The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
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sequence length |
139
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structure length |
139
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Chain Sequence |
AGWNAYIDNLMADGTCQDAAIVGYKDSPSVWAAVPGKTFVNITPAEVGILVGKDRSSFFVNGLTLGGQKCSVIRDSLLQDGEFTMDLRTKSTGGAPTFNITVTMTAKTLVLLMGKEGVHGGMINKKCYEMASHLRRSQY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The structure of an open state of beta-actin at 2.65 A resolution.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Complex (acetylation/actin-binding)
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| molecule keywords |
BETA-ACTIN
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| total genus |
44
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| structure length |
139
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| sequence length |
139
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-05-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| P | PF00235 | Profilin | Profilin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2BTF P; 3KYE A; 3LGO A; 1PRQ A; 3UB5 P; 3T1S A; 1A0K A; 2HZ5 A; 2JKF A; 3NUL A; 3DAV A; 3CPT B; 1CF0 A; 2E8J A; 5EV0 A; 1VET A; 1J3W A; 5EM1 A; 2ACG A; 1FIL A; 1ACF A; 3LEQ A; 5FEG A; 1SKO A; 2PAV P; 3T1R A; 3MS6 A; 2PBD P; 2JKG A; 2PRF A; 1Y4O A; 3T1X A; 4D60 A; 1VEU B; 4X1M A; 1SZV A; 4QWO A; 4ESP A; 1CQA A; 4X1L A; 3T1Q B; 1VEU A; 1CJF A; 3NEC A; 3CPT A; 3T12 B; 4FTX A; 4X25 A; 3D9Y A; 2VK3 A; 1VET B; 2B95 A; 1FIK A; 2V8C A; 2ZL1 B; 5EVE A; 3L9K A; 1PNE A; 1PFL A; 3L7H A; 1HLU P; 1F2K A; 1SKO B; 2V8F A; 3CHW P; 4FUW A; 1G5U A; 5FEF A; 5EM0 A; 5FDS A; 1Z09 A; 1AWI A; 1K0K A; 2ZL1 A; 1YPR A; 3MSH A; 3U4L P; 1D1J A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2OLU A; 2AVX A; 1BLS A; 4WYY A; 3Q7V B; 5TJJ A; 3LR4 A; 2B18 A; 1JWP A; 3T1S A; 3HUN A; 2Z6C A; 4Q0J A; 3GSG A; 2A24 A; 4PHT A; 1K56 D; 3GVB A; 4HNB A; 4OPY A; 4NXE A; 4MEZ A; 4X6T A; 3SOI A; 4YWZ A; 3E2L A; 4E3N A; 2K31 A; 1XP4 A; 4II7 A; 1BLH A; 2H0T A; 5G4Y A; 4DRT A; 1SKO A; 4S2O A; 2PBD P; 4GD6 A; 2QKP A; 1K54 A; 2HPB A; 1YKD A; 3MBZ A; 2J9O A; 2WYX A; 4CLC D; 4LRX C; 4EUV A; 1SDE A; 1TDL A; 4R4R A; 3SW1 A; 2XRO A; 2IA2 A; 5HAI A; 2G7U A; 1YLJ A; 2OV5 A; 1G6A A; 4HBT A; 4JXS