2H8R | Genus

Total Genus 56

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	56
sequence length	219
structure length	176
Chain Sequence	SILKELQALNTEEAAEQRAEVDRMLSEDPWRAAKMIKGYMQQHNIPQREVVDVTGLNQSHLSQHLNKGTPMKTQKRAALYTWYVRKQREILRQFNQTVMRRNRFKWGPASQQILYQAYDRQKNPSKEEREALVEECNRAECLQRGVSPSKAHGLGSNLVTEVRVYNWFANRRKEEA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	5'-D(CPTPTPGPGPTPTPAPAPTPAPAPTPTPCPAPCPCP*
publication title	Structural basis of disease-causing mutations in hepatocyte nuclear factor 1beta. pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
molecule tags	Transcription activator/dna
total genus	56
structure length	176
sequence length	219
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2006-06-07

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.60	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Homeodomain-like	2h8rA02
1.10.260.40	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	434 Repressor (Amino-terminal Domain)	lambda repressor-like DNA-binding domains	2h8rA01

2MW8A 2AXZA 5M3MJ 2JMWA 3G1LA 1ZZCA 3HBLA 1MBEA 2X6OA 1JUSA 1H8AC 1I6HJ 2EBIA 1ADRA 5EGOA 1QPZA 2Y9ZA 3I4MJ 4D5FA 4YG1A 4A3KJ 3A03A 5K7ZA 2CUFA 4I6ZA 2KZ8A 2OF7A 1MBGA 1GVDA 2JN6A 3ZHIA 3H5TA 4NDLA 5M5XJ 1ZZ9A 2LFBA 4DZPA 2CSFA 2AHQA 3FISA 4MLOA 3G5GA 4X4IA 1QP4A 2LYJA 4I6RA 2Y9YA 3F0CA 3HGYA 2PMZN 2NOGA 4M3GA 3OOUA 1JFTA 1ETYA 4UUTA 5F27A 3ZQGA 1L1MA 5C44J 1RESA 2CQXA 1POGA 3LSPA 5K7HA 5M5WJ 3CDLA 3OSFA 1JFSA 3B7HA 2IU7A 4EEFG 2OR1L 3JRGA 1JT0A 2JK3A 1QVTA 2XPWA 1SANA 2GBYA 3MKLA 2ME6A 1JKRC 2GRLA 3MLFA 3JXDL 1WGXA 1ETXA 2LVSA 1FEXA 4JCXA 1A5JA 3GTKJ 2HOAA 2QCOA 1ZR4A 1ENHA 2IUOA 1IG7A 1PRVA 2L9RA 1TWFJ 5EZHA 2E2IJ 3WHBA 2IBDA 3C2BA 4M3BA 4X1EA 5E3NA 3GBFA 1F36A 1P7IA 4M3EA 5E3OA 5A7LA 4F8DA 3GTPJ 2PUFA 3A02A 2PUAA 2EZHA 4C3IJ 2K40A 3ZOBA 1ZQ3P 2K9NA 3ZQHA 4Z5DA 2DMQA 5F1JA 3WHCA 4L5EA 3BQYA 2XSDC 3GTOJ 2R7ZJ 1ZTRA 3HOVJ 2ICTA 2LD5A 4Z58A 2JA7J 4W97A 5IYBJ 3TEDA 1QRYA 2HINA 1WH5A 1PUFA 2HI3A 