DTT A; 1NZU A; 5FQQ A; 1N4O A; 3MZD A; 4EQI A; 3ITB A; 4DKI A; 3K3C A; 5FI2 A; 5FL3 A; 4ZDX A; 3BY9 A; 2EXB A; 3M6B A; 3HLE A; 1OJ5 A; 2ZQD A; 3T50 A; 4BD0 A; 3HBR A; 2O9C A; 5J7E A; 3NOT C; 1SDN A; 2Y2G A; 1RGZ A; 3CPT A; 4R4S A; 5AQ9 A; 4PM5 A; 2BG1 A; 3MQQ A; 3A3J A; 3QNC A; 1OME A; 2Y2K A; 5CER A; 3EQU A; 3C4P A; 4LCL A; 1DJA A; 4FSF A; 5EV0 A; 2WAE A; 1Q2P A; 4EEU A; 3VP3 A; 2JE5 A; 4S2J A; 1IFQ A; 2ZMV A; 5MC7 A; 1NXY A; 2VEA A; 1PW1 A; 2EX6 A; 2YKF A; 3OOV A; 1PZP A; 1PFL A; 4JF6 A; 3O86 A; 4WUJ A; 4ETZ A; 3WS0 A; 1XJ4 A; 2J3T D; 2ZC7 A; 1AXB A; 5GHZ A; 2OLU A; 2A24 B; 2OV5 A; 3BLM A; 4PKY G; 3OC2 A; 4JLF A; 3ZNT A; 4JPM A; 1TDG A; 1L3L A; 4C75 A; 2QWS A; 4EBL A; 4FOF A; 3G32 A; 4B88 A; 3OLO A; 1K55 A; 3C4O A; 3TW8 A; 4YFM A; 4UQI S; 5HPI A; 2IWC A; 5FQ9 A; 3V3S A; 1H8Z A; 3IBR A; 3CUE C; 4R0Q A; 3LGO A; 5DVA A; 1H8M A; 4X6T A; 3BFF A; 1KVM A; 4FTX A; 2JBF A; 3LI9 A; 4PPR A; 4N9L A; 4CLC A; 2HDU A; 1DY6 A; 2R9W A; 4UA9 A; 3NOU C; 2KDK A; 4CLC C; 4K0X A; 3S7P A; 4FCF A; 3LCE A; 2ZL1 B; 1PYY A; 2M7U A; 1I2W A; 4ZAM A; 5KMW A; 2ZC6 B; 4Q8I A; 1LLB A; 1CQA A; 1XJ2 A; 4QY6 A; 2ZM2 A; 2ZBB A; 2XH9 A; 4WL9 A; 4KZA A; 1NY0 A; 2P08 A; 4X55 A; 1JTD A; 3UN7 A; 1XGI A; 3KYZ A; 2P9V A; 2QHK A; 2GJ3 A; 1W79 A; 4KQQ A; 4PKY A; 3OPH A; 4HJ4 A; 2P74 A; 5EM1 A; 4NXB A; 2H10 A; 4ZJ1 A; 1MBL A; 2PYP A; 1CEG A; 3IS2 B; 1L2S A; 2PD7 A; 3H9W A; 1PI5 A; 3P01 A; 1FR6 A; 1K57 A; 1ALQ A; 4JGQ A; 1BUL A; 1VB6 A; 5HL1 A; 2VGL S; 3HL9 A; 3MQO A; 1N9N A; 5C5K A; 5AQB A; 3EGX C; 5E2H A; 2W3H A; 2MJ6 A; 1ZG6 A; 1F5M A; 2OAP 1; 4R23 A; 2HP9 A; 3TRC A; 2XSS A; 5E2G A; 1JNU A; 2B5R A; 1K54 A; 2B18 A; 1G6O A; 1AWI A; 1FOF A; 4DRT A; 4I3I A; 3MKE A; 3P98 A; 3W2Z A; 1K54 C; 4DE2 A; 1OTA A; 4ZTK A; 3RXW A; 4DDS A; 1CI9 A; 3Q81 A; 1SKO A; 1V9Y A; 4O0P A; 2EX2 A; 2Z2L B; 3IWO A; 5EVE A; 3VV4 A; 1TVF A; 3FZC A; 1MWS A; 1FCM A; 2AVX A; 4QD4 A; 3HLF A; 1YKD A; 2WGI A; 1L0F