The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
|
sequence length |
96
|
structure length |
96
|
Chain Sequence |
METAIITLSKDGRITEWNKKAEQLFGLKKENVLGRRLKDLPDFEEIGSVAESVFENKEPVFLNMYKMGERYFNIRFSPFRNAKTQLLEGVIITIDD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of PAS-linked histidine kinase and the response regulator complex
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Thermotoga maritima
|
| molecule keywords |
Sensor protein
|
| total genus |
28
|
| structure length |
96
|
| sequence length |
96
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.13.3: Histidine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-03-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Beta-Lactamase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2V9A A; 3BWL A; 2K7S A; 3KX0 X; 4HP4 A; 5J3W A; 4LPZ A; 3PHY A; 3K3C A; 3GDI A; 3RTY A; 4B9O A; 5I5L A; 1V9Z A; 1F98 A; 1OTI A; 3UB7 A; 3F1N B; 3F1P A; 1D7E A; 5F5Y A; 2JN7 A; 1T18 A; 4H6J A; 3CAX A; 2KDK A; 1DRM A; 5IS1 A; 4JGR A; 1OTB A; 2ZOI A; 4I39 A; 1TS7 A; 4XT2 B; 2R78 A; 1OT6 A; 2L4R A; 3E4Q A; 4EXO A; 3A0S A; 3LIE A; 1GSX A; 2VLG A; 4GS9 B; 1T1C A; 2J80 A; 3H7W A; 5J4E A; 1ODV A; 4EER A; 5HDD A; 2A24 A; 4KQD A; 2ZOH A; 4HY8 A; 5HWV A; 1T19 A; 3NOU C; 5A8B A; 4DJ2 A; 4PKY A; 5KIZ A; 4WL9 A; 4I3J A; 1XFQ A; 3IS2 A; 3NOP C; 2B02 A; 4GHI B; 3UB9 A; 1P0Z A; 2OWJ A; 4HIA A; 4WF0 A; 2CMN A; 4EET B; 2V0W A; 1D06 A; 2M1C A; 2D01 A; 2QJ5 A; 2OOL A; 5EFW A; 4WN5 A; 1LSW A; 1LSX A; 4JGP A; 4I3A A; 2W0N A; 3NOT C; 3FC7 A; 4YWZ A; 2PDR A; 3C2W A; 3H82 B; 4WUJ A; 3UE6 A; 5IU1 A; 2PYR A; 4L9E A; 5TBM B; 4R3A A; 2PD7 A; 3PYP A; 5HSQ A; 5F69 A; 4HJ3 A; 1OTA A; 3GEC A; 3MQO A; 4EW7 A; 4HP9 A; 5AVF A; 3MFX A; 3A0V A; 2YKH A; 1XJ6 A; 3CWF A; 1T1B A; 1DP8 A; 4NXB A; 3UB8 A; 1N9O A; 4I3I A; 4JGQ A; 4HI4 A; 4LRX C; 2WKP A; 3F1O B; 2YKF A; 1LL8 A; 1X0O A; 1GSV A; 4HHD A; 4HH3 A; 4F3L A; 2D02 A; 4GCZ A; 3CLO A; 4HOI A; 2QWS A; 4M4X A; 3NHQ A; 2WKR A; 5G4Y A; 1XFN A; 2HV1 A; 3P7N A; 4R38 A; 2JHE