1B31 | Genus

Total Genus 130

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	130
sequence length	302
structure length	302
Chain Sequence	EASVSIDAKFKAHGKKYLGTIGDQYTLTKNTKNPAIIKADFGQLTPENSMKWDATEPNRGQFTFSGSDYLVNFAQSNGKLIRGHTLVWHSQLPGWVSSITDKNTLISVLKNHITTVMTRYKGKIYAWDVLNEIFNEDGSLRNSVFYNVIGEDYVRIAFETARSVDPNAKLYINDYNLDSAGYSKVNGMVSHVKKWLAAGIPIDGIGSQTHLGAGAGSAVAGALNALASAGTKEIAITELDIAGASSTDYVNVVNACLNQAKCVGITVWGVADPDSWRSSSSPLLFDGNYNPKAAYNAIANAL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Family 10 xylanase
molecule keywords	PROTEIN (XYLANASE)
publication title	Xylan binding subsite mapping in the xylanase from Penicillium simplicissimum using xylooligosaccharides as cryo-protectant. pubmed doi rcsb
total genus	130
structure length	302
sequence length	302
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	1998-12-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1b31A00

2XFYA 4TOQA 2JALA 1V6YA 1W1PA 5GNZA 2ZXBA 1MQPA 2FH6A 4N42A 1MXGA 4PMXA 2BVTA 2VRJA 5IFPA 4C7DA 4QDMA 1UH3A 2BHUA 4UOQA 1OIMA 1PZ2A 3CZLA 1ZBKA 4PMVA 5LA1A 1V0NA 4WKFA 4UNIA 1XSJA 1V6XA 3WL1A 1E71M 1C7SA 2VX5A 4HA3A 2J7HA 1HX0A 3ARZA 4DUVA 5BXSA 4PMNA 3VMOA 4A3YA 2CHNA 1TCMA 2WC7A 2XGIA 3MMUA 3PZTA 3CZGA 1TE1A 3AFBA 4U33A 1OBAA 1FOBA 1G94A 2FGZA 1C90A 3A4XA 3N04A 5CLTA 4B9ZA 1CGXA 3ARSA 3B9AA 1ZB5A 4CD6A 3WMCA 1KGUA 2WLYA 2RGLA 2CXGA 3OLEA 1GPFA 3CH9A 3LPPA 4WF7A 3NSNA 1YQ2A 2V3EA 5A95A 3KWXA 2W91A 4E8DA 1CXEA 1GQKA 4CN4A 2J7FA 1ODUA 2A3CA 1VEPA 4HP5A 4DWSC 4LXFA 3SCWA 1GQIA 3K8KA 4UOZA 4TUFA 3RM4A 2W62A 3WFZA 2XYLA 1B1YA 3ZJKA 2J62A 2G8ZA 3VM7A 3MMDA 1RPKA 2BVDA 4BA0A 1VBUA 3BH4A 2CITA 1D3CA 3OG2A 4N0RA 3U5UA 1JYXA 3MSDA 3M7SA 3SCNA 4AZGA 5CG0A 1CZ1A 4TXEA 4D6JA 1BFNA 1E5JA 4CKQA 2WANA 3T09A 1J0IA 3VX1A 5BXRA 1GVYA 2WCAA 2NT0A 4GI9A 4BQ2A 4MJ2A 3AYRA 1E0WA 2XJ7A 5M17A 2X05A 3VGHA 2PWFA 2UY5A 5I79A 4P7OA 2QPUA 