The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
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sequence length |
139
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structure length |
139
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Chain Sequence |
b'AGWNAYIDNLMADGTCQDAAIVGYKDSPSVWAAVPGKTFVNITPAEVGILVGKDRSSFFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQDGEFTMDLRTKSTGGAPTFNITVTMTAKTLVLLMGKEGVHGGMINKKCYEMASHLRRSQY'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The structure of an open state of beta-actin at 2.65 A resolution.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
BETA-ACTIN
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| molecule tags |
Complex (acetylation/actin-binding)
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| total genus |
44
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| structure length |
139
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| sequence length |
139
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-05-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| P | PF00235 | Profilin | Profilin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SZV A; 1VET B; 2PBD P; 2ZL1 A; 5EV0 A; 1VET A; 1D1J A; 1SKO B; 3D9Y A; 3CPT B; 1Y4O A; 1F2K A; 3MSH A; 3LGO A; 2JKF A; 1SKO A; 1VEU B; 1PNE A; 5FEG A; 3CPT A; 5EM0 A; 4FUW A; 1FIK A; 1PRQ A; 3UB5 P; 5FDS A; 3LEQ A; 2VK3 A; 1AWI A; 2PAV P; 1G5U A; 4ESP A; 3T1X A; 1HLU P; 1J3W A; 1YPR A; 3L9K A; 5EM1 A; 5FEF A; 3NUL A; 1PFL A; 4FTX A; 3DAV A; 3MS6 A; 3T1S A; 3T1Q B; 3NEC A; 4X25 A; 3L7H A; 1VEU A; 3KYE A; 2ACG A; 3T1R A; 2B95 A; 1Z09 A; 1A0K A; 1ACF A; 2JKG A; 2HZ5 A; 5EVE A; 1CJF A; 4X1M A; 4D60 A; 2BTF P; 3T12 B; 1CF0 A; 2V8F A; 1CQA A; 1K0K A; 4X1L A; 1FIL A; 2PRF A; 2V8C A; 4QWO A; 3CHW P; 2E8J A; 3U4L P; 2ZL1 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3K3D A; 4X69 A; 5A8B A; 4LRZ E; 5CHM A; 4S2N A; 2NUP C; 2QMI A; 3T4K A; 1PW1 A; 2J9O A; 4YIN A; 4ZBE A; 2H5S A; 1CEG A; 3QHY A; 1M40 A; 3CPT B; 2ZOH A; 2DCF A; 3PBO A; 1IKI A; 3PYP A; 5AQ9 A; 3T4S A; 5FEG A; 1K56 A; 1NLY A; 2HDU A; 1KGE A; 2EX9 A; 2ZBB A; 1K4F A; 1H0M A; 2J80 A; 2V0U A; 4GJ4 A; 3TSG A; 3W4O A; 3T1X A; 1K57 C; 1K55 C; 3C2W A; 3QP4 A; 2VV7 A; 1H8M A; 4P6B A; 2Y2I A; 2XFT A; 4L9F A; 4QY6 A; 2OV5 A; 4OPZ A; 3NEC A; 4OPQ A; 5EVI B; 4KEN B; 3W2Z