The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
|
sequence length |
96
|
structure length |
96
|
Chain Sequence |
METAIITLSKDGRITEWNKKAEQLFGLKKENVLGRRLKDLPDFEEIGSVAESVFENKEPVFLNFYKFGERYFNIRFSPFRNAKTQLLEGVIITIDD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of PAS-linked histidine kinase and the response regulator complex
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Sensor protein
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Thermotoga maritima
|
| total genus |
27
|
| structure length |
96
|
| sequence length |
96
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.13.3: Histidine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-03-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Beta-Lactamase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2V0U A; 4WLA A; 1DP8 A; 5HD3 A; 5EFW A; 3LIF A; 4R6L A; 2VV8 A; 4GHI B; 3MR0 A; 5F69 A; 2WKQ A; 2QKP A; 5G4Z A; 3UB6 A; 3B33 A; 2VV7 A; 4JGP A; 3PHY A; 2INW A; 1UWP X; 1LT0 A; 4R70 A; 3BY8 A; 2PR6 A; 2VLG A; 2V1A A; 4LPZ A; 4JGO A; 2OOL A; 4I3J A; 4HY8 A; 3LIA A; 3LID A; 1DP6 A; 1XJ6 A; 5HWV A; 1P0Z A; 4R38 A; 1WA9 A; 5TBM B; 4DJ3 A; 2A24 B; 4LRX C; 5HSQ A; 3F1O B; 4HQA A; 2Z6D A; 4WUJ A; 3UB8 A; 1T1C A; 2KX6 A; 5IU1 A; 2KDK A; 4I3I A; 3H82 A; 3GDI A; 3F1P B; 5HZH A; 2PR5 A; 5DJT A; 4HIA A; 2K7S A; 4HHD A; 2L0W A; 1OT9 A; 3MJQ A; 3H7W A; 4XT2 A; 2GJ3 A; 3UMD A; 1S1Y A; 1S4R A; 1OTB A; 2M1C A; 2JHE A; 4PKY G; 4GS9 A; 1XJ3 A; 2CMN A; 3CAX A; 2Z6C A; 3NOT C; 5AVF A; 5HWW A; 3ULF A; 3LI9 A; 4EES A; 4LRY C; 4EEU A; 2V1B A; 4B9O A; 2R78 A; 3BY9 A; 5F6A A; 1G28 A; 3MXQ A; 2V9A A; 4BBU A; 3E4O A; 5HDD A; 4NXF A; 1LSV A; 1TS0 A; 1XFQ A; 1TS6 A; 3H9W A; 1S1Z A; 2P7J A; 3LYX A; 2ZOI A; 1N9L A; 3VE3 A; 3CLO A; 3UME A; 2I9V A; 1LSW A; 3MFX A; 3NHQ A; 4YWZ A; 5AVE A; 4M4X A; 1D06 A; 4HP9 A; 2EA9 A; 4E04 A; 3NOP C; 5DKL A; 4NXG A; 1GSX A; 2W0N A; 4WL9 A; 4KUO A; 3VOL A; 3MQO A; 1BYW A; 4HH2 A; 2ZBB A; 2H28 A; 3SW1 A; 1VB6 A; 1UGU A; 4EXO A; 2PHY A; 3ICY A; 4EER A; 4MN5 