5HXMA 1E6SM 1HJSA 4TVUA 3I3BA 5CPTA 1JYWA 3W37A 4J28A 2WWDA 3TP4A 1VFOA 1V08A 3CLWA 3IAPA 3JUGA 2D24A 4CN6A 5GPRA 3WDIA 2PC8A 2WK2A 4AD4A 4CD7A 1FH9A 2WCGA 1Z32X 5AY7A 1AQHA 4HMCA 3IK2A 3GNRA 2BXZA 2BY0A 1KCLA 4LX4A 1E56A 3ZOAA 5ECUA 5KEZA 2WPGA 3DHPA 4J27A 1J0ZA 2OSYA 3NYDA 2Z1KA 1CEOA 4OBRA 3N13A 5BXTA 1F4HA 4B15A 2XIBA 1K9DA 3VNZA 2WZIA 4GO8A 4P7QA 2WHMA 3WDPP 4HA4A 5A6BD 3WDRA 1MW0A 3RJYA 1CECA 3RIKA 3OGSA 1A47A 1C8XA 1UH4A 5I0DA 2J74A 2D0FA 4KGJA 3THDA 3M6DA 3S2CA 1E5NA 2O9TA 1VEOA 5GQBA 3WNOA 4NSBA 4P8WA 5A6AA 1UR1A 1UWIA 2FHCA 1BYAA 3RDKA 1JL8A 5A6JA 5I23A 3IJ7A 2F2HA 1FHDA 1OT1A 1VBRA 2XWEA 4ATDA 1DP0A 4JL1A 3GH7A 2JE8A 4MNKA 3WF2A 2YDQA 4R27A 2CBVA 5M03A 5DT7A 2G3MA 1XRVA 1HXJA 5A6KA 1KXHA 2YKKA 3WF3A 3VNYA 2CNCA 2EBNA 3L4UA 4P8VA 1AMYA 3BAXA 3AHTA 2ZICA 2WSPA 2FGLA 3UERA 3NDYA 3T0BA 1HKIA 1PAMA 3OIHA 1VEMA 3EDDA 3AXHA 1GQJA 1QI2A 5D9MA 2C7FA 1FFQA 3BCFA 3GBDA 2V3GA 3WD0A 1TZ7A 3CTTA 3A4WA 2VURA 1UD6A 2YL5A 3CZEA 1B3WA 3BGAA 2Z1SA 1OD0A 3OGRA 4XV0A 5I6SA 1JYNA 4QP0A 2CBIA 2B31A 2QLYA 1FHLA 3WNLA 4BF7A 1B31A 3D3AA 3PZVA 2CKSA 3N12A 1WDPA 1CGTA 1UQYA 4PRWA 1W3KA 3VPLA 1CBGA 2X0YA 1CXHA 1UOKA 3K1DA 3WMSA 5JIWA 1V0KA 4WKHA 3CMGA 2FDMA 3MUY1 3L4VA 4UQDA 4U3AA 2ZX5A 3WEMA 4HOXA 3SUSA 1NWUA 4W5UA 3VM5A 4HMEA 2DGAA 4EK7A 3WDHA 3AHYA 2GDVA 1GCYA 5CZKA 4A3HA 1VENA 3CO4A 5CPQA 1UZ1A 4JFTA 3AIRA 1JAKA 4F66A 2GVYA 3ZO9A 3OBAA 4B3KA 3GH4A 5A2CA 4D6CA 2VRQA 3WF1A 3HMCA 2C0HA 5HOSA 1UD4A 3WBEA 1K9FA 2D23A 4F9DA 1NP0A 3WUEA 1E0VA 3K8MA 4WKAA 1J0JA 3UCQA 1HJWA 4J3VA 3AHZA 2PWDA 4D72A 1JD7A 1QW8A 4Q22A 1E4IA 2WVVB 2EXOA 3WUBA 3WNMA 1GOMA 4GIAA 3WD4A 7A3HA 3EMCA 1JI2A 3WIJA 2D22A 3SUUA 2WZHA 3AIQA 3VMPA 4NI3A 2F61A 4YPJA 1F4AA 2G3NA 3ZJ7A 1LQ0A 3N15A 3QHOA 1OCQA 2ZXAA 1H49A 1EDGA 4C7GA 1XSIA 3EMQA 2WNWA 1OSEA 1PX4A 1J11A 2ZUWA 4AEEA 3BSGA 3EBVA 3AHVA 3VGBA 1JFXA 1X1NA 1PZ3A 4TX8A 4OBSA 1JYVA 3EMZA 2PWHA 