The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
35
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sequence length |
134
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structure length |
133
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Chain Sequence |
SGSWQTYVDDHLMDIEGTGQHLTSAAIFGTDGTVWAKSASFPEFKPNEIDAIIKEFNEAGQLAPTGLFLGGAKYMVIQGEAGAVIRGKKGAGGICIKKTGQAMVFGIYDEPVAPGQCNMVVERLGDYLLDQGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural, Functional, and Immunological Characterization of Profilin Panallergens Amb a 8, Art v 4, and Bet v 2.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Allergen
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| source organism |
Artemisia vulgaris
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| molecule keywords |
Pollen allergen Art v 4.01
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| total genus |
35
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| structure length |
133
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| sequence length |
134
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-11-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3NUL A; 2V8F A; 2PAV P; 4X1M A; 3T1S A; 2PRF A; 1PNE A; 2HZ5 A; 2ZL1 A; 1F2K A; 1PFL A; 3L7H A; 4X25 A; 2E8J A; 3LEQ A; 3D9Y A; 1HLU P; 1SKO B; 1SZV A; 3T1R A; 3CPT B; 5EV0 A; 3T12 B; 3DAV A; 1FIL A; 5EVE A; 3MS6 A; 5EM0 A; 1J3W A; 1D1J A; 1FIK A; 1PRQ A; 4X1L A; 2ACG A; 1AWI A; 4ESP A; 1CJF A; 1CF0 A; 5FEF A; 3UB5 P; 3L9K A; 2JKF A; 3CPT A; 1VET B; 2V8C A; 4FTX A; 3KYE A; 1Y4O A; 3T1Q B; 1A0K A; 5FEG A; 1CQA A; 2BTF P; 5FDS A; 4QWO A; 4D60 A; 1ACF A; 1VET A; 3T1X A; 1K0K A; 1SKO A; 5EM1 A; 3NEC A; 3LGO A; 1VEU B; 1G5U A; 2PBD P; 2VK3 A; 2JKG A; 2B95 A; 1Z09 A; 3CHW P; 1YPR A; 3U4L P; 4FUW A; 2ZL1 B; 1VEU A; 3MSH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1CEF A; 2W3F A; 4QHC A; 1K57 C; 3SH8 A; 2DRW A; 2D02 A; 1O07 A; 2ZQ8 A; 5F82 A; 1YAX A; 3UB9 A; 4MDZ A; 1YLW A; 4EUZ A; 1KE0 A; 3DW0 A; 3C7V A; 3UDF A; 1PFL A; 1O7E A; 1NRF A; 3ZG5 A; 1LSX A; 3C7U A; 4K0W A; 4B93 A; 3Q1F A; 4Q0I A; 1DJC A; 3ULF A; 3HLE A; 4R1G A; 3TJZ C; 3DBA A; 2JKT I; 1HLU P; 4S2O A; 4BBT A; 1FIL A; 1QMF A; 1MWS A; 3MS6 A; 1XJ6 A; 2Q9M A; 3T50 A; 3E4O A; 4LFU A; 3PBR A; 4GB7 A; 5GL9 A; 3UB5 P; 4ARZ A; 1KDS A; 1LL5 A; 4JGQ A; 1F98 A; 4WMC D; 