A; 4H6J A; 3ZQ5 A; 3FG8 A; 5HDS A; 4EEP A; 4HJ4 A; 1UWN X; 1S66 L; 4F3L B; 2QJ7 A; 3LIB A; 4JGQ A; 4L9G A; 1N9O A; 2B02 A; 3VE4 A; 4NXB A; 3PYP A; 3D72 A; 1TS8 A; 3LI8 A; 5J7E A; 1GSV A; 1LSX A; 3IS2 A; 4HJ3 A; 1S4S A; 5A8B A; 1DP9 A; 2OWJ A; 4EET B; 3BWL A; 1OJG A; 5DJU A; 3RTY A; 3A0V A; 4GCZ A; 1XFN A; 1OJ5 A; 2W27 A; 1OTA A; 3F1N A; 4HI4 A; 3LIE A; 4HP4 A; 3C8C A; 4GHI A; 3E4P A; 4GW9 A; 2JN7 A; 1P97 A; 4BBT A; 3RH8 B; 5DKK A; 5HD5 A; 3KX0 X; 2PDR A; 5F5Y A; 3G6O A; 3FC7 A; 3LIC A; 3H82 B; 4I39 A; 1V9Y A; 1OTD A; 5I5L A; 3HJI A; 4MN6 A; 5TBM A; 4HNB A; 4WF0 A; 2D02 A; 2A24 A; 2YKH A; 3H7W B; 2PYR A; 4XT2 B; 1T18 A; 4LRZ E; 1XJ4 A; 3F1O A; 1MZU A; 4I3A A; 4L9E A; 3T50 A; 4GS9 B; 3F1P A; 4I5S A; 4LLO B; 2PYP A; 1XJ2 A; 1OTI A; 2WKP A; 3E4Q A; 3NJA A; 3K3D A; 3OLO A; 2OWH A; 1DRM A; 4KQD A; 4HH3 A; 2L4R A; 1S67 L; 3MQQ A; 4RQ9 A; 1OT6 A; 2PD8 A; 2VV6 A; 3A0R A; 4PKY A; 4R3A A; 4KUK A; 5HDC A; 2J80 A; 2V0W A; 5F68 A; 3EWK A; 3A0S A; 2QJ5 A; 3K3C A; 2YKF A; 4EQ1 A; 4NXE A; 3LUQ A; 3CWF A; 5KIZ A; 1KOU A; 2PD7 A; 1F9I A; 1TS7 A; 2WKR A; 1D7E A; 4JGR A; 4K08 A; 3UB9 A; 1LL8 A; 3P7N A; 3UB7 A; 2D01 A; 3EEH A; 3GEC A; 4I38 A; 2QHK A; 1ODV A; 4HOI A; 4H6J B; 1JNU A; 1N9N A; 3HJK A; 1GSW A; 2L1M A; 3UE6 A; 4HJ6 A; 5J4E A; 1V9Z A; 1F98 A; 3NOU C; 3IBR A; 1T1B A; 5HWT A; 4DJ2 A; 1EW0 A; 3IS2 B; 3C2W A; 5G4Y A; 2QWS A; 1T1A A; 4WN5 A; 2HV1 A; 2ZOH A; 1Y28 A; 4L9F A; 1X0O A; 2VEA A; 1OTE A; 4EW7 A; 2BAS A; 1T19 A; 4BBV A; 1NWZ A; 4F3L A; 5IS1 A; 3F1N B; 5J3W A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2V20 A; 1DP8 A; 1SKO A; 3IXD A; 1F5M A; 1E3U A; 5KMW A; 2VV8 A; 3IF6 B; 5F69 A; 2QKP A; 3CIT A; 1E3U D; 2VV7 A; 4D60 A; 3PHY A; 2IWC A; 4DKI A; 1UWP X; 3DTM A; 2Z2M B; 3BY8 A; 3HBR A; 2V1A A; 4PHT A; 1F2K A; 4H8R A; 1VET B; 3WRZ A; 5FQK A; 3LID A; 1LL5 A; 4OOL A; 5EUA A; 3NIA A; 4R38 A; 5TBM B; 2IWD A; 4UQI S; 4OOM A; 2R9X A; 2RCX A; 2I72 A; 4WZ4 A; 5FDS A; 1ZTU A; 3OC2 A; 1K6S A; 2IA2 A; 5FQI A; 4FSF A; 4N1X A; 2WKE A; 1J9M A; 3GDI A; 4KQR