The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
39
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sequence length |
130
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structure length |
130
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Chain Sequence |
SWQTYVDDHLLCEIEGNHLSSAAILGQDGSVWAQSSNFPQFKPEEITAIMNDFAEPGSLAPTGLYLGGTKYMVIQGEPGTVIRGKKGPGGVTIKKTNQALIIGIYDEPMTPGQCNMIVEKLGDYLIDTGL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of Peanut ( Arachis hypogaea ) Allergen Ara h 5.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Profilin
|
| molecule tags |
Allergen
|
| source organism |
Arachis hypogaea
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| total genus |
39
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| structure length |
130
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| sequence length |
130
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-04-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3L7H A; 2PRF A; 2VK3 A; 1HLU P; 1G5U A; 3D9Y A; 2ACG A; 1CF0 A; 2ZL1 A; 2ZL1 B; 1ACF A; 3T1R A; 1PFL A; 3NEC A; 5FEG A; 1PRQ A; 2PBD P; 4FUW A; 1Z09 A; 3NUL A; 1K0K A; 4ESP A; 3KYE A; 1FIL A; 1F2K A; 1PNE A; 3LEQ A; 1VEU A; 1VEU B; 2E8J A; 1VET A; 4QWO A; 1VET B; 1CJF A; 3MSH A; 2V8C A; 3T1X A; 2B95 A; 3UB5 P; 3LGO A; 3T1S A; 2BTF P; 5FEF A; 5EVE A; 1A0K A; 3L9K A; 2HZ5 A; 1YPR A; 3U4L P; 1SZV A; 1Y4O A; 3DAV A; 3CPT A; 3CPT B; 5FDS A; 4X25 A; 2JKF A; 3CHW P; 5EV0 A; 5EM1 A; 3MS6 A; 1CQA A; 4FTX A; 2JKG A; 1D1J A; 3T12 B; 2PAV P; 5EM0 A; 2V8F A; 1SKO A; 1SKO B; 4X1M A; 4X1L A; 1AWI A; 3T1Q B; 4D60 A; 1FIK A; 1J3W A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5DTT A; 3V5M A; 3A0V A; 3UO9 A; 3AGF A; 2J3T D; 1TS7 A; 2UWX A; 1OJG A; 3LY4 A; 3OCL A; 3UDI A; 4WEJ A; 4E3I A; 2ZMV A; 4EUZ A; 1MY8 A; 2Y4A A; 3G6O A; 3EGX C; 1PIO A; 1NLZ A; 3A3E A; 5EVL A; 3MKE A; 1IEL A; 2LB9 A; 3TG9 A; 4N1X A; 4P0M A; 5F5Y A; 2G2W A; 1ES4 A; 3UMD A; 3F1O B; 1LL5 A; 4LCL A; 3PYP A; 3Q7V A; 5HWV A; 2ZQ7 A; 5DJT A; 2K7S A; 2Y55 A; 4Y17 A; 4P87 A; 4RX3 A; 2ZQD A; 4L9F A; 1IEM A; 2B02 A; 4B4Z A; 3MSH A; 3UN7 A; 3FPW A; 1FOF A; 1YSQ A; 2DCF A; 4KZ9 A; 4LV1 A; 3CIT A; 2A2L A; 3HUN A; 4GLQ A; 3CLO A; 1K56 A; 1HD8 A; 3TJZ C; 4DJ2 A; 1NZO A; 4X53 A; 3C4P A; 4UAA A; 4QJG A; 1IYQ A; 3PBR