1SR9A

Crystal structure of leua from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
626
structure length
573
Chain Sequence
TIVKPAGPPRVGQPSWNPQRASSMPVNRYRPFAEEVEPIRLRNRTWPDRVIDRAPLWCAVDLRDGNQALIDPMSPARKRRMFDLLVRMGYKEIEVGFPSASQTDFDFVREIIEQGAIPDDVTIQVLTQCRPELIERTFQACSGAPRAIVHFYNSTSILQRRVVFRANRAEVQAIATDGARKCVEQAAKYPGTQWRFEYSPESYTGTELEYAKQVCDAVGEVIAPTPERPIIFNLPATVEMTTPNVYADSIEWMSRNLANRESVILSLHPHNDRGTAVAAAELGFAAGADRIEGCLFGNGERTGNVCLVTLGLNLFSRGVDPQIDFSNIDEIRRTVEYCNQLPVHERHPYGGDLVYTAFSGSHQDAINKGLDAMKLDADAADCDVDDMLWQVPYLPIDPRDVGRTYEAVIKGGVAYIMKTDHGLSLPRRLQIEFSQVIQKIEVSPKEMWDAFAEEYLAPVRPLERIRQHVDAADDDGGTTSITATVKINGVETEISGSGNGPLAAFVHALADVGFDVAVLDYYEHAMSAGDDAQAAAYVEASVTISKTVWGVGIAPSITTASLRAVVSAVNRAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords 2-isopropylmalate synthase
publication title Crystal structure of LeuA from Mycobacterium tuberculosis, a key enzyme in leucine biosynthesis
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 181
structure length 573
sequence length 626
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.3.13: 2-isopropylmalate synthase.
pdb deposition date 2004-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
A PF08502 LeuA_dimer LeuA allosteric (dimerisation) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1sr9A01
3.30.160.270 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Double Stranded RNA Binding Domain Double Stranded RNA Binding Domain 1sr9A02
3PF3A 4MLJA 2YXGA 5LNWA 3L65A 3IIXA 1GWJA 5GVJA 3I7SA 3TXVA 1TPUA 2VENA 3GDMA 4HNNA 1K8XA 2QDHA 1VS1A 2QJGA 3LXBA 2ALDA 1HL2A 1K8ZA 1NAL1 5K9XA 5I3GA 4HIBA 3QEZA 3C4UA 5G2HA 1OG0A 1WDWA 4NJKA 4BI6A 3HPXA 5CPMA 4JN6A 3B04A 4NJIA 3W2NA 2WPBA 3G22A 4FNQA 1LBFA 3QW4B 3TV8A 5EA9A 4QNWA 1WOBA 4NNCA 1G7VA 2F84A 4H6KA 3AJXA 1Z41A 1ZAIA 4MJMA 3LCHA 1EP3A 4UR7A 1P0NA 3UWYA 