The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
90
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structure length |
90
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Chain Sequence |
GSETRTISSTAQERVDLEAVRLASIVDSRLIGTGSVDEDFLREQIRDARYAVIRIPGQPVVEVGTKPTGDVLQGRATGEEGETVLVEEPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mechanism of the pH-Induced Conformational Change in the Sensor Domain of the DraK Histidine Kinase via the E83, E105, and E107 Residues
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Streptomyces coelicolor
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| molecule keywords |
Putative two-component system histidine kinase
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| total genus |
21
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| structure length |
90
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| sequence length |
90
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-12-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF18092 | DraK_HK_N | DraK Histidine Kinase N-terminal domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Beta-Lactamase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2MJ6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4KQR A; 5IU1 A; 2PD7 A; 4IUH A; 4ID4 A; 3IF6 C; 2EX2 A; 3QP2 A; 4UEY A; 2HP6 A; 4GCZ A; 4QPR A; 2VV6 A; 2Y2N A; 3NI9 A; 4MDZ A; 3GTC A; 3WS4 A; 2ZC3 B; 4LFU A; 1GA9 A; 2ZD8 A; 5EVI C; 3Q81 A; 1K57 C; 4HY8 A; 3SH7 A; 3HLF A; 5D3O A; 3M2K A; 1M40 A; 4KZ7 A; 2XRN A; 1XPB A; 3C7V A; 3CUE A; 3B47 A; 2D01 A; 3F1N A; 3MFX A; 5TJJ A; 1HD8 A; 1MKI A; 2QYB A; 4B9O A; 1K56 D; 3R4K A; 4N1X A; 1RP5 A; 1W79 A; 1KE0 A; 3ZNT A; 2W1T B; 1E3U D; 1NRJ A; 2PHY A; 4UQI M; 3T4T A; 3K3C A; 4JGR A; 1YLJ A; 1G6O A; 4MN5 A; 4P6Z S; 4WL9 A; 2ZM8 A; 2GJ3 A; 3Q7V A; 3IWI A; 2ZC5 B; 3WS5 A; 4Y7P A; 4EBP A; 4B88 A; 5E43 A; 3AGE A; 2DNS A; 2V2F F; 1SDN A; 1P9R A; 5CGS A; 1SKO A; 3T1Q B; 1PI4 A; 4WLA A; 2QPN A; 3MMH A; 1K55 A; 4GS9 A; 4PMA A; 1V9Y A; 2ZQ7 A; 3H82 A; 3E4O A; 3LIC A; 1HZO A; 1NY0 A; 2PYR A; 4L0L A; 3RFB A; 4GW9 A; 4HBU A; 2HDR A; 1LSX A; 5HWT A; 4WMC A; 1FCO A; 2A24 A; 3FPW A; 4CLC B; 2VGL S; 2OV5 A; 3LEQ A; 1CF0 A; 4LCL A; 1NYY A; 5KSH A; 4G3K A; 3ZFZ A; 1BTL A; 5JYO A; 3N7W A; 2WKR A; 2KLI A; 3DWZ A; 3GQZ A; 3H7W A; 1XKZ A; 4GNU A; 3DTM A; 3FPV A; 1NLY A; 3E0Y