The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
23
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sequence length |
136
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structure length |
136
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Chain Sequence |
SDMTRDGLANKALAVARTLADSPEIRQGLQKKPQESGIQAIAEAVRKRNDLLFIVVTDMQSLRYSHPEAQRIGQPFKGDDILKALNGEENVAINRGFLAQALRVFTPIYDENHKQIGVVAIGLELSRVTQQINDSR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The NMR structure of the sensory domain of the membranous two-component fumarate sensor (histidine protein kinase) DcuS of Escherichia coli.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| molecule keywords |
SENSOR PROTEIN DCUS
|
| total genus |
23
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| structure length |
136
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| sequence length |
136
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| ec nomenclature |
ec
2.7.13.3: Histidine kinase. |
| pdb deposition date | 2003-07-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Beta-Lactamase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3F1N B; 3NHQ A; 3C8C A; 1XFQ A; 3H7W A; 3ICY A; 4I38 A; 3FG8 A; 4GS9 B; 2B02 A; 1T1B A; 5IS1 A; 2VV6 A; 3G6O A; 4I3A A; 1EW0 A; 4RQ9 A; 3H9W A; 4HP9 A; 4R6L A; 3LIF A; 4LLO B; 4EES A; 3MQO A; 1F98 A; 1OTI A; 2PD8 A; 1GSW A; 5F6A A; 1UWN X; 4YWZ A; 2BAS A; 1OJ5 A; 4H6J B; 4NXB A; 1TS0 A; 1NWZ A; 1OTE A; 2WKQ A; 1OTA A; 2VLG A; 4E04 A; 2W0N A; 3E4O A; 4I5S A; 2ZOH A; 1N9N A; 4HNB A; 3OLO A; 1TS7 A; 1N9L A; 2JN7 A; 3PHY A; 1TS8 A; 5HDC A; 4HIA A; 2L1M A; 3MFX A; 1XJ3 A; 1LSV A; 3A0V A; 3UMD A; 1KOU A; 5J7E A; 3MQQ A; 3T50 A; 3IS2 A; 4I3J A; 4HQA A; 3UB6 A; 2H28 A; 4EQ1 A; 3VE4 A; 2W27 A; 3A0S A; 4WL9 A; 3CAX A; 4KQD A; 1P97 A; 3F1P A; 2YKH A; 3IS2 B; 5J3W A; 1WA9 A; 2ZOI A; 4EEP A; 5HSQ A; 5HWT A; 1MZU A; 2L0W A; 4R70 A; 1XJ2 A; 2INW A; 5J4E A; 2EA9 A; 3F1P B; 4EER A; 1S4S A; 3SW1 A; 1DP6 A; 3RH8 B; 1XJ6 A; 5AVE A; 5I5L A; 5HD5 A; 1LSW A; 4HJ3 A; 2YKF A; 4HY8 A; 5HDS A; 3UME A; 3A0R A; 