The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
35
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sequence length |
134
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structure length |
133
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Chain Sequence |
SGSWQTYVDDHLMDIEGTGQHLTSAAIFGTDGTVWAKSASFPEFKPNEIDAIIKEFNEAGQLAPTGLFLGGAKYMVIQGEAGAVIRGKKGAGGICIKKTGQAMVFGIYDEPVAPGQCNMVVERLGDYLLDQGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Allergen
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| molecule keywords |
Pollen allergen Art v 4.01
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| publication title |
Structural, Functional, and Immunological Characterization of Profilin Panallergens Amb a 8, Art v 4, and Bet v 2.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Artemisia vulgaris
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| total genus |
35
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| structure length |
133
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| sequence length |
134
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-11-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1FIK A; 3T1R A; 1FIL A; 1SZV A; 3CPT A; 1VET B; 4FUW A; 1SKO B; 1G5U A; 1PFL A; 2ACG A; 2BTF P; 1Y4O A; 3T1S A; 1J3W A; 2V8F A; 2PBD P; 3T1Q B; 3DAV A; 3T12 B; 1Z09 A; 3MSH A; 1PRQ A; 1HLU P; 1VET A; 2HZ5 A; 1CQA A; 4X1M A; 1SKO A; 5FEF A; 1A0K A; 4ESP A; 2PAV P; 3U4L P; 2B95 A; 3NUL A; 1CF0 A; 5EV0 A; 3MS6 A; 5EM0 A; 1ACF A; 2ZL1 B; 4X1L A; 1F2K A; 5EM1 A; 1VEU B; 1K0K A; 3LEQ A; 3T1X A; 4X25 A; 3NEC A; 5FEG A; 4D60 A; 3CHW P; 3L9K A; 3CPT B; 5FDS A; 4FTX A; 2E8J A; 3L7H A; 2JKG A; 1CJF A; 5EVE A; 1YPR A; 3UB5 P; 2VK3 A; 2PRF A; 2ZL1 A; 1D1J A; 1AWI A; 1VEU A; 3KYE A; 3LGO A; 2V8C A; 3D9Y A; 1PNE A; 2JKF A; 4QWO A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4WEL A; 3C4P A; 4I3J A; 1ESU A; 5DF8 A; 1TS0 A; 5F1G A; 4O0P A; 5GHX A; 2ZMF A; 4MN6 A; 3PAG A; 1WE4 A; 1K4E A; 4Y3I A; 3WRZ A; 3VOZ A; 1KVL A; 1OPX A; 3NI9 A; 3UNW A; 3E2L A; 3MSH A; 5L07 A; 3IH8 A; 5BOH A; 2Y55 A; 1L0G A; 1F5M A; 4X1M A; 3A3D A; 4P85 A; 5DJU A; 3M2J A; 2H5S A; 4ESP A; 3RTY A; 4R0Q A; 4P0M A; 2B95 A; 3GTC A; 1PYY A; 3H82 B; 3TRC A; 4PM9 A; 3MMH A; 4N9L A; 4Y15 A; 2R9W A; 4UAA A; 3EOI A; 2PDR A; 1BSG A; 4QY6 A; 3HLG A; 1GSW A; 3Q81 A; 