The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
135
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structure length |
127
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Chain Sequence |
GSGSWQTYVDEHLMDIEGTGQHLASAAIFGTDGNVWASSSFPEFPDEINAIIKEFSEPGALAPTGLFLAGAYMVIQGEPGAVIRGGAGGICITGQAMVFGIYEEPVNPGQCNMVVERLGDYLVDQGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural, Functional, and Immunological Characterization of Profilin Panallergens Amb a 8, Art v 4, and Bet v 2.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Profilin
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| molecule tags |
Allergen
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| source organism |
Ambrosia artemisiifolia
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| total genus |
31
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| structure length |
127
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| sequence length |
135
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-11-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SZV A; 2HZ5 A; 3D9Y A; 1PNE A; 1SKO A; 2ZL1 A; 3T1S A; 2B95 A; 3CHW P; 4FTX A; 1F2K A; 2PRF A; 2V8F A; 2V8C A; 3NEC A; 2JKG A; 5EVE A; 1FIL A; 3KYE A; 2ACG A; 3DAV A; 1HLU P; 1VEU B; 3L7H A; 1CJF A; 3T12 B; 1A0K A; 3T1X A; 4X1L A; 1FIK A; 1CF0 A; 1Y4O A; 5FEF A; 1YPR A; 3T1R A; 4QWO A; 4ESP A; 1AWI A; 1VET B; 1PRQ A; 1CQA A; 2E8J A; 3LGO A; 3CPT A; 5EM1 A; 5FDS A; 4D60 A; 1D1J A; 1SKO B; 5EV0 A; 2PBD P; 1J3W A; 2ZL1 B; 1VEU A; 3MS6 A; 3T1Q B; 1G5U A; 2PAV P; 3NUL A; 1ACF A; 3LEQ A; 4X1M A; 1Z09 A; 2BTF P; 4X25 A; 2JKF A; 3U4L P; 5EM0 A; 1VET A; 5FEG A; 4FUW A; 1K0K A; 3UB5 P; 1PFL A; 2VK3 A; 3L9K A; 3CPT B; 3MSH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1SZV A; 1PNE A; 2OLV A; 4N9L A; 5C5K A; 2Y2P A; 4S2I A; 3UB8 A; 3UME A; 3ZG8 B; 3U2A A; 5D3O A; 3P01 A; 2FZ0 A; 1EW0 A; 4JXV A; 3VFH A; 3A3E A; 4YIN A; 1LL8 A; 4UHU A; 3QNB A; 1N9O A; 4BD1 A; 3C2W A; 5F6A A; 3ZFZ A; 1MPL A; 2V1A A; 3M2J A; 2WGI A; 3IF5 A; 3IH9 A; 1JTG A; 5K5B A; 4NG2 A; 2VA0 A; 4MBK A; 1GHP A; 4PM7 A; 3KSI A; 4JBF A; 1TEM A; 4S2P A; 1X0O A; 3S4X A; 2QJ7 A; 2JKR I; 4K08 A; 3A0R A; 1NYM A; 1H5X A; 2QHK A; 5HAR A; 5DKK A; 4LRY C; 3O86 A; 1LSX A; 1K57 A; 2WKP A; 5F1F A; 2XDM A; 2XLN A; 3MXR A; 1FCM A; 1PW8 A; 2ZC6 B; 