The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
125
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structure length |
125
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Chain Sequence |
SWQTYVDTNLVGTGAVTQAAILGLDGNTWATSAGFAVTPAQGQTLASAFNNADPIRASGFDLAGVHYVTLRADDRSIYGKKGSAGVITVKTSKSILVGVYNEKIQPGTAANVVEKLADYLIGQGF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal packing induces a conformational change in profilin-I from Acanthamoeba castellanii.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PROFILIN IA
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| molecule tags |
Contractile protein
|
| source organism |
Acanthamoeba castellanii
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| total genus |
34
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| structure length |
125
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| sequence length |
125
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-08-18 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3NEC A; 4ESP A; 3CPT B; 2JKF A; 3NUL A; 3UB5 P; 1CF0 A; 1Z09 A; 3L7H A; 1PNE A; 2ZL1 B; 1FIL A; 1SKO B; 5EV0 A; 4X1M A; 1CJF A; 3T1S A; 3T1X A; 1Y4O A; 3T12 B; 1PRQ A; 4FTX A; 1A0K A; 2PRF A; 2V8F A; 3D9Y A; 2BTF P; 2HZ5 A; 2E8J A; 2V8C A; 3T1Q B; 1VET A; 3DAV A; 5EM0 A; 4X25 A; 2VK3 A; 1G5U A; 3KYE A; 4X1L A; 3MSH A; 2B95 A; 4D60 A; 1SZV A; 1YPR A; 1CQA A; 1K0K A; 3U4L P; 3MS6 A; 1FIK A; 1ACF A; 2ACG A; 1VET B; 1VEU A; 4QWO A; 3LGO A; 1F2K A; 1D1J A; 5FEF A; 3L9K A; 5FEG A; 5EVE A; 1AWI A; 1J3W A; 3CHW P; 5EM1 A; 5FDS A; 1HLU P; 1VEU B; 3CPT A; 3LEQ A; 1PFL A; 4FUW A; 2ZL1 A; 3T1R A; 2PAV P; 1SKO A; 2JKG A; 2PBD P; #chains in the Genus database with same CATH topology 3IX3 A; 4ESP A; 4MDZ A; 3ZDJ A; 1S0W A; 4O0P A; 4OQI A; 3W2Z A; 2H5S A; 1CF0 A; 2HDS A; 2ZMF A; 3LIE A; 3OLO A; 2HP9 A; 3HUO A; 5EOO A; 4OVD A; 4U3T A; 3H82 A; 1UGU A; 2ZD8 A; 1NYM A; 2QWS A; 4PM6 A; 4LRZ E; 2ZLY A; 1VHM A; 3HLG A; 3QNB A; 2ZOI A; 5G4Z A; 1SDN A; 3ICY A; 2XQZ A; 2BTF P; 4E3L A; 2W3H A; 1ONH A; 2HF6 A; 