3BLF | Genus

Total Genus 117

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	117
sequence length	319
structure length	306
Chain Sequence	RLEILDVTLRDGEQTRGVSFSTSEKLNIAKFLLQKLNVDRVEIASARVSKGELETVQKIMEWAATEQLTERIEILGFVDGNKTVDWIKDSGAKVLNLLTKGSLHHLEKQLGKTPKEFFTDVSFVIEYAIKSGLKINVYLEDWSNGFRNSPDYVKSLVEHLSKEHIERIFLPDTLGVLSPEETFQGVDSLIQKYPDIHFEFHGHNDYDLSVANSLQAIRAGVKGLHASINGLGERAGNTPLEALVTTIHDKSNSKTNINEIAITEASRLVEVFSGKRISANRPIVGEDVFTNLYANPILPERFGRKR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
molecule keywords	Citramalate synthase from Leptospira interrogans
publication title	Molecular basis of the substrate specificity and the catalytic mechanism of citramalate synthase from Leptospira interrogans pubmed doi rcsb
source organism	Leptospira interrogans
total genus	117
structure length	306
sequence length	319
ec nomenclature	ec 2.3.3.13: 2-isopropylmalate synthase.
pdb deposition date	2007-12-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00682	HMGL-like	HMGL-like

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3blfA00

1T96A 2ZZ3A 3M44A 3A24A 1OFBA 5H2ZA 1F7BA 4I7WA 3SSJA 1KW1A 4WXZA 5CG7A 5G2WA 2X1SA 3TJLA 2WOQA 4K38A 4UTJA 1K03A 1VS1A 3CQ0A 1OYBA 5D38A 3GX9A 1OYAA 1PHQA 2Y6ZA 1GVOA 2X30A 3M6YA 3SZ8A 2ISWA 2DZSA 2YCEA 1OX6A 3CWOX 3Q37A 4GWEA 1FUYA 4HNTA 2TRSA 3USBA 1RQEA 1GVFA 5GVJA 2EF9A 3OVQA 3LB0A 1EX5A 3HGSA 2Z6IA 2WNNA 4GBUA 2Z6JA 2V2HA 4IMCA 1X8FA 5BW6A 1QPQA 4JTEA 1GJPA 1RV8A 4N6FA 1KM2A 3P80A 3C6CA 2TSYA 3FS2A 3GXTA 1EUAA 3HO8A 3SI9A 3TAKA 1KFJA 4N9DA 1VCFA 1W56A 3M7WA 4FNQA 5AHMA 3W7KA 1QFEA 3MWAA 3DENA 1SO3A 5DY3A 1G7UA 3FFSA 2YGYA 1W1ZA 3HG2A 3THQA 4IX2A 4NZFA 4MLRA 4MJZA 4ZMGA 1AK5A 2A0NA 3C4UA 3DZ1A 1KFCA 4RK8A 3LHTA 1SU5A 2GJNA 4O53A 3UWVA 4JN6A 4LV4A 4M7SA 1TCDA 3C2FA 5F4SA 3B05A 1T8XA 4BFAA 3G1DA 2GQAA 3MBDA 3PVFA 3W7QA 2G95A 3HJZA 3C8FA 2CFFA 3CIXA 1XFBA 2E5CA 3C3NA 5CZSA 1ME7A 2HS6A 2RDWA 4TO8A 1TQJA 2Q3OA 3WK0A 2Y7EA 4MY9A 3INPA 3P8IA 1KBJA 1KLZA 2WKJA 2C15A 1WBJA 3ATZA 2CW6A 1Z44A 5CZJA 4DO4A 3OIXA 2XN1A 5I3GA 3FKKA 3B0PA 3P5YA 4Z1DA 3E96A 1PIIA 3NQ7A 4DF0A 