3TELA

Lytr-cps2a-psr family protein with bound octaprenyl pyrophosphate lipid and manganese ion
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
SEYSLSVAVLADSEIENVTQLTSVTAPTGTDNENIQKLLADIKSSQNTDLTVNQSSSYLAAYKSLIAGETKAIVLNSVFENIIELEYPDYASKIKKIYTKGFTKKVEAPKTSKNQSFNIYVSGIDTYGPISSVSRSDVNILMTVNRDTKKILLTTTPADAYVPIADGGNNQKDKLTHAGIYGVDSSIHTLENLYGVDINYYVRLNFTSFLKMIDLLGGVDVHNDQEFSALHGKFHFPVGNVHLDSEQALGFVRERYSLADGDRDRGRNQQKVIVAILQKLTSTEALKNYSTIINSLQDSIQTNVPLETMINLVNAQLESGGNYKVNSQDLKGTGRMDLPSYAMPDSNLYVMEIDDSSLAVVKAAIQDVMEGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Cps2A, Integral membrane regulatory protein Wzg
publication title A widespread family of bacterial cell wall assembly proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 129
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03816 LytR_cpsA_psr Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.260.150 Mainly Alpha Orthogonal Bundle 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 3telA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3telA01
3MC2A 1TXFA 1LGBC 1J1NA 5LOMA 1I6AA 3U8QA 4OZ9A 1MXVA 1UQWA 1OQHA 3MEJA 2AIXA 4X1BA 2DXYA 3C35A 1H3DA 1MXWA 3QAXA 2QS2A 3CFZA 2PMSA 3V89B 1URDA 4YB7A 2V93A 4XIGQ 4ISUA 1WODA 2DVZA 3KOSA 3FV2A 2RCBA 4NMYA 4OESA 4I62A 3DP8A 4C1UA 1UTHB 4DIGA 2NVUB 4DE8A 5L9OA 3A09A 5JTYB 1PB9A 3VLUA 1JQFA 3ZKKA 1DOTA 5FTHA 2QS4A 4NE4A 3PUXE 3MP1A 1IUDA 2Z8DA 2REJA 1B05A 2UVIA 2I4BA 2P0SA 3MBPA 4YU0A 1USYH 4P0IA 1LB9A 4FJPA 1O63A 5TP9A 2UVJA 1IZ1A 1QJMA 5H8NB 3MAMA 1URGA 3SETA 1AMFA 3EHSA 3C32A 3SESA 4F19A 3RTWB 3B6TA 3CSBA 3MVWA 1CB6A 1OIBA 2ABHA 2ESNA 4PETA 5I2KB 2Z23A 4RNSA 4IB2A 4O3AA 2VGQA 3OO6A 5KCJB 3G3FA 1II5A 1UIVA 4OTEA 4H6DA 3IOWA 4EF1A 3W9WA 4FAJA 5I56B 5FHNA 4BLAA 2I48A 2O1MA 2RINA 3IJXB 4R2FA 1POTA 4KCCA 2H98A 4XKRA 4OHNA 3MVZA 4EUOA 3HV1A 2O84X 2H9BA 3O6HA 1Y1ZA 3OO7A 5DYHA 2OCUA 2DOJA 1UTHA 2XXRA 3H3GA 2BJJX 1OLAA 4DXBA 1P1OA 2R71A 5JTYA 2DWAA 2OLBA 4RA1A 2THIA 4H8JA 2ZYOA 5I84A 2A5SA 2DYXA 4JWOA 3OWQA 2PVUA 3IORA 4FORA 3DELB 4GRKA 4R74A 