A; 3IXB A; 5CED A; 2HJ9 C; 3LYX A; 3S7Q A; 3ZNY A; 2A49 A; 1XGI A; 4YIN A; 2QWS A; 2Y2M A; 5CGW A; 2B02 A; 5CHM A; 1Z6F A; 3H9W A; 4I39 A; 2PU4 A; 1YMX A; 5DFY A; 1K6R A; 3B3X A; 4OKP A; 1PW8 A; 1BLC A; 3T12 B; 3KSI A; 1F5M A; 2QMI A; 1PZP A; 3OPR A; 5DFX A; 1ESI A; 1BUL A; 1OJG A; 3DTE A; 4EW7 A; 4DJ2 A; 1K57 A; 4PHT A; 1BYW A; 5L07 A; 1FR6 A; 4LV1 A; 3S22 A; 2Y55 A; 4HES A; 4YOF A; 3T50 A; 2R78 A; 1JWZ A; 4WZ5 C; 5F69 A; 2ZBB A; 3C7U A; 3NDG A; 5EFW A; 1DRM A; 2OWJ A; 3GSG A; 3E4P A; 3HLG A; 5HD5 A; 2ZOH A; 4ETX A; 1YT4 A; 3EGX C; 1BT5 A; 1V9Z A; 1FSW A; 1FQG A; 1PWD A; 1VM1 A; 2GNX A; 4NXE A; 2JN7 A; 2PRF A; 4R0Q A; 4N1H A; 4LV0 A; 3UME A; 3T1X A; 4Y0O A; 3ZDJ A; 5A8B A; 2WGW B; 3HUM A; 5A93 A; 3K2N A; 5E2G A; 3NDE A; 5L09 A; 5CTN A; 1FCN A; 2B18 A; 4X69 A; 3PAE A; 2Q9M A; 2H28 A; 3LR0 A; 4ZAM A; 5HDD A; 2PT7 A; 4IUK A; 1GHM A; 4I3A A; 3KYE A; 3CMZ A; 2FH5 A; 4KG6 A; 3BWL A; 1FCM A; 2EA9 A; 4ME4 A; 2Y2H A; 1L0F A; 3O88 A; 1IYQ A; 4UA9 A; 1PNE A; 4KG2 A; 3MZE A; 2ZL1 A; 3E98 A; 5F1F A; 1YLT A; 4F3L A; 4HQA A; 3CHW P; 5DKL A; 2NUT C; 5E2H A; 1GCE A; 2G2W A; 5F68 A; 2WK0 A; 2LB9 A; 3M6H A; 3Q07 A; 4S2K A; 4LV3 A; 1AXB A; 5EUA A; 4MMN A; 4WEL A; 1LLB A; 3UPO A; 2QZ6 A; 5EOO A; 4UHU A; 3G2Z A; 2MJ6 A; 4OPR A; 3C30 A; 2EX9 A; 3MZF A; 5MC7 A; 3G6O A; 5GHZ A; 1BUE A; 3NUL A; 1HLU P; 4WZ5 A; 4CLC D; 1RGZ A; 2ZQD A; 3GVB A; 3CI6 A; 4NXF A; 1IEL A; 3F1P B; 5EVL A; 1N9N A; 2XR0 A; 1OME A; 1YLY A; 3U4L P; 3W2Z A; 3UDI A; 4DN0 A; 5JYP A; 1CJF A; 5HZH A; 1IOU A; 2Q9N A; 3LY3 A; 1IKI A; 1N4O A; 3UNW A; 1JWV A; 4NXB A; 3UO9 A; 5DTS A; 3BW6 A; 4OQI A; 1MWT A; 4WEK A; 1DP8 A; 3MXQ A; 4HHD A; 2J7V A; 3UDF A; 3PHY A; 1GSV A; 1ACF A; 1G68 A; 5CEB A; 4FD8 A; 5F5Y A; 2V8F A; 4PM9 A; 4BQM A; 2O99 A; 3EQV A; 2Q0O A; 2ZQ9 A; 5L8M A; 1OTD A; 2Y2Q A; 1YLW A; 4YNR A; 3UE3 A; 1KE4 A; 4QD4 A; 4E3I A; 2B5R A; 3BY9 A; 3OPP A; 2XK1 A; 2Y2G A; 1G5U A; 5KIZ A; 3V5M A; 2JKF A; 4OOM A; 3HLB A; 2KX6 A; 1PW1 A; 3E2K A; 4BEN A; 4BJP A; 3BFG A; 1IYS A; 3PBO A; 3SS5 A; 5LBR A; 1ES2 A; 1NZO A; 3LIF A; 4BL2 A; 2HGV A; 1UWN X; 4K0W A; 4U0T A; 4R1G A; 4KUO A; 1ODV A; 1LL5 A; 1TS6 A; 3ITA A; 1DP6 A; 2KOI A; 4QHC A; 2Y2J A; 3GDI A; 2Y4A A; 3Q7V B; 3QP6 A; 3BEC A; 4RVA A; 2HZ5 A; 5HPI A; 3D4F A; 5A92 A; 1SKO B; 1L0D A; 1N9O A; 4DKI A; 4GS9 B; 4KZ3 A; 1SKF A; 3H82 B; 3LIA A; 3KSF A; 1BSG A; 1XFQ A; 1T18 A; 3DTK A; 1HTZ A; 5GLB A; 2WYX A; 3BFE A; 5HWV A; 4IVI A; 3WRT A; 2WKP A; 3MZD A; 4OOL A; 4L9E A; 1K4E A; 5AQB A; 3QNB A; 5HDS A; 3R7W A; 4GLQ A; 3OZH A; 3LCE A; 1BLS A; 2X71 A; 2OWH A; 3H7W B; 1FR1 A; 2R9W A; 4JKT A; 3W4O A; 1CEG A; 5IHV A; 2GX5 A; 1KVM A; 2A2L A; 3NHQ A; 3UB9 A; 2Y2L A; 1K4F A; 3NBL A; 3RXW A; 2Y79 A; 4DJ3 A; 1Y4O A; 1YKD A; 2M1C A; 2VEA A; 1ERM A; 1WYC A; 5FQI A; 4EU0 A; 3V3R A; 5TGF A; 4JF5 A; 3ZHH A; 2V0W A; 3FKV A; 3IX8 A; 3QP5 A; 1KOU A; 1TS0 A; 2OLV A; 3IXG A; 4II7 A; 1SHV A; 5TBM B; 2VV8 A; 1ZKJ A; 5J4E A; 3LUQ A; 4ARZ B; 3ISG A; 4OLD A; 2VJW A; 4JPM A; 5IS1 A; 2XRO A; 2JKG A; 3D9Y A; 3HJI A; 1XX2 A; 1ONH A; 5F1G A; 2CMN A; 4PM6 A; 3T4J A; 2Y2I A; 1XFN A; 5FEG A; 1PYY A; 4X53 A; 1K0K A; 4G3V A; 3GV9 A; 4BWI A; 2OOL A; 5E2E A; 5GLC A; 4KZA A; 4IVK A; 3PBQ A; 3LI9 A; 3WRZ A; 3M6B A; 4Q0I A; 3VFH A; 3UMD A; 4GHI A; 3QHY A; 4EQI A; 3LEZ A; 4O0P A; 5C5K A; 5HAP A; 1TDL A; 4M4X A; 1MWS A; 2O0Y A; 4HJ3 A; 1S67 L; 4LRX C; 1XGJ A; 1W5D A; 1CI9 A; 5GL9 A; 4LPZ A; 3T4K A; 1H5X A; 2HV1 A; 1K56 A; 3UY6 A; 2Y91 A; 3M2J A; 4LRY C; 3IH9 A; 1STZ A; 2VK3 A; 3S7N A; 3UE1 A; 3FC7 A; 1YMS A; 2IA2 A; 1MZU A; 4WZ4 A; 1FIK A; 3V39 A; 1XP4 A; 3EOI A; 2RL3 A; 3G30 A; 1Z09 A; 4GKU A; 2B95 A; 3S7O A; 4S2P A; 4WM9 A; 5HAR A; 2XSS A; 2H0Y A; 4Y2F A; 4P6Z M; 5HDC A; 1EWZ A; 4RQ9 A; 3ZG9 B; 2HDQ A; 2VZW A; 1O7E A; 1F9I A; 4BBT A; 3HUN A; 2E8J A; 2O9A A; 3DTI A; 3BM6 A; 4RX3 A; 1CI8 A; 1GHI A; 2ZL1 B; 1MKM A; 1OPX A; 3U2A A; 4F3L B; 2VGL M; 5HL6 A; 1W7F A; 4H6J B; 4NG2 A; 4P85 A; 5HFO A; 5FDS A; 3UB6 A; 1NRF A; 3T1S A; 5L10 A; 4ZJ1 A; 5EM1 A; 3UE0 A; 2ZMA A; 3LIB A; 1H8Z A; 5KZH A; 1MPL A; 4WN5 A; 1S4R A; 4RA7 A; 5AVE A; 2X02 A; 4HOI A; 3TOI A; 2JKT M; 1PI5 A; 4QJG A; 3A3F A; 4OON A; 1YSQ A; 4R4S A; 1S0W A; 4MBF A; 4DE3 A; 4GDN A; 4UAA A; 5F82 A; 2C5W B; 1YLP A; 4EEU A; 1W63 Q; 3MXR A; 1KDS A; 3BFF A; 3IF6 A; 2Y2K A; 4KQO A; 4E04 A; 4C75 A; 4CLC C; 5DF7 A; 1O07 A; 2W1R A; 4NXG A; 3A3J A; 4CQH A; 3G31 A; 2BAS A; 5EVI A; 4GJ4 A; 2EXA A; 4QU3 A; 2IWB A; 3G35 A; 3MBZ A; 4P0M A; 4WYY A; 2WZX A; 2FZ0 A; 4S2I A; 1BLP A; 1ZTU A; 4UA7 A; 3RTY A; 3EGD C; 3D72 A; 1DY6 A; 1JNU A; 1ESU A; 3CIT A; 2VKS A; 2UV0 E; 5DKK A; 3HLD A; 5J3W A; 5DJT A; 4HJ6 A; 1DP9 A; 3KYZ A; 1LSW A; 1VHM A; 3ZYT A; 3TRC A; 4IBX A; 3MXS A; 4DDS A; 1MXO A; 1BZA A; 1GA0 A; 5AJG A; 2XF3 A; 3C4P A; 2ZOI A; 3OCN A; 3MSH A; 4PM7 A; 