A; 3OPH A; 1TF1 A; 2VGK A; 4OPR A; 3Q7Z A; 1BZA A; 2PR5 A; 3VSK A; 1DY6 A; 5CHJ A; 4HHD A; 1G5U A; 3R7W A; 3DTE A; 4U0X A; 4QHC A; 2P9V B; 1OT9 A; 2X01 A; 4NEE D; 4XT2 A; 2GJ3 A; 1S4R A; 1OTB A; 4LEN A; 3NC8 A; 3B47 A; 2WK0 A; 1YMX A; 3GR2 A; 5AQB A; 5FEF A; 5FAS A; 2CMN A; 4Z1W A; 2W3D A; 2Z6C A; 3MF0 A; 3NOT C; 1ACF A; 1JWP A; 5L07 A; 4NK3 A; 1HZO A; 4B9O A; 1K0K A; 3ZNT A; 1CK3 A; 3BYD A; 5EM1 A; 2C6W B; 3SZT A; 4XXR A; 1ERQ A; 3MXQ A; 1K54 C; 1Q2Q A; 5HDD A; 3EGD C; 2XA7 S; 4B4Z A; 1TS0 A; 1XFQ A; 2QZ6 A; 1LI9 A; 4X6T A; 3LR3 A; 4JF6 A; 3BEB A; 3OBF A; 2E8I A; 3UE0 A; 2ZQC A; 2XFT A; 2O9C A; 4DDS A; 3MFX A; 3IBJ A; 3Q82 A; 4YWZ A; 4ZRR A; 2PU2 A; 1GCE A; 3A3J A; 1YM1 A; 5DFX A; 1D06 A; 3N6I A; 4HP9 A; 4ARZ B; 1FSY A; 3MZD A; 2EA9 A; 2WGI A; 4E04 A; 1W8Q A; 3NOP C; 1H8Z A; 4N9L A; 5AQ9 A; 4FOF A; 5M18 A; 5GHY A; 1JTG A; 3MQO A; 4KZ8 A; 5FI2 A; 1BYW A; 3NDE A; 4HH2 A; 3DBA A; 2ZBB A; 1PFL A; 4BD1 A; 2H28 A; 4ZTK A; 3WS1 A; 1UGU A; 3ICY A; 4JF4 A; 4U0T A; 3FYZ A; 2ZM0 A; 1G6O A; 4UA7 A; 2XFS A; 3FG8 A; 5HDS A; 1NZU A; 4HJ4 A; 1FR1 A; 1ES5 A; 4F3L B; 3EQU A; 4PMA A; 3O3V A; 4LV1 A; 2B02 A; 4NXB A; 3IF5 A; 5EVE A; 2O9B A; 2ZC5 B; 1KVL A; 2JKG A; 4QD4 A; 1EI5 A; 2P74 A; 3ZNY A; 5EVL A; 2V1Z A; 1GHP A; 1ONG A; 4QB8 A; 1OJ5 A; 3HLE A; 2EX6 A; 3F1N A; 3DWZ A; 3LIE A; 4HP4 A; 1BLC A; 1GA9 A; 1HD8 A; 1RP5 A; 1JWV A; 4IBX A; 1KGE A; 4QWO A; 2EX2 A; 3IF6 A; 3E0Y A; 4JKT A; 5HD5 A; 3KX0 X; 1NYM A; 3MXS A; 4CJN A; 2PDR A; 2W3H A; 5FSR A; 5HAI A; 3HLB A; 3I7J A; 4YFM A; 4I39 A; 3ZYT A; 1MWS A; 1V9Y A; 1VET A; 5DFY A; 4DXB A; 4GDN A; 4EU0 A; 1OTD A; 1SHV A; 4N9K A; 5HW3 A; 5GLD A; 3UDF A; 2W3E A; 5TBM A; 4E3M A; 2XSS A; 3FPW A; 4WF0 A; 2ZJ9 A; 2PBD P; 3LGO A; 4WBG A; 3SH9 A; 3SOI A; 2XA7 M; 3BFD A; 3LEZ A; 3PBS A; 2HJ9 C; 2VK3 A; 3K2N A; 4KZ4 A; 4LRZ E; 3EGX C; 1C3B A; 3T50 A; 1IYP A; 4GS9 B; 3PBT A; 1SDE A; 2CC1 A; 3T4J A; 4O0P A; 4WZ5 C; 3ITB A; 1ZG4 A; 3W4O A; 3C5A A; 3UPN A; 3LO7 A; 4CLC D; 2H10 A; 2ZMA A; 2G2U A; 4R3B A; 2WKP A; 2P9V A; 3UNW