The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
132
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structure length |
132
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Chain Sequence |
SWQTYVDEHLMCDIEGTGQHLASAAIFGTDGNVWAKSSSFPEFKPDEINAIIKEFSEPGALAPTGLFLAGAKYMVIQGEPGAVIRGKKGAGGICIKKTGQAMVFGIYEEPVNPGQCNMVVERLGDYLVDQGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural, Functional, and Immunological Characterization of Profilin Panallergens Amb a 8, Art v 4, and Bet v 2.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Allergen
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| source organism |
Ambrosia artemisiifolia
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| molecule keywords |
Profilin
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| total genus |
31
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| structure length |
132
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| sequence length |
132
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-11-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4X1L A; 2B95 A; 1G5U A; 5FEG A; 4X1M A; 1SZV A; 1PFL A; 3L9K A; 5EV0 A; 3LGO A; 2PAV P; 1VET A; 3NUL A; 2PBD P; 2BTF P; 3KYE A; 1D1J A; 5FDS A; 3T1X A; 3NEC A; 1CF0 A; 1SKO A; 5EVE A; 1AWI A; 4X25 A; 3CHW P; 3DAV A; 1F2K A; 2JKG A; 3T1S A; 2HZ5 A; 1K0K A; 1CJF A; 3T1R A; 3L7H A; 1J3W A; 3CPT B; 1FIK A; 3MSH A; 1A0K A; 2VK3 A; 2ZL1 B; 5EM1 A; 4ESP A; 1VEU B; 5EM0 A; 1FIL A; 3CPT A; 3U4L P; 4QWO A; 2E8J A; 1ACF A; 1PRQ A; 3T1Q B; 3LEQ A; 2PRF A; 3T12 B; 1VET B; 2V8C A; 1HLU P; 2V8F A; 4FTX A; 1VEU A; 2ACG A; 1SKO B; 1Y4O A; 1Z09 A; 1YPR A; 1CQA A; 5FEF A; 4D60 A; 2JKF A; 3MS6 A; 3UB5 P; 2ZL1 A; 4FUW A; 1PNE A; 3D9Y A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4CLC C; 3TRC A; 3KX0 X; 1IYP A; 5GLB A; 1C3B A; 1DY6 A; 2QZ6 A; 2ZM8 A; 1ERM A; 2Q0O A; 3UO9 A; 1ES3 A; 3CUE C; 1W8Q A; 4GNU A; 5AVE A; 2XGN A; 1G68 A; 2PYP A; 1L0G A; 1IYO A; 5TBM A; 3ZVW A; 4EUV A; 3GRJ A; 2W3G A; 4BBV A; 4ZTK A; 1P97 A; 5HW3 A; 2VGL S; 1AWI A; 2GX5 A; 5U47 A; 1MKI A; 4KQD A; 4OH0 A; 1VQQ A; 3ULF A; 5CTN A; 5L2F A; 5E2H A; 2LB9 A; 3DBA A; 2R9W A; 3VOL A; 1M40 A; 1LSV A; 3FV7 A; 4MN7 A; 1KGF A; 5M1A A; 5CTM A; 3G4P A; 4DF6 A; 3ZG9 B; 3S7N A; 3LYX A; 2YKF A; 4GW9 A; 1FCO A; 4BJP A; 3AGD A; 3EQV A; 3UPO A; 