The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
46
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
TINPTNYTLLKKQAASLIEDEHHMIAILSNMSALLNDNLDQINWVGFYLLEQNELILGPFQGHPACVHIPIGKGVCGTAVSERRTQVVADVHQFKGHIACDANSKSEIVVPIFKDDKIIGVLDIDAPITDRFDDNDKEHLEAIVKIIEKQLA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| source organism |
Staphylococcus aureus
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| publication title |
structure of fRMsr of Staphylococcus aureus
rcsb |
| molecule keywords |
Putative uncharacterized protein
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| total genus |
46
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature |
ec
1.8.4.14: L-methionine (R)-S-oxide reductase. |
| pdb deposition date | 2009-11-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Beta-Lactamase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VHM A; 4Z1W A; 5HPF A; 3BJN A; 3IBR A; 2K31 A; 4G3W A; 4IJG A; 3E0Y A; 3NOP C; 4G3K A; 4O01 A; 3CI6 A; 4LRY C; 4IUH A; 1YSP A; 2KLI A; 2KOI A; 4QPR A; 3E98 A; 2OOL A; 2O9B A; 4PAU A; 4Y3I A; 4Y5F A; 4ZRR A; 4RQ9 A; 3W2Z A; 2VJW A; 3G6O A; 4FOF A; 3S7Q A; 4YNR A; 1STZ A; 3VV4 A; 3HCY A; 2O9A A; 1MKM A; 4Y2F A; 3KSG A; 2W3H A; 3EEA A; 3C2W A; 4E04 A; 3K2N A; 2M7U A; 3ZQ5 A; 5DFX A; 2ZMF A; 5HPI A; 2IA2 A; 3DBA A; 3MMH A; 3CIT A; 2M7V A; 2W3E A; 3NOU C; 2W3F A; 2W3D A; 4CQH A; 3MQ0 A; 4O8G A; 5DFY A; 2XSS A; 4DMZ A; 1YSQ A; 1YKD A; 2W1T B; 5I5L A; 2O99 A; 3OOV A; 5LBR A; 4IUK A; 3S7O A; 2QYB A; 3TRC A; 2W3G A; 3S7P A; 5HL6 A; 4MDZ A; 3LFV A; 3NOT C; 3IBJ A; 3KSF A; 4ME4 A; 3RFB A; 5TJJ A; 2O9C A; 3D3O A; 2XRN A; 4R6L A; 1TF1 A; 2Y79 A; 4MN7 A; 2W1T A; 4GLQ A; 2LB9 A; 2HGV A; 2LB5 A; 5L8M A; 4BWI A; 1MC0 A; 4EU0 A; 4ETX A; 2XRO A; 2VZW A; 4MCW A; 2GX5 A; 4YOF A; 1F5M A; 4R70 A; 3R4K A; 4LRZ E; 4O0P A; 4DN0 A; 3NHQ A; 2G7U A; 2VEA A; 3OBF A; 2Y8H A; 4GW9 A; 5HSQ A; 3S7N A; 4Q0J A; 4ETZ A; 5AJG A; 4Q0I A; 3KSI A; 3KO6 A; 2VKS A; 4G3V A; 1TD5 A; 5C5K A; 2W1R A; 3MF0 A; 4Q0H A; 4EUV A; 2O0Y A; 1ZTU A; 3O5Y A; 5K5B A; 4LRX C; 2K2N A; 3KSH A; 2B18 A; 4MMN A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2JKF A; 2WK0 A; 3FC7 A; 2K31 A; 3WRZ A; 1V9Z A; 2CMN A; 4LRY C; 5CER A; 1GHP A; 1DJC A; 1ERQ A; 3MS6 A; 1HTZ A; 4RQ9 A; 1GSW A; 4KG6 A; 