The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
135
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structure length |
127
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Chain Sequence |
GSGSWQTYVDEHLMDIEGTGQHLASAAIFGTDGNVWASSSFPEFPDEINAIIKEFSEPGALAPTGLFLAGAYMVIQGEPGAVIRGGAGGICITGQAMVFGIYEEPVNPGQCNMVVERLGDYLVDQGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Allergen
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| molecule keywords |
Profilin
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| publication title |
Structural, Functional, and Immunological Characterization of Profilin Panallergens Amb a 8, Art v 4, and Bet v 2.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Ambrosia artemisiifolia
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| total genus |
31
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| structure length |
127
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| sequence length |
135
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-11-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4QWO A; 2ACG A; 5FEG A; 1G5U A; 1K0K A; 2HZ5 A; 1SZV A; 1PNE A; 1PRQ A; 1Z09 A; 4D60 A; 5FDS A; 3T12 B; 1VET B; 3T1S A; 2PBD P; 1F2K A; 2PRF A; 1FIK A; 3MSH A; 3NUL A; 1ACF A; 1SKO A; 3D9Y A; 1PFL A; 1YPR A; 4FUW A; 5FEF A; 3CPT A; 3UB5 P; 3LGO A; 3NEC A; 4X1M A; 1D1J A; 2JKF A; 1Y4O A; 2ZL1 B; 3LEQ A; 1VEU B; 4ESP A; 2E8J A; 3T1X A; 1A0K A; 4X1L A; 1J3W A; 5EM0 A; 3DAV A; 1FIL A; 3L7H A; 1VET A; 1CJF A; 1HLU P; 2JKG A; 2VK3 A; 2ZL1 A; 3L9K A; 3T1Q B; 1CF0 A; 2PAV P; 5EVE A; 3KYE A; 1AWI A; 1SKO B; 3T1R A; 5EV0 A; 4FTX A; 3CPT B; 3U4L P; 3CHW P; 2V8F A; 2B95 A; 3MS6 A; 2V8C A; 1CQA A; 5EM1 A; 2BTF P; 4X25 A; 1VEU A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3C7V A; 4IED A; 3U2A A; 1NYY A; 4BEN A; 1MKI A; 1BUE A; 3PBO A; 4KQO A; 3QP5 A; 3SOI A; 4HBT A; 2ZC6 B; 4HH2 A; 1NY0 A; 1EI5 A; 3IXG A; 4R23 A; 4R0Q A; 4BLM A; 4E3L A; 2VA0 A; 1ODV A; 5AQB A; 1EW0 A; 4N9K A; 1W79 A; 3F1N A; 4PKY G; 5HPF A; 4X55 A; 3HRE A; 3UNW A; 3C5A A; 5FQI A; 3EGD C; 1H8Z A; 2QKP A; 1M40 A; 1AXB A; 5KSC A; 4OPZ A; 4WZ5 A; 4LRY C; 4R1G A; 4IUH A; 5G4Y A; 3HLG A; 2ZJ9 A; 3ZNT A; 3IX3 A; 2B5R A; 4GD8 A; 3K3D A; 5GHY A; 5M18 A; 4HEF A; 2A24 B; 3N8L A; 3HBR A; 1FCM A; 1Y4O A; 1CK3 A; 3MZE A; 5KMW A; 3R7W B; 