3T22A 3T96B 3IB0A 1IITA 1EH3A 3IO4A 4YB6A 4IO5A 1ZTYA 4G68C 3O6IA 2PT1A 1LAXA 2NOOA 4U1ZA 5KZTA 5H8NA 3THIA 4H67A 4JWYA 3RT8A 3H4ZA 4GWOA 1M5EA 3IOUA 2XHDA 3V5AA 3MZ9A 1PB7A 2ZMBA 1L5TA 4FEDA 4GQOA 2H5YA 3N6TA 1WVJA 1RYXA 4N6PA 1P1NA 5I2KA 3MZ1A 3O28A 4NF8B 2XXTA 1B3EA 5KCJA 5H8SA 3S4UA 3FXRA 5JK4A 3K02A 5I56A 2RF1A 2PBWA 1NNPA 1HSJA 3MUQA 3KJ7A 4PFWA 4F29A 4IY5A 5H8HA 1TFDA 3G3JA 2HXWA 3H6WA 1TFAA 1H43A 1MM6A 2FA7A 1UIUA 4DDDA 3PD9A 3TMGA 1R9LA 4LONB 2DE4A 4H0WA 1SI0A 5I57B 1B7HA 1BTJA 2QS1A 3PUVE 2V3TA 2F7BA 4KD5A 1MY3A 1ZLQA 2OJTA 3FJMA 3RPWA 5AA2B 1A8EA 4R72A 4ELPA 1P1QA 3OMBA 2D3IA 3K00A 3EPEA 5HPQA 5DT6A 4WKMA 4DXUA 4U22A 3VV5A 2F6PA 3HHFA 4RPOA 3QSLA 3CSGA 4WXJA 1YTVA 3VLWA 3K6UA 2Y7IA 2P1SA 1GV8A 4NF8A 4NTLA 1EZOA 3MQ9A 1QKBA 4TOZA 3UA8A 3DM0A 2HEUA 4F3PA 2B3BA 4I9DA 1PDAA 3QXMA 1MXUA 3LSWA 2E0SA 1MPDA 3BBRA 4IY6A 4KCDA 2XXVA 4R6YA 1SD3A 3U72A 1N76A 4U2RA 1GGGA 1NL5A 1LCFA 2DVCA 3PPPA 1QULA 2XXIA 3DLNA 1RKMA 3N5LA 1PBQA 3CR9A 5ELVA 1B5IA 3PE5A 1DMBA 1ZKBA 4FEBA 3PD8A 3TTMA 5CMBA 3KG2A 3S9EA 4U4XA 3S9NC 3M3KA 1SYIA 5I57A 1FTOA 3KN3A 3CG1A 2G93A 4ESWA 4OVJA 3OSQA 5I58B 4KYEA 3UIFA 2F35A 3PUWE 5B7DA 5AA2A 5AA2D 3E13X 3K6XA 3PGFA 5ITOA 4TLMB 4KPTA 4THIA 4QSCA 1H44A 4ZZEA 5CMKA 2XD3A 1JEVA 1AL3A 2W7YA 3BKIB 2ZYMA 3PMWA 3T9VA 5AA4B 4IO7A 2I4CA 1R9QA 1QKAA 3FVGA 3CRBA 1XVYA 2H4IA 4XKNA 1FTKA 4YKIA 3K1MA 2YJPA 2ONRA 1NNFA 1GR2A 2Y7KA 3GZGA 3JV9A 1B3GA 3Q29A 3T9XB 4AB5A 5TP9B 4X48A 3KBRA 4Q30B 3VVFA 1JEUA 5DVJA 2XXPA 4JBZA 3VXBA 2AL5A 3P7IA 4OMBA 3DP6A 4YAHX 2Y7PA 1FQEA 3OD7A 4FE8A 1B1XA 1DSNA 3K6VA 1FTLA 1N04A 3S2VA 1IXCA 5EHSA 4EDPA 4QSDA 4HCWA 1EZ9A 3KGCA 4JSDA 1SI1A 2ANJA 4OFOA 3ZS6A 2GFEA 2H99A 3TODA 3RNNA 3FASA 4BDLA 3T66A 2NUVA 4H5FA 3LUYA 5I58A 2UVHA 1JW4A 1MXYA 2PX1A 4EQ7A 3WAEA 3TTNA 1MY2A 3KOTA 1SQYA 1HSLA 1P1WA 5KDTB 4OXVA 5BUUA 3OSRA 3TUSA 1B9JA 1Y4CA 2F36A 1B2HA 4EQBA 3E9XA 4POWA 3QIMA 3R26A 4MH5A 1ZMGA 3OKZA 1ZBMA 3O6GA 3LR1A 3MP8A 5HM4B 4P11A 4G8NA 5AA4A 1MDP1 1FQAA 3MPKA 3K01A 2REGA 4XKQA 4Z0IA 3ODBA 1JW5A 2IEEA 2Z8EA 3EF7A 3SEWA 4U1OA 