The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
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sequence length |
139
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structure length |
139
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Chain Sequence |
AGWNAYIDNLMADGTCQDAAIVGYKDSPSVWAAVPGKTFVNITPAEVGILVGKDRSSFFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQDGEFTMDLRTKSTGGAPTFNITVTMTAKTLVLLMGKEGVHGGMINKKCYEMASHLRRSQY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The structure of an open state of beta-actin at 2.65 A resolution.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Complex (acetylation/actin-binding)
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| molecule keywords |
BETA-ACTIN
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| total genus |
44
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| structure length |
139
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| sequence length |
139
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-05-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| P | PF00235 | Profilin | Profilin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2V8F A; 2V8C A; 3T1R A; 1D1J A; 3T12 B; 1HLU P; 2PRF A; 4D60 A; 1CF0 A; 1PFL A; 4QWO A; 1ACF A; 4X1L A; 3L7H A; 2PBD P; 3NEC A; 3L9K A; 3MS6 A; 5EM0 A; 2ACG A; 3CPT A; 3CPT B; 1SZV A; 3T1S A; 1K0K A; 2JKF A; 2HZ5 A; 3LEQ A; 4ESP A; 1VEU A; 1SKO A; 3UB5 P; 1CQA A; 5FEF A; 1FIL A; 4X25 A; 2PAV P; 3MSH A; 3D9Y A; 3LGO A; 5EV0 A; 3U4L P; 4FUW A; 1PRQ A; 3NUL A; 5EM1 A; 3CHW P; 1Y4O A; 4X1M A; 1G5U A; 4FTX A; 2E8J A; 1VEU B; 3DAV A; 1SKO B; 2B95 A; 3T1X A; 1PNE A; 1A0K A; 2ZL1 A; 5FDS A; 2BTF P; 1J3W A; 2ZL1 B; 2JKG A; 5FEG A; 1YPR A; 2VK3 A; 3KYE A; 1CJF A; 1F2K A; 1AWI A; 5EVE A; 1VET A; 1Z09 A; 1FIK A; 1VET B; 3T1Q B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3SS5 A; 3LCE A; 5CEC A; 4HJ6 A; 1Q2Q A; 4O0P A; 3QP5 A; 3QP2 A; 1ODV A; 1PW1 A; 2VX8 A; 4X56 A; 3P01 A; 5TJJ A; 4JBF A; 5L2F A; 3LY4 A; 5EVI D; 2VEA A; 2ZQC A; 3NEC A; 5HAR A; 4G3W A; 3PBO A; 2HJE A; 5KZH A; 3FPV A; 1SZV A; 2EFX A; 2J9P A; 1GSW A; 4WM9 A; 3LIA A; 4GHI A; 4XUX A; 1ONG A; 1K55 C; 2ZQ7 A; 2QWS A; 1F98 A; 1NLZ A; 3KSH A; 4KUO A; 2HJ9 C; 4QY6 A; 5HZH A; 5CGS A; 5FAQ A; 2ZLY A; 1CEF A; 1HZO A; 4Z1W A; 1LSX A; 5HW3 A; 2XA7 S; 2M7V A; 5AVE A; 1PYY