3TELA

Lytr-cps2a-psr family protein with bound octaprenyl pyrophosphate lipid and manganese ion
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
SEYSLSVAVLADSEIENVTQLTSVTAPTGTDNENIQKLLADIKSSQNTDLTVNQSSSYLAAYKSLIAGETKAIVLNSVFENIIELEYPDYASKIKKIYTKGFTKKVEAPKTSKNQSFNIYVSGIDTYGPISSVSRSDVNILMTVNRDTKKILLTTTPADAYVPIADGGNNQKDKLTHAGIYGVDSSIHTLENLYGVDINYYVRLNFTSFLKMIDLLGGVDVHNDQEFSALHGKFHFPVGNVHLDSEQALGFVRERYSLADGDRDRGRNQQKVIVAILQKLTSTEALKNYSTIINSLQDSIQTNVPLETMINLVNAQLESGGNYKVNSQDLKGTGRMDLPSYAMPDSNLYVMEIDDSSLAVVKAAIQDVMEGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A widespread family of bacterial cell wall assembly proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule tags Transferase
molecule keywords Cps2A, Integral membrane regulatory protein Wzg
total genus 129
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03816 LytR_cpsA_psr Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.260.150 Mainly Alpha Orthogonal Bundle 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 3telA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3telA01
4IY6A 3FATA 2ALUA 2DVZA 4HCYA 4OFJA 2I58A 3TFLA 1URGA 3T9XB 5DEXA 4YB6A 1ZU0A 2XX9A 4KQPA 1GTKA 3T9VA 3TYHA 4YKKA 3VVFA 1B0LA 3PPRA 4RNSA 3KEIA 4YB5A 2DOJA 2PYYA 5DVFA 4IO5A 3K6XA 1I69A 1P99A 5FTHA 3OENA 1PBQA 1D9VA 1D9YA 2O1LA 3O2AA 4BDOA 5I58B 3ONMA 2O51A 1BP5A 4QFOA 1ZMGA 3IOWA 5H8HA 3T66A 3K0VA 5I59A 1AOVA 4U22A 2Y7IA 5DT6A 2O6AA 3FUZA 4PQJA 1JEUA 1US5A 1H43A 3MZ9A 3TEPA 2HCAA 2XXWA 2XXUA 2F34A 4N07A 1XS5A 4X1BA 1B3LA 1D3KA 3C9HA 3K1NA 1SW1A 3KOTA 3PUVE 3CIJA 2GH9A 4POWA 1MDP1 4GF8A 3JYRA 1SYIA 4AQ4A 2ZYNA 3O29A 4HCWA 1A7LA 4KI0E 5DVJA 1UQWA 3S2VA 1PDAA 3TDJA 3FZVA 1IUDA 3OO9A 2F5XA 2Y7WA 3OELA 3G7WA 1HSLA 2ANJA 5F1QA 3Q28A 4QHQA 1M5CA 1PC3A 1R1NA 2Z8EA 4R2BA 2R9JA 2I4BA 2HQ0A 3PMXA 2GHAA 2QS4A 4R9FA 4IO2A 2AYSA 2UXAA 1NNKA 3OEKA 4NEDA 1L5TA 3OMBA 5I57B 3NROA 4JB7A 1JVXA 5CM6A 1AL3A 3AXFA 3MAMA 1IITA 5ELVA 1B7UA 4QSEA 2P1SA 5JTYB 2QS1A 1YTVA 4AB6A 1LFHA 2QJEA 3IORA 4IO4A 3MVYA 3KJTA 1MQHA 4OWDA 4ZEKA 3TTNA 