The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
116
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sequence length |
372
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structure length |
372
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Chain Sequence |
MHSQVIAPGFEPVAELFGVFLEQDPDYSAQVAAYHRGVKVLDLSGGPHIRPDSVTGVFSCSKGMAGLVMALLVQDGELDLEAEVVKYWPEFGVEGKSSITVAQLLSHRAGLLGVEGGLTLHEVNNSELAAAKLAELPPLWKPGTAFGYHALTIGIFMEELCRRITGSTLQEVFEQRIRAVTGANFYLGLPESEESRFAQFRWAADPSWPWVDPASHFGLAANAAVGDILDLPNIREVRAAGLSSAAGVASAEGMARIYAAALTGLEGKSAMPPLLTEETIRTVSAEQVFGIDRVFGETGCFGTVFMKSHTRMPFGSYRAFGHDGASASLGFADPVYELGFGYVPQTAEPGGVGCRNFQLSSAVREVIAGFAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure Analysis of Esta from Arthrobacter Sp. Rue61A--an Insight Into Catalytic Promiscuity.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Hydrolase
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| source organism |
Arthrobacter nitroguajacolicus
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| molecule keywords |
ESTERASE A
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| total genus |
116
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| structure length |
372
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| sequence length |
372
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-08-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00144 | Beta-lactamase | Beta-lactamase |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Beta-lactamase | Beta-lactamase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3ZYT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2ZLY A; 1XJ3 A; 4S2N A; 4UA6 A; 3W4P A; 1E4D A; 4IBX A; 1K0K A; 2QPN A; 5DFY A; 2KOI A; 4KZB A; 3S7N A; 3UME A; 4BBV A; 1O07 A; 3VP1 A; 4LPZ A; 1Q2P A; 5KSC A; 1W8Q A; 4KZ4 A; 5EOO A; 4R23 A; 3IX3 A; 4GCZ A; 1W7F A; 4OVD A; 4BBU A; 2J3W A; 4FH2 A; 3UPN A; 1TEM A; 1MC0 A; 2VKS A; 2V8F A; 2HP9 A; 3LID