The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
132
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structure length |
132
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Chain Sequence |
SWQTYVDEHLMCDIEGTGQHLASAAIFGTDGNVWAKSSSFPEFKPDEINAIIKEFSEPGALAPTGLFLAGAKYMVIQGEPGAVIRGKKGAGGICIKKTGQAMVFGIYEEPVNPGQCNMVVERLGDYLVDQGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural, Functional, and Immunological Characterization of Profilin Panallergens Amb a 8, Art v 4, and Bet v 2.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Profilin
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| molecule tags |
Allergen
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| source organism |
Ambrosia artemisiifolia
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| total genus |
31
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| structure length |
132
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| sequence length |
132
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-11-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Y4O A; 3CPT B; 1FIK A; 2VK3 A; 4ESP A; 4FTX A; 1SZV A; 5EM0 A; 3MS6 A; 5EM1 A; 1CF0 A; 1J3W A; 1AWI A; 5FDS A; 2PAV P; 1HLU P; 2JKF A; 3T1S A; 1G5U A; 2V8F A; 1CJF A; 3T1X A; 3CHW P; 3LGO A; 3T12 B; 3KYE A; 5EVE A; 1PFL A; 4X1L A; 2B95 A; 1YPR A; 3MSH A; 3NUL A; 5FEF A; 2PRF A; 3UB5 P; 2E8J A; 2ACG A; 4X25 A; 3DAV A; 3D9Y A; 3LEQ A; 1K0K A; 2BTF P; 1A0K A; 1VET A; 3U4L P; 1ACF A; 3L9K A; 5FEG A; 3T1R A; 2PBD P; 1Z09 A; 1VEU A; 1PRQ A; 1PNE A; 2JKG A; 2V8C A; 1FIL A; 1D1J A; 3CPT A; 3T1Q B; 4FUW A; 1VET B; 4X1M A; 2HZ5 A; 3NEC A; 3L7H A; 4QWO A; 1F2K A; 1SKO B; 1CQA A; 1VEU B; 4D60 A; 2ZL1 B; 1SKO A; 5EV0 A; 2ZL1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1GA0 A; 4UQI M; 2XDM A; 4KUK A; 2OLV A; 3H7W B; 3KO6 A; 3CZD A; 1MXO A; 3OCL A; 1YLZ A; 3ZDJ A; 3MS6 A; 4BL3 A; 2A49 A; 3CWF A; 2KLI A; 1GCE A; 1DP8 A; 4FOF A; 1D06 A; 2EWV A; 1IKI A; 1PIO A; 3IT9 A; 4P6Z S; 1T19 A; 4DXC A; 2HPB A; 3HLG A; 5EVI C; 4R4R A; 3IBJ A; 4RQ9 A; 3RFB A; 4CPK A; 1JTG A; 4L0L A; 4MLL A; 1S4S A; 2XR0 A; 4BBT A; 1ZG6 A; 5HDS A; 2J8Y A; 3S1Y A; 3OPH A; 5HL1 A; 1LL9 A; 3OC2 A; 5CX7 A; 5KMW A; 3PAE A; 3IWQ A; 1DJA A; 3UNW A; 2XK1 A; 4GNU A; 4Y15 A; 3IBR A; 3SS3 A; 3G34 A; 1YLY A; 4IHQ A; 3ZCZ A; 1XA7 A; 3VOZ A; 1PW8 A; 1OME A; 3N8S A; 4MNR A; 2ZBB A; 3LYX A; 4PM9 A; 2W3F A; 3R4K A; 5KZH A; 2Z6C A; 4JF4 A; 1MZU A; 1PWG A; 3M6H A; 1T1A A; 2PR6 A; 4Y13 A; 4KZ3 A; 2DRW A; 3C30 A; 3BWL A; 4B4X A; 1CI8 A; 4HJ4 A; 2XH9 A; 4JXG A; 3V39 A; 4HY8 A; 2XEP A; 4MMN A; 3F1O A; 3CPT A; 5HAP A; 1N4O A; 2Q0O A; 3TJZ C; 1VET B; 4X1M A; 1MKM A; 4G3K A; 2ZQD A; 4EW7 A; 3Q07 A; 3RH8 B; 3NEC A; 4OOY A; 4DE0 A; 4E3O A; 3A3E A; 3FWL A; 4YFM A; 5EV0 A; 4HHD A; 2HP9 A; 5HAI A; 3UDF A; 3G2Z A; 2ZC3 B; 3IF5 A; 2VX8 A; 4JKT A; 3G4P A; 1NXY A; 4U3T A; 1CF0 A; 2Y91 A; 5K5B A; 1JNU A; 3Q7V A; 3KX0 X; 1H3Q A; 4WZ4 A; 2Y59 A; 5J8X A; 4F3L B; 3H82 B; 3CI6 A; 1LLB A; 1JWP A; 4GW9 A; 4E3L A; 2JKR I; 4WMC A; 1XJ4 A; 4NET A; 1K57 C; 4IED A; 2L1M A; 2J3T C; 3NUL A; 3UPN A; 4XUZ A; 1ODV A; 1PI4 A; 3CG5 A; 4G3V A; 2ZMF A; 2E8J A; 1KGF A; 4KQO A; 3VV4 A; 3QP6 A; 5EVI A; 2WKH A; 4HNB A; 5A8B A; 1V9Y A; 1XJ3 A; 5EE8 A; 3TW8 A; 3DTK A; 3AGD A; 5A92 A; 1HVB A; 2D02 A; 1JVJ A; 1MKI A; 2G2U A; 3C38 A; 2XRO A; 3ITB A; 4S2J A; 3PYP A; 4N9K A; 1S1Z A; 3BQ8 A; 3Q81 A; 1IYO A; 4LV1 A; 5I5L A; 2P9V A; 1BT5 A; 4UEY A; 4F94 A; 2GNX A; 1O7E A; 3LO7 A; 3SW1 A; 2WAD A; 3S7P A; 5F5Y A; 3GQZ A; 2W3G A; 3NI9 A; 4KG2 A; 3IX4 A; 2QPN A; 4PAU A; 1OPX A; 4E3N A; 1KVL A; 3M2J A; 1RGY A; 5E2E A; 1MWR A; 2HDS A; 2A2L A; 5FI7 A; 3LID A; 4JXW A; 3CAX A; 5F6A A; 2W3E A; 4KZB A; 5EEC A; 4NEE D; 5FDS A; 4Q0I A; 2WGI A; 4B88 A; 3EQV A; 1K6S A; 3BQA A; 1WA9 A; 4XT2 A; 1SHV A; 1BSG A; 3FPW A; 1DJB A; 1P9W A; 4LLO B; 4IUK A; 3BJN A; 5DJT A; 5FI2 A; 4P85 A; 4IBX A; 3BFG A; 4IUH A; 2EXB A; 4OPZ A; 2O0Y A; 4GD8 A; 1GHP A; 2IWC A; 2KOI A; 4MEZ A; 2HJ9 C; 2XSS A; 1NZO A; 3LUQ A; 4KZ4 A; 1NY0 A; 1OJG A; 1M40 A; 1PWC A; 3ZYT A; 4OVD A; 5EVI B; 4KUO A; 4JF5 A; 1KE0 A; 2QHK A; 4KQQ A; 2ZM2 A; 4LPZ A; 1JWV A; 1ZTU A; 3NDE A; 1K25 A; 2Q9N A; 3W4P A; 1OJ5 A; 3T1R A; 1K57 A; 2PBD P; 1LI9 A; 3OPP A; 4R23 A; 2ZQ7 A; 3UDI A; 4BD1 A; 4OON A; 4GD6 A; 4JGQ A; 5AQ9 A; 1LT0 A; 2P9V B; 2JBF A; 4MBH A; 5L07 A; 4O0P A; 2PYP A; 3N6I A; 4KZ8 A; 2XRN A; 3ICY A; 2ZJ9 A; 2VEA A; 2O9B A; 4BMW A; 1BLC A; 4HES A; 5I94 A; 1CQA A; 5CEB A; 5FQI A; 1OT6 A; 4KZA A; 4WBG A; 3A3I A; 5F1F A; 3FZC A; 1M6K A; 4OKP A; 4PKY A; 1KOU A; 4AFI A; 3EGD C; 4E6X A; 1TDL A; 1K55 C; 4PM6 A; 4D2O A; 1ERO A; 3M6B A; 4IJG A; 2O9A A; 1TVF A; 4GB7 A; 3LY4 A; 4XT2 B; 2X01 A; 5HAQ A; 