The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
39
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sequence length |
132
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structure length |
132
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Chain Sequence |
HMKCPVCHQGEMVSGIKDIPYTFRGRKTVLKGIHGLYCVHCEESIMNKEESDAFMAQVKAFRASVNAETVAPEFIVKVRKKLSLTQKEASEIFGGGVNAFSRYEKGNAQPHPSTIKLLRVLDKHPELLNEIR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Three dimensional structure of the MqsR:MqsA complex: a novel TA pair comprised of a toxin homologous to RelE and an antitoxin with unique properties.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Dna binding protein
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| source organism |
Escherichia coli k-12
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| molecule keywords |
HTH-type transcriptional regulator MQSA (YGIT/b3021)
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| total genus |
39
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| structure length |
132
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| sequence length |
132
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-03-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF15731 | MqsA_antitoxin | Antitoxin component of bacterial toxin-antitoxin system, MqsA |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | 434 Repressor (Amino-terminal Domain) | lambda repressor-like DNA-binding domains | ||
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2PUD A; 3SCF A; 2IVQ A; 2KEK A; 2A6C A; 5A7L A; 1CQT A; 3CLC A; 2MQK A; 1E3O C; 4I6T A; 1OCT C; 2EF8 A; 2CRO A; 3G5G A; 2O49 A; 1GT0 C; 3SCG A; 3OQO A; 1UXD A; 2EWT A; 2KEJ A; 3GA8 A; 2GRM A; 1RZR A; 3R1F A; 3F51 A; 1B0N A; 3QWG A; 2FJR A; 2ICP A; 2LYJ A; 3F6W A; 1PRU A; 1ZZ6 A; 1ZZ7 A; 3CEC A; 3OP9 A; 2JVL A; 4I6U A; 4OB4 A; 4Z5D A; 3QYX A; 2PUC A; 3L1P A; 1ZVV A; 2PUG A; 3QQ6 A; 2PUA A; 1WH8 A; 3LFP A; 3OMT A; 3QF3 A; 2CSF A; 2L8N A; 1WET A; 3OQM A; 3HI2 A; 2AW6 A; 4JQD A; 3GN5 A; 1JFS A; 3BS3 A; 2KEI A; 2IUO A; 2LYK A; 2WIU B; 4IVZ A; 4Z59 A; 4YG7 B; 4X4B A; 3D1N I; 4I8T A; 1ZPQ A; 1LQC A; 