4UCFA 1G01A 4RE4A 3QOMA 3CUJA 3NSXA 2CKRA 2YDSA 4KMQA 2BY1A 2W63A 4OKDA 4R5EA 3VDCA 3O2LA 3WFLA 2PF0A 2VZTA 1ESWA 1JD9A 2BFGA 1CNVA 3BLPX 4H8VA 4ATWA 4MDPA 3LPGA 5IDIA 2XHYA 1ISYA 1M04A 2O9PA 5IFTA 4M29A 3VIPA 2J7EA 2V38A 1CTNA 2PBOA 4K68A 4HOZA 4AZIA 1WZKA 1B9ZA 1KR0A 3PBGA 4AD0A 2G3JA 4GZIA 1J0HA 1LLOA 3ZR5A 2BVYA 1AVAA 1WDSA 4AZBA 1U33A 3AI0A 5EB8A 1QNQA 5FKYA 2J75A 2DDXA 2YA2A 3GNPA 1CGWA 1CYGA 3BAYA 3NDZA 4JCMA 1CLVA 3FNDA 1O7AA 3GYCA 3FW6A 3MANA 4JHZA 4H2CA 5M3WA 3VDAA 3BAKA 4JFUA 1XSKA 1UD5A 5A6BA 3CHFA 3UG4A 3ARXA 2AAAA 3ZT7A 5HPOA 1KWKA 3W24A 1E70M 3B8SA 1KFWA 1XYFA 1EGZA 1EH9A 2VJXA 3AIBA 5A2BA 4D6IA 4WLCA 1HJQA 3ARYA 4PMUA 4QCFA 3UG5A 3ARVA 3CHDA 1GOWA 2J78A 1KBBA 3N9KA 3TONA 3UETA 2V5DA 4IUGA 1LF1A 9CGTA 1W9XA 1PEZA 3VIHA 2WBKA 4J3UA 4U2YA 1QBAA 3NJ3A 2WVVA 1ZL1A 3KL5A 2VOTA 1ZU8A 2A3BA 4DM1A 3W29A 4JAWA 3E1F1 4H7VA 2CEQA 2WLZA 1TFVA 1V0MA 1JNEA 2F8QA 4IPLA 4X0VA 1GQLA 1WO2A 2VRKA 2RGMA 1IV8A 4M82A 4ACZB 3W28A 4JKLA 2EQDA 3THCA 1LG2A 2ZX8A 4JKKA 3MKKA 2OWWA 1LWJA 2CIPA 4UQ9A 3M07A 4D6DA 1JNDA 1U30A 3DECA 8A3HA 2W61A 1KR1A 3K8LA 3SUTA 3W81A 1G9HA 1HKKA 3L2LA 4W89A 1UR0A 4QLLA 1JIBA 2GSJA 3WUGA 3GDBA 3A6OA 4GZEA 1JI1A 4UFMA 3OLIA 1R8LA 3VD5A 3MUAA 4XB3A 2WZEA 5I3DA 4EANA 4HPHA 3VIIA 2XG9A 3DYPA 1B3VA 1HJVA 4FLSA 3ARTA 1QHPA 2GFTA 4TVCA 1WNOA 4DUXA 5A8QA 3G6MA 1KXTA 3S6TA 4CD4A 1GOIA 1XV8A 3B9DA 2A3EA 1NQ6A 1R7AA 2VT0A 2FHBA 3RPMA 3ALFA 1NOFA 3G6LA 3AZRA 3L4WA 2D0GA 1HT6A 4U5KA 3WEOA 3CPUA 4HA1A 4UFIA 3WH7A 3QHNA 2YL6A 3GH5A 1WAWA 1UA7A 3U5YA 2VX6A 3II1A 1KWGA 1OGSA 2DH3A 4LYQA 1WDRA 5FIPA 3EDEA 4UFKA 3CUIA 2WMIB 4FMVA 2Y8KA 1B2YA 3A3HA 3BXWA 1GNXA 1LJYA 1J0KA 3WNPA 4MB3A 5D8ZA 1NWSA 3IJ9A 2JF6A 1ZBWA 3AMLA 4M8UA 4AD2A 4PSRA 3VIOA 4KH2A 3AMCA 4FLQA 2W4XA 3WUFA 2QV4A 2VVSA 1VJSA 3WD3A 4PTWA 3O9NA 1MQRA 1VF8A 1LG1A 1HL8A 3AS0A 5I2UA 5CSUA 2WM0A 3AICA 1TVNA 1QI0A 2J7CA 4FF5A 4J7RA 