A; 2V9A A; 3WS4 A; 3S4X A; 1IEL A; 1YMS A; 2EXA A; 3N8R A; 3BFD A; 4CLC C; 3IWI A; 4DMZ A; 4MDZ A; 1OJG A; 3NOT C; 1Z09 A; 3MR0 A; 1P97 A; 3OC2 A; 4Q8I A; 3A3F A; 1MWR A; 2Z2L B; 1LHY A; 3R4K A; 1P0Z A; 5FI2 A; 2XDM A; 1N9L A; 3RH8 B; 2Y8H A; 1CQA A; 3MXR A; 3DWK A; 3FYZ A; 3MBZ A; 2H28 A; 4UQI M; 2JBF A; 4KZB A; 4PPR A; 2Y2N A; 3HBR A; 1XFQ A; 4ETX A; 4OP8 A; 3Q1F A; 2VEA A; 1SDN A; 4ETZ A; 3PBT A; 1K6S A; 3KYQ A; 4IVK A; 1K55 A; 1XXM A; 3LUQ A; 2Z6D A; 5GLA A; 4WEJ A; 3U2A A; 5TBM B; 5A93 A; 1EW0 A; 5GHX A; 3NI9 A; 4QY5 A; 1LI9 A; 4OH0 A; 2O9C A; 5TFQ A; 3QP8 A; 4MCW A; 2QPN A; 5BOH A; 2WAE A; 1BT5 A; 1YQS A; 4CQH A; 4FSF A; 1LL8 A; 3BEB A; 3ZVW A; 4KZ5 A; 3BM6 A; 5KZH A; 4IHQ A; 3VP2 A; 1VM1 A; 5FEF A; 3HLW A; 4FTX A; 2OSU A; 4C3Q A; 1KDS A; 4IBX A; 3O5Y A; 4DJ3 A; 4KZ9 A; 1ALQ A; 1YLZ A; 1H8Y A; 1JWZ A; 3FPV A; 3H7W A; 2J9P A; 4LCL A; 1GHI A; 1BLP A; 1NYM A; 1DY6 A; 2HZ5 A; 5EVE A; 1DP9 A; 1MKI A; 3VOZ A; 3FV7 A; 4RX2 A; 4MBK A; 2C5W B; 3D3O A; 5DF7 A; 4EU0 A; 3CI6 A; 2JN7 A; 4DN0 A; 4I5S A; 4KQQ A; 3V3R A; 1BYW A; 2G2W A; 1RP5 A; 1MKM A; 2IWD A; 4WYY A; 3FKV A; 1OJ5 A; 4Q0I A; 1WYB A; 3O86 A; 4XT2 B; 1IFQ A; 4NKP A; 3PBN A; 2R9W A; 5FQM A; 3M6H A; 3T50 A; 5HDD A; 2M1C A; 4A5R A; 1FR6 A; 1YLP A; 3M2K A; 1TEM A; 3Q7Z A; 3K2N A; 3P09 A; 4EUV A; 4PHT A; 2XF3 A; 3IWO A; 5AVE A; 4GCZ A; 1GSW A; 3C4O A; 2QKP A; 4N1H A; 4QJG A; 4IVI A; 4N1X A; 4PM7 A; 4JGP A; 2VX8 A; 2J7V A; 1G6A A; 1CEF A; 5EE8 A; 1E25 A; 2ZJ9 A; 1DJB A; 3ICY A; 2PYR A; 2V0W A; 1JVJ A; 2WAD A; 3P7N A; 5L07 A; 3MJQ A; 3MZF A; 1A0K A; 4R3A A; 1GCE A; 3S7Q A; 2QWS A; 1N4O A; 4EUZ A; 4KG6 A; 3DTK A; 4Y5F A; 1ONH A; 2VA0 A; 2KOI A; 4GN2 A; 3PXP A; 1NJ4 A; 2MJ6 A; 4NG2 A; 1N9O A; 2EWV A; 3PBS A; 5DFY A; 3GV9 A; 2UWX A; 4IBR A; 2PT7 A; 3C38 A; 1JWP A; 3HLF A; 1D06 A; 1Y54 A; 5HDS A; 4PM9 A; 3C30 A; 1XP4 A; 3LIF A; 1JWV A; 2UV0 E; 3OCN A; 3VFH A; 3VP1 A; 4EET B; 4L9E A; 1IYS A; 5A90 A; 5HX9 A; 1VEU B; 1ESU A; 1ERM A; 4HEF A; 3EEH A; 4OQG A; 4EQ1 A; 3A3J A; 5CEC A; 5EVL A; 4JXS A; 1G5U A; 2ZM8 A; 2DMW A; 2C6W B; 4JXV A; 4M4X A; 2AVX A; 1VQQ A; 5DTT A; 5HAQ A; 4U0T A; 4KG2 A; 5A92 A; 2WKQ A; 1MPL A; 4EW7 A; 3QP1 A; 4F3L A; 3VSK A; 3Q81 A; 3CJM A; 1FCO A; 1HZO A; 5FQJ A; 4CJN A; 4NXG A; 3LIB A; 1ERO A; 1S67 L; 3ISG A; 1IYQ A; 1ZC2 A; 4L0L A; 3WRT A; 4BBT A; 4GOG A; 5A91 A; 1SKF A; 3V67 A; 1CI8 A; 4JF6 A; 4UEY A; 