2AXU A; 2PIJ A; 4Z58 A; 3OQN A; 1PRA A; 2GZU A; 2PE5 A; 1QQB A; 2H8R A; 3EUS A; 2LYQ A; 3GN5 B; 3KZ3 A; 3BDN A; 1RPE L; 3JXB C; 1Y9Q A; 1RZS A; 3BD1 A; 2O38 A; 1PRV A; 4MCT A; 3TRB A; 1QP4 A; 3H5T A; 4JCY A; 3KXA A; 3O9X A; 3JXD L; 4O8B A; 4YAR A; 3HZI B; 3FMY A; 3CRO L; 1XWR A; 5K98 B; 1IC8 A; 4JCX A; 1CJG A; 2AWI A; 1UXC A; 1PER L; 3ZHM A; 3IVP A; 1HF0 A; 3VK0 A; 4MCX A; 1NER A; 1DWK A; 4X4E A; 2XI8 A; 1QQA A; 2LYL A; 3DNV B; 2KPJ A; 4YBA A; 3KJX A; 3JXC L; 1ZAY A; 2PUE A; 1QP0 A; 3ZKC A; 3FYA A; 1LLI A; 2D5V A; 2PUF A; 4IWR A; 1LMB 3; 2AXV A; 2R63 A; 3B7H A; 4Z5H A; 4X4F A; 3S8Q A; 1JWL A; 2PPX A; 1BDH A; 4GHJ A; 1OSL A; 2LYS A; 4PU4 C; 1LCD A; 2ICT A; 4X4G A; 3PXP A; 3ZHI A; 4PU3 C; 3G7D A; 1RZR D; 2IVG A; 2LCV A; 4Z5C A; 1Y7Y A; 1BDI A; 2AXZ A; 4J1W A; 2B5A A; 2L49 A; 1JFT A; 1ZS4 A; 1ZUG A; 2XSD C; 4I6R A; 2BNN A; 2XJ3 A; 3LIS A; 2BJC A; 3UFD A; 2BNO A; 2PUB A; 1DW9 A; 2AUW A; 3MLF A; 1VPW A; 1PNR A; 3U3W A; 2WUS R; 4J1X A; 4Y42 A; 2KZ8 A; 4NDW A; 2LYP A; 4PU8 A; 2IU7 A; 1QPZ A; 4X4I A; 4GQM A; 2EBY A; 3SCH A; 2OR1 L; 2IV1 A; 4IA8 A; 1JH9 A; 3GBF A; 1R63 A; 1ZZB A; 3F52 A; 4FBI A; 4X4C A; 1NEQ A; 1WH6 A; 2LYR A; 2MEZ A; 4YG1 A; 1X57 A; 1O4X A; 1YSE A; 4X4H A; 1ZZ9 A; 1L1M A; 1ZZC A; 4PU7 A; 1RIO A; 3RZZ A; 1QP7 A; 1AU7 A; 1LCC A; 4F8D A; 1POU A; 2HIN A; 2OFY A; 1WIZ A; 2XCJ A; 2IVB A; 1R69 A; 4X4D A; 1S7E A; 2BNM A; 2JCG A; 2GRL A; 4FN3 A; 1X2L A; 1EFA A; 1UTX A; 1SQ8 A; 4YG4 A; 1ZZ8 A; 2HSG A; 2R1J L; 1ADR A; 2XIU A; 2O4A A; 3FYM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3FZM B; 5GON E; 2PG8 A; 3I1A A; 4N78 D; 4ZHQ E; 3CEC A; 4LF4 T; 2ES0 A; 4ZI3 C; 3HKE E; 3A9Y A; 4AI6 A; 4UIG A; 1LKX A; 2UUA T; 2PJQ A; 3FZL B; 5AQR B; 4BAY B; 2G0U A; 2YDQ A; 5AQS B; 3N9L A; 4HFE A; 4DID B; 5JRC B; 3OQN A; 2VK9 A; 5FXZ A; 4MCT A; 2HHH T; 4ILB A; 3CX7 B; 2W61 A; 2JQQ A; 1X79 A; 3EDU A; 4PAG A; 3R84 B; 4HWC A; 4X4E A; 1QQA A; 4PJN A; 2CM0 A; 4ILU A; 3A5X A; 2VVN A; 3LBX B; 3N2G E; 5FKY A; 2X9Y A; 2W0G A; 1LMB 3; 1Z0P A; 2W62 A; 3VR9 A; 2IIU A; 4HFD A; 4UV8 B; 1JWL A; 2XQY A; 3ZN1 B; 1NEN A; 3F31 A; 3LSV A; 2K48 A; 2Y8D A; 4X4G A; 1BR1 A; 4G2A A; 4H9O C; 4PK4 A; 3IHR A; 1Y7Y A; 2LE8 A; 4O8S A; 2B5A