3CWF A; 2O9A A; 5AQA A; 4P6B A; 3T1Q B; 4UA9 A; 3UB8 A; 2VGK A; 1K6S A; 1A0K A; 2V8C A; 1RGY A; 5EVI D; 5U47 A; 1Z6F A; 1Y28 A; 4QU3 A; 5HD5 A; 1ONG A; 3MZD A; 3N8S A; 3IXG A; 4U0X A; 2ZMA A; 1W63 Q; 4IVK A; 4DJ3 A; 3TRC A; 3HBR A; 1Y54 A; 3R7W B; 4II7 A; 5TJJ A; 5GLD A; 3T4Q A; 2BAS A; 2EFX A; 3B42 A; 3FPW A; 1JWP A; 3QP2 A; 3A0V A; 3EQU A; 1DJA A; 3DWK A; 2D02 A; 4GKU A; 3RXX A; 2XRO A; 2VZW A; 2GX5 A; 4JF4 A; 2FFF B; 1FR6 A; 4N1X A; 2Y2N A; 1NRJ A; 5DF9 A; 3ZVT A; 3M6H A; 2D01 A; 2WAD A; 2VK3 A; 5HAI A; 1TS6 A; 5AQB A; 4EUV A; 3TE8 A; 2XFS A; 5JYP A; 1J3W A; 4YIN A; 4GOG A; 5I94 A; 4DRT A; 1OTD A; 3SZT A; 3KSH A; 3LIF A; 2OWH A; 1IEL A; 3PBN A; 1ZG4 A; 4BBV A; 1XP4 A; 2EX2 A; 2OWJ A; 1ES5 A; 3A3E A; 2ZQC A; 4Y5F A; 2XQZ A; 3LGO A; 4Y17 A; 3U2A A; 2C6W B; 4ARZ B; 2W3H A; 4NXG A; 1FSW A; 4N9L A; 3F1N A; 4S2N C; 2WZX A; 4JXW A; 1N9L A; 3BY9 A; 1D06 A; 1IYP A; 5DVA A; 1MWR A; 2W3F A; 1T1A A; 5GLB A; 2Y2M A; 2ZC5 B; 1SDN A; 1RCJ A; 3PHY A; 5I5L A; 4RVA A; 1H0M A; 3S7O A; 3VOZ A; 1LL9 A; 3P7N A; 3T1R A; 1JVJ A; 3IHA A; 2B5R A; 3BQA A; 5E2H A; 3F1P B; 5J7E A; 5HAQ A; 4D60 A; 1QME A; 3VP2 A; 5L09 A; 4WZ4 A; 2ZM8 A; 4LFU A; 3R4K A; 5D3O A; 1XFQ A; 1HZO A; 4IVI A; 1YQS A; 2PDR A; 2ZL1 A; 5AJG A; 1K38 A; 3UME A; 1XKZ A; 5EE8 A; 3UE1 A; 5HDC A; 5JYO A; 4HIA A; 3T1S A; 4FUW A; 2NUP C; 3H9W A; 4R0Q A; 1YLP A; 2XR0 A; 3RJU A; 5FA7 A; 5HWW A; 1G5U A; 3CZD A; 5G4Z A; 3SH8 A; 1L2S A; 4BL2 A; 4E3J A; 5HW3 A; 2QMI A; 4BJP A; 2JC7 A; 5HWV A; 2L4R A; 4UA6 A; 4FTX A; 3VV4 A; 3HCY A; 4Y2F A; 1MKI A; 3T4L A; 2X71 A; 5EEC A; 4BL3 A; 3BFC A; 3NY4 A; 4L9G A; 1MWU A; 5DFX A; 2GZA A; 4GB7 A; 3IF6 B; 2G2W A; 3C8C A; 3C4P A; 4EES A; 5DFY A; 5FQ9 A; 3OCN A; 4M4X A; 4N92 A; 2HPB A; 4I39 A; 5M1A A; 2HP9 A; 4LV3 A; 3LFV A; 1L3L A; 3A3I A; 3KSF A; 1LL5 A; 4QHC A; 1SHV A; 2JE5 A; 4MN7 A; 4HBU A; 3JVV A; 4RX3 A; 5A93 A; 1S6R A; 1EWZ A; 4EET B; 3NDE A; 3QP8 A; 3GVB A; 1O7E A; 3G34 A; 3NJA A; 3ISG A; 4GDN A; 4ZJ3 A; 5FAQ A; 1XJ3 A; 3C7V A; 2Q0O A; 1TS7 A; 5A91 A; 3LCE A; 2ZJ9 A; 2WZZ A; 2Z6C A; 5IS1 A; 4OOM A; 1TS8 A; 1PW1 A; 1JTD A; 4DXB A; 4N9K A; 3W4O A; 1RGZ A; 3HJK A; 5HPF A; 5F83 A; 3NOP C; 4QB8 A; 3DW0 A; 3FPV A; 1GCE A; 4PPR A; 1YMS A; 3V3R A; 5AVF A; 3LIB A; 2I72 A; 4Y3I A; 2VJW A; 3VSL A; 2Y59 A; 4ZDX A; 4NXB A; 3N8L A; 