3HCY A; 4B9O A; 2XD5 A; 3PTE A; 5DFX A; 1L0F A; 4OP8 A; 3OPR A; 4BBT A; 5CED A; 1KOU A; 2OOL A; 5CXW A; 1RCJ A; 5AJG A; 3ZHH A; 2VV8 A; 2XEP A; 1NXY A; 4HQA A; 4HJ6 A; 3GEC A; 2BLS A; 1I2S A; 3UPP A; 4HP4 A; 1P0Z A; 3E98 A; 4E3O A; 2V20 A; 2QMI A; 3BFD A; 3KSH A; 2Y91 A; 3FWL A; 4X69 A; 4CLC B; 4JLF A; 3EQU A; 4IJG A; 5FI6 A; 3EEH A; 2HPB A; 1GHM A; 4WBG A; 1IEM A; 5F83 A; 3BEC A; 2WKQ A; 5DJT A; 3IX4 A; 2BTF P; 4U0X A; 4BLM A; 3Q81 A; 4X56 A; 3UDI A; 2ZMF A; 3F1N A; 3UDF A; 3NEC A; 3GVB A; 3WS0 A; 2XF3 A; 5F1G A; 2WGI A; 2Y2M A; 2HDU A; 4X25 A; 3Q7V B; 5KZH A; 1XP4 A; 1OJ5 A; 4FCF A; 5CER A; 3T50 A; 4EUZ A; 2P9V A; 2OV5 A; 3W4O A; 3W4P A; 2HZ5 A; 4NXG A; 3T1R A; 5F82 A; 2EX6 A; 1RGZ A; 1K4E A; 4K91 A; 3PBO A; 5L07 A; 4X53 A; 5HL1 A; 3LI8 A; 4YOF A; 5EVI C; 4BL3 A; 1DJA A; 4OPR A; 2VEA A; 1MY8 A; 3NY4 A; 4XT2 A; 5DKK A; 4JGP A; 3VOY A; 4Y3I A; 2Q9M A; 3C7V A; 2EFU A; 3JYI A; 3GR2 A; 2WGW A; 4HH3 A; 4WLA A; 2ZQ7 A; 1S67 L; 2JE5 A; 1LSX A; 1LL8 A; 3EOI A; 1W63 Q; 5K5B A; 1DJB A; 1XJ2 A; 2Y2I A; 1YQS A; 2ZQC A; 1GSW A; 3LID A; 4GHI A; 3IH8 A; 2GZA A; 4PAU A; 2HGV A; 2HJ9 C; 3MF0 A; 4FUW A; 2ZC6 B; 2KOI A; 4R23 A; 1EWZ A; 4P6Z M; 4N1X A; 3ZGA B; 3OOV A; 4EQ1 A; 3VSL A; 3MFX A; 1PZO A; 3NUL A; 4MLL A; 2J7V A; 3BQA A; 4O8G A; 1ZG6 A; 2HP5 A; 2JKR I; 4Y2F A; 3SW1 A; 1EW0 A; 3H7W B; 1ES5 A; 1BLH A; 3PBT A; 3S1Y A; 2H10 A; 3IX8 A; 3MMH A; 1FOF A; 2VX8 A; 2J3T D; 1ES4 A; 2QJ5 A; 3ITA A; 4HEF A; 1S0W A; 3UB6 A; 5EVI B; 4L0L A; 2HDR A; 1FR6 A; 3VP2 A; 5KMW A; 3V3S A; 1G6A A; 1K38 A; 4RVA A; 3C8C A; 3PXP A; 1VB6 A; 1CEG A; 4RQ9 A; 4KQR A; 1QME A; 1K57 A; 1LHY A; 5AQA A; 1I2W A; 4KQO A; 1BTL A; 4XXR A; 1BLC A; 2ACG A; 1MWS A; 4RX2 A; 4JGQ A; 3A3J A; 3MR0 A; 1SKF A; 1ESI A; 2A3U A; 3DW0 A; 3N8L A; 3EEA A; 1KE3 A; 3MQO A; 1NWZ A; 2ZQ8 A; 2FZ0 A; 1G6O A; 3IWO A; 1BUL A; 5HWT A; 2ZM2 A; 3FPV A; 2I72 A; 1TS6 A; 3MKF A; 3LEZ A; 3D72 A; 4OLG A; 3LI9 A; 4H8R A; 3C2W A; 3MXQ A; 5F68 A; 1VET A; 4JXS A; 1K56 A; 2WAD A; 2Y2L A; 4GCZ A; 1XKZ A; 4ZRR A; 5DTS A; 4JF4 A; 1CF0 A; 3FG8 A; 3A3D A; 3DWK A; 2XA7 S; 3T1S A; 2WAE A; 4K08 A; 3NDE A; 4PM8 A; 1FR1 A; 5FDH A; 1S1Y A; 2JN7 A; 2IWD A; 5A90 A; 4S2N A; 2W1T A; 5E2G A; 3KSG A; 1U60 A; 3OCN A; 4MMN A; 3DTE A; 5L8M A; 3ZFZ A; 2IWB A; 3WWX A; 3MFD A; 3F1O A; 1ZG4 A; 3AGF A; 3WS4 A; 3NI9 A; 1JTG A; 3S7Q A; 4R0Q A; 4WN5 A; 5GHX