The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
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sequence length |
139
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structure length |
139
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Chain Sequence |
AGWNAYIDNLMADGTCQDAAIVGYKDSPSVWAAVPGKTFVNITPAEVGILVGKDRSSFFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQDGEFTMDLRTKSTGGAPTFNITVTMTAKTLVLLMGKEGVHGGMINKKCYEMASHLRRSQY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Complex (acetylation/actin-binding)
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| publication title |
The structure of an open state of beta-actin at 2.65 A resolution.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
BETA-ACTIN
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| total genus |
44
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| structure length |
139
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| sequence length |
139
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-05-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| P | PF00235 | Profilin | Profilin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1CQA A; 2V8C A; 3L7H A; 1AWI A; 2JKF A; 2PBD P; 3CPT A; 5FEF A; 1VEU B; 2BTF P; 3MSH A; 2ZL1 B; 1HLU P; 3T12 B; 3L9K A; 1VET A; 2V8F A; 1SKO A; 5EM1 A; 2VK3 A; 5EM0 A; 1F2K A; 1PFL A; 1ACF A; 3U4L P; 3T1R A; 3MS6 A; 3LGO A; 1G5U A; 1Z09 A; 4X1M A; 3LEQ A; 4X1L A; 3T1S A; 4FUW A; 2PRF A; 2B95 A; 1CJF A; 2HZ5 A; 1FIL A; 3CPT B; 4FTX A; 4QWO A; 5EVE A; 1VET B; 1PNE A; 1A0K A; 1SKO B; 3DAV A; 1Y4O A; 1PRQ A; 3T1Q B; 3NUL A; 4D60 A; 4ESP A; 3T1X A; 1CF0 A; 1J3W A; 2JKG A; 1FIK A; 1SZV A; 1D1J A; 2PAV P; 3NEC A; 1YPR A; 5FEG A; 1VEU A; 3D9Y A; 2ZL1 A; 3KYE A; 3UB5 P; 1K0K A; 2E8J A; 4X25 A; 5FDS A; 3CHW P; 2ACG A; 5EV0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Y54 A; 3ZGA B; 5MC7 A; 2VLG A; 4ARZ B; 3HLB A; 3CJM A; 3OZH A; 4X6T A; 4QPR A; 3UY6 A; 5DFX A; 4N92 A; 5EVI C; 4S2O A; 1DJB A; 4E3M A; 3PYP A; 1YSP A; 1NRJ A; 1NWZ A; 2W3D A; 1ZG6 A; 2JN7 A; 5E2G A; 4K08 A; 4K91 A; 5J7E A; 5DF7 A; 2VV6 A; 1P9W A; 2A2L A; 3UDX A; 4OQ0 A; 4BD1 A; 4RA7 A; 1CI9 A; 4E3N A; 2O9B A; 1S66 L; 4JGQ A; 3LEQ A; 3KO6 A; 1IEM A; 4FOF A; 3ZVW A; 1BUL A; 1JWP A; 4GJ4 A; 1XA7 A; 4KZB A; 2WKQ A; 5F83 A; 1PNE A; 2VV7 A; 1I2S A; 2B18 A; 4IBR