2EFX A; 3LEZ A; 3KYQ A; 3LO7 A; 3QP4 A; 4GJ4 A; 3QP2 A; 4HP9 A; 3VMA A; 3ZGA B; 3JYI A; 1JVJ A; 4WEK A; 4KUK A; 4JF5 A; 4DXC A; 4KZB A; 5HL1 A; 4EBP A; 4CJN A; 4WBG A; 3PBQ A; 4GW9 A; 4CQH A; 4OOY A; 1MWR A; 2PR5 A; 1S66 L; 2EX8 A; 5IS1 A; 1BZA A; 3MKF A; 2WAE A; 4LLO B; 3WS5 A; 1YM1 A; 5EVI A; 2MJ6 A; 4E04 A; 3MR0 A; 4P6B A; 1BLC A; 3TRC A; 2L1M A; 4N1X A; 3K3D A; 4JKT A; 1YSQ A; 2K31 A; 3LI8 A; 2JBF A; 2W1R A; 3FPV A; 2Y2K A; 5KMW A; 4RQ9 A; 1L2S A; 1CI9 A; 5CXW A; 3M2J A; 3NUL A; 3E2L A; 4HNB A; 2VKS A; 3OPP A; 2ZM0 A; 5HAQ A; 3VSK A; 2ZL1 B; 1KVL A; 1KDW A; 4EWF A; 2HDQ A; 4JGQ A; 1IYP A; 4A5R A; 2FFF B; 2VV7 A; 3VFF A; 1OJ5 A; 3MQ0 A; 3TOI A; 5JYP A; 1GHI A; 4DXB A; 3ZG5 A; 4KG6 A; 1A0K A; 3EGD C; 2Z6C A; 1OTD A; 3ULF A; 1EI5 A; 2VZW A; 3CUE C; 3G4P A; 5EPH A; 3QP1 A; 5CEB A; 2R9X A; 4EV4 A; 1G68 A; 1K25 A; 1VET A; 3H82 B; 3IX4 A; 1XGJ A; 3ZG8 B; 5FI6 A; 4BL3 A; 2VK3 A; 2WAF A; 3N6I A; 4G3K A; 4YWZ A; 3OC2 A; 4DE3 A; 1D7E A; 3G2Y A; 4O8G A; 3ZCZ A; 4JLF A; 4R0Q A; 1XGI A; 3U4L P; 1YLZ A; 2L4R A; 1BUE A; 4K0X A; 1H0M A; 4UA9 A; 1IYO A; 2ZM8 A; 3NDG A; 4BQM A; 1KOU A; 4B93 A; 1PWC A; 4F3L A; 1F2K A; 3VP4 A; 4LV1 A; 3F1O A; 5FAT A; 5FAQ A; 4DMZ A; 5FEG A; 2RCX A; 3HRE A; 5BOH A; 1YLP A; 3G6O A; 3B47 A; 4ME4 A; 3A0V A; 4RX3 A; 3ZFZ A; 1WYB A; 3CPT A; 2OV5 A; 2XEP A; 4BBU A; 5FQQ A; 2XLN A; 3SH7 A; 2VGJ A; 1XXM A; 4QY5 A; 4UQI S; 5HX9 A; 3UPN A; 1YQS A; 3HBR A; 1YT4 A; 4JXV A; 2BG1 A; 3LR4 A; 5EVI B; 3WS1 A; 4WF0 A; 3RH8 B; 5A93 A; 1BYW A; 4KZ9 A; 1GCE A; 1GA9 A; 3BYD A; 4IVI A; 1LL9 A; 1XJ2 A; 1FIL A; 2W3E A; 4LEN A; 2HP5 A; 3A0R A; 3HUM A; 1ZKJ A; 1KGF A; 1L0G A; 5E2H A; 5CRF A; 3EEA A; 3E98 A; 4JBF A; 5FQK A; 3A0S A; 3IF6 A; 3SS4 A; 1F5M A; 4BEN A; 5HWW A; 3D4F A; 1T1C A; 3Q7V A; 3HVF A; 2IA2 A; 5F5Y A; 4BD0 A; 2VV6 A; 4YIN A; 1F98 A; 4O7D A; 3UB6 A; 4F94 A; 1SZV A; 1YPR A; 4ETX A; 3NHQ A; 3IWO A; 5DFY A; 1VET B; 3CMZ A; 2EA9 A; 2QMI A; 2O9C A; 4QWO A; 2WKI A; 2IWB A; 4FSF A; 2C5W B; 3BFG A; 1W63 Q; 2R9W A; 3BM6 A; 5CHM A; 3QP5 A; 4GKU A; 4HP4 A; 3OPL A; 2DMW A; 2ZQC A; 4GB7 A; 