4NEE D; 3SH9 A; 3T4O A; 3IF5 A; 2J80 A; 1FSY A; 2M7U A; 2XLN A; 5HZH A; 3C7U A; 4GD8 A; 4NXF A; 3EGD C; 3HLB A; 5HPI A; 3ITA A; 2C5W B; 2M7V A; 1UGU A; 3UMD A; 3IF6 C; 2M1C A; 1Q2Q A; 2WKH A; 3BW6 A; 1GSV A; 3VFH A; 1ZKJ A; 3WRT A; 1W8Y A; 5GHZ A; 4OP8 A; 3D3O A; 3PBT A; 4F3L B; 1G28 A; 2DNS A; 4U0T A; 2QJ5 A; 1IYS A; 2Y79 A; 4BBT A; 3CG5 A; 1Y4O A; 1IEM A; 1JTG A; 3P01 A; 1LI9 A; 1WE4 A; 4HHD A; 1VET A; 4DE2 A; 2H0Y A; 1GHI A; 2WKI A; 3QP4 A; 3O86 A; 4ZJ1 A; 3S7N A; 4HH2 A; 3I7J A; 2ZQ8 A; 1NYM A; 2OAP 1; 1K54 C; 1KE0 A; 4FCF A; 4I3I A; 5EVE A; 3SS4 A; 2PHY A; 4K0W A; 3TSG A; 4KQO A; 1OME A; 2H5S A; 1M40 A; 5TBM A; 2Y2Q A; 3S4X A; 3NIA A; 4LV2 A; 2QJ7 A; 4QPR A; 1PNE A; 2GNX A; 3MZF A; 5HDS A; 4BQM A; 2Y55 A; 2IWD A; 1TVF A; 3PBR A; 1H8M A; 2A24 A; 3G6O A; 2L0W A; 4R4R A; 1IFQ A; 3MXR A; 3ZNY A; 3WWX A; 5CEC A; 4HJ4 A; 2PT7 A; 2WGW B; 2VGL S; 2Y2P A; 4MN6 A; 5HDD A; 3AGE A; 4YWZ A; 5DKK A; 3IWI A; 5E43 A; 2Y2O A; 5FI7 A; 1S67 L; 1T1C A; 3T4T A; 2ZLY A; 1CJF A; 4PKY G; 2JN7 A; 4E6X A; 2E8I A; 3BEC A; 5FQQ A; 3AGD A; 4KZ3 A; 3WS4 A; 3MR0 A; 3F1P A; 1PWD A; 3ICY A; 5FEG A; 1SKF A; 2A2L A; 4HJ6 A; 3UB6 A; 2DCF A; 4P85 A; 5GHX A; 3T4S A; 3IX3 A; 4MCW A; 5FQM A; 4EBN A; 3LUQ A; 3NHQ A; 4GHI B; 1ERM A; 5FDS A; 4CLC E; 4XUX A; 4KUO A; 3OBF A; 1S1Y A; 2Y8H A; 3E4O A; 3ITB A; 1H8Y A; 4E3I A; 3G32 A; 3ZFZ A; 3BLM A; 1SCW A; 4P6Z M; 1OJ5 A; 1LLB A; 2Y2K A; 1VHM A; 4IJG A; 3ZHH A; 1XA1 A; 2OSU A; 3E98 A; 4NXE A; 4WF0 A; 1WA9 A; 3M2J A; 3HLE A; 4MBH A; 4K08 A; 3C30 A; 3GEC A; 5FL3 A; 5DKL A; 3VMA A; 1MKM A; 4QY6 A; 1C3B A; 5DF7 A; 3BY8 A; 1PIO A; 2EA9 A; 1SDE A; 4R38 A; 4KQQ A; 3MMH A; 2W3E A; 2Y2H A; 3HUO A; 1YT4 A; 3BQ8 A; 4X53 A; 1YAX A; 4XT2 A; 3CLO A; 3EWK A; 2JKR M; 4MDZ A; 4LLO B; 5HX9 A; 5FQK A; 4H8R A; 3RFB A; 3K3C A; 5FSR A; 1G6A A; 2HJ9 C; 3CPT B; 3VP0 A; 3EQV A; 4R6L A; 4HEF A; 1IYO A; 5GHY A; 5E2F A; 5EVL A; 1S4R A; 1KGE A; 4X55 A; 2V1B A; 1BZA A; 2UV0 E; 3B33 A; 2PYR A; 2ZC6 B; 3TG9 A; 3A3D A; 5EVI A; 3VE3 A; 2PU4 A; 3GSG A; 2V0W A; 1X0O A; 4C3Q A; 4A5R A; 2V20 A; 2V0U A; 4WL9 A; 4KZ4 A; 4GCZ A; 1I5Q A; 3SW1 A; 4Q0I A; 3WS1 A; 1L0G A; 1KDW A; 1VEU B; 3KO6 A; 1BLP A; 1MZU A; 4Z9Q A; 4JXV A; 2OV5 A; 4WZ5 C; 3LO7 A; 3Q7V B; 4DDY A; 3MKE A; 1OT6 A; 3NC8 A; 4G3K A; 4HY8 A; 4Y0O A; 1N4O A; 1HLU P; 