A; 3S7Q A; 4G3K A; 1YLW A; 2XD5 A; 3T1X A; 2JBF A; 2A49 A; 3R7W A; 3BQA A; 1ZG4 A; 1BZA A; 3DTE A; 4S2K A; 4NXF A; 1DP6 A; 5EE8 A; 4WYY A; 1VHM A; 1GSV A; 2PYP A; 3SH9 A; 4DE0 A; 3RFB A; 3HLC A; 2PDR A; 3UPP A; 1PWG A; 4O0P A; 1K55 A; 1MPL A; 3OBF A; 5F6A A; 1CQA A; 3QP6 A; 3TSG A; 5A92 A; 1ES2 A; 4R4S A; 4DMZ A; 4LGW A; 1HD8 A; 3SS5 A; 3OCN A; 3IT9 A; 4OOM A; 4HP9 A; 3MSH A; 4EBP A; 5FI2 A; 3LR5 A; 2VGJ A; 1DY6 A; 1KDW A; 4XT2 B; 3CUE C; 5FI7 A; 4XUX A; 1NZU A; 5DJU A; 4EWF A; 1F2K A; 3IX3 A; 2VJW A; 4B4Z A; 4YFM A; 5D3O A; 4MDZ A; 3T1R A; 4R70 A; 4GHI B; 5G4Z A; 4R3J A; 2Q0O A; 3C5A A; 4FUW A; 4Y17 A; 5KSH A; 4GDN A; 2IA2 A; 3GQZ A; 2XRO A; 3IS2 B; 4WBG A; 1S4S A; 1TS8 A; 5DTK A; 4RX2 A; 1BYW A; 3LIB A; 4NEE D; 1A0K A; 2LB9 A; 3MR0 A; 1HTZ A; 2EFU A; 2K7S A; 2WGV A; 3CAX A; 1YT4 A; 4UA9 A; 3OCL A; 3T50 A; 3V5M A; 1BT5 A; 3P7N A; 4JXW A; 2ZQ7 A; 1K56 D; 1HVB A; 1G68 A; 2V1B A; 5TGF A; 5DKK A; 4JLF A; 4Z9Q A; 3KYQ A; 3N8S A; 1KGG A; 1NJ4 A; 2YKF A; 1G28 A; 3UMD A; 2HDU A; 2Y2K A; 5IU1 A; 1DJC A; 4DKI A; 2WYX A; 2J9O A; 4Y3I A; 4U0T A; 4KZ9 A; 4P0M A; 3OPL A; 3H9W A; 3E4P A; 3W4P A; 4G3W A; 4WMC A; 1RGY A; 3S1Y A; 2Y4A A; 4N9K A; 3R7W B; 4OPY A; 4FSF A; 1IKG A; 3B42 A; 1T1C A; 2V2F F; 3MMH A; 3B47 A; 4ZJ2 A; 4KG5 A; 5HDS A; 5AVF A; 3BM6 A; 2HV1 A; 2M7U A; 3WS4 A; 4L9F A; 5CHM A; 5HWT A; 1H8M A; 5IT5 A; 1UGU A; 3BFF A; 2VK3 A; 3ZG8 B; 1P97 A; 3G2Z A; 2Y8H A; 1XJ4 A; 5FQJ A; 3E2K A; 4R38 A; 4FD8 A; 4OOL A; 1K57 A; 2EA9 A; 5AQ9 A; 2WAE A; 1BLH A; 5GL9 A; 3W8K A; 2B95 A; 3WS0 A; 4E3K A; 4FTX A; 4HJ3 A; 1L2S A; 5HZH A; 4MBF A; 4WZ5 C; 2XH9 A; 2Z6D A; 1XPB A; 5L8M A; 3GEC A; 3PAG A; 4DJ2 A; 1MWU A; 1YLY A; 5GLB A; 3UE6 A; 2KOI A; 3MZE A; 3C8C A; 4EQ1 A; 2WKR A; 3BQ8 A; 2GJ3 A; 2JKG A; 2PR6 A; 4NXG A; 3DTM A; 3FWL A; 3DBA A; 4EET B; 4GB7 A; 4OOY A; 3KYE A; 1JWZ A; 3W4Q A; 3S7O A; 3BWL A; 5GHY A; 3MFX A; 3UB7 A; 3M6H A; 4HEF A; 2MJ6 A; 2X02 A; 5CGX A; 4QU3 A; 5HAI A; 3EEH A; 1IYP A; 3P98 A; 5U47 A; 3KSG A; 1E3U D; 3LUQ A; 2C6W B; 5GHZ A; 1OTI A; 2XQZ A; 4UA6 A; 3ZYT A; 3DTI A; 1ERQ A; 3NC8 A; 4PM9 A; 3IF6 A; 1VB6 A; 2C5W B; 3T4K A; 5HFO A; 2Y91 A; 2J3T C; 5GLD A; 3BRM A; 1YLZ A; 4IHQ A; 2P04 A; 3BFD A; 3UN7 A; 4OH0 A; 5F68 A; 4KG6 A; 1TS7 A; 2ZQA A; 4L0L A; 1MWT A; 4IJG A; 5EEC A; 3HLW A; 2VKS A; 3LID A; 3NBL A; 5CED A; 3NOU C; 1ODV A; 2HJ9 C; 3ULF A; 3SH7 A; 4QB8 A; 4FCF A; 