A; 1ES4 A; 3PHY A; 5KIZ A; 2XFT A; 2A24 A; 3QNB A; 4BJP A; 4HH2 A; 2O9C A; 1OT9 A; 4DE2 A; 2VV6 A; 5F68 A; 4LRZ E; 1OME A; 4WLA A; 4MBH A; 3K3D A; 3VSK A; 2PBY A; 2ZL1 A; 1I2S A; 5FEG A; 3EGX C; 4PAU A; 3GDI A; 3UPO A; 4EQ1 A; 2WK0 A; 1CJF A; 4E3K A; 4UQI S; 1FR6 A; 1GHP A; 4AFI A; 4E3O A; 4LRY C; 1N4O A; 3C4P A; 3HBR A; 3JVU A; 4BD0 A; 4KZ4 A; 2ZD8 A; 4P85 A; 3O86 A; 2H10 A; 2ZQ9 A; 3VFH A; 2XEP A; 1MWR A; 3ICY A; 3V3R A; 2B18 A; 3HLG A; 3Q1F A; 5FQJ A; 4HBT A; 3T12 B; 3HUN A; 4UA7 A; 3EQV A; 3UE3 A; 1ZTU A; 5EVL A; 3T4L A; 1K57 A; 3CUE C; 5D3O A; 2Y55 A; 4P0M A; 2G7U A; 3IXH A; 3H7W B; 4WZ4 A; 4Y3I A; 1T1C A; 2WKH A; 3UB8 A; 1ERQ A; 2B5R A; 3WS5 A; 1QME A; 4F94 A; 2X01 A; 3WRZ A; 2WZZ A; 2ACG A; 2M1C A; 3T1S A; 1OTD A; 1FR1 A; 5FL3 A; 5U47 A; 4UA9 A; 2ZMF A; 3ZDJ A; 1OJG A; 2WKR A; 5J8X A; 2H0T A; 1NZU A; 1LHY A; 4MN7 A; 4O7D A; 3NOP C; 4LPZ A; 4Z9Q A; 4LV0 A; 4RX2 A; 5A90 A; 3BLM A; 4CLC E; 1W63 Q; 3VOZ A; 1K6S A; 4YIN A; 1CI9 A; 1BT5 A; 5EM1 A; 3CHW P; 3OPL A; 4GLQ A; 2O9A A; 4X55 A; 4LV1 A; 1QMF A; 2Y91 A; 2JKT M; 3S1Y A; 2OWJ A; 4RVA A; 3DTE A; 2PYR A; 1EI5 A; 5HPF A; 1XGJ A; 1YPR A; 2HDS A; 4GD8 A; 2EX8 A; 4Q0J A; 4F3L A; 3PBN A; 5EVE A; 3C5A A; 2P9V B; 1VET B; 4GNU A; 3GTC A; 4WZ5 A; 3UB6 A; 4JXS A; 3UME A; 1VHM A; 4E3J A; 2JCH A; 3FPW A; 3IXG A; 5TBM B; 4NXF A; 4HH3 A; 1P0Z A; 4JF5 A; 3I7J A; 3HLC A; 1J9M A; 1CI8 A; 1XJ3 A; 1YQS A; 4R3A A; 2X71 A; 5EOO A; 5M18 A; 2PRF A; 2WUQ A; 2XF3 A; 3NIA A; 4L9G A; 1Y54 A; 3NCK A; 1STZ A; 4CLC B; 3ZNT A; 1SDE A; 3PAE A; 3DW0 A; 3FZC A; 3IX4 A; 5DVA A; 5DTK A; 1MPL A; 4MNR A; 1OTE A; 2G2W A; 2XH9 A; 3ZG9 B; 2FZ0 A; 5FDH A; 1FIL A; 3C7U A; 4CLC D; 3MSH A; 1JVJ A; 5HL1 A; 2WYX A; 4I3J A; 2ZC6 B; 4R0Q A; 5L10 A; 2D01 A; 4GN2 A; 3P09 A; 2RCX A; 2W3H A; 4YOF A; 4JF6 A; 4H6J A; 1G5U A; 4HBU A; 5HWV A; 2EX2 A; 1H3Q A; 5HDC A; 2Y2K A; 1Z6F A; 4GDB A; 1KE3 A; 1JWZ A; 3A3F A; 4XUZ A; 4B4Z A; 5FAT A; 4BL2 A; 1BLC A; 4S2M A; 1XFQ A; 4JGR A; 1TS8 A; 2C6W B; 2PHY A; 4DDS A; 1IEL A; 4EET B; 3ZCZ A; 1I5Q A; 5FQM A; 3ITA A; 4GD6 A; 4KG6 A; 5CX7 A; 4IED A; 3HJK A; 5HDD A; 2JC7 A; 4NEE D; 4R70 A; 2EXB A; 1FCN A; 4JF4 A; 4WUJ A; 2J8Y A; 1TEM A; 2ZM8 A; 5HAQ A; 1WA9 A; 3UE0 A; 2ZC4 B; 2DNS A; 4HIA A; 2Q0O A; 1UWP X; 3M6H A; 4D60 A; 2XFS A; 4M3K A; 4PM7 A; 5FQQ A; 3VSL A; 2H0Y A; 3NC8 A; 3E2L A; 3OPH A; 4Y2F A; 4BWI A; 3ZG5 A; 3CWF A; 4NXG