4A3UA

X-structure of the old yellow enzyme homologue from zymomonas mobilis (ncr)
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
355
structure length
355
Chain Sequence
PSLFDPIRFGAFTAKNRIWMAPLTRGRATRDHVPTEIMAEYYAQRASAGLIISEATGISQEGLGWPYAPGIWSDAQVEAWLPITQAVHDAGGLIFAQLWHMGRMVPSNVSGMQPVAPSASQAPGLGHTYDGKKPYDVARALRLDEIPRLLDDYEKAARHALKAGFDGVQIHAANGYLIDEFIRDSTNHRHDEYGGAVENRIRLLKDVTERVIATIGKERTAVRLSPNGEIQGTVDSHPEQVFIPAAKMLSDLDIAFLGMREGAVDGTFGKTDQPKLSPEIRKVFKPPLVLNQDYTFETAQAALDSGVADAISFGRPFIGNPDLPRRFFEKAPLTKDVIETWYTQTPKGYTDYPLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords NADH\:FLAVIN OXIDOREDUCTASE/NADH OXIDASE
publication title Crystal Structure Determination and Mutagenesis Analysis of the Ene Reductase Ncr.
pubmed doi rcsb
source organism Zymomonas mobilis
total genus 132
structure length 355
sequence length 355
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4a3uA00
4JY9A 4DO4A 4TMBA 3SJ3A 2OX1A 2H3BA 4JDBA 1VHCA 1BEUA 1EPXA 2ZTKA 3M9YA 5KSWA 3LHYA 3TR2A 1YADA 3VE9A 3THAA 1TSIA 3DFSA 1AW2A 2GQ9A 3LTPA 1TPWA 4Q4KA 4LVDA 1GVRA 3NZ1A 1H5YA 1DORA 1JUBA 3HGJA 3HG2A 3BGJA 2CW6A 2YR1A 3P82A 4RXFA 3TH6A 3W1NA 3EEGA 1W54A 4IUOA 4N9DA 3NL2A 2EKCA 4DELA 4X2RA 3P84A 1H62A 5AHIA 1Q45A 2Z6JA 1W31A 2GUUA 3LB0A 5I3HA 4Z1BA 1H7NA 5I3FA 1NFBA 2J9ZA 4L4LA 1J2WA 1GJPA 3EXRA 5D2VA 3LBMA 5AHFA 4Z0JA 4UFIA 3NXFA 3O16A 1GPWA 3S5NA 2C6QA 4HSNA 1SZEA 5TBOA 3UWVA 2BWGA 3B06A 2ZTJA 4UR8A 3WK3A 1H1YA 3GKAA 3MP5A 2Y6ZA 3NQVA 5F1UA 1CI1A 2V9DA 4QISA 3SGZA 1EP2A 5CZSA 3KVJA 4O0KA 4FF7A 4M5PA 4WXYA 3WJYA 1F6PA 3STEA 1SZGA 4RCXA 2C18A 3GDTA 1TV8A 1EA0A 5CZTA 2Y7GA 2YCEA 5FEWA 1SO6A 4CNOA 2ZFAA 3LX9A 4LU0A 4UTIA 4MFEA 3W7NA 2NV2A 3O06A 5D2WA 3C0JA 1Q3NA 4YLWA 1SO4A 2V8ZA 3QC3A 3T4CA 3TROA 2B4GA 4CQ8A 3DKJA 4NXSA 4CNNA 3NGJA 1W8SA 3STCA 4QNEA 2JKEA 3C2RA 1A5SA 3QQ1A 4O16A 1WBJA 3F1QA 1JCXA 5D2TA 1YXCA 3W1UA 1QAPA 3G1VA 4BWLC 1GEQA 4GJ1A 4PFMA 4CNPA 5K9DA 4XWUA 5E1QA 1XBXA 2CWNA 2VFGA 2P0OA 1KM1A 5HR6A 3SIZA 3RNDA 1BWKA 3DFQA 3NL3A 4XUGA 3W1LA 1SO3A 4PODA 3MI3A 4O53A 4Y90A 