The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
116
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sequence length |
372
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structure length |
372
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Chain Sequence |
MHSQVIAPGFEPVAELFGVFLEQDPDYSAQVAAYHRGVKVLDLSGGPHIRPDSVTGVFSCSKGMAGLVMALLVQDGELDLEAEVVKYWPEFGVEGKSSITVAQLLSHRAGLLGVEGGLTLHEVNNSELAAAKLAELPPLWKPGTAFGYHALTIGIFMEELCRRITGSTLQEVFEQRIRAVTGANFYLGLPESEESRFAQFRWAADPSWPWVDPASHFGLAANAAVGDILDLPNIREVRAAGLSSAAGVASAEGMARIYAAALTGLEGKSAMPPLLTEETIRTVSAEQVFGIDRVFGETGCFGTVFMKSHTRMPFGSYRAFGHDGASASLGFADPVYELGFGYVPQTAEPGGVGCRNFQLSSAVREVIAGFAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure Analysis of Esta from Arthrobacter Sp. Rue61A--an Insight Into Catalytic Promiscuity.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
ESTERASE A
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| molecule tags |
Hydrolase
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| source organism |
Arthrobacter nitroguajacolicus
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| total genus |
116
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| structure length |
372
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| sequence length |
372
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-08-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00144 | Beta-lactamase | Beta-lactamase |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Beta-lactamase | Beta-lactamase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3ZYT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3BY9 A; 5FAP A; 3T50 A; 1YAX A; 2VLG A; 4LV2 A; 4HP9 A; 4P6Z M; 4Y15 A; 2Y2K A; 5I94 A; 4BEN A; 3UB9 A; 3CI6 A; 4LLO B; 1Y28 A; 1SCW A; 1MPL A; 3PBR A; 3A3I A; 4IBX A; 1NLZ A; 3JPU A; 3LIC A; 4LRX C; 1ZKJ A; 3C7U A; 4WZ4 A; 1TDL A; 4X69 A; 2PHY A; 3S22 A; 1Y54 A; 3EQU A; 5J3W A; 1F98 A; 3IBR A; 3EOI A; 