The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
35
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sequence length |
134
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structure length |
133
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Chain Sequence |
SGSWQTYVDDHLMDIEGTGQHLTSAAIFGTDGTVWAKSASFPEFKPNEIDAIIKEFNEAGQLAPTGLFLGGAKYMVIQGEAGAVIRGKKGAGGICIKKTGQAMVFGIYDEPVAPGQCNMVVERLGDYLLDQGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural, Functional, and Immunological Characterization of Profilin Panallergens Amb a 8, Art v 4, and Bet v 2.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Allergen
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| source organism |
Artemisia vulgaris
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| molecule keywords |
Pollen allergen Art v 4.01
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| total genus |
35
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| structure length |
133
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| sequence length |
134
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-11-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SKO A; 3T12 B; 1G5U A; 1K0K A; 2VK3 A; 1SKO B; 3MS6 A; 1CF0 A; 2PBD P; 1F2K A; 1FIL A; 4FUW A; 2B95 A; 1ACF A; 3UB5 P; 1YPR A; 3DAV A; 3U4L P; 5FEG A; 3D9Y A; 1Z09 A; 5EV0 A; 4X1M A; 5EVE A; 3T1Q B; 4FTX A; 2PAV P; 3L9K A; 2JKF A; 3KYE A; 4QWO A; 1VEU A; 4X1L A; 2PRF A; 2E8J A; 1VEU B; 3CHW P; 3T1X A; 2ZL1 A; 5FDS A; 2ACG A; 1J3W A; 2ZL1 B; 2V8C A; 2HZ5 A; 1PFL A; 1FIK A; 3L7H A; 1VET A; 3CPT A; 1PNE A; 3NEC A; 5EM0 A; 4X25 A; 1HLU P; 1PRQ A; 2JKG A; 3CPT B; 5EM1 A; 3LGO A; 4D60 A; 3T1S A; 3NUL A; 2V8F A; 1CQA A; 1D1J A; 1A0K A; 3MSH A; 3T1R A; 2BTF P; 4ESP A; 1CJF A; 5FEF A; 1SZV A; 1VET B; 1AWI A; 3LEQ A; 1Y4O A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1SKO A; 4BL3 A; 3V50 A; 4MBH A; 5AVE A; 5FSR A; 2HJE A; 4D2O A; 2OLV A; 1RGY A; 2Y4A A; 4GLQ A; 3T4L A; 5HPI A; 1VB6 A; 4EBP A; 3M2K A; 3C7V A; 4KG2 A; 3VSK A; 2VX8 A; 4S2P A; 3BFD A; 1GHM A; 2GX5 A; 4L9G A; 3RXW A; 4IUH A; 1L0F A; 3HL9 A; 4S2N A; 1YLY A; 3PTE A; 4JGQ A; 3S7Q A; 2ZQC A; 4EW7 A; 4OLG A; 5DTT A; 3BQ8 A; 2O0Y A; 4PKY G; 2PRF A; 2J9O A; 3A3E A; 3FPW A; 2PR6 A; 5IU1 A; 1L0G A; 4K91 A; 1G6A A; 2ZL1 B; 3DTM A; 3W4Q A; 2HV1 A; 2DMW A; 2WGW B; 4HES A; 