A; 1XKZ A; 1XJ4 A; 3SH7 A; 3CUE A; 3IT9 A; 2WGW B; 4NXG A; 2IWC A; 2KLI A; 4H8R A; 1MKI A; 5AQ7 A; 5FAO A; 4ARZ A; 4GLQ A; 1H8Z A; 4S2K A; 5CTN A; 3C7U A; 1TS0 A; 1YT4 A; 4R70 A; 4LGW A; 1W63 Q; 4GD8 A; 3RJU A; 2E8I A; 4WMC D; 1SKO A; 3CG5 A; 5HDS A; 3TRC A; 3S4X A; 2I9V A; 5CX7 A; 5F68 A; 2Y2L A; 1VHM A; 1DRM A; 4UQI M; 3NBL A; 3HLW A; 4JGP A; 3ZG8 B; 3OBF A; 3ZNT A; 1VM1 A; 4RYE A; 1VEU A; 1L3L A; 3IXD A; 4WYY A; 3G32 A; 4EW7 A; 4DE0 A; 1LI9 A; 1YM1 A; 1AWI A; 3AGE A; 4X25 A; 2EX8 A; 4WEK A; 3KO6 A; 1T1A A; 1UWP X; 3BQA A; 4E6X A; 4EV4 A; 2EX2 A; 1H3Q A; 2WAE A; 3IX8 A; 3LR3 A; 4P87 A; 2H5S A; 4HY8 A; 4DJ3 A; 5FAT A; 1W79 A; 4BD1 A; 1YLJ A; 2HP5 A; 5CEC A; 4KQD A; 3UPO A; 1QME A; 5FI2 A; 3NC8 A; 4IVK A; 3LR5 A; 3DTK A; 1L0E A; 2Y59 A; 1YSQ A; 1NJ4 A; 2PHY A; 1SDN A; 1IFQ A; 1YQS A; 4JGO A; 3RXW A; 4EU0 A; 4OQH A; 4KUO A; 4AFI A; 3CPT B; 5TBM B; 5FEG A; 3OLO A; 3VFF A; 3NOT C; 4Q0H A; 4OPY A; 4O0P A; 1EI5 A; 3IHB A; 2JCH A; 3N7W A; 4X56 A; 1ZTU A; 4N9K A; 4MN7 A; 1CK3 A; 3HLC A; 5GLD A; 1K54 A; 3K3D A; 2WYX A; 3D3O A; 1JWZ A; 4EEP A; 3SS5 A; 4Y0U A; 3F1P B; 3LEZ A; 4Y15 A; 4R3J A; 3VP4 A; 1MY8 A; 5HL6 A; 2ZMV A; 3UE6 A; 1NRJ A; 3G30 A; 1K25 A; 4KZ3 A; 1PW8 A; 3Q7V A; 2OLU A; 4O8G A; 4HHD A; 5EVE A; 1A0K A; 1TVF A; 1KE0 A; 3T4S A; 1LL9 A; 3TSG A; 1JWP A; 2OWJ A; 3QP4 A; 4LV1 A; 3BLM A; 1F2K A; 4LRZ E; 4N92 A; 3E0Y A; 3A0S A; 3OCL A; 2QYB A; 3SH8 A; 3M2K A; 2I72 A; 1S67 L; 1W8Y A; 4PMA A; 2GX5 A; 4OLD A; 2ZC4 B; 5EFW A; 2A24 B; 5DTK A; 3C4P A; 4XUZ A; 3S7P A; 2Y2M A; 2E8J A; 3VMA A; 4S2O A; 4S2L A; 4XT2 B; 4NKP A; 5FQI A; 4NET A; 3N8R A; 3CI6 A; 1E25 A; 3C4O A; 4R3A A; 4MMN A; 4JF5 A; 3LI8 A; 4QY5 A; 3NOP C; 4NXE A; 3U2A A; 3A3F A; 5FQ9 A; 4E3O A; 3NDE A; 3GVB A; 1VET B; 1TDG A; 3OPL A; 5EVI A; 1KGE A; 3WS0 A; 5DTT A; 3JVU A; 4M4X A; 3P7N A; 4RX3 A; 3C30 A; 4MLL A; 3CIT A; 1K55 A; 2WK0 A; 4KZ7 A; 2QJ5 A; 1JTG A; 4EEU A; 2V0U A; 2JHE A; 3P98 A; 1XX2 A; 2GNX A; 1ESU A; 2HJE A; 5F1G A; 2ZC3 B; 