3LIA A; 2Z6C A; 3NJA A; 4GCZ A; 4HHD A; 3LI9 A; 2QHK A; 2A24 B; 1OTB A; 5HWV A; 4EXO A; 2ZBB A; 4KUO A; 1N9O A; 3H7W B; 3F1O A; 4NXG A; 4WN5 A; 5KIZ A; 4PKY G; 4K08 A; 4JGO A; 3H82 A; 4L9G A; 1JNU A; 2KDK A; 4BBT A; 1VB6 A; 4L9F A; 2V9A A; 4DJ2 A; 2V1A A; 3D72 A; 3LIB A; 5HZH A; 1GSV A; 2WKR A; 3BY8 A; 4MN5 A; 4R38 A; 4HI4 A; 3BY9 A; 3GDI A; 3ZQ5 A; 4F3L A; 4R3A A; 4I39 A; 4BBU A; 5DKK A; 1T18 A; 2K7S A; 3EWK A; 4JGP A; 2VV8 A; 1T19 A; 2D02 A; 5HWW A; 2JHE A; 3HJI A; 1T1C A; 2OOL A; 1D06 A; 4XT2 A; 2L4R A; 2Z6D A; 5TBM A; 1LSX A; 5A8B A; 5F5Y A; 3PYP A; 5DJU A; 1V9Z A; 4M4X A; 4LRX C; 4B9O A; 3FC7 A; 5DJT A; 4HP4 A; 2PR6 A; 3K3C A; 3MJQ A; 4WUJ A; 5IU1 A; 3UB8 A; 1S1Y A; 3GEC A; 4HH2 A; 3UB9 A; 1BYW A; 4NXE A; 3IBR A; 3NOP C; 5DKL A; 1OT9 A; 2M1C A; 2P7J A; 3K3D A; 2KX6 A; 2PYR A; 5AVF A; 3F1N A; 4EW7 A; 3NOT C; 2PDR A; 4I3I A; 1UGU A; 1S4R A; 1S67 L; 3NOU C; 4GS9 A; 4HH3 A; 4HJ6 A; 5HDD A; 1LL8 A; 2PD7 A; 2PR5 A; 4NXF A; 1XFN A; 3B33 A; 1LT0 A; 1X0O A; 3LID A; 2I9V A; 4MN6 A; 4EET B; 2PYP A; 1ODV A; 3LI8 A; 2R78 A; 2HV1 A; 4L9E A; 5G4Y A; 2QKP A; 1UWP X; 4H6J A; 3F1O B; 3EEH A; 4GHI A; 1DRM A; 4BBV A; 4LPZ A; 2V0U A; 3VE3 A; 1S66 L; 3H82 B; 3KX0 X; 3C2W A; 4WF0 A; 4HOI A; 2D01 A; 4GHI B; 2VEA A; 4PKY A; 1TS6 A; 2WKP A; 4JGQ A; 4KUK A; 3P7N A; 1OTD A; 3CWF A; 2CMN A; 1P0Z A; 5EFW A; 3HJK A; 3MXQ A; 5HD3 A; 3E4Q A; 4WLA A; 3LIC A; 1S1Z A; 1OJG A; 1G28 A; 1D7E A; 1Y28 A; 2GJ3 A; 4LRZ E; 4F3L B; 4HJ4 A; 5F69 A; 5G4Z A; 3UE6 A; 2QJ7 A; 3VOL A; 4EEU A; 2V1B A; 2VV7 A; 3BWL A; 3RTY A; 1DP9 A; 2OWJ A; 1V9Y A; 3E4P A; 1F9I A; 4LRY C; 2OWH A; 4XT2 B; 4JGR A; 5TBM B; 1DP8 A; 3UB7 A; 3LYX A; 3CLO A; 2J80 A; 3LUQ A; 2QWS A; 5F68 A; 1OT6 A; 2PHY A; 3ULF A; 4GW9 A; 1T1A A; 3LIE A; 1XJ4 A; 2V0W A; 2A24 A; 4DJ3 A; 3MR0 A; 2QJ5 A; 1GSX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2P74 A; 3C8C A; 1XFQ A; 2XQZ A; 1TEM A; 4DKI A; 4N1X A; 1YM1 A; 1PWC A; 3HLC A; 4KZA A; 1XX2 A; 4IJG A; 4RX2 A; 4R0Q A; 4N1H A; 3KSI A; 3MQO A; 2G2W A; 4UQI S; 4OON A; 1L0D A; 2WGV A; 3AGE A; 4YWZ A; 3RFB A; 3PR6 A; 2ZQC A; 4E3K A; 