3JS3A 3M5XA 4TIMA 2CFFA 3LCHA 1F6KA 3W84A 1WA3A 3GLCA 1PVNA 1W5NA 1SZFA 1ZAHA 4GBUA 4PA8A 3NL5A 1ICQA 1TTPA 4Y8FA 3LCWA 4K38A 5C2XA 2A2IA 3GYEA 4TMCA 1G7UA 3DXIA 1KBIA 1TJRA 5I3IA 2Q8LA 2YXGA 5F2GA 4FNSA 3RK8A 1GQNA 2WNZA 1A5CA 1OFOA 5KZDA 3UPBA 1LORA 5K9CA 4O50A 5I3GA 4GC4A 3PB2A 3R89A 5H2ZA 3NYZA 2TRSA 2JKAA 4GNJA 2QAFA 2R8WA 5CSRA 4QIUA 4K6AA 3MI6A 1Y0EA 1HO4A 1EB3A 5DCBA 1NVMA 4IQLA 2ZRYA 4K8HA 1H7WA 3WK0A 1O94A 1L6YA 1MEHA 4JD4A 5ABTA 3ANYA 2OCZA 2X1UA 2ZA3A 3PB0A 4QQ3A 4HPJA 1WDWA 2A6NA 5CZJA 7TIMA 2CLMA 2J9XA 1W5OA 1JCYA 5AFDA 3TQ0A 1XC4A 4WUIA 1N55A 5D04C 3GR7A 2QJIA 4UTMA 1JQXA 3UXAA 3W1AA 3QRHA 1OFEA 1ICPA 1ZAJA 1OFDA 3L65A 2AAMA 3A24A 1VQTA 3Q2DA 4UFKA 3SSJA 4O4VA 1ZJIA 2DORA 2J24A 3ELFA 4TX9A 4BFAA 2Y7FA 4I7WA 3ABSA 3CTLA 3NQ8A 3F4WA 4AXKA 4UMBA 3M47A 3EWZA 3EWWA 5LNUA 2VELA 3RLVA 1LBLA 2RDTA 2X2GA 4I9AA 4YMZA 4H4IA 1YDNA 3JR2A 2J27A 5BNKA 5FF4A 5D09A 2Z1BA 4JX5A 1FY6A 3CC1A 4PTNA 1MXSA 1OX4A 2E68A 3O05A 1F76A 1K8ZA 1F05A 1YLVA 3KRUA 2GJLA 3Q37A 3YPIA 1OABA 4I7VA 4YL2A 2QCDB 4Y9AA 2CLLA 4NNAA 4XTDA 2EPHA 4UR7A 1LROA 2ZZ3A 5BMWA 4O11A 4LUIA 2JKPA 1SQ7A 4BWLA 2QCGA 3PSVA 4H6KA 1RZMA 3HPSA 1VPXA 1K02A 3DFPA 4X3ZA 3BVJA 5A5WA 4X22A 3M43A 4E2BA 3IIXA 4PH6A 5HMSA 4DQWA 3RLUA 3CM4A 5G2IA 3TJXA 1KTCA 1PS9A 2YFOA 3S9YA 3WK1A 5DCDA 3W3OA 5CKSA 3PUOA 4JNMA 3W2UA 3S5YA 4FO4A 4OT7A 4DPPA 1GVQA 1TTIA 3DFNA 3W1MA 1YTEA 4N4QA 3CIXA 2RKXA 3NQDA 5G2WA 2EGZA 5F4SA 2E5BA 3DBPA 3LHVA 3MP4A 2V5BA 3DFTA 1W37A 1GOXA 1UBSA 1ZHAA 2ZBTA 5LHEA 1KTNA 1LOSA 4HN4A 3G0UA 3C3NA 3PUDA 5KZMA 1F73A 4S1FA 4ZMGA 3A9IA 4CCEA 3G0XA 5BRBA 3HIJA 1H7RA 3P67A 4MLRA 1P4CA 2QR6A 1X6UA 1M7OA 5SWUA 3BW3A 5AYYA 4GUIA 1AMKA 1OHLA 3TAKA 4TO8A 4FIQA 3O6YX 4UTTA 5FI8A 4ZQPA 4O10A 4JTSA 5HINA 1LBFA 1WAUA 3GVGA 4EWND 5BMXA 3NPUA 1IXPA 3LXBA 5K4ZA 2EAWA 5GVJA 4JR5A 4FX7A 2GVLA 1CX9A 4IGHA 2R94A 3WJWA 1W1ZA 5D37A 3G3DA 1TPC1 1ME7A 4WY0A 4X9SA 3S1UA 1RD5A 4IMEA 4PL2A 2WSQA 3W07A 3NNTA 3MHUA 4O1CA 3SFKA 4HKPA 4HPXA 1WQ5A 2Q8ZA 1RVGA 1O60A 1OX6A 3W87A 3R5EA 3MBFA 3EXSA 3MYOA 3G1HA 4UIOA 3STGA 2DZUA 2FPTA 2VEIA 