The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
35
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sequence length |
134
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structure length |
133
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Chain Sequence |
SGSWQTYVDDHLMDIEGTGQHLTSAAIFGTDGTVWAKSASFPEFKPNEIDAIIKEFNEAGQLAPTGLFLGGAKYMVIQGEAGAVIRGKKGAGGICIKKTGQAMVFGIYDEPVAPGQCNMVVERLGDYLLDQGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural, Functional, and Immunological Characterization of Profilin Panallergens Amb a 8, Art v 4, and Bet v 2.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Allergen
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| source organism |
Artemisia vulgaris
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| molecule keywords |
Pollen allergen Art v 4.01
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| total genus |
35
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| structure length |
133
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| sequence length |
134
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-11-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4X1L A; 1SKO A; 3MS6 A; 2ZL1 A; 5EVE A; 5FEG A; 3CHW P; 2JKG A; 3LGO A; 3NEC A; 1YPR A; 3U4L P; 1PFL A; 1A0K A; 3DAV A; 1K0K A; 2V8C A; 4ESP A; 3T1S A; 1ACF A; 1SZV A; 2ACG A; 1PNE A; 1AWI A; 1CF0 A; 3T1Q B; 1VET B; 1F2K A; 3D9Y A; 3UB5 P; 1Z09 A; 1VET A; 4FUW A; 2B95 A; 4QWO A; 1CJF A; 3CPT B; 1Y4O A; 2VK3 A; 3L7H A; 3CPT A; 4D60 A; 1FIL A; 3NUL A; 2BTF P; 2V8F A; 2PAV P; 5FDS A; 2PBD P; 1J3W A; 1FIK A; 2PRF A; 5FEF A; 2E8J A; 3T1X A; 1CQA A; 3MSH A; 5EM0 A; 4X25 A; 3T12 B; 5EV0 A; 3LEQ A; 1VEU B; 1D1J A; 1HLU P; 2JKF A; 3T1R A; 1G5U A; 1SKO B; 2ZL1 B; 1PRQ A; 3L9K A; 5EM1 A; 4FTX A; 3KYE A; 1VEU A; 2HZ5 A; 4X1M A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3N6I A; 4KZ9 A; 3UMD A; 4G3W A; 4OQI A; 5HDD A; 4PPR A; 3ULF A; 2FFY A; 4ID4 A; 1N9L A; 5J3W A; 3WS5 A; 1H3Q A; 5AQA A; 2XRO A; 4ZJ2 A; 4JKT A; 4EEU A; 2J8Y A; 1XGJ A; 3ZGA B; 2ZC4 B; 4WUJ A; 1CK3 A; 1PNE A; 1C3B A; 1S6R A; 2P04 A; 4BEN A; 4LRY C; 1PI5 A; 4KZB A; 4OVD A; 4BBV A; 5GLA A; 2UV0 E; 3MBZ A; 1JWZ A; 1YLY A; 4I3A A; 3LR3 A; 2EFU A; 2HDR A; 3HCY A; 3V67 A; 2XFS A; 2XDM A; 1H5X A; 2O9A A; 4ETX A; 1K55 C; 2V0U A; 5FI2 A; 3FPV A; 1KE0 A; 1BUE A; 2ZQ7 A; 