A; 1ZHH B; 1PWD A; 4GB7 A; 4OPY A; 3Q81 A; 4OQI A; 1SZV A; 2Y55 A; 4KQD A; 2B5R A; 2XGN A; 3PXP A; 4MMN A; 4M3K A; 2QMI A; 4PKY A; 4R3A A; 4E3N A; 5TFQ A; 4OON A; 4BWI A; 3W8K A; 3QNB A; 4EQ1 A; 2JKT M; 5BOH A; 4DMZ A; 3IWQ A; 3LUQ A; 1KOU A; 1F9I A; 3GMW A; 2WKR A; 5HL6 A; 1D7E A; 4CPK A; 2ACG A; 2ZC6 B; 3HUO A; 3BFG A; 1PYY A; 4YIN A; 1FIK A; 3RXW A; 4P6Z M; 2D01 A; 4ZJ2 A; 2HDR A; 1PZP A; 4Y2F A; 2Y2L A; 3GEC A; 4FUW A; 3VMA A; 4DDY A; 1GSW A; 4HJ6 A; 4ARZ A; 5K5B A; 1NXY A; 4OP8 A; 3BFC A; 1KE4 A; 1V9Z A; 5HPI A; 1T1B A; 4E6X A; 4DJ2 A; 4FD8 A; 1PZO A; 2Y79 A; 4LV2 A; 3LY4 A; 2G2W A; 5G18 A; 4N92 A; 2BTF P; 4A5R A; 2HGV A; 1PNE A; 1BT5 A; 1VQQ A; 4L9F A; 4G3K A; 4EV4 A; 4KZ9 A; 2VEA A; 5LBR A; 4S2N C; 4EW7 A; 2JCH A; 4F3L A; 2V8F A; 2KOI A; 5J3W A; 1XKZ A; 3UN7 A; 3WS4 A; 1CJF A; 5EFW A; 2Y2M A; 3TW8 A; 1W79 A; 2QPN A; 2PAV P; 5E2F A; 3S7P A; 5FL3 A; 5M1A A; 5TR7 A; 5EM0 A; 3VP4 A; 1PI4 A; 1NZO A; 5GHZ A; 2NUT C; 4JGP A; 1XXM A; 1FOF A; 1LT0 A; 4WM9 A; 4DRT A; 3UO9 A; 2PR6 A; 1ES2 A; 4LFU A; 2K31 A; 3ZVT A; 1KGG A; 4JGO A; 3SH7 A; 2OOL A; 4I3J A; 1H0M A; 5HAR A; 3T12 B; 1H3Q A; 3LIA A; 1IEM A; 1DP6 A; 1P0Z A; 3NUL A; 1U60 A; 5GLC A; 4GDB A; 3HLC A; 2A24 B; 4K91 A; 2HDQ A; 3F1O B; 4HQA A; 2XLN A; 4WUJ A; 2KX6 A; 4IHQ A; 1ES4 A; 2KDK A; 3DTK A; 3T1R A; 3V3R A; 4R23 A; 1MXO A; 5AJG A; 3P01 A; 2Y8H A; 5GL9 A; 4ZJ1 A; 1FR6 A; 5DJT A; 4KG2 A; 4S2I A; 4HIA A; 3ISG A; 3CG5 A; 1BSG A; 4R4R A; 2HP5 A; 5FAQ A; 2VA0 A; 3MJQ A; 3KSH A; 1K57 A; 2VX8 A; 4WEK A; 4MBF A; 5DF7 A; 4WEL A; 4S2K A; 1MWR A; 4GLQ A; 4QY6 A; 3L7H A; 4GS9 A; 1XJ3 A; 3QP8 A; 3CAX A; 3LCE A; 3TOI A; 5HWW A; 5AVF A; 3ULF A; 3WS5 A; 4BMW A; 1K56 D; 4EES A; 2V1B A; 3O87 A; 3GQZ A; 5F6A A; 4ETZ A; 5FI6 A; 1ZC2 A; 4OQH A; 2H0Y A; 5F83 A; 3ZFZ A; 4BJP A; 2O0Y A; 1L0G A; 4X53 A; 3MBZ A; 3T4T A; 1FIL A; 2P7J A; 4KZA A; 1K55 A; 2H5S A; 1W63 Q; 1XGI A; 2LB9 A; 1FSW A; 5E2E A; 2I9V A; 1A0K A; 4EQI A; 1YQS A; 1FCO A; 1XPB A; 3NHQ A; 2HF6 A; 3MZE A; 3RFB A; 4RVA A; 5HX9 A; 3N8S A; 5A91 A; 