A; 3PBN A; 4S2L A; 3WS2 A; 2V8C A; 1T1A A; 1ZTU A; 5GLD A; 5FQK A; 4OOM A; 5DFY A; 3I7J A; 2XRO A; 3F1N B; 2Y79 A; 1Y4O A; 4KZ3 A; 2INW A; 3ICY A; 4RX3 A; 1N9N A; 5F69 A; 2H28 A; 3D4F A; 3QNB A; 2WYX A; 3NOT C; 3LR4 A; 3NHQ A; 1SCW A; 2C6W B; 3UY6 A; 2ZL1 A; 4AFI A; 1DRM A; 2A2L A; 4QPR A; 1G5U A; 4LV1 A; 3JPU A; 4B93 A; 3UE0 A; 2M1C A; 2ZQD A; 3GDI A; 2JKT I; 1KDW A; 4HJ3 A; 1TS8 A; 2FFY A; 5DF8 A; 4DDY A; 3M6H A; 3KYE A; 2HDQ A; 2W0N A; 3NOU C; 4R38 A; 3IF5 A; 3CAX A; 2A24 B; 1AXB A; 5TFQ A; 5M19 A; 2O0Y A; 1EI5 A; 4OPQ A; 2WGW B; 1K55 A; 2G2U A; 4EXO A; 4FSF A; 3IF6 A; 4H6J A; 2EXB A; 4N92 A; 2PYR A; 5TJJ A; 4E6X A; 4N9K A; 1DP8 A; 1YLJ A; 4FOF A; 4DRT A; 2WUQ A; 4LV2 A; 4P87 A; 2PBY A; 4Y0O A; 1TF1 A; 3VP1 A; 4PM9 A; 3EGD C; 4JXV A; 4S2I A; 5HZH A; 3PYP A; 5HPI A; 4GHI B; 1HVB A; 1A0K A; 1XJ6 A; 2O9A A; 4ARZ A; 5CGS A; 1NJ4 A; 5GHY A; 1F98 A; 1DJC A; 4WZ5 C; 4D2O A; 3U2A A; 2PDR A; 1PRQ A; 4P85 A; 1E25 A; 3LEQ A; 2PRF A; 5E43 A; 4CLC D; 1ERQ A; 5A93 A; 2QYB A; 3MZD A; 4UAA A; 5CX7 A; 2GNX A; 1Q2P A; 3BFF A; 5EFW A; 1F9I A; 5HD5 A; 5CHM A; 1ALQ A; 4I3J A; 1BUE A; 1N9L A; 5F6A A; 3MXS A; 3BLS A; 5AQ7 A; 3VOZ A; 3G30 A; 4GZB A; 5DKL A; 3BJN A; 3QHY A; 5CEB A; 2HDS A; 3ZNT A; 3FC7 A; 1SZV A; 3A0R A; 5EV0 A; 3LIC A; 4KG5 A; 2H5S A; 4LLO B; 4O01 A; 4ETX A; 2L4R A; 5FAS A; 2D02 A; 4KZ8 A; 4S2J A; 2KLI A; 4S2K A; 3A0S A; 1OTB A; 2R78 A; 3CG5 A; 2WKR A; 4DE1 A; 4K0X A; 4R3A A; 3R7W B; 3JVV A; 3UE1 A; 1K6R A; 2Y2O A; 1ODV A; 1LT0 A; 2XDM A; 4S2M A; 2WKH A; 4PM7 A; 1FSW A; 4LV0 A; 3VSK A; 1J9M A; 2V0W A; 4ZDX A; 3HVF A; 4Q0J A; 4F3L A; 4JKT A; 2VK3 A; 3Q82 A; 4NXB A; 4GDB A; 3KSF A; 4BEN A; 2VV6 A; 3E4O A; 2CC1 A; 2DMW A; 3UDX A; 3N8R A; 5FI7 A; 2PD8 A; 3BFG A; 4JF6 A; 1VET B; 3C30 A; 2W3H A; 5HD3 A; 4DKI A; 1IYQ A; 2QHK A; 1HZO A; 5FI2 A; 1VEU A; 1N9O A; 3P98 A; 3CI6 A; 1OT6 A; 2H0Y A; 3QNC A; 3PBQ A; 2ZMV A; 2VGJ A; 2R9X A; 1UGU A; 4PPR A; 1ZKJ A; 2XFT A; 2K2N A; 2NUT C; 5GLC A; 1T1C A; 3GMW A; 4O0P A; 4BD0 A; 5IHV A; 1H0M A; 2X02 A; 3D9Y A; 1E4D A; 1YMS A; 2WZX A; 3E4Q A; 1KE4 A; 4UQI M; 1YLY A; 1YLP A; 3LGO A; 5EVL A; 4EES A; 3IH9 A; 1L3L A; 2B5R A; 2B18 A; 2VA0 A; 1SHV A; 2EX8 A; 5EVI D; 4KQQ A; 4Y5F A; 3WS5 A; 1IKG A; 1XGI A; 2VZW A; 2P08 A; 1JNU A; 2M7V A; 3HJK A; 1RGY A; 4GDN A; 4KZ6 A; 4GB7 A; 1GSX A; 3HLF A; 3IS2 A; 3HUO A; 4NET A; 4JGO A; 