1ESI A; 4WYY A; 1RGZ A; 3S7Q A; 4NEE D; 1K0K A; 1TF1 A; 1YLT A; 4E6X A; 5KMW A; 1TS7 A; 3V5M A; 1CI9 A; 2O0Y A; 1BT5 A; 2XK1 A; 3U4L P; 3PBR A; 5AQB A; 3W4O A; 2L1M A; 4DDS A; 5FQ9 A; 1TDG A; 2HGV A; 1LSV A; 2B95 A; 3TOI A; 3MQQ A; 2Y2I A; 3E2L A; 4GJ4 A; 2J3T D; 3GMW A; 1FR1 A; 1PYY A; 2ZLY A; 4OOY A; 2H28 A; 4X69 A; 4GKU A; 4EQ1 A; 2UV0 E; 2A2L A; 1E25 A; 3A0S A; 3LR4 A; 1P97 A; 3QP2 A; 2ZD8 A; 2ZM0 A; 2Y2M A; 5TGF A; 5CED A; 4NG2 A; 2NUT C; 2J3W A; 3EQV A; 1K55 A; 1G68 A; 3O3V A; 3B3X A; 4ZBE A; 1W63 M; 2XFS A; 5CXW A; 3O5Y A; 2Y2O A; 3ZG9 B; 2C6W B; 4BEN A; 1XJ6 A; 4ETZ A; 3RJU A; 5J8X A; 5HAQ A; 3SOI A; 4S2N C; 1PWG A; 5EUA A; 4B93 A; 2XRN A; 3ZG0 A; 5HDS A; 4KZ7 A; 3BFF A; 1JVJ A; 2Y79 A; 4R1G A; 1YT4 A; 5AQ9 A; 5F1F A; 3BRM A; 4GCZ A; 4IVK A; 3KSH A; 3LI9 A; 2QHK A; 4P87 A; 2XD5 A; 1LL9 A; 2ZBB A; 2X71 A; 3CPT B; 4R3B A; 1N9O A; 4N9L A; 3F1O A; 3LY4 A; 1YSP A; 4OLD A; 3BYD A; 5CTN A; 4PKY G; 2OAP 1; 4P6Z S; 1YMS A; 3OPP A; 4L0L A; 2W3F A; 3N6I A; 4L9F A; 1F5M A; 2V9A A; 4GZB A; 4DJ2 A; 4QHC A; 3D72 A; 4WEL A; 3DTM A; 2CC1 A; 1TD5 A; 3HL9 A; 3LIB A; 3EQU A; 4BMW A; 4EWF A; 2WKR A; 4S2P A; 1L3L A; 4R38 A; 2WZZ A; 4S2J A; 1F2K A; 3GDI A; 2WAD A; 3IF6 C; 3BFD A; 1HLU P; 4JF6 A; 1W7F A; 1ERQ A; 1PI4 A; 3Q7V A; 4HEF A; 3UO9 A; 1GHI A; 2W3H A; 3D3O A; 2J9O A; 3S7P A; 3FYZ A; 3EEA A; 2VGJ A; 3R4K A; 2ZMF A; 1ONG A; 1PFL A; 3PBT A; 1L0E A; 3HLG A; 3NEC A; 3HLW A; 2HPB A; 4X68 A; 2L4R A; 4BD1 A; 5FAP A; 2J7V A; 2VJW A; 1MBL A; 5TBM A; 4NKP A; 1ES4 A; 1LSX A; 5A8B A; 3OCL A; 1XP4 A; 2OV5 A; 4BL2 A; 3HRE A; 1V9Z A; 3T4T A; 2VGL S; 2I72 A; 3ZG5 A; 2H0Y A; 4C6Y A; 4LV0 A; 2W3D A; 4OQG A; 1FQG A; 4WUJ A; 1S1Y A; 4GD8 A; 4LV1 A; 1K6S A; 4EBL A; 4UA7 A; 3HLF A; 4FTX A; 4BD0 A; 2EXB A; 3C5A A; 3NIA A; 5FI6 A; 3WRT A; 1L2S A; 4NXE A; 3IBR A; 2QPN A; 2M1C A; 5A91 A; 4CLC B; 2KX6 A; 5GLC A; 3F1N A; 3Q07 A; 4EW7 A; 1C3B A; 3HBR A; 2Y2P A; 3NOU C; 4GS9 A; 5CER A; 3Q1F A; 1IYO A; 1J9M A; 4DE2 A; 3HUO A; 2PT7 A; 3T4Q A; 2PR5 A; 4QWO A; 4Y7P A; 1VET A; 2ZMV A; 4R3J A; 4MLL A; 1ZG4 A; 1X0O A; 3LID A; 3QNB A; 2PYP A; 3QP5 