A; 3DTM A; 2W0N A; 4JXW A; 3HUO A; 5FEG A; 3IX4 A; 4DE3 A; 4I3A A; 4ARZ B; 5KSC A; 2DRW A; 2EFX A; 4JXG A; 2OWJ A; 2ZLY A; 1FSY A; 3IF6 B; 4BEN A; 2V8F A; 3T1S A; 2J80 A; 1GCE A; 2WKE A; 4HH2 A; 2P04 A; 1Y28 A; 1BUE A; 1LT0 A; 3PYP A; 3W4Q A; 3QP6 A; 1TS0 A; 4UAA A; 2Y2Q A; 4X1M A; 4BJP A; 3GR2 A; 4KZ4 A; 4HBT A; 5F69 A; 2K31 A; 4EUV A; 1NLY A; 5DFY A; 3FKV A; 4HJ3 A; 3WRT A; 1KDW A; 4MMN A; 5A91 A; 1P97 A; 2WAD A; 2ZQ7 A; 4HEF A; 4NXF A; 3VE3 A; 5CGW A; 3G35 A; 4IBR A; 3DBA A; 4I5S A; 4MN7 A; 4DF6 A; 1O7E A; 2JKR M; 2Y2P A; 5CGS A; 3GTC A; 4JKT A; 3IF5 A; 3VP1 A; 4E3N A; 3VMA A; 4OPQ A; 4C6Y A; 5HDD A; 3FKW A; 3HLG A; 3UE3 A; 4ID4 A; 2KX6 A; 4WMC A; 5L2F A; 3F1P B; 3S7N A; 5AVF A; 2WAF A; 3IWQ A; 3QP2 A; 5HFO A; 3B33 A; 1IYP A; 1K56 A; 2DMW A; 2K2N A; 3S4X A; 3SH8 A; 3G31 A; 3O88 A; 1ES2 A; 2JKF A; 2WGV A; 3GMW A; 3JVV A; 3HRE A; 3T12 B; 3E2L A; 2B02 A; 3BJN A; 3HJK A; 2J3W A; 4MDZ A; 2WZZ A; 3ZG5 A; 2ZQA A; 1K4F A; 1NYY A; 1PWD A; 3IXG A; 3QP1 A; 2IWB A; 4JXS A; 4B4X A; 1GHI A; 5HD5 A; 5A92 A; 4PM6 A; 4F94 A; 1N9O A; 1QME A; 5HPF A; 1K38 A; 1G5U A; 1PRQ A; 3T4J A; 2X71 A; 1ODV A; 3T4L A; 3CHW P; 4GS9 B; 3WS4 A; 2A2L A; 1ZTU A; 4OPY A; 2V1Z A; 1TEM A; 5CXW A; 4GB7 A; 3JYI A; 5I94 A; 2INW A; 5G18 A; 2PRF A; 2H0Y A; 5DF7 A; 3JPU A; 1G68 A; 1MKM A; 4WF0 A; 3LI8 A; 1FIK A; 1GHP A; 4BBT A; 2V9A A; 3NEC A; 3D72 A; 1IEM A; 2XD5 A; 4DN0 A; 3IS2 A; 2J7V A; 5FAS A; 3ZHH A; 1MWU A; 4RQ9 A; 3C30 A; 3IQA A; 3LEQ A; 2EX8 A; 4HHD A; 5GLB A; 1XGJ A; 4S2K A; 4NXE A; 3DWZ A; 3H82 B; 2UWX A; 3N6I A; 3VP2 A; 1VEU B; 1LL5 A; 3LIB A; 1YSP A; 3RTY A; 1K25 A; 3C7V A; 2H5S A; 3DWK A; 2OWH A; 4OPR A; 3IT9 A; 3E2K A; 3ZQ5 A; 4EBN A; 2HP5 A; 4CPK A; 3CG5 A; 1MXO A; 4GDB A; 1YLP A; 2V1B A; 4NK3 A; 4MBK A; 3HCY A; 2ZOH A; 1IKG A; 4MLL A; 5DTK A; 4PMA A; 4EV4 A; 4HI4 A; 3D9Y A; 4XUX A; 5FQI A; 4OQH A; 2P7J A; 1TS6 A; 4R6L A; 2Y55 A; 3B3X A; 1U60 A; 2WKI A; 2W3G A; 