3TELA

Lytr-cps2a-psr family protein with bound octaprenyl pyrophosphate lipid and manganese ion
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
SEYSLSVAVLADSEIENVTQLTSVTAPTGTDNENIQKLLADIKSSQNTDLTVNQSSSYLAAYKSLIAGETKAIVLNSVFENIIELEYPDYASKIKKIYTKGFTKKVEAPKTSKNQSFNIYVSGIDTYGPISSVSRSDVNILMTVNRDTKKILLTTTPADAYVPIADGGNNQKDKLTHAGIYGVDSSIHTLENLYGVDINYYVRLNFTSFLKMIDLLGGVDVHNDQEFSALHGKFHFPVGNVHLDSEQALGFVRERYSLADGDRDRGRNQQKVIVAILQKLTSTEALKNYSTIINSLQDSIQTNVPLETMINLVNAQLESGGNYKVNSQDLKGTGRMDLPSYAMPDSNLYVMEIDDSSLAVVKAAIQDVMEGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A widespread family of bacterial cell wall assembly proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule tags Transferase
molecule keywords Cps2A, Integral membrane regulatory protein Wzg
total genus 129
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03816 LytR_cpsA_psr Cell envelope-related transcriptional attenuator domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.260.150 Mainly Alpha Orthogonal Bundle 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 434 Repressor (Amino-terminal Domain) 3telA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3telA01
3TFLA 3FZVA 4ESXA 1Y4TA 2YJPA 3CFZA 1VFEA 1O64A 2H5YA 3KEIA 4IGRA 3DP6A 1OLAA 4WEPA 1GV8A 3VE1B 4Q30B 3QUFA 4F3GA 1H3DA 1USYE 1QJMA 2B65A 4DDDA 1FQEA 1SI1A 3MBPA 1JW4A 3HHFA 1URSA 4I8CA 4O3BA 2IEEA 2QMWA 1B5JA 4G68C 5F7VA 3W15C 4FIMA 4ZZEA 3TCHA 3SERA 3TTKA 2REGA 2ESNA 3H6VA 2XXIA 2DXRA 4LZ5A 3I5OA 1CB6A 3LSLA 3N6UA 3IJOB 1WODA 2O68A 2F6GA 1R1NA 2Q2CA 2OJTA 4N13A 4U1ZA 4KYEA 3HV1A 4JSOA 4E0XA 4EQBA 2H9BA 1BTJA 1MPDA 2RKMA 2WKYA 2XD2A 3O6HA 3SDFA 4F2QA 1HSJA 4G77A 4FORA 2ZNTA 3RTWB 1LBBA 1B0LA 3U93A 1FTJA 3FIRA 3WAEA 1OQGA 3S9MC 3QAXA 1ZMGA 4FATA 3IO6A 3IJXB 1UIUA 4U4SA 4LUBA 4U22A 3M8UA 4FEBA 5F1QA 3VXCA 1LAHE 4M1VA 5ISUA 3H6TA 2O7IA 3JZJA 2HAUA 2KLFA 3A3UA 3O66A 3OENA 4RK9A 3RTFB 3D4CA 1BLFA 2HXWA 4GOTA 2QJEA 3GBBA 2V93A 1MPCA 4QFPA 1SVXB 2GHAA 3Q26A 3KFMA 3KOSA 1D9YA 3DM0A 4O3AA 4QFOA 2I3WA 2Y7PA 5FHMA 2PYYA 4GVOA 4G8HA 2VD3A 4GLIA 2I4BA 