A; 3ZQ5 A; 4PM8 A; 3UE6 A; 3MF0 A; 1CI9 A; 1YAX A; 3T1Q B; 3OZH A; 5FA7 A; 3LID A; 4I5S A; 3G30 A; 4EET B; 5FI2 A; 3QP6 A; 1VET B; 3NI9 A; 4FH4 A; 2IWD A; 4KQO A; 3BYD A; 5HD3 A; 3V3R A; 1N9O A; 2FH5 A; 3IBR A; 1YLW A; 4QU3 A; 1XJ6 A; 2EXB A; 4OLG A; 5LBR A; 3G6O A; 2WKE A; 4Z9Q A; 3T4O A; 2ZQ9 A; 1D7E A; 2O9B A; 3IH8 A; 4WMC A; 1PW1 A; 2CMN A; 3D4F A; 4OPQ A; 2XGN A; 3CIT A; 1GHP A; 4XUZ A; 4WEL A; 2VX8 A; 3C38 A; 3EEA A; 2V9A A; 4S2K A; 1PWC A; 3IX3 A; 5IS1 A; 4XUX A; 5CHJ A; 4R70 A; 1AXB A; 4P0M A; 2XFT A; 3JYI A; 1ONH A; 4F3L A; 5HD5 A; 3WRZ A; 2Q0O A; 3OCN A; 5G4Z A; 5A91 A; 4LV1 A; 5CRF A; 5FQJ A; 1YMS A; 3N4I A; 3A3I A; 5F1G A; 3PYP A; 1Y54 A; 1H8Z A; 2XEP A; 1F9I A; 1SZV A; 3PBQ A; 1MKM A; 4H8R A; 4Q0H A; 3T4Q A; 4JF4 A; 3G35 A; 1GA9 A; 4K08 A; 1DRM A; 4O7D A; 1KGE A; 3MJQ A; 2GNX A; 5CER A; 2W27 A; 1O07 A; 4OQG A; 2ZQA A; 5DKK A; 3HJI A; 1YLT A; 3H82 B; 5HZH A; 4KQR A; 2XR0 A; 1XJ4 A; 4MDZ A; 4ETZ A; 3IF6 C; 4P6B A; 4CLC E; 2VK3 A; 3BFE A; 1G6O A; 3LIF A; 4N92 A; 4LV3 A; 1W5D A; 1BUL A; 3CI6 A; 5CEC A; 4E3M A; 3HLE A; 5GLA A; 1KGG A; 3E4P A; 4R3J A; 1YLZ A; 1LHY A; 4DJ3 A; 4R23 A; 2W3D A; 4OVD A; 1Z09 A; 4JXW A; 4GDN A; 3ZG7 B; 2ZD8 A; 2XFS A; 5HSQ A; 5CGW A; 2GX5 A; 3UE0 A; 5G18 A; 2QWS A; 1MZU A; 3H9W A; 4BD0 A; 3QNB A; 1GSX A; 1NLZ A; 5TGF A; 1OTD A; 1KDS A; 1MXO A; 2L0W A; 2HZ5 A; 3N8S A; 3Q82 A; 1IEL A; 4OH0 A; 2EX8 A; 3BQ8 A; 3N8L A; 1S4R A; 3IF6 B; 2JKT I; 2ACG A; 1Q2Q A; 2Y2J A; 2Z2L B; 3IXD A; 2A3U A; 3M2K A; 1W63 M; 3B47 A; 4JGQ A; 2P7J A; 1YLY A; 1BLP A; 1RGZ A; 4E3O A; 4Y13 A; 4UAA A; 4Y2F A; 1CK3 A; 3S4X A; 4KZB A; 3HUM A; 3NCK A; 4ZJ2 A; 1YLP A; 5HAP A; 1SDN A; 2C6W B; 1FCN A; 2OWJ A; 4H6J A; 5L8M A; 5HDD A; 4RX2 A; 4X25 A; 4ARZ A; 1E3U A; 1XXM A; 2ZQ8 A; 2HDU A; 3E0Y A; 2IWB A; 4S2N C; 2B95 A; 4JXV A; 4KZ9 A; 3CJM A; 1L0F A; 3HLW A; 4N1H A; 1PNE A; 1KE3 A; 1M6K A; 4RYE A; 1HLU P; 4EES A; 2J3T D; 2V8F A; 4OP8 A; 1ES5 A; 3ZG9 B; 2BLS A; 3W2Z A; 1OME A; 3G32 A; 4GCZ A; 4HIA A; 2FFY A; 3FYZ A; 3V67 A; 3MQQ A; 5HWW A; 4IUK A; 3CMZ A; 5IU1 A; 1EI5 A; 3UPP A; 3HLD A; 3BFC A; 2V2F F; 2PD8 A; 1EWZ A; 4RA7 A; 2LB9 A; 1L0G A; 3GTC A; 3ZG0 A; 2VV7 A; 4QB8 A; 1GCE A; 1K6S A; 3FKW A; 3UDF A; 3UPN A; 3PBO A; 5CED A; 2HJE A; 3WS2 A; 5FAT A; 3TOI A; 1CF0 A; 3GEC A; 1PW8 A; 1YSP A; 4WBG A; 4DE1 A; 4PPR A; 5M1A A; 5EVI A; 1HVB A; 2WZZ A; 3LEQ A; 3PR6 A; 