4WF0 A; 4EBL A; 4OH0 A; 1KE3 A; 4IUH A; 4GJ4 A; 2Y79 A; 4CQH A; 1TS8 A; 3O87 A; 1YSQ A; 4GOG A; 4Y0U A; 1NWZ A; 4H6J B; 1N9N A; 3DTI A; 1JVJ A; 1NRJ A; 3NUL A; 3B47 A; 3ZVT A; 4JGR A; 3NI9 A; 3KSF A; 4HHD A; 3ZNT A; 4YOF A; 2IWD A; 4OPQ A; 2Y2O A; 4E3O A; 5HAP A; 2DCF A; 5HSQ A; 5G18 A; 1LSW A; 4HOI A; 5AVF A; 1PFL A; 1J9M A; 1MC0 A; 3CLO A; 1IEL A; 3MKF A; 4Y2F A; 1WYB A; 5LBR A; 4LRZ E; 1L0D A; 3V5M A; 4PM5 A; 4BEN A; 4QD4 A; 4EW7 A; 1L0E A; 3BY9 A; 2HGV A; 3H82 B; 4BL3 A; 3UB6 A; 3BJN A; 1MWT A; 1TD5 A; 5DF7 A; 1ZHH B; 3IHB A; 4R1G A; 1XJ2 A; 1S1Z A; 3G30 A; 4RA7 A; 1BSG A; 3QP5 A; 1WA9 A; 2WZZ A; 2FFF B; 4GLQ A; 3BQA A; 3EEH A; 3DTM A; 5HZH A; 2Y2K A; 4HJ6 A; 3D3O A; 5FL3 A; 4XT2 B; 3S1Y A; 1XJ3 A; 1HLU P; 4JF5 A; 2VX8 A; 4XUZ A; 2RCX A; 3GRJ A; 3TE8 A; 4ZBE A; 2V1Z A; 4QWO A; 4ESP A; 2Q9N A; 2ZC7 A; 2GZA A; 2ZQ7 A; 4M3K A; 1Q2P A; 2ZC5 B; 5GLD A; 1C3B A; 1E3U A; 1SHV A; 3OCN A; 3IWI A; 1XJ6 A; 2W3G A; 4HBT A; 3BFC A; 2JBF A; 2YKF A; 5DF8 A; 3OC2 A; 4Y13 A; 3EQV A; 3ZYT A; 2JC7 A; 5FI6 A; 2EWV A; 3HJK A; 4B4Z A; 2NUP C; 4X1M A; 4S2M A; 1XJ4 A; 2VV8 A; 5EOO A; 2KLI A; 4GKU A; 3VOZ A; 3ULF A; 2O9B A; 5I94 A; 3HUN A; 1EWZ A; 3H9W A; 4MCW A; 4YFM A; 3BLS A; 3E4P A; 2VZW A; 2NUT C; 1SCW A; 3CG5 A; 3VP3 A; 1K54 A; 5E2E A; 3F1P B; 4CLC A; 1RGY A; 1ES4 A; 3E4O A; 5JYP A; 1ONG A; 4MBH A; 4NKP A; 3LR0 A; 4R6L A; 1Q2Q A; 3MQQ A; 4KG6 A; 2GDN A; 2EWW A; 4R0Q A; 1S0W A; 3IF6 C; 1VM1 A; 5EVE A; 5EVI A; 2PYR A; 4UA9 A; 3IX4 A; 3LIB A; 2GNX A; 3NCK A; 1FR6 A; 4P87 A; 3T4S A; 2K2N A; 1G6O A; 1VEU B; 2VJW A; 2XGN A; 3T1X A; 3QP8 A; 3GSG A; 3PYP A; 3T1R A; 2KOI A; 4I38 A; 3OBF A; 5IU1 A; 3SS5 A; 1VET B; 5HDC A; 1ESU A; 5E43 A; 4X68 A; 5E2F A; 1BLP A; 4LPZ A; 1DP8 A; 4GD8 A; 5DKL A; 3BFE A; 4EET B; 4IHQ A; 4Q0H A; 4ARZ B; 3EGD C; 3IWO A; 1YT4 A; 4DMZ A; 5A90 A; 5HD3 A; 4CLC E; 3IH8 A; 4JGQ A; 3B42 A; 1OTB A; 1PZP A; 2Y59 A; 1L2S A; 3CJM A; 3MZE A; 5DJU A; 4BBT A; 5G4Z A; 4B4X A; 2WGV A; 4RX2 A; 1K6S A; 4KQR A; 1H8M A; 3D4F A; 3CZD A; 1K4E A; 2V9A A; 2WAE A; 3T4T A; 1PW1 A; 4WM9 A; 3H7W A; 4EER A; 4KZ3 A; 1CI8 A; 5HWT A; 4OP5 A; 2PHY A; 3IXB A; 3ZNY A; 3S7P A; 2HZ5 A; 1OT9 A; 3G6O A; 4UEY A; 5CEC A; 4DJ2 A; 1YLP A; 5FQI A; 4PM9 A; 4OQI A; 3UE1 A; 4ZDX A; 2OLU A; 4E04 A; 4ZAM A; 2ZMF A; 4LCL A; 2IWB A; 1F2K A; 3TSG A; 1GSW A; 2WKE A; 2J7V A; 4IVK A; 3E0Y A; 