The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
130
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structure length |
130
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Chain Sequence |
SWQSYVDDHLMCDVEGNHLTAAAILGQDGSVWAQSAKFPQLKPQEIDGIKKDFEEPGFLAPTGLFLGGEKYMVIQGEQGAVIRGKKGPGGVTIKKTNQALVFGFYDEPMTGGQCNLVVERLGDYLIESEL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The crystal structure of a major allergen from plants.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Actin binding protein
|
| source organism |
Arabidopsis thaliana
|
| molecule keywords |
PROFILIN I
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| total genus |
34
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| structure length |
130
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| sequence length |
130
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1996-11-27 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2VK3 A; 1ACF A; 3CPT B; 3NUL A; 3NEC A; 2ZL1 B; 1SKO A; 2HZ5 A; 3T1X A; 3KYE A; 5EVE A; 2BTF P; 3T1S A; 5EM0 A; 1VEU A; 4X1M A; 2V8F A; 1PNE A; 1K0K A; 1F2K A; 2V8C A; 3L7H A; 1G5U A; 1FIK A; 3T12 B; 3LEQ A; 3T1Q B; 1AWI A; 4D60 A; 3L9K A; 1A0K A; 1VET B; 3MS6 A; 1J3W A; 1VEU B; 5EV0 A; 1Z09 A; 4X25 A; 4FUW A; 5FEG A; 2PBD P; 4X1L A; 2JKG A; 2PRF A; 5EM1 A; 2ZL1 A; 4FTX A; 1PRQ A; 3D9Y A; 1SZV A; 3CHW P; 3LGO A; 1SKO B; 1FIL A; 2B95 A; 2E8J A; 3DAV A; 1Y4O A; 3U4L P; 3MSH A; 4QWO A; 2JKF A; 1CJF A; 3CPT A; 1CF0 A; 1CQA A; 1YPR A; 2ACG A; 1PFL A; 5FDS A; 3T1R A; 1VET A; 1HLU P; 5FEF A; 3UB5 P; 4ESP A; 1D1J A; 2PAV P; #chains in the Genus database with same CATH topology 5DKL A; 3CPT B; 2EXA A; 5HAR A; 3W2Z A; 4DRT A; 2ZOI A; 4OPZ A; 4R3J A; 2VJW A; 4FH2 A; 4LPZ A; 1K6R A; 4MN7 A; 1E3U A; 5M19 A; 2V1Z A; 1YMX A; 2X02 A; 5FAT A; 4QHC A; 3IF5 A; 5DF7 A; 4BBT A; 3AGF A; 3GVB A; 3MZD A; 3JPU A; 5JYP A; 1G5U A; 4BMW A; 4LRY C; 3GR2 A; 5CGS A; 2Y2H A; 3M6H A; 5A91 A; 3ZFZ A; 2O0Y A; 2GX5 A; 1WYC A; 4HH3 A; 3OPP A; 1VEU B; 5HAQ A; 5D3O A; 2W3E A; 4X25 