5CTN A; 3EGX C; 1G68 A; 3F1N A; 2Y2N A; 2K7S A; 4N9L A; 2Z6D A; 4BD0 A; 3UPP A; 1L0G A; 3IHB A; 3HLE A; 5FDS A; 2V1Z A; 4ZJ3 A; 2J9P A; 2W0N A; 3VE4 A; 4ARZ A; 1MWS A; 5CHU A; 5L10 A; 4AFI A; 1LL9 A; 2PU2 A; 1PZO A; 2VV6 A; 4Z1W A; 1ONH A; 2V1A A; 3HBR A; 1LI0 A; 4KG5 A; 1YQS A; 1PW8 A; 4K0X A; 1YT4 A; 3C7V A; 4MBH A; 4K0W A; 4IED A; 2WGI A; 5EM1 A; 4UQI S; 4FTX A; 3G32 A; 5FQM A; 4O7D A; 5FQQ A; 2EFX A; 1DP8 A; 2J7V A; 2QJ7 A; 4N1X A; 2JKG A; 4L9F A; 4Y2F A; 4JF5 A; 4QB8 A; 5JYO A; 3SOI A; 1XJ6 A; 1PWG A; 4ESP A; 2JBF A; 2ZC5 B; 5U47 A; 2PT7 A; 4FCF A; 5I5L A; 2O0Y A; 5HDS A; 1NYM A; 2DMW A; 4IUH A; 1Y28 A; 2CMN A; 5EFW A; 3E4Q A; 4HI4 A; 3N8L A; 5G4Y A; 4QWO A; 1NRJ A; 2V0W A; 4Q8I A; 3UY6 A; 4Y5F A; 3BQ8 A; 1W63 M; 4B88 A; 5IT5 A; 1IEM A; 3AGF A; 4WLA A; 1NJ4 A; 3HJK A; 2PAV P; 3BY9 A; 4MN7 A; 3JYI A; 4Y3I A; 1BLC A; 1DP6 A; 5IS1 A; 1DP9 A; 1Z6F A; 3A3D A; 3T1X A; 1CQA A; 4GZB A; 4PM9 A; 1BZA A; 3IS2 B; 4ZDX A; 2VX8 A; 3CJM A; 1XKZ A; 4S2L A; 1WA9 A; 3UNW A; 5CHM A; 2BAS A; 5FI6 A; 2KX6 A; 4Y0O A; 3HJI A; 3ZG9 B; 5F1G A; 1IFQ A; 1OPX A; 3BM6 A; 3W4Q A; 3EWK A; 4LLO B; 3EEA A; 3MXS A; 2OOL A; 4WL9 A; 4JBF A; 2ZOH A; 2XF3 A; 5F5Y A; 3IBJ A; 3HUM A; 4KZ8 A; 4OP5 A; 5FAO A; 3T1S A; 3CLO A; 1OME A; 3LIA A; 3VP3 A; 4NET A; 1AWI A; 4B4X A; 1ES5 A; 3TOI A; 4FH4 A; 2EX2 A; 4ETZ A; 2JCH A; 4DMZ A; 1ERQ A; 2XK1 A; 4HBT A; 3BY8 A; 4LRX C; 4DE1 A; 1IOU A; 2RCX A; 1EWZ A; 3UB5 P; 3JVU A; 4EV4 A; 4P0M A; 3QP8 A; 1TS8 A; 4E3I A; 1W79 A; 3EEH A; 5M19 A; 2XLN A; 2VK3 A; 2Y8H A; 1GHI A; 4Y17 A; 2R9W A; 5HWV A; 5GHY A; 3DWZ A; 2VZW A; 3L7H A; 3HLB A; 2WKP A; 1VM1 A; 3W8K A; 4R23 A; 2HV1 A; 4ZRR A; 1S0W A; 2XD5 A; 1I2S A; 1T1B A; 3VP2 A; 4DN0 A; 2WK0 A; 1MWT A; 2GZA A; 4Q0J A; 3LIC A; 1P9R A; 3MQ0 A; 4OLG A; 3R7W B; 5EV0 A; 3T4O A; 4EW7 A; 2JKT I; 3OCN A; 1VHM A; 1KE3 A; 4HJ6 A; 1CEF A; 2WKR A; 5K5B A; 1P0Z A; 3IS2 A; 5FA7 A; 4H8R A; 3MR0 A; 4CLC E; 2HP5 A; 1LL5 A; 4R70 A; 2FH5 A; 4BBT A; 4LV0 A; 5FI7 A; 5DVA A; 4I3I A; 4HNB A; 4D2O A; 4EWF A; 4KZ6 A; 1RCJ A; 3TG9 A; 1FQG A; 2L0W A; 3PR6 A; 2UWX A; 5C5K A; 1A0K A; 4WZ5 C; 4B4Z A; 3BFC A; 2Q9N A; 4OPR A; 3BEB A; 3NCK A; 4U3T A; 4KUO A; 4K91 A; 2XSS A; 1TDG A; 3NHQ A; 4NXF A; 5EPH A; 2ZMA A; 1NLY A; 3S7Q A; 4CPK A; 3MFX A; 2EX9 A; 3ZG5 A; 5AVE A; 3RXW A; 3G31 A; 2PYP A; 1ERO A; 2J3T C; 3P01 A; 5CEC A; 3C4O A; 2P7J A; 2WGV A; 3BFG A; 