4I3A A; 3PHY A; 2Y4A A; 3UY6 A; 4PHT A; 4R1G A; 3BLM A; 3QP2 A; 5GHX A; 1IEL A; 4MDZ A; 2VV7 A; 4R3B A; 4X25 A; 3PBN A; 2JC7 A; 3UN7 A; 5F1G A; 1NWZ A; 4WZ5 C; 2PYP A; 3LYX A; 4WMC A; 1K55 A; 4B88 A; 5KZH A; 4OLD A; 1YSQ A; 3OPL A; 1ACF A; 3UPO A; 1LT0 A; 1ZTU A; 2Y8H A; 4O01 A; 3UDF A; 3MF0 A; 2J8Y A; 4R70 A; 4OP8 A; 4WEJ A; 2V1Z A; 1H5X A; 1XP4 A; 4A5R A; 4DJ3 A; 1SKF A; 2OWJ A; 4CLC E; 4GZB A; 1GHI A; 4OKP A; 5IU1 A; 1BTL A; 2GNX A; 2HF6 A; 4ZDX A; 3QNB A; 2WK0 A; 2IA2 A; 3PTE A; 1K57 A; 1BZA A; 4Y2F A; 3G34 A; 4E3M A; 3VFH A; 2R9W A; 2ZBB A; 4RVA A; 5F82 A; 5JYP A; 2W3E A; 1ES5 A; 4HH2 A; 1XJ4 A; 4Y0T A; 1FIL A; 2K31 A; 5HAI A; 5FAS A; 3NOP C; 5HWV A; 5A91 A; 1ZHH B; 3BLS A; 4KQO A; 3CPT B; 3H7W B; 4O8G A; 3P7N A; 3CZD A; 3T4L A; 4NK3 A; 4MLL A; 3OZH A; 3G35 A; 1CF0 A; 5K5B A; 1LLB A; 3KSH A; 3WS1 A; 2HP6 A; 2Y91 A; 1KDW A; 3NCK A; 5A90 A; 2D01 A; 4GB7 A; 5LBR A; 1KVM A; 1PWC A; 2W27 A; 4JXS A; 5MC7 A; 3OCL A; 4OPY A; 1YMS A; 3BEB A; 3D3O A; 1F2K A; 2JKF A; 5CRF A; 3ICY A; 1ESU A; 5TBM B; 3W4O A; 3UE6 A; 4FH2 A; 4KQD A; 3G31 A; 5FQK A; 2H10 A; 4EER A; 3SS5 A; 2XD5 A; 3ULF A; 4P0M A; 4Y3I A; 3IS2 A; 2Y2G A; 3ZGA B; 2Z6C A; 2XRO A; 4AFI A; 3PYP A; 3CWF A; 3VP1 A; 4EW7 A; 2QWS A; 2QPN A; 2VGL S; 3EGX C; 3VMA A; 3NBL A; 3L9K A; 3HUM A; 1YT4 A; 4X68 A; 2KLI A; 4FOF A; 1STZ A; 1SZV A; 3B47 A; 4KZ4 A; 1YPR A; 2B02 A; 3F1N A; 3LY4 A; 3MZF A; 3GVB A; 3S7P A; 1Q2P A; 3Q7V A; 3ISG A; 2J9O A; 4ARZ B; 4ZJ2 A; 2ZL1 B; 3MKE A; 1FIK A; 3MFX A; 4E04 A; 2V8C A; 1YLJ A; 2X02 A; 3OPH A; 4R6L A; 3WRT A; 5HZH A; 2ZQ7 A; 5DFY A; 1CEF A; 1BT5 A; 5EOO A; 2JCH A; 3TE8 A; 2Q9N A; 1CI9 A; 3GEC A; 4MCW A; 1W8Q A; 2V8F A; 2PT7 A; 4R38 A; 4BL3 A; 2H28 A; 3LGO A; 5FDH A; 3EEA A; 1GSX A; 4FH4 A; 4QY6 A; 2E8I A; 4MN6 A; 2PBY A; 1JTG A; 3UB5 P; 4D60 A; 2BG1 A; 1VET A; 4ZTK A; 2EFX A; 1G5U A; 1BSG A; 4MEZ A; 3G4P A; 3A3J A; 3FKW A; 4IBR A; 4KZ6 A; 5M19 A; 1JNU A; 5D3O A; 4IVK A; 2EWW A; 1DP6 A; 3KX0 X; 2EX9 A; 1FQG A; 1W8Y