A; 3A0R A; 1S67 L; 4R70 A; 3LIC A; 3UMD A; 3MR0 A; 4KUK A; 4EES A; 2QJ7 A; 3F1P B; 2W27 A; 3G6O A; 3MQQ A; 1TS6 A; 4H6J B; 4KUO A; 1N9L A; 4BBU A; 3LI8 A; 2PR6 A; 3SW1 A; 4NXF A; 3LYX A; 3NJA A; 1S4R A; 4WLA A; 3EEH A; 3H7W B; 5AVE A; 4HH2 A; 3LIA A; 2A24 B; 2H28 A; 2Z6D A; 1F9I A; 1P97 A; 5J7E A; 1XJ3 A; 4I38 A; 2GJ3 A; 2INW A; 1G28 A; 3F1N A; 2WKQ A; 4BBV A; 1OTE A; 3ZQ5 A; 1TS8 A; 1S1Y A; 1T1A A; 5G4Z A; 5DKL A; 3IS2 B; 4XT2 A; 5F6A A; 5HWT A; 1GSW A; 1OJG A; 3E4O A; 4K08 A; 1Y28 A; 4RQ9 A; 4HNB A; 1S1Z A; 4GS9 A; 2L1M A; 1V9Y A; 2L0W A; 2PHY A; 3H9W A; 2V1B A; 1MZU A; 3ICY A; 5HZH A; 1LT0 A; 2V0U A; 3LIF A; 3HJK A; 3C8C A; 4LLO B; 2I9V A; 2EA9 A; 4LRZ E; 1DP6 A; 2VEA A; 4L9G A; 3OLO A; 5DJU A; 2QHK A; 4PKY G; 3VE4 A; 3UME A; 2QKP A; 1JNU A; 1BYW A; 4GHI A; 1TS0 A; 4GW9 A; 4E04 A; 4I5S A; 4L9F A; 4NXE A; 1UWN X; 4NXG A; 2VV7 A; 4MN6 A; 4LRY C; 3EWK A; 3K3D A; 5HWW A; 1VB6 A; 3VOL A; 3BY8 A; 2ZBB A; 3BY9 A; 4R6L A; 4HJ4 A; 3UB6 A; 2VV6 A; 1N9N A; 2KX6 A; 2V1A A; 3IBR A; 1UGU A; 4MN5 A; 3H82 A; 2VV8 A; 3B33 A; 2P7J A; 4F3L B; 4EEP A; 3T50 A; 3LUQ A; 5F68 A; 3LI9 A; 1KOU A; 5TBM A; 1NWZ A; 1LSV A; 3RH8 B; 2PR5 A; 5HD5 A; 3MJQ A; 1S66 L; 4HJ6 A; 1OTD A; 4EQ1 A; 4EEU A; 1WA9 A; 1DP9 A; 1OJ5 A; 2Z6C A; 4HQA A; 1EW0 A; 5HDC A; 2BAS A; 4BBT A; 3HJI A; 2PD8 A; 2PYP A; 5HDS A; 5DKK A; 3E4P A; 4JGO A; 3ULF A; 3LIB A; 1UWP X; 3FG8 A; 5DJT A; 3VE3 A; 1XJ2 A; 3LID A; 4DJ3 A; 3MXQ A; 2OWH A; 3D72 A; 1S4S A; 3F1O A; 5HD3 A; 1OT9 A; 1XJ4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2OLU A; 2DNS A; 3OCL A; 1BTL A; 2VGL M; 4UHU A; 5M18 A; 1XPB A; 1IKG A; 3RTY A; 2WYX A; 4K0W A; 4Y5F A; 4JF5 A; 4BL2 A; 1NRF A; 4WZ5 A; 3Q81 A; 2JBF A; 3VP3 A; 1T18 A; 5GL9 A; 4X1L A; 3FWL A; 1TS7 A; 4JKT A; 2GDN A; 2XF3 A; 2R78 A; 3C7V A; 1ESU A; 3E4Q A; 2Y59 A; 3LIE A; 1K4F A; 3PAE A; 1MXO A; 3N8S A; 3O86 A; 1GHM A; 1KDW A; 4RYE A; 4KZ9 A; 1PZP A; 3KYE A; 3D9Y A; 3VSK A; 2R9W A; 5FAT A; 4EER A; 1YSP A; 4QWO A; 4X68 A; 1W8Q A; 4LV2 A; 4KQD A; 4BMW A; 4UAA A; 