4PU7A 4IHYA 4PU3C 4D5CA 1NK3P 4JCYA 2CUEA 3MN2A 5F0CA 2PUGA 3RZOJ 1BW6A 1IDYA 2EZLA 4CYCA 3JRCA 3QWGA 1JKOC 2PIJA 4J19A 5GP9A 3BD1A 4PU8A 3A01B 1SFOJ 5E3MA 3F6WA 5FKKA 1Z0XA 3S1RJ 1XC5A 5EF6A 1WH7A 2B63J 1B72B 2LP0A 4QSHA 2R5ZB 4XIDA 2EBYA 2YUSA 1VNDA 1MBFA 4DYQA 3VPRA 5FKOA 5F0HA 2HSGA 2EQRA 3QPSA 2IVGA 5BNGA 1W0UA 4IWRA 1FTZA 2COBA 3OSGA 2DMTA 2LYKA 5DS9A 1TWAJ 1UTXA 2VPRA 1IRZA 2R63A 2ID6A 4JX5A 2OFYA 2BNOA 5FLVA 4FN3A 2WB1N 2IEKA 3O8HA 3CECA 4YG7B 4JYKA 2DMNA 1VFCA 3SCGA 2TRTA 2TCTA 3K7AJ 3OIOA 1LFUP 1UG2A 1TWHJ 1JJ8C 2BNNA 1ZZ8A 3FMYA 4A69C 1UHSA 2MG4A 1U8BA 2NVYJ 1UXDA 5EDNA 3HEFA 4Y42A 1VF9A 1Y1VJ 2BJCA 2DMUA 2FJ1A 3BR0A 2HOSA 1YRNB 3PM1A 4X4CA 4FE7A 3OQOA 1T33A 3S2HJ 4A93J 4X4GA 4I8TA 2H8RA 3Q0WA 3JR9A 3JRBA 4BXXJ 3JRAA 2ICPA 3E7LA 2P81A 2O38A 1OFCX 3D1NI 3BR3A 2FJRA 1RZSA 2IV1A 3RQIA 4A3FJ 1NTCA 4X4DA 4QIWN 2LYLA 4DYCA 2LCVA 3S8QA 4PU4C 4Y7NJ 2XGDA 3GTGJ 1U9OA 4MCXA 1RKWA 2A6CA 3CCYA 2M34A 1AHDP 2X48A 1NEQA 1ETQA 3BR2A 1OJLA 2HXIA 1JUPA 3TW7A 4FE4A 3SCHA 5C4XJ 1RIOA 5F04A 1PNRA 2ECBA 2RAEA 3O9XA 1X2MA 3S15J 1TWGJ 1QQBA 1JTXA 5IP6A 1X57A 3RZZA 3R1FA 1ZZBA 2DA3A 2JJ7A 5F0FA 3H3VK 1WIZA 3F52A 2L8NA 2Y31A 3OP9A 1HDDC 2GM4A 1EF4A 1MSEC 2Y0SN 2LK2A 1MH4A 2K9SA 2LLKA 4AC0A 4NDWA 2AXUA 3UFDA 4AUXA 3GTJJ 1NK2P 1U9NA 3Q0VA 3DCFA 3UKGA 3DNVB 4IHVA 1B72A 5EYRA 1EFAA 3Q0UA 2R5ZA 3BTIA 3G1OA 2L0KA 4IHWA 4X4EA 2DA7A 3LNQA 2XPVA 5K7FA 3TP0A 4HNVA 1LQCA 1IGNA 3GN5B 2DN0A 3LSJA 2KPJA 1ETOA 1QP7A 2AXVA 5F08A 1JT6A 4XK4A 3QPLA 5FKLA 4G12A 1BW5A 3CMYA 2JVLA 3ZHMA 1ZKGA 2GLOA 1GUUA 2ELKA 4UUSB 1OCPA 1IJWC 1BL0A 4LOCA 1WH6A 2XCJA 3QQAA 1JWLA 4B3AA 4M3FA 2AW6A 5JLXA 1X2NA 3L1PA 3ZQCA 4IEJA 1ITYA 2R92J 2PUDA 4JQDA 4A3IJ 4FTHA 3U3WA 4X4HA 5J3LA 2VI6A 1GV5A 4D7MA 1ZK8A 2YU9J 1Y1WJ 3LSRA 1NERA 1ZZ6A 3F51A 4X4BA 3FK7A 4AYBN 3HGGA 5J1YA 1I50J 5FLMJ 1H88C 3M4OJ 5C3EJ 1Y9QA 3FYMA 2XB5A 4BY7J 2MQKA 3LISA 1ORKA 1MH3A 3HB9A 2CU7A 2VUMJ 5IYDJ 2I10A 4Z5HA 1IC8A 5M3FJ 4O8BA 5FKNA 1ZUGA 2HXOA 3HDDA 4IHXA 2XGEA 1XG1A 4JX6A 1XS9A 