3N9SA 4O57A 3PBWA 4IWWA 4UFLA 4HN4A 3HG5A 1O5KA 8TIMA 3SR7A 1WXJA 1IXQA 4LS2A 1Z48A 4DPQA 3N73A 1FXPA 1TTIA 3HBLA 5K4XA 3UXDA 5D2TA 1FDZA 2A7NA 4KFPA 2H90A 4JGDA 1QAPA 3W7IA 3UWWA 3PY2A 1PL9A 1OFPA 2ZZ6A 3EWZA 1GEQA 1GVRA 4H3DA 4OT7A 4UXDA 1AL8A 4AF0B 7TIMA 1QO2A 2QJHA 4RXFA 4RLIA 4A29A 4HKPA 3W7LA 1H62A 3M0ZA 1GVQA 1C8VA 3PF3A 2JGYA 3LLFA 2Z2UA 4XQ6A 1KTBA 1ONRA 4MY8A 3N2XA 1BKSA 4RCXA 3RNDA 2QKFA 2A85A 5CKSA 4ADUA 3LGEA 3OEXA 4CNPA 1W37A 2V0TA 2WV8A 1IGSA 1Z42A 2G5WA 3HIJA 3EX3A 1WX0A 3S1WA 3P61A 5AHFA 3LCIA 2BZNA 2ZRVA 3SECA 4MZ1A 3N19B 3KX6A 3LLDA 3VKJA 3SW6A 3B4UA 3W7MA 4JTGA 3KOFA 4K8HA 4O17A 3L5LA 3IVUA 1PE1A 3LDVA 1TJPA 3KRUA 4AWUA 2QCMA 3B0VC 2E5BA 3O05A 1FCUA 3EKZA 3BGJA 4A22A 1GTHA 3LHUA 3NYZA 1M7PA 1ZAJA 2V30A 2DZPA 2Y7GA 4PA8A 3HOJA 5DXYA 4JTUA 2NLIA 5LGXA 4E2BA 2GQ9A 1A5SA 4O0ZA 3TXZA 5KITA 4Z08A 5C6MA 2Q8ZA 2WNZA 1V5XA 1DQXA 1XDMA 3QH2A 3IIVA 2YZRA 2NX3A 2YYUA 3C61A 3H55A 2PRLA 5AHLA 1SR9A 3G1XA 1P1XA 2J6XA 3I68A 2ZA2A 3NL3A 4OWGA 1DL3A 2ZZ5A 3TAOA 5LNSA 1IIHA 3GDTA 4G1KA 1I2NA 2VEMA 5CZ0A 1XC4A 3LCLA 4UTKA 3NO5A 3FYOA 3W1TA 3ANYA 1H7OA 5FF3A 3LOTA 4UR8A 2JGQA 5D04C 3SJ3A 2A21A 3TK7A 3SGUA 2ZZ4A 2OZ0A 3GYEA 3G8RA 1G4EA 3BW4A 2YR1A 3G8EA 3TSBA 1VC4A 2WSYA 2QAFA 1UB3A 2ZYFA 3S8HA 2VFGA 1YDOA 3W2JA 1C9DA 4PTNA 4X3ZA 1FCBA 2Y61A 3QEZA 4CQ8A 4U4MA 2FB2A 3B06A 1MEIA 1RR2A 3NGJA 4M5PA 3QZEA 4C1LA 5F2GA 1SW7A 1KBIA 2V81A 3L5AA 1R2RA 3P81A 5LNWA 3S42A 3PM6A 1SW0A 3N9RA 4Q33A 3W7NA 4LUIA 2RKXA 4DO6A 2OMAA 2B7OA 5LNVA 5F1UA 1TPB1 2GVGA 5TIMA 1YPFA 3GZ3A 3M43A 4O14A 1GPWA 3QFEA 1HTIA 5HJLA 3Q58A 2DJXA 2E09A 3QYQA 5CSSA 3EB2A 1BTMA 2C13A 3W76A 4A2SA 1KFLA 5U7SA 5CPLA 4XTDA 3VNDA 4O50A 2ZRZA 1O4UA 4UCGA 1MEHA 4HSOA 1W5PA 4M19A 2FDSA 4FNSA 4JIPA 4O18A 2ALDA 1JVNA 1JCLA 5CSRA 3TQ0A 1KFEA 1UUMA 1F74A 3S5OA 2E5DA 4JIQA 2D73A 3A5FA 5KZDA 1C29A 5U4NA 4Q4KA 4Y90A 4IGHA 3T44A 3W1RA 5FF0A 1EP1A 2A5HA 3LTPA 1OX4A 4WZHA 4BR1A 4XKYA 2VFIA 1WAUA 2ABAA 1EIXA 1O94A 2GOUA 3KRZA 1I2RA 3IIOA 4O19A 2E68A 4UC5A 3EWUA 2EPHA 3NQGA 3W1QA 1ME8A 3BG3A 1XUZA 3S1UA 2QJIA 1T0OA 3C0JA 1W5MA 2ZZ2A 2YPIA 3O07A 4E2DA 2TPSA 3CM4A 