A; 5F5Y A; 4LRY C; 1CJF A; 2MJ6 A; 5DF9 A; 1LL9 A; 1SHV A; 4EWF A; 5DKL A; 2I9V A; 4JXW A; 1GA9 A; 4UQI M; 4GW9 A; 3MZD A; 1XKZ A; 4ZJ1 A; 3RXW A; 3LCE A; 4DE1 A; 3LIB A; 3ZDJ A; 4BQM A; 2B5R A; 2BAS A; 3KSF A; 4LEN A; 2XA7 M; 2ZQ9 A; 3HJI A; 3T1X A; 4NXB A; 1E25 A; 2VK3 A; 2J3T C; 2WKR A; 5HD3 A; 4YIN A; 3M2K A; 1XJ3 A; 2M1C A; 2Y2H A; 3TW8 A; 5DTT A; 1ONG A; 4L9G A; 3MXR A; 5CEB A; 1OTA A; 2EX8 A; 3N7W A; 4HEF A; 3CLO A; 3S7O A; 1FR6 A; 1ERO A; 2NUT C; 4UA6 A; 2Z6D A; 4OPR A; 3E4O A; 1CEG A; 1L3L A; 1L2S A; 5FQJ A; 5FQ9 A; 5C5K A; 1PNE A; 3C5A A; 4GNU A; 3OPP A; 3DBA A; 2A49 A; 5FSR A; 3R4K A; 3CPT A; 3H7W A; 1GSV A; 2PU4 A; 2O9A A; 3N6I A; 1YLY A; 2WKQ A; 4PKY A; 2HPB A; 2HP5 A; 5E2G A; 3O5Y A; 1YLW A; 2D02 A; 2VA0 A; 1ZG6 A; 3ZG7 B; 1NJ4 A; 2QYB A; 1QME A; 1ES3 A; 2OLV A; 3VSK A; 4CPK A; 2Z2L B; 2PAV P; 3BYD A; 4WEL A; 4WM9 A; 3GV9 A; 1K56 D; 1PRQ A; 1TVF A; 3VOY A; 2HV1 A; 3TG9 A; 3JYI A; 4ZBE A; 5GHZ A; 4C3Q A; 2Y2L A; 3D4F A; 1K0K A; 1L0E A; 3T12 B; 4CLC D; 1LHY A; 3DW0 A; 4OQ0 A; 1L0G A; 2W3H A; 3BWL A; 3E2L A; 1OT9 A; 4X53 A; 4M4X A; 4L9F A; 4S2I A; 3M6H A; 5DJU A; 4GS9 B; 4ETX A; 2YKH A; 3UB6 A; 4IJG A; 2LB5 A; 2Y2P A; 3S4X A; 5AQ7 A; 4E3I A; 3MBZ A; 1YQS A; 3P09 A; 1DJC A; 3A0V A; 2QZ6 A; 3IBJ A; 3CMZ A; 3A3E A; 2Y2O A; 4S2N A; 1W63 Q; 4II7 A; 5CHM A; 2L4R A; 4XT2 B; 2EXA A; 4PAU A; 5DF7 A; 4HY8 A; 1NRJ A; 1BYW A; 1PWD A; 1CQA A; 2R78 A; 2BTF P; 2PDR A; 1VHM A; 4GJ4 A; 3SS4 A; 2QKP A; 1S0W A; 3ZYT A; 3GSG A; 1IEM A; 2XK1 A; 1KGG A; 4MN5 A; 2P9V A; 3O86 A; 4ME4 A; 5CGW A; 5HSQ A; 5FQQ A; 2OAP 1; 2PRF A; 5EV0 A; 4DDY A; 1XFN A; 2A24 A; 4WUJ A; 5GLD A; 4F3L A; 4QHC A; 3PBT A; 1G6O A; 2L1M A; 2YKF A; 3WS0 A; 3IS2 B; 4HHD A; 3R7W A; 5FAT A; 1IOU A; 3BRM A; 1I2W A; 2J9P A; 5FQI A; 1NY0 A; 3G30 A; 4Y0U A; 3T4Q A; 2JN7 A; 3IXD A; 2VZW A; 4HJ4 A; 5FI7 A; 3GR2 A; 1ERM A; 3ZCZ A; 1TS0 A; 2KDK A; 5KSH A; 4EU0 A; 2J3T D; 4LGW A; 1ESI A; 5F69 A; 4C75 A; 5IS1 A; 3DAV A; 5DF8 A; 4DE2 A; 1KE4 