1XKZ A; 4S2L A; 5CRF A; 1OME A; 3SH7 A; 1OTI A; 2YKH A; 3DAV A; 1YLZ A; 2HDQ A; 2PYP A; 5FDH A; 2R9W A; 4E3I A; 4PHT A; 3UDF A; 1ZG6 A; 2EFX A; 3OPL A; 5L09 A; 1LI9 A; 2UWX A; 2R78 A; 3LGO A; 2OWJ A; 4ZJ3 A; 3SH8 A; 2JKT I; 1M40 A; 2W0N A; 4OKP A; 2JE5 A; 3NDE A; 3UDI A; 5DFX A; 2J3T D; 3MMH A; 4HH3 A; 1F5M A; 1BZA A; 2PBD P; 3KYZ A; 3DWK A; 1Y28 A; 3A0S A; 1ES3 A; 2R9X A; 5CED A; 3ITB A; 3TRC A; 3HLB A; 4HJ3 A; 2O99 A; 5EOE A; 2WKQ A; 3E4Q A; 3GDI A; 2FH5 A; 5HL1 A; 3F1O A; 1H3Q A; 5F5Y A; 5EFW A; 1SDE A; 2WUQ A; 1IKG A; 2Z6C A; 4NET A; 2KDK A; 1QME A; 3KO6 A; 4S2K A; 1GHM A; 1T18 A; 3NOU C; 4BWI A; 3C4O A; 5HL6 A; 1W63 Q; 2WGW A; 4WZ5 A; 3QP1 A; 1W8Q A; 4NXE A; 5M19 A; 1QMF A; 3BWL A; 2PRF A; 2QYB A; 4MLL A; 2QJ5 A; 3FG8 A; 4XXR A; 5DVA A; 4O0P A; 3WRT A; 4Q0J A; 4KQQ A; 3IS2 B; 3CAX A; 4KZ4 A; 3UE0 A; 3LY3 A; 4K91 A; 4YNR A; 1KGF A; 1ESI A; 3BFD A; 3N8S A; 4EBP A; 3OPP A; 3LR5 A; 4PKY G; 5U47 A; 4X1L A; 1FIK A; 4WEJ A; 2P9V A; 3MZF A; 4KUO A; 4KZ7 A; 4DN0 A; 4WMC A; 5A91 A; 4KG2 A; 1V9Y A; 3R4K A; 1XA1 A; 3JYI A; 4PM6 A; 2E8J A; 2CC1 A; 5CGS A; 1JNU A; 2MJ6 A; 1I2W A; 3VOL A; 4FH2 A; 3N6I A; 1KVL A; 3IHA A; 3LY4 A; 1YLT A; 5FQQ A; 3DBA A; 3HLF A; 3KX0 X; 4ZJ1 A; 4S2J A; 4YWZ A; 4GZB A; 4OQH A; 3HLW A; 1CEG A; 3W4Q A; 2ZD8 A; 3ZG7 B; 5EM0 A; 3N8L A; 5FQK A; 2QPN A; 4E3K A; 1P9R A; 3NOP C; 2IA2 A; 2WZX A; 2HP5 A; 1N4O A; 1FOF A; 2ZOH A; 5TBM A; 3RXX A; 3VE4 A; 3IQA A; 5TGF A; 2Y91 A; 3ZGA B; 5AVE A; 1XPB A; 3I7J A; 1SKO A; 4H8R A; 4UQI S; 2B18 A; 4Q8I A; 4GS9 A; 5AQ7 A; 3NHQ A; 3BFF A; 5AJG A; 4FH4 A; 5MC7 A; 5GL9 A; 2L0W A; 3E2L A; 2EXB A; 3WS4 A; 2PD8 A; 2WKR A; 3PTE A; 4Y17 A; 5IT5 A; 2D01 A; 3FYZ A; 4DE1 A; 4DDY A; 4DXC A; 3HL9 A; 3MFD A; 4QU3 A; 5F68 A; 5KSH A; 2X71 A; 3HLC A; 4X55 A; 3VV4 A; 2J3T C; 4P0M A; 1LLB A; 3G2Y A; 2OWH A; 1LSV A; 5KMW A; 4IUK A; 4R4S A; 1NYY A; 2XRO A; 1YPR A; 4HP9 A; 3K3D A; 2W3E A; 3WWX A; 1YLJ A; 3ZVW A; 2G2U A; 3QP4 A; 4UAA A; 3GR2 A; 3MR0 A; 3CPT A; 2Z2M B; 5EM1 A; 3HBR A; 2DRW A; 2XR0 A; 5CXW A; 5HPF A; 3M6H A; 3BM6 A; 1DJB A; 3BW6 A; 3S7Q A; 2ZJ9 A; 4RVA A; 3VE3 A; 2ZQC A; 4QY6 A; 3PBN A; 3OPR A; 4KQO A; 1ACF A; 4D2O A; 4EUV A; 2JN7 A; 1KGG A; 4X25 A; 2JKF A; 1L0F A; 3FWL A; 3MKE A; 4I39 A; 4IJG A; 3TW8 A; 2H5S A; 3ZG9 B; 1E25 A; 2QKP A; 4HES A; 4UQI M; 5DF9 A; 4PPR A; 4B93 A; 5HAI A; 2X01 A; 5GLB A; 