2Y6ZA 5H91A 3S5NA 3DFSA 4WY0B 5FF2A 3DU0A 4AF0B 4BR1A 3LCWA 1KM4A 1F05A 1OABA 3LRLA 3TQKA 4O8RA 4DBEA 3W7MA 3M5ZA 3G1AA 1ML1A 4BWLA 3PB2A 1ZHAA 1K7XA 3W1PA 5L6UA 3STCA 5ABTA 3MBDA 1BEUA 3CIWA 3N9RA 4ICNA 5AFDA 4Z0JA 3EWZA 5DXYA 1I2NA 2ZZ6A 4MZ1A 3HIJA 3NYZA 5FEZA 2E6DA 3LI0A 3IRDA 3FJLA 3O6DA 3FKKA 1X1ZA 2ISSA 3R2GA 2PC4A 3N14A 2ZTJA 2A7NA 2VKZG 3BV4A 5F4SA 1OFPA 4OE7A 2XN2A 5I3JA 1K8YA 4DF0A 4MY1A 3NQFA 2ZTKA 4PH6A 1YADA 1LRQA 1JUEA 5U7SA 3P84A 4JR5A 4Z1DA 5D03A 4GFSA 3HG2A 4XWUA 3GVGA 4RX0A 3V75A 3T78A 3MP3A 2A7PA 3EWYA 1TTQA 5FF3A 3SJ3A 3W7NA 2FFCA 1OF8A 2GJLA 3W70A 3E0IA 3M5VA 3VNDA 3R5EA 1A53A 1AW5A 3W76A 2FPYA 3QSTA 3M47A 2VFFA 3TK7A 1T0OA 3LBMA 3W1LA 3CT7A 1I2OA 2FB2A 3PSWA 3KRSA 5AHLA 2WSYA 5LGXA 2WNNA 1VRDA 4K7YA 2DZPA 3IIVA 5G2IA 4R34A 4AHPA 4MYAA 2CLMA 3Q58A 1TPWA 1QNVA 1PHWA 3LGEA 1H7OA 2Z6IA 2OX1A 1D9EA 4GNJA 4NX5A 4KFPA 3NQCA 4HSNA 1Q3NA 4FB7A 3GR7A 1HO4A 3QQ1A 1TCDA 5D33A 3FYPA 3HGRA 1LOSA 3IGXA 4UMCA 3EXRA 2ZA2A 2YR1A 4HPXA 1W5QA 1YTEA 5BMWA 4IOTA 4FO4A 4MUZA 1C8VA 1TTPA 4UTMA 2RDUA 3S1XA 1GTHA 1SSDA 2B0MA 3S5ZA 4EWND 3LX9A 3MHGA 3ATZA 4LS1A 4A29A 5IBXC 3S1WA 2C6QA 4K6AA 2C1HA 2A4AA 4S2CA 1WQ5A 2QCFA 3QPYA 1JCJA 1GOXA 4MKNA 3ANYA 1W5PA 3GXTA 1OX5A 3W1QA 5F1VA 3G18A 2ABAA 4JYFA 3NQ8A 1TYGA 1OFBA 3A24A 3CC1A 1OK4A 3GX9A 2C18A 3IVUA 3GXNA 5CPLA 2I14A 1A5SA 5KSWA 3P80A 1UJPA 2A1YA 2B7PA 4GXMA 3LRKA 2X16A 3L68A 1ME8A 2CZFA 2QAFA 2V9DA 5EKYA 4UTHA 3LHZA 5G1TA 3LTYA 4WXYA 3C3NA 5FF4A 1FWRA 2NUWA 2E5CA 3LRMA 3BGGA 3M43A 5K7JA 5I3IA 5FI8A 5LNRA 3EWWA 4ZQMA 4IX0A 3M5YA 1X7FA 1XDMA 4AWUA 2BTMA 4N6FA 3W07A 2NUYA 1KM3A 3CM4A 1YYAA 2YGYA 3CWOX 4GRSA 2YW4A 2ZCGA 3KOFA 1TPVA 2FJKA 1TRIA 4QNEA 4GUFA 5D09A 3CEUA 4LVFA 3HOJA 1JULA 4WJEA 2CZ5A 3PAJA 1FWTA 1W37A 3MI6A 5I3HA 1H5YA 5HQEA 1OFDA 2NUXA 4PCFA 3GDTA 4BI7A 3UY8A 4IUOA 4FNUA 2CU0A 2DZUA 4YWIA 5C5YA 1JQVA 4JTTA 