The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
132
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structure length |
132
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Chain Sequence |
SWQTYVDEHLMCDIEGTGQHLASAAIFGTDGNVWAKSSSFPEFKPDEINAIIKEFSEPGALAPTGLFLAGAKYMVIQGEPGAVIRGKKGAGGICIKKTGQAMVFGIYEEPVNPGQCNMVVERLGDYLVDQGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural, Functional, and Immunological Characterization of Profilin Panallergens Amb a 8, Art v 4, and Bet v 2.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Allergen
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| source organism |
Ambrosia artemisiifolia
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| molecule keywords |
Profilin
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| total genus |
31
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| structure length |
132
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| sequence length |
132
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-11-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5EV0 A; 3CHW P; 3T1S A; 4FUW A; 2PRF A; 3U4L P; 1FIK A; 2JKG A; 1ACF A; 2HZ5 A; 4D60 A; 1VET B; 1G5U A; 3T1X A; 4X25 A; 1SKO B; 3KYE A; 3CPT B; 1VEU A; 1VET A; 1SKO A; 1CQA A; 2B95 A; 3CPT A; 3LGO A; 5FEF A; 1CJF A; 1CF0 A; 2ZL1 B; 1A0K A; 4ESP A; 3DAV A; 4X1L A; 3T12 B; 5EM0 A; 1D1J A; 1PFL A; 2ZL1 A; 2VK3 A; 2V8F A; 4QWO A; 1SZV A; 2E8J A; 3T1Q B; 1J3W A; 1AWI A; 3D9Y A; 3LEQ A; 3NUL A; 1Z09 A; 5EM1 A; 2V8C A; 1F2K A; 1K0K A; 2BTF P; 3L9K A; 2ACG A; 5FEG A; 1YPR A; 4X1M A; 4FTX A; 1FIL A; 1Y4O A; 5FDS A; 3T1R A; 1PRQ A; 1HLU P; 3UB5 P; 1PNE A; 2JKF A; 3MS6 A; 3MSH A; 3NEC A; 5EVE A; 1VEU B; 2PAV P; 3L7H A; 2PBD P; #chains in the Genus database with same CATH topology 2Z2M B; 1KOU A; 2L4R A; 4S2N C; 5J4E A; 4BJP A; 4H6J B; 4EES A; 3FPV A; 3T4S A; 3TG9 A; 4PM9 A; 5DKK A; 3QP5 A; 3GEC A; 4WUJ A; 4H6J A; 4R3A A; 2GDN A; 1XPB A; 3ZVT A; 2PU4 A; 4EQI A; 3NCK A; 1TS6 A; 3NHQ A; 4OOL A; 5E2F A; 4Y7P A; 3Q7V A; 1S6R A; 5FEF A; 2P04 A; 1LLB A; 2ZC5 B; 1DY6 A; 4Q0I A; 3HLC A; 5EVI B; 5FAO A; 1CEF A; 3LY4 A; 3S22 A; 4JXG A; 4KZB A; 1XA7 A; 3W2Z A; 1NWZ A; 3C2W A; 3UPN A; 4OQI A; 3VOY A; 4UEY A; 3ULF A; 2OWH A; 4K0W A; 1TF1 A; 2FFY A; 5CTN A; 2NUP C; 4E6W A; 4N9K A; 5HFO A; 3C7V A; 4I38 A; 4YIN A; 