3S4X A; 2PD8 A; 3BEB A; 2UV0 E; 3EGX C; 3MJQ A; 3MFX A; 4F3L B; 1K54 A; 1ESU A; 4NEE D; 4R1G A; 4BMW A; 3BFD A; 4K91 A; 2J9O A; 4OPZ A; 3FYZ A; 1G6A A; 3GV9 A; 2PBD P; 1BUL A; 1IYS A; 2PDR A; 3IHB A; 3FKW A; 3C7U A; 4LV3 A; 3CPT B; 2O9B A; 4WZ5 C; 1ODV A; 2VJW A; 1FCM A; 3VP3 A; 1ES5 A; 5GL9 A; 4EUV A; 4MBF A; 1I2S A; 3PBT A; 3HLD A; 2W3D A; 1S1Z A; 4RYE A; 3HLE A; 4HJ3 A; 2G7U A; 1JTD A; 2HJ9 C; 3W4P A; 1XJ3 A; 4HBT A; 4ID4 A; 2ZM2 A; 3F1N A; 3PBO A; 4HI4 A; 4AFI A; 2PD7 A; 3VOY A; 3FV7 A; 3NIA A; 2QYB A; 3VE4 A; 4D2O A; 1G5U A; 1EW0 A; 3PAG A; 2B95 A; 4Q0I A; 3IF6 B; 3UPO A; 4Y0O A; 3C38 A; 3Q7V B; 1MPL A; 1NZU A; 5J4E A; 2Q9N A; 1PIO A; 2ZQD A; 2Y2O A; 4IVK A; 4M4X A; 2G2U A; 5E2E A; 5EVE A; 1L3L A; 3HLB A; 5AVF A; 4S2I A; 1IEL A; 4Y0T A; 2GNX A; 4O01 A; 3VFH A; 1ESI A; 3DWZ A; 4EUZ A; 2A2L A; 3OOV A; 3GSG A; 5FL3 A; 3BWL A; 4B9O A; 5FAP A; 1PW1 A; 2W3G A; 2ZC4 B; 1Y54 A; 2JKG A; 2Z2M B; 3UB7 A; 4YFM A; 4MN6 A; 1TS0 A; 3NOT C; 3LR5 A; 1K38 A; 2OWH A; 4Y17 A; 5GLB A; 3V50 A; 5KSH A; 3C7V A; 4OPY A; 4X56 A; 2WGI A; 4PM9 A; 1W7F A; 3A3I A; 4MCW A; 1NRJ A; 4DJ2 A; 3N8L A; 2B02 A; 2K7S A; 1LSV A; 2ZC7 A; 5HAR A; 3W8K A; 1IOU A; 3IHA A; 4X53 A; 3IQA A; 3IX8 A; 1CK3 A; 3PHY A; 5E43 A; 3S7N A; 5EVI C; 2Y2J A; 3G30 A; 3NI9 A; 2K2N A; 5EM0 A; 4N9K A; 4EQ1 A; 1YMX A; 4I5S A; 2XFS A; 2IWC A; 3I7J A; 1YKD A; 3JVU A; 4PM5 A; 4NXG A; 2A3U A; 5AQ9 A; 4QPR A; 5F68 A; 3F1N B; 1JTG A; 4ZBE A; 4HY8 A; 4D60 A; 4DKI A; 2FZ0 A; 3VE3 A; 4JXS A; 3SH9 A; 4JXG A; 1NY0 A; 1LSX A; 5HD3 A; 5FEF A; 4G3V A; 2Y2P A; 4GOG A; 1G6O A; 4MMN A; 4UAA A; 2O0Y A; 4WUJ A; 1FOF A; 2INW A; 3LEQ A; 4OKP A; 1IKI A; 1K4F A; 5F6A A; 5DFX A; 1BTL A; 1ERO A; 1PZP A; 3KSG A; 2P74 A; 5TBM A; 3H7W A; 2M7U A; 2WZZ A; 5F83 A; 4IBR A; 5FAS A; 2WK0 A; 3GRJ A; 2JKF A; 4IHQ A; 3S7Q A; 3TW8 A; 3UB5 P; 3BY8 A; 2I9V A; 2Z2L B; 3P09 A; 1PNE A; 3P7N A; 1JWP A; 4HJ6 A; 4KZA A; 2V1B A; 2O99 A; 4PHT A; 1ONG A; 1XA7 A; 3LFV A; 1NXY A; 3VSL A; 1Y4O A; 3V5M A; 2CMN A; 4ZJ2 A; 2CC1 A; 4DN0 A; 3NBL A; 5CGW A; 4ZRR A; 4EBL A; 1QME A; 5FSR A; 2ZC6 