1LI0 A; 4R3B A; 3U2A A; 1ERM A; 2Y8H A; 3S7P A; 5CTM A; 4E3N A; 3DWZ A; 3GSG A; 4PKY A; 3IF6 A; 4E3J A; 1F2K A; 1IOU A; 3EEA A; 4I3J A; 4O01 A; 3EQU A; 1WYC A; 4DMZ A; 4GHI B; 2OWJ A; 5EVI A; 3CPT B; 3PBN A; 3LR0 A; 3A3D A; 3NUL A; 3AGE A; 1G6A A; 3ZG0 A; 1K6S A; 4EET B; 2JKT M; 3CG5 A; 1U60 A; 4AFI A; 1IYO A; 2AVX A; 2XA7 S; 5TFQ A; 1K25 A; 3T4S A; 2B95 A; 4I3A A; 3TSG A; 4LV3 A; 2EWW A; 3H82 B; 1FSY A; 4WUJ A; 2O9C A; 4ID4 A; 3ZNT A; 5JYP A; 2PYR A; 4L9E A; 5HW3 A; 1KDS A; 4A5R A; 1YT4 A; 4HJ3 A; 1OTA A; 4DDS A; 3VOY A; 4QU3 A; 1MKM A; 3MQO A; 4JXS A; 3W4Q A; 3T1R A; 3HLG A; 2XFS A; 3A0V A; 4RX2 A; 2H0T A; 1XJ6 A; 1W7F A; 1KVM A; 3AGD A; 3CWF A; 3MF0 A; 5DTT A; 1DP8 A; 4NXB A; 3UB8 A; 1AWI A; 5EVI D; 2W3D A; 3LR4 A; 4I3I A; 4JGQ A; 3IX4 A; 1YPR A; 4B93 A; 4LRX C; 4HES A; 1PYY A; 3P09 A; 4KZB A; 2Y2I A; 3ITA A; 4ETZ A; 4XUZ A; 2XLN A; 4S2K A; 2D02 A; 3IHB A; 2ZMF A; 2QWS A; 4M4X A; 2HV1 A; 1JWV A; 2W1R A; 2QYB A; 3WS2 A; 3A0R A; 4BEN A; 1STZ A; 4QPR A; 3LIC A; 4CLC E; 1KE4 A; 2QPN A; 3G6O A; 4JLF A; 4OPZ A; 3MQQ A; 4ZJ1 A; 4CLC A; 3DTK A; 3IWQ A; 4BBU A; 1K6R A; 3ZDJ A; 2J9P A; 2C5W B; 5E2H A; 2FH5 A; 4WLA A; 1K57 A; 1ES4 A; 2V1Z A; 2EFX A; 4KZ3 A; 1SCW A; 4RX3 A; 4UQI S; 5AVE A; 3HLF A; 4X53 A; 1A0K A; 2A3U A; 1P97 A; 4ARZ A; 3E2K A; 1RGY A; 1JWP A; 3E98 A; 3MBZ A; 4WZ5 C; 3T12 B; 3BQ8 A; 2ZM8 A; 3F1N A; 4EV4 A; 2WKQ A; 1OTE A; 3DAV A; 4JBF A; 2XDM A; 3IT9 A; 1TS8 A; 4BJP A; 3IF6 B; 4XXR A; 4Q0J A; 2Z2M B; 4B4Z A; 1GSW A; 4DE1 A; 5EVI B; 3TE8 A; 4G3V A; 4E6X A; 4BD0 A; 4K08 A; 3L7H A; 4CLC D; 3IXG A; 3FPV A; 3E0Y A; 4PM6 A; 3H9W A; 2XH9 A; 3AGF A; 2WAE A; 5TGF A; 4IED A; 3CHW P; 2W3E A; 4WEL A; 1LT0 A; 1YMX A; 4PHT A; 3BLS A; 2EA9 A; 2VGK A; 4N92 A; 2ZJ9 A; 2VZW A; 4L9G A; 1HVB A; 1J3W A; 1ES2 A; 3IF6 C; 4EBL A; 4PKY G; 1TVF A; 3VE4 A; 2QKP A; 1JNU A; 1BYW A; 4KQO A; 5EVI C; 2Y2O A; 2HDR A; 3TRC A; 5CRF A; 2VV7 A; 4BD1 A; 4MN6 A; 4PPR A; 2J8Y A; 3ZVT A; 4DRT A; 4GDN A; 3VOL A; 2ZBB A; 1GA0 A; 2H10 A; 2ZQ7 A; 5HX9 A; 1W63 M; 