1XVYA 3PPRA 4IO6A 2BJJX 1Y4CA 4OWDA 3RY3A 2DYXA 5CMCA 4F3BA 4NF8A 2Y7IA 1B3GA 3PPPA 3QUJA 5I58B 4MLVA 3O97A 4JXIA 4KCCA 5ITOA 3SKPA 3BFUA 1IUDA 1EZOA 1MY2A 1IXCA 3K02A 1M5FA 1PBQA 2FA7A 5FTHA 1SDXA 3SEWA 2X7PA 1P1OA 2XXWA 3IB0A 1O7TA 2F7CA 1N3XA 4N6PA 1IZ1A 3B6QA 1Y3NA 2QRYA 3Q29A 4U21A 4F1UA 4C0RA 1DMBA 1SI0A 4N07A 3FVNA 2GRVA 1MXYA 1SYHA 3H3GA 3OO9A 4OERA 1HSEA 2XX8A 1MM6A 2Z8DA 4G4PA 3RPWA 4OQOA 1NL5A 4M4GA 5DTBA 5TP9B 4PETA 1P1UA 3FVKA 3IO4A 3VVFA 5ICTA 5KDTA 2Z23A 3OEKA 5L9OA 3R6UA 3LSXA 3CR9A 4XKQA 4JWYA 4EXKA 1A7LA 1UTHB 4PFTA 3K00A 3PMWA 4GWOA 4ZS9A 3BFTA 2QS4A 4JB7A 3QXMA 3ZKKA 4GFRA 2V25A 2QS1A 4I1DA 3OXNA 1B7UA 4KD5A 4PE5B 1URGA 4IO3A 2UYEA 1Z7ME 5BUUA 5TPAA 2P2AA 4OFLA 1H44A 4GF8A 1II5A 3MZ9A 2UYFA 3IOVA 1FQDA 3U1OA 3M3FA 4NF4A 3OKZA 1SD3A 3G3GA 1IXGA 4FAJA 2XXXA 3MEJA 2DSFA 4F3SA 4PFUA 1B32A 2VD2A 4H1XA 2V3TA 2Y7KA 3OSQA 2I0BA 3C33A 2I48A 1DPPA 1UTBA 1O63A 3K6XA 3PPOA 2HFBA 4LZ8A 3TCFA 4EQ7A 1YTVA 4K3FA 2DXYA 3VLWA 2ZYMA 1P1QA 2F6PA 3N5LA 4QSEA 1PC3A 3T22A 3VVEA 3TELA 1YPNA 5I56B 2REJA 4MH5A 1PBPA 1QKBA 2ONRA 3C4MA 4H5GA 3QIMA 1QULA 4H67A 1IQ7A 2XD3A 2QS3A 5I2KA 1B0HA 4X48A 1GTKA 4R73A 5H8HA 3TMGA 4GXSB 1S7YA 3P7IA 1B4ZA 4F1VA 1TXFA 2V3UA 3GLBA 2I58A 3KN8A 1D9VA 1B52A 1H45A 3D4GA 3V89B 2D5WA 3G3FA 1ZBMA 3OSRA 2GFEA 2XXYA 5AA2A 3B6WA 4TLLB 3C36A 1N84A 4RNSA 3PD8A 3U8QA 4H8JA 4DXCA 1EZPA 5CC2A 3OEMA 2QS2A 3W9VA 3MZBA 3PUWE 1QUKA 3ILUB 4ECFA 2DE2A 4LATA 2NUVA 1ZJLA 4BDQA 1MQJA 3MQ9A 2NVUB 1SBPA 3N26A 3Q28A 3SEUA 1A54A 1NH8A 1QUJA 3MVZA 4ZEBA 4LP2B 1RKMA 1US4A 1ELJA 3KOTA 2F97A 5ICQA 5H8QB 4F39A 1H43A 1MPBA 3T9UA 1JNFA 5L9SA 2PT1A 3S9EA 4YKKA 4RPNA 1XS5A 3CFLA 1AL3A 3K4UA 3B7DA 4ZECA 3O6IA 3V83A 4QFKA 3MWBA 1MQHA 1XVXA 3IX1A 1PB7A 4RXLA 3IORA 3MW0A 3CG1A 4F22A 2B3BA 1MXXA 1N7WA 2Q89A 3HCQA 3KSXA 3OO8A 5CM6A 4MBPA 3QSLA 3SETA 3H6WA 4HS7A 4QF9A 4F19A 3LC8A 2NXOA 1MXWA 3DP4A 4JWOA 4QSCA 3EN3A 5FHOA 4POXA 2I4CA 1MQIA 4Q8RA 4E0WA 3V8XB 1FCKA 2O69A 2QSXA 1A99A 3NROA 3ONMA 4Q5TA 4AB5A 4OESA 5I2NB 5KZTA 3TCGA 1JW5A 1B7ZA 3FV2A 3FVOA 2QPQA 1P99A 1S50A 3K6VA 4QFLA 5CMMA 3VXBA 