4MLQA 4C1TA 4JWXA 1MQIA 4IGRA 1XC1A 3D4GA 2H4IA 2Y84A 2ZNSA 3G3HA 4ESWA 5CBRA 2XXPA 3MEJA 2REGA 4TLLB 1QVSA 3IOTA 2XXIA 2G93A 4KCDA 5I56A 3K4UA 4EQ7A 3V5AA 3K1PA 4WXJA 3A3UA 3LUYA 3MWBA 1JW1A 1Y9UA 1PB9A 3GXAA 1Q1KA 3ODBA 4G8NA 5FHMA 3U72A 2Z8FA 2XD3A 1IXCA 3LR1A 1H44A 4FORA 3G3IA 1B05A 1BIYA 4EQ9A 3BBRA 4DXCA 4XIGQ 3OO8A 3DM0A 2D21A 3RQTA 3ECRA 4X48A 3PPNA 4OFLA 5FHOA 5BWJA 3RNNA 4FJPA 1J1NA 4KPTA 1SDXA 4F3PA 3O6HA 1B5JA 2QL3A 3ILTB 3MUQA 3SKPA 3OKZA 4BDMA 1MS7A 1URSA 3CSBA 2F7BA 3HV1A 2I3WA 2QSXA 5CBSA 1B7ZA 2YLNA 4Z7EA 1QUIA 1SVXB 3S4UA 5IKBA 1B2HA 3JV9A 4F2QA 1ANFA 3IR1A 2I3VA 2ONSA 3O97A 3TCGA 5FHNA 4FIMA 2H25A 2HXWA 3IB1A 3PE5A 1NMUA 5AA4B 5IAIA 4OYVA 1B3EA 1POY1 4Q5TA 4X9TA 1EH3A 2O84X 4I8CA 1Y4TA 3K6VA 1H45A 2VHAA 3C4MA 4KR5A 3IJOB 4H8IA 3TZAA 3O6GA 1XVYA 2QS2A 2DXYA 2REJA 1EZOA 3N5LA 2X7PA 4NF6B 3C36A 1P1UA 3KN7A 3LSFB 5AE4A 4PE5B 4QRZA 4ZZEA 4NF4B 1GV8A 3UIFA 1Y1MA 2ABHA 3Q27A 3W9WA 3H7MA 2DWAA 1S9TA 1DPPA 1OIBA 1ZBMA 1OVTA 1TFAA 2UYFA 1NNTA 1SW5A 1D4NA 1B1HA 1LAHE 2XXVA 4ZS9A 5EYFA 5KCJB 4LZ5A 2YJPA 3TTKA 5FTIA 3PD8A 3QUFA 3MVWA 3MC2A 3PUWE 4O3CA 4P0IA 4M4GA 3KZGA 1LFIA 1TXFA 2GHBA 3C33A 4GL0A 4F18A 5I58A 4P11A 1A40A 2ZNUA 3C34A 4BDLA 3FJ7A 2F6GA 1Y3QA 3A09A 3GZGA 3SEWA 4JWOA 4Q8RA 1LCTA 1YAEA 1R6ZA 3CVGA 1ZLQA 3KGCA 3FV1A 1OLCA 3PU5A 4JSDA 4R73A 2R6GE 1H76A 2ZYKA 3F11A 3H6VA 3MBPA 4R74A 3TODA 4ZECA 3MPKA 3M3KA 4GFRA 3RY3A 3DP8A 2DYXA 5H8QA 1AIVA 4G8MA 3K6WA 2VP1A 2V3TA 2UVHA 4H6DA 4LP2B 1S7YA 3T93B 3N26A 1M5EA 2ZXTA 2LAOA 2UVJA 5M2VA 1AMFA 2ESNA 3LC8A 4ZEIA 2F7CA 3QXMA 4HS7A 5I2NA 3O66A 3V89B 4G4PA 4NF6A 1B3HA 3VFJA 2XXXA 4I9DA 4YMBA 4R6HA 5LOMA 1P1QA 1B5IA 5EHSA 4F2OA 2PT2A 3D4CA 1P1WA 5I57A 1B1XA 2I48A 4PFTA 5I2KB 3W9VA 3PPQA 3T22A 2VD2A 3PV0E 4DCYA 4DIGA 5H8FA 4YKIA 4GOTA 3QYTA 1URDA 3MZ1A 3FVGA 4QF9A 4EDPA 3E4RA 3QSLA 4KYDA 3QK6A 4XKPA 4YKPA 3FXQA 4N13A 3T96B 1I6BA 4RXLA 1JQFA 3UK4A 1IEJA 3U92A 4IB2A 3UA8A 4LVQA 4F39A 4G77A 3FXUA 3IX1A 4GL8A 1OLAA 1B9JA 3CG1A 3OO7A 4ZZAA 1IQ7A 2THIA 3I3VA 5TP9A 1SD3A 3VLVA 2XXQA 1LSTA 1FTLA 4DE8A 1MG1A 1Y3NA 