A; 1I5Q A; 3DWZ A; 3G32 A; 1H8Z A; 5IHV A; 2HV1 A; 1Z6F A; 2M7V A; 1PZP A; 4RVA A; 2QKP A; 4X53 A; 3F1O B; 4ARZ A; 3T1S A; 3BFE A; 3ZGA B; 3PBN A; 2XH9 A; 4LPZ A; 4KG6 A; 2PU2 A; 5DVA A; 1XXM A; 2Q9N A; 4WZ4 A; 3BLS A; 4HOI A; 4O8G A; 1FIL A; 3GR2 A; 4MMN A; 2D01 A; 1P9R A; 3IWI A; 1DY6 A; 3N7W A; 2JKR M; 2O9C A; 3L7H A; 3FWL A; 3S7N A; 1Q2Q A; 4OLG A; 4QD4 A; 1O07 A; 2GZA A; 3MXR A; 3E4Q A; 1G6O A; 4IUK A; 1S1Z A; 5FDS A; 1CEF A; 4B4Z A; 1G28 A; 3DAV A; 2XEP A; 3C4P A; 4GDB A; 2EWW A; 5G4Z A; 2XD1 A; 2O99 A; 1FIK A; 1H8M A; 3TW8 A; 1SKO A; 5JYO A; 5EVI B; 5IT5 A; 3CMZ A; 3PBQ A; 1YLJ A; 3DTE A; 3IXD A; 1JWP A; 3E4P A; 5HX9 A; 4LRY C; 2MJ6 A; 2EFU A; 3QHY A; 5TBM B; 1K6R A; 1MWT A; 3UB7 A; 4ZJ1 A; 4JF4 A; 3OZH A; 3K2N A; 2XA7 M; 4ID4 A; 5GLD A; 1OT6 A; 3V67 A; 1ES3 A; 2V8F A; 4FCF A; 1DJC A; 5FQI A; 3MKE A; 1PWD A; 3DTI A; 1XJ4 A; 1YSQ A; 2K2N A; 1IKI A; 2ZQ8 A; 1GSX A; 1GA0 A; 1SHV A; 3TG9 A; 3S1Y A; 3F1N B; 1KE3 A; 3ICY A; 1IFQ A; 4E3I A; 3MXS A; 1L0F A; 2EXA A; 2XDM A; 4GS9 B; 2B02 A; 1T1B A; 2VV6 A; 4WMC A; 4I3A A; 1VET B; 4RQ9 A; 3H9W A; 4S2N A; 3LEZ A; 1ZG6 A; 4PMA A; 4LLO B; 2Y8H A; 1F98 A; 1MWU A; 1OTI A; 3JPU A; 5EVL A; 1RP5 A; 1UWN X; 1K54 C; 2BAS A; 2IWC A; 3QP1 A; 1OJ5 A; 1BTL A; 4NXB A; 1OTA A; 4ARZ B; 3HLE A; 4UAA A; 1ZKJ A; 4E04 A; 2W0N A; 3E4O A; 4XXR A; 4I5S A; 2ZOH A; 5HL6 A; 1N9N A; 3S4X A; 4WMC D; 1FCO A; 4Q8I A; 2ZL1 A; 2P08 A; 1KGF A; 2JN7 A; 3PHY A; 4C3Q A; 3MZD A; 5HDC A; 3G4P A; 3LGO A; 3UMD A; 2WAE A; 2VGL M; 1K38 A; 4K0X A; 3WS5 A; 1JWV A; 2G2U A; 4DE3 A; 4HQA A; 2JKF A; 1ZC2 A; 3NI9 A; 4EBP A; 2W27 A; 4KQD A; 3D4F A; 3ITB A; 4R4R A; 2YKH A; 2V8C A; 3CG5 A; 3IS2 B; 5J3W A; 1WA9 A; 2ZOI A; 1XA1 A; 4EEP A; 1SKO B; 3IF6 A; 5HWT A; 3GVB A; 2L0W A; 3S7O A; 1KVL A; 4QY6 A; 5DFY A; 2HP5 A; 2HP6 A; 5DF7 A; 4MBK A; 3VV4 A; 5J4E A; 3ITA A; 5TR7 A; 1SCW A; 3BW6 A; 4PAU A; 3RH8 B; 2ZJ9 A; 3EGX C; 3Q7Z A; 5HPI A; 3P01 A; 4KEN B; 1WYC A; 5I5L A; 3PXP A; 3C30 A; 2X02 A; 4HJ3 A; 2YKF A; 4OPY A; 4WM9 A; 5HL1 A; 1K57 A; 1BLH A; 2ZQ9 A; 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