3HCY A; 4KUK A; 3MXR A; 3SH8 A; 3OCL A; 2OOL A; 4H8R A; 3CPT A; 4O0P A; 3P01 A; 2VEA A; 5CER A; 3WS0 A; 4HJ3 A; 3BY8 A; 4Q0H A; 1ZC2 A; 5TBM B; 5DF9 A; 4EQI A; 1BUE A; 4DE0 A; 2O9C A; 5EEC A; 4IVK A; 1OT6 A; 2XSS A; 1OPX A; 2VV6 A; 3N8S A; 1I5Q A; 5AQ9 A; 3VOL A; 5CEC A; 3LIF A; 3IS2 A; 1PWG A; 4JXS A; 4XUX A; 4EET B; 1XKZ A; 1AWI A; 3LEQ A; 1YMS A; 3QNC A; 1I2S A; 4PHT A; 4PPR A; 5U47 A; 2B5R A; 2DNS A; 1ODV A; 5F68 A; 3CJM A; 4IUK A; 1KGF A; 4UAA A; 3IQA A; 4S2K A; 4XT2 B; 2WZX A; 4EWF A; 5I94 A; 4PM9 A; 1TDL A; 5DVA A; 1U60 A; 3L9K A; 3UB6 A; 3FG8 A; 3RTY A; 2BAS A; 2Y2I A; 3NOT C; 5K5B A; 4MLL A; 4LRZ E; 5CRF A; 5EVL A; 4Z1W A; 1W79 A; 3CLO A; 4FH4 A; 3G31 A; 3C5A A; 2ACG A; 3OPL A; 4G3K A; 1ESU A; 2ZQ9 A; 3G30 A; 1L0D A; 3UE3 A; 3BWL A; 1LL9 A; 3MKE A; 3F1N B; 3T4O A; 2H0T A; 4DJ3 A; 2XQZ A; 3GDI A; 1FCM A; 4OP5 A; 2ZQA A; 3TRC A; 4GHI B; 1ES3 A; 4K08 A; 4F3L A; 1GHP A; 1JWP A; 3QP4 A; 4ARZ B; 4IBX A; 1VQQ A; 3MMH A; 3G4P A; 2OWH A; 3E4O A; 3HLD A; 1ES4 A; 3O86 A; 1OT9 A; 5IS1 A; 3KSH A; 3UPP A; 5DTS A; 2ZC7 A; 3HLF A; 5L10 A; 2W3F A; 3MKF A; 4I38 A; 4KZB A; 3E4Q A; 1KGG A; 1TD5 A; 2O9B A; 1G5U A; 3IF6 B; 5AQA A; 3JPU A; 4GDB A; 1V9Y A; 3IX4 A; 2PBY A; 4DF6 A; 1K55 A; 4E3L A; 2A24 B; 5KIZ A; 4R1G A; 2HF6 A; 2WUQ A; 3MZD A; 5FI7 A; 4GB7 A; 4BQM A; 2PT7 A; 1XP4 A; 1IYP A; 2V1B A; 3ZCZ A; 5HDC A; 2MJ6 A; 3B33 A; 4FTX A; 1ALQ A; 2PHY A; 3SW1 A; 4YIN A; 3PAG A; 1XA1 A; 1YLT A; 1XXM A; 4DDS A; 4BWI A; 2J3T D; 3GQZ A; 1UWP X; 4Y15 A; 4A5R A; 5GL9 A; 4BEN A; 3HVF A; 4ARZ A; 4H6J A; 3SS3 A; 3Q7V B; 2Y59 A; 1IFQ A; 3RFB A; 5DKK A; 3LY4 A; 2D02 A; 2ZM8 A; 5E2F A; 4EBN A; 2DRW A; 1E3U A; 3LIB A; 1T19 A; 1K6R A; 5HWV A; 3S7N A; 3NHQ A; 2PD7 A; 3JVV A; 1JWZ A; 5GLD A; 1K54 A; 1MWU A; 3MXQ A; 5J4E A; 3IH9 A; 2A49 A; 3G32 A; 4X6T A; 4BLM A; 3RXX A; 2YKF A; 1KDW A; 4HH3 A; 2XD5 A; 3NCK A; 2I72 A; 2Y2K A; 4Y17 A; 3UMD A; 2EXB A; 1W63 Q; 2H0Y A; 1Q2P A; 1PIO A; 2PU4 A; 3LR0 A; 5CGS A; 4L9E A; 3HRE A; 3D3O A; 3KYQ A; 1XGJ A; 4R0Q A; 2A2L A; 2XD1 A; 2Q0O A; 4RYE A; 2XLN A; 1F5M A; 2K7S A; 3UN7 A; 4FUW A; 3ZQ5 A; 4ZTK A; 3UB9 A; 3LEZ A; 5GHX A; 5E2G A; 4NK3 A; 3BJN A; 3Q7V A; 4Y5F A; 2G2U A; 3GMW A; 3QNB A; 2V1Z A; 3MZF A; 5L09 A; 1OJ5 A; 1N4O A; 1YSP A; 3TJZ C; 1MPL A; 4HQA A; 1Z09 A; 4RX3 A; 5GHY A; 5DF8 A; 3R7W B; 1OTE A; 4CLC D; 2Z2M B; 3C7U A; 4Y0U A; 3DTI A; 4X53 A; 4WZ5 A; 