1FOF A; 3BRM A; 3VOY A; 4L9E A; 1L0E A; 4I39 A; 3G32 A; 4OOM A; 1E3U D; 2NUT C; 2Y2I A; 2HP5 A; 4HJ3 A; 4S2O A; 2A3U A; 3GR2 A; 1NYY A; 3EWK A; 3HLB A; 1NWZ A; 5CHJ A; 2PRF A; 2PHY A; 4LRX C; 4EXO A; 1EWZ A; 2I72 A; 1IOU A; 5DTK A; 5CHU A; 4RA7 A; 2P74 A; 1GHI A; 1NJ4 A; 1YKD A; 2PYR A; 3D9Y A; 4DJ2 A; 3U4L P; 3E0Y A; 5IU1 A; 3TOI A; 2W3H A; 1CI9 A; 3V3R A; 3R7W A; 2FH5 A; 3UB7 A; 4R3A A; 5DTS A; 1S4R A; 2V8C A; 4WEL A; 4R6L A; 3ZG7 B; 2VV6 A; 2OLU A; 1TS7 A; 3MFX A; 1BUL A; 1XJ2 A; 3KSH A; 1KGG A; 3VP0 A; 1PZP A; 3DWK A; 4FCF A; 4K0W A; 3LR5 A; 4CLC C; 2VGJ A; 5FQM A; 3IX3 A; 3UE1 A; 4EV4 A; 4DE3 A; 5E2F A; 3C7V A; 2O99 A; 3B33 A; 5FAQ A; 1KDS A; 3LIC A; 1YSP A; 4Y0T A; 4R4S A; 5KSH A; 4EU0 A; 4M4X A; 3PBQ A; 3N4I A; 1STZ A; 1OTA A; 4KQR A; 1YLT A; 4GCZ A; 2H5S A; 4EBN A; 3DBA A; 3GEC A; 4GZB A; 1K55 A; 3HLE A; 3C7U A; 3DW0 A; 3HLD A; 4FSF A; 3ZGA B; 3CLO A; 3DAV A; 3LEQ A; 5G4Y A; 3P09 A; 2WAF A; 4QB8 A; 2BTF P; 3R7W B; 2ZQC A; 3VP1 A; 4P87 A; 3BY9 A; 1YM1 A; 1TD5 A; 4M3K A; 3T4J A; 2BG1 A; 4QD4 A; 4S2K A; 3TRC A; 1F5M A; 4HJ6 A; 1YAX A; 3D4F A; 3CJM A; 1OTI A; 3B3X A; 1OTB A; 2YKF A; 1H8Z A; 4E3M A; 4OQ0 A; 2HDQ A; 1UWP X; 4YOF A; 4OP8 A; 3CMZ A; 2PD8 A; 2W27 A; 3NIA A; 5E2G A; 2WKP A; 2JKF A; 1T18 A; 3N8L A; 1S6R A; 5HD3 A; 2VKS A; 1LL5 A; 1XXM A; 3MQ0 A; 3UE3 A; 5A91 A; 5AJG A; 5M1A A; 5EVE A; 4CLC A; 2C5W B; 5IHV A; 2V20 A; 4BQM A; 1XFQ A; 4YNR A; 2JN7 A; 3HL9 A; 4U0T A; 5FEF A; 4Y0O A; 4BBV A; 3OCN A; 1K56 D; 2Y2Q A; 3IH8 A; 3E98 A; 1N9L A; 1FQG A; 4PPR A; 3FKV A; 3LIA A; 1K0K A; 1MWT A; 4MBF A; 4DE2 A; 2VGL M; 4BLM A; 4JXS A; 4Y7P A; 2H0Y A; 3ZHH A; 3VFF A; 1SCW A; 3QP1 A; 3JPU A; 2JE5 A; 4B93 A; 1BLH A; 4H6J A; 1PNE A; 1NYM A; 4FH4 A; 4EEU A; 2X02 A; 3S7O A; 4LRZ E; 1FSW A; 5L2F A; 1SDE A; 5TR7 A; 3MR0 A; 3EEA A; 4I5S A; 1ES4 A; 5CXW A; 1ONG A; 4ZRR A; 3W8K A; 3MKF A; 3PTE A; 3H9W A; 2EA9 A; 4JPM A; 1ES3 A; 1HD8 A; 2IWD A; 1TDG A; 4GHI A; 4ESP A; 2IWB A; 5CEC A; 4WZ5 C; 2H0T A; 4KQD A; 5MC7 A; 4KZ5 A; 2XD5 A; 3AGF A; 1BZA A; 2WAE A; 1W7F A; 2ZM8 A; 4K91 A; 1DJC A; 5HWW A; 3MKE A; 4NXB A; 3MFD A; 4CLC B; 4ZBE A; 3T4L A; 3S22 A; 3LR3 A; 2GDN A; 1YPR A; 2ZC5 B; 3MMH A; 5FAO A; 1TS8 A; 1JTD A; 4K0X A; 1ONH A; 2FFF B; 1TS6 A; 4RX2 A; 3UB6 A; 4LV2 A; 2W1R A; 4X53 A; 4JBF A; 5FQK A; 3KSF A; 5J3W A; 2X71 A; 3UMD A; 1PWD A; 4H6J B; 3T4O A; 