B; 3A3D A; 2BAS A; 1MWT A; 3GQZ A; 2XD1 A; 4B4X A; 3FG8 A; 1LL8 A; 5L07 A; 1MXO A; 1NRF A; 4CLC D; 3B42 A; 4HES A; 3WS2 A; 4X68 A; 1OTB A; 1MKM A; 3EWK A; 3MS6 A; 4WYY A; 1OME A; 4WL9 A; 2Y91 A; 1MZU A; 3UDF A; 4OH0 A; 1ZTU A; 5CEC A; 2PYR A; 4C6Y A; 3UE6 A; 3IBJ A; 3QP8 A; 3MQQ A; 3CHW P; 5HDC A; 3D3O A; 2PHY A; 2V1Z A; 2A49 A; 3BEC A; 4ZTK A; 5E2G A; 3T4S A; 3IH8 A; 4LV2 A; 5AQB A; 3CLO A; 1KE3 A; 3IF6 C; 5HPF A; 1OPX A; 2D02 A; 2O9A A; 4Y7P A; 2Y8H A; 3HJI A; 2Y55 A; 3O87 A; 4OLD A; 3IS2 A; 2DNS A; 4HQA A; 3RXX A; 3O88 A; 3VP0 A; 5DTS A; 2VA0 A; 1ZG6 A; 2XK1 A; 5TBM B; 4FCF A; 3H7W B; 5A92 A; 1T1A A; 5TGF A; 4WEL A; 2X71 A; 1KE4 A; 2H28 A; 1DY6 A; 3IXH A; 3ZQ5 A; 5FQI A; 1RP5 A; 2HJE A; 5FQJ A; 3GR2 A; 1IKG A; 4GN2 A; 4E3N A; 1GA0 A; 1OT9 A; 1XFQ A; 3T1Q B; 5GLD A; 3G32 A; 1N4O A; 3GMW A; 2WUQ A; 1K54 C; 3UB9 A; 4L0L A; 5FI7 A; 3UY6 A; 1W8Q A; 2AVX A; 5GHY A; 1OJG A; 2J3T D; 5TJJ A; 1D1J A; 3ZG9 B; 1DJA A; 3IBR A; 3MF0 A; 4BL2 A; 5HZH A; 4IJG A; 4BBT A; 4C3Q A; 3C8C A; 1Z6F A; 1YMS A; 5GLC A; 1O7E A; 5MC7 A; 5EM1 A; 1YLW A; 3SS5 A; 1XKZ A; 4DF6 A; 5FDS A; 1ZG4 A; 1JWZ A; 1ERM A; 1WE4 A; 3BQA A; 2RL3 A; 4DRT A; 4UHU A; 3KYZ A; 3T1R A; 4S2P A; 5CGS A; 1YLT A; 5FA7 A; 2GDN A; 1UWN X; 2QKP A; 4OPR A; 4CLC A; 1N9B A; 2UWX A; 5F1G A; 3A3F A; 4GCZ A; 2OLV A; 4OOM A; 1H8M A; 3MXQ A; 3NDE A; 3T4Q A; 4MLL A; 5CER A; 4I3I A; 5EEC A; 3O5Y A; 1HD8 A; 3IT9 A; 3TSG A; 4X1M A; 4KZ8 A; 4IBX A; 5FQM A; 1LT0 A; 4R3J A; 5KZH A; 3IS2 B; 4FTX A; 3WS0 A; 2WAD A; 5IHV A; 1PI5 A; 3DTM A; 4HH2 A; 4NET A; 4GLQ A; 4WZ4 A; 4P6Z M; 1XA1 A; 3MQO A; 1DP8 A; 4JPM A; 1DJB A; 3B33 A; 2HZ5 A; 5EVL A; 5HW3 A; 4EW7 A; 2E8J A; 2ZOH A; 2Q9M A; 2ZQA A; 3KX0 X; 3V3R A; 5L09 A; 3VOZ A; 2J9P A; 3KYE A; 4JGR A; 1IEM A; 1CEG A; 4H6J A; 4XT2 A; 2WKE A; 4N1H A; 1CQA A; 1K55 A; 3LY3 A; 3LI9 A; 2Y4A A; 4UEY A; 4DE1 A; 1V9Z A; 3D72 A; 1IYQ A; 2HGV A; 5K5B A; 2EXA A; 3EEH A; 4P85 A; 3ZNY A; 3ISG A; 1LL5 A; 3BQ8 A; 5FI2 A; 1J3W A; 4PAU A; 4Z1W A; 4GDB A; 4EBN A; 2HP6 A; 3HLF A; 1PI4 A; 4JF6 A; 4IUH A; 3ZVT A; 4GS9 A; 1PWG A; 1TVF