A; 2G2U A; 4H6J B; 3M2J A; 1LL5 A; 3TSG A; 2EA9 A; 1Q2Q A; 3LIE A; 3OC2 A; 3GQZ A; 1K6S A; 2ZJ9 A; 4PKY G; 4CLC B; 4FUW A; 1TEM A; 3C38 A; 1FSY A; 5CHU A; 4OH0 A; 5IHV A; 3GDI A; 4KG6 A; 1BLS A; 4ID4 A; 4EBN A; 1SDE A; 5CTN A; 1JWP A; 4I5S A; 3KYQ A; 2ZMV A; 4BJP A; 3Q7V B; 5FAQ A; 5JYO A; 2KOI A; 1FOF A; 1ONH A; 3VFF A; 1E3U D; 1T1A A; 3PBQ A; 4N92 A; 4X56 A; 1V9Y A; 2LB9 A; 2JKT I; 4Q0I A; 3EGD C; 2WGV A; 3C7V A; 4LRZ E; 4WF0 A; 2ZC4 B; 1VET B; 4BLM A; 1SDN A; 3E4Q A; 5HWT A; 4C6Y A; 2ZM8 A; 1PYY A; 1H8Z A; 1MXO A; 4K0X A; 3LFV A; 1W79 A; 4Q0J A; 5CX7 A; 2XR0 A; 3FG8 A; 3Q7Z A; 1Z09 A; 2VEA A; 3VE4 A; 5GL9 A; 5EE8 A; 3IF6 C; 2IWC A; 4MNR A; 4E3O A; 5HWW A; 4NG2 A; 4U0X A; 4PM9 A; 3OCN A; 1GHP A; 1J9M A; 2VJW A; 3O87 A; 3NI9 A; 1D06 A; 3MR0 A; 5FL3 A; 5FA7 A; 3UDI A; 2EWV A; 4FCF A; 2GJ3 A; 4WZ5 A; 1KGF A; 4E3J A; 4NEE D; 1BUL A; 1H0M A; 1MKI A; 5DFX A; 4GKU A; 3EWK A; 4MN7 A; 1SKO B; 1K57 C; 3C2W A; 4GS9 A; 1AWI A; 1UWN X; 1P0Z A; 3HLG A; 3UE3 A; 4BL2 A; 1LI0 A; 1T19 A; 2ACG A; 2DMW A; 3LR5 A; 2XRN A; 2O9C A; 3HLW A; 4K91 A; 4RA7 A; 3IXG A; 4BBT A; 2HDS A; 2HDU A; 2XSS A; 2WZZ A; 4GD8 A; 3WS5 A; 4EQ1 A; 4EET B; 4DXB A; 4XT2 A; 4ZRR A; 5L10 A; 4KUO A; 3SH8 A; 3KYE A; 3TRC A; 3IWQ A; 5DJT A; 1BLH A; 1NZU A; 4IED A; 4O0P A; 5U47 A; 4WLA A; 4KUK A; 4Y0O A; 4HP4 A; 2DRW A; 4F94 A; 4P87 A; 3ZNT A; 3K3C A; 5AQA A; 4L9E A; 2XF3 A; 4GHI A; 3T4J A; 3H9W A; 4S2J A; 5CGS A; 4JLF A; 5EVI C; 2VGL M; 2JHE A; 3QP4 A; 2O99 A; 3CAX A; 3OOV A; 1VM1 A; 2CMN A; 2OLU A; 3JVV A; 3RXX A; 4UEY A; 4QJG A; 5E43 A; 4X1M A; 1MKM A; 3C8C A; 2X01 A; 1PWG A; 1T1B A; 5FI6 A; 3KSG A; 2RL3 A; 3LR4 A; 3UO9 A; 4HQA A; 3LUQ A; 3E4P A; 2WKH A; 4WL9 A; 4YWZ A; 1K56 A; 4KZ9 A; 2Y2Q A; 1PFL A; 3K2N A; 4H6J A; 4XXR A; 3NDG A; 4JXV A; 3ZVW A; 1OPX A; 1D7E A; 5FDS A; 4CLC A; 3ZVT A; 2A2L A; 3KYZ A; 3V5M A; 4FD8 A; 3RFB A; 1O7E A; 3LR0 A; 1N4O A; 3Q07 A; 1MWS A; 5HAR A; 4G3K A; 5HL1 A; 3G2Y A; 3ITA A; 2Y79 A; 4WN5 A; 3CHW P; 3IH8 A; 