3LI8 A; 5KSH A; 4Y13 A; 3FPW A; 3UPO A; 1YM1 A; 2D01 A; 2PRF A; 2JKT M; 5FI7 A; 3V39 A; 3C8C A; 3ZVT A; 4P6Z M; 3W4Q A; 3ZG7 B; 5CEB A; 1LI0 A; 5F82 A; 1E4D A; 4U3T A; 1NY0 A; 3EWK A; 4D2O A; 1ODV A; 4QU3 A; 4UHU A; 4H6J A; 3D9Y A; 5G18 A; 1YLY A; 1LSW A; 2HJE A; 2OLV A; 4JGR A; 4Y3I A; 3BY8 A; 3SS4 A; 3QP6 A; 4Y0T A; 4EES A; 3ZNT A; 2XSS A; 3E98 A; 2X02 A; 3E2L A; 1ZHH B; 3VE4 A; 3CUE A; 4R70 A; 3EGX C; 1J3W A; 5GHY A; 2ZMV A; 3L9K A; 4BEN A; 4EQI A; 3G2Y A; 3TJZ C; 2Y2P A; 1U60 A; 3N8S A; 1XGI A; 3UPN A; 5F68 A; 5HAI A; 3KX0 X; 3MQO A; 2P7J A; 3H7W B; 5FI6 A; 3B33 A; 3KYE A; 3E4P A; 3M6B A; 4ZJ2 A; 4ZJ1 A; 1OTD A; 4FCF A; 4N92 A; 2PBY A; 2XH9 A; 2L4R A; 3RXX A; 1TF1 A; 1KE0 A; 3I7J A; 3WS2 A; 5D3O A; 4E04 A; 2V8F A; 1OTA A; 5DF8 A; 3LR5 A; 2JCH A; 4C6Y A; 3UDX A; 2E8J A; 1XGJ A; 4ZDX A; 3CWF A; 3IX4 A; 4DF6 A; 3LIC A; 4XUX A; 4OQH A; 3UE0 A; 4E6W A; 2Y4A A; 3KSH A; 2PU4 A; 2PBD P; 4YFM A; 3UE1 A; 5CRF A; 5EFW A; 2ZL1 A; 3BRM A; 3HCY A; 1K54 C; 4YOF A; 4OVD A; 1DRM A; 4WZ5 C; 3UN7 A; 4R4S A; 3ZG9 B; 2JKF A; 3VP4 A; 2OWH A; 2Y2H A; 2VKS A; 2XA7 S; 1PRQ A; 1YLJ A; 2BAS A; 4HOI A; 4MLL A; 4MN7 A; 1AWI A; 5K5B A; 4I3A A; 1O7E A; 2R9X A; 2P74 A; 4LPZ A; 1HLU P; 5CER A; 4S2M A; 3G31 A; 4NET A; 3BW6 A; 3NC8 A; 3BFG A; 3FZC A; 3LIA A; 3T4Q A; 3GTC A; 2OAQ 1; 4GD6 A; 4PM8 A; 4WZ4 A; 2FFY A; 3L7H A; 3OPL A; 1PI5 A; 4JF5 A; 1HTZ A; 3ITA A; 5EOE A; 4XUZ A; 3SH9 A; 3A3D A; 1VEU A; 2Y2G A; 1BZA A; 3VP3 A; 3SS3 A; 4ZRR A; 2ZMA A; 3IT9 A; 2EFX A; 3AGF A; 4X68 A; 3JVU A; 4JBF A; 4DE2 A; 3CAX A; 5DKL A; 3NDG A; 3VE3 A; 3T12 B; 1LT0 A; 3HLC A; 3OBF A; 4WZ5 A; 4C75 A; 4LFU A; 1PYY A; 2LB5 A; 3EQU A; 3ZYT A; 1ZG6 A; 2M7U A; 2Y2J A; 4HI4 A; 1H5X A; 1YT4 A; 3MZD A; 4R3B A; 3G32 A; 4S2J A; 3VOY A; 1I2W A; 2ZM2 A; 4P0M A; 4CLC D; 4G3W A; 3BWL A; 1W63 M; 1TS0 A; 2G7U A; 5AJG A; 4OQI A; 3VMA A; 3KSI A; 1C3B A; 4GDN A; 1OT9 A; 3T4J A; 4O01 A; 1Y4O A; 4LEN A; 2WGW B; 3HLD A; 2IWC A; 1S6R A; 4RA7 A; 1M6K A; 5JYO A; 2WKE A; 5DVA A; 3W4P A; 5G4Z A; 3SW1 A; 1FSW A; 5CED A; 2HV1 A; 2JE5 A; 4FOF A; 1MWS A; 1K57 A; 3IBJ A; 4EER A; 3F1O B; 2WAF A; 2O0Y A; 2B5R A; 1FOF A; 1YPR A; 3D72 A; 4LLO B; 2QJ5 A; 4F3L B; 2L1M A; 4N9L A; 3H9W A; 5M19 A; 2W3G A; 5CTM A; 5E2F A; 2E8I A; 2HF6 A; 4CLC A; 3H82 A; 5GLD A; 4WUJ A; 5AQB A; 3M2J A; 4HH2 A; 4R38 A; 3N6I A; 4E3N A; 3LFV A; 5F6A A; 4AFI A; 3TRC A; 2HP9 A; 