4XKPA 3K1PA 4GL0A 3QUFA 3D4GA 4G2ZA 3MP6A 3CG3A 2QS3A 3ZKLA 1JETA 4ZE9A 3SEYA 1O7TA 1BLFA 1D3KA 3E3KA 3KN7A 2DWJA 1LAFE 3GXAA 3H6VA 3ZSFA 3PMXA 3GLBA 4GXSB 3K2DA 2ZNTA 5ITPA 4TQUQ 3DP4A 4GXAA 1MQJA 4KHZE 2V25A 1OVBA 4UA8A 1LFGA 3CFLA 4ZE8A 4PQJA 2M8CA 2VP1A 4M1VA 5H8HB 4BDQA 4N07A 5IAIA 4ZECA 4LA9A 1B1HA 4NF6B 4LATA 1XHYA 4G4PA 5KDTA 1Y3QA 2F97A 2DS9A 4KI0E 3SEXA 1I6QA 1OQGA 1PC3A 1LB8A 3TELA 4JWXA 4ZEKA 2D21A 5L8DA 2Q8JA 2XXHA 4OERA 3HO7A 3LBSA 1LCTA 2X7QA 1VE4A 5TU0A 1Z7NE 3SKPA 3W15C 4DCXA 1MG1A 3G3GA 4H1XA 1N7WA 5M2VA 5A5XB 3MJNA 4OENA 1S7YA 3H7MA 3R7XA 3TTRA 5H8FB 2UYEA 1B3HA 3IB2A 1Y9UA 2HCAA 1POY1 5CC2A 2IA4A 2NWJA 1ATGA 3PMVA 1SW5A 2GRVA 1LSTA 1S50A 1ELJA 3C31A 1OVTA 1XS5A 4POXA 4U4SA 4IO3A 3G3KA 5AA1A 3UK4A 4F3SA 1B52A 1MQIA 1YCJA 3IOVA 2O6AA 1MH4A 3RN8A 4P0GA 3A3UA 3VVDA 3OXNA 3TFLA 1A7LA 1Y4TA 2XXQA 2QSXA 1M5DA 4MF3A 3K1NA 2OBGA 4NF6A 3O2AA 5I2NB 2I0BA 2I3WA 4YICA 3FVNA 3EHTA 2CZLA 4NF4B 3TKDA 2I58A 4G77A 1BP5A 1B0LA 3H06B 3OEKA 2QRYA 1A54A 1ANFA 2OWTA 4R6KA 1LLSA 4C1TA 3SEUA 1DTGA 2O68A 3PPNA 1B5JA 5IKBA 3L6HA 1YPNA 2CMOA 2ONKE 1LBBA 4M4GA 2LAOA 3B7DA 5A5XA 3W9VA 3CVGA 5TPAB 3K4UA 5H8FA 3H6TA 5ISUA 3FD3A 2F8DA 3OEMA 1MXZA 3O29A 1B7ZA 2UXAA 4BDNA 5HBCA 3JYRA 3PPQA 1FTJA 4L17A 3I3VA 1IIWA 2HAUA 2OZZA 3SERA 3KN8A 4OFLA 3GBAA 3OO8A 1PEBA 3TQWA 4QRZA 4RXLA 4DXCA 1A40A 2V3QA 1QVSA 4DCYA 1Y3NA 2E1SA 1D9VA 3TDJA 2ONSA 3H03A 2YPNA 4R2BA 2VD2A 4X9TA 4F22A 5L9MA 1ZJLA 2YLNA 3NXHA 2V84A 1DPEA 4I8CA 1Q35A 4DE9A 3M3FA 1UTBB 2XX9A 5CBRA 5I2NA 1LFHA 3ONMA 4WEPA 1MS7A 4NF4A 4IO6A 4PP0A 3PV0E 4R9GA 4ZEFA 4ZEBA 1O64A 3N6UA 4LUBA 3R6UA 1NNTA 4KYSA 3BFUA 4OFJA 4G8HA 1T0KA 1MY4A 3RT6B 2RC9A 3M3LA 2Q2CA 1NMUA 4IO2A 4DLDA 2Y7RA 4NWCA 3CI8A 1N3XA 4FECA 4OQOA 5TPAA 3M8UA 2GHAA 3KFMA 1N7XA 3FUZA 2HQ0A 2PYYA 1RYOA 4JSOA 4NF5B 4F1YA 2Z8FA 1EZPA 3LSFB 3HSTA 2VD3A 2P2AA 4RPNA 5CMCA 3F11A 3ECRA 3RQTA 3HPIA 1MPCA 3CFXA 4F1VA 1DTZA 3PU5A 4QFKA 4ONYA 4ZZAA 3UP9A 3O9PA 4KR5A 4DZ1A 4WEDA 3MVXA 4YKJA 3B6WA 2ZNSA 3Q28A 1B40A 4QFLA 4EXKA 3QUJA 4OETA 2QL3A 2R9JA 4GOTA 3H6UA 1UTBA 