2H5YA 2XXTA 3GBAA 3KJ7A 4KCCA 1RYXA 4UA8A 1ATGA 3VE1B 5TPAB 2B65A 3QAXA 1MXXA 2DP8A 3IJXB 1JW5A 4JWYA 3KFMA 1FQDA 3MP8A 5DEXB 2Q2CA 1SBPA 3R6UA 5J1DA 1B58A 3CR9A 3K6UA 2NWJA 4UACA 2Q88A 4C0RA 2FA7A 2DWIA 3OSRA 1Z7NE 3S9LC 2OWTA 1F9BA 1B4ZA 4H8JA 2B3BA 4YB7A 4IGTA 4H5FA 3SDFA 1SYHA 3SEXA 1OMPA 2RCAA 2UVIA 1B51A 3KN8A 3OOAA 1MQGA 2ZMBA 3CFLA 1MY1A 3HPIA 4O3BA 2RKMA 3H6TA 4MF3A 4EQBA 2CMOA 1IXGA 4JDFA 4U4XA 3ZS6A 3IL1B 5L8DA 3TTRA 1B3GA 5AA1A 3EQ1A 2XD2A 3EPEA 3ZSFA 1FTOA 3CRBA 3GBBA 3VVDA 4FEDA 5B7DA 4R6KA 1CE2A 1UTHA 3RTWB 4FATA 1NNFA 2GRVA 1LLSA 2P2AA 3FGSA 4U2RA 5DTBA 1NNPA 2PT1A 4NWCA 4MBPA 5EHMA 3TCFA 1IXIA 3K01A 2HZKA 4I62A 1MY3A 4DDDA 1QUKA 4EUOA 5KDTA 2OBGA 2I0CA 4RA1A 3S9EA 1MRPA 1VFDA 1TT1A 4DLDA 5HM4B 3HHFA 1M5BA 4DXUA 3MVXA 3U8QA 3U94A 4NF5A 1MH3A 1N7WA 1DTGA 1QKBA 3EHUA 1Z7ME 1OQGA 1EZ9A 1M5DA 4LATA 5L9SA 3OEMA 1ZIUA 2F97A 4PFYA 1MPDA 2RC7A 4G68B 2NVUB 4ELRA 4R75A 1R9LA 2DE4A 1A54A 4OHNA 4KFQA 4R6YA 5JEIA 2XX7A 4F22A 1LAXA 5H8HB 3K1MA 4JXIA 2VOZA 4KYSA 4LQ5A 1NL5A 4PETA 3RUMA 3TAJA 3THIA 3WAEA 4XKRA 4F3BA 3MP1A 3BFUA 3LSXA 1DOTA 1XT8A 1WODA 2Y7RA 4RK2A 4EXKA 2PVUA 1GGGA 3MP6A 3OSQA 1FQAA 1QJMA 3EF7A 3FVKA 3RLFE 4ZE9A 3FD3A 4IO6A 3VV5A 1QULA 2HAUA 4K3FA 1B4HA 2WKYA 3MVZA 4QFLA 2B3FA 2XXYA 4R2FA 4FECA 5K2XA 4DZ1A 1SI0A 2CZLA 2P0SA 3PGFA 2A5SA 2DVCA 4MH5A 1LBBA 1N76A 3E13X 1LAFE 4JSOA 5DYHA 3V8XB 1DTZA 2AIXA 1SI1A 3E9XA 2UYEA 4XXUA 1DPEA 4U21A 1O64A 4U1OA 5ICTA 4H65A 3BKIB 3EHSA 3LSLA 1MPBA 2PMSA 2H99A 4G8HA 3UN6A 4OEUA 3USDA 4R9GA 3W15C 3O28A 5H8NB 3IB0A 1FTJA 4G68C 3G3KA 3N6UA 4OXVA 4QFKA 3G3JA 3K2DA 4ZDMA 3Q25A 1VSOA 3C32A 1USYH 1XVXA 2NUVA 2V84A 4KD5A 4YU0A 4F1YA 2RC9A 3B7DA 4F1VA 3KG2A 4O3AA 4NTLA 3RT8A 4OETA 4F3SA 4FAJA 5I84A 1UTBB 2NOOA 1FQFA 1US4A 2O1MA 4EF1A 3LBSA 3U93A 3O6IA 1MH4A 4PP0A 4MFIA 5AA3A 5KZTA 3VLWA 2RC8A 2FNCA 4OBMA 4AB5A 3M3LA 4E0XA 1ZKBA 4BDNA 1B5HA 3OO6A 2DWHA 2F35A 4WKMA 1TWYA 1QUJA 2Z8DA 1MM7A 1SW2A 3H6WA 3IK6B 3RN8A 2XHDA 3KN3A 3TMGA 3IAZA 4NE4A 3SEVA 3JZJA 4EXLA 3FJMA 2ONRA 2D5WA 4LUBA 1OVBA 2D3IA 3TTLA 5B70A 3FJGA 2IEEA 