4PM7 A; 4WEL A; 1NWZ A; 4QHC A; 4D60 A; 4WYY A; 5JYP A; 2JCH A; 5TBM A; 2HF6 A; 4OKP A; 1TS7 A; 3TSG A; 4RVA A; 1SDE A; 2O9B A; 2PR6 A; 3IF6 A; 4D2O A; 2UV0 E; 3IHA A; 4NEE D; 4HIA A; 2E8J A; 2J8Y A; 3N8S A; 4IUK A; 1VET A; 2JKT I; 2ZM8 A; 2JHE A; 2QMI A; 4R3B A; 4WEJ A; 3LIF A; 3WWX A; 3HUN A; 3IX3 A; 3M6H A; 3HVF A; 3G30 A; 4DXB A; 2D02 A; 2C5W B; 3QNB A; 2FFY A; 5L8M A; 4GW9 A; 2HPB A; 4S2I A; 2ZQC A; 1S1Y A; 2ZD8 A; 5M18 A; 3F1N B; 2W1T A; 2Q0O A; 3ZDJ A; 5EFW A; 2Y4A A; 2A49 A; 2OSU A; 5M1A A; 1XJ6 A; 1CJF A; 4H6J B; 3WS2 A; 4UHU A; 1IEL A; 2I9V A; 1E3U D; 4HP4 A; 2EXA A; 4OQG A; 3C38 A; 2FH5 A; 4WLA A; 2OLV A; 2LB9 A; 3UO9 A; 3LFV A; 1NRF A; 2G2W A; 5TFQ A; 3OCN A; 2VZW A; 2WKQ A; 3O3V A; 4IVK A; 3PXP A; 4BLM A; 3C8C A; 2XEP A; 3VOL A; 5L09 A; 3MFD A; 3VP0 A; 3S22 A; 2FZ0 A; 4G3K A; 3HLB A; 1S6R A; 4ZBE A; 5F5Y A; 4KZ3 A; 3R4K A; 2A3U A; 4PM9 A; 5EVI A; 1MY8 A; 4OOL A; 1S4S A; 4O01 A; 4CQH A; 2Y2M A; 2WGW B; 4LRY C; 1CK3 A; 1YT4 A; 4QJG A; 4B9O A; 3QP8 A; 4CLC E; 5AQA A; 3ZYT A; 4KUK A; 3A0V A; 2EWW A; 1MPL A; 3G2Y A; 3AGD A; 1K55 C; 2XFS A; 3PBS A; 1Q2Q A; 4GS9 A; 4Y0U A; 1RGY A; 2O9A A; 2Y8H A; 4WZ4 A; 3NUL A; 5I5L A; 5HW3 A; 2XD1 A; 1N9B A; 4OH0 A; 3UDI A; 5KZH A; 1FQG A; 2HJE A; 1FCO A; 4IJG A; 2DCF A; 3TE8 A; 3SZT A; 2ZC4 B; 3R7W A; 4F3L B; 2Q9M A; 5IU1 A; 1YPR A; 1IYQ A; 2Y59 A; 3PBO A; 4S2N A; 3E4Q A; 4LRZ E; 3LO7 A; 2J9P A; 3LEZ A; 3KO6 A; 3N4I A; 3Q7V A; 3PBT A; 1BLC A; 4KQO A; 2B95 A; 3CIT A; 4X25 A; 3H82 A; 5J3W A; 3D3O A; 3OCL A; 4LV2 A; 3A0S A; 1X0O A; 3Q1F A; 2ZMF A; 3IXD A; 3T4Q A; 4KUO A; 2ZJ9 A; 2Y2H A; 3C5A A; 3WRZ A; 3MF0 A; 2QYB A; 5CX7 A; 2VX8 A; 3UPN A; 1HVB A; 5HAR A; 3ZG7 B; 1ONG A; 4DDY A; 1YAX A; 1JTG A; 3FPW A; 1TS8 A; 1K57 C; 2VV7 A; 5DF9 A; 4OPZ A; 4GHI A; 4EBP A; 3FC7 A; 3ZCZ A; 3FYZ A; 4DJ3 A; 5F1G A; 2W3E A; 1BLH A; 5CRF A; 3AGF A; 3MFX A; 5DKK A; 4O7D A; 1IKI A; 1H0M A; 1NJ4 A; 1OJG A; 2QPN A; 3CLO