A; 3E2L A; 3IQA A; 4OP5 A; 4Y5F A; 5HX9 A; 1K4E A; 5DKL A; 1K54 C; 3HUO A; 1OTA A; 1D7E A; 3MS6 A; 4UEY A; 3W8K A; 1YLY A; 1D1J A; 4WEL A; 3T4L A; 2P9V B; 3NC8 A; 3RFB A; 4CLC E; 3LR5 A; 4UHU A; 2GDN A; 2OLV A; 4E3J A; 1KOU A; 3IXB A; 4D60 A; 4HEF A; 1ESU A; 1K57 C; 1KE0 A; 3HLW A; 4EQI A; 2VK3 A; 4P6Z S; 5J3W A; 4K91 A; 1CF0 A; 2E8I A; 1TD5 A; 3N7W A; 3BYD A; 4F3L A; 3LIF A; 3C8C A; 1XXM A; 1VHM A; 3LIA A; 5FEG A; 3HVF A; 3ITA A; 3NDE A; 2VA0 A; 3G2Y A; 4NXB A; 2R78 A; 3ZG8 B; 3PAG A; 3NUL A; 3FWL A; 1X0O A; 1T18 A; 1EW0 A; 2QMI A; 2W1R A; 3KYE A; 2W3E A; 5A92 A; 4LRZ E; 1K6S A; 3UDF A; 3FV7 A; 1XA1 A; 1MBL A; 3VFF A; 4CLC B; 1ES2 A; 1S67 L; 3LUQ A; 4U0T A; 3UY6 A; 3CI6 A; 1XP4 A; 4LEN A; 4GCZ A; 4GHI B; 2BTF P; 3P01 A; 2FH5 A; 4ETZ A; 4HP9 A; 4OKP A; 1ZC2 A; 1KGE A; 3VSL A; 4PM7 A; 3ZVT A; 1LSV A; 3V3R A; 4X69 A; 1V9Y A; 4S2J A; 1W8Y A; 1N9B A; 1YAX A; 2ZC6 B; 4OPZ A; 2QJ7 A; 4ZAM A; 4II7 A; 5FAT A; 3GR2 A; 4G3W A; 4GS9 B; 3EQV A; 2WKP A; 1W63 Q; 1FSW A; 3EWK A; 1YMX A; 3GTC A; 4IBX A; 2OOL A; 2X02 A; 3HLF A; 4OPQ A; 3VP2 A; 5A91 A; 1JVJ A; 4GW9 A; 3BFF A; 4OOM A; 5GL9 A; 3VFH A; 4KZ7 A; 5EVI A; 2B5R A; 1G6O A; 5EVI D; 3PTE A; 4E04 A; 1T1A A; 5F69 A; 3SH9 A; 2V20 A; 4Y0U A; 3LI9 A; 4YNR A; 3S22 A; 4DN0 A; 4JPM A; 1NLY A; 4EU0 A; 4GOG A; 5TJJ A; 1OT6 A; 4JGO A; 1LL8 A; 1F2K A; 1FR1 A; 4QU3 A; 1WYB A; 5HZH A; 5FI2 A; 2JBF A; 2G2U A; 4NET A; 1XJ3 A; 4GDN A; 3UB6 A; 3HLC A; 5E2F A; 3IHB A; 1ODV A; 5DFX A; 3ZYT A; 4N1H A; 4P6Z M; 4XT2 B; 3IS2 B; 4BBT A; 1G68 A; 3O5Y A; 4X56 A; 1BLH A; 2Z6D A; 3F1P B; 4XUX A; 3E98 A; 3G32 A; 2VEA A; 4WZ4 A; 1IFQ A; 1BUL A; 4HHD A; 1T19 A; 5L8M A; 3CG5 A; 3MXQ A; 3DTK A; 3VOZ A; 1PW8 A; 4XXR A; 3SS4 A; 1D06 A; 1FQG A; 1G28 A; 4JF5 A; 4LV0 A; 1Q2P A; 3SZT A; 5FQQ A; 3R7W B; 4EUV A; 4EQ1 A; 4WEK A; 1IYS A; 5EVI C; 4DE3 A; 3IF6 A; 3PBT A; 3HLE A; 2ZM0 A; 2W3G A; 1FIK A; 3FKV A; 5M18 A; 2FZ0 A; 2GJ3 A; 2ZQA A; 2V9A A; 3WS0 A; 3CAX A; 1YSP A; 3LEZ A; 2Y2Q A; 1DJB A; 3WS5 A; 1HZO A; 4DDY A; 3MQQ A; 2ZOI A; 3IHA A; 2QWS A; 2A24 A; 3VP4 A; 2VKS A; 1H0M A; 1N9O A; 4BL2 A; 3TRC A; 1FIL A; 1E25 A; 2EX9 A; 3E0Y A; 4FSF A; 2VGL S; 3EOI A; 4HJ6 A; 4PM6 A; 2OV5 A; 4DDS A; 4DKI A; 4QWO A; 3DW0 A; 4OPY A; 2G7U A; 4S2L A; 1JWZ A; 4GKU A; 3BQA A; 2B95 A; 4MN6 A; 2R9W A; 3LGO A; 3EQU A; 2O0Y A; 5FQM A; 3BM6 