3H0GJ 2CRGA 3S1MJ 4XRSA 1R9TJ 3FK6A 1LLIA 3LFPA 2YS9A 4DW6A 4XRMA 2FD5A 3HOZJ 1B0NA 1JJ6C 2CROA 1ETWA 1VI0A 1LFBA 3IH4A 1HCRA 3GTQJ 2DA1A 3HOWJ 1DU0A 3S2DJ 3NARA 3G1MA 4J1XA 1R69A 2PPXA 4C3JJ 4GHJA 2E2JJ 3S14J 2M0CA 1FIAA 4A3GJ 4DYRA 3KXAA 3KZ3A 4A3BJ 1I3QJ 4A3CJ 3TRBA 3BTJA 5J1UA 3QQ6A 1ZPQA 2EZIA 3IH3A 2O9LA 2IVQA 1R63A 3BR1A 3DEWA 1LCCA 2K9QA 3QF3A 2OPTA 2Y30A 3NAUA 4YG4A 2WV1A 3LOCA 1ZVVA 1A6IA 1T56A 5IYCJ 2CQQA 5HODA 5EEAA 2Y2ZA 1MBHA 2JCGA 3BG5A 2R5YB 5IP7J 2HDDA 2CJJA 1SQ8A 1JGGA 5IP9J 1MBKA 4X6AJ 1DW9A 3CROL 1B8IB 2E2HJ 3JRHA 2NVXJ 2NS7A 1LE8B 4Z5CA 1MSFC 2DTZA 3LSGA 3GN5A 4YARA 2N8GA 4S0HB 3B6AA 2HQ5A 2EH3A 2DMPA 3BDNA 3CLCA 1GDTA 1TC3C 2R1JL 3RKQA 5K98B 2EF8A 1HOMA 3W6VA 2X9DA 3GBGA 4V2GA 2L7FP 2O7OA 4UUSA 2O8KA 4J1WA 4QTRA 4W1UA 2XB0X 5FJ8J 4I6TA 4CYCB 3HM5A 3S16J 2KEJA 1AKHB 2O4AA 1Y7YA 3RZDJ 1XWRA 2M8GX 2XGCA 2R0QC 1H89C 2L49A 4RBOA 3S17J 2XRLA 1WPKA 1HDPA 4BBRJ 2AUWA 2JWTA 1FTTA 3A01A 4I6UA 1HLVA 3GTMJ 1PRAA 2VKEA 1WI3A 4B4CA 1LCDA 5GPAA 1WETA 1ETVA 2IAIA 1WCMJ 3HKZN 5IPAA 4B1RA 4GFBA 2KEKA 3I4NJ 1JKPC 4A3LJ 3BTLA 3TP3A 3BG9A 3HOUJ 3EUSA 4MIMA 3ZQLA 2JA5J 2AWIA 4JX4A 2WAQN 2FX0A 2LKXA 1GT0C 3G7DA 1E3OC 2NS8A 2HOTA 1RR7A 2LYRA 2MEZA 2PUCA 3JRFA 1W0TA 1JKQC 3MVPA 5EG0B 1D5YA 1S7EA 2NVQJ 1CJGA 1F43A 3FKIJ 4FCYA 1U78A 2DA5A 2E1OA 3ZKCA 2ID3A 2VKVA 1ZZ7A 5FKMA 3OQMA 3GTLJ 1HF0A 2LTPA 1WH8A 1IDZA 2XPUA 1JUMA 1PRUA 4XRSG 1K83J 2WUSR 1QP0A 1QVUA 3ZQFA 1BJZA 4BKXA 3BR6A 2ZB9A 3JREA 4M3DA 4M6VA 1YSEA 1BDIA 1YRNA 1ZR2A 2L7ZA 1BA5A 2MGQA 2LYQA 2XJ3A 1RPEL 3BS3A 4MCTA 2PUBA 2R5YA 1JTYA 3IH2A 5M5YJ 3PO3J 3QYXA 3KJXA 1BDHA 1B8IA 2PUEA 2PE5A 4FBIA 1MBJA 2L7MP 4JP0A 4V2FA 3M3YJ 2DA6A 2IVBA 3VK0A 1LE8A 2M2EA 1DU6A 4MFEA 5EGOB 5C4JJ 1APLC 4DZJA 2GRMA 2AO9A 3BG3A 3CQZJ 4A3EJ 3B6CA 2H1KA 1OSLA 3SFIA 1MNMC 3K2AA 2KEIA 2O49A 3BQZA 4MFDA 1ZAYA 1X58A 4IA8A 1X2LA 4FISA 1UXCA 3HOXJ 4BBSJ 2KDZA 2ECCA 2GZUA 1ETKA 1TWCJ 3FIWA 3Q3SA 1JH9A 3SJMA 2NVTJ 1AKHA 4BY1J 4RDUA 3SDGA 4OB4A 2QF7A 4YBAA 2WIUB 3FYAA 4C3HJ 2HYJA 