5M2VA 4AQ4A 4H6DA 4ELRA 3MP8A 4U2RA 1VSOA 1B5IA 1B3EA 1MY1A 1JQFA 1R6ZA 4I62A 4U4XA 3C34A 3EQ1A 3PMVA 3THIA 5BWJA 1JEVA 1FQBA 2LAOA 3C35A 2X26A 5I2NA 3CSGA 4FE8A 3W9WA 1F9BA 1OLCA 4X1DA 3TTRA 1MQGA 3A3CA 2F7AA 4OYVA 3UGWA 1R9LA 1MG1A 2RC7A 3QFIA 1N04A 2DS9A 1D3KA 3TAJA 1LFHA 2D3IA 4ESWA 3K0VA 3RLFE 3LR1A 2R6GE 1DOTA 2H25A 4ZEIA 4DCXA 2DWHA 3MVYA 1Y9UA 1QW0A 3H06B 4R75A 1BP5A 3RQTA 3VFJA 2Z22A 3FXRA 1NH7A 5L8DA 2Y7RA 2YLNA 2AIXA 2YPNA 4RK2A 1LFIA 1Y1MA 3PU5A 4YB5A 4ZDMA 4YMBA 5EHSA 5AE4A 1NNTA 4C1TA 4NWCA 1IXHA 4YB6A 4DLDA 1PB8A 4I9DA 1AOVA 1SW5A 4XKRA 5AA4B 1LSTA 4ELOA 3AXFA 2AL4A 3CRBA 4IO2A 5H8FB 4F31B 4HW8A 1LAGE 4FEDA 4KHZE 5CBSA 1MXVA 1GVCA 2UVJA 4DZ1A 5CBRA 5CI5A 3FUZA 4MLQA 2RC8A 1NKXA 3EHSA 3FATA 3ILTB 2Z8EA 1BKAA 1JW1A 2O6AA 1I6AA 1P1WA 1UQWA 3KSJA 3PUYE 3S9NC 4JDFA 3U92A 1FTOA 1N7XA 3QK6A 3S4UA 1EZ9A 3BKIB 3CI8A 4R6YA 2XHDA 2W7YA 4XKNA 1LAFE 4WKMA 3WAFA 3EHTA 1LAXA 4GRKA 5DYHA 4R2BA 1DPEA 2H98A 3VV5A 2VHAA 5A5XB 4XKPA 4EF1A 5I84A 3PD9A 4R72A 2F7BA 1B3FA 3KG2A 5AA1A 1B1HA 2RCBA 3K1NA 2Y84A 4NF6A 2D21A 2V84A 4KCDA 4OMBA 5DEXA 1NNPA 4OXVA 4PQJA 1PDAA 3IR1A 1LGBC 4BDNA 4UACA 4DCYA 1B1XA 2PX1A 2Q2AA 2XXRA 4YKIA 5HBCA 2GHBA 5TPAB 1BIYA 4NF6B 5H8NB 3HO7A 2DOJA 5EYFA 3KJ7A 2R9JA 4IB2A 3TEPA 4LVQA 5DEXB 3PE5A 1TFDA 4TOZA 4YKPA 2F36A 3PGFA 2HQ0A 5CRYA 2Z8FA 4OETA 4LQ2A 5ELVA 5I58A 3TYHA 2ZYNA 3EHUA 2ZXTA 4WEDA 3TODA 1LB9A 4YMAA 1MY0A 1A40A 3OO6A 4GL8A 2RINA 1UTBB 5TU0A 4IGTA 4F2OA 2A5SA 1POTA 5H8FA 5H8SA 1XC1A 2VP1A 4ND9A 3IOTA 3MZ1A 3PPQA 4QFNA 2Q9TA 3IK6B 3I3VA 4OENA 3H03A 3JYRA 3O2AA 4RY1A 4YU0A 4NWDA 1OIBA 1WVJA 3ZKLA 4EUOA 2UVHA 2CMOA 3KJTA 2M8CA 2DQVA 2ONSA 5I59B 1AIVA 1LCFA 4DXBA 1IXIA 1UIVA 2THIA 3LSFB 4DE8A 1XT8A 4IY6A 1LLSA 1B40A 1VR5A 2ALUA 4QSDA 2UXAA 4R9FA 1AMFA 1S9TA 4OEVA 4DXUA 1Y20A 3M3LA 5KDTB 4BDLA 5I57B 4KYDA 4IY5A 5K2XA 1QUIA 4QHQA 3V5AA 3OD7A 2HEUA 4OTEA 3PMXA 1Q1KA 4MFIA 2DWAA 3FVGA 4NF5A 4OHNA 5AA2B 5I59A 1JVYA 4R6KA 2XX7A 4R9GA 2HCAA 1B6HA 5AA2D 2VGQA 3GXAA 1AH5A 3ODBA 4Z7EA 1MS7A 1M5BA 2R71A 3KBRA 4NTLA 3IOUA 1B58A 3EPEA 4THIA 2OWTA 4EXLA 4ZE9A 3RT6B 