3O5Y A; 3LI8 A; 4MNR A; 2P74 A; 1N9B A; 2ZOI A; 2WKI A; 5L2F A; 3WRZ A; 5F1G A; 4ZAM A; 2J3T C; 3C30 A; 3KYZ A; 5HAR A; 2OV5 A; 1SCW A; 4MN6 A; 2ZJ9 A; 2V0W A; 2JKR M; 3MJQ A; 2VGK A; 4X55 A; 1P9R A; 1QME A; 4OOY A; 4JF4 A; 4KZ3 A; 5FAS A; 4P87 A; 1MWS A; 3ZYT A; 1TEM A; 4R4R A; 1FCO A; 3LIE A; 2XK1 A; 1PW8 A; 2ZMA A; 4MN5 A; 1CEF A; 4PM6 A; 5DKL A; 5TFQ A; 1DY6 A; 5F5Y A; 4LCL A; 2Z6D A; 5DFX A; 3TG9 A; 4BBV A; 3KX0 X; 3VE3 A; 1SZV A; 5HWT A; 1ERO A; 1NXY A; 4WBG A; 4QB8 A; 3H7W B; 4B4Z A; 3CG5 A; 3SS5 A; 1JWV A; 5EVI D; 2QJ7 A; 4PAU A; 1MZU A; 4HBT A; 4ZBE A; 1S1Z A; 2H10 A; 3SOI A; 2Y2M A; 4RQ9 A; 2IWC A; 1DJC A; 1YPR A; 1IOU A; 2M7V A; 1GSW A; 5EV0 A; 3A0S A; 4I3I A; 4X1M A; 4IJG A; 4JF5 A; 3ICY A; 2JN7 A; 4ETX A; 3OLO A; 4KZ9 A; 5IT5 A; 2AVX A; 5HFO A; 2FH5 A; 5HAP A; 4WYY A; 3OBF A; 3K2N A; 5A92 A; 2E8J A; 2WKE A; 2XR0 A; 1TS0 A; 4R70 A; 5FDS A; 2Y2Q A; 1CEG A; 3HLG A; 3Q1F A; 4QY5 A; 5GLC A; 3N8L A; 3HLB A; 1PWC A; 2QKP A; 4L9F A; 5CXW A; 1O07 A; 3E2K A; 1FIK A; 1E4D A; 4HNB A; 4U0X A; 4PM5 A; 4U3T A; 1NZU A; 5EM1 A; 3LIC A; 4E3I A; 3DBA A; 1CK3 A; 4S2N C; 3WS1 A; 3TW8 A; 3BY9 A; 3R4K A; 3ITB A; 4HIA A; 1KVL A; 4F94 A; 4Y2F A; 3UDF A; 4B93 A; 2LB9 A; 1P0Z A; 3Q7Z A; 3IH8 A; 4E3K A; 4GW9 A; 5FQK A; 2VV7 A; 1CJF A; 2KOI A; 2O99 A; 4JGO A; 3HUO A; 4YWZ A; 2FZ0 A; 5HAI A; 4OKP A; 3EWK A; 1H5X A; 3AGE A; 2JKR I; 2VK3 A; 3DTE A; 1MXO A; 4LV0 A; 1ERM A; 1PZO A; 3CWF A; 5C5K A; 5HD3 A; 3UB5 P; 4EES A; 4S2I A; 2E8I A; 5DTK A; 1ZTU A; 4UA6 A; 4CJN A; 2EX2 A; 1IYQ A; 1PWD A; 3K3D A; 1DRM A; 1YQS A; 1XJ6 A; 3KYE A; 2B18 A; 4WUJ A; 2WAE A; 4IBR A; 4HBU A; 4CPK A; 5E43 A; 4KZ7 A; 1XFN A; 3PBQ A; 2GJ3 A; 3TOI A; 4QPR A; 1ESI A; 1LSX A; 5EVI B; 2J7V A; 4HI4 A; 3ZVW A; 3T50 A; 5DJT A; 1BLH A; 4B88 A; 2FFY A; 2P9V B; 4GOG A; 3V39 A; 3HUN A; 3VP0 A; 2ZD8 A; 3ZVT A; 4JBF A; 1MKI A; 3BLS A; 2W1T B; 4GS9 B; 3BM6 A; 2V8F A; 3VP4 A; 4ZDX A; 2EWW A; 3NI9 A; 3Q82 A; 3OOV A; 3MSH A; 4BMW A; 4WMC D; 5EOE A; 2HGV A; 2J3W A; 5FEF A; 1YKD A; 3RH8 B; 1E3U D; 5G4Y A; 5FAO A; 5L07 A; 2M7U A; 5FI6 A; 4YOF A; 5TJJ A; 3MS6 A; 3WS5 A; 1F2K A; 4DXC A; 1YMX A; 2QWS A; 1OME A; 4Y3I A; 1W8Q A; 4GCZ A; 5FQM A; 3E0Y A; 2ZOH A; 3IWQ A; 1WYB A; 3Q07 A; 3GEC A; 3EGX C; 1PI5 A; 3ULF A; 1LSW A; 1IYS A; 4M3K A; 4QY6 A; 1QMF A; 5HZH A; 3E98 A; 4OPR A; 2L4R A; 1FOF A; 4O01 A; 1V9Z A; 5GHZ A; 4ME4 A; 3LIA A; 