4II7 A; 2XFS A; 3G4P A; 4YNR A; 1W5D A; 3S1Y A; 2OAQ 1; 2JKR M; 2W3H A; 4NXF A; 1HZO A; 3BEC A; 3PBT A; 3DTM A; 5HPI A; 1O7E A; 4K0W A; 4OPR A; 4NEE D; 4HNB A; 4DE2 A; 3G34 A; 5HPF A; 2ZC5 B; 3SH9 A; 4MDZ A; 2XA7 M; 4B93 A; 4GDN A; 3T1X A; 3PAG A; 1KE4 A; 2ZC6 B; 2EX9 A; 4IHQ A; 3MZD A; 2HDQ A; 1QMF A; 1LL5 A; 3LFV A; 1XA7 A; 5EVL A; 4OON A; 3ISG A; 1YLY A; 4OOM A; 3LEQ A; 3HLD A; 2Y2H A; 5HAI A; 1F5M A; 3DWZ A; 2J3T D; 3ZG7 B; 3BFF A; 1D06 A; 2WKP A; 4LFU A; 1UGU A; 4WEL A; 3RFB A; 1YSP A; 3T1S A; 3H7W A; 1T1B A; 5DFX A; 4ESP A; 5HW3 A; 1VQQ A; 2INW A; 2VJW A; 3TW8 A; 1K6S A; 3VP2 A; 2ZMF A; 1X0O A; 3I7J A; 3LGO A; 2J9O A; 4I5S A; 3V67 A; 1M6K A; 4DN0 A; 1OT9 A; 3O3V A; 4NG2 A; 3CAX A; 3PBO A; 5CER A; 4CLC A; 3NUL A; 1PI4 A; 3F1N B; 2QZ6 A; 1G5U A; 3KSG A; 3HUM A; 4D2O A; 1LSV A; 3ICY A; 4EXO A; 4GS9 B; 3E4Q A; 3H82 A; 1K4F A; 2Y91 A; 3PBN A; 3KSI A; 4H6J A; 5IT5 A; 2XD1 A; 1BLP A; 5FQK A; 3C7V A; 4Y7P A; 5L8M A; 3V3R A; 1MWS A; 2JN7 A; 1Y28 A; 4CLC E; 3LIB A; 1RGY A; 5GLC A; 1TDL A; 2JKF A; 2M1C A; 3TOI A; 3ZYT A; 4GHI B; 4JGR A; 3TG9 A; 4NXB A; 5HAQ A; 4Y2F A; 1NLY A; 2OLV A; 4I3A A; 2PRF A; 3M6H A; 1NRF A; 3OZH A; 2KDK A; 3UB6 A; 4HES A; 3E98 A; 5EPH A; 3RH8 B; 3LIC A; 3GDI A; 1S1Z A; 3UB9 A; 3RXX A; 4LV3 A; 1IKI A; 5DJT A; 2H10 A; 4BL3 A; 2UWX A; 2VGL M; 4MN5 A; 4QWO A; 5KZH A; 3WWX A; 2JE5 A; 2WKR A; 1D7E A; 4M3K A; 3D72 A; 4I38 A; 5DVA A; 5FI6 A; 1CJF A; 1WE4 A; 3GMW A; 4L0L A; 2K31 A; 1ES4 A; 1L0D A; 3KYE A; 4E3M A; 4FTX A; 5A92 A; 3AGD A; 3BYD A; 4B9O A; 3LCE A; 4OOY A; 4GW9 A; 3FPW A; 4DKI A; 1KOU A; 2Z6D A; 1BYW A; 1MBL A; 2ZM0 A; 4U3T A; 1CQA A; 4DXC A; 2Q9M A; 5HZH A; 3E4O A; 2AVX A; 4GDB A; 5E43 A; 2EFX A; 2PT7 A; 2LB9 A; 5FQJ A; 5G18 A; 1BTL A; 3Q1F A; 4RA7 A; 2L1M A; 4R3B A; 2ZM2 A; 3C38 A; 3JVV A; 3KSH A; 4LEN A; 3JYI A; 2PBD P; 1DJA A; 1YPR A; 2PU2 A; 4Y0O A; 1YKD A; 5E2E A; 2L4R A; 4KG6 A; 3IQA A; 3GV9 A; 1G6O A; 3L7H A; 3BFC A; 3B42 A; 3NDG A; 4ETZ A; 3VFH A; 1YMS A; 1BLH