4WIWA 4UTFA 1RP8A 2IXUA 4U5IA 3UG3A 1BG4A 3DYOA 2W66A 2QF8A 3ARQA 1NWRA 3QR3A 5ABHA 1E3XA 1E72M 4CVWA 2VZOA 1R87A 2V3FA 1CPUA 3FY1A 4ACZA 2GK1B 1QI3A 1ZBCA 4D6HA 1GJUA 1PX8A 1H4PA 3WQ6A 2ZX7A 2J7BA 3NIYA 1XD1A 3RCNA 2UWFA 4CGTA 1R7OA 2JFEX 1ISVA 3BSHA 2WKGA 2YA1A 4UOJA 4GQQA 2WMHA 1DHKA 1UWTA 1KQYA 3NCOA 1SR0A 2O9OA 6A3HA 1GOOA 4AIOA 3MUIA 2WMFA 2ZUUA 3PZOA 3WH5A 4B16A 3W38A 4HTYA 3WELA 4YHEA 1E1FA 3DYMA 4OOUA 4PSPA 1D7FA 1KXQA 2ZOXA 1E0XA 3OLGA 1W3JA 4D1JA 2VZSA 4W7WA 1NWTA 4Z2IA 4M24A 2WMJA 3EDKA 1FH8A 4J3WA 2D0HA 3FHQA 3PZQA 2ZWYA 4PUEA 1HNYA 4V2XA 4MNLA 1DEDA 5HPCA 4LGXA 1EA9C 4BQ3A 5IXEA 3PTQA 3VGEA 1E40A 2VX7A 2WCSA 2WAGA 4MDOA 2YDRA 1JZ6A 3D5HA 2EPLX 1JGIA 5F7UA 4PCTA 1I1XA 1L8NA 3PHAA 1TA3B 5LYRA 2J7GA 2WMIA 3SEPA 4RE2A 1CGYA 1MWOA 1CIUA 4LPCA 1V6UA 5IHSA 2BXYA 4Y7EA 1BLIA 2TAAA 4JHOA 3POHA 1E6RA 1B3XA 3U7BA 3OZOA 1GJWA 3IANA 3AZSA 2BHYA 1XCXA 3ECQA 5JBFA 1UR2A 4GXPA 2ZWZA 4MADA 4XX6A 4AWEA 1SMDA 1KB3A 4CD8A 1W9DM 4AW7A 3L4TA 3ARRA 2QMKA 3HN3A 2CERA 4LYRA 1BG9A 1EXPA 4CU6A 3VIMA 1V0LA 4CD5A 3W6MA 1UR4A 1QBBA 1XCWA 2QMJA 4W7VA 4CCDA 2GK1A 1KQZA 1E3ZA 2D3LA 3ARPA 5D4YA 3AMDA 4EKJA 3VGGA 4UZSA 1TG7A 2Y5EA 1AQ0A 3BAJA 1W3LA 4MAVA 4M56A 4DWSD 2VCCA 4UQBA 2A3AA 4W85A 2PBGA 4ATLA 1V02E 2GJPA 1V3KA 2XWDA 2O9RA 2OWXA 5ABEA 2W92A 1HF6A 4ZXOA 1VAHA 4TVDA 2DSVA 4KRUA 2BHZA 1GUVA 3UEQA 1WZLA 3CUFA 3FHAA 1JDAA 2DT1A 3LMYA 1TR1A 1GOKA 5A6LA 2YOCA 4AZ6A 3MMWA 3PZUA 1HIZA 5D9OA 1DWHM 3L4XA 5GNXA 2YBTA 4BQ5A 1Q6FA 2Q8XA 5C70A 1QW9A 1WZMA 4D1IA 4M80A 2ZUTA 4GO9A 3VIKA 1QNPA 1VFMA 1OINA 1UZ4A 3GXMA 5CXPA 1E55A 1DTUA 4GPNA 3AS3A 1UWSA 3ZMRA 2MANA 3RO8A 2QHAA 1OGGA 5D9PA 1MFUA 4A4AA 4MNMA 5E09A 4V28A 3F4VA 4W8BA 1JZ3A 1PX3A 1B0IA 2OLHA 1W3HA 3AZTA 4ZXLA 3ZJ8A 1TA3A 2E9BA 1QNOA 4CU7A 5A8MA 3F5KA 4MNJA 3TTOA 3CUHA 3AMKA 2WMGA 1OB0A 4NZCA 4TTGA 4ZFMA 2J8GA 1OWQA 2ZIDA 3GXDA 1J01A 1JAEA 2Y8VA 1X6LA 5CSYA 1UWUA 