3ATYA 2E1DA 4ZQRA 1GG1A 3VI2A 5HWMA 3LOTA 3DHFA 4JTTA 3FYOA 5FF3A 3P8JA 1FXPA 1IF2A 3IGXA 1JVNA 4O1BA 4RV8A 4FX8A 4UC5A 3RU6A 3QSRA 3UWQA 2X1TA 3L9CA 2NWRA 1OK4A 6ALDA 3TJLA 1GYLA 2VC6A 1RR2A 3W88A 1Q6LA 4RX0A 1PE1A 2DU2A 1T99A 3W1PA 4BI7A 4NJIA 5AHEA 3S6DA 1H51A 5G5IA 2V0TA 2WJZA 2ISVA 1EIXA 2PURA 2QEZA 1A5AA 4WY0B 2JBMA 1VC4A 1ME9A 3K30A 1JULA 2A85A 5U4NA 4YWIA 3P5ZA 5LSMA 3A23A 1JUKA 1KM0A 4JTGA 3CWOX 2C1HA 3CPRA 4NZFA 4QAIA 3V1PA 1KFKA 3L5LA 1EUNA 3W73A 3HBLA 4XTIA 3QF0A 2QCNA 2VXNA 5HWNA 4M7TA 2JGQA 1QCWA 3N3MA 4ADSA 4Z0SA 2GVGA 4ZQOA 4MPQA 2NX1A 3QH2A 3PBWA 4K8EA 2PC4A 1IIHA 1XUUA 3FJLA 3H54A 3R8RA 3OIXA 2A7PA 4N9BA 3LHZA 4IMGA 1FWTA 4JTLA 5EY5A 1S5VA 1XBVA 4CQAA 2TPSA 3RMJA 2BLEA 4NXKA 2BZNA 5C55A 1N7KA 4ADUA 1P0NA 1I2RA 4IMFA 1JCJA 3GB6A 2I14A 1IXOA 4LRTA 5U7SA 1G4PA 5HUOA 1QPOA 5J5DA 1Q6OA 4NU7A 3VNDA 4OBTA 5K2ZA 3INPA 3W83A 3HG3A 3TXZA 2ZRUA 2Y88A 4NQ1A 1WV2A 3M16A 4ORMA 4BR1A 4MZ1A 3BV4A 3DI0A 1FWWA 1LRTA 1GZGA 1VH7A 4FXSA 1ZALA 3NR0A 3F03K 3BO9A 4O19A 4UTWA 2I9EA 4P2VA 1TYGA 3S1XA 1XDMA 1TPUA 2G97A 4N2YA 3B03A 1AW5A 1QPQA 3G1AA 5F2LA 3CIWA 3P74A 4J9JA 3LGEA 1JRCA 1PCKA 3W86A 3LRKA 4AEOA 3VCRA 1G6CA 4AAJA 4O54A 4BK9A 3IGSA 1VRDA 3NQCA 1AL7A 2ZZ2A 2O7SA 5AB3A 4CCCA 3P80A 4Y6GA 1B3OA 2A21A 1WOAA 1ZFJA 4FHAA 1HFBA 1OJXA 1H61A 1R30A 4UCGA 1HO1A 3IVTA 3M41A 1LZOA 2F7FA 4MZ8A 1LRQA 1TTQA 3W1TA 3TMLA 1H63A 3G0SA 4IMDA 3ABQA 3TNOA 4LV9A 1IXNA 1FWRA 1TV5A 4NJJA 4O57A 1KM4A 3LHTA 4MY1A 4JTKA 1ZCOA 3N2XA 1HL2A 1SPQA 3Q94A 5EBUA 3QYQA 2QUUA 3DI1A 1NEYA 3G8RA 3LCIA 2ABAA 5IBXC 3W7LA 3EX2A 2NWSA 1QO5A 4JTFA 1VYSX 2B7NA 3E96A 4S2CA 1JCNA 2NX3A 5HULA 2LLEA 3UD6A 5K7JA 3LV6A 5BOOA 1B57A 4ICNA 3H53A 4Z1CA 4IMCA 2FDSA 4YCOA 2A4AA 3B04A 3MMTA 5FF0A 5D03A 4MLJA 1ZY9A 2V81A 4JDYA 1L9WA 1KM6A 2JGYA 3R2GA 2ALDA 4ADTA 3VE7A 2A1YA 4A22A 1M7PA 2B7PA 3N19B 2NLIA 4QM1A 4CCDA 2FB2A 4GUGA 1I2NA 4Q32A 3GAYA 2NUWA 1LBMA 2GVJA 5AYZA 3W7DA 3GXPA 3C4UA 3N34A 4BI5A 1I2QA 2YPIA 3PG8A 5DN1A 2A5HA 2V2HA 4N02A 4R34A 3UWYA 3SR7A 2OT0A 5LNWA 2C0AA 4KFOA 5T26A 1WXJA 4E38A 3BGGA 4Z08A 3UY7A 