3NEC A; 1Y28 A; 3VE3 A; 5HL1 A; 1CI8 A; 3CIT A; 2EFU A; 4H6J B; 4FOF A; 2W1R A; 3B42 A; 4S2N C; 5EFW A; 3MZF A; 4IUH A; 4HQA A; 4R3B A; 5CRF A; 2XA7 M; 3SZT A; 1WYC A; 2HJE A; 3G2Z A; 5L2F A; 4EBN A; 1DP9 A; 1S1Z A; 2V8C A; 3CAX A; 1S66 L; 2W0N A; 2W3G A; 1W63 Q; 3OPH A; 3SH9 A; 3HJK A; 1ALQ A; 4CLC A; 1FIK A; 3IXH A; 3JVU A; 4UHU A; 4EXO A; 2VV7 A; 2DRW A; 5A91 A; 2JKR M; 1ERO A; 4OQH A; 1RCJ A; 3RXW A; 1P9W A; 2X02 A; 1YLJ A; 3LCE A; 3OPP A; 3W8K A; 1NRJ A; 3BJN A; 1FR1 A; 5AJG A; 3HLE A; 2WAE A; 4HP4 A; 3UPN A; 5FAT A; 4X6T A; 3O87 A; 4WUJ A; 4PAU A; 3S22 A; 2VX8 A; 3PBT A; 3G32 A; 4NK3 A; 2ZC3 B; 1TS6 A; 4BBU A; 4WM9 A; 5HDC A; 2D02 A; 2ZOI A; 5KMW A; 4N92 A; 4X53 A; 3FZC A; 5GLD A; 5J4E A; 4KZ5 A; 4K08 A; 4I5S A; 2I9V A; 2VV8 A; 4JXV A; 4WMC D; 5GL9 A; 4FH4 A; 1XPB A; 5F83 A; 5DFY A; 3MXQ A; 2XD5 A; 2O9A A; 3Q1F A; 1N4O A; 3IXB A; 5DVA A; 1MWR A; 1PWG A; 4NXB A; 4OH0 A; 1YLY A; 5HL6 A; 3BLS A; 3LIA A; 4N1H A; 4ETZ A; 1TDG A; 5E2G A; 2EX6 A; 5DTK A; 5JYO A; 3BRM A; 5E43 A; 5CGS A; 2JKF A; 4R3A A; 2L0W A; 2OWJ A; 4NG2 A; 3WWX A; 1ZC2 A; 1CEG A; 4MDZ A; 3QP6 A; 3V67 A; 1XGJ A; 2HGV A; 5JYP A; 1ZKJ A; 1GSV A; 2DCF A; 4R3J A; 1T1C A; 3VP4 A; 2J9O A; 1NYY A; 3SH8 A; 1BLC A; 2EA9 A; 2YKF A; 4B88 A; 1UGU A; 4ID4 A; 3EWK A; 4JGO A; 4R4R A; 3VSL A; 5EVI D; 4KQR A; 1S67 L; 1PRQ A; 3LI9 A; 4L0L A; 4H8R A; 2PYP A; 3RJU A; 1KE0 A; 5DKL A; 4MBH A; 5CHJ A; 3PTE A; 2KDK A; 3N8R A; 1N9B A; 3P7N A; 2IWD A; 3N6I A; 2Z6D A; 4IBX A; 2EXA A; 5F5Y A; 2GX5 A; 2WGW B; 3HBR A; 2JBF A; 5EM0 A; 3MJQ A; 4DF6 A; 2Y59 A; 3BWL A; 5HZH A; 1PWD A; 3HJI A; 4X25 A; 2WZX A; 4GS9 A; 2INW A; 2D01 A; 3VV4 A; 4EQI A; 3ZVW A; 5HAI A; 1STZ A; 4BL3 A; 4EBP A; 1XJ3 A; 1T19 A; 1VM1 A; 1K38 A; 5EEC A; 1S1Y A; 1LSW A; 2XFS A; 2XK1 A; 1SCW A; 4LEN A; 4HBT A; 4K91 A; 1ES3 A; 3OCL A; 3FV7 A; 3KX0 X; 1GCE A; 1S4R A; 3Q7Z A; 3W4O A; 3LYX A; 2O9B A; 4U3T A; 1SKO B; 1MZU A; 3UE6 A; 4LRZ E; 1K6S A; 2OWH A; 4HHD A; 4JBF A; 2W3E A; 3LIB A; 5FL3 A; 2KX6 A; 1FCM A; 4DJ2 A; 2XDM A; 4E3N A; 3UPP A; 5E2F A; 4UEY A; 4DDS A; 3M6B A; 3FKV A; 5DTS A; 2XH9 A; 3LI8 A; 3T12 B; 1OTE A; 1U60 A; 2WKE A; 4JXW A; 3LY3 A; 4GDN A; 2XF3 A; 1FSY A; 3FPV A; 1A0K A; 3K3C A; 3OOV A; 5HDD A; 2LB9 A; 5A93 A; 3UPO A; 4MLL A; 4ZAM A; 2Z2L B; 1TVF A; 3LR0 A; 3LO7 A; 4Y17 A; 1GA0 A; 4JF4 A; 3MQO A; 4S2L A; 2A2L A; 4P6Z M; 2XQZ A; 4C6Y A; 3C7V A; 4N9K