3BT9A 3HZIB 2W48A 2R93J 1CQTA 3JXCL 4A3MJ 3PXPA 1O4XA 1RZRA 1RZRD 2JA6J 3OMTA 2LYSA 3SCFA 1RKTA 4ABZA 1Q1VA 3BR5A 3O8GA 5DTDA 5JLWA 4I76A 4XICA 1FJLA 1K61A 2DA4A 1LMB3 2LR8A 1GV2A 4D7NA 2XIUA 1DWKA 1QPIA 4IVZA 2LYPA 1RPWA 1UMQA 2MSYA 1POUA 1ZGWA 2FQ4A 3S1NJ 5IOYA 1P7JA 5J1RA 1IUFA 4MO7A 1RETA 2E19A 1VPWA 1IV6A 2KT0A 5EG0A 3S1QJ 2LY9A 2ME0A 1PUFB 2G0EA 5EZGA 2BNMA 4A3DJ 1QQAA 1Z77A 3JRDA 3JRIA 5E3LA 9ANTA 1ZS4A 2DJNA 1G2HA 2XI8A 3IVPA 5IOZA 3BTCA 2JA8J 2D5VA 3HOYJ 3PO2J 1PERL 1AU7A 2M9HA 4Z59A 4Y52J 5GPCA 1FIPA 3OQNA 2DA2A 3ZQIA 1OCTC 2EZKA 3IV5A 4X4FA 4GQMA 4A3JJ 2EWTA 3JXBC 2B5AA 3TW6A 4C2MJ
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1RR8C 2JMWA 3G1LA 3PL8A 5FB2A 3HBLA 3TEPA 4C9YA 3L2WA 3FF5A 3S93A 3CF2A 1JUSA 1H8AC 1QPZA 4GCVA 3KP3A 2ZJPF 1S72I 3ZQ7A 4D5FA 4L0ZB 4YG1A 1HW5A 5BPIA 5K7ZA 4XONA 2R7DA 3TDZC 4ESFA 2OF7A 2DPUA 3CUOA 2M3AA 3AFHA 3ZHIA 2R7VA 2UXXA 4NDLA 5M5XJ 4PJ0C 1ZZ9A 1B6AA 5H6RA 2CSFA 3K6GA 5LFAA 4X4IA 2QEXI 1KONA 3DTEA 1QP4A 3BP8A 2PXVA 3LA7A 5BQTA 3OYNA 1RI7A 2HPIA 2PMZN 2UXNA 4ZYGA 1ETYA 2R7QA 3H9QA 4KT6A 2WAQA 5K7HA 2ESHA 5DCMA 1JFSA 4DBQA 2OR1L 2XXPA 2DTRA 3I54A 1QVTA 2PMZA 3CUQC 2ME6A 1JKRC 3MLFA 4L9TA 1ETXA 4YFNF 1A5JA 1ZR4A 1ENHA 3MEXA 2XROA 1IG7A 1W5TA 1X3WB 4ZTFA 1TWFJ 5EZHA 2IBDA 2VN2A 3C2BA 4U0WA 5E3NA 5A7LA 1B9NA 2CQ7A 4PZJA 1NH3A 4F8DA 2CUZA 5L3GA 3A02A 1MJBA 4BQOA 5CKTA 1ZQ3P 2V3CC 2DMQA 5FGMA 4L5EA 3GTOJ 3SX0A 4M9SA 3HOVJ 1WJDA 3COAC 1VQ9I 2JA7J 4PJLA 1WWXA 4W97A 2BW3A 3QWLA 2LYCA 2HINA 1R71A 1U3EM 1BIBA 4D5CA 3WTTC 4E7SA 3MN2A 2PUGA 3DEEA 2KQRA 1IO2A 1FSEA 3VB2A 1JKOC 4ZZLA 1OQYA 2VC1A 1SFOJ 4MTDA 1T39A 4ZDOA 4U0YA 2LREA 3K70C 3S1RJ 2VE9A 3FKJA 1WH7A 4BE1A 1G3SA 4FQGA 4HRIA 2BHYA 4ON0A 4DJAA 2STWA 2EBYA 5JR3A 2PXKA 1FBUA 1ULYA 2M4GA 3Q9SA 5FKOA 2HSGA 5FLXZ 4Y15A 4II3A 2FQ3A 2HYGD 2IVGA 5BNGA 5J4YA 3G73A 1FTZA 2COBA 2L9VA 1KQ0A 3F6OA 1MDMB 4EM2A 5DS9A 4JX5A 2IA1A 2PMHA 2QQAA 4UNOA 4Q48A 3CECA 2DMNA 1Z7UA 2TRTA 2OJED 2BNNA 1ZG1A 1TWHJ 1TW3A 4BYYA 4RMNA 2D45A 