3TFCA 1H7OA 1E51A 4EVZA 4XKYA 3EX4A 2YW3A 5F2IA 1VLWA 2E09A 5AN7A 1XL9A 2DZTA 3SGUA 3WJXA 5KINA 3EWYA 2V2CA 2X16A 1OFBA 1LTDA 3EB2A 3LCFA 3AO0A 5D30A 2D73A 3TE9A 1W5QA 3GDLA 3B05A 1DOSA 1ONRA 2RFGA 2DZPA 5C6MA 1GTEA 4MUZA 3FKKA 1UUMA 1ZAIA 1QPRA 2HTMA 4AHQA 2OJPA 4GUJA 1LLWA 3CB8A 1K8YA 3H55A 2VFFA 1KM2A 3TSMA 3I65A 4Q33A 3TW6A 3W7GA 5AOUA 4ZQNA 3HGOA 1DJNA 5AHNA 5CGQA 2WNQA 2Z2UA 5AC7A 1ZENA 4MJMA 1X1ZA 2WOQA 3BG3A 5G4EA 2E77A 3U6WA 4B5NA 1CW2A 4WZHA 4DPQA 4A29A 3L5MA 1N8FA 3EKZA 4MFDA 1ZNNA 3I68A 4A3UA 1XFBA 3P61A 3QFEA 4AH7A 1M5WA 1FCUA 1SU5A 5IBXA 5DELA 2RHGA 3CQ0A 4XKYB 3KAOA 3W1XA 1TV7A 2WV8A 3LLFA 4KFNA 1FCBA 3Q58A 5AHMA 3W70A 4AWTA 1D9EA 3LTSA 3UPWA 4DBDA 2B7OA 5G4WA 2P10A 1RQBA 1B9BA 3DGRA 4ZZ9A 3TU9A 2FB3A 4M6QA 4Y96A 2B0MA 5HNRA 1NF7A 3CEPA 3EX3A 4LVGA 3VKJA 4PCFA 5FEZA 4KKXA 3UQNA 4LTSA 2GPTA 3FS2A 3W23A 4E0CA 5AC8A 3PM6A 1PIIA 4K7VA 1OF8A 1OYAA 3C8FA 3W76A 2C14A 2WSRA 3STFA 1OFRA 5EA9A 2H90A 3W7RA 4E2DA 4WOQA 2DJLA 4K37A 4L4MA 4JXCA 2HSAA 4NT0A 4JYDA 4UFMA 4TU1A 3LRMA 4GFSA 2CLIA 3PBYA 3OA3A 4Z1AA 4AWSA 2KZHA 2WQPA 1VLIA 4NX0A 1X7FA 4HNTA 3MHGA 3AJXA 4WJEA 2OZ0A 3TMQA 5F4WA 3GX9A 1XM3A 1KFLA 3L66A 4KWVA 2CLHA 8TIMA 3KHJA 3O8AA 1SZNA 1I8JA 4WQ6A 4GWEA 1SW7A 3W2MA 1XI3A 4JYFA 3V75A 1GG0A 1KLYA 3MYPA 4M19A 1MSSA 3BG9A 2GOUA 2FIQA 3L0KA 3G1XA 3HMJG 4UTUA 4O1AA 5I3JA 4DBEA 4JS3A 3T44A 3QMRA 4IXXA 4D2JA 1PL9A 3N2MA 3OG3A 1OX4B 2NXIA 3FA5A 1W5MA 4NVTA 4TR9A 3O63A 1THFD 1OK6A 3KFTA 4DF1A 1RQHA 2ZCGA 2J9YA 4AHOA 1SSDA 4O13A 1DL3A 4O8RA 3G1YA 1Q6QA 2ZZ5A 5KTLA 3EXTA 3QZEA 2CZEA 3B0PA 2ATMA 3U2OA 3NPXA 2H8XA 4O1DA 3KRSA 1W56A 1EUAA 3DH7A 1G67A 3HPZA 1SW3A 1AK5A 3W85A 1VGAA 3M1ZA 2A7NA 1VYRA 3NG3A 2GQAA 1MO0A 5EMUA 3KX6A 3LV5A 2YSWA 3NZRA 2AQWA 1LCOA 4FEZA 1TQXA 3GZ3A 4OQVA 3G24A 4G1KA 1XBYA 4IX2A 4PC8A 4NZJA 1C8VA 1FXQA 3DKLA 1QMLA 3HQ1A 1Z48A 3O6DA 4JTUA 3G3MA 2QAPA 3LCGA 4UMAA 4O28A 4LWWA 3W2LA 3GNDA 4RLIA 2DZVA 3KOFA 3LBCA 3SY5A 3C61A 3PY2A 5FEXA 3LXAA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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