3R7W A; 3A3I A; 1E3U A; 1N9N A; 1BLH A; 1VQQ A; 2V1A A; 2FFF B; 1Q2P A; 2VV8 A; 3B33 A; 3HBR A; 1LHY A; 5LBR A; 1BLS A; 5BOH A; 4X56 A; 5TBM A; 3RH8 B; 4GOG A; 4O0P A; 5DFY A; 3D3O A; 4EQ1 A; 3T4Q A; 3QP5 A; 3G2Y A; 5L07 A; 2XRO A; 5HDC A; 2BAS A; 3HJI A; 3WRT A; 1MWU A; 5DKK A; 1JWZ A; 4IHQ A; 3ULF A; 3MFD A; 1I2W A; 4CLC B; 3LIB A; 2PBY A; 1NXY A; 2Y2G A; 1KE0 A; 1AXB A; 1PWD A; 3S22 A; 4B4X A; 5DJT A; 1L0D A; 4ESP A; 5E2G A; 3QNC A; 2OWH A; 5KSC A; 1NZU A; 2RCX A; 4QY5 A; 1EI5 A; 3NDE A; 5D3O A; 3UE3 A; 5CEC A; 3S7O A; 4BLM A; 2V9A A; 3BWL A; 2ACG A; 3MS6 A; 4UA9 A; 4X25 A; 2DMW A; 1CF0 A; 3LR5 A; 1H8M A; 4FH2 A; 4L0L A; 1ZG6 A; 4GD6 A; 3PHY A; 3K3C A; 2HJ9 C; 2ZQ9 A; 3GDI A; 2ZM0 A; 4P6Z M; 2R9X A; 2ZC5 B; 1FR6 A; 4ARZ B; 4K0X A; 1MWT A; 4MBF A; 1LI9 A; 1V9Z A; 2EXA A; 1OTI A; 3UB7 A; 3F1N B; 3F1P A; 5F5Y A; 4DN0 A; 3CJM A; 1FOF A; 2Y2H A; 4FTX A; 3GVB A; 4E3L A; 1DRM A; 4JGR A; 4CLC C; 3UPP A; 4I39 A; 2VA0 A; 4ETX A; 1ZC2 A; 4QB8 A; 3A0S A; 1K56 D; 5E2F A; 2VLG A; 4KZ5 A; 1NLY A; 2Y2L A; 1K57 C; 3NI9 A; 3V39 A; 3M2K A; 2OAP 1; 1NJ4 A; 1L0E A; 1Z6F A; 4WEK A; 2XD5 A; 5HDD A; 3KSH A; 3FV7 A; 4O7D A; 1T19 A; 3WWX A; 1LL9 A; 3EOI A; 2XQZ A; 3LR3 A; 2HGV A; 1NYM A; 1MKI A; 4WL9 A; 4Y15 A; 5FQ9 A; 1YAX A; 5F1F A; 4X1M A; 3CUE A; 4H8R A; 1YLZ A; 1XFQ A; 2B02 A; 1FIK A; 1H3Q A; 4HIA A; 4OOY A; 2DCF A; 5GHY A; 1NY0 A; 2ZQC A; 2CMN A; 4MN7 A; 2VK3 A; 5GLC A; 1YLY A; 2V0W A; 1D06 A; 1RCJ A; 2M1C A; 2D01 A; 1IEM A; 2XGN A; 4WN5 A; 4GD8 A; 1PWC A; 4JGP A; 3R7W B; 2XR0 A; 2ZC7 A; 3NOT C; 1XKZ A; 4MLL A; 4NEE D; 4YWZ A; 2PDR A; 4B88 A; 2EX9 A; 3LFV A; 4ZRR A; 1WYB A; 3UE6 A; 3PBS A; 2J3T D; 3Q7V A; 3MKE A; 5TBM B; 4IBX A; 1ONH A; 3PYP A; 4MBK A; 4OQI A; 4ZDX A; 4GJ4 A; 3T4J A; 2WKE A; 3MXS A; 2JKT I; 3ZYT A; 5FAP A; 3EQV A; 3UDF A; 3I7J A; 3MFX A; 3NC8 A; 4NK3 A; 3NEC A; 3UO9 A; 5KMW A; 1LL5 A; 4HI4 A; 1K55 C; 5FAQ A; 4QJG A; 1MPL A; 2YKF A; 1LL8 A; 1X0O A; 1YLT A; 3V3R A; 4HHD A; 3O88 A; 3WRZ A; 4GCZ A; 1VEU A; 3UE0 A; 4HOI A; 5HAP A; 4P0M