2ZYOA 4M1VA 3R7XA 2I0BA 4OESA 2I4CA 4DXBA 3QIMA 4DCXA 4L17A 4BDRA 5KCJA 3PMWA 4POXA 3PPPA 1NH8A 1P1NA 4XKNA 3RT6B 1VFEA 3TQWA 5JTYA 4ISUA 4GD5A 2X7QA 3H4ZA 1USYE 3LSWA 1RKMA 4OMBA 5CMBA 5DVIA 1BLFA 5ITOA 4YMAA 5AA2B 4OFOA 4ONYA 1B0HA 4GXSB 5I59B 4ZEBA 3HN0A 1N0TA 4ZEFA 1MY4A 2Y7KA 4PFUA 3NXHA 1A99A 3TPAA 1B52A 4NF8B 1MY2A 4QSCA 3V83A 4MLVA 1OQHA 2I6EA 2M8CA 3CG3A 4LZ7A 5AA4A 1EU8A 2QS3A 2RCBA 3PUXE 3VVEA 1MQJA 1CB6A 2W7YA 1P1OA 1A8EA 5L9MA 3TELA 1N3WA 1MXUA 2AL5A 2Q9TA 4ZE8A 1PEBA 3TKDA 2QMXA 2OCUA 1FW0A 1JVYA 1BKAA 4OENA 5A5XB 2XXRA 4YAHX 4IO7A 1PB8A 4KHZE 1Y4CA 3HCQA 3ZKLA 3K00A 4GXAA 4NF4A 2F36A 3OWQA 1N3XA 2OZZA 1NFTA 2XXHA 3R26A 4TQUQ 1LGBC 3PD9A 1GVCA 3T9HB 3RTFB 3GLBA 1O7TA 4P0GA 2HAVA 4G68A 2O7UA 3MQ9A 5HBCA 2F7AA 4ELOA 2DQVA 4GVOA 3T9UA 1I6QA 4QFNA 1QKAA 4YICA 2V3UA 3VXBA 5AA2A 5CC2A 4RYAA 1SW4A 4PFWA 3HO7A 5JK4A 1FTKA 4KYEA 2OK2A 3ILUB 3IO4A 3UP9A 2BJJX 4NF8A 5HPQA 1M5FA 2O7IA 4GIZA 2G29A 4GRKA 4YZZA 1ELJA 3FV2A 3L6GA 4ND9A 1IZ1A 3DP6A 3IOVA 4XKQA 5H8SA 3IOUA 1EZPA 1B7HA 2A5TA 1MXVA 1ZJLA 2V25A 3CFZA 4TOZA 4YKJA 4HW8A 3B6TA 1LAGE 2Q89A 1MPCA 1HSJA 3S9NC 1VR5A 1XOCA 1B40A 4H1XA 1A55A 1A8FA 5TU0A 1MXZA 4F31B 4H5GA 2V93A 1WDNA 5A5XA 4ESXA 4OZ9A 2Y7PA 3KOSA 1B32A 4EF2A 3KSJA 3VLUA 2HEUA 3TUSA 3FVOA 1WVJA 1AH5A 4XTCQ 4ELPA 3QFIA 5I2KA 4RPOA 2QPQA 3H6UA 1SQYA 3FXRA 4Q0CA 3FVNA 1BTJA 3N6TA 4U23A 5CMKA 4HTGA 1MM6A 1LBCA 4LA9A 2Q2AA 2DS9A 2VGQA 4OTEA 4QFPA 2RINA 1FTMA 2PX1A 2DE3A 1PB7A 5CI5A 2Q8JA 4Z0IA 4E0WA 3G3GA 3FIRA 3M3FA 2FYIA 1LB8A 4OEVA 3TTMA 5H8QB 1JEVA 1Y3PA 1II5A 1UIVA 2A5TB 2HZLA 3O9PA 4LQ2A 1B3FA 4FEBA 3M8UA 5ISUA 1HSEA 1Y20A 3A3CA 4U4SA 5TPAA 2Z22A 2E0SA 3DELB 4Q30B 3KSXA 3SEUA 3UGWA 5BUUA 4OVJA 2ONKE 2XX8A 1LB9A 4TLMB 2E1SA 1POTA 2Z23A 5F7VA 1IIWA 3CFXA 3WAFA 3U1OA 4C1UA 1MXWA 2UVGA 3OD7A 3SESA 3ZKKA 3CI8A 1MY0A 3EHTA 4RJZA 4H67A 3P7IA 3PUZE 2DWJA 4G2ZA 4OERA 2OJTA 3MPLA 5L9OA 1FQCA 4ZEDA 2VD3A 3B6WA 3IB2A 1S50A 2DSFA 3N94A 5H8NA 2NXOA 4F19A 1KWHA 1O63A 3PMVA 2H9BA 3Q26A 4THIA 2F8DA 3SEYA 3CSGA 1FCKA 4ECFA 5I56B 1B6HA 2V3QA 3PPOA 4OQOA 3H3GA 1R9QA 