3B42 A; 5EVL A; 4ETZ A; 3E4Q A; 3MKF A; 4JXW A; 1IEM A; 3UMD A; 5CGX A; 4WM9 A; 3HLE A; 2B02 A; 2FFF B; 2I9V A; 4QY5 A; 5IHV A; 3DTE A; 3FYZ A; 5GLC A; 1DP9 A; 2WKQ A; 3ZQ5 A; 3GEC A; 4II7 A; 1BUL A; 3MBZ A; 4LV0 A; 3BRM A; 4NK3 A; 3OOV A; 3UB7 A; 5KZH A; 3A3I A; 3MS6 A; 2V0W A; 2V8C A; 4MBF A; 3VP3 A; 1K57 C; 4PKY A; 1VEU A; 4BL2 A; 4E6W A; 5CHU A; 1NZU A; 3M6B A; 1CI8 A; 4BWI A; 4FH2 A; 3CI6 A; 4KZ4 A; 2W1T B; 3OLO A; 1V9Y A; 5A90 A; 4LCL A; 3FG8 A; 1ONG A; 2WKE A; 4DRT A; 2AVX A; 2PBD P; 4WL9 A; 4OON A; 1FIK A; 3MSH A; 3FV7 A; 1K4E A; 5CGS A; 1SDE A; 3WS5 A; 2J7V A; 3DTK A; 4E3N A; 4EEP A; 1YLP A; 3OCN A; 4CPK A; 1TS6 A; 2P08 A; 4XXR A; 1PZO A; 3WWX A; 1E4D A; 4Y5F A; 2ZBB A; 5EOO A; 4Y17 A; 5F1G A; 2XEP A; 2ZQ9 A; 5FSR A; 2VX8 A; 1WYB A; 1XKZ A; 5CHM A; 3KSG A; 4HQA A; 4S2O A; 4N1X A; 2CC1 A; 4G3K A; 3MXS A; 3T4T A; 1J3W A; 2V0U A; 2Y2O A; 3N8S A; 2Z2M B; 5KSH A; 4BQM A; 3S4X A; 2JKG A; 2P7J A; 3DWZ A; 2ZL1 A; 1RGY A; 5AQ9 A; 3RXW A; 4D2O A; 5L09 A; 2K31 A; 4BJP A; 5EVE A; 2HDQ A; 2PYP A; 1T1B A; 5CEC A; 5CXW A; 3NY4 A; 1GA0 A; 4KZ6 A; 3QNB A; 3FZC A; 3K2N A; 1LL8 A; 3VP1 A; 3F1P A; 4YOF A; 4Y0T A; 2A3U A; 2P9V B; 3VV4 A; 3G34 A; 3Q81 A; 3TG9 A; 4CLC E; 5HAR A; 2WUQ A; 4EER A; 3MQQ A; 2PR5 A; 4DJ2 A; 1L0E A; 1G5U A; 1S4R A; 3IXD A; 1DP8 A; 5F1F A; 2HZ5 A; 3UPO A; 2Y2L A; 3DWK A; 3G6O A; 3HUM A; 3ULF A; 4WN5 A; 3T1S A; 1IKI A; 3BFC A; 4OP5 A; 3LR5 A; 3MXR A; 1ES5 A; 2QJ7 A; 2EXA A; 1BLP A; 1VQQ A; 1E25 A; 4CJN A; 4BBV A; 2NUP C; 2E8I A; 5DFY A; 5EVI A; 1LSX A; 5DTS A; 5E2G A; 3JVV A; 3P01 A; 4B93 A; 2ZM2 A; 5HL1 A; 4N9L A; 3SS3 A; 4MCW A; 2Y2H A; 1DP6 A; 5M1A A; 2PD7 A; 4DXB A; 5F68 A; 4EUZ A; 4OOL A; 2E8J A; 5EUA A; 2WKH A; 1D06 A; 5EM0 A; 1XGI A; 4X6T A; 4YNR A; 3N4I A; 3ISG A; 4GB7 A; 4PM7 A; 4KEN B; 1T1A A; 4MN7 A; 5FQJ A; 4ETX A; 1KE3 A; 4X56 A; 1KDW A; 4L9F A; 1GHM A; 3Q82 A; 5HDS A; 2Q9N A; 4KG6 A; 2XFT A; 3QP6 A; 2Y2M A; 2X71 A; 3EWK A; 1GCE A; 4P6Z M; 3DBA A; 3IX8 A; 4MBH A; 4KZ9 A; 2HJ9 C; 5CX7 A; 4LRX C; 3NDG A; 1XJ3 A; 3WS2 A; 1YLW A; 1K54 A; 5HWW A; 2PD8 A; 1K0K A; 1NYM A; 2ZMF A; 3G4P A; 4EBP A; 4JPM A; 1BZA A; 4KZA A; 5F6A A; 5F69 A; 5E2H A; 2M7V A; 3LIF A; 2Y79 A; 3G31 A; 4UA6 A; 1F2K A; 1DY6 A; 3FPV A; 2ZQ7 A; 3VOY A; 3IH9 A; 3IX4 A; 2V1Z A; 4R4R A; 3VP0 A; 5CED A; 1SKO A; 4MN5 A; 2ZM8 A; 4ZAM A; 1O07 A; 4IHQ A; 1L0D A; 