4OQG A; 4X69 A; 3C38 A; 4KG2 A; 4E3N A; 3Q1F A; 4Y0T A; 2B02 A; 2EWV A; 3JVV A; 3PAE A; 4A5R A; 3ZFZ A; 4JGQ A; 3IWQ A; 5AQB A; 3EOI A; 3LR0 A; 4OP8 A; 2JKR I; 1JTD A; 2JKR M; 2YKH A; 5I94 A; 3OPR A; 1FIK A; 3HLC A; 4QHC A; 2ZC3 B; 2HPB A; 1V9Y A; 4GD8 A; 4Y15 A; 4OLD A; 4R3J A; 4EBN A; 4XUX A; 4EEP A; 5CGS A; 1T1A A; 2OWJ A; 4EER A; 3MFD A; 3LIE A; 3PBQ A; 3R7W A; 1P97 A; 3BW6 A; 3V3R A; 2FFF B; 1JWV A; 5CEB A; 3NOP C; 4Y0U A; 4IBR A; 1KOU A; 4S2M A; 4NEE D; 4OQ0 A; 2WKE A; 3IX4 A; 3FZC A; 3HUN A; 3LGO A; 3HVF A; 2Y2L A; 3IBR A; 1K25 A; 5AQ7 A; 4MEZ A; 2ZBB A; 4GB7 A; 2Y2I A; 2X01 A; 2X71 A; 3ZDJ A; 3VP1 A; 4JF4 A; 3E4P A; 5EVL A; 5L07 A; 5E2F A; 3BRM A; 4LFU A; 4JXW A; 1PYY A; 3O5Y A; 3VOZ A; 2GJ3 A; 4IHQ A; 3P7N A; 2I72 A; 2OAQ 1; 3CG5 A; 3LCE A; 2ZMF A; 3NOU C; 2Y91 A; 2FZ0 A; 5EE8 A; 3V5M A; 1HTZ A; 3VOY A; 2V9A A; 2ZQA A; 4N1H A; 2A3U A; 4HJ4 A; 2VGL S; 3ZNT A; 2HDS A; 4FOF A; 1SCW A; 5BOH A; 1CI8 A; 1T1C A; 3QP5 A; 2PD7 A; 4PAU A; 4YIN A; 3I7J A; 5DKL A; 1GHP A; 2A2L A; 4R3A A; 3MKE A; 2XGN A; 3B47 A; 3T12 B; 4I38 A; 2VLG A; 4QPR A; 4XUZ A; 4I5S A; 1F9I A; 1ESI A; 1SHV A; 5EVI C; 5F69 A; 1STZ A; 4N9K A; 1S66 L; 1M40 A; 4YFM A; 1PW1 A; 4DE2 A; 4GW9 A; 1J9M A; 4IUK A; 3NJA A; 1FCM A; 1H0M A; 5DKK A; 4O0P A; 1ONG A; 5HD3 A; 4E3M A; 1M6K A; 2OLV A; 3CWF A; 3EQV A; 4PM5 A; 2A24 A; 2E8I A; 3NEC A; 5CGX A; 5GLC A; 3CI6 A; 3IX3 A; 5E2G A; 3ZVT A; 2HF6 A; 2W3E A; 2PDR A; 5DJT A; 4HH3 A; 4R38 A; 4EXO A; 4M4X A; 1K55 A; 4B93 A; 4X6T A; 3ZHH A; 5KMW A; 4ZJ1 A; 1TD5 A; 3DTM A; 2XD1 A; 3IF5 A; 4RQ9 A; 1H8M A; 4UA7 A; 2XEP A; 4HY8 A; 1W63 Q; 3A3I A; 2XQZ A; 5FL3 A; 4YNR A; 3V3S A; 2Z2L B; 5L09 A; 3UB9 A; 1GA9 A; 4S2P A; 5HL6 A; 4ZTK A; 1BT5 A; 3Q7V B; 5MC7 A; 4FH2 A; 1EW0 A; 3B42 A; 3HL9 A; 1YKD A; 4LCL A; 2GNX A; 2KOI A; 2PD8 A; 4U0X A; 1PI4 A; 3A0R A; 1Q2P A; 3IWO A; 2J80 A; 4BL2 A; 2KDK A; 4CLC C; 2ZC6 B; 1DJB A; 1F98 A; 4Y7P A; 1LSV A; 1N9O A; 1MKM A; 2J3W A; 3FG8 A; 2Y2M A; 1GHM A; 2ZL1 B; 3CIT A; 3DWK A; 2C6W B; 4K08 A; 3UO9 A; 3PHY A; 5EVE A; 1FSY A; 3H7W B; 1IYO A; 2INW A; 1SDN A; 2XA7 M; 4PM7 A; 1PFL A; 4P6Z S; 3M6H A; 3BLS A; 4WEJ A; 2V8C A; 3T4L A; 1E25 A; 4MN5 A; 4DJ2 A; 3SW1 A; 3TE8 A; 1N9B A; 4IJG A; 3ZG8 B; 3ZQ5 A; 3PTE A; 1F2K A; 3BEC A; 1K4E A; 1XJ2 A; 3TSG A; 1LLB A; 3MZF A; 4FUW A; 4Q0H A; 4OON A; 5FQ9 A; 2LB5 A; 5F6A A; 3ISG A; 2Y2O A; 3G2Z A; 1PIO A; 