3GMW A; 2OSU A; 4KG6 A; 2RL3 A; 3UB9 A; 1W63 M; 1IYP A; 4OPY A; 4L9F A; 2I9V A; 4OQH A; 3GTC A; 1KE4 A; 2EX8 A; 1TEM A; 4X6T A; 1YLJ A; 4WN5 A; 5D3O A; 4ZTK A; 3VP4 A; 4O8G A; 3L7H A; 3PBR A; 4D60 A; 5C5K A; 3ZG5 A; 4GHI B; 3F1O B; 4OPQ A; 3CPT B; 4B9O A; 1FSY A; 3KYQ A; 2QKP A; 4ME4 A; 4EES A; 3MXQ A; 3ZFZ A; 4EBL A; 4EBP A; 4LEN A; 2V8F A; 3S7N A; 1I2S A; 5AQ7 A; 5M19 A; 1T1C A; 3IXH A; 3T1X A; 3M2K A; 4GS9 A; 2LB9 A; 3KYE A; 4X69 A; 3RJU A; 5HAR A; 2J3W A; 1PFL A; 3SZT A; 3O3V A; 1DY6 A; 3Q7V B; 5HX9 A; 4WZ5 A; 2Y2L A; 4I3A A; 4PM7 A; 1YLP A; 1G6A A; 1SKF A; 1OT9 A; 3UME A; 3WRT A; 1XJ6 A; 3E2L A; 4CQH A; 4R1G A; 3O5Y A; 2FZ0 A; 3BFC A; 5CTM A; 3HUO A; 4GDB A; 4WYY A; 3OZH A; 4BBU A; 1Z09 A; 2VGL S; 2Y79 A; 4R3J A; 1P9R A; 1PRQ A; 3PBT A; 4Y5F A; 1ERQ A; 1F98 A; 3ZNT A; 2J9O A; 3T1Q B; 5CRF A; 1ZC2 A; 1BLS A; 3HUN A; 2P04 A; 2ZQ9 A; 2EX9 A; 4EET B; 1ZHH B; 1U60 A; 2J3T D; 3LFV A; 4QWO A; 5HDC A; 1XP4 A; 3A0V A; 4RYE A; 5EUA A; 2QJ5 A; 3ZG0 A; 3WS4 A; 3S7Q A; 3MZE A; 4WF0 A; 2Y2J A; 3HJI A; 1DP6 A; 3ZG8 B; 4X68 A; 2ZMV A; 2EX2 A; 5FI6 A; 5EOE A; 4WEK A; 1AWI A; 2ZC4 B; 2PAV P; 3W2Z A; 1KGE A; 1XGJ A; 2KX6 A; 2XLN A; 1GSX A; 1PW1 A; 4GJ4 A; 4DJ3 A; 2OV5 A; 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4E3I A; 3CUE C; 2R78 A; 5G18 A; 3QHY A; 2XQZ A; 4KG5 A; 4S2I A; 3NOT C; 4R0Q A; 5E2H A; 1A0K A; 5E43 A; 1BUE A; 1S0W A; 3O88 A; 3HVF A; 2L4R A; 3JVV A; 1H0M A; 2QJ7 A; 4OQI A; 4GOG A; 3MZF A; 1D1J A; 4ZJ1 A; 4R70 A; 4ETZ A; 1DRM A; 5LBR A; 3T4S A; 2WKQ A; 3ISG A; 3JVU A; 2VJW A; 3BLM A; 3JYI A; 3IHA A; 4C75 A; 2H28 A; 2WGV A; 1NRF A; 3SS4 A; 3NJA A; 2WGW B; 4PMA A; 1F2K A; 1SKO B; 2XA7 M; 1FCO A; 1IKG A; 5JYP A; 3WS5 A; 3IF6 C; 3K3D A; 2ZL1 A; 5J7E A; 2GJ3 A; 3FV7 A; 4JXV A; 4NXF A; 1GSW A; 3IXD A; 5FQJ A; 3O87 A; 3W4Q A; 3ITA A; 1ESI A; 2M1C A; 3ULF A; 4XXR A; 5AVE A; 2B18 A; 3E4P A; 2LB5 A; 4RVA A; 2D01 A; 1RP5 A; 3CHW P; 3LGO A; 3V5M A; 5FQQ A; 3UE0 A; 3OOV A; 1N9B A; 3G30 A; 2JKT M; 3EOI A; 3D3O A; 1L0D A; 3GSG A; 2OAP 1; 2VV7 A; 1N9N A; 3MBZ A; 4N92 A; 5CED A; 4MCW A; 3CIT A; 2Y2H A; 3UN7 A; 4JGO A; 4CLC D; 4HH2 A; 3ZVW A; 1XFN A; 4GKU A; 4PHT A; 4OQG A; 2CC1 A; 1VET A; 5FEG A; 1XPB A; 4JF6 A; 4FH2 A; 5TJJ A; 4S2M A; 3HLW A; 1O07 A; 1LHY A; 2WZX A; 2JCH A; 1K4E A; 2B5R A; 1FIL A; 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