2PR5 A; 1OTA A; 1FSY A; 4GN2 A; 1OJG A; 4QY5 A; 1G68 A; 1MWT A; 1H5X A; 3GVB A; 2WAE A; 3BWL A; 2GNX A; 4D2O A; 1GA0 A; 2J9P A; 5I5L A; 4KQQ A; 3FV7 A; 4QU3 A; 1D06 A; 1I5Q A; 2HF6 A; 3EOI A; 5A91 A; 2IWD A; 3DWZ A; 5AQB A; 3VP4 A; 3O87 A; 3MQ0 A; 4BBU A; 3EWK A; 3NY4 A; 3NDE A; 1DP8 A; 2VJW A; 4R38 A; 3G34 A; 1GSX A; 2FZ0 A; 2NUT C; 3V67 A; 2R9W A; 2EXA A; 2B02 A; 4MDZ A; 1O7E A; 1SKF A; 2PHY A; 1JTD A; 3SS4 A; 3WRZ A; 5FAT A; 3GR2 A; 5EE8 A; 4N1H A; 5FA7 A; 3CAX A; 3UB7 A; 3CPT B; 3PTE A; 1U60 A; 2HPB A; 3C5A A; 1DJA A; 3KO6 A; 3T4Q A; 3CPT A; 4BD0 A; 3DTE A; 2KOI A; 3ZGA B; 1ONH A; 5GLD A; 3P98 A; 1P0Z A; 3JPU A; 5E43 A; 3F1O A; 3IXB A; 3F1P B; 3H82 A; 4WZ5 C; 1GSV A; 1CEG A; 1LL5 A; 3V50 A; 4BLM A; 4E3M A; 1OTI A; 3F1P A; 5CHJ A; 4PM7 A; 4BD1 A; 2QPN A; 4P6B A; 1C3B A; 4G3K A; 5DKL A; 2VV8 A; 2Z6D A; 5BOH A; 3IXG A; 1IYS A; 1XP4 A; 4RX2 A; 4X1M A; 1FCN A; 4KZ8 A; 1OTE A; 1BUE A; 1T1A A; 3IWQ A; 4S2O A; 2JHE A; 4C6Y A; 1H0M A; 3TOI A; 3UME A; 2INW A; 3MSH A; 3U2A A; 1N9O A; 3LIF A; 4IVK A; 1ZKJ A; 2W3G A; 2PAV P; 4PPR A; 3IHA A; 3SOI A; 2H0T A; 5GLA A; 3M2J A; 3PYP A; 3ZQ5 A; 3GTC A; 3N7W A; 4GHI A; 2PT7 A; 5DF8 A; 1W8Q A; 3DTK A; 4Q0H A; 4JGO A; 1M40 A; 2JN7 A; 4PHT A; 5FAS A; 1IEM A; 1K56 A; 3T4L A; 2JKG A; 4R4S A; 4DJ2 A; 1S1Z A; 1FR1 A; 4OPQ A; 1ZG4 A; 1VET B; 4GLQ A; 1FR6 A; 4NKP A; 4JBF A; 3KYE A; 2M7U A; 4FCF A; 3WRT A; 1FOF A; 1TD5 A; 3E4P A; 1VET A; 1OTB A; 4ETZ A; 4ID4 A; 3VE4 A; 2VGJ A; 4GNU A; 1IYP A; 4EUV A; 1N4O A; 5EVI C; 1YSQ A; 4Z9Q A; 2I9V A; 2WKE A; 3ZNT A; 5U47 A; 2XSS A; 2ZMA A; 1LSX A; 4QB8 A; 3LIC A; 3AGE A; 3IH9 A; 5EOE A; 3ZCZ A; 1PYY A; 1JWZ A; 4OH0 A; 3A3I A; 1UWP X; 3FKV A; 2QZ6 A; 4O8G A; 1BLH A; 4NEE D; 3L9K A; 5HPF A; 4EU0 A; 2J3W A; 3CMZ A; 3LIA A; 4JGP A; 2O0Y A; 3HLG A; 3IBR A; 3T1R A; 5FQJ A; 4P6Z M; 4R1G A; 3JVU A; 1W8Y A; 5HAP A; 2W1T A; 1MKI A; 3S4X A; 5HAI A; 2G2W A; 3CIT A; 3UMD A; 4P6Z S; 1V9Y A; 4JF6 A; 4MBF A; 5M1A A; 3H7W B; 2XGN A; 2Z6C A; 4ZJ2 A; 1OME A; 2JCH A; 1NZO A; 4OPR A; 3IX8 A; 1H8Y A; 3H7W A; 1RGY A; 2W3H A; 4FUW A; 4RQ9 A; 2PRF A; 4KG5 A; 2ZQD A; 3PBT A; 2OAQ 1; 3LFV A; 1W7F A; 5HDS A; 4RYE A; 3N6I A; 5CRF A; 1DP6 A; 1ZC2 A; 4LV2 A; 1KE0 A; 2OSU A; 4X69 A; 3UDF A; 3IWO A; 3GRJ A; 1RCJ A; 2QJ7 A; 1K56 D; 1ERQ A; 3FZC A; 3EGD C; 2J80 A; 3GV9 A; 1HZO A; 5LBR A; 2DCF A; 2O99 A; 3RTY A; 