A; 1P9W A; 4O0P A; 4WM9 A; 4DXC A; 1H3Q A; 2XFS A; 3HJK A; 3MZF A; 1KDS A; 2Y2K A; 3GV9 A; 1H8Z A; 2HPB A; 3H82 B; 3GQZ A; 5GLB A; 4R23 A; 2HGV A; 5A93 A; 4WF0 A; 5FDS A; 4MBF A; 2D02 A; 3OLO A; 3QNB A; 2PR5 A; 1ZTU A; 1RP5 A; 3QNC A; 4MN5 A; 3B47 A; 3UE1 A; 2Y2M A; 4I3I A; 2WAE A; 1SDN A; 4O01 A; 4AFI A; 4S2M A; 1E4D A; 3RH8 B; 4LV2 A; 4OOL A; 3IF6 C; 3BFD A; 3LFV A; 3LR3 A; 1BLS A; 4JXV A; 4GJ4 A; 1MC0 A; 5EE8 A; 1DRM A; 4Z1W A; 3BEB A; 4Y13 A; 3VSK A; 1SKO A; 1NRJ A; 1AWI A; 5F83 A; 3T1Q B; 3FG8 A; 2XRN A; 3MZE A; 3G31 A; 1NZU A; 2WKR A; 5DF7 A; 1HLU P; 1XPB A; 1NYY A; 5CGS A; 4PHT A; 4DF6 A; 2Y2O A; 3B3X A; 5CTM A; 3RJU A; 5FAQ A; 1PYY A; 3M2K A; 5E2G A; 3TOI A; 1MPL A; 5IU1 A; 1K0K A; 3EEH A; 3VE4 A; 1W8Q A; 2Q0O A; 5FA7 A; 4ME4 A; 3E4O A; 3LY3 A; 3Q7V B; 1W5D A; 4E3O A; 3OPL A; 5HAI A; 1MZU A; 4KG5 A; 4OH0 A; 3IXH A; 2VLG A; 2EX2 A; 3FZC A; 4NG2 A; 4R0Q A; 4MBH A; 3W4Q A; 2WKH A; 4UA9 A; 5GHY A; 3UNW A; 5C5K A; 3PBO A; 2H0T A; 2XLN A; 4HP4 A; 2EWW A; 3T4Q A; 4BMW A; 3BFC A; 4BWI A; 1DP9 A; 4B88 A; 1TEM A; 1H5X A; 4NEE D; 1VQQ A; 4E6X A; 1FCN A; 2VGL M; 4HBU A; 2JHE A; 5CED A; 1ES5 A; 2C5W B; 5TGF A; 2PD7 A; 2JKG A; 2PYP A; 1NY0 A; 4UQI M; 1UGU A; 2A3U A; 3UDX A; 4GDB A; 5EM0 A; 2ZMF A; 3Q7Z A; 4MLL A; 5F6A A; 4K08 A; 4PM5 A; 5FAO A; 5L09 A; 1H8M A; 4IJG A; 2WAD A; 1J3W A; 2J3W A; 5CER A; 3SOI A; 3O88 A; 1K54 A; 3D72 A; 3WS2 A; 3MZD A; 4F3L B; 2IWC A; 3D3O A; 3UB8 A; 4MCW A; 2BLS A; 1ERO A; 1JWP A; 4EET B; 5AVF A; 1ONG A; 4HOI A; 3VE3 A; 2Z2L B; 1PNE A; 2HDQ A; 1VEU A; 3O86 A; 3E2K A; 4R4S A; 1M6K A; 1K57 A; 5EFW A; 4OQH A; 4S2O A; 4ID4 A; 4ZRR A; 5HWW A; 1Y28 A; 3KSH A; 2WAF A; 3C7V A; 2J8Y A; 5DF8 A; 4KZ6 A; 4CJN A; 3QP1 A; 2BG1 A; 2O99 A; 5L07 A; 1SDE A; 2JE5 A; 2W3H A; 4BBV A; 5HD5 A; 1LSX A; 3KYQ A; 5HDD A; 4BQM A; 4OP8 A; 5CTN A; 1PW1 A; 1W63 M; 3V3S A; 4S2I A; 1L3L A; 4NXG A; 2W3D A; 3KYZ A; 3KX0 X; 5A8B A; 4FTX A; 3ZG5 A; 1F98 A; 1E3U A; 4JGP A; 3B33 A; 3O3V A; 4MMN A; 3JVU A; 3NDG A; 1LSW A; 5FQ9 A; 1XGJ A; 4A5R A; 3BEC A; 3BJN A; 4X68 A; 5KMW A; 1K56 D; 3KSI A; 3T12 B; 5GLC A; 5DTS A; 1XA7 A; 3QP2 A; 2K2N A; 4X1L A; 2O9B A; 4OQG A; 3NOT C; 5LBR A; 5HPI A; 5EVI B; 1NWZ A; 3LIE A; 1MWR A; 3D9Y A; 1I2W A; 4L0L A; 3O87 A; 2ZMA A; 2ZL1 A; 4N9K A; 1ACF A; 3Q81 A; 1XJ4 A; 5IHV A; 2Y8H A; 1WYC A; 4PAU A; 4GN2 A; 