A; 3GMI A; 2KND A; 2JMH A; 3SOL A; 3VRB A; 1HNZ T; 2PFV A; 1IBM T; 3C98 B; 3AA1 B; 2PXK A; 3L39 A; 4IL4 A; 4O2A E; 3OPC A; 4EOZ B; 3ZSS A; 2BG9 A; 4J1X A; 1OED A; 3P4W A; 4X5T A; 4IT4 A; 1ZKE A; 3EHZ A; 2IV1 A; 3SFE A; 1L1M A; 4PU7 A; 3OBV E; 3RIU A; 4QX7 B; 1R69 A; 4JYA T; 4JI1 T; 2L8K A; 2JCG A; 2XQ5 A; 3K3Q C; 4CXW A; 5ABE A; 2XQ3 A; 3NWI A; 2WMN A; 3A8Y C; 3AEC A; 3SR4 A; 2O49 A; 2WDR A; 5AQN B; 2K5B B; 3KVB A; 2IC6 A; 2XJ7 A; 4TWD A; 2CRB A; 3CQC B; 5HEO A; 2ZM8 A; 4QX8 B; 4B3R T; 1U4Q A; 2R6G F; 4ISS A; 3OMT A; 2NW9 A; 2WU2 A; 2Z6E A; 3LK4 2; 5GAG i; 1W0A A; 4ERR A; 2BKP A; 2NTX A; 5LBQ B; 2PBI A; 1RPE L; 3K3O A; 2PXE A; 4GIW A; 2V6X A; 3BD1 A; 2XAQ B; 4YTP A; 3H5T A; 2WP9 A; 5AQU B; 4JI8 T; 3LK2 B; 2LRK A; 2FJB A; 3N9O A; 3AVR A; 3RF1 A; 2KPJ A; 2SPC A; 5BMV E; 5LGU B; 2QRX A; 2D5V A; 2CWY A; 3P4P A; 5FL0 A; 1CUN A; 2XZE A; 4YXD A; 2CXF A; 3V5U A; 3KBU A; 1VCT A; 3ZYK A; 3ZHI A; 4IIJ E; 1JNZ A; 2CEA A; 4KUM B; 1KNZ A; 1SHZ C; 3G0T A; 2LLW A; 4ILA A; 5HXH A; 2Y6X A; 3CKD A; 2VKO A; 3RYC E; 2JQH A; 3WAJ A; 1YQ4 A; 2EBY A; 5LCY A; 4IE0 A; 2WZI A; 5AQJ B; 1O4X A; 2ZMA A; 3ZJ1 A; 2HIN A; 5JR9 C; 2XAF B; 3PJA J; 3IEE A; 4IGU A; 4JLE A; 3ZST A; 2D2S A; 3VHL A; 1HNX T; 3OTO T; 3I9Y A; 5DJQ C; 4HWH A; 3I0O A; 4AKH A; 1MMA A; 1OCT C; 1OXZ A; 3VRA A; 3QUJ A; 2YU2 A; 2CLY B; 2CBJ A; 3BQL A; 4TX5 A; 5HWX A; 4DR1 T; 2V7M A; 3NZL A; 3L1P A; 4Z90 A; 4X62 T; 2UXB T; 4CN6 A; 4EKG A; 4U2Y A; 2XM1 A; 1VOM A; 2IUO A; 1WLX A; 3TLU A; 2WDV A; 5JUW A; 4TV9 E; 4Q25 A; 1AJ3 A; 1WR6 A; 4QHO A; 3KXA A; 2FJA A; 1NAF A; 2ZM0 A; 2V26 A; 4LMK A; 1W0B A; 3UUN A; 2I59 A; 2LOP A; 4AQF A; 3DNV B; 4AQY T; 2W63 A; 2XM2 A; 2KSR A; 3FYA A; 4I43 B; 2A9U A; 4Z5H A; 2D9D A; 5C8Y E; 1L0V A; 1LCD A; 2JQK A; 2LSY A; 2W2U A; 4ZOL E; 1RZR D; 4OK0 A; 1QLB A; 4LMJ A; 3OKQ A; 1DUL A; 1JFT A; 1SE7 A; 3ABV A; 1MIV A; 2LOS A; 3ZT7 A; 2YBD A; 2E9X C; 5BR8 T; 4DV0 T; 4U2Z A; 2DNX A; 2PXP A; 4Y42 A; 1JNR A; 4ANJ A; 1XDP A; 2F4V T; 3SCH A; 2ODU A; 1FJG T; 4K0U A; 5EK4 A; 3AXJ B; 1HNW T; 3E08 A; 4DR5 T; 2NTY A; 2MTQ A; 5DQV A; 2ZM2 A; 3I0Q A; 2O4A A; 1CQT A; 3FBL A; 2EF8 A; 3UWP A; 4ZI2 D; 1MIW A; 4LFC T; 3AEA A; 1GT0 C; 2IC9 A; 3FZH B; 2EWT A; 