A; 3PXP A; 1BSG A; 5HWT A; 2VX8 A; 2WGW A; 4FD8 A; 3OBF A; 1KGG A; 1SKO A; 2B18 A; 3R4K A; 2XA7 M; 3FKV A; 5AJG A; 4Q0J A; 2V0U A; 1FR6 A; 3FPW A; 1TDL A; 1LLB A; 4LCL A; 1XP4 A; 2JN7 A; 2V9A A; 1Z09 A; 3VOL A; 4CLC B; 4XUX A; 1Q2P A; 4ARZ A; 2P08 A; 4EEP A; 3NOU C; 4FH4 A; 5EV0 A; 1CJF A; 1FR1 A; 5DJU A; 1DRM A; 2PU2 A; 1HVB A; 1SDE A; 4Y0U A; 3G31 A; 4Y3I A; 1SKF A; 2JKR M; 3BFC A; 3V3S A; 1ZHH B; 1XFN A; 4IED A; 2J7V A; 2V8F A; 3VP1 A; 4OP5 A; 2ZQ8 A; 4QU3 A; 3SH8 A; 2BLS A; 1X0O A; 4OQ0 A; 3EQV A; 3UDI A; 4WLA A; 2V8C A; 4II7 A; 4YNR A; 3MXR A; 4KZ7 A; 5C5K A; 2KDK A; 2V2F F; 1I5Q A; 1MWS A; 5CTN A; 1WYC A; 1I2W A; 4JF4 A; 1W5D A; 5FDH A; 2ACG A; 2ZQ9 A; 1EWZ A; 3BLM A; 3NY4 A; 2VGL M; 2B5R A; 3W4O A; 4S2J A; 4H6J B; 4XT2 B; 4GD8 A; 2LB9 A; 4OQH A; 2Y2G A; 3NCK A; 4PMA A; 3IWI A; 2HPB A; 5DTT A; 5IT5 A; 3FWL A; 3FZC A; 2ZMA A; 2XA7 S; 1NLY A; 2A24 A; 2DRW A; 3H9W A; 1PYY A; 4GD6 A; 4KZ3 A; 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1P9W A; 2WZX A; 4ZAM A; 1GSX A; 3UE1 A; 4BLM A; 4E3M A; 5DF8 A; 2IWD A; 2FH5 A; 3CAX A; 2QZ6 A; 3V39 A; 1LSW A; 2OLU A; 2XSS A; 3K3C A; 4E3I A; 2ZC3 B; 4X1L A; 3N8S A; 4RX2 A; 1S67 L; 5E2F A; 5M19 A; 5M18 A; 4CLC C; 4S2N A; 1FIK A; 5A8B A; 4BJP A; 4MN7 A; 2VGK A; 2NUP C; 4GHI A; 2DCF A; 5A91 A; 4E3J A; 1N9L A; 1KGE A; 1BLH A; 2HDU A; 4E3K A; 3WRT A; 4KQQ A; 2OAQ 1; 2YKH A; 2ZJ9 A; 3M2K A; 1YLY A; 2W1T A; 1TS8 A; 3G35 A; 1VEU B; 5FAO A; 5EFW A; 1MY8 A; 3LYX A; 1GHP A; 5CTM A; 4H8R A; 4HBU A; 4EXO A; 1NYY A; 1GHM A; 5GHX A; 3NEC A; 4ZJ1 A; 2PBY A; 2OAP 1; 3RFB A; 3IH9 A; 2Y2H A; 5DKL A; 3UB8 A; 2WKP A; 3PBR A; 4FOF A; 2ZQ7 A; 1G28 A; 2G2W A; 4P87 A; 2Y2I A; 4RA7 A; 4MBH A; 2JKR I; 1K55 C; 4I39 A; 1W79 A; 3HCY A; 3WS4 A; 4Y13 A; 4DE2 A; 3PR6 A; 1E3U D; 4WMC D; 2EXB A; 2EX9 A; 3ZVW A; 1FCO A; 4PKY G; 3DTK A; 4LFU A; 5L2F A; 2ZC5 B; 3GEC A; 3S7O A; 4RVA A; 4L9E A; 2M1C A; 3CIT A; 2WKR A; 1W63 M; 2Y2M A; 1ERQ A; 4UA7 A; 3UO9 A; 4NG2 A; 4KUO A; 4U0T A; 2HDR A; 3IXG A; 4IUK A; 1K57 A; 4DE0 A; 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