1XDUA 3HEFA 5DT2A 2ZXHA 3CUQB 5LHGA 2RREA 1Y1VJ 3L09A 2GOMA 5H2FC 4FX4A 2FJ1A 1VQLI 2HOSA 3VYUB 4A93J 3E6CC 3JR9A 2L02A 3V8JA 1OFCX 2KRFA 2RGVA 3D1NI 2QUFA 2FJRA 4KIFA 3RQIA 3SEQA 3H5AA 4X4DA 2LCVA 1PYVA 4OIPF 1EH6A 3DTKA 2YBDA 3QOWA 4AVZA 2O61A 2XAHA 5HDKA 2CMPA 3GTGJ 2VJ4A 5CJ9A 1U8RA 1WJAA 5FFZA 4MCXA 1IV8A 2OQRA 1WSUA 1MNEA 2LY1A 1OKRA 4NQWB 1AHDP 4LGWA 4U7DA 2RQQA 2HXIA 3D0SA 1JUPA 3TW7A 4FE4A 4BEHB 1E0EA 3M9LA 3V42A 1RIOA 3PIOF 4G7HF 3O9XA 2A61A 1SD6A 1TWGJ 1ZRCA 1JTXA 5IP6A 3R1FA 2A6HF 4XSXF 1N25A 1BC8C 2JJ7A 2QSGX 3F52A 2OQGA 3R6SA 2L8NA 1MMAA 5KK1A 1EH7A 4HZFA 4P1WA 5L3CA 3TO9A 1BR2A 1JHHA 2LC2A 2LSOA 3OYJA 2PFBA 2ZSHB 2LK2A 4TV7A 2IS6A 3SZTA 5ILSA 2K9SA 3K69A 3WGIA 4AC0A 1QO0D 1I5ZA 2AXUA 3OYGA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2MW8 A;  2AXZ A;  5M3M J;  2JMW A;  3G1L A;  1ZZC A;  3HBL A;  1MBE A;  2X6O A;  1JUS A;  1H8A C;  1I6H J;  2EBI A;  1ADR A;  5EGO A;  1QPZ A;  2Y9Z A;  3I4M J;  4D5F A;  4YG1 A;  4A3K J;  3A03 A;  5K7Z A;  2CUF A;  4I6Z A;  2KZ8 A;  2OF7 A;  1MBG A;  1GVD A;  2JN6 A;  3ZHI A;  3H5T A;  4NDL A;  5M5X J;  1ZZ9 A;  2LFB A;  4DZP A;  2CSF A;  2AHQ A;  3FIS A;  4MLO A;  3G5G A;  4X4I A;  1QP4 A;  2LYJ A;  4I6R A;  2Y9Y A;  3F0C A;  3HGY A;  2PMZ N;  2NOG A;  4M3G A;  3OOU A;  1JFT A;  1ETY A;  4UUT A;  5F27 A;  3ZQG A;  1L1M A;  5C44 J;  1RES A;  2CQX A;  1POG A;  3LSP A;  5K7H A;  5M5W J;  3CDL A;  3OSF A;  1JFS A;  3B7H A;  2IU7 A;  4EEF G;  2OR1 L;  3JRG A;  1JT0 A;  2JK3 A;  1QVT A;  2XPW A;  1SAN A;  2GBY A;  3MKL A;  2ME6 A;  1JKR C;  2GRL A;  3MLF A;  3JXD L;  1WGX A;  1ETX A;  2LVS A;  1FEX A;  4JCX A;  1A5J A;  3GTK J;  2HOA A;  2QCO A;  1ZR4 A;  1ENH A;  2IUO A;  1IG7 A;  1PRV A;  2L9R A;  1TWF J;  5EZH A;  2E2I J;  3WHB A;  2IBD A;  3C2B A;  4M3B A;  4X1E A;  5E3N A;  3GBF A;  1F36 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2H8RA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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