3O9PA 1TFAA 4X1BA 3VVDA 1M5CA 4R6HA 4ZEDA 5H8QA 3MPLA 1B9JA 1FQFA 2F34A 3GBAA 3MAMA 3PUXE 1JEUA 2UVGA 4DE9A 1B46A 5CMBA 1ATGA 1LBCA 2PBWA 5K2YA 3E9XA 3IL1B 2HZKA 3L6GA 5H8NA 4EF2A 2P1SA 1SW1A 3DLNA 3N6TA 1QKAA 1Y3PA 2Y7WA 2ABHA 2HZLA 3C32A 3LSWA 3ZSFA 4F1YA 5IAIA 1IITA 4ELQA 1Y1ZA 2Q8JA 3B6TA 2O1MA 4BLAA 3JV9A 2RCAA 5DT6A 1B7HA 2F5XA 3PUVE 2ZMBA 2DE4A 4OZ9A 3CG3A 1MQDA 4OVJA 3KZGA 4LQ5A 2NWJA 3UORA 1A55A 4BDRA 4LA9A 3G3HA 1B05A 3G7WA 3GZGA 2O7UA 4GL0A 2O84X 3G3JA 1XOCA 3UIFA 3H7MA 4AB6A 1GGGA 1LB8A 1MXZA 1B3HA 1Z7NE 1JVXA 4YICA 1EH3A 5KCJB 3UN6A 1VFDA 2QL3A 2ZNSA 4LZ7A 5IKBA 1J1NA 2OCUA 1OVTA 1RYOA 4ZEFA 3SEVA 4EDPA 3RUMA 5LOMA 5I57A 1B51A 2OZZA 4JWXA 1YAEA 3E3KA 3TTNA 3CSBA 4KI0E 3IB2A 5B70A 1MY3A 2NOOA 3MVXA 3SESA 3SEYA 4YKJA 4NF5B 3F11A 2FYIA 3G3KA 3OWQA 3O29A 4DIGA 1FTMA 4GD5A 5KCJA 2XXUA 4G68A 1NNKA 5HPQA 4KR5A 3DP8A 1US5A 2QMXA 3FJ7A 2FNCA 4G8MA 4GIZA 4JBZA 1EU8A 1N76A 4ZZAA 1B3LA 1UTHA 4F29A 1DSNA 3MPKA 3IAZA 1MH3A 3C9HA 4ISUA 4P11A 4R2FA 1ZIUA 4XXUA 5JTYB 2XXTA 3E13X 3U94A 4F3PA 1D4NA 1OMPA 4G68B 1FW0A 4MF3A 3T9XB 2XX9A 3TDJA 5J1DA 2OLBA 3T9VA 3FASA 4RA1A 1Q35A 4KFQA 1FTKA 5AA4A 4JSDA 5JEIA 3OELA 4H5FA 2A5TA 4NEDA 1QVSA 3CIJA 4G8NA 1FTLA 4EQ9A 1I6BA 3OO7A 2DE3A 3K2DA 4NF8B 3RN8A 4U1OA 3IB1A 2UVIA 2HAVA 4OFOA 1OVBA 4IO4A 3TTLA 1RYXA 3TQWA 2A5TB 3G3IA 2O51A 4H8IA 1SQYA 1SW4A 2I0CA 4PP0A 3Q25A 1MRPA 2I49A 1POY1 5CMKA 1N0TA 3O28A 2I3VA 1OQHA 2OK2A 1WDNA 3O6GA 3R7XA 3FD3A 1R9QA 2VOZA 5DVFA 5L9MA 4BDOA 1NMUA 4PFYA 5HM4B 4FECA 3CFXA 1Y3QA 3FJGA 4RPOA 4KYSA 5I2KB 1CE2A 2G29A 3K1MA 1P1NA 5DVJA 3UP9A 2AL5A 3PPNA 1FQCA 2H4IA 3KGCA 3QYTA 3FV1A 3U72A 1MXUA 1B4HA 1ANFA 3H4ZA 3E4RA 4L17A 3MVWA 4O3CA 4UA8A 4Z0IA 3TKDA 1ZKBA 4NE4A 4HCWA 3RGYA 3HSTA 1B5HA 2XXHA 3UA8A 4H65A 1L5TA 1TT1A 3K6WA 2F78A 2PMSA 1MY4A 1DTZA 3FXUA 4KPTA 4NMYA 4YZZA 1IEJA 1I69A 4POWA 3K6UA 2E0SA 3A09A 3FXQA 4GQOA 1JETA 3TQLA 3VDFA 1B2HA 2XXVA 3BBRA 1DTGA 3HN0A 3H6UA 4NF4B 2DP8A 3TZAA 5JTYA 2X7QA 1VE4A 1YCJA 4IO7A 3EF7A 3Q27A 1TWYA 4PFWA 1I6QA 3T93B 2XXQA 3RNNA 4ZEKA 1M5EA 1XHYA 1NFTA 3HHGA 2CZLA 2I6EA 2ZYOA 3OMBA 4R74A 