2W3H A; 4R3A A; 1ESI A; 1XXM A; 4X56 A; 3GDI A; 5FAO A; 5HAR A; 1S67 L; 4ID4 A; 5HDC A; 2ZC6 B; 4CLC E; 3BYD A; 3D3O A; 4PPR A; 3JPU A; 3NHQ A; 4WZ4 A; 2GNX A; 4O01 A; 4HOI A; 3OOV A; 1VEU A; 2XA7 S; 1TS0 A; 3Q1F A; 2ZL1 A; 3GV9 A; 4CPK A; 2ZJ9 A; 4S2L A; 3PR6 A; 3ZHH A; 1IYQ A; 2WUQ A; 4S2M A; 5CXW A; 2A3U A; 4X53 A; 3VP3 A; 3H7W A; 2VV8 A; 4MEZ A; 4N1H A; 1PWC A; 3A0S A; 4LV1 A; 3JVU A; 1NLZ A; 2O9C A; 4L9E A; 5HSQ A; 3BFE A; 3QHY A; 1KE3 A; 2V1Z A; 2VGL S; 3EQU A; 5AVE A; 1DP8 A; 3MQQ A; 1OTE A; 2K31 A; 1TVF A; 4IED A; 3RXW A; 1ONG A; 1K6S A; 4HP4 A; 4OLG A; 2Y2J A; 4S2N C; 1LSX A; 4R23 A; 3UME A; 2OSU A; 1OT6 A; 1TEM A; 3LR4 A; 2EX8 A; 3LIA A; 3IWQ A; 4HBT A; 3O88 A; 1L0E A; 1Z6F A; 5DVA A; 4P87 A; 2EX6 A; 3GR2 A; 2PRF A; 3MQO A; 1CEF A; 1T18 A; 3MXR A; 3IXG A; 1CI8 A; 2DNS A; 3OPH A; 3A3J A; 2Y2O A; 3NUL A; 4EEU A; 1K56 A; 1CK3 A; 3PBN A; 2VA0 A; 1W63 Q; 4CJN A; 4P6B A; 3BEC A; 1QMF A; 3IXH A; 1ZHH B; 3HUM A; 5EVI D; 4HQA A; 4BD0 A; 3PAE A; 1N9B A; 3WS5 A; 3Q7Z A; 1GA0 A; 2DCF A; 5HWW A; 3UPN A; 5FDH A; 1XGJ A; 1FR1 A; 3W2Z A; 3MQ0 A; 3GVB A; 1XA1 A; 4I5S A; 4KQD A; 1NY0 A; 1AWI A; 3C2W A; 1N9L A; 2XDM A; 1IEL A; 1V9Y A; 4HY8 A; 5FEF A; 1VEU B; 2R78 A; 2J9P A; 2ZL1 B; 1HLU P; 4MBK A; 1PI4 A; 1K54 C; 5CRF A; 1O07 A; 1K4F A; 2QZ6 A; 2G2W A; 3H7W B; 2D01 A; 2Q9N A; 2KX6 A; 5CHJ A; 5L2F A; 2JCH A; 3KSF A; 3IS2 A; 4I3I A; 1EW0 A; 3IWI A; 4X1L A; 5TJJ A; 5HX9 A; 2X71 A; 4EES A; 4HI4 A; 2I72 A; 4UQI S; 1MBL A; 4G3V A; 1TD5 A; 1OJG A; 3ITB A; 1W79 A; 2ZC4 B; 4CQH A; 4DF6 A; 3HVF A; 5A93 A; 1P9R A; 4ZJ3 A; 2QPN A; 1YPR A; 4GS9 B; 3HLD A; 4KZ4 A; 4OVD A; 3D9Y A; 3P09 A; 5IHV A; 1I5Q A; 4AFI A; 2W1R A; 1ZKJ A; 5FQ9 A; 3ZFZ A; 2DRW A; 2H5S A; 1K0K A; 2LB5 A; 2PBY A; 3LIE A; 5FSR A; 5DJT A; 1JNU A; 3N8L A; 4JKT A; 2ZC3 B; 1IOU A; 1QME A; 1Q2Q A; 4ZBE A; 4R1G A; 1TDL A; 3EGX C; 4X69 A; 2HDS A; 1CEG A; 5EUA A; 2BLS A; 1LI0 A; 3MZF A; 4NXE A; 4L9G A; 1BLS A; 2W0N A; 2EX9 A; 4U3T A; 2HP5 A; 1S1Z A; 2V20 A; 2HP9 A; 5HAP A; 4WM9 A; 1XJ6 A; 5KSC A; 3MKF A; 1H0M A; 4PHT A; 5FAS A; 4C6Y A; 1YQS A; 3BW6 A; 1L0D A; 2WZZ A; 2JC7 A; 5I5L A; 5E2E A; 1PW1 A; 1DRM A; 2ZMA A; 4YOF A; 1OPX A; 3K3D A; 3AGE A; 2Y59 A; 5F1G A; 3MS6 A; 5DTT A; 3TW8 A; 3LGO A; 4IUH A; 2Y2Q A; 3B3X A; 4II7 A; 2PU4 A; 1FIL A; 4KQQ A; 4Y0T A; 4GLQ A; 3IH9 A; 1K38 A; 3LCE A; 4B88 A; 1AXB A; 2XSS A; 3KSH A; 1BUE A; 