A; 1BT5 A; 5HZH A; 3MBZ A; 1LSX A; 4MCW A; 1GHM A; 4EW7 A; 5GHX A; 2NUP C; 5BOH A; 5HX9 A; 3NOP C; 2VV8 A; 3EQV A; 4QPR A; 1ACF A; 5HD3 A; 4Y0O A; 3LR4 A; 5FA7 A; 5DKL A; 2XRO A; 3L9K A; 4EWF A; 3NI9 A; 5FQJ A; 3WS5 A; 4X69 A; 1LSW A; 4WN5 A; 5HWT A; 3H7W A; 2PT7 A; 1EW0 A; 4NXG A; 3BY8 A; 3T4T A; 4OLG A; 3RFB A; 3N7W A; 5CHU A; 4HNB A; 4IBX A; 1CI8 A; 3RH8 B; 4OLD A; 1PIO A; 2Z6C A; 4IED A; 5CEB A; 4BBV A; 3OPR A; 3O87 A; 1IYO A; 4S2M A; 3F1O B; 3HLD A; 2V0U A; 4H8R A; 3BFD A; 5CED A; 4OQI A; 3EWK A; 3LYX A; 4CJN A; 1D1J A; 4JBF A; 4FUW A; 4LCM A; 4KZ9 A; 5A90 A; 2PU4 A; 4LLO B; 1ERQ A; 1STZ A; 2HV1 A; 1BLP A; 3IH9 A; 3UPO A; 4S2P A; 3GVB A; 5FAO A; 4GD6 A; 4EUZ A; 1G6A A; 3LR0 A; 3ZVT A; 1KGG A; 2ACG A; 5AJG A; 4LEN A; 4KG5 A; 1ES4 A; 5EE8 A; 1P9W A; 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5HDC A; 2QJ7 A; 3VOY A; 3CWF A; 1YM1 A; 5F83 A; 1W63 M; 2J3T C; 4GJ4 A; 5FI6 A; 5LBR A; 3UY6 A; 4MNR A; 1CEF A; 1XFN A; 5CHM A; 1VQQ A; 4DJ2 A; 3P09 A; 3EEH A; 3EOI A; 3TOI A; 2VGK A; 4BD1 A; 1UGU A; 2WKP A; 3SS3 A; 3OPP A; 4RA7 A; 4EET B; 1M40 A; 5GLD A; 2PD8 A; 2WKR A; 1Y4O A; 2BLS A; 3W4O A; 4X56 A; 1S67 L; 2Z2M B; 3NHQ A; 5IHV A; 1IYS A; 3BYD A; 2VK3 A; 2Y79 A; 2PBD P; 3ZFZ A; 3M2J A; 2JKG A; 1OPX A; 2V8C A; 3DAV A; 2XR0 A; 4R70 A; 3GSG A; 3IHB A; 3MKF A; 1L0D A; 4XT2 B; 2VA0 A; 3K2N A; 3GQZ A; 5CTN A; 3Q7Z A; 2WYX A; 4MN6 A; 4PHT A; 4ZJ3 A; 3U2A A; 4GLQ A; 1SHV A; 3S7Q A; 1EI5 A; 1HTZ A; 4R38 A; 2NUT C; 3E4P A; 3W4P A; 1NYM A; 5DJU A; 4ARZ A; 5CGX A; 4E3M A; 2J9O A; 3MXR A; 3N8R A; 1D7E A; 2ZQ8 A; 4GN2 A; 3B47 A; 1ZKJ A; 3MR0 A; 2HDR A; 3V50 A; 4FH2 A; 1SKO B; 3IF6 C; 4K08 A; 2LB5 A; 4DE0 A; 2VJW A; 1YLY A; 2EWV A; 4ZJ2 A; 4LPZ A; 1FIL A; 4M3K A; 4S2O A; 4K0W A; 2XF3 A; 2OOL A; 2PHY A; 5EOE A; 1PZO A; 3V5M A; 2Q9N A; 4ESP A; 4E3J A; 3PHY A; 4UEY A; 2L0W A; 1HZO A; 4HP9 A; 4Y7P A; 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