4Y0T A; 2ZMF A; 3G4P A; 4KZA A; 3IHB A; 4A5R A; 3FYZ A; 2G2W A; 3KYE A; 3HJI A; 4BJP A; 3E4Q A; 4C75 A; 3F1P A; 3GMW A; 3Q7V B; 4KG6 A; 3OCL A; 2V20 A; 3C2W A; 5CTM A; 2JHE A; 2PBY A; 3DWZ A; 4MN7 A; 2UV0 E; 2NUT C; 5EOO A; 4E6W A; 2VKS A; 3SZT A; 3GQZ A; 3IQA A; 4FH2 A; 5DTS A; 3SH7 A; 2VLG A; 1YLP A; 4PM6 A; 2PR6 A; 3IBR A; 1K55 C; 5FAT A; 3MZF A; 4WL9 A; 4DJ3 A; 3SS3 A; 1ONH A; 3UE3 A; 1OTB A; 2HP5 A; 2ZC5 B; 4PM7 A; 2ZQD A; 4P87 A; 3EQV A; 4IED A; 3T4S A; 3G30 A; 4HJ3 A; 1XGJ A; 3WRT A; 3LR3 A; 3K2N A; 4X6T A; 2QJ5 A; 3ITA A; 5U47 A; 1MBL A; 5A92 A; 1SKO B; 3T12 B; 4OOY A; 1DY6 A; 4LGW A; 5TFQ A; 1NJ4 A; 2J8Y A; 2WAE A; 1KE4 A; 4R6L A; 3UDX A; 1D1J A; 3TRC A; 2EX9 A; 1T19 A; 2X71 A; 1K57 A; 5F5Y A; 1IEL A; 3S7O A; 2M7U A; 4R70 A; 5E2G A; 4B88 A; 1BZA A; 3MR0 A; 4MMN A; 3IHA A; 2ZMV A; 3JYI A; 1MZU A; 2QMI A; 4EEP A; 1GSX A; 2EXB A; 2HDR A; 4UA6 A; 4OVD A; 4PMA A; 1P9W A; 3M2K A; 3JVV A; 4EER A; 1IKI A; 3QNC A; 1W63 Q; 1XFN A; 3NEC A; 3W4Q A; 3W2Z A; 4JXG A; 3GVB A; 5E2F A; 4UAA A; 3MBZ A; 4KUO A; 3UB6 A; 1MKM A; 5E2E A; 5DTT A; 4L9E A; 4KQQ A; 1FSW A; 1ZTU A; 2ZOH A; 3DTK A; 1ESI A; 1FSY A; 3B42 A; 4U0T A; 5FAQ A; 4RVA A; 4H6J A; 4OON A; 4F3L B; 3RTY A; 3EEA A; 2G2U A; 4ID4 A; 1W8Q A; 4KQD A; 5CER A; 4MLL A; 1I2S A; 3MXR A; 3UN7 A; 1YLT A; 5HD5 A; 5KSC A; 4S2K A; 1FOF A; 1K38 A; 4IUK A; 2H10 A; 1ZG4 A; 4IHQ A; 3M6H A; 1QME A; 4KZ8 A; 5TJJ A; 3A3I A; 1EI5 A; 5EVI C; 4DDS A; 5GLB A; 1K55 A; 2A24 A; 3T4T A; 1I2W A; 3NHQ A; 3KO6 A; 4BL2 A; 2PT7 A; 2WAD A; 4II7 A; 3ITB A; 3ZNY A; 5TR7 A; 3ZG0 A; 5FI2 A; 1SDE A; 1H8Y A; 2XSS A; 4CPK A; 2O99 A; 3FZC A; 3Q07 A; 1DP9 A; 1YMX A; 4ZJ1 A; 4YWZ A; 1TD5 A; 3LY3 A; 3PXP A; 3LR0 A; 1S66 L; 4KZ5 A; 2C5W B; 1TF1 A; 3T1X A; 4GS9 B; 5EM1 A; 3C4P A; 5EUA A; 4DF6 A; 4QU3 A; 2NUP C; 4GLQ A; 4HH2 A; 4JF6 A; 4G3V A; 1U60 A; 1YPR A; 2Z2L B; 4WF0 A; 4IVK A; 4DRT A; 2XDM A; 3U2A A; 3A3D A; 2Z6C A; 4LEN A; 4IUH A; 1SHV A; 5IHV A; 4GNU A; 3NUL A; 3PHY A; 1ONG A; 3FPW A; 3HL9 A; 1PNE A; 4R0Q A; 2DMW A; 1XJ3 A; 4BBU A; 4DE0 A; 1G6A A; 1XA1 A; 4OP8 A; 1HD8 A; 3HUM A; 2D01 A; 3D72 A; 3ZG8 B; 1LL8 A; 2Y4A A; 3F1N B; 4ZJ2 A; 3O5Y A; 3T4K A; 2KDK A; 4OPZ A; 5DJU A; 5IU1 A; 1OTA A; 2R9X A; 5IT5 A; 2PR5 A; 2ACG A; 3LIE A; 3G6O A; 2L4R A; 2QKP A; 3IH8 A; 3RXX A; 1NLZ A; 2WKI A; 3E2L A; 4KZ3 A; 4PPR A; 2HGV A; 4GW9 A; 3SS5 A; 1CI9 A; 4GZB A; 2A49 A; 