The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
125
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structure length |
125
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Chain Sequence |
SWQTYVDTNLVGTGAVTQAAILGLDGNTWATSAGFAVTPAQGQTLASAFNNADPIRASGFDLAGVHYVTLRADDRSIYGKKGSAGVITVKTSKSILVGVYNEKIQPGTAANVVEKLADYLIGQGF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Three-dimensional solution structure of Acanthamoeba profilin-I.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PROFILIN IA
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| molecule tags |
Actin-binding
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| source organism |
Acanthamoeba sp.
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| total genus |
11
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| structure length |
125
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| sequence length |
125
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1994-01-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4X25 A; 4X1M A; 1FIL A; 1Z09 A; 2ZL1 B; 4FUW A; 2BTF P; 3CPT B; 3UB5 P; 3T12 B; 5FDS A; 1VEU A; 1K0K A; 1CF0 A; 4X1L A; 1SKO B; 3KYE A; 2VK3 A; 2ZL1 A; 3T1Q B; 1CJF A; 4QWO A; 2PRF A; 3T1R A; 1VET B; 3CPT A; 1A0K A; 1AWI A; 1HLU P; 1YPR A; 2HZ5 A; 1SKO A; 2B95 A; 2JKG A; 2V8F A; 3NEC A; 1ACF A; 1VET A; 3CHW P; 5EVE A; 3L7H A; 3U4L P; 3MS6 A; 3NUL A; 3LGO A; 1F2K A; 1CQA A; 5FEG A; 2PBD P; 1PRQ A; 1Y4O A; 3T1X A; 3LEQ A; 2PAV P; 1PNE A; 1SZV A; 3T1S A; 4FTX A; 2V8C A; 4ESP A; 1VEU B; 4D60 A; 3DAV A; 5EM1 A; 5EM0 A; 2ACG A; 3D9Y A; 3MSH A; 2E8J A; 3L9K A; 5EV0 A; 1FIK A; 1PFL A; 1J3W A; 1G5U A; 5FEF A; 2JKF A; 1D1J A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1GCE A; 4G3W A; 4NKP A; 4CJN A; 5DJT A; 4S2M A; 2W0N A; 1P9R A; 5I94 A; 1TS0 A; 3ULF A; 4HBT A; 3PAE A; 1E4D A; 4GCZ A; 1CI9 A; 4X1L A; 4BBT A; 4OVD A; 5HFO A; 2Y79 A; 2P9V B; 3NIA A; 1SKF A; 5M19 A; 2GJ3 A; 1AWI A; 1HLU P; 2HZ5 A; 5AVF A; 3LIC A; 3B3X A; 3IH9 A; 5GLB A; 2Q9M A; 3HUO A; 4JGQ A; 2JHE A; 4O0P A; 3BRM A; 1M6K A; 2B02 A; 1XP4 A; 1LL9 A; 3CHW P; 4P0M A; 2OWH A; 3LI8 A; 1F2K A; 2Y2Q A; 3ZCZ A; 5EUA A; 3UPO A; 2ZD8 A; 4OPR A; 1Y4O A; 4KZA A; 3GSG A; 4YWZ A; 3D3O A; 1K6S A; 1MWS A; 2PYP A; 1YMS A; 1YLW A; 3PTE A; 1L2S A; 4BJP A; 5GHX A; 1K55 C; 1NZO