A; 1I2S A; 5HFO A; 3QP2 A; 4ID4 A; 2JC7 A; 4EUV A; 2XGN A; 4P6B A; 1GSV A; 5LBR A; 3FYZ A; 3DWK A; 1N4O A; 1P9R A; 4X55 A; 2B18 A; 1U60 A; 3VSL A; 4L9E A; 1CI9 A; 2EFU A; 4DDY A; 4ZJ2 A; 2VEA A; 1KE3 A; 5GLA A; 2QHK A; 4S2I A; 3ZHH A; 3FZC A; 4FOF A; 3BLS A; 3HLE A; 1ONG A; 3DAV A; 4FD8 A; 3K2N A; 3NIA A; 4QJG A; 4E3L A; 3HLB A; 4I3I A; 1ERQ A; 2BG1 A; 2WKQ A; 4A5R A; 2VX8 A; 1KGG A; 2GDN A; 1RGZ A; 5HAP A; 4S2N C; 3A3I A; 2PBY A; 1YLW A; 4WMC A; 2G7U A; 4JXW A; 3AGF A; 3UMD A; 2JBF A; 3IH8 A; 3UNW A; 1L0G A; 5AVF A; 4F3L B; 4ZJ3 A; 2W3D A; 2WGW A; 3T4O A; 3EEH A; 3PBR A; 1IOU A; 1P0Z A; 4KZ9 A; 3VSK A; 1RCJ A; 3VV4 A; 1LLB A; 3BW6 A; 2GJ3 A; 2O99 A; 2W1T B; 4CPK A; 5I94 A; 4I3J A; 5FAS A; 3T4L A; 3CUE C; 3IF5 A; 5EM1 A; 3VOZ A; 3ZVW A; 4QY6 A; 2G2W A; 1SKO B; 4X53 A; 1BT5 A; 1ERO A; 5MC7 A; 4QU3 A; 3WRT A; 3O87 A; 4JKT A; 1IYP A; 4P0M A; 5KSH A; 4X1L A; 5CHU A; 3QNB A; 1PW1 A; 5TGF A; 1S4R A; 3IHA A; 2ZL1 A; 2WGI A; 2B02 A; 3CLO A; 4ME4 A; 1VEU B; 1LL8 A; 2PR6 A; 5E2F A; 2Y4A A; 1MPL A; 1CEG A; 3LY3 A; 3OOV A; 2HV1 A; 2J9P A; 2H0T A; 1K57 A; 1GHM A; 1M40 A; 4FSF A; 1NZU A; 5EM0 A; 2O0Y A; 5FI7 A; 1C3B A; 1KVL A; 5F5Y A; 5DF8 A; 3NCK A; 1XP4 A; 2J7V A; 5D3O A; 3PTE A; 4HEF A; 3T4Q A; 5F69 A; 3CHW P; 3T1R A; 3MFX A; 5C5K A; 3CPT A; 1K56 D; 4OKP A; 2OV5 A; 4UHU A; 1XA1 A; 4ZRR A; 1CI8 A; 3A0R A; 3PHY A; 4LCM A; 4DXB A; 1LT0 A; 3MR0 A; 2EWV A; 5GL9 A; 3SOI A; 2P9V A; 5TJJ A; 1MWT A; 1PYY A; 1H8M A; 4IUH A; 3BFE A; 1G68 A; 3UO9 A; 4Q0I A; 4PM6 A; 5AVE A; 4P6Z S; 4C75 A; 1Z09 A; 3F1P A; 1TF1 A; 5U47 A; 5HAR A; 3IBJ A; 2O9C A; 3Q07 A; 4R0Q A; 2P7J A; 5CEB A; 3SS3 A; 3BEB A; 4QD4 A; 2FFF B; 3Q82 A; 1ZHH B; 4G3V A; 2JKT I; 3U4L P; 2JKG A; 4KZ5 A; 2XD5 A; 3T12 B; 1ODV A; 4P85 A; 5F83 A; 2W27 A; 5TFQ A; 3B3X A; 1GA9 A; 2WZX A; 1ZC2 A; 1HLU P; 4PAU A; 5M1A A; 2PYP A; 3OPR A; 2HDS A; 1NY0 A; 1PNE A; 3MKF A; 1TS7 A; 2QWS A; 2J8Y A; 4OOL A; 4HP9 A; 1GHI A; 2A24 A; 2C6W B; 1FCN A; 3IS2 B; 5HD5 A; 3H9W A; 