3IXB A; 3UB7 A; 4DDS A; 4JF5 A; 4OQI A; 2H0Y A; 3BQA A; 3BFG A; 4X1L A; 1FCM A; 3IH9 A; 4IUH A; 3VOZ A; 2V20 A; 2OAQ 1; 4QPR A; 3V39 A; 3MQ0 A; 1U60 A; 2CC1 A; 3IHA A; 4DMZ A; 2FZ0 A; 2P9V B; 4QU3 A; 3UPP A; 2O9B A; 2ZD8 A; 5L07 A; 2A24 B; 2HDR A; 3VSL A; 1M6K A; 4F3L B; 1HVB A; 1YMX A; 1PIO A; 1OTI A; 5F83 A; 4NET A; 2UV0 E; 4QWO A; 3N4I A; 4DE0 A; 3R7W B; 1VEU B; 4JGP A; 1OTB A; 1PI5 A; 3OBF A; 3B42 A; 2O0Y A; 4HJ3 A; 2ZLY A; 2W3F A; 5EOE A; 3LI9 A; 3QP1 A; 5FQM A; 4KZA A; 4MBH A; 3L7H A; 5HL6 A; 5EFW A; 2QHK A; 1OJ5 A; 1Z6F A; 5A92 A; 4B93 A; 3I7J A; 3MZE A; 5CTM A; 5EVE A; 1ZG4 A; 2PU2 A; 4N1X A; 4R0Q A; 4E6X A; 2GZA A; 2AVX A; 5CED A; 2W3D A; 4EBL A; 1MWT A; 1SKO A; 4UQI S; 1YKD A; 5EEC A; 2W1T A; 3NEC A; 5HX9 A; 4M3K A; 5KIZ A; 3CIT A; 1P97 A; 2XA7 S; 4HH3 A; 5E2H A; 4HOI A; 3N8L A; 1XPB A; 2NUP C; 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4I38 A; 1HTZ A; 3SS3 A; 4KQR A; 5E2E A; 4KZ7 A; 4ZAM A; 4PM8 A; 4GHI B; 3RH8 B; 2QJ7 A; 3E0Y A; 5HDD A; 3U4L P; 3C30 A; 1RCJ A; 4I3J A; 3DTE A; 1VEU A; 4G3W A; 3E98 A; 3DWZ A; 2OWH A; 4JPM A; 2WAF A; 1LSV A; 4Q8I A; 3DWK A; 1BLP A; 1PW1 A; 4UA7 A; 3UME A; 1W5D A; 2WKI A; 1LSW A; 2EX6 A; 3MS6 A; 3UNW A; 2PD7 A; 5DTS A; 3N8S A; 2P74 A; 1NRF A; 1VQQ A; 1PW8 A; 2XFT A; 4P6B A; 4QB8 A; 4I3I A; 5KMW A; 5AQ9 A; 3IQA A; 3W4P A; 4UAA A; 4NXF A; 3GMW A; 3DTK A; 3CG5 A; 3HCY A; 2R9X A; 3NUL A; 1TDG A; 4B4Z A; 3PR6 A; 5J4E A; 1HD8 A; 4S2M A; 3HLC A; 2Y2J A; 2QMI A; 3PAE A; 3HLB A; 4E3N A; 1DJA A; 3VP3 A; 4EES A; 3PBS A; 1XJ6 A; 4KQQ A; 5CHJ A; 1GA0 A; 3HUN A; 4GN2 A; 4HBT A; 1DRM A; 1XX2 A; 2ZQC A; 4JF6 A; 3T4T A; 3M6B A; 2GDN A; 4ETZ A; 3DTI A; 3S7N A; 4KZ5 A; 3H82 A; 1EWZ A; 4RX2 A; 4P6Z S; 2G7U A; 4EBP A; 4KZ8 A; 3UE1 A; 2ZM0 A; 4HJ6 A; 4RQ9 A; 2JBF A; 5TGF A; 3BFD A; 1MBL A; 2BLS A; 3PXP A; 4HIA A; 5G18 A; 5L8M A; 4U3T A; 4PPR A; 3LIF A; 2IWD A; 5AVE A; 1OTE A; 1PZP A; 3MMH A; 4PMA A; 2P7J A; 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