A; 4L9F A; 1L0G A; 2P04 A; 4IVK A; 3WRT A; 5A91 A; 3IHA A; 2A3U A; 1KGE A; 2RCX A; 4JXV A; 4O8G A; 2BAS A; 1T19 A; 2V2F F; 2XQZ A; 3GEC A; 2P74 A; 4QHC A; 4WMC A; 3IQA A; 4UA9 A; 1K56 A; 2DCF A; 1F9I A; 4RQ9 A; 2QMI A; 2YKF A; 5HX9 A; 2C5W B; 5FI6 A; 3MJQ A; 5DFX A; 4HOI A; 3OPL A; 4R0Q A; 2VK3 A; 4UAA A; 5IS1 A; 3PBN A; 3HJK A; 5KSH A; 4MBK A; 1MZU A; 3HL9 A; 1NJ4 A; 4GD8 A; 2Y91 A; 4G3K A; 1KDS A; 3IS2 B; 2JKG A; 5FQM A; 3LR3 A; 3T4J A; 4C75 A; 2GNX A; 3F1P B; 4OP5 A; 4HP9 A; 1GHP A; 5DJU A; 5KIZ A; 1VHM A; 1PRQ A; 3VSL A; 4PKY G; 4ZDX A; 4UHU A; 1SZV A; 1NLZ A; 3DBA A; 3VFH A; 4GNU A; 5EVL A; 3P7N A; 4BQM A; 2XD1 A; 4RA7 A; 5HWT A; 3U2A A; 3W8K A; 4XT2 A; 1N9N A; 3PBQ A; 5EOE A; 3HLB A; 4DXC A; 2FFF B; 5CHJ A; 1P0Z A; 5F68 A; 4CLC A; 2E8J A; 2XGN A; 1PWG A; 3MFD A; 2PBY A; 1IFQ A; 5EEC A; 4GDN A; 4E3M A; 4S2I A; 3E2L A; 3W4P A; 3UB8 A; 1FCO A; 2OOL A; 2HDU A; 3NOU C; 1N4O A; 3CWF A; 5TGF A; 3JYI A; 3MZE A; 3WWX A; 1NLY A; 1FR1 A; 4K91 A; 4E3K A; 2ZL1 A; 2J9O A; 3T1Q B; 2O9B A; 3B42 A; 3BFE A; 2KLI A; 3IXH A; 2NUP C; 4IUH A; 3C7V A; 5GLC A; 5L10 A; 3LID A; 4FCF A; 3SS3 A; 3ZYT A; 2XRO A; 1YSP A; 1ESI A; 3S1Y A; 3UB9 A; 4R38 A; 1KE3 A; 1S66 L; 3SW1 A; 4JPM A; 3PYP A; 4BMW A; 1GA0 A; 3KSG A; 3N7W A; 3MQQ A; 4CLC E; 2VV8 A; 1LL8 A; 4LRZ E; 3VP4 A; 3NUL A; 2W3G A; 3P98 A; 1E25 A; 1CEG A; 2V1A A; 2VGK A; 1E3U D; 4JF4 A; 1JTG A; 4GB7 A; 3IT9 A; 3BQ8 A; 2Y8H A; 3KSI A; 4WZ4 A; 3NY4 A; 2A49 A; 3UNW A; 4OPQ A; 1G68 A; 1PW8 A; 2I9V A; 2K31 A; 3T4Q A; 2JE5 A; 1BUE A; 3E4Q A; 4B4X A; 3KO6 A; 4WZ5 C; 1TS8 A; 3A3F A; 3KYZ A; 4R1G A; 4DN0 A; 3D9Y A; 1BTL A; 4M3K A; 1DP8 A; 1OJ5 A; 4OLD A; 4DMZ A; 2OAQ 1; 2ZMA A; 3IX4 A; 1SHV A; 3CLO A; 3MQ0 A; 1JNU A; 2B18 A; 4HEF A; 3TE8 A; 1MWT A; 3E4P A; 3R4K A; 4X1M A; 1M40 A; 4EQ1 A; 2H28 A; 3NBL A; 1W8Q A; 3UME A; 3OPP A; 2V9A A; 1TF1 A; 3I7J A; 2QJ5 A; 1MPL A; 2FH5 A; 3T4L A; 3SH8 A; 3OOV A; 4JGP A; 2V0U A; 3S7Q A; 3MZF A; 3SH7 A; 3UDF A; 1PZO A; 4ZBE A; 3LR5 A; 4LPZ A; 2EWV A; 2QPN A; 3OC2 A; 3ZGA B; 3QP8 A; 4IBR A; 2B95 A; 2ZC4 B; 3S4X A; 1OT6 A; 1MBL A; 3BEB A; 4N9K A; 1MXO A; 2LB5 A; 4RX3 A; 1BLH A; 4HI4 A; 4PM7 A; 5F1G A; 1PIO A; 3QP1 A; 3FPW A; 4Y2F A; 1JTD A; 1BLC A; 3N4I A; 4S2N C; 2P9V A; 3HRE A; 4ESP A; 4GOG A; 4CLC B; 3LCE A; 3PBT A; 1XX2 A; 5EOO A; 1Y28 A; 3FZC A; 4JXS A; 2IWB A; 2D02 A; 1HD8 