2O69A 3QUJA 1Y1ZA 1YCJA 3C35A 1UTHB 5K2YA 1RYOA 2F78A 2ZNTA 4WEDA 5CMMA 5TP9B 3VXCA 2X26A 4FE8A 3G3FA 3Q29A 4NMYA 5CMCA 3MJNA 1JETA 4GWOA 1PBPA 1TFDA 3I5OA 1NH7A 1IXHA 2O68A 1MXYA 1GR2A 4BLAA 2PBWA 5KDTB 2OWSA 1DMBA 5I2NB 3HSTA 3H06B 3DLNA 4NF5B 1FQBA 1Q35A 2KLFA 2F6PA 3C31A 5ITPA 3SETA 4GQOA 3MZBA 1N84A 4H0WA 4LONB 4RPNA 4U1ZA 3SERA 1QW0A 4JBZA 3PUYE 2DE2A 1DSNA 2R71A 3RGYA 3E3KA 4F29A 1I6AA 4N6PA 1H3DA 5H8FB 3VDFA 3MW0A 1ZTYA 1B46A 1N7XA 3TCHA 1N04A 4IY5A 5AA2D 1MDQA 4NWDA 2H98A 3FASA 5ICQA 2HFBA 1JW4A 3IO6A 2AL4A 4RY1A 4DE9A 1XHYA 4X1DA 1UIUA 4F1UA 4RK9A 4I1DA 4F3GA 1MQDA 4GLIA 3TQLA 2QMWA 1LCFA 2QRYA 5CRYA 1UTBA 3L6HA 4IO3A 2DXRA 1T0KA 2ZYMA 3EN3A 3KBRA 3H03A 3UORA 1NKXA 1FQEA 2GFEA 2YPNA 1JNFA 1YPNA 3HHGA 4WEPA 3RPWA 1LFGA 2IA4A 2OLBA 3DP4A 3K02A 1VE4A 3B6QA 4R72A 3OXNA 2I49A 4BDQA 3I6VA 3S9MC 4LZ8A 4ELQA 4QSDA 2RF1A 3BFTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2MEZA 3FATA 2DVZA 3TYHA 1IMCA 3VVFA 4YKKA 1B0LA 3KEIA 1P99A 5FTHA 1D9VA 4QFOA 1AOVA 2LYPA 3FUZA 1US5A 4N07A 3TEPA 2XXWA 2XXUA 1D3KA 3F6WA 2VPNA 1IMDA 1YZ0A 4AQ4A 2ZYNA 5DVJA 4KI0E 3OO9A 1HSLA 2FHYA 2R9JA 2QS4A 3VK0A 2AYSA 2P3NA 3KC1A 1FBHA 2XJ3A 4GBWA 4P1EA 4ZEKA 3QMFA 4C1TA 4JWXA 3A9YA 4ESWA 2XXPA 4PBQA 3IOTA 4KCDA 1FPFA 1JWLA 4MNPA 5LDZA 2Z8FA 5EQ9A 1H44A 4DXCA 1QP7A 3DM0A 2D21A 3RQTA 4OFLA 4FJPA 4ER3A 3O6HA 3ILTB 1URSA 3HV1A 2I3WA 2QSXA 4AS4A 1B7ZA 4Z7EA 2JQEA 3JV9A 4F2QA 2HPGA 2ONSA 5FHNA 4FIMA 1QPZA 5AA4B 1B3EA 1POY1 4Q5TA 1LQCA 1JFSA 4X9TA 2O84X 4I8CA 2CSFA 2VHAA 3TZAA 4H8IA 3U65A 2X7PA 4PE5B 4QRZA 5DT2A 3W9WA 1Y1MA 3Q27A 3H7MA 1DPPA 1S9TA 3K1MA 1ZBMA 5I3SA 3IFAA 2XXVA 5KCJB 4LZ5A 5FTIA 3PD8A 5EQ8A 4M4GA 3A09A 3GZGA 5DTMA 1YAEA 3KGCA 3PU5A 1FBGA 4FBIA 4JSDA 2ZYKA 1H76A 2J7UA 5H8QA 1NUXA 4G8MA 1M5EA 3O66A 2XCJA 4NF6A 1B3HA 5EHSA 1P1WA 2L8NA 5ESYA 4G61A 4YKIA 3QYTA 3FVGA 3QSLA 4KYDA 4YKPA 1I6BA 4I3EA 2LYJA 4P47A 1B9JA 3OO7A 4ZZAA 2THIA 3I3VA 5TP9A 2XXQA 4DE8A 3UFDA 4KCCA 2H5YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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