A; 1F2K A; 2QJ5 A; 2ZMA A; 1VEU B; 2V20 A; 5GLB A; 4PPR A; 4Y7P A; 1DY6 A; 3C38 A; 1SHV A; 1LI0 A; 1YSQ A; 5EVI C; 4CJN A; 4B93 A; 2Y79 A; 4KQD A; 1LT0 A; 1MBL A; 2KLI A; 3ISG A; 3KSF A; 3CPT B; 3IHA A; 2ZM2 A; 3R4K A; 2DNS A; 4BBT A; 1BLP A; 2ZQD A; 2PR5 A; 4HH3 A; 3ITA A; 5AVF A; 2PR6 A; 2P9V A; 4NXF A; 4CQH A; 1QME A; 5CTN A; 5IS1 A; 4KUO A; 3KYE A; 5HWV A; 4G3V A; 3R7W B; 3T4O A; 3D9Y A; 4P87 A; 4FD8 A; 3WS1 A; 2I72 A; 4R38 A; 1XJ6 A; 4XT2 A; 4NXE A; 3UB8 A; 4ETX A; 4BL2 A; 4G3K A; 4Q0J A; 2PHY A; 4EWF A; 1NWZ A; 4ARZ A; 1K54 C; 4MCW A; 2A3U A; 5TGF A; 2WGI A; 2ACG A; 2OSU A; 2Y2P A; 5E2E A; 1MPL A; 2V8F A; 2W3D A; 3ZG0 A; 4JGR A; 3IHB A; 4QU3 A; 2PD8 A; 1D7E A; 3T4S A; 5CER A; 1JTG A; 4IVK A; 4B9O A; 4LV1 A; 5HFO A; 4X56 A; 1HLU P; 4AFI A; 3EGD C; 2WKH A; 3UME A; 4KZ9 A; 2J7V A; 4OPQ A; 2XFT A; 3DWK A; 2XRO A; 4EEP A; 4QPR A; 5EV0 A; 1IFQ A; 2HPB A; 1XXM A; 4E3M A; 4X1L A; 3GV9 A; 5IHV A; 3WS5 A; 1IOU A; 1L2S A; 5KZH A; 5FI7 A; 5CGW A; 2M1C A; 2PD7 A; 5F69 A; 3H82 A; 1I2W A; 4FSF A; 2V2F F; 3TSG A; 2HF6 A; 2WKQ A; 4JF5 A; 1K55 C; 1MXO A; 4GKU A; 4OOL A; 1M6K A; 1AWI A; 2IWC A; 3BFC A; 3IF6 A; 1OTD A; 4R4S A; 1E25 A; 3A3E A; 3P98 A; 1KGG A; 5HD3 A; 4H6J A; 5EPH A; 3MFX A; 1L0E A; 1EW0 A; 1YM1 A; 3GSG A; 4U0T A; 3VP2 A; 4X55 A; 1NJ4 A; 1T1A A; 2C5W B; 2VEA A; 2HDS A; 4HJ6 A; 2W3H A; 3GEC A; 1I2S A; 4OPR A; 4ZRR A; 3ZVT A; 2XEP A; 1S6R A; 4I3I A; 5CHU A; 4GW9 A; 4DMZ A; 3DBA A; 2EX8 A; 3C30 A; 4QD4 A; 3E0Y A; 3HUM A; 3LY4 A; 3ZYT A; 3FWL A; 4BJP A; 3LIE A; 3BFE A; 3F1P A; 4KG2 A; 3IQA A; 5DF7 A; 2ZC6 B; 4WZ5 A; 4Z9Q A; 3A3F A; 2GDN A; 1K4F A; 1E4D A; 4JF6 A; 3RH8 B; 1BUE A; 3PBO A; 5HPI A; 4BEN A; 3HLB A; 4EQ1 A; 3UE3 A; 3VP0 A; 1SKF A; 4OON A; 1AXB A; 1YMS A; 3BY9 A; 1WA9 A; 3IBJ A; 2A49 A; 4X69 A; 4RVA A; 3NIA A; 4O8G A; 4GJ4 A; 1GSX A; 3E4P A; 4U0X A; 4S2O A; 2E8J A; 4EES A; 3HLC A; 3BW6 A; 2WKI A; 4KZ8 A; 2H0Y A; 3S4X A; 2ZQ7 A; 1UWN X; 4F3L B; 4O7D A; 1ZTU A; 4PKY A; 1FCO A; 3IF6 C; 5A90 A; 4CLC D; 4HJ4 A; 4HJ3 A; 5D3O A; 5L09 A; 1YT4 A; 2EWV A; 4KZA A; 2C6W B; 3BQ8 A; 1LL8 A; 4WLA A; 2P04 A; 3ITB A; 3CLO A; 2IA2 A; 3EGX C; 2Z2M B; 1BT5 A; 4UQI M; 2Y4A A; 2JC7 A; 5HWW A; 4GCZ A; 5G4Z A; 3UN7 A; 5MC7 A; 2PBD P; 1W79 A; 3T1Q B; 3FG8 A; 3RXX A; 3BQA A; 3NCK A; 3DAV A; 3GR2 A; 4S2K A; 4DKI A; 4LRX C; 1IKG A; 2QJ7 A; 4KEN B; 5I5L A; 4OKP A; 5DKK A; 3MXS A; 4NKP A; 