5DKL A; 1GSX A; 2E8J A; 2W0N A; 4WL9 A; 4KUO A; 1ES3 A; 4BD0 A; 4KQO A; 3VOL A; 2HZ5 A; 1NY0 A; 4WMC A; 3PTE A; 3IT9 A; 4G3W A; 3N7W A; 1ERM A; 2PHY A; 4WMC D; 4NKP A; 4IVI A; 2Y4A A; 1RGZ A; 2FH5 A; 2V8C A; 2Y59 A; 3A3E A; 1YT4 A; 3IX3 A; 4MN7 A; 2EX8 A; 4DE1 A; 3ZG7 B; 3LR5 A; 2QJ7 A; 1K4F A; 5JYP A; 4PM6 A; 3Q1F A; 2J9O A; 5CTM A; 1K4E A; 4X68 A; 3D72 A; 3T4K A; 3LI8 A; 1LSX A; 4HJ3 A; 3VV4 A; 1S4S A; 4PM9 A; 4ID4 A; 1RGY A; 1DP9 A; 2OWJ A; 4EET B; 3UDX A; 4DE2 A; 4JXW A; 1OJG A; 3RTY A; 2GNX A; 2VGL M; 3A0V A; 3WWX A; 2DCF A; 2A49 A; 2VKS A; 5AQA A; 2AVX A; 3DAV A; 5CX7 A; 1I5Q A; 2Y2G A; 3E4P A; 4GW9 A; 2JN7 A; 3IXB A; 3UPP A; 2K2N A; 3ZGA B; 1P97 A; 4HES A; 5DKK A; 3DW0 A; 4WYY A; 3MFD A; 1JWZ A; 1L3L A; 3VOZ A; 1L2S A; 2EFX A; 4IUH A; 5F5Y A; 4KZ3 A; 3G6O A; 2OLV A; 3LIC A; 4Y5F A; 1W8Y A; 3H82 B; 1MY8 A; 3IHA A; 5CHU A; 2Y2I A; 2UV0 E; 1K54 A; 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4ZAM A; 4E3I A; 2Q9M A; 3UPO A; 1GA0 A; 2EXA A; 3QHY A; 1N4O A; 5HWT A; 3HL9 A; 2PU4 A; 5EE8 A; 4OP5 A; 3IS2 B; 4LCM A; 2QWS A; 1T1A A; 1XX2 A; 2MJ6 A; 3ZDJ A; 3PBR A; 5JYO A; 2ZOH A; 5DF8 A; 1NLZ A; 1ERO A; 4MEZ A; 1VM1 A; 4U3T A; 1SDN A; 3T1S A; 4Z9Q A; 2BAS A; 1T19 A; 4KZ6 A; 3AGF A; 4E3O A; 2V0U A; 4WLA A; 1XGJ A; 3PBO A; 4OPQ A; 3PBN A; 2Y2H A; 4GNU A; 1MWT A; 3LIF A; 3MKF A; 2ZD8 A; 4DXC A; 4GHI B; 3MR0 A; 5L2F A; 4WZ5 A; 5U47 A; 2XD1 A; 3B33 A; 1VHM A; 3ZG8 B; 3U4L P; 1BTL A; 3S1Y A; 3UDI A; 4CLC C; 1DJA A; 2WAF A; 1K25 A; 3BLS A; 3PAG A; 3FPV A; 3LR0 A; 3BEC A; 4HY8 A; 3QP2 A; 1I2S A; 1WYB A; 4P6B A; 5HWV A; 1WA9 A; 1AXB A; 4Y13 A; 3ITA A; 1M6K A; 2V2F F; 3C4O A; 4LRX C; 3VOY A; 2J9P A; 5HSQ A; 1FQG A; 3OOV A; 2GX5 A; 3UB8 A; 3IX8 A; 5IU1 A; 5EVI C; 5AQ7 A; 3H82 A; 4S2P A; 1MPL A; 3F1P B; 4PPR A; 2LB5 A; 4DE0 A; 2GZA A; 1SKF A; 4UA9 A; 1H5X A; 4Y0T A; 4EUV A; 2K7S A; 4B88 A; 4BEN A; 3U2A A; 1Z09 A; 2L0W A; 3BW6 A; 2WZZ A; 3CHW P; 3H7W A; 3LY3 A; 1S1Y A; 3BRM A; 2M1C A; 5GLB A; 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