A; 4CPK A; 4R38 A; 1YKD A; 3K2N A; 3BLM A; 1S67 L; 4R70 A; 3VP2 A; 3IH8 A; 1Z09 A; 1BUL A; 5EM1 A; 3RJU A; 1IYQ A; 2GX5 A; 3F1P B; 3DTE A; 5HPI A; 3P98 A; 4HBT A; 5HAI A; 1TS6 A; 4KUO A; 3SOI A; 1N9L A; 5FI7 A; 1BT5 A; 5A91 A; 1SKO A; 2ZQD A; 3LI8 A; 1G68 A; 2ZMA A; 5GHZ A; 2K31 A; 2PR6 A; 2Z2L B; 1BLP A; 3T1X A; 4NXF A; 5FDS A; 3UY6 A; 3IXH A; 3IX8 A; 3ZCZ A; 3O87 A; 4OON A; 5EVE A; 1K54 A; 5DF9 A; 4YNR A; 3EEH A; 1TDG A; 3UDI A; 2GZA A; 5IHV A; 2Y2P A; 1XX2 A; 2RL3 A; 3PTE A; 4GB7 A; 3M6B A; 4X6T A; 3IHA A; 2I72 A; 2LB5 A; 3NBL A; 1OME A; 3ITB A; 5J7E A; 3KYQ A; 4D60 A; 4I38 A; 2GJ3 A; 2INW A; 4DF6 A; 4BBV A; 5GLA A; 3V50 A; 1OPX A; 1S1Y A; 2HJE A; 3PR6 A; 2OV5 A; 4KZ6 A; 5G4Z A; 5DKL A; 4XT2 A; 5F6A A; 2Y2K A; 3UN7 A; 5CGW A; 1SDN A; 3E4O A; 3Q82 A; 1Y28 A; 5GHX A; 1H0M A; 5DVA A; 5HFO A; 3OPL A; 1PRQ A; 4S2I A; 3BEB A; 3KSF A; 2L0W A; 2C6W B; 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1XGI A; 1F98 A; 3DTI A; 1FQG A; 1KE3 A; 3G31 A; 1D7E A; 2V20 A; 4G3W A; 2O9B A; 1BSG A; 4H6J A; 3IXB A; 3CAX A; 1CI9 A; 3N4I A; 1FCM A; 4XT2 B; 2XA7 M; 3VP1 A; 1OT6 A; 5GLD A; 4ZTK A; 1TDL A; 2WGV A; 1SZV A; 4DXC A; 4FUW A; 3ZHH A; 2PBD P; 3A3F A; 1K54 C; 2B5R A; 4OPQ A; 2J80 A; 5J4E A; 2GNX A; 2W1T B; 1K55 A; 2A24 A; 2ZOH A; 3MSH A; 4HY8 A; 5JYO A; 5KZH A; 1G5U A; 1GHI A; 4ZBE A; 4DJ2 A; 3JVU A; 1N9B A; 4ZAM A; 2VGL S; 4DE3 A; 2HF6 A; 1VHM A; 1F5M A; 5DTS A; 4R4R A; 2NUT C; 3GMW A; 3RXW A; 5KIZ A; 3HUN A; 4C3Q A; 3SS3 A; 5FQK A; 4MEZ A; 4KQQ A; 4WEJ A; 3G32 A; 3IS2 A; 4EU0 A; 5CXW A; 5F83 A; 3BFF A; 1BUE A; 2EX6 A; 3UB9 A; 1P0Z A; 1KGG A; 2WK0 A; 4WF0 A; 3WS5 A; 4C75 A; 2HPB A; 3Q07 A; 1PZO A; 1G6O A; 2WAF A; 3SH9 A; 4LV0 A; 5FEF A; 1N4O A; 4FSF A; 2OOL A; 1K56 A; 1EWZ A; 5F1G A; 4EUZ A; 5EEC A; 3QP2 A; 2V8C A; 5FQI A; 2W0N A; 4E3M A; 1Y4O A; 1L0G A; 2DRW A; 3C2W A; 3RFB A; 1XXM A; 1H8Z A; 4C6Y A; 5EM0 A; 3PBQ A; 5IU1 A; 2BTF P; 5FA7 A; 2PD7 A; 2V2F F; 5F69 A; 4OP8 A; 5TJJ A; 2ZC3 B; 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