1QHOA 3AIUA 4KGLA 1UKOA 2J8FA 1EDQA 5FD0A 1HVXA 2WB5A 2Y4SA 3AROA 4D6GA 2EPOA 2CHOA 4PMZA 2YL9A 4S3JA 1TVPA 4UZUA 1QNRA 1US3A 1PIFA 1C8QA 2XVGA 5DT5A 3AHXA 1GHRA 5E0FA 4B3LA 4XUYA 2QPSA 5TD4A 3F5LA 1DWGM 5DO8A 4PCSA 4UQEA 2ZUSA 3SCQA 1ITCA 3VTRA 2W67A 3WD2A 4AEFA 4W86A 4XZWA 1DWJM 1QOXA 4BZYA 3OZPA 1CXLA 1E6NA 3SIMA 2G3IA 4AD3A 4DWSB 2V3DA 1LWHA 2CETA 4CU8A 1WCGA 2IUZA 1FFRA 2WHLA 3KEHA 4P7NA 3CUGA 1G5AA 1JXKA 4D6FA 1UR8A 3VILA 1I1WA 3WKZA 4QAWA 1QI5A 3EYPA 1IZKA 3VVGA 1E6PA 1US2A 4W87A 3KZSA 3CMJA 4NRRA 1H2JA 1CLXA 1EOMA 3AIVA 3UR8A 4UQAA 1VB9A 4DM2A 1Q6DA 4WK9A 3GTNA 1MW3A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4NRS A;  3PWA A;  3ALG A;  3E5P A;  1B30 A;  3F5J A;  4KRT A;  3TLL A;  4CCZ A;  5G4H C;  3G8E A;  4E2O A;  3LHU A;  4HJW A;  5EMY A;  1EJV C;  4NX0 A;  7ODC A;  4IME A;  1R85 A;  2ATM A;  1L8P A;  2NQ9 A;  3KDO A;  3NSM A;  1Z8A A;  4KER A;  3BG9 A;  4QLJ A;  1PJ9 A;  3KAO A;  2ZBT A;  4XTD A;  3HF3 A;  3I3D A;  2PP1 A;  4TQT A;  2C19 A;  1ONE A;  5A8P A;  3UZJ A;  5C2G A;  4KFO A;  4DBE A;  2E9M A;  1EJS C;  1Q4N X;  2GJX B;  5ECV A;  2WXD M;  3RM8 A;  3C2Y A;  1E4M M;  3WDJ A;  3PBY A;  1KCK A;  3PZN A;  1C93 A;  3OO2 A;  4ZMG A;  1CGU A;  3RR4 A;  2PU0 A;  4OJY A;  1V03 A;  3NPU A;  2Z27 A;  3DEN A;  3W4R A;  1WBJ A;  1P6C A;  4M1B A;  2RKX A;  3MHG A;  1QPK A;  1XIN A;  5HWM A;  2WC4 A;  3FIG A;  3WBA A;  3MU7 A;  2ZX9 A;  1VRX A;  3H53 A;  2E8Z A;  3G0X A;  1YTE A;  1V3M A;  4L4M A;  3WNK A;  1H09 A;  1V7A A;  5AYI A;  3USZ A;  1XH0 A;  1H3G A;  2TSY A;  3RM9 A;  1VFT A;  3LTY A;  3VZZ A;  1F74 A;  3MUZ 1;  3MBF A;  4H41 A;  3FEM A;  5BCA A;  1S2T A;  4H00 A;  2R24 A;  3CWH A;  2NX3 A; 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1B31A

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Chord Diagram

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