5D32A 5LSMA 3EWXA 1VLWA 2CLEA 3V75A 3TV8A 5K7JA 1H63A 3NZ1A 1VLIA 3PS7A 1L2UA 5DCDA 1XDLA 1MSSA 3ABRA 4AHOA 4TX9A 1SFJA 4FXSA 2ISVA 5DBTA 4JTFA 4MOZA 2V8ZA 4FHAA 3I7RA 4NNAA 4O1CA 1Q6RA 3PBVA 3KFTA 3K30A 1TRDA 3LI1A 5EA9A 1TPC1 1KM1A 2NWRA 4O11A 3NPUA 4BF9A 2FFCA 4ORMA 4JY9A 3GXPA 1UBSA 1OABA 5HWNA 1ZAIA 3TMQA 4DF2A 1E51A 3CIWA 1ALDA 3WJYA 1QR7A 2IQTA 4DELA 2TMDA 3DBPA 5FF4A 4N9CA 4MUZA 1A5AA 3KXQA 3W1MA 2GQ8A 2J88A 4JEQA 4FX7A 5AC6A 5EKYA 4NXKA 4UMCA 1ZJIA 3W7OA 3THAA 3Q94A 4L4MA 3W1UA 2QF7A 4UUIA 4EOUA 1ICQA 4AAJA 2DJLA 1H1YA 2JK2A 4NNBA 4ICNA 1FX6A 1SSGA 2PE4A 5AFDA 4N2YA 3W22A 5BNKA 3W2UA 2WJZA 4GUHA 1XBXA 4GUJA 3FEMA 5BRBA 3MMTA 5CPOA 3CB8A 4YMZA 2H8ZA 3DAQA 2ZZ7A 3IIZA 3MP5A 4XTIA 3TSMA 4EF9A 1LROA 4ADSA 4I7VA 3ZS4A 3BO9A 1D3HA 4LUJA 4MYXA 3TCEA 3F1QA 1XI3A 4QIUA 1WYIA 4S2BA 5E0KA 2CLLA 4UTWC 4N4PA 2QJGA 1KTNA 5F1VA 3LRMA 4CCEA 1ZY9A 3LXBA 3TFXA 2E1DA 5IM51 3CWNA 1DKWA 5EBUA 5FEZA 5G2HA 4OE7A 3P84A 2ZTJA 2R14A 4O16A 3B0UX 3MYOA 1G7VA 3P74A 4UFIA 2QCDB 1AG1O 5ABTA 3C2OA 3LHWA 5BMWA 3F4NA 4WOQA 3O1NA 2A7RA 1JCMP 3P5ZA 3AJXA 2Y89A 3PR2A 3P67A 4HHPA 4LVDA 1ZCOA 1TREA 2BLEA 1HUVA 4NJHA 3C2VA 1FCVA 3LHZA 3QQ0A 3W1LA 1I2OA 3VCRA 2YX0A 4ADTA 4NXSA 2RDUA 4K39A 3G1HA 2QR6A 3W9ZA 2A1YA 5TBOA 3LCWA 1TTJA 3TE9A 4KKXA 1YTDA 1KLYA 1RZMA 2PURA 3G1SA 4OV4A 4FB7A 1LM1A 1SQ7A 4N9BA 4R34A 1W5NA 3LCHA 3QW4B 5D05A 4LT9A 4H4IA 1JUBA 3NZRA 1SZEA 1VH7A 1AW5A 4ZQNA 3ABQA 4TIMA 3CEPA 1JCJA 4LNYA 1SW3A 4KWWA 1ME9A 2BWGA 3MW7A 1K8ZA 3DU0A 3TX9A 5DBUA 5D09A 4HT3A 4X22A 1KM4A 4JX6A 4JNMA 1TMHA 1VHNA 4UTWA 2VEIA 3FA5A 3NQ2A 1SFLA 2PCQA 4AEOA 1GTEA 3O06A 2YYTA 3BGGA 3O16A 2OX1A 2UV8G 5G4WA 3D0CA 1TPEA 2VEKA 2RHGA 1PHWA 3UWYA 1JR1A 2QCLA 3CHVA 2DZVA 5L9FA 2EAWA 1H50A 3W7JA 3TMLA 3GNDA 1T99A 2DZUA 3BG9A 3SY5A 5T26A 4LWWA 2DORA 4UMAA 2HMCA 2NXGA 1L6YA 4NUWA 2NUXA 3PG8A 1D3GA 1FXQA 3BVJA 1SZNA 3QC3A 3W1AA 3W7HA 4IJBA 1ZALA 4LW7A 5HULA 3NVTA 1QPNA 3VE9A 5FESA 1XBVA 1U5JA 3P8JA 4R33A 3I7QA 4IMFA 3MP4A 3LI0A 3LCGA 2Y70A 1LRQA 1EP2A 2RFGA 4AHPA 2FIQA 3STGA 1YPIA 2VFHA 3FOKA 3PBUA 4Z0SA 2JKEA 1P4CA 2XFWA 4Y6GA 4AXKA 1TO3A 4EIVA 2ZRXA 