1FQCA 4R9FA 4KFQA 5CBSA 1AH5A 1SBPA 3SEVA 4MBPA 4MLVA 2ALUA 5H8QB 3OOAA 4NWDA 1HSEA 2VOZA 5B70A 3RTFB 4GF8A 4YB5A 2X26A 4ZEDA 2HZKA 1FTMA 4Q5TA 1IXIA 1D9YA 4G68B 2Z22A 4F3BA 1OLCA 1MQDA 2KLFA 1QW0A 4EXLA 3RLFE 4LZ8A 1Y3PA 3QK6A 3AXFA 5ICQA 4LZ7A 4RK2A 4ZS9A 3U93A 1Y20A 4GD5A 3FXUA 1BIYA 5L9SA 4EQ9A 4AQ4A 4YMBA 4PFTA 1MY0A 2DP8A 4RYAA 1N84A 1S9TA 4O3BA 2DWIA 3I5OA 1B7UA 5FTIA 4F18A 3UN6A 2F78A 4NF5A 5CI5A 3UORA 3FGSA 2Y7WA 3LSLA 1B51A 4O3CA 2Y84A 2I6EA 2OWSA 3Q27A 4H65A 1Y1MA 3U1OA 4Z7EA 1QUJA 2A5TB 4YKKA 3BFTA 1TT1A 2DXRA 2V3UA 2B65A 1US5A 3PPRA 2XXWA 5F7VA 4G8MA 1FQDA 4ELOA 1IXGA 2Q89A 3K6WA 2I3VA 3CIJA 3T93B 4JDFA 1XOCA 3T9UA 3NROA 2X7PA 3I6VA 2Q88A 3C34A 3A3CA 1B58A 4GLIA 3IJOB 4JB7A 4QFNA 2G29A 3EQ1A 5H8QA 4OYVA 3IL1B 1Q1KA 1FCKA 3GBBA 2DQVA 3FJGA 4KQPA 2HZLA 3O97A 3FVOA 1N3WA 3B6QA 4G68A 3C4MA 2F6GA 3S9MC 1NNKA 1SYHA 3G7WA 4F31B 1SDXA 3HHGA 3FATA 3C33A 5EHMA 4F3GA 3TZAA 2ZNUA 5I59B 4ZEIA 3IB1A 1M5FA 4PE5B 4FATA 2XX7A 5CRYA 5CMMA 3C36A 3TCHA 4MLQA 4HCYA 4C0RA 1B3FA 1B46A 1MPBA 3KSXA 3TQLA 2FNCA 1PB8A 2ZYNA 5AE4A 1IQ7A 3VVEA 5EYFA 4IO4A 3N94A 2XXXA 4XTCQ 4GVOA 4N13A 2A5TA 2XXUA 1A8FA 2F34A 2R6GE 4F2OA 4F39A 4QF9A 1TWYA 2VHAA 2HAVA 2QPQA 4Q8RA 3N26A 4LP2B 3D4CA 3WAFA 4U21A 2XXYA 1B5HA 1B4HA 1ZIUA 4QSEA 4ELRA 2F7CA 4HTGA 4YMAA 1R6ZA 1GTKA 1MH3A 4KYDA 4MFIA 3RGYA 1A55A 1DPPA 1JNFA 1MQGA 1MQHA 1URSA 1QUKA 4OWDA 4BDRA 1OMPA 1XC1A 4K3FA 1EU8A 1AIVA 4NEDA 3TAJA 1YAEA 4JXIA 2WKYA 4EF2A 5ICTA 1D4NA 3IR1A 4OEVA 2RCAA 1IEJA 4PFYA 3KEIA 3PPOA 5I59A 3TCFA 2QMXA 2FYIA 2GH9A 1M5BA 1FW0A 4RJZA 1WDNA 1SW4A 2O7UA 5F1QA 4PFUA 5J1DA 1MY1A 2PT2A 3KZGA 3SDFA 4X1DA 2DE3A 3ILTB 1SW2A 4XXUA 4LQ5A 1USYE 2HFBA 1FQFA 3C9HA 4ECFA 1VR5A 4H5GA 4OBMA 5JEIA 2O1LA 1B6HA 1NKXA 4QFPA 3VLVA 1IXHA 1M5CA 4HS7A 3T9HB 2RC8A 3TTLA 4HW8A 3FIRA 3PUYE 4ZDMA 1H76A 4I1DA 4IGRA 1FQBA 4LVQA 1B4ZA 3TEPA 5AA3A 3USDA 2ZYKA 3FXQA 2F7AA 5DEXB 4OEUA 3V8XB 1NH8A 4BDMA 3VXCA 1AOVA 2Q2AA 3QYTA 1SVXB 1ZU0A 3MPLA 3IOTA 4GIZA 1B0HA 1MRPA 3G3HA 3FJ7A 2DE2A 1PBPA 2I49A 4E0WA 1XVXA 1H45A 4QFOA 1N0TA 3HCQA 2O69A 