5HL6 A; 5EVL A; 2IWB A; 1DJA A; 2PD8 A; 1KVL A; 3QNB A; 3IBJ A; 1KOU A; 3T1Q B; 1U60 A; 3G34 A; 4O7D A; 3S7P A; 4DDY A; 5F69 A; 5CEB A; 5E2H A; 2HF6 A; 4EV4 A; 5HW3 A; 5FQQ A; 2XD1 A; 2Z2M B; 3VP4 A; 1NLY A; 2IWC A; 3C30 A; 4KZ7 A; 1MWS A; 2W27 A; 4E6W A; 4X25 A; 4KEN B; 3T4O A; 2GZA A; 2HDR A; 3VMA A; 4DE1 A; 5EV0 A; 3N8R A; 4QY5 A; 1G6A A; 3HJK A; 4HH3 A; 4BBU A; 2QJ7 A; 3VE4 A; 2OAP 1; 3O86 A; 3UB9 A; 2Y2G A; 1JTD A; 3IHB A; 1ES4 A; 2RL3 A; 1K25 A; 3C4P A; 2WGI A; 3LI9 A; 3K3C A; 4EW7 A; 1YLT A; 2Z2L B; 3LEZ A; 2XK1 A; 4P6Z M; 1S1Y A; 1K6R A; 4S2J A; 2M1C A; 2O0Y A; 1CJF A; 4LCM A; 4Q0J A; 2ZC7 A; 2JKR I; 5CER A; 1LHY A; 4JGP A; 3BLS A; 5CGW A; 5DFY A; 4GZB A; 1H8Y A; 1ALQ A; 4HJ4 A; 4EQI A; 4GDB A; 2FFY A; 4IVK A; 3MZD A; 2V9A A; 2PAV P; 3RTY A; 5I94 A; 4KQR A; 3LIC A; 4UHU A; 4KZ3 A; 3MFD A; 4KZ8 A; 4GD8 A; 2ZBB A; 2P7J A; 3UB5 P; 4I38 A; 5EVI A; 2E8J A; 3BY9 A; 3C7U A; 3FZC A; 4KUO A; 4OP8 A; 4HH2 A; 3F1O A; 3RJU A; 2J7V A; 2M7V A; 3IHA A; 4NK3 A; 3G6O A; 2KLI A; 3UB6 A; 5A91 A; 3EWK A; 2ZQ9 A; 1FSY A; 3CPT A; 2O9A A; 2J3T D; 3IX4 A; 5KMW A; 4LRZ E; 3VE3 A; 1J9M A; 3EQV A; 4YNR A; 1GSW A; 3NJA A; 3PBR A; 2W3E A; 1WA9 A; 2Y2I A; 4KG2 A; 2FZ0 A; 3CI6 A; 5EPH A; 4EUV A; 5EOE A; 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4P85 A; 3Q07 A; 4BL3 A; 4ZAM A; 3V67 A; 4Y0U A; 5F82 A; 4X55 A; 3CLO A; 4FH4 A; 1N9N A; 5J8X A; 4DRT A; 4GS9 A; 3UB8 A; 3PBQ A; 3FPW A; 4GKU A; 1WE4 A; 1YLP A; 4E3J A; 3WRT A; 3BEB A; 1WYB A; 1PIO A; 4ETZ A; 5FQM A; 4PM8 A; 4F3L B; 3W4O A; 5CEC A; 2B5R A; 1S4R A; 3FYZ A; 4OPR A; 2ZQD A; 2XFS A; 3TJZ C; 5TR7 A; 3DTK A; 2P08 A; 2XLN A; 2P74 A; 2EXA A; 5HWV A; 4EER A; 2PYR A; 3M2J A; 3N7W A; 4Y15 A; 1GHP A; 4B93 A; 3ZVT A; 2DMW A; 4JF4 A; 1X0O A; 2QMI A; 1XX2 A; 2Q9M A; 5LBR A; 4BJP A; 3C4O A; 5EM1 A; 4QHC A; 2ZMF A; 1N9O A; 1W7F A; 3PXP A; 4U0X A; 4WZ5 A; 5E43 A; 5L09 A; 3HLF A; 5CHU A; 5J3W A; 1ACF A; 1UWN X; 3LR0 A; 4MMN A; 5FI6 A; 4BLM A; 2EWW A; 2QWS A; 5HAQ A; 2XRN A; 3MKE A; 1LLB A; 3EGD C; 5HD5 A; 3FV7 A; 2HPB A; 1I2W A; 5GHX A; 4QWO A; 3F1P B; 1RCJ A; 5M1A A; 2WAF A; 3UE3 A; 1K57 C; 1NZO A; 5A8B A; 4NET A; 1SKO B; 2WKI A; 3PTE A; 3H82 B; 2K2N A; 3Q82 A; 4HES A; 5F5Y A; 2WGW A; 1Y4O A; 1KDS A; 4R3B A; 2Y2H A; 5AQ7 A; 2XR0 A; 5AQB A; 2Y2N A; 1FQG A; 4M4X A; 1FIK A; 3U2A A; 4EUZ A; 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