5HAI A; 3T4S A; 3ICY A; 1GA9 A; 4ZJ3 A; 5EVI D; 5HWT A; 4GJ4 A; 4GD6 A; 1OT6 A; 2ZL1 B; 2Y55 A; 4K0W A; 4UHU A; 2Z6C A; 5FAS A; 2XLN A; 3JPU A; 5E2F A; 4ZJ2 A; 3Q7V B; 3BFG A; 5BOH A; 3W4O A; 3SW1 A; 2R9X A; 4EQ1 A; 2L1M A; 3CWF A; 3GV9 A; 3A0V A; 1ZKJ A; 3ITB A; 1S0W A; 3S22 A; 3SS4 A; 1MBL A; 3T4O A; 3UDI A; 1MKM A; 1F98 A; 2EWW A; 5C5K A; 4CLC B; 4E6X A; 3KYE A; 4EET B; 2PBY A; 3HLD A; 4P6Z S; 4WZ5 C; 3RFB A; 2A24 A; 3PBR A; 1XJ2 A; 4OQG A; 4CQH A; 2EFX A; 3U4L P; 3TJZ C; 2XR0 A; 2GX5 A; 1RGZ A; 5EM1 A; 3R7W A; 2ACG A; 4F94 A; 2DNS A; 1FOF A; 3T4Q A; 4MMN A; 2WAE A; 5FDS A; 3G32 A; 4RYE A; 1NLY A; 1ZHH B; 4I3J A; 3EEH A; 3GDI A; 1T19 A; 3O3V A; 3HCY A; 3NUL A; 4EBL A; 1G28 A; 3BLS A; 4M4X A; 2LB9 A; 3ZG7 B; 2WGV A; 4R3A A; 4R38 A; 4FD8 A; 3OC2 A; 5CEB A; 4JGP A; 3LYX A; 2DRW A; 1N9L A; 4NXF A; 3VMA A; 4NXG A; 2HDU A; 1JNU A; 1LSW A; 4IVI A; 1PWD A; 2J9O A; 3BJN A; 4P6B A; 4ME4 A; 2ZD8 A; 3RJU A; 2W1T A; 4WF0 A; 2HP9 A; 3OBF A; 1O7E A; 4KQQ A; 1T1C A; 2XD5 A; 5FAO A; 3I7J A; 2EX6 A; 3H82 B; 5J4E A; 1FCO A; 4P87 A; 4UAA A; 2EX2 A; 3PBS A; 3N6I A; 3IXB A; 5L10 A; 4KUO A; 4WMC A; 3M2K A; 4B88 A; 2PAV P; 3UPP A; 1P0Z A; 4NXB A; 3SH9 A; 1UWN X; 3NOP C; 2EX8 A; 5FAQ A; 3LR4 A; 4HES A; 1JWZ A; 3FWL A; 2V8F A; 3HLW A; 1QME A; 4OPQ A; 5HWV A; 4P85 A; 3E2K A; 1TF1 A; 2RL3 A; 3O88 A; 4JGO A; 3GR2 A; 5TGF A; 5LBR A; 4B4X A; 1OTE A; 2KX6 A; 1Z09 A; 4JF5 A; 2IWD A; 4HIA A; 1IOU A; 1G6A A; 4Z1W A; 4IUK A; 3MFX A; 5TBM A; 3UE3 A; 3NBL A; 1H0M A; 3QP4 A; 4Y2F A; 3C30 A; 2Y2I A; 5L8M A; 4FUW A; 2QZ6 A; 4JF6 A; 2M1C A; 1ESI A; 2P9V A; 4KUK A; 2ZQC A; 5CGW A; 3RXX A; 2OWJ A; 2BG1 A; 5MC7 A; 1IYP A; 4MN6 A; 2P74 A; 2JKF A; 3VOZ A; 3OPH A; 4UEY A; 1MY8 A; 4ZBE A; 3T1X A; 2QWS A; 1A0K A; 3S7Q A; 3CLO A; 3PBN A; 4Y3I A; 1UWP X; 4PM6 A; 1U60 A; 4XUX A; 1IKG A; 3OPL A; 5G4Z A; 3VE4 A; 2PDR A; 3FKW A; 1OTD A; 4ZDX A; 3TOI A; 3DTI A; 5K5B A; 4WMC D; 3GSG A; 3LY3 A; 2WKR A; 2WGI A; 4WYY A; 3UE6 A; 3HUN A; 4I39 A; 3M6H A; 1PWG A; 5EV0 A; 5EVI C; 4HOI A; 4LV3 A; 1W63 Q; 4RVA A; 1OJG A; 1OT9 A; 3G35 A; 4E3O A; 4LGW A; 3PYP A; 5EE8 A; 3HUO A; 2BAS A; 4HJ3 A; 3ZDJ A; 1WE4 A; 4IVK A; 2JKT I; 3W4P A; 4LEN A; 4S2I A; 3TW8 A; 3BWL A; 3JYI A; 5GHX A; 2Z6D A; 1YQS A; 1N4O A; 1NZO A; 1NRJ A; 2Y2J A; 5GHZ A; 1VET B; 2YKH A; 1TS8 A; 5DF7 A; 4QB8 A; 3MXQ A; 3UY6 A; 1LT0 A; 2ZQ8 A; 2MJ6 