2RL3 A; 3G2Y A; 4GLQ A; 4R6L A; 3A3E A; 4KG2 A; 1G28 A; 5F1F A; 4K91 A; 5BOH A; 3IH9 A; 4N1X A; 4BWI A; 1TVF A; 1YMX A; 2EXA A; 3DW0 A; 5DFY A; 2HDQ A; 2M1C A; 4R4S A; 3AGE A; 1FOF A; 1K38 A; 3BW6 A; 3O88 A; 2JHE A; 4HQA A; 4DE2 A; 1MWU A; 3W4P A; 4JF6 A; 2R9W A; 5DF7 A; 1WA9 A; 2QPN A; 3M6B A; 4R3A A; 5EPH A; 3MQ0 A; 4BBU A; 2DCF A; 1KVL A; 1S0W A; 2ZL1 B; 1QME A; 1SKO B; 5FAQ A; 3HLG A; 3QP1 A; 5HDC A; 3ZG5 A; 3LY4 A; 3VP0 A; 5L09 A; 3HLF A; 4MN7 A; 2EA9 A; 5EM0 A; 5FDS A; 3FG8 A; 3MZF A; 3BFG A; 2WKR A; 3N8R A; 1PIO A; 3UE1 A; 1L2S A; 2Y2K A; 1XGJ A; 4U0T A; 4EBP A; 3KSF A; 3ZG8 B; 4OP5 A; 3LY3 A; 3KSG A; 4NKP A; 4UQI M; 4X55 A; 4KEN B; 3KYE A; 1ERQ A; 4U3T A; 1XPB A; 2X71 A; 3FZC A; 4IUH A; 2J8Y A; 1HZO A; 4K0X A; 4Y0O A; 4FCF A; 3IQA A; 5FQI A; 3H7W B; 1ACF A; 5F69 A; 3NDE A; 4MN6 A; 4LV0 A; 4FSF A; 3WS4 A; 2UV0 E; 3CUE A; 4X1M A; 3V3S A; 4WZ5 C; 1W8Q A; 5E2G A; 1NXY A; 3IX4 A; 4HEF A; 3EEH A; 1XX2 A; 2GJ3 A; 4GHI B; 1CQA A; 1I2W A; 3ZGA B; 2W1R A; 1XJ3 A; 3RTY A; 2K7S A; 4KQQ A; 4G3K A; 1VEU A; 4EWF A; 3NEC A; 3QP8 A; 2A49 A; 4EBL A; 4C75 A; 2H0Y A; 1E25 A; 3KX0 X; 4CLC A; 4HJ3 A; 5HFO A; 3ZNT A; 3G4P A; 1N4O A; 5TBM A; 3P98 A; 3TE8 A; 3A0S A; 4S2J A; 4HJ6 A; 5CGX A; 1GHM A; 4I39 A; 3KO6 A; 1TD5 A; 3LYX A; 1NZU A; 2JC7 A; 1FCO A; 3WRT A; 4EW7 A; 3HRE A; 2WAE A; 3ZVT A; 5HPF A; 1AWI A; 1NY0 A; 5CTM A; 4B88 A; 4I3J A; 4UA7 A; 1PYY A; 1D1J A; 5D3O A; 3BLS A; 1RCJ A; 2PYP A; 1XKZ A; 5GHX A; 3K3D A; 1A0K A; 1LL5 A; 3DAV A; 4MBF A; 3SH9 A; 3BM6 A; 4ZJ3 A; 4GOG A; 5DF9 A; 4B93 A; 5CEB A; 2VV6 A; 3V50 A; 4KZ4 A; 2PAV P; 5I5L A; 4QPR A; 5J4E A; 2XF3 A; 4CPK A; 2QHK A; 3U2A A; 4D60 A; 5EE8 A; 3OPH A; 3VP1 A; 1BT5 A; 3P09 A; 3VP3 A; 3UDI A; 1N9L A; 3VP4 A; 1XGI A; 5M19 A; 2ZC6 B; 1ODV A; 2PBY A; 4LGW A; 5J3W A; 1W79 A; 5E2E A; 2HP9 A; 4Y0T A; 4DXC A; 4PAU A; 1STZ A; 4EEP A; 4HH2 A; 4PM5 A; 4HH3 A; 2YKF A; 3UB8 A; 1FQG A; 1O7E A; 3MZE A; 3S22 A; 3C30 A; 4DF6 A; 3A3F A; 1FIK A; 3S7O A; 2V8C A; 5FL3 A; 3NOU C; 3EGD C; 4QD4 A; 2VGL S; 3ZNY A; 3EQU A; 2GDN A; 2Y91 A; 4GB7 A; 5FAP A; 2JKT M; 5HL1 A; 4FD8 A; 4OQI A; 2PR6 A; 2E8I A; 1NLY A; 2Y2Q A; 2Y2O A; 4IBX A; 1L3L A; 3AGD A; 4Y0U A; 4Y3I A; 1BLC A; 3VE4 A; 3OPR A; 5HW3 A; 3UB9 A; 3LEZ A; 1FSW A; 1NYM A; 4ZBE A; 3GR2 A; 4S2M A; 2Y2I A; 4IVK A; 5JYP A; 1ESU A; 4OLD A; 1TS7 A; 3F1P A; 1FIL A; 5EVI C; 4NK3 A; 3IT9 A; 