A; 4OQH A; 4JBF A; 4MLL A; 3VE4 A; 3BFG A; 5F82 A; 4X55 A; 4EW7 A; 3W4O A; 2MJ6 A; 2R9X A; 5CGS A; 4WL9 A; 1MC0 A; 3A3D A; 2XFS A; 4S2L A; 2J3W A; 3UE6 A; 5A90 A; 5F1F A; 4F3L A; 4Y0T A; 2ZL1 B; 1OTI A; 2A2L A; 3E0Y A; 2HP9 A; 3O88 A; 2V20 A; 3TJZ C; 2XA7 S; 2ZQC A; 2HV1 A; 4JKT A; 2XA7 M; 2WAE A; 4LCM A; 4II7 A; 3S7N A; 2X71 A; 1UGU A; 1G28 A; 4GD6 A; 5CEB A; 3NCK A; 1YLT A; 1YM1 A; 3V3R A; 4DF6 A; 3K3C A; 4Q0I A; 1S0W A; 3B33 A; 3NDE A; 3PAG A; 4E3O A; 1S4R A; 4GKU A; 4Y3I A; 5AQ9 A; 1Q2P A; 2JC7 A; 2ZMV A; 2V0W A; 1VET A; 2HP5 A; 2W3H A; 5J4E A; 2ZJ9 A; 4MMN A; 2GX5 A; 2ZOI A; 2Y2O A; 3PBS A; 2PBD P; 4YOF A; 4B88 A; 2FFY A; 1K54 C; 4ZAM A; 4LRX C; 5FAS A; 1GSX A; 3A0R A; 2WAF A; 3VP3 A; 3Q1F A; 3LIA A; 4Q0J A; 4MNR A; 4B93 A; 1H5X A; 1YLP A; 2WUQ A; 1H8Y A; 1ODV A; 3FG8 A; 4OH0 A; 3F1P A; 3F1O A; 4OP8 A; 2WZZ A; 1GHM A; 4DE3 A; 1K4F A; 1XFQ A; 5AJG A; 1LLB A; 3UO9 A; 3EQV A; 3MKE A; 4LLO B; 4MDZ A; 4MBH A; 1Z09 A; 3Q7Z A; 2Z6D A; 3ZG8 B; 1L0D A; 3UB5 P; 2HDS A; 3LY4 A; 5A92 A; 2EFX A; 4KZ6 A; 1CF0 A; 2HF6 A; 2J3T C; 5EE8 A; 3CG5 A; 4UQI S; 4UQI M; 5DVA A; 1WYC A; 3HBR A; 1DRM A; 4WF0 A; 2Y2L A; 3V3S A; 4OOM A; 2Q9N A; 5DKK A; 4RX2 A; 5L07 A; 2M7V A; 4HBU A; 2J3T D; 4EBN A; 2V8F A; 4N9L A; 3T50 A; 2VA0 A; 4GZB A; 2QHK A; 4KG5 A; 3GV9 A; 3RFB A; 2J7V A; 3BLS A; 1ERM A; 5CEC A; 1CK3 A; 4GHI A; 2VX8 A; 4P6B A; 2QZ6 A; 1ERQ A; 1OTD A; 4RYE A; 1I5Q A; 4FTX A; 4H8R A; 1U60 A; 5TJJ A; 4A5R A; 3CZD A; 4OPY A; 5HAI A; 3DTI A; 4LCL A; 4ZJ3 A; 3WS1 A; 4OPZ A; 2KX6 A; 3HLD A; 1K55 A; 5D3O A; 1DJB A; 5HAQ A; 1KGG A; 5GHZ A; 3PR6 A; 2HGV A; 5M18 A; 2R9W A; 1OTA A; 2UV0 E; 4P87 A; 3VSK A; 3DWZ A; 3N8R A; 3FYZ A; 3MSH A; 4F3L B; 3M2J A; 3K2N A; 4PMA A; 4HH3 A; 5F5Y A; 5L2F A; 3FKV A; 2JCH A; 4KZ8 A; 4P85 A; 3SS4 A; 3HLW A; 4ARZ B; 2WAD A; 1K25 A; 4HJ4 A; 5CED A; 3DTM A; 4N1H A; 1FIL A; 2M1C A; 3A3E A; 4GS9 A; 2BTF P; 3DTK A; 4LV3 A; 1ES4 A; 5G4Z A; 1UWN X; 3G2Y A; 4KZB A; 4Z1W A; 1HVB A; 5FQK A; 4YFM A; 4B9O A; 3HCY A; 1IEM A; 1RCJ A; 1WYB A; 5HPI A; 1EI5 A; 1VET B; 1BZA A; 4PM5 A; 3A3J A; 1TDL A; 1QMF A; 2H10 A; 1H0M A; 2ZOH A; 3L7H A; 1SDN A; 3F1N A; 3HLE A; 4BLM A; 1QME A; 2W1R A; 2L1M A; 2AVX A; 4K08 A; 3AGD A; 5J8X A; 3UY6 A; 3OCN A; 3VOY A; 1NXY A; 3LEQ A; 3IWO A; 1K57 A; 4D2O A; 2WGV A; 2ZMF A; 1LSW A; 3BWL A; 1PWC A; 1OME A; 1PW1 A; 4OOY