3P09 A; 3WRZ A; 4HJ6 A; 3Q7Z A; 1FIK A; 4PM7 A; 5GHX A; 5J3W A; 1S1Y A; 4FCF A; 4HBT A; 4OLG A; 2PU4 A; 1SZV A; 3M6B A; 4UQI S; 4EBN A; 4WZ5 A; 2R9W A; 1IYS A; 1GCE A; 3MSH A; 3ULF A; 5EE8 A; 2BTF P; 5IU1 A; 4B88 A; 1MKM A; 3O88 A; 4X1M A; 3TJZ C; 5FDH A; 3IXH A; 2EXA A; 4IBR A; 4JLF A; 2Y2G A; 1ZG6 A; 1FCM A; 5A90 A; 1Y4O A; 1OTD A; 3IF6 A; 2VLG A; 5JYP A; 1BUL A; 4GZB A; 5EVI B; 1RP5 A; 1ZG4 A; 4PKY A; 2PAV P; 5FEF A; 3QHY A; 2M7V A; 1PIO A; 3R7W B; 5HL1 A; 4BLM A; 3N8S A; 5EVI C; 2HPB A; 1K38 A; 2WUQ A; 1K55 C; 1XXM A; 3T4T A; 4DRT A; 1S6R A; 2A2L A; 3MQQ A; 1XFQ A; 2X02 A; 4EER A; 3HCY A; 4RX2 A; 2ZOI A; 3R4K A; 5DF9 A; 1JNU A; 3GTC A; 3MS6 A; 2ZQ7 A; 4PM5 A; 4EBL A; 1PI5 A; 4C3Q A; 3QNC A; 4BBT A; 3VE3 A; 4WLA A; 4IJG A; 1L2S A; 3O5Y A; 5M18 A; 4HI4 A; 1CEF A; 3EGX C; 3IH9 A; 3MZE A; 1Q2Q A; 3HJK A; 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2WGV A; 2V1Z A; 3G6O A; 3QP6 A; 1NWZ A; 3ZGA B; 3LIE A; 2OAP 1; 2YKF A; 5TR7 A; 5A93 A; 3N4I A; 4WBG A; 5DF7 A; 3BFD A; 1OTI A; 5HWV A; 1K4E A; 1PZO A; 2Y79 A; 2EX6 A; 5CED A; 3L9K A; 4EES A; 5CGW A; 3W4O A; 4KQQ A; 1E3U D; 4GJ4 A; 3UN7 A; 3ZVT A; 4OPQ A; 1T18 A; 3OPH A; 3HLF A; 4FH4 A; 2M7U A; 5DKK A; 3ZCZ A; 3P01 A; 3G31 A; 4HP4 A; 4IUK A; 2Y2O A; 4BJP A; 4B4X A; 3ZDJ A; 2X01 A; 4YIN A; 5DKL A; 2RL3 A; 2VK3 A; 3DTE A; 5DTS A; 1ONH A; 3W8K A; 2A3U A; 3PBS A; 4KUK A; 2Y2K A; 3MJQ A; 4G3K A; 4PM8 A; 1XGJ A; 1P9W A; 2W1R A; 1EW0 A; 4PPR A; 2XR0 A; 2W3G A; 3LR0 A; 3WS2 A; 3GEC A; 1S4S A; 4E3K A; 5CHM A; 5DJU A; 4P6Z M; 3VOY A; 2YKH A; 3EQU A; 2EA9 A; 1XFN A; 2PD7 A; 4JPM A; 4YOF A; 3UPP A; 2VGL S; 2XK1 A; 3T50 A; 3BQ8 A; 3DTI A; 3N8L A; 4E3I A; 3MXS A; 4F3L A; 4BEN A; 3IWO A; 2ZQ8 A; 4JXS A; 4ARZ B; 2XSS A; 3FG8 A; 1N9N A; 3A3E A; 3QP1 A; 2WKH A; 1XJ6 A; 1GSX A; 1BLC A; 2IWD A; 1HD8 A; 5E2G A; 4N1H A; 2ZJ9 A; 2W1T A; 3G35 A; 3CZD A; 3NOU C; 1OJ5 A; 3OC2 A; 4R38 A; 4MEZ A; 1XPB A; 4GB7 A; 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