A; 5FL3 A; 1DJC A; 1XA1 A; 3R4K A; 4OQI A; 3TRC A; 2FH5 A; 5IS1 A; 4HY8 A; 3Q7Z A; 3UDX A; 4WZ4 A; 4QPR A; 1ZTU A; 1K55 A; 4S2L A; 3VSK A; 3T4L A; 2W3E A; 1BT5 A; 4OLD A; 4G3V A; 4JXS A; 4DF6 A; 5I94 A; 1K54 C; 3A3F A; 5JYO A; 1YSQ A; 2D02 A; 3NHQ A; 3L7H A; 1IEL A; 5D3O A; 3A3E A; 3P09 A; 4HHD A; 2Z2L B; 1IYS A; 5A8B A; 2EXB A; 3KYQ A; 1K4F A; 1ES3 A; 3JVU A; 3BFE A; 4I5S A; 2O0Y A; 2EWV A; 2KLI A; 2XA7 M; 2INW A; 4UQI M; 3F1O B; 3B33 A; 1SKF A; 4PM8 A; 3EEA A; 1V9Z A; 1DJA A; 3BW6 A; 5HL6 A; 2G2U A; 2XRO A; 5AQA A; 4Y0U A; 4YIN A; 5FEG A; 3Q7V A; 5TBM B; 2V1B A; 4HP9 A; 4X53 A; 4U0T A; 1KVM A; 5FQM A; 4D60 A; 3IF6 B; 5E43 A; 2G2W A; 5EEC A; 4EEU A; 3QP2 A; 2ZC4 B; 3Q1F A; 5GL9 A; 2HJE A; 4MDZ A; 5AQ7 A; 4DE3 A; 1GHP A; 2HDS A; 2WGW B; 4CLC A; 2WZX A; 3PAE A; 2PYR A; 3ZCZ A; 1PWC A; 2V2F F; 1YPR A; 1VM1 A; 3ZVW A; 5EFW A; 1FR1 A; 4B9O A; 3T4J A; 1YMS A; 3BFF A; 2ZQA A; 3EQV A; 1XX2 A; 3KYZ A; 2R9W A; 2V9A A; 4RX2 A; 1D1J A; 4KZB A; 4O0P A; 4GLQ A; 5AJG A; 3T4K A; 1W7F A; 4LPZ A; 2YKF A; 2L4R A; 2GDN A; 2VKS A; 1FSW A; 3ZG8 B; 4UQI S; 4ARZ A; 5GLA A; 3E4O A; 1XPB A; 2Y2G A; 1CF0 A; 3MR0 A; 1K56 A; 2LB5 A; 3LCE A; 3FKV A; 2JKT M; 4FTX A; 4HBU A; 3AGF A; 4GCZ A; 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2IA2 A; 4KZ7 A; 5J7E A; 5TR7 A; 5CER A; 2W0N A; 5HD5 A; 4ZRR A; 3UE0 A; 4ID4 A; 2GZA A; 3B3X A; 3WRZ A; 2JKR I; 2O9C A; 4DE1 A; 4C3Q A; 4WEJ A; 1C3B A; 5CHJ A; 4YFM A; 3HJI A; 2Y2N A; 3M2J A; 3SS5 A; 1HTZ A; 1LHY A; 4EW7 A; 1PW8 A; 5FAT A; 3UB8 A; 2W3D A; 1JVJ A; 2VGJ A; 2J9P A; 3H9W A; 4X1M A; 4H8R A; 3BY9 A; 4ARZ B; 2OV5 A; 3KSF A; 2NUT C; 3LEQ A; 4QU3 A; 2O99 A; 3BEB A; 1P9W A; 2H0Y A; 3ZGA B; 3DAV A; 4Q0H A; 5FQK A; 1VET A; 4K0X A; 3MF0 A; 1KVL A; 1NRF A; 5AVF A; 4ZTK A; 4RQ9 A; 4L9G A; 1E3U D; 4MNR A; 2EFU A; 4S2P A; 1G68 A; 5HFO A; 4KZ8 A; 2PHY A; 3T1Q B; 5KIZ A; 4GDB A; 2FFY A; 1T18 A; 4E3I A; 5HDC A; 3IWO A; 4QD4 A; 3IS2 B; 2V20 A; 1BYW A; 5G18 A; 4OPR A; 4MBK A; 2DCF A; 1QMF A; 4Q0J A; 3C2W A; 2C5W B; 3UO9 A; 3GMW A; 3BEC A; 3NC8 A; 3ZNY A; 1K55 C; 3N7W A; 3ZHH A; 3MMH A; 3HVF A; 4Z9Q A; 3CZD A; 3S7O A; 3N8R A; 4PAU A; 2I72 A; 1TDG A; 3BQ8 A; 4QY6 A; 2QPN A; 1HVB A; 3T12 B; 4AFI A; 3FPW A; 3ZG5 A; 1N9B A; 1SHV A; 3PXP A; 4GNU A; 3D9Y A; 3F1O A; 3VP4 A; 4OP8 A; 3IH8 A; 4A5R A; 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