1X0O A; 4BD0 A; 2VLG A; 1FR6 A; 3LR3 A; 4GLQ A; 1D06 A; 3F1O A; 2Y2I A; 4GN2 A; 1PWC A; 2LB5 A; 4KZ6 A; 1XP4 A; 2EXB A; 3K2N A; 4BQM A; 4Y0O A; 1NXY A; 5FQK A; 3VP1 A; 4OOY A; 3IX4 A; 3PHY A; 4GD8 A; 3IT9 A; 3UB6 A; 3TG9 A; 2ZLY A; 3LEZ A; 4OLD A; 5M19 A; 3L9K A; 3SOI A; 2FZ0 A; 2ZC4 B; 1SDN A; 2XLN A; 2ZC7 A; 4KQQ A; 3TOI A; 4E3O A; 3ZDJ A; 4M3K A; 4KG6 A; 4KZ7 A; 1DJC A; 5J8X A; 1JVJ A; 1EI5 A; 2Q9M A; 2WGW A; 3MKF A; 3EQV A; 2ZJ9 A; 1ES2 A; 2L1M A; 3O3V A; 4O01 A; 1OT9 A; 3TJZ C; 3D72 A; 2NUT C; 2J8Y A; 4ZTK A; 3FKW A; 5FQM A; 5AQ7 A; 4F94 A; 3T50 A; 5HWT A; 3MKE A; 3HL9 A; 1OTI A; 2BLS A; 1YKD A; 3AGF A; 3W4Q A; 3T4L A; 5AQA A; 2OLV A; 5IU1 A; 1XGI A; 3LIC A; 4HBU A; 5FQQ A; 3NOP C; 1GHI A; 3MR0 A; 5CGX A; 5HX9 A; 1K57 A; 3IS2 A; 1DJA A; 2ZOH A; 4CLC C; 3IH9 A; 1FCN A; 1ERM A; 4R23 A; 4DE3 A; 4JXS A; 4BWI A; 5M18 A; 2OAQ 1; 3A0R A; 3BEC A; 2EFX A; 1CQA A; 4PM6 A; 3P01 A; 5DTT A; 3T4K A; 1SKO A; 3DTM A; 1G28 A; 4WL9 A; 4PHT A; 2PBY A; 4LCM A; 5I94 A; 3IX3 A; 4EUV A; 2ZL1 B; 3EEA A; 4WF0 A; 4OQI A; 3N7W A; 1ES5 A; 3V50 A; 3PBS A; 4NXG A; 2O9C A; 2QMI A; 2WKR A; 4WYY A; 3LFV A; 3NBL A; 3QP4 A; 4Y0T A; 1H8Z A; 5M1A A; 1ONH A; 5FAO A; 3G6O A; 1MY8 A; 3KYQ A; 3DTE A; 2H10 A; 4D2O A; 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1NZO A; 4MN7 A; 5U47 A; 2ZD8 A; 1EWZ A; 1ZHH B; 2PT7 A; 3F1N B; 1VQQ A; 4YWZ A; 2EX2 A; 1H8Y A; 3ZNT A; 4E3I A; 1ESI A; 3CMZ A; 3UB7 A; 3OC2 A; 3Q7V A; 1HD8 A; 4XUZ A; 4Y5F A; 3HLW A; 3UE0 A; 1TDL A; 2Y2K A; 1FQG A; 1UWP X; 5TBM B; 2X71 A; 2FH5 A; 2JKT M; 3FYZ A; 2V9A A; 4HNB A; 4DE2 A; 4C75 A; 4KZB A; 4LFU A; 3N8S A; 1NZU A; 2P08 A; 3N4I A; 3T1X A; 2FFF B; 4K0X A; 1XJ4 A; 3BFF A; 1ERQ A; 3WS4 A; 5FEG A; 2CMN A; 1K56 A; 3QNC A; 3A0V A; 4PM5 A; 3UB9 A; 2V1Z A; 4L9F A; 3BYD A; 4ZJ2 A; 3G30 A; 2JKG A; 5EVE A; 1IYP A; 4UA9 A; 2WKP A; 4HY8 A; 3VSK A; 1N9O A; 3VFF A; 2ZQ9 A; 2Y2M A; 5HAQ A; 5FAQ A; 4FCF A; 3G35 A; 5EUA A; 1IEL A; 3JYI A; 3VOY A; 5KIZ A; 3UDI A; 2R78 A; 3QP8 A; 3SW1 A; 3CUE A; 3T1R A; 4WZ4 A; 3DTI A; 4EER A; 4JKT A; 3A0S A; 5CED A; 3O88 A; 2ZC5 B; 4OPY A; 3GDI A; 2NUP C; 3NDE A; 4F3L A; 3LR4 A; 3B3X A; 4GHI B; 1H3Q A; 2V1A A; 4JGP A; 2P74 A; 4KZ3 A; 5DF9 A; 4I3A A; 5EVL A; 1O07 A; 2ZM0 A; 1XFN A; 4KZ4 A; 4E3L A; 2J3W A; 1CK3 A; 5G18 A; 4WN5 A; 4IBR A; 1IKI A; 2A24 B; 2XSS A; 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