1W8Y A; 3T1Q B; 1A0K A; 1E4D A; 3F1O B; 5FEG A; 2XK1 A; 4BL3 A; 3BM6 A; 1W79 A; 3AGF A; 1VHM A; 3LI9 A; 5EFW A; 5EVI A; 3G35 A; 3UO9 A; 5L2F A; 1NY0 A; 1G5U A; 3WWX A; 1GHM A; 5M18 A; 2I72 A; 4GDN A; 2BAS A; 3M6B A; 2JKG A; 4N9L A; 5HDD A; 3BFG A; 4HY8 A; 2W3G A; 1D06 A; 4LLO B; 3VSK A; 1YSP A; 3V39 A; 3WS2 A; 4HJ4 A; 4FUW A; 5FL3 A; 4HP4 A; 1T18 A; 4R3A A; 4DDY A; 2XGN A; 3VFF A; 1X0O A; 1OJG A; 1JWV A; 1MC0 A; 3SOI A; 4Z9Q A; 1N9N A; 3BW6 A; 2A3U A; 2W1T B; 2HJE A; 3RH8 B; 5DTK A; 3IX3 A; 3OPP A; 2P74 A; 3B3X A; 4Y3I A; 4R3J A; 5HAI A; 2XRO A; 1AXB A; 3BWL A; 3LEQ A; 1P0Z A; 5FI7 A; 2W27 A; 1K6R A; 5EVI D; 1YKD A; 2B5R A; 2HDU A; 1E3U D; 1DP6 A; 1NZO A; 5F69 A; 2WZZ A; 4MBF A; 4R3B A; 4O0P A; 5EE8 A; 3KX0 X; 3OPR A; 3PAG A; 4PKY A; 4NEE D; 3MKF A; 4KZ6 A; 4NXF A; 1LI0 A; 4DE1 A; 1L2S A; 2V9A A; 3UNW A; 5HW3 A; 4HQA A; 2XRN A; 2PU2 A; 3FKW A; 2EX8 A; 3HVF A; 1H8M A; 3T4O A; 2Y8H A; 1YQS A; 4KEN B; 3TE8 A; 4YOF A; 1WE4 A; 5F6A A; 5C5K A; 3P98 A; 4DE3 A; 3IS2 A; 3NIA A; 3NOT C; 3UB7 A; 5FAO A; 4R4S A; 3Q7V A; 1RP5 A; 1G6O A; 1TEM A; 3PBN A; 1ODV A; 2ZM0 A; 3CJM A; 1LHY A; 5HL1 A; 5HWW A; 2MJ6 A; 2PAV P; 1WA9 A; 1MY8 A; 4HH3 A; 4OPR A; 4EXO A; 4KG2 A; 5FQ9 A; 2LB9 A; 3C4O A; 2ZBB A; 3GDI A; 1C3B A; 3NJA A; 4CJN A; 4HI4 A; 4X25 A; 3HUN A; 1L0E A; 2W1R A; 2OWJ A; 4WEJ A; 1BUE A; 1H3Q A; 3ISG A; 4U0X A; 2QWS A; 2ZJ9 A; 3MQQ A; 2B18 A; 4PAU A; 4UA7 A; 2PHY A; 3ZGA B; 3OC2 A; 4U3T A; 4Q0H A; 2XLN A; 2OAQ 1; 2WKQ A; 4X1L A; 4L9F A; 3A0S A; 2ZQ9 A; 1CJF A; 2V2F F; 4LV1 A; 5FEF A; 2QHK A; 5HDS A; 4OOM A; 2JKF A; 3PR6 A; 1NXY A; 3KSG A; 2IA2 A; 1ESU A; 4RX3 A; 3S4X A; 1Y4O A; 4OQ0 A; 1JWP A; 2WUQ A; 3BYD A; 4QJG A; 2BTF P; 4Y0U A; 3GEC A; 3KSH A; 3UPO A; 1BUL A; 1FQG A; 2Y2M A; 1CK3 A; 1DJB A; 2VZW A; 3SH9 A; 2Y2J A; 4Y7P A; 3QP4 A; 3LUQ A; 5DF9 A; 3MF0 A; 3R7W B; 4RX2 A; 4JF4 A; 3Q81 A; 5J8X A; 5AQB A; 1EWZ A; 3CZD A; 1KDW A; 2PYP A; 2FFF B; 2FFY A; 4DE2 A; 3OOV A; 1S4S A; 5FI6 A; 4NKP A; 1T1C A; 1YLZ A; 1PZP A; 5A8B A; 3TW8 A; 4WEL A; 4JXW A; 4I38 A; 3IX8 A; 3BFE A; 3BRM A; 1K56 A; 3MFD A; 3PBT A; 2V1B A; 5HL6 A; 2IWD A; 2P08 A; 3VP4 A; 4F3L A; 1KGE A; 3MZE A; 3IXH A; 5G4Z A; 4YFM A; 1KVM A; 5HZH A; 1TDG A; 5CHM A; 4OPQ A; 3QP5 A; 3ICY A; 3EOI A; 3ZNT A; 5FQJ A; 3A3J A; 5KSH A; 4NXB A; 4ZAM A; 3V67 A; 3RJU A; 3VSL A; 3O86 A; 3VOY A; 2Q9N A; 4CQH A; 2ZMA A; 4Y0O A; 1IYP A; 