3ZHH A; 2W0N A; 4QY6 A; 5DJT A; 3BFF A; 2M7V A; 4HHD A; 3HCY A; 2FFF B; 3BQA A; 1Y4O A; 3EQV A; 1DP9 A; 4L9F A; 3LR3 A; 3IF5 A; 2KX6 A; 4QY5 A; 4P87 A; 4BD1 A; 4DE3 A; 4Z1W A; 4JXG A; 4KZ7 A; 3T4S A; 2ZMV A; 2V1A A; 1JTG A; 1OTB A; 4NXG A; 3PTE A; 3VOY A; 2NUP C; 1OTA A; 2QYB A; 1CEG A; 1PZP A; 1XFN A; 4MMN A; 4OPZ A; 2XD5 A; 3M2J A; 2BAS A; 3MKF A; 5KMW A; 3F1N A; 2EX9 A; 5EVI B; 4GS9 A; 1PFL A; 2P9V B; 4O01 A; 3ZVW A; 1H5X A; 5HL6 A; 4OKP A; 3O86 A; 3RFB A; 5A92 A; 1TDG A; 2Y2M A; 3DTI A; 1MPL A; 1DP6 A; 5L10 A; 1H8Y A; 1GHI A; 5TR7 A; 3C8C A; 4X53 A; 4EQ1 A; 1N9B A; 2A2L A; 1NZO A; 3MZD A; 4KUK A; 4WUJ A; 4XT2 A; 4B4X A; 4WEK A; 4S2I A; 1N9N A; 2PR5 A; 1BYW A; 1H8M A; 2DNS A; 1OTE A; 1UWP X; 3IHB A; 4PM9 A; 4MCW A; 2JKR M; 3LFV A; 1YSQ A; 3R7W B; 4R0Q A; 4RVA A; 4YFM A; 2KOI A; 5E2F A; 3C4O A; 4GJ4 A; 3ZYT A; 1J3W A; 1L0D A; 1V9Z A; 1JWZ A; 4MNR A; 5F5Y A; 2KDK A; 5KZH A; 4Y17 A; 2R78 A; 4Y5F A; 4E3I A; 2XH9 A; 2IWC A; 2Q9N A; 4YNR A; 4EV4 A; 3CUE C; 3BRM A; 3O5Y A; 4WL9 A; 3IXG A; 3MR0 A; 1KE0 A; 1KE4 A; 2ZC7 A; 1JWV A; 1K55 C; 1LL9 A; 2OAP 1; 4UA6 A; 4HBU A; 4RX3 A; 1MY8 A; 1LL8 A; 2VJW A; 3IX8 A; 2QJ5 A; 1JNU A; 2JN7 A; 3FWL A; 4PKY G; 2WGW B; 2I9V A; 1BTL A; 1K6R A; 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2O9C A; 3UE3 A; 4OQH A; 4Q8I A; 5A8B A; 1ES2 A; 2A24 B; 1D06 A; 1VB6 A; 2WZX A; 2EX2 A; 3CAX A; 2PU2 A; 2V1B A; 5A90 A; 4A5R A; 4FH2 A; 2OLV A; 2XA7 S; 5GLC A; 4U0X A; 1MKI A; 4L9E A; 2E8J A; 3BFD A; 4XXR A; 4PMA A; 1NWZ A; 5F6A A; 1BSG A; 4LV2 A; 4OQ0 A; 3PAG A; 4JBF A; 2Y8H A; 1S4S A; 3IS2 A; 2J3W A; 4EQI A; 3CZD A; 3Q1F A; 1ERO A; 1ESI A; 3IF6 A; 1LLB A; 4HY8 A; 5CHM A; 2WKH A; 1ZG6 A; 5EUA A; 4E6W A; 4E6X A; 2WAF A; 4ME4 A; 4X1L A; 2WKI A; 1W8Y A; 1DJA A; 1JVJ A; 2W3G A; 2XQZ A; 3MQO A; 3AGF A; 1PI5 A; 1CJF A; 2P74 A; 5DVA A; 3LO7 A; 3NOP C; 5F82 A; 3EOI A; 5EVI D; 2Y79 A; 2ZMF A; 3Q7Z A; 2OOL A; 1K56 A; 2ZC4 B; 3F1P B; 3HBR A; 1F2K A; 4JKT A; 3C2W A; 1NRJ A; 3LCE A; 4D2O A; 1UGU A; 1Q2P A; 2H5S A; 2CC1 A; 4BEN A; 2VKS A; 1MC0 A; 1SKF A; 4F3L B; 3FKV A; 4BBT A; 1YPR A; 2HF6 A; 3NBL A; 3S7Q A; 1X0O A; 4MLL A; 3W4O A; 3LI8 A; 5GLD A; 3BY8 A; 5DKL A; 5K5B A; 1TS6 A; 3CWF A; 2JKF A; 1GA0 A; 3OOV A; 1OPX A; 3IHA A; 4S2L A; 3ULF A; 2PHY A; 1TS0 A; 2PD7 A; 4NXF A; 4X69 A; 1OTI A; 3G31 A; 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