1GA0 A; 3K3D A; 4OLD A; 3D9Y A; 5HFO A; 1IYQ A; 3UDI A; 4Y15 A; 4KZ7 A; 3UE0 A; 3KSG A; 3MJQ A; 1DJB A; 2WGI A; 2KDK A; 2K7S A; 4LV1 A; 2IA2 A; 3EEH A; 4BMW A; 2R9W A; 3CIT A; 2VV7 A; 4R1G A; 4CQH A; 3IXH A; 3HL9 A; 1SKO A; 2ZC3 B; 3G2Z A; 1IKG A; 1PRQ A; 2XA7 S; 4F3L A; 2V2F F; 3V67 A; 1XJ4 A; 3O3V A; 4X56 A; 4ID4 A; 5TFQ A; 5CGX A; 2YKH A; 5EOO A; 1EI5 A; 4UQI M; 3KYZ A; 3UN7 A; 1AXB A; 3IX8 A; 1LSW A; 3OCL A; 3QHY A; 4CLC C; 1KE4 A; 3OPP A; 4NG2 A; 3CUE C; 4HH3 A; 1WYC A; 1FR1 A; 2Z2L B; 2HV1 A; 1GHM A; 1K57 A; 4CJN A; 2G7U A; 4EW7 A; 3OZH A; 4IBX A; 3N8R A; 4EEU A; 1CF0 A; 3UE3 A; 1P9W A; 4Q0J A; 4JF5 A; 3F1O A; 2ZC7 A; 4UAA A; 3P98 A; 2RCX A; 2A3U A; 5K5B A; 1NY0 A; 4H6J A; 1ONH A; 1ESU A; 4EV4 A; 3FZC A; 4B4X A; 5DJT A; 2WAE A; 3ULF A; 3IBR A; 4P87 A; 4OKP A; 1ALQ A; 2KOI A; 4HP9 A; 4KQD A; 2OOL A; 1KGF A; 4Y7P A; 1TS0 A; 5KZH A; 1MWT A; 4RYE A; 1IOU A; 2VV8 A; 4IED A; 1S0W A; 3LR5 A; 5CHU A; 3GDI A; 2BLS A; 4X1M A; 4X69 A; 3RH8 B; 2PAV P; 4S2K A; 1LI0 A; 3PTE A; 4HI4 A; 5J8X A; 2OLV A; 2VX8 A; 2ZOI A; 1VB6 A; 3H7W B; 5CGS A; 4E3N A; 2R78 A; 5F1G A; 2W1T B; 3IS2 B; 3GRJ A; 1ZC2 A; 3JPU A; 3PR6 A; 3LY3 A; 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4GDB A; 1CEF A; 2PRF A; 1YLZ A; 1S4S A; 3LR0 A; 5HL1 A; 1UWN X; 2ZD8 A; 3T12 B; 1S66 L; 3KSI A; 4G3V A; 3B3X A; 5CGW A; 3Q7V A; 4WMC D; 2Y2I A; 3EGX C; 1SZV A; 4E6W A; 5A92 A; 3M2K A; 1NZU A; 1MBL A; 2WKQ A; 4B88 A; 3CMZ A; 2ZQD A; 3PAE A; 4IHQ A; 1OTA A; 5E2G A; 3E2L A; 4S2O A; 5FQI A; 3QP1 A; 1XX2 A; 2RL3 A; 3CAX A; 3E0Y A; 4WMC A; 4AFI A; 2JHE A; 5G18 A; 3F1N B; 5FAP A; 4JXG A; 4DKI A; 2UWX A; 4PAU A; 4DXC A; 1P9R A; 4LCL A; 1O07 A; 3JYI A; 3N4I A; 3O88 A; 3K2N A; 1NXY A; 1PYY A; 1UWP X; 4FH2 A; 3A3J A; 1ZG6 A; 1G6O A; 2ZM2 A; 4EWF A; 2PD7 A; 2EWV A; 3H82 B; 1KVL A; 2JKR I; 5AQ7 A; 4JF6 A; 2P04 A; 4ARZ A; 3UDX A; 3OOV A; 5LBR A; 3D4F A; 4WYY A; 1ES3 A; 5HAP A; 3S7P A; 2VLG A; 4PKY A; 4JKT A; 2EX9 A; 2VGJ A; 4OH0 A; 3MZE A; 3TW8 A; 2Y4A A; 3BFF A; 1TF1 A; 3HLW A; 2I9V A; 1FCO A; 4Y0T A; 1S1Z A; 1F98 A; 2ZL1 B; 2PBY A; 4WEL A; 2V8F A; 4LEN A; 4B93 A; 1BLC A; 4PM5 A; 1T19 A; 1F5M A; 4K91 A; 4O0P A; 3SS3 A; 1GSX A; 3CHW P; 2HZ5 A; 4ZJ2 A; 3S22 A; 2HF6 A; 5GL9 A; 1K55 A; 3FKV A; 1NLZ A; 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