2EX9 A; 3D72 A; 3S7O A; 1XFN A; 1L0F A; 3T12 B; 2OOL A; 5C5K A; 4Q8I A; 2Y2K A; 3TSG A; 4S2N A; 1E4D A; 5J7E A; 5F68 A; 2P9V A; 4HI4 A; 4KZ5 A; 1NZU A; 3ITA A; 4G3V A; 2FH5 A; 5EEC A; 5HDC A; 3W4P A; 5HZH A; 2G7U A; 1TDL A; 4I5S A; 1OJ5 A; 3C7U A; 3HUM A; 4O7D A; 2RCX A; 3DTM A; 2XK1 A; 1BSG A; 1ZHH B; 3UB9 A; 5GHZ A; 1IKG A; 1YPR A; 3CLO A; 5FQI A; 2HGV A; 1W5D A; 1NYY A; 4JPM A; 3MZD A; 3E2L A; 5EPH A; 1LSV A; 4B93 A; 3MXR A; 2V0U A; 4AFI A; 5AQA A; 5HWV A; 5CXW A; 1MKM A; 2Y2P A; 4JGR A; 1NRJ A; 2W1R A; 2WGV A; 3LYX A; 3SW1 A; 3CJM A; 3BLM A; 5E2H A; 1GCE A; 5KIZ A; 3VP1 A; 2W3D A; 1IYQ A; 3F1N A; 1ACF A; 4KQO A; 2VZW A; 1BLP A; 2WKI A; 2ZOH A; 3PR6 A; 4RVA A; 1VEU A; 2PD8 A; 1S67 L; 2J3T D; 3WS2 A; 2EWW A; 4GW9 A; 3TJZ C; 2WK0 A; 1PWG A; 4S2M A; 1YLJ A; 1XJ2 A; 2Z2L B; 2Y2I A; 1CF0 A; 2Y4A A; 2ZL1 B; 1ES5 A; 4QPR A; 4X1L A; 3MF0 A; 3KX0 X; 5HWT A; 4ZJ3 A; 1LI0 A; 2B18 A; 5CEB A; 2ZL1 A; 2VK3 A; 1MZU A; 1ZG6 A; 2Y91 A; 3LI9 A; 4YWZ A; 4E3L A; 4FH2 A; 2H5S A; 3MXQ A; 4OOM A; 1YSP A; 4BMW A; 3A3E A; 1GHI A; 4X56 A; 4NG2 A; 4IBR A; 1VQQ A; 1FIL A; 3HJK A; 2Y2J A; 4JLF A; 5F83 A; 2ZLY A; 1KVL A; 3UB5 P; 1XFQ A; 3FYZ A; 4EBL A; 1ESI A; 1GHP A; 2A24 A; 4U0X A; 4K0X A; 3DW0 A; 5HX9 A; 1BUL A; 4WZ5 A; 3MQO A; 3EQU A; 1YLW A; 2A2L A; 3WWX A; 1VB6 A; 4DE2 A; 3HUN A; 3SZT A; 2OLV A; 3LID A; 4X68 A; 1MWU A; 3R7W A; 1FIK A; 3MZF A; 1YT4 A; 3MQQ A; 2MJ6 A; 2JKT I; 2HZ5 A; 4JF5 A; 1PWC A; 5TFQ A; 1SKO B; 4IHQ A; 4R0Q A; 4OLD A; 1N9L A; 2XH9 A; 2W3F A; 3VSL A; 2XQZ A; 5HWW A; 1LSW A; 3IXH A; 3V3S A; 1SKO A; 4DE3 A; 2XRO A; 4WZ4 A; 1DP9 A; 5G4Z A; 1PW8 A; 1WYC A; 5TJJ A; 1JWV A; 2M1C A; 3G4P A; 3UPO A; 3LIB A; 2V8F A; 1FCM A; 5FAQ A; 2ZC7 A; 4HHD A; 4CPK A; 2E8I A; 2XA7 M; 2WAF A; 1P9W A; 2HDR A; 1UWN X; 1I2W A; 4ETX A; 4ZJ1 A; 5CHM A; 1XJ6 A; 4X53 A; 2Y2M A; 2V2F F; 4U0T A; 2XA7 S; 3QHY A; 3O88 A; 3MBZ A; 2UWX A; 4PKY G; 2ACG A; 4UA6 A; 4XXR A; 5EVI A; 3JYI A; 4OP8 A; 1N9B A; 3ITB A; 3SS5 A; 4JXV A; 1DRM A; 3B33 A; 2DNS A; 2EX8 A; 5EUA A; 3BEC A; 3T4T A; 3E4Q A; 3LI8 A; 3Q07 A; 1HTZ A; 2L0W A; 3E98 A; 2LB9 A; 3ZFZ A; 4KZ7 A; 3CHW P; 1JNU A; 3HJI A; 1KDS A; 4DE0 A; 4OQ0 A; 3M2K A; 4WMC A; 4NXB A; 4X6T A; 3TW8 A; 2OV5 A; 4WL9 A; 3NBL A; 4H8R A; 5K5B A; 4R4R A; 4LRX C; 1NJ4 A; 3OBF A; 5AQ7 A; 4S2I A; 3HBR A; 3IXD A; 3ZVW A; 4WN5 A; 1ERO A; 2X02 A; 5HW3 A; 4WEL