3BLS A; 4I39 A; 3DTE A; 3HVF A; 4BL3 A; 1YLT A; 1FQG A; 3UDI A; 2G2U A; 2INW A; 3GQZ A; 4ARZ A; 1S66 L; 1CF0 A; 1TVF A; 2Y2M A; 2V1B A; 4WF0 A; 1FIL A; 3LY3 A; 4QWO A; 1UWN X; 2VGL S; 4HP4 A; 3O3V A; 5L09 A; 4KQD A; 3TG9 A; 1KGF A; 3T4T A; 2HGV A; 1SZV A; 3AGD A; 2W3H A; 4H6J B; 5GLC A; 4B88 A; 4I3I A; 4HQA A; 2BLS A; 3GSG A; 5EV0 A; 2WKI A; 3OOV A; 3IXG A; 3EOI A; 3IF6 C; 3TE8 A; 3NIA A; 5DTS A; 4Y0U A; 1SKO A; 2ZC4 B; 5DFX A; 5EM0 A; 5F5Y A; 1PIO A; 5FL3 A; 4RYE A; 2JC7 A; 2Q0O A; 4E3K A; 1L0E A; 3PTE A; 4GS9 B; 3IWQ A; 3IXD A; 1OT6 A; 3CZD A; 4G3V A; 1GHM A; 3IHB A; 3IF5 A; 3V3S A; 2XK1 A; 3LIE A; 5IHV A; 5TR7 A; 1ES5 A; 3S7P A; 4BMW A; 4WL9 A; 1GA0 A; 1J9M A; 3GVB A; 3LI9 A; 1DP6 A; 2ZQD A; 5FSR A; 4ZAM A; 3IHA A; 4E3L A; 4B93 A; 1KVL A; 1X0O A; 4R6L A; 1ACF A; 3WWX A; 2PDR A; 1V9Z A; 4QB8 A; 2LB9 A; 1DP8 A; 4HJ6 A; 3IF6 A; 4LV1 A; 1NYY A; 1F9I A; 3IH8 A; 3HL9 A; 5FQK A; 5CTN A; 4MN5 A; 3A0V A; 3IX8 A; 2XD5 A; 3MZE A; 5I5L A; 1NXY A; 4X56 A; 3ZQ5 A; 1AXB A; 2EA9 A; 2CMN A; 1SHV A; 2ZL1 B; 1KOU A; 1MC0 A; 1GSV A; 1QME A; 1W7F A; 2Q9N A; 2HP6 A; 3HUN A; 3UB9 A; 3UB8 A; 4WLA A; 2XD1 A; 1YMX A; 2J3T C; 3SH8 A; 4DE3 A; 1XJ4 A; 3GEC A; 3A3I A; 3DBA A; 3QNB A; 4BJP A; 4KQR A; 2O99 A; 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3NOP C; 3CMZ A; 4Y15 A; 2FZ0 A; 1XA1 A; 2WK0 A; 4X25 A; 3ZG5 A; 2O9B A; 1YSP A; 2P9V B; 1NZU A; 2ACG A; 4OOY A; 4ARZ B; 1K38 A; 2EWW A; 4I38 A; 3RTY A; 2ZQA A; 1MWT A; 4GS9 A; 5FQ9 A; 3RJU A; 2XEP A; 4QPR A; 1PZO A; 3VFF A; 5CHU A; 1BUL A; 4X1L A; 2YKH A; 4LV3 A; 5AQ7 A; 5FQI A; 4EV4 A; 2PYP A; 3F1P A; 1TDG A; 3EQV A; 3DTI A; 4R1G A; 3V50 A; 5M1A A; 1W8Q A; 1LLB A; 4OP5 A; 2H10 A; 1YLW A; 3MXS A; 3ZDJ A; 4DDY A; 2WGV A; 2ZC5 B; 1QMF A; 3R7W A; 3LYX A; 1SKO B; 1STZ A; 4EEU A; 2A24 A; 3LCE A; 5HD3 A; 1F2K A; 4OQ0 A; 2WKH A; 3QNC A; 1W63 Q; 1FSY A; 2VJW A; 3G6O A; 2X71 A; 2GDN A; 4RX3 A; 2EFU A; 1L2S A; 4F94 A; 1KDW A; 4PM5 A; 3T4O A; 3BQA A; 4GZB A; 2XA7 M; 2W1R A; 1ES2 A; 1MBL A; 4OOM A; 4YNR A; 5FAQ A; 3HLB A; 4GKU A; 2L0W A; 2HP5 A; 2Q9M A; 4LGW A; 3MS6 A; 3LY4 A; 4Z9Q A; 2Y2O A; 4OLD A; 3QP5 A; 1K4E A; 5FDH A; 1ERQ A; 4NXF A; 2XLN A; 2V1A A; 2KX6 A; 2YKF A; 3ZG8 B; 2B95 A; 5L8M A; 4LRY C; 4OPR A; 5HPI A; 2QZ6 A; 4HHD A; 3IF6 B; 3BFC A; 2ZC6 B; 1D7E A; 5J7E A; 2ZD8 A; 4KG5 A; 3UME A; 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