A; 4QY5 A; 3F1O B; 4OKP A; 4PPR A; 4R3B A; 4QY6 A; 4CQH A; 1O07 A; 1XJ3 A; 4KZ4 A; 1ONH A; 5E43 A; 4LEN A; 1T1C A; 1H8M A; 3M6B A; 3G4P A; 1CEF A; 1XA1 A; 3FKW A; 1PYY A; 3L9K A; 4R3A A; 4NEE D; 3KYQ A; 4HES A; 1HTZ A; 4OLG A; 1Z6F A; 1J3W A; 1IYQ A; 5K5B A; 5HPF A; 3Q82 A; 2BG1 A; 1K56 D; 1ZG4 A; 2Y4A A; 4EEU A; 5HWV A; 1J9M A; 4R4S A; 3UN7 A; 3G6O A; 4MN7 A; 3ISG A; 4S2O A; 2W1T A; 1FSY A; 5AQB A; 3GMW A; 2BLS A; 3BW6 A; 2EA9 A; 2EX2 A; 1SCW A; 5GLA A; 2ZC3 B; 2JKT I; 4BD0 A; 4F94 A; 3LO7 A; 2NUT C; 3C7U A; 1DJA A; 5FI2 A; 4NET A; 2ZM2 A; 2XF3 A; 4GHI B; 1E3U A; 4JGO A; 4EES A; 4KUO A; 5EVE A; 4DKI A; 4MBF A; 4OOL A; 4I5S A; 1BT5 A; 1X0O A; 4HJ3 A; 3BYD A; 3UB6 A; 3C2W A; 3IF5 A; 4S2P A; 1NWZ A; 1L0F A; 1PZP A; 3ZNY A; 3QP6 A; 5FDH A; 5HD5 A; 1KGF A; 5J7E A; 1LI0 A; 2EX9 A; 1PNE A; 1KE4 A; 2EX8 A; 4IED A; 4UA7 A; 4CLC C; 3C8C A; 1W79 A; 3V50 A; 4Y13 A; 3IXG A; 1OTE A; 5FQ9 A; 2DNS A; 1YLJ A; 2L0W A; 1KE0 A; 4P6Z M; 3ZHH A; 4CLC D; 3G32 A; 5HAR A; 2Z2M B; 3P09 A; 4GS9 B; 3LIE A; 4PKY A; 2B5R A; 3PHY A; 1S4S A; 3IXD A; 5FQI A; 3UE3 A; 4KZ3 A; 2HPB A; 4HP4 A; 3KX0 X; 2LB9 A; 4Y17 A; 4X25 A; 4DE1 A; 2O99 A; 4BBU A; 4R70 A; 3TSG A; 2Y2M A; 4KQO A; 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1S67 L; 1LSX A; 2WKE A; 3MXQ A; 3HJI A; 3Q07 A; 1NYM A; 3UMD A; 1UWP X; 2O0Y A; 1IYS A; 1PI5 A; 4BL2 A; 4ARZ A; 1PWD A; 3UPN A; 4FOF A; 3MFX A; 3VOL A; 2Z2L B; 5FEG A; 4E3L A; 2A24 B; 4X53 A; 2ZC5 B; 4X69 A; 4WM9 A; 1K38 A; 4E3N A; 2PD8 A; 4ZJ1 A; 3QP2 A; 1DP9 A; 2XH9 A; 3G31 A; 4KQD A; 4UA6 A; 3QHY A; 3IH8 A; 5E2F A; 1NY0 A; 3UPP A; 4EET B; 2ZQ8 A; 5HDS A; 5DFY A; 1VM1 A; 3TRC A; 3VP1 A; 3M2K A; 3FPV A; 4JGR A; 3E2K A; 4LGW A; 4IBX A; 3CIT A; 1V9Z A; 4Q0H A; 3VP2 A; 5G18 A; 1N9L A; 5FSR A; 2VGJ A; 3P01 A; 1FOF A; 4Y7P A; 1S1Y A; 1WA9 A; 4EUV A; 2R78 A; 1ZC2 A; 3JPU A; 5FEF A; 1NZU A; 2JKF A; 1ZKJ A; 3EGD C; 1OJG A; 1BLS A; 3V5M A; 4DE2 A; 1ERO A; 3NI9 A; 4XUZ A; 1RP5 A; 3GDI A; 4KG6 A; 3H82 B; 5FAQ A; 3EGX C; 1SKO B; 3KYE A; 2W3F A; 2INW A; 1F98 A; 4OQI A; 3QP4 A; 1DP6 A; 4YNR A; 4PAU A; 1YPR A; 5CX7 A; 4KQQ A; 4Y0U A; 2K7S A; 1MKI A; 4GW9 A; 4I38 A; 3NOT C; 4Z9Q A; 1W63 M; 3V67 A; 2IWC A; 3U4L P; 2JKR I; 3GVB A; 3SH9 A; 3B47 A; 3GR2 A; 4HH2 A; 1BUL A; 1GSW A; 3BY8 A; 3ZNT A; 4AFI A; 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