4RYAA 1ZU0A 1LFGA 1LCTA 1MM7A 3NXHA 2P0SA 1HSLA 4OEUA 4QRZA 4XTCQ 5FHNA 3ZS6A 3L6HA 2DWIA 2H99A 4IO5A 3T66A 4C1UA 1M5DA 5I56A 5ITPA 2IA4A 2AYSA 2RF1A 1NNFA 3T9HB 2OWSA 3ECRA 2B3FA 3PUZE 3VLVA 5A5XA 4ONYA 2V3QA 3FJMA 3DELB 3MC2A 4LONB 5H8HB 2Q88A 2E1SA 3TTMA 4H0WA 3K01A 3MP6A 4XIGQ 3KN7A 4YAHX 3KN3A 2GH9A 3M3KA 1FQAA 4RJZA 3N94A 4BDMA 3VLUA 3HPIA 2PT2A 5TP9A 1KWHA 2ZNUA 4P0IA 5EHMA 2DVCA 3TUSA 3TPAA 2O1LA 4ELPA 3S9LC 3T96B 1PEBA 2DWJA 4HCYA 5FTIA 2XXPA 1MDQA 2F35A 1URDA 5B7DA 5AA3A 5JK4A 2ANJA 1A8EA 1PB9A 2F8DA 2PVUA 3RT8A 4Q0CA 1A8FA 3SEXA 4OBMA 3CVGA 2ONKE 3MJNA 4F18A 4ZE8A 1MH4A 1MDP1 1ZTYA 3MUQA 3IOWA 4TQUQ 3UK4A 4OFJA 1GR2A 3R26A 1ZLQA 3LBSA 1T0KA 4FJPA 5DVIA 1SW2A 3C31A 2DVZA 2ZYKA 1N3WA 3USDA 3S2VA 2G93A 4U23A 2RC9A 3I6VA 3OOAA 4KQPA 4TLMB 4WXJA 4X9TA 4GXAA 4HTGA 3LUYA 4G2ZA 3FGSA 1H76A 2OBGA 3PV0E 1SYIA 4P0GA 3MP1A 1USYH 4YB7A 3K1PA 1IIWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2LLVA 3TFLA 3FZVA 3E78A 2YJPA 3CFZA 1VFEA 2H5YA 3DP6A 4WEPA 4F3GA 2B65A 1SI1A 3MBPA 1JW4A 2IEEA 2QMWA 1B5JA 3TTKA 4LZ5A 4MAGA 3I5OA 1WODA 4U1ZA 2Q2CA 3BD1A 3HV1A 1BTJA 2RKMA 2WKYA 1NI9A 1O4XA 1FTJA 3FIRA 3QAXA 3IJXB 1WIZA 2IUOA 4U22A 4RK9A 3OENA 2QJEA 3GBBA 1Y9QA 3DM0A 2I3WA 2PUGA 4GVOA 4GLIA 1MFQC 1XVYA 3PPRA 2DYXA 5CMCA 4F3BA 4NF8A 2Y7IA 3QUJA 3R1FA 4KCCA 5ET5A 1M5FA 1PBQA 2X7PA 1P1OA 4JVCA 3IB0A 1SI0A 1SYHA 2XX8A 1MM6A 3D1NI 1RDXA 4G4PA 5DTBA 4PETA 3FVKA 3OEKA 5L9OA 3R6UA 4PFTA 3K00A 5A7LA 3BFTA 2QS4A 4XEQA 3ZKKA 1NV4A 2QS1A 1B7UA 1URGA 5BUUA 4OFLA 1H44A 3MZ9A 1FQDA 4NF4A 3OKZA 4FAJA 5ET8A 4PU3C 2DSFA 2VD2A 4PTKA 2LYRA 4LZ8A 3K6XA 1O63A 2DXYA 2ZYMA 1P1QA 1NV5A 1CQTA 1YPNA 1FJ6A 5DSXA 1QKBA 2H8RA 2ONRA 4H5GA 3QIMA 1QULA 3P7IA 4F1VA 1TXFA 3OSRA 2XXYA 3B6WA 4TLLB 1N84A 4RNSA 2BJIA 1EZPA 5CC2A 4HE0A 2NUVA 1MQJA 3MQ9A 1A54A 1QUJA 4X4EA 1H43A 1NUXA 2HCNA 3T9UA 3DM5A 4J1XA 1XS5A 3K4UA 1POUA 3MLFA 1LBWA 3O6IA 4QFKA 1QP4A 1XVXA 2B3BA 3OO8A 1N7WA 3KJXA 1RZSA 3QSLA 3GBFA 3H6WA 4P1EA 2YBDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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