5EUA A; 4UEY A; 5TJJ A; 4R6L A; 3CUE C; 5CHJ A; 3KO6 A; 4PKY A; 2WKH A; 3BQA A; 3Q7V A; 3HLG A; 4JXG A; 3NOT C; 2PRF A; 3UE0 A; 3WRT A; 3MSH A; 1GA0 A; 1UWN X; 5CXW A; 1FSW A; 2VA0 A; 1VEU B; 4GDB A; 3T4Q A; 5TFQ A; 2PR5 A; 3GV9 A; 4L9G A; 3K3D A; 1SKO B; 5DJU A; 2JE5 A; 5CER A; 1ESU A; 5AVF A; 3FC7 A; 3TW8 A; 4MBF A; 3F1O B; 1K56 A; 2HP6 A; 4S2I A; 2A49 A; 4L0L A; 1MWU A; 4OOY A; 3WWX A; 1RP5 A; 3ZNY A; 1U60 A; 3UDF A; 3O87 A; 2ZL1 A; 4RYE A; 3RJU A; 3W4O A; 3CHW P; 2EA9 A; 5AJG A; 4MN6 A; 4GDN A; 4OOL A; 1NRF A; 3CMZ A; 1YPR A; 3MZE A; 1ZC2 A; 3WS1 A; 5KSC A; 4P87 A; 4JLF A; 3H7W A; 4YWZ A; 3MJQ A; 4OPQ A; 5HPF A; 3IF6 C; 3PYP A; 4QY5 A; 1GCE A; 5FQI A; 1ZG4 A; 3B33 A; 1I2W A; 1NY0 A; 1MKI A; 4R1G A; 1MC0 A; 4S2O A; 1YLJ A; 5AQ9 A; 4E6W A; 3BFD A; 3FYZ A; 2QYB A; 1W8Y A; 1XPB A; 1Y54 A; 2VGJ A; 2XH9 A; 3CPT B; 3S1Y A; 2PYR A; 3SS4 A; 1K6S A; 4KQO A; 3PBS A; 2ZMV A; 4D60 A; 4EQ1 A; 3JPU A; 4JGP A; 2PBD P; 4RX3 A; 4PM6 A; 1ZHH B; 5FAP A; 4BBU A; 1K56 D; 1WYB A; 3LR4 A; 2R78 A; 2H0T A; 1KGF A; 1DY6 A; 1G6O A; 4ME4 A; 4HHD A; 4EQI A; 4KQR A; 1YM1 A; 1D1J A; 1G28 A; 4DXB A; 3S7O A; 3UE6 A; 4E3J A; 3G2Y A; 4I3J A; 4HES A; 3L9K A; 3MXQ A; 4BJP A; 4NXE A; 3S7N A; 3KYE A; 1VEU A; 2HZ5 A; 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4H6J A; 3D9Y A; 2QWS A; 3UPO A; 2DCF A; 1ZTU A; 1TVF A; 3IXH A; 1FOF A; 3OZH A; 4KG6 A; 3Q07 A; 4N92 A; 1XFQ A; 2ZQ8 A; 4KQQ A; 2Y2J A; 4XT2 B; 1K38 A; 2VV7 A; 4C3Q A; 1K54 C; 3IH8 A; 2IA2 A; 3IX8 A; 2C5W B; 1TDL A; 3G34 A; 4KZ5 A; 3VFF A; 3E0Y A; 3AGE A; 4UA6 A; 2H5S A; 3W4P A; 3CZD A; 3G6O A; 3FKV A; 1J3W A; 1FCO A; 2V20 A; 1JNU A; 2L1M A; 2P9V A; 5J8X A; 3ZCZ A; 3OBF A; 1LI9 A; 2D01 A; 1ES2 A; 2W27 A; 2V2F F; 3UE1 A; 3K2N A; 2JKF A; 3F1P A; 4MMN A; 2PR6 A; 1T19 A; 3S22 A; 1OTE A; 3UDI A; 4WYY A; 1IKI A; 4X56 A; 1XJ4 A; 3D3O A; 4KZ4 A; 3B3X A; 2VJW A; 3VSL A; 4II7 A; 3PAG A; 3GMW A; 5HWT A; 1UWP X; 1XX2 A; 1YLT A; 1L0E A; 3G30 A; 1IYS A; 3IH9 A; 3U4L P; 3VSK A; 1ES3 A; 1L3L A; 1RGZ A; 3DAV A; 4EU0 A; 1LHY A; 1PWD A; 3KYZ A; 4JGR A; 1LT0 A; 2ZM0 A; 1K6R A; 3LI8 A; 4C6Y A; 4KZA A; 3SH7 A; 4WEL A; 3SZT A; 1CF0 A; 1UGU A; 3T1Q B; 3IHA A; 2VGK A; 5G18 A; 1OTA A; 4O01 A; 4C75 A; 4Y13 A; 3FV7 A; 5EVI D; 1KDS A; 2Y2Q A; 4BL3 A; 4KEN B; 4CLC A; 2ZQD A; 2LB9 A; 3GVB A; 1AXB A; 4LCM A; 5J4E A; 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