4GL8A 1R1NA 5K2YA 4YKPA 4FIMA 4BDOA 1I69A 2I0CA 4R75A 3TCGA 1NH7A 2B3FA 4YZZA 3FVKA 3U94A 4AB6A 3MVYA 3L6GA 4Q0CA 1JVYA 5DVFA 5K2XA 4GFRA 1NFTA 2UVGA 3EN3A 3RY3A 3V83A 3QFIA 2O51A 1LBCA 3LSXA 1US4A 3OO9A 2XD2A 1P1UA 1F9BA 2GHBA 1I6BA 4IGTA 1SW1A 5FHMA 4RK9A 4E0XA 4LZ5A 1VFDA 3MW0A 4R6HA 3KSJA 2F5XA 2H25A 5DTBA 3FZVA 1QUIA 1JVXA 4F2QA 4H8IA 1B3LA 4TLLB 2RC7A 4U23A 1LAGE 1MDQA 3PUZE 1A99A 1MXXA 1XT8A 4UACA 1P99A 2RKMA 2D5WA 3KJTA 1BKAA 4QHQA 5DEXA 3OELA 3Q26A 2ZXTA 4F1UA 2O7IA 5DVIA 3JZJA 3O66A 3ILUB 3TYHA 3UGWA 3HN0A 3IAZA 5BWJA 3MZBA 2XX8A 3MWBA 1VFEA 5CM6A 5FHOA 3VE1B 3FV1A 2DWHA 1Z7ME 4LQ2A 1B32A 3IK6B 2OK2A 3S9LC 1LAHE 4ELQA 3VFJA 1JW1A 2NXOA 3TPAA 3K0VA 2Q9TA 1KWHA 3VDFA 3IX1A 4ND9A 3G3IA 2UYFA 4RY1A 3LC8A 4ESXA 2DSFA 2AYSA 3OENA 1LFIA 1CE2A 3TTKA 1MM7A 2AL4A 3U92A 3E4RA 2QMWA 3EHUA 3RUMA 2QJEA 4R73A 3IO6A 1GVCA 3Q25A 1VSOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MC2A 2LCVA 1IMCA 1TXFA 1LGBC 1RZSA 4G61A 1J1NA 5LOMA 1I6AA 1DK4A 3U8QA 4OZ9A 1MXVA 1UQWA 1OQHA 3MEJA 3OQOA 2AIXA 1DCUA 4X1BA 2DXYA 3C35A 1H3DA 1MXWA 3QAXA 3R1FA 3E79A 2QS2A 3CFZA 1S7EA 3SR4A 2PMSA 3V89B 1IMFA 1URDA 4O94A 4YB7A 2V93A 4XIGQ 1ZZ9A 4ISUA 1WODA 2DVZA 4PU3C 1JH9A 3KOSA 3FV2A 2RCBA 4NMYA 4PBQA 4OESA 4I62A 3DP8A 4C1UA 1UTHB 4DIGA 4PAFA 2NVUB 4DE8A 5L9OA 3EKIA 2PFYA 3A09A 3PTYA 2OX3A 5JTYB 2AXUA 1PB9A 3ISPA 3VLUA 1JQFA 4ER0A 3ZKKA 4P1LA 1DOTA 5FTHA 2QS4A 4F8DA 4DI4B 4NE4A 2PXTA 3LFPA 3PUXE 4GWWA 3KJXA 3R09A 3MP1A 1IUDA 4N4UA 2Z8DA 3GBFA 2REJA 1B05A 2UVIA 3OP9A 2I4BA 2P0SA 3MBPA 4YU0A 1USYH 4P0IA 2PE5A 1LB9A 4ER5A 4FJPA 1O63A 5TP9A 2UVJA 1IZ1A 1QJMA 5H8NB 3MAMA 1URGA 3SETA 1NV6A 4X4HA 1AMFA 3EHSA 3VK0A 4MX6A 3C32A 3SESA 4F19A 3RTWB 3B8BA 1YZ0A 3B6TA 3CSBA 3MVWA 1CB6A 3BIHA 1OIBA 2ABHA 5IZ3A 2ESNA 2JJKA 4PETA 2CZKA 1Y7YA 5I2KB 3A9XA 2Z23A 4RNSA 4IB2A 4O3AA 2VGQA 3OO6A 5KCJB 3G3FA 1II5A 1UIVA 3LV0A 4OTEA 5T3JA 4H6DA 3IOWA 3QYXA 4EF1A 2P3NA 3W9WA 4FAJA 5I56B 4N15A 2O38A 5FHNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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