1J9M A; 1I2W A; 3JPU A; 3T4O A; 1H8Y A; 2XQZ A; 2INW A; 2K2N A; 2L0W A; 3SW1 A; 3KO6 A; 5CHJ A; 3VP3 A; 3LY4 A; 3SOI A; 3IHA A; 3S7P A; 3BJN A; 2P7J A; 1YPR A; 3OPL A; 4X55 A; 3IS2 A; 4E6W A; 2XEP A; 2PAV P; 1PZO A; 2Y59 A; 5EV0 A; 3FYZ A; 4ESP A; 5DVA A; 2W1T A; 4UA6 A; 3F1O A; 1JTD A; 3PBS A; 1MC0 A; 2VLG A; 2V1A A; 1X0O A; 5EPH A; 1PWC A; 1SDE A; 3HLW A; 4DE2 A; 1L0E A; 3VP1 A; 3NOU C; 3A0V A; 5EOE A; 4PAU A; 1L0G A; 1KGE A; 3UB8 A; 1E25 A; 3TJZ C; 2HP9 A; 2BG1 A; 2XH9 A; 3UE6 A; 2UWX A; 4PKY A; 4P87 A; 1ES5 A; 4ZBE A; 4M3K A; 4E3L A; 5J7E A; 3R7W B; 3P98 A; 1FOF A; 2O9B A; 4IED A; 3OOV A; 3MR0 A; 4KZ9 A; 4HH2 A; 3IX3 A; 2W3E A; 4LRZ E; 3CAX A; 4B93 A; 2WUQ A; 3MJQ A; 5AVF A; 3N8L A; 3L9K A; 3PAG A; 2XGN A; 5FI7 A; 2JCH A; 3TSG A; 4Y0T A; 4JXW A; 5CGX A; 5FAQ A; 5FI6 A; 2YKF A; 4YWZ A; 2EWW A; 4HNB A; 4IBR A; 4WUJ A; 3A0S A; 3TW8 A; 2WGI A; 1EI5 A; 4Y5F A; 1NLZ A; 4YFM A; 1J3W A; 4EXO A; 3LR5 A; 4JF4 A; 5E2F A; 1TS8 A; 2QJ5 A; 1XJ4 A; 2L4R A; 3T1R A; 3UPN A; 5CEC A; 3I7J A; 3WS1 A; 5KSC A; 4N9L A; 4NET A; 3BRM A; 4EER A; 2Y2P A; 2VV7 A; 1HVB A; 4P6B A; 4D2O A; 3Q1F A; 4OVD A; 1S66 L; 4OPY A; 1VEU A; 4Z1W A; 4OOY A; 4PPR A; 2DRW A; 3UN7 A; 2J80 A; 4IJG A; 3ICY A; 1OT6 A; 1Y54 A; 4KQQ A; 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2E8I A; 4X1M A; 3V67 A; 3BLM A; 2ZMV A; 3VMA A; 2M7U A; 3WS0 A; 2PYP A; 5EVI B; 2XD1 A; 4C6Y A; 2PU2 A; 3VSK A; 4JXV A; 1IYO A; 4XT2 A; 3Q82 A; 2ZM2 A; 5DF8 A; 4E3N A; 2BTF P; 3DW0 A; 3G34 A; 5CX7 A; 4LLO B; 1I5Q A; 1D06 A; 1LSV A; 1P9W A; 1DJA A; 3VOZ A; 4BL3 A; 1OTB A; 3ULF A; 4CLC E; 3IWQ A; 1K6S A; 4E6X A; 2PBY A; 3IF5 A; 3LID A; 4BLM A; 4ZJ2 A; 3VV4 A; 3S1Y A; 3V3S A; 4FH2 A; 4QY6 A; 3UPP A; 4B4Z A; 4EBL A; 1N9B A; 2Z2M B; 1TVF A; 3PBN A; 3RXX A; 4D60 A; 4OQH A; 2ACG A; 4S2N C; 5DTK A; 4CJN A; 3VOY A; 3PTE A; 1H3Q A; 3O86 A; 2XLN A; 1KGF A; 3LI8 A; 4HBT A; 1S1Z A; 2QHK A; 4U0X A; 1E3U A; 5FI2 A; 1KE3 A; 3IHB A; 2XDM A; 3ITB A; 3ZGA B; 1H0M A; 4KZ8 A; 2J8Y A; 2PR5 A; 1Q2P A; 1EW0 A; 4FTX A; 1FIL A; 1OTI A; 5HWW A; 2I9V A; 5HW3 A; 3GEC A; 2IWC A; 4HIA A; 3DWK A; 3LR4 A; 4OQ0 A; 4I38 A; 2QJ7 A; 3VP4 A; 3GMW A; 4KUK A; 1QMF A; 3IS2 B; 1MWR A; 4HEF A; 3ZG7 B; 3OC2 A; 4UQI S; 2ZQC A; 3F1O B; 3BYD A; 3OBF A; 1TD5 A; 2FFF B; 2J3W A; 4JXG A; 1XJ2 A; 5FDH A; 4KG5 A; 5DF9 A; 3P09 A; 3WWX A; 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