1JUEA 2CZEA 1DJQA 2A4AA 2FB3A 3WK3A 4JTJA 4OU1A 3B03A 1B3OA 1G67A 1QPRA 5CZTA 2G97A 3HF3A 1JCXA 3G1FA 3FLUA 4LVFA 1JJKA 4UTMA 4MJMA 3UY8A 2B7PA 4A21A 2E6AA 2ZTKA 3BW2A 3N34A 3UYCA 3CU2A 2OT0A 5D2VA 1GG0A 1O60A 2WQPA 4MFEA 4O1AA 4NJIA 4HNVA 4Y96A 3W88A 1OF6A 3LXCA 4JD4A 4WD0A 4AH7A 2DZXA 4YCOA 4O0KA 2E6FA 2ZFAA 2QAPA 1YTKA 4C1KA 4M6VA 3TW7A 4D2JA 1A5BA 2AGKA 4W9TA 4DPPA 3M1ZA 4S2CA 4WUIA 5A5WA 3FYPA 3GDMA 4IXXA 3G1AA 5KZMA 3YPIA 3TA6A 1TSIA 3DGRA 2KZHA 3W70A 3CPRA 3WJWA 5I3FA 2Y88A 1F6KA 3DH7A 4LVAA 1Q6LA 4PH6A 1WBHA 4DO5A 2W79A 1DORA 1QO5A 1HFBA 3IV3A 4JICA 4M7TA 1H5YA 1UCWA 4K7YA 3L68A 1YYAA 3PB0A 4Z1CA 3W1XA 3M5XA 2H8XA 1B4KA 4Z1AA 2RH9A 5HNRA 4FX6M 1SO6A 3CTLA 4CCCA 3UWUA 1NSJA 2QUUA 4ONVA 3LCFA 1QDSA 3MBFA 1R47A 3NPWA 1FQ0A 2Y85A 4MKNA 1FWNA 4FF7A 3TC7A 3QSRA 3LTYA 1TB3A 2WSRA 5HQEA 2EHHA 3GDKA 4MIMA 2YW3A 4GUGA 1UUOA 3ATYA 4FXRA 1O95A 5K9DA 4QM1A 4FIQA 1UASA 4IMDA 1H7WA 3BARA 5J5DA 2Q8LA 1W8SA 1S5VA 3TC6A 5IBXC 2EGZA 4BI6A 3W6YA 3W84A 1VZWA 4UFHA 2GPTA 4RZ4A 3B8DA 2DZTA 1XM3A 3TDFA 2QCNA 4IUOA 5C54A 4DF1A 1LDCA 5I3KA 2I9EA 4GRSA 3RFAA 3TFCA 1KFKA 1OFOA 4XZ9A 2VKZG 3QMTA 5F2MA 3NL6A 3P82A 1TRIA 2I14A 5AOUA 1W31A 1EPXA 1GQNA 4AB4A 3WK2A 3DI0A 2YFOA 4AF0A 5AC7A 1F76A 4O1DA 4P61A 5K9XA 3S1VA 5HWJA 3DHFA 5FEPA 3WK1A 1CW2A 3GKFA 1BWKA 1XL9A 5MHBA 2CLOA 3R5EA 2ZA3A 3IVTA 4AWTA 5A8GA 1PS9A 4RV8A 2XN0A 3QSTA 3UPBA 3A5VA 4IXHA 3PUOA 2GVJA 2NWSA 3G18A 3EWYA 4OV9A 4PC8A 5G1YA 5K9CA 3GXNA 3A9IA 2BSLA 3TR2A 1LZOA 2YSWA 3NM3A 3S6DA 3S5NA 5CPMA 3DXIA 3G3MA 3N2MA 1G4PA 1LOLA 3TROA 4AWSA 2XN2A 3HGRA 4GJ1A 1IIGA 1I2QA 1B57A 1R2SA 3MP3A 5K2ZA 1VYPX 1LYXA 1BEUA 3RLVA 1KM3A 3P7YA 1J2WA 4K36A 4JYFA 1ICPA 3PSVA 1G4SA 1VGAA 1LLZA 4GUIA 2R91A 3STEA 5L6UA 3DFTA 1O5XA 3W73A 3C56A 5D2XA 1OVDA 3R13A 5IBXA 1VHCA 4MYAA 3HQ1A 3W7PA 4UFJA 5K4ZA 5F4XA 3HGOA 3NL5A 3DFPA 2FPVA 4U28A 3G24A 1TPVA 3W2LA 4JR5A 2NUYA 2VELA 3QMRA 3W1NA 4ZQRA 3RF9A 1JCYA 5KSWA 5DN1A 3MUXA 4IOTA 1QCWA 2W6RA 3IGUA 1A50A 2V5LA 3QW3A 2NX9A 1R2TA 2H6RA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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