2LYJ A; 4CXX A; 1X9B A; 2VL8 A; 1WYC A; 3MZK B; 1WET A; 2HH7 A; 4LF8 T; 4PFO A; 3M9L A; 2KLQ A; 2IAK A; 3BS3 A; 3MXZ A; 2PTF A; 4IE7 A; 2WSS V; 2AXU A; 3GZC A; 3PUS A; 3PUG A; 1VCS A; 1HCI A; 2LHN A; 2M67 A; 2VB6 A; 3UQ7 A; 4TNW A; 5FVK A; 1NW3 A; 4OYJ A; 3RIA A; 4KP3 C; 2UXN B; 2MOZ A; 3ZMV B; 1DWK A; 4HRA A; 4V1A v; 2LYL A; 1ZAY A; 1US7 B; 2EHO B; 3ESL A; 4LF5 T; 2LSI A; 2BBH A; 3OYZ A; 4H63 H; 5JDG A; 2IVG A; 3ZMZ B; 4OBM A; 3PU8 A; 1G8X A; 1YQ3 A; 1ZEE A; 2IDO B; 1BR2 A; 1U5P A; 2PUB A; 1DW9 A; 2L1P A; 5C2T A; 4H9P C; 4DV4 T; 2WCA A; 1Y01 A; 3HKB E; 2JIW A; 2VUR A; 1R63 A; 5AFU L; 1YSE A; 5IYZ E; 4CZZ B; 3ANW A; 4DBQ A; 2OFY A; 2V5C A; 4YT0 A; 2BNM A; 2RA1 A; 4L5G A; 1WYB A; 1NEK A; 4C90 A; 3AXJ A; 2MQK A; 1E3O C; 4ZXL A; 2CRO A; 3PUA A; 4GKJ T; 1ZZ6 A; 2J7W A; 1U2Z A; 3UU4 A; 5CB4 E; 1N34 T; 5KDM C; 3OQM A; 1D0X A; 3MK7 C; 4XAX B; 3NBX X; 5FYM A; 1J5W A; 5CA1 E; 2LYK A; 3AE4 A; 1ZPQ A; 4TZ4 C; 3EUS A; 3HR0 A; 3WI3 A; 3F2E A; 4AQG A; 3W15 B; 3VKG A; 2M6B A; 4DR6 T; 3UU8 A; 3M3Z B; 4DBR A; 4GKK T; 2C5I T; 3AA6 B; 3J7Y q; 1XWR A; 5K98 B; 4BA9 A; 1LRZ A; 2LKG A; 4PJL A; 3ZHM A; 3KV9 A; 2ACX A; 5CFB A; 3EUH A; 2XI8 A; 1J1J A; 2DCF A; 1UGO A; 2PUE A; 3KJX A; 3N9P A; 4IWR A; 4HFH A; 4O4L E; 2R63 A; 4X4F A; 1OSL A; 4EZI A; 1H7C A; 2D0U A; 2J4G A; 4CN1 A; 3ZKR A; 4NXN T; 3IA3 A; 1LVK A; 3ZYL A; 3ZMS B; 2E5L T; 4JEU B; 3EI0 A; 3RH3 A; 2X67 A; 5LP6 E; 1UUR A; 3E22 E; 4GQM A; 3MA9 A; 4QH1 A; 2IHR 1; 2Q9Q C; 5FXW A; 1JH9 A; 3UUM A; 2BG9 B; 1XDO A; 1OED B; 2W00 A; 4CI3 B; 3X1D A; 2H3R A; 5IUX A; 3KVA A; 2HPJ A; 2GRL A; 1ADR A; 4IDQ A; 5DTR A; 3AE3 A; 2YEV C; 2VQF T; 2FJD A; 5HEU A; 3SCG A; 5LOV E; 1QB2 A; 4ZZB A; 4EXT A; 3RYH E; 3PE0 A; 4NUU A; 3AE7 A; 2PUG A; 4KX6 A; 4U7I A; 4DV7 T; 1IZN B; 2CPT A; 3QNU A; 2AW6 A; 4ILC A; 2YIN A; 4X65 T; 1W9R A; 5LBM A; 5E0O A; 4MBQ A; 2CWO A; 2V3C C; 3BDN A; 3N9N A; 2VL0 A; 2O38 A; 1PRV A; 3SWH A; 2ZLY A; 4H63 V; 4JCX A; 2BG9 E; 1OED E; 4MCX A; 3BQI A; 4AKR B; 3T1H T; 3SFD A; 4YBA A; 3BK9 A; 4HGA A; 5KX5 E; 4WVL A; 5LG3 A; 2K3W A; 1BR0 A; 1E2A A; 3G7D A; 5F8P A; 4KI0 F; 4UXN B; 2LCV A; 4Z5C A; 4PJJ A; 3VKH A; 3UUX B; 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