A; 2EFU A; 3PHY A; 1ONG A; 2ZM2 A; 1A0K A; 1K55 C; 3Q82 A; 3MZE A; 3SH9 A; 4CQH A; 5HD5 A; 3UNW A; 3IF5 A; 4XT2 B; 3ZG7 B; 2EXB A; 4ZRR A; 4EER A; 1RP5 A; 1WE4 A; 3G2Y A; 5F1G A; 2UV0 E; 4XT2 A; 2JBF A; 4B9O A; 5DF7 A; 5DFY A; 5EVL A; 1YMX A; 2V1B A; 4OP5 A; 3UE1 A; 4DKI A; 1SDE A; 4LRZ E; 3SH7 A; 5DFX A; 1Y28 A; 4OVD A; 2ZBB A; 5FDS A; 3LEZ A; 4IUK A; 4JXW A; 4L0L A; 3ZG0 A; 3NIA A; 2QHK A; 5JYO A; 4UAA A; 4Y3I A; 5HAR A; 3ZDJ A; 4Y2F A; 5CTM A; 3MMH A; 3RH8 B; 5HDD A; 2BLS A; 5EVI D; 1PI4 A; 1STZ A; 1L0E A; 1Y54 A; 3A3F A; 1LI9 A; 4HQA A; 4MLL A; 5TGF A; 4EEU A; 2QJ5 A; 2ZQ9 A; 1MBL A; 4CJN A; 2ZM8 A; 4O0P A; 4DJ3 A; 4HP4 A; 5DTK A; 1KGG A; 5CX7 A; 4BWI A; 4GB7 A; 2WAD A; 4L9F A; 3N8R A; 3O3V A; 2ZQ8 A; 3S7N A; 1KDW A; 2FFF B; 2HP6 A; 5L8M A; 1MWR A; 4X55 A; 4WF0 A; 4DE1 A; 4EXO A; 1K6R A; 4X25 A; 4WMC D; 2Y2H A; 4GCZ A; 5AQ9 A; 3CUE C; 1VHM A; 3IS2 B; 4S2J A; 3MFD A; 2HP5 A; 3IS2 A; 3CWF A; 2J8Y A; 4ZBE A; 1WYB A; 3ZG9 B; 2JKT M; 5FQ9 A; 5FQQ A; 5DF9 A; 3VFH A; 3BY9 A; 1SZV A; 5CGW A; 1RGZ A; 2JC7 A; 2VX8 A; 3O86 A; 3G2Z A; 1PZP A; 3LCE A; 5L07 A; 2QMI A; 2WGW B; 2Y2G A; 3FWL A; 2BTF P; 1TEM A; 4MNR A; 1M6K A; 5FEG A; 2WGW A; 2IWB A; 1MXO A; 3EQV A; 2QWS A; 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3KSF A; 1PIO A; 4DRT A; 1IFQ A; 1O07 A; 1XGI A; 3B3X A; 5D3O A; 3NOT C; 1XX2 A; 4HH2 A; 3LY3 A; 1T18 A; 4Y0U A; 4Y13 A; 4WYY A; 4D60 A; 2XDM A; 4A5R A; 2H0Y A; 3BY8 A; 4ZTK A; 3C4P A; 4KQD A; 4QHC A; 4ARZ B; 1CI8 A; 2WZZ A; 4R70 A; 1CQA A; 4OKP A; 3LGO A; 1XXM A; 1FQG A; 2GZA A; 2Y2O A; 2PR6 A; 3JVV A; 3TRC A; 3KSI A; 2OAP 1; 1ES2 A; 3NOP C; 4N9L A; 2BAS A; 4YFM A; 1H8Z A; 5FQM A; 3P7N A; 5M19 A; 3WS5 A; 4O01 A; 4E3K A; 4Y0T A; 1F2K A; 4S2L A; 1YAX A; 3NJA A; 2PYP A; 3FG8 A; 2YKF A; 3C4O A; 4UA7 A; 4EV4 A; 1T19 A; 4I3I A; 3LR5 A; 4P0M A; 3NC8 A; 1K55 A; 3NDG A; 4JGQ A; 3ICY A; 3GQZ A; 4KUK A; 4S2K A; 1KVM A; 5A90 A; 2VV7 A; 4HES A; 4OPY A; 2XRN A; 3N4I A; 5GLC A; 3VV4 A; 1PI5 A; 1OTD A; 3A0S A; 5L09 A; 1K25 A; 5HSQ A; 3IX4 A; 4BBT A; 3IWI A; 3MFX A; 1K4F A; 3FPW A; 3A3D A; 5F6A A; 3UO9 A; 1K54 A; 1YQS A; 1NLY A; 1YLY A; 4GDB A; 4RX3 A; 1JWP A; 3VFF A; 1F98 A; 2HDS A; 4HY8 A; 1S4R A; 1H3Q A; 1N9N A; 4DXC A; 3ISG A; 3BW6 A; 3VP2 A; 2PD7 A; 3MKF A; 3S7P A; 2I72 A; 4BL2 A; 1BTL A; 1MWS A; 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