A; 4OON A; 1TS7 A; 1SCW A; 5AQA A; 2O99 A; 3MZF A; 4DMZ A; 4BBU A; 3T4J A; 2HZ5 A; 4S2O A; 1FCO A; 2XLN A; 2DRW A; 2V2F F; 3MMH A; 1S1Y A; 1BYW A; 3NI9 A; 1MWS A; 4S2N A; 4NK3 A; 3G30 A; 5HAP A; 4P6Z S; 5FAP A; 2ZQA A; 3UMD A; 2ZQ8 A; 3DTM A; 4RYE A; 3V3S A; 2EX9 A; 4DE0 A; 1BSG A; 2Y2M A; 3A3J A; 2OAP 1; 4X1M A; 3ZYT A; 3G31 A; 4UEY A; 1E3U A; 4FCF A; 3BQA A; 1UGU A; 1L3L A; 4ETZ A; 4ZJ1 A; 4WMC A; 5KSH A; 4RA7 A; 4L9F A; 1S6R A; 1S67 L; 4KQD A; 2J3T C; 4MCW A; 4U3T A; 3A3E A; 2ZL1 B; 2A2L A; 1L0D A; 2V1Z A; 3ZVT A; 1OTI A; 4OH0 A; 4IBX A; 4KEN B; 1KOU A; 2RL3 A; 3G4P A; 1HVB A; 2A3U A; 1MKM A; 4U0T A; 4CJN A; 5F82 A; 3TE8 A; 1H8Z A; 4JLF A; 1GSX A; 2XQZ A; 1RGY A; 4EWF A; 4B9O A; 3UPP A; 3NHQ A; 4ZDX A; 3MQQ A; 5AJG A; 1HLU P; 4GS9 A; 1F5M A; 1H5X A; 1ACF A; 5L8M A; 3TJZ C; 3D72 A; 4M4X A; 3PBQ A; 2CC1 A; 4JPM A; 4L9E A; 1O7E A; 1ERO A; 1MKI A; 3CI6 A; 3A3I A; 2WGW A; 2LB5 A; 2JN7 A; 3WWX A; 3NY4 A; 1YLP A; 3F1O A; 1ZG4 A; 1K54 A; 5EE8 A; 3GVB A; 1KDW A; 4DJ3 A; 3ISG A; 5E2G A; 2HGV A; 4WN5 A; 3U2A A; 2WAF A; 3WS0 A; 3KO6 A; 4E6X A; 3IBR A; 3NUL A; 2L4R A; 3VP3 A; 4E3M A; 5AQ9 A; 4P87 A; 5DJU A; 5CGW A; 3IWI A; 4BEN A; 4OOL A; 3SZT A; 1U60 A; 1UWN X; 4WF0 A; 2PU4 A; 1A0K A; 4ETX A; 1W8Y A; 1W79 A; 4OQ0 A; 3KX0 X; 1PWC A; 2VV7 A; 5F1F A; 5FSR A; 3PBT A; 1G6A A; 4BD1 A; 3LYX A; 4DE3 A; 3SH7 A; 3HVF A; 4QB8 A; 3EQU A; 3HJI A; 5I94 A; 3VOL A; 4KZ8 A; 1YT4 A; 1IFQ A; 2IWD A; 3W4P A; 4OQI A; 3BY8 A; 3PBR A; 3VP4 A; 1IYP A; 3T1R A; 1BUE A; 4GKU A; 4R4S A; 1EW0 A; 5CRF A; 4Y0T A; 3T4T A; 2HDU A; 4K0W A; 5HL6 A; 4NXB A; 2Q9M A; 2JKR I; 1P9R A; 3IH8 A; 1PZO A; 5EVI B; 2ZMA A; 1NRJ A; 4ARZ A; 2GNX A; 2E8I A; 4LV2 A; 2I9V A; 1XJ6 A; 1P9W A; 2W27 A; 4KZB A; 3BQ8 A; 2PR6 A; 1MWT A; 5J3W A; 1L0G A; 4HI4 A; 2XRN A; 4ESP A; 4B93 A; 3K3C A; 4ZAM A; 5EEC A; 3TW8 A; 2WKP A; 5AQ7 A; 4QY5 A; 1L2S A; 2EWW A; 3Q82 A; 1FSW A; 3B33 A; 2FFY A; 1GHM A; 1GCE A; 4UHU A; 3EWK A; 4KQR A; 4OPY A; 3CMZ A; 1OPX A; 2P08 A; 4FTX A; 3OBF A; 3DAV A; 3V5M A; 3KSI A; 1YLY A; 4QPR A; 5JYP A; 2BTF P; 2EX6 A; 3MQ0 A; 4XT2 B; 3BFC A; 4PKY G; 2WKI A; 3PBS A; 3FKV A; 5EOE A; 1FQG A; 3RXW A; 3MXR A; 4HNB A; 4B88 A; 4PHT A; 1Z09 A; 3D3O A; 3ZG0 A; 4NKP A; 1WYC A; 5A8B A; 4PPR A; 1D7E A; 1JNU A; 4C6Y A; 4C3Q A; 5GLB A; 5FQK A; 1BUL A; 4X6T A; 1H0M A; 2XK1 A; 3KYQ A; 5CGX A; 2BG1 A; 2Y8H A; 4CPK A; 1G28 A; 4MDZ A; 