3A3D A; 5DKK A; 2H28 A; 1MWU A; 4FH4 A; 1EWZ A; 5CRF A; 4LCM A; 2X71 A; 4P85 A; 4R3B A; 4Q0J A; 1Y54 A; 2IA2 A; 3T4O A; 5FDH A; 5I5L A; 3DWK A; 3BLS A; 4WYY A; 3W4O A; 3EEA A; 3HLG A; 3K3D A; 3IXG A; 4C6Y A; 2GX5 A; 3MQ0 A; 4HH2 A; 1TF1 A; 3A3I A; 4HIA A; 1F5M A; 1W7F A; 5EPH A; 2D01 A; 1S4S A; 3Q1F A; 3HJI A; 2XDM A; 2HZ5 A; 1HVB A; 3UE3 A; 3DAV A; 4Q0I A; 4PPR A; 1JTD A; 1S1Y A; 5DFY A; 4EXO A; 1JTG A; 4NK3 A; 1ES3 A; 5HAQ A; 5FQI A; 5AVE A; 4DRT A; 3ITB A; 1BT5 A; 3ZQ5 A; 3GVB A; 3DTM A; 3T50 A; 1K6R A; 1K4F A; 3NJA A; 4KQR A; 4L9E A; 1BSG A; 5K5B A; 2EX6 A; 1L0G A; 3OCN A; 2ZD8 A; 5KZH A; 3IBJ A; 3FC7 A; 1STZ A; 3S4X A; 3IF6 B; 3JVV A; 4R38 A; 4RYE A; 3N8L A; 3L7H A; 4JF6 A; 5TFQ A; 1FCM A; 2V1B A; 2FFY A; 5FSR A; 1PFL A; 4LFU A; 1MWT A; 3VOL A; 3PR6 A; 4ZJ1 A; 1ZG6 A; 1OME A; 2A24 B; 5A90 A; 5HAR A; 4EV4 A; 3C4O A; 4I3A A; 4FCF A; 1L0E A; 5F1G A; 4KZ4 A; 3UME A; 2JKT M; 3PBQ A; 4H6J A; 3T4T A; 3SS5 A; 1S1Z A; 2XFT A; 2Z2M B; 4NXE A; 1ONH A; 1YPR A; 5HD3 A; 2ZQC A; 5D3O A; 2LB5 A; 2NUT C; 4WMC A; 3G30 A; 4JF4 A; 1PI4 A; 3CPT A; 5TBM A; 2HF6 A; 4GD8 A; 4KZ5 A; 3T4K A; 1GHM A; 4WMC D; 4BD1 A; 4MN7 A; 2ZBB A; 5EM1 A; 4NXF A; 3GDI A; 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1VEU B; 4KZA A; 2ZM2 A; 3IH9 A; 2P04 A; 3B42 A; 2I72 A; 3UE0 A; 1RCJ A; 4QY5 A; 2B18 A; 2L4R A; 2K31 A; 1PZO A; 4Q8I A; 2HDS A; 2ZOH A; 5DVA A; 1L0F A; 4XUZ A; 3UB5 P; 5TR7 A; 4JXS A; 4I3J A; 3T1S A; 3JPU A; 5AQA A; 2W1T A; 5AQ7 A; 1XX2 A; 4ARZ A; 3S7O A; 1QME A; 5FEF A; 2XA7 M; 2RL3 A; 3AGE A; 5EVE A; 1SHV A; 1FCO A; 2H0Y A; 4BEN A; 1A0K A; 2KX6 A; 3L9K A; 5M1A A; 5IS1 A; 2OAP 1; 5CEB A; 4OLD A; 4JKT A; 2MJ6 A; 3MF0 A; 5FL3 A; 4X25 A; 2WGW A; 4WLA A; 3UE6 A; 4KG2 A; 2Q9N A; 2XRO A; 1CEF A; 2Y2I A; 3K2N A; 2XEP A; 4EBN A; 2PU2 A; 1P9R A; 3NCK A; 3FPV A; 1RGZ A; 4UA7 A; 4LLO B; 4WZ5 A; 2QPN A; 3BWL A; 5CGW A; 3WRT A; 4H8R A; 4JGR A; 3BQ8 A; 1TS0 A; 1OT9 A; 1XFQ A; 3KO6 A; 1YLT A; 3A0R A; 4G3V A; 3N4I A; 3Q07 A; 1NJ4 A; 1LL9 A; 3G34 A; 4BL3 A; 2PRF A; 5M19 A; 2ACG A; 3KSG A; 2PYR A; 1OTB A; 4YWZ A; 1GSW A; 5CEC A; 3HCY A; 2ZL1 B; 4B93 A; 4EBP A; 2X01 A; 2OWH A; 1OTI A; 3IXD A; 1YM1 A; 1CK3 A; 3QP5 A; 1XJ6 A; 3RTY A; 1OPX A; 3SH7 A; 3G4P A; 4KUO A; 2O9A A; 4DE1 A; 1ALQ A; 2J9O A; 3U2A A; 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