3H9W A; 4FH4 A; 2VEA A; 3UME A; 2ZC3 B; 2ZM2 A; 4DXC A; 3GV9 A; 3IF6 B; 3FWL A; 1ZKJ A; 1S1Z A; 3D3O A; 4IVI A; 3P09 A; 2W3D A; 4K91 A; 3NDG A; 4S2N C; 1K56 D; 1L0D A; 5FDH A; 5L07 A; 3VMA A; 5F68 A; 1PI4 A; 2JKT M; 1PWC A; 3E2K A; 5I94 A; 3W4O A; 2OSU A; 2OWH A; 3VE4 A; 1ERO A; 4OKP A; 3G34 A; 2W3H A; 4GS9 A; 1DJA A; 2ZL1 B; 1VB6 A; 1W63 M; 2H0T A; 4X53 A; 3C38 A; 1DP8 A; 3LID A; 2Y2G A; 3VP3 A; 2PRF A; 3NY4 A; 3N8S A; 4YIN A; 1YM1 A; 1KOU A; 2PD8 A; 3MKE A; 2O9B A; 4X69 A; 3BY8 A; 1TS8 A; 1W7F A; 2BG1 A; 1OPX A; 2OLU A; 1LL9 A; 5AVE A; 4MEZ A; 2Y91 A; 4F94 A; 3IWQ A; 4GHI B; 1ERQ A; 5TGF A; 2J3W A; 3O3V A; 4D2O A; 4WN5 A; 3D9Y A; 5LBR A; 4OQG A; 3K3D A; 4EES A; 5HFO A; 4PM9 A; 2BLS A; 4B4Z A; 4Y17 A; 5DFY A; 4DN0 A; 2J9P A; 4OOL A; 2ZQA A; 1IYO A; 2Z2M B; 4EEU A; 4WZ5 C; 4HHD A; 1W5D A; 5GLA A; 4NET A; 1PI5 A; 1BTL A; 1CI8 A; 2XFS A; 5EVL A; 2ZQC A; 2WZX A; 5M1A A; 1XXM A; 3LIC A; 3VFH A; 3BLS A; 4E04 A; 1VM1 A; 1S4R A; 5G18 A; 4JPM A; 1VEU B; 1D7E A; 4X56 A; 1CEG A; 1XGI A; 2VK3 A; 3F1O A; 1H8Z A; 3DTI A; 1HVB A; 3UE1 A; 3N6I A; 3ZCZ A; 4M4X A; 1Q2Q A; 1E25 A; 3U4L P; 4E3N A; 2J7V A; 5KIZ A; 4IJG A; 5CED A; 4K0X A; 2X01 A; 4FOF A; 2INW A; 4S2N A; 5CEC A; 5CEB A; 5CGW A; 3H82 B; 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3BLM A; 4N92 A; 2CMN A; 5HD3 A; 3IX4 A; 2WKE A; 4UA9 A; 1KVL A; 3BFF A; 3CPT B; 5EV0 A; 2Z6D A; 4ME4 A; 4HP9 A; 3NCK A; 2JKR M; 4E3M A; 3IF6 C; 1FIK A; 1LSV A; 1AWI A; 3LIA A; 1PZO A; 2QPN A; 1GHP A; 3VP0 A; 1BLS A; 4BWI A; 3LYX A; 1OT9 A; 2Q0O A; 3EGX C; 4BD0 A; 3UE6 A; 4DMZ A; 3OCN A; 1Z6F A; 3V3S A; 3LR4 A; 5GHY A; 4O01 A; 2V0W A; 1XKZ A; 4H8R A; 1BT5 A; 1YT4 A; 2V0U A; 2B02 A; 5FDS A; 2H0Y A; 2QZ6 A; 2WKP A; 2PDR A; 4BLM A; 1P97 A; 4S2L A; 3G32 A; 5A91 A; 4CLC E; 4KZB A; 3PYP A; 4HBU A; 4Y15 A; 2B95 A; 3HLD A; 2C6W B; 2W3E A; 2ZLY A; 3T4J A; 3OZH A; 3ZG9 B; 2VGK A; 1M40 A; 5HX9 A; 1FCN A; 1OT6 A; 2IWC A; 3FG8 A; 5FA7 A; 3K3C A; 3VP2 A; 2HP9 A; 1T1B A; 4X1M A; 1RGZ A; 2K31 A; 3R7W A; 3T1S A; 4EBP A; 5FQQ A; 1NRJ A; 2OOL A; 1N9B A; 3MMH A; 3CAX A; 3L7H A; 3Q82 A; 3QP1 A; 1MWR A; 3N8R A; 3GRJ A; 2P9V B; 1S67 L; 3GTC A; 2O9A A; 5EVI B; 1MXO A; 1RGY A; 3HJK A; 2XD1 A; 1TVF A; 3TG9 A; 4K08 A; 4ZDX A; 4BBV A; 5A90 A; 3SS4 A; 4PM8 A; 2OV5 A; 1CF0 A; 3CUE A; 3PTE A; 2WGI A; 2HF6 A; 3KSF A; 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