A; 2D02 A; 3WRZ A; 3FZC A; 2VLG A; 2ZQA A; 2PRF A; 2J3T C; 1PZP A; 1LL9 A; 3Q7V A; 3P7N A; 2PT7 A; 5E2G A; 3HLF A; 2W1R A; 1PRQ A; 4BLM A; 1K25 A; 3PTE A; 3PHY A; 4ARZ A; 5F69 A; 1PWC A; 3PXP A; 4R4R A; 3HBR A; 1PW1 A; 3NHQ A; 4WM9 A; 1V9Y A; 1CF0 A; 3HLG A; 2EX9 A; 3MKF A; 4I38 A; 3D4F A; 3ISG A; 1LT0 A; 2EWW A; 4OOL A; 2J8Y A; 4GN2 A; 1OPX A; 4MCW A; 4JKT A; 2EA9 A; 3BEB A; 4AFI A; 1G28 A; 4EV4 A; 4LLO B; 1KDS A; 5AQB A; 2A49 A; 2V20 A; 4S2P A; 3TOI A; 2INW A; 3Q7V B; 2WGI A; 4P87 A; 1GSV A; 3KYE A; 3PYP A; 5KSH A; 3T1S A; 2Y2Q A; 4E6X A; 3O5Y A; 4ARZ B; 4EET B; 2QHK A; 1GCE A; 3LO7 A; 3C5A A; 1MY8 A; 3ZNT A; 4IHQ A; 2IA2 A; 3DTE A; 4E3L A; 3IXG A; 4IUK A; 5HDD A; 4ETX A; 2PD8 A; 5HX9 A; 2W3F A; 4HIA A; 4LRX C; 3G34 A; 1MKM A; 4NXF A; 3BFE A; 1Y28 A; 4JPM A; 1IYQ A; 5GHY A; 1FR6 A; 1IKI A; 3BWL A; 3BY8 A; 4FOF A; 1WYB A; 4DDS A; 1BT5 A; 3SW1 A; 3ZHH A; 2GZA A; 3TJZ C; 4MMN A; 4BD1 A; 4I39 A; 2VGL M; 3VE4 A; 1MXO A; 3PBO A; 4BL2 A; 4OP5 A; 2C6W B; 1IYO A; 5F1F A; 3HLB A; 4X69 A; 4DE3 A; 5GLD A; 3CMZ A; 4X55 A; 1XPB A; 4LGW A; 4EBL A; 2H28 A; 3HLW A; 4F3L B; 1YLP A; 2GJ3 A; 1YLW A; 1N9L A; 4GNU A; 3BY9 A; 4GHI A; 2WAE A; 2XA7 M; 1HLU P; 2ZBB A; 2V2F F; 3F1N B; 2Q0O A; 1W8Y A; 1EI5 A; 1LI9 A; 1IYS A; 2VZW A; 3DTK A; 4WUJ A; 3UDI A; 2ZQ7 A; 3QP6 A; 3MQQ A; 1BLH A; 3CG5 A; 3H82 A; 1SKO A; 4KZ9 A; 2W27 A; 5FQI A; 3GMW A; 1STZ A; 3CI6 A; 4IUH A; 4WEL A; 3LR4 A; 1KGG A; 5EVE A; 1IKG A; 3EGX C; 4PMA A; 4Y0O A; 1MBL A; 4CJN A; 1UWP X; 3V39 A; 1GHM A; 5FAP A; 3FPW A; 1S0W A; 1RGZ A; 2D01 A; 3CUE C; 2KX6 A; 4XUX A; 5CGX A; 4GHI B; 3SS3 A; 5DTK A; 4P6Z M; 2XA7 S; 3GRJ A; 3E98 A; 4L0L A; 4S2N A; 3F1P B; 2OWJ A; 1W7F A; 2HDQ A; 4E04 A; 5KSC A; 3Q1F A; 5HWW A; 1VHM A; 1YLT A; 4HNB A; 1SZV A; 3PAG A; 5AVF A; 3V5M A; 1SKO B; 2VV6 A; 1Y4O A; 1E25 A; 3NOU C; 4JF4 A; 3MR0 A; 1ALQ A; 5FAQ A; 4EEU A; 1DJC A; 4JGQ A; 1JTG A; 5L10 A; 4DMZ A; 1LL5 A; 5GL9 A; 2ZQC A; 2A24 B; 2G2W A; 3OC2 A; 3G4P A; 3UME A; 3ICY A; 2EX2 A; 5DFY A; 1ERQ A; 3CZD A; 5GHZ A; 4DF6 A; 3CWF A; 4P6Z S; 2P9V A; 3PBS