4U0T A; 3IWQ A; 4LV3 A; 5IS1 A; 1JWP A; 1SDE A; 1UWP X; 5GLA A; 3W8K A; 5AVF A; 3D3O A; 5BOH A; 2PR5 A; 2ZD8 A; 3Q1F A; 3CPT B; 1ES2 A; 3RH8 B; 4G3W A; 3VE3 A; 2O99 A; 2L0W A; 4GD8 A; 4HHD A; 3UME A; 4OKP A; 2ZL1 B; 3DTI A; 5J7E A; 1JWZ A; 2DRW A; 2Q9N A; 3ZDJ A; 3Q07 A; 1FIL A; 2WKP A; 4ZJ1 A; 1W63 M; 5EEC A; 5G4Y A; 4E3I A; 4EBP A; 1MKM A; 3BYD A; 3LY4 A; 3NCK A; 3HLC A; 1NYY A; 2X01 A; 4BQM A; 1TDG A; 1IYS A; 3H82 A; 2IA2 A; 1UWN X; 3E4P A; 3F1P B; 4BD1 A; 2Y2H A; 1TS7 A; 3LIE A; 2JKF A; 4UA9 A; 3VFH A; 3SS3 A; 4MN5 A; 3IXD A; 1W7F A; 1WE4 A; 3BEB A; 5DF9 A; 1GA0 A; 3S4X A; 4KG2 A; 1DP9 A; 3OLO A; 4EBN A; 2NUP C; 3K3D A; 4ARZ B; 1N9B A; 2X71 A; 2Y2P A; 3T4O A; 2XQZ A; 4LEN A; 4C3Q A; 1OTE A; 5HAI A; 3T4Q A; 3UB9 A; 1YT4 A; 1KDS A; 2DNS A; 2ZQA A; 4IHQ A; 2V2F F; 5FAP A; 1S4R A; 2HF6 A; 3OBF A; 5HDS A; 3V50 A; 2DCF A; 1YAX A; 3DAV A; 1T19 A; 1F2K A; 4E3L A; 5MC7 A; 3ZNY A; 2W3F A; 5F1F A; 3G34 A; 3SH8 A; 4OQG A; 3QP2 A; 4PHT A; 1LL5 A; 1HD8 A; 4WM9 A; 1PW8 A; 4Y13 A; 1CK3 A; 2V9A A; 5EPH A; 3TSG A; 4HNB A; 4GD6 A; 4UA6 A; 3PR6 A; 5FL3 A; 4BWI A; 3T4T A; 5EM0 A; 4I5S A; 4PM5 A; 2FH5 A; 3KYQ A; 1G28 A; 3CZD A; 3T12 B; 4R3J A; 5FAQ A; 3A3F A; 4CLC E; 1YLZ A; 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3MZF A; 2GDN A; 1XJ4 A; 1S6R A; 5HAR A; 1XFN A; 2Y59 A; 5E2F A; 1XJ3 A; 2EX9 A; 5J8X A; 4XUX A; 5TGF A; 2V1A A; 1NYM A; 3T4K A; 4CLC A; 1E3U D; 3ZG0 A; 2P9V B; 3DWZ A; 3P09 A; 3G35 A; 1JVJ A; 3PAG A; 5DTT A; 1I5Q A; 4I38 A; 4KZ9 A; 2O9C A; 3B3X A; 5E2E A; 4WEJ A; 2HP9 A; 3H82 B; 3CWF A; 2IWC A; 1IOU A; 3L7H A; 4MBF A; 4XT2 B; 5I5L A; 5TR7 A; 1VHM A; 3HUN A; 4E04 A; 4HIA A; 3RXW A; 3HBR A; 4BL2 A; 4LCM A; 5EOO A; 2JC7 A; 3Q7Z A; 2A49 A; 5C5K A; 2J9P A; 4EWF A; 4OQ0 A; 1V9Z A; 4G3K A; 4P0M A; 4Y7P A; 1K57 C; 3LCE A; 4MN6 A; 4KUK A; 1T1B A; 2Z6D A; 4ID4 A; 4B88 A; 3G32 A; 1FQG A; 3N7W A; 4ZAM A; 1GHI A; 2EX2 A; 3M6B A; 1HLU P; 1MZU A; 3RXX A; 3LO7 A; 1NRJ A; 1CQA A; 2HJE A; 2JKR M; 3T4S A; 1V9Y A; 2FFF B; 1JTD A; 4LGW A; 2Z2L B; 3FYZ A; 1PWG A; 2Y55 A; 3KYZ A; 3TOI A; 3C4O A; 3BRM A; 4NEE D; 4U3T A; 1IFQ A; 4X1M A; 3NDG A; 3S7O A; 1TD5 A; 3ZG7 B; 5EUA A; 1BLS A; 1VM1 A; 4Z9Q A; 4NG2 A; 5AQ9 A; 4KZ4 A; 1YMX A; 3LR5 A; 3CHW P; 2K7S A; 4QHC A; 4S2N C; 2Y2J A; 2K31 A; 4EEP A; 4I39 A; 1XA7 A; 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