5KSC A; 4DJ3 A; 5CHM A; 1DY6 A; 2O0Y A; 1HTZ A; 4C3Q A; 1IYO A; 5GHY A; 3UMD A; 3CHW P; 4KZA A; 3T4K A; 4L9G A; 1IKI A; 2Q9M A; 3CWF A; 1HVB A; 2EX2 A; 5BOH A; 2W3D A; 3F1N A; 2DMW A; 1NJ4 A; 5GLC A; 2PT7 A; 2P74 A; 3MQ0 A; 4ZRR A; 5FA7 A; 4GW9 A; 4NK3 A; 2ACG A; 4B9O A; 4NXF A; 3UDX A; 2A3U A; 4MN5 A; 1ZG4 A; 2XRN A; 4F3L A; 3L7H A; 2K31 A; 3R7W A; 1P9W A; 3IXH A; 3RTY A; 1NLZ A; 1LL9 A; 2HF6 A; 3PBS A; 3FKW A; 4U0X A; 3C7U A; 3SH9 A; 2ZMA A; 2BAS A; 4LCM A; 1K55 C; 3IXD A; 2VV7 A; 4OVD A; 3DTK A; 2O9A A; 3RXW A; 2XD5 A; 3MBZ A; 1YLY A; 1G6A A; 5TJJ A; 2PAV P; 4B88 A; 1TDL A; 3V50 A; 1GSV A; 3LI9 A; 3IF6 A; 4WYY A; 4HP4 A; 4LGW A; 4JLF A; 3GEC A; 3C4P A; 1T1C A; 1T1B A; 3C7V A; 3PBQ A; 5FAT A; 2Y2Q A; 1FR1 A; 3GMW A; 4AFI A; 1YSP A; 4E6W A; 2OAQ 1; 1YM1 A; 1BLC A; 5HX9 A; 4HH2 A; 4WBG A; 2HJE A; 5DTS A; 3NBL A; 3A3D A; 2M7V A; 2W1T A; 4X6T A; 1PWD A; 3ZHH A; 5HPI A; 1JWV A; 1DP9 A; 4R3B A; 2RL3 A; 4GNU A; 3LIF A; 5KIZ A; 1GA9 A; 4LV1 A; 5E2H A; 5A93 A; 1E4D A; 1IEM A; 4C75 A; 1CEF A; 1FQG A; 1XFQ A; 2BG1 A; 4MEZ A; 2X02 A; 2VEA A; 3GTC A; 1TS7 A; 3OCL A; 3P7N A; 2XSS A; 3MZD A; 4QPR A; 2WKH A; 2WK0 A; 1M6K A; 1JWZ A; 5FDS A; 4EQ1 A; 3PAG A; 1K25 A; 1K56 D; 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4DDS A; 4LLO B; 1K4F A; 1ERO A; 1Z6F A; 2ZQ8 A; 1P97 A; 1XXM A; 4H6J A; 4X56 A; 3PHY A; 5CEB A; 1CK3 A; 3C38 A; 2V8F A; 3LIC A; 1YAX A; 2P7J A; 3NC8 A; 3GV9 A; 2G2W A; 1K38 A; 2GJ3 A; 3NY4 A; 4KZ5 A; 4OLD A; 3KYE A; 5FI7 A; 2ZQD A; 3IX3 A; 3G31 A; 4WN5 A; 4EU0 A; 5EEC A; 5L2F A; 2VGL M; 2PR6 A; 1SDN A; 2O9C A; 1IFQ A; 3H82 A; 4ME4 A; 2Y2I A; 4MNR A; 3O3V A; 2W1T B; 5CGX A; 5F82 A; 1JWP A; 4KZ8 A; 4RX3 A; 3HLE A; 3EOI A; 2H28 A; 3UB9 A; 3CIT A; 2FFY A; 1VB6 A; 3BEC A; 4CLC B; 4XT2 A; 2HP9 A; 3MS6 A; 2WKI A; 4KQD A; 4L0L A; 1L0G A; 4O7D A; 5JYO A; 3MF0 A; 4KZ6 A; 2XD1 A; 4Q0I A; 1DRM A; 1MWS A; 1W8Y A; 4KEN B; 5CHJ A; 3T4Q A; 3OOV A; 5EVI B; 1ZC2 A; 1W7F A; 3EEA A; 2HP6 A; 5CGW A; 3MQO A; 1BLH A; 2ZQA A; 5HW3 A; 3UE6 A; 2ZLY A; 3P98 A; 5J7E A; 3HVF A; 2B95 A; 4FTX A; 3PR6 A; 3Q7V B; 4OOY A; 1GHI A; 2L4R A; 3CUE C; 3QP6 A; 2PDR A; 3BRM A; 4DE3 A; 2B02 A; 4OP8 A; 3K3C A; 4WL9 A; 1ERM A; 1LI0 A; 3OPH A; 4BQM A; 2XF3 A; 3FZC A; 3CMZ A; 1TS0 A; 3V3S A; 2VGK A; 4Y5F A; 1T1A A; 3F1P A; 5DTK A; 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