A; 4HJ3 A; 3DW0 A; 3PBR A; 5HW3 A; 2XQZ A; 1H8M A; 4HP4 A; 5FI7 A; 1CEG A; 1K56 A; 2B02 A; 3LUQ A; 1LSW A; 3PBT A; 1IEL A; 4CLC E; 3M2J A; 4YNR A; 4OP8 A; 3EQV A; 2JBF A; 2W1T B; 1F2K A; 1ES5 A; 2Y2G A; 1PW8 A; 3O3V A; 4GD8 A; 5E2H A; 3WS5 A; 1NZO A; 4OKP A; 4GB7 A; 4KQR A; 5EVI A; 5FQK A; 1NWZ A; 2JKT M; 3ZQ5 A; 2OV5 A; 4EW7 A; 3EOI A; 1OTB A; 4WMC D; 2AVX A; 4L9E A; 4B88 A; 5HDS A; 4B93 A; 1TS7 A; 4Y13 A; 5TBM A; 5L2F A; 3U4L P; 5DJT A; 1P9R A; 1XJ2 A; 4HI4 A; 4QWO A; 4KZ6 A; 3NDG A; 1MC0 A; 4HH2 A; 1OTD A; 5KMW A; 3W4O A; 2P04 A; 2X71 A; 5G4Z A; 5A92 A; 2ZM8 A; 2WAF A; 4U0X A; 1TDL A; 2XFS A; 1GHI A; 4P0M A; 3P01 A; 3LI9 A; 4GCZ A; 5E43 A; 2BLS A; 5DFX A; 4P85 A; 3D3O A; 1OTE A; 2FZ0 A; 3AGE A; 3QP5 A; 3PR6 A; 4ESP A; 3JVU A; 2KDK A; 4PHT A; 4UQI M; 5DTS A; 1KE3 A; 3WWX A; 3SZT A; 2PR5 A; 3QP2 A; 3C38 A; 4M3K A; 3LIE A; 2FH5 A; 3CAX A; 1OJ5 A; 4GS9 A; 3IHB A; 3VFF A; 5FSR A; 4IJG A; 4QY5 A; 1MWS A; 1RCJ A; 3QP8 A; 2ZMA A; 5DF9 A; 4KQD A; 1WA9 A; 3ZDJ A; 4XT2 A; 3BFG A; 1T18 A; 2XD1 A; 5A90 A; 5CGW A; 5GLA A; 3UDX A; 2ZMF A; 1NZU A; 2Y2P A; 3T4J A; 2ZD8 A; 4FUW A; 3V3R A; 4NG2 A; 3MXQ A; 2PYP A; 2XH9 A; 2PBD P; 1AXB A; 1K57 A; 4UQI S; 2XR0 A; 4WF0 A; 3VOZ A; 1CK3 A; 2Z2M B; 4N1X A; 4EUZ A; 3DAV A; 1MPL A; 4LV2 A; 3HJK A; 5HSQ A; 1JTD A; 5C5K A; 5EPH A; 3GTC A; 3TW8 A; 1T1B A; 4GS9 B; 4S2O A; 3MSH A; 3OZH A; 2LB5 A; 2HDU A; 2HP6 A; 4EER A; 1JWV A; 4KZ7 A; 1H0M A; 3CPT A; 2BAS A; 4PPR A; 3IT9 A; 1FCM A; 1XP4 A; 1ES2 A; 5M18 A; 4BD0 A; 3IXD A; 1BLP A; 3HVF A; 1D7E A; 4O7D A; 4HBT A; 5HPI A; 1K55 A; 4MNR A; 3MBZ A; 3MJQ A; 3OOV A; 3IH9 A; 4Q0I A; 2J3T D; 3BLM A; 4OPY A; 4ZJ1 A; 4CLC A; 4KQQ A; 1I5Q A; 3A3I A; 1TF1 A; 4S2N C; 2K2N A; 1S4S A; 5F6A A; 5CX7 A; 1LHY A; 2P7J A; 1KGF A; 4MN5 A; 4JF6 A; 2XRO A; 2XFT A; 4UA6 A; 1XFQ A; 1XKZ A; 1CI9 A; 2Y2K A; 4B9O A; 4CPK A; 4Q0J A; 3RJU A; 2IWB A; 5HDC A; 1VEU A; 1I2S A; 3HUN A; 3EWK A; 4OVD A; 3E2K A; 3HLD A; 3MQO A; 4E3K A; 3A3D A; 3C8C A; 4E3I A; 3UE0 A; 3LCE A; 2EFX A; 5EEC A; 1N9O A; 2UV0 E; 1ERM A; 2GDN A; 4CLC B; 3HLC