4IED A; 4MEZ A; 3OC2 A; 5BOH A; 4Y7P A; 4R23 A; 5FAQ A; 2W0N A; 4JKT A; 4R3J A; 4ZRR A; 2WAF A; 2ZL1 A; 3KSI A; 1S66 L; 3OPR A; 2WGW A; 4MCW A; 2ZQ7 A; 4DKI A; 4P6Z M; 4HP4 A; 1NLY A; 3NIA A; 1P97 A; 1PYY A; 1K55 C; 1XJ3 A; 4N1H A; 2K2N A; 5TBM A; 2WYX A; 5CTM A; 3HLC A; 4RX2 A; 5EM0 A; 5J7E A; 2KX6 A; 2NUP C; 3BYD A; 1L3L A; 2I9V A; 4WEL A; 3NJA A; 1X0O A; 2PD8 A; 5EOO A; 4FOF A; 5AJG A; 2QYB A; 3TE8 A; 4DN0 A; 2VLG A; 2PYP A; 3GTC A; 1MWR A; 2Y8H A; 4HOI A; 4CQH A; 4ZJ1 A; 1M6K A; 1YM1 A; 4UQI M; 1N9L A; 4YFM A; 2EX9 A; 3E2L A; 4OOL A; 5A90 A; 1S67 L; 4JF6 A; 3UME A; 1ES2 A; 3N7W A; 2VZW A; 3EEH A; 4X68 A; 2PBD P; 3QP2 A; 4XT2 A; 4OON A; 2P08 A; 3GSG A; 1K54 C; 3C4O A; 1OTI A; 5FEG A; 1IKI A; 3IF5 A; 2P04 A; 2OLU A; 3D9Y A; 5EVE A; 4EEU A; 2PAV P; 4HJ4 A; 2KDK A; 2XEP A; 4LV3 A; 1NJ4 A; 2X02 A; 4HP9 A; 1BTL A; 4EU0 A; 3MQQ A; 4ZJ2 A; 3BFC A; 3IBR A; 4HEF A; 3ZG5 A; 1LLB A; 4E6W A; 1K57 A; 3WS2 A; 3CIT A; 4GN2 A; 1MY8 A; 1O7E A; 4BD0 A; 3LYX A; 1Y28 A; 2YKH A; 4KUO A; 3VE4 A; 2QHK A; 4KZ6 A; 3F1N A; 3MF0 A; 5FQI A; 2JE5 A; 5HDD A; 2IWB A; 4XUZ A; 1PNE A; 3LFV A; 3VV4 A; 4GKU A; 2RL3 A; 4BBT A; 4R38 A; 2JKG A; 1TS7 A; 2EFX A; 3UE0 A; 4GHI A; 5FQJ A; 5HX9 A; 1S4R A; 4JXV A; 1YLJ A; 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3CUE A; 1VET B; 5FI2 A; 2HDS A; 5FDH A; 4KQO A; 5HSQ A; 3A0R A; 3KO6 A; 1SHV A; 3LID A; 1G28 A; 2PU2 A; 3C8C A; 4WEJ A; 2Y2N A; 1FIL A; 3LR4 A; 2XH9 A; 2Y2G A; 4KZ8 A; 4Q0J A; 5FAP A; 1C3B A; 3R7W A; 2CC1 A; 4R4S A; 3IWI A; 3OCN A; 1DJA A; 2JKF A; 2VGL S; 4FH2 A; 2K31 A; 4GJ4 A; 3I7J A; 5J3W A; 1F9I A; 4XXR A; 4S2J A; 2QPN A; 2G2W A; 1WYC A; 1T1A A; 3FKW A; 1OTD A; 3PR6 A; 5CGW A; 1XJ2 A; 2XA7 M; 3BW6 A; 5M19 A; 4I3A A; 1VET A; 1BT5 A; 4R3B A; 4X69 A; 5FA7 A; 5HPF A; 5HD5 A; 4NXE A; 4KG6 A; 1PW1 A; 4WLA A; 3T1S A; 4JXW A; 3IXB A; 4NXB A; 3FC7 A; 1P9W A; 5KSH A; 4KZA A; 4P6Z S; 3UNW A; 5EUA A; 1E25 A; 1K25 A; 3A3J A; 1GCE A; 5M18 A; 5D3O A; 4C6Y A; 2BTF P; 3VOZ A; 2UWX A; 3C2W A; 2HP5 A; 3QHY A; 3H7W A; 2PYR A; 3FPV A; 4I5S A; 4CLC B; 3WWX A; 3BEC A; 3DWK A; 3GV9 A; 4Q8I A; 2VA0 A; 1SKO B; 4Y0T A; 4KQR A; 1BLS A; 2QMI A; 4R3A A; 3PAE A; 3OPH A; 4DDY A; 2PDR A; 2Z6C A; 3CI6 A; 4BJP A; 1T18 A; 1ACF A; 4KEN B; 3ZG0 A; 3G35 A; 2GDN A; 1FSW A; 1CI8 A; 4UQI S; 2JBF A; 1H8Y A; 3LUQ A; 3EOI A; 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