1YMX A; 5A93 A; 3R4K A; 1IYO A; 5DF8 A; 4II7 A; 2P74 A; 3IF6 A; 3EEH A; 3UPN A; 3SOI A; 4S2K A; 5EM0 A; 5GLA A; 3T4Q A; 1DY6 A; 4HJ4 A; 4EXO A; 2OOL A; 2W3F A; 2Y2H A; 1GA0 A; 3BYD A; 5EVI C; 2W3D A; 4DF6 A; 1ES2 A; 2MJ6 A; 3W8K A; 1OTB A; 2Y2L A; 3IX3 A; 3LR5 A; 4DXC A; 1LSW A; 1S4S A; 5E2E A; 2V1B A; 5IS1 A; 3Q07 A; 3BEC A; 4ME4 A; 1BLS A; 3O5Y A; 1YMS A; 4X53 A; 5TFQ A; 5J7E A; 4OPQ A; 1VEU B; 3HLW A; 1Y28 A; 1SKO B; 5F1G A; 4EEP A; 2V0W A; 1FOF A; 3VP1 A; 2IWB A; 3H82 A; 4KZ9 A; 4YNR A; 2UV0 E; 1XKZ A; 2L1M A; 5L07 A; 4QU3 A; 3RJU A; 3LFV A; 5TGF A; 3HL9 A; 1AWI A; 1K55 A; 1YLT A; 1NXY A; 3G6O A; 2HDQ A; 1IYQ A; 5FI6 A; 1E3U D; 3WS4 A; 2OAQ 1; 3P7N A; 3KSF A; 1S1Z A; 4DXB A; 4WMC D; 3OLO A; 2EXA A; 3PR6 A; 5HSQ A; 2W1T A; 5AQB A; 3RFB A; 1WE4 A; 2JHE A; 1JWV A; 4KG2 A; 3LR0 A; 1Q2P A; 4H8R A; 4JGQ A; 3E4O A; 4GS9 B; 1CF0 A; 1KE4 A; 1SHV A; 2DMW A; 1JWP A; 1F9I A; 1PW8 A; 3HLD A; 1VQQ A; 5E43 A; 4EBL A; 3IS2 A; 4S2P A; 3Q7Z A; 1NRF A; 3G32 A; 3F1P B; 1DJC A; 2WGW B; 4JGP A; 2BLS A; 3LI9 A; 1K6R A; 3F1O B; 2ZOH A; 3BJN A; 1PZP A; 4X25 A; 4U0X A; 3W4Q A; 4N1H A; 4PM9 A; 1TVF A; 5CTN A; 1ERM A; 4QJG A; 1DJA A; 3BFF A; 1ESU A; 3R7W A; 3A0R A; 2L0W A; 2JBF A; 4HHD A; 3IXD A; 3S4X A; 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4JXG A; 2ZM2 A; 4JXV A; 4Y5F A; 2QJ7 A; 4HQA A; 3WS1 A; 3QP1 A; 5HAI A; 2X02 A; 1OJ5 A; 4K0X A; 2V8C A; 5GL9 A; 2QYB A; 4R3B A; 3IWQ A; 3A0V A; 2XD1 A; 3UB7 A; 2VGL M; 1T19 A; 2OLV A; 3DBA A; 2QKP A; 3L7H A; 5HD3 A; 3S7Q A; 1S66 L; 3N4I A; 5G4Z A; 3DTI A; 1XJ2 A; 4OP8 A; 3V50 A; 2EFU A; 2GJ3 A; 2JKF A; 2V1A A; 4Y17 A; 3PAG A; 1O07 A; 2Y59 A; 3O87 A; 3BRM A; 1HD8 A; 4Q8I A; 1MXO A; 4FSF A; 4QD4 A; 1V9Z A; 1W8Q A; 1Y4O A; 3O88 A; 2P9V A; 2WGV A; 4N9L A; 3EGD C; 2O9B A; 1TDG A; 4RX3 A; 3NOT C; 3G35 A; 3GQZ A; 2HDR A; 5CXW A; 5TBM A; 3CAX A; 1XGI A; 3NJA A; 4OQH A; 2ZC5 B; 5JYO A; 1S4R A; 5CER A; 1TS0 A; 4LGW A; 4KZ6 A; 1XA7 A; 1D06 A; 4OPZ A; 2Y2G A; 1F2K A; 3IXB A; 4HES A; 3KYZ A; 2KLI A; 4HOI A; 1NJ4 A; 4K08 A; 1YKD A; 2W1R A; 2W1T B; 1XX2 A; 2JKR M; 3UO9 A; 3LIE A; 1E4D A; 4F3L B; 4WBG A; 2QPN A; 3FKW A; 4E3N A; 4G3V A; 1M40 A; 4NET A; 1KGG A; 2FH5 A; 3O3V A; 4IUK A; 1JTD A; 4I5S A; 2XR0 A; 1YAX A; 1XXM A; 4YWZ A; 3HCY A; 1NZO A; 3WS2 A; 3MKE A; 3M2K A; 4Q0I A; 2ZJ9 A; 3QP4 A; 1N9N A; 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