A; 2ZC7 A; 2NUT C; 4OON A; 2P08 A; 5HD5 A; 1NYM A; 1Z09 A; 5CRF A; 1D06 A; 2JKG A; 4E3N A; 5F68 A; 4EEP A; 1XX2 A; 3LIA A; 2YKH A; 4S2K A; 4HY8 A; 2VGK A; 4IBX A; 3LYX A; 3BFC A; 3BJN A; 5DTT A; 5F83 A; 4Y0T A; 3MZE A; 4KQO A; 3LIC A; 2C5W B; 1DP6 A; 2J3W A; 5G4Y A; 2H0Y A; 5EVI C; 5GLB A; 1BLC A; 3SH9 A; 1S6R A; 1U60 A; 4JGO A; 2W3G A; 5IT5 A; 3PBQ A; 2QPN A; 3NOP C; 3ZYT A; 3ZVT A; 1W5D A; 4Y2F A; 3NUL A; 5FA7 A; 2H5S A; 2BG1 A; 4FCF A; 3NC8 A; 2OAQ 1; 2JCH A; 3WS0 A; 1LSV A; 4R6L A; 3N4I A; 4MBK A; 1GA0 A; 2DRW A; 2HP5 A; 1PNE A; 1TDG A; 3WS1 A; 3IXH A; 2L4R A; 2VX8 A; 3S22 A; 3MFX A; 1HD8 A; 3T12 B; 1XA1 A; 1S66 L; 4OOM A; 5F1G A; 4YWZ A; 4OLG A; 3A0V A; 1TEM A; 4HHD A; 4JXV A; 3UE1 A; 3FWL A; 5HL1 A; 4X1L A; 4F3L A; 1ERO A; 2KOI A; 2PYR A; 1NJ4 A; 1M40 A; 5FAO A; 4HBU A; 4KG5 A; 5KZH A; 2GNX A; 2WKE A; 4P6B A; 2EX8 A; 1JWP A; 3A3E A; 3PBN A; 4PKY A; 4G3K A; 1MKI A; 1Q2Q A; 2M7V A; 2ZLY A; 3VP4 A; 5KIZ A; 3SH8 A; 4MLL A; 3F1N A; 1IFQ A; 1GA9 A; 4ZAM A; 1W8Q A; 2HP9 A; 3VP1 A; 3KSG A; 4PM7 A; 1YPR A; 1N4O A; 3E4Q A; 4ME4 A; 3MF0 A; 3VSK A; 1OME A; 5FDS A; 4DKI A; 5TJJ A; 4Q8I A; 2HGV A; 4II7 A; 3WRT A; 2O9B A; 1L0E A; 3BFF A; 1E3U D; 1DRM A; 2L0W A; 1Y54 A; 4GD6 A; 1K57 C; 3E0Y A; 5LBR A; 2WKP A; 1ZC2 A; 2ZJ9 A; 3LR3 A; 3T4Q A; 4DE1 A; 4EBN A; 3A0S A; 1PI4 A; 3F1O B; 4PAU A; 3NOT C; 5K5B A; 1MZU A; 4R0Q A; 5J7E A; 5DF8 A; 3P98 A; 2G7U A; 2DMW A; 2PU2 A; 3GDI A; 4O8G A; 5EM0 A; 1ES3 A; 4GJ4 A; 3F1P A; 2O99 A; 2ZMV A; 3N8L A; 2JKR I; 4GW9 A; 4MBF A; 1K55 C; 3S4X A; 3UDF A; 3S7N A; 1DY6 A; 4LV1 A; 1YKD A; 3RH8 B; 4WEK A; 4CLC C; 2WAD A; 5G18 A; 4JLF A; 3VSL A; 3DTI A; 4RYE A; 2VGL S; 4OLD A; 3D72 A; 3LR5 A; 3IF6 A; 1N9N A; 3W4Q A; 3OPH A; 1I2W A; 4EU0 A; 2PR6 A; 3C4O A; 5I94 A; 1YLY A; 3GQZ A; 4GLQ A; 3A0R A; 2A24 A; 5JYO A; 1EWZ A; 1JWZ A; 5FQM A; 3S7P A; 1XXM A; 5F5Y A; 1KE4 A; 2QJ5 A; 4DJ2 A; 4I3A A; 2KLI A; 1JVJ A; 1MWU A; 3R7W B; 4OQ0 A; 4I5S A; 4B4X A; 2I9V A; 4K0X A; 1O07 A; 1CJF A; 5HFO A; 5GHX A; 4HJ6 A; 2WGW B; 3MQ0 A; 1L0D A; 1QMF A; 2B5R A; 3H7W B; 1H3Q A; 2ZQ8 A; 3NJA A; 2V9A A; 1W79 A; 1KDW A; 1ZHH B; 4HEF A; 2QYB A; 1KGE A; 3VV4 A; 2W1T A; 1ESU A; 1K38 A; 4LRZ E; 3TRC A; 2XD5 A; 4MDZ A; 3IF6 B; 3NY4 A; 4XXR A; 1PWG A; 1ONG A; 3ZNY A; 5HWV A; 3FYZ A; 3EQU A; 3V3S A; 4K08 A; 3N7W A; 5FAS A; 5CTM A; 2L1M A; 2JHE A; 1L0F A; 2ZOH A; 4JGP A; 3B47 A; 3NCK A; 2IWD A; 4OQH A; 2XK1 A; 2H10 A; 5HD3 A; 1BUE A; 3UB9 A; 4X68 A; 2EWV A; 3A3J A; 3L9K A; 1G68 A; 2UWX A; 5A93 A; 2J7V A; 1TS6 A; 4Y5F A; 1J3W A; 3TE8 A; 5AVE A; 4Y0U A; 1K4F A; 3ULF A; 2Y55 A; 2Z2L B; 4QU3 A; 1K6S A; 2Y2I A; 1OJG A; 3D9Y A; 3LGO A; 4JGR A; 2QKP A; 2B95 A; 1YT4 A; 3BLS A; 5E2E A; 3LID A; 1HVB A; 2HJ9 C; 3UPN A; 3MMH A; 3IX3 A; 3K2N A; 5FDH A; 2HV1 A; 3BYD A; 3C7V A; 5FI2 A; 1RP5 A; 4C6Y A; 2J9P A; 2K7S A; 5FQQ A; 2V1B A; 3E4O A; 2VV8 A; 5CHJ A; 3IX8 A; 1YLJ A; 4DN0 A; 3KX0 X; 1HZO A; 3C7U A; 4Y7P A; 1KVM A; 4OPR A; 3UB5 P; 1GSX A; 4BBV A; 1D1J A; 2PAV P; 1IYP A; 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1FR1 A; 1OTI A; 4ZJ2 A; 3CLO A; 2OOL A; 1FCO A; 1PZO A; 1XGJ A; 1NRF A; 2M1C A; 2OWH A; 4R38 A; 3GV9 A; 3C30 A; 1VET B; 3HUO A; 4U0T A; 4EXO A; 4WBG A; 2XRN A; 5FEG A; 4JXG A; 4DXC A; 4M4X A; 2VGJ A; 3OPR A; 3JVV A; 3NIA A; 5CEB A; 2LB9 A; 1IEM A; 3RXW A; 1T1A A; 5IS1 A; 4U3T A; 5CHU A; 4LCL A; 1EW0 A; 4O01 A; 3K3C A; 4KEN B; 2O9A A; 4ETZ A; 1VM1 A; 4JBF A; 2Y2N A; 4C75 A; 2W0N A; 3T4T A; 3IWO A; 2Q9N A; 5IHV A; 4ZRR A; 2Y79 A; 1SCW A; 3FV7 A; 1P97 A; 1TS8 A; 1FSY A; 3MXS A; 3U2A A; 2WZX A; 4HP9 A; 2XF3 A; 3OCL A; 5L8M A; 1DP9 A; 4MEZ A; 4QB8 A; 3CIT A; 3EEH A; 3OLO A; 5AQA A; 3B33 A; 1OT9 A; 4B4Z A; 3ZG5 A; 4ZJ3 A; 5CER A; 3NEC A; 1K54 A; 4FSF A; 4NXE A; 5CEC A; 4IBR A; 3N8S A; 4WZ4 A; 1OT6 A; 5DVA A; 2CMN A; 3WS2 A; 4R3B A; 4KZ5 A; 2WZZ A; 2A3U A; 5L09 A; 3VOY A; 3IWI A; 1L2S A; 4IED A; 2Z6D A; 4GKU A; 4OH0 A; 3T1Q B; 1JNU A; 1PIO A; 4R4S A; 3IH8 A; 4H8R A; 3KYZ A; 1XFN A; 2HPB A; 3LIF A; 1T19 A; 1XA7 A; 4X56 A; 4KUK A; 4NEE D; 1P9W A; 4FH4 A; 4N1H A; 4FTX A; 2WKH A; 2DCF A; 4R70 A; 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