5KZDA 1MO0A 2Z0IA 3MI3A 4IMEA 3R13A 5CZSA 4XKYA 3MHUA 4WD0A 3N9SA 2QCHA 2JBMA 3CU2A 3SGZA 1R47A 1HUVA 1TTJA 3WJXA 3TCEA 1TQJA 1W3NA 3NR0A 4N9BA 3UZ5A 2CLEA 2WKJA 5DELA 3TNOA 2B4GA 2GQ9A 3PVFA 1TQXA 2WO5A 2Q3OA 5E0KA 4AEOA 3W86A 2Y62A 1GEQA 3GKAA 3NPVA 3QMTA 3B4UA 4RLIA 2C3ZA 2FIQA 5TQLA 1KLZA 1XUZA 2NX1A 4NU7A 4IX2A 1LORA 2ZBTA 5D05A 1WA3A 3W9ZA 3JRKA 2DU2A 4I7VA 4OBTA 2D73A 4AB4A 2DJXA 5A8GA 3NPWA 5EPDA 3LOTA 4QM1A 3C2RA 1N55A 4O54A 4OV4A 3W72A 3M5XA 1H1ZA 4AWTA 3QC3A 2TRSA 1PCKA 3BG3A 3P5ZA 2A6NA 3IIPA 4O1CA 1O5KA 5D2WA 3IVTA 2YCEA 1SZGA 3QMRA 2ISVA 5AYZA 3TKFA 5BOOA 1B57A 1LLWA 3PR2A 5BMXA 5LHFA 5FF0A 3PC0A 1QMLA 4JTUA 3YPIA 3DFOA 1DOSA 4NXSA 3TAKA 3GXPA 4O19A 2O7QA 3STGA 2E09A 3IEBA 3GKFA 3HJZA 2XFWA 2Y7DA 3W7OA 4MLRA 2JGQA 3SIZA 3USBA 5DCBA 1L6SA 4CNOA 1OFEA 3PB0A 4LRTA 1SU5A 5D02A 5D38A 4S1FA 3UNDA 1SO4A 2J9ZA 5K4XA 1ZAJA 4TIMA 2YX0A 3V1PA 1G4EA 4LW7A 1PS9A 1SQ7A 1DKWA 3CLMA 2RKXA 1GJPA 2ABBA 4MZ8A 4IQLA 2HMCA 1OHLA 3W23A 3WJZA 1IXOA 3TQVA 3NM1A 4X3ZA 4MIMA 3U2OA 3BVJA 5DLCA 4LVBA 4IMFA 1BTMA 1TJRA 2QR6A 5KITA 1OF6A 4BF9A 4YLWA 5CPOA 4O13A 1QOQA 1K02A 4WY0A 3KVMA 1F76A 4EF9A 1WBJA 4Y8FA 3MYOA 3ABRA 3M6YA 1XDLA 1L6WA 3NOEA 4O0ZA 1QPOA 4L4MA 4M6PA 3TC7A 4NX0A 4KWVA 4AAJA 1YDOA 2X1SA 4MYXA 4JEQA 4WQ6A 4AMAA 1ZCOA 1ALDA 3G24A 4RXGA 4IJBA 3QRHA 4ALDA 1RZMA 3DGRA 4JYDA 4K8EA 4PC8A 4RZ5A 3NDOA 2E6AA 3G1SA 4LY8A 1FXPA 1MEHA 2QCMA 3DZ1A 4UTIA 1TREA 4JYEA 3W1AA 8TIMA 4ZQPA 3P8IA 5FESA 1K3UA 4UFHA 3EB2A 4M7TA 1U5JA 2OT1A 3DFQA 4FNPA 3LBCA 3NL6A 1I2QA 3P8JA 2V5BA 4QSHA 1RVGA 1W8SA 3AO0A 1S3HA 1UUMA 2CLIA 5FF7A 1TIMA 2RFGA 2VFDA 2E1DA 1T99A 4YCPA 3TQ0A 2NXHA 2CLHA 2YYUA 1FCBA 3EEGA 1KV5A 3TROA 3OEXA 4MZYA 3WFAA 2ZA1A 3G1DA 4O53A 4UFIA 3R12A 3W2MA 3C6CA 1XBYA 4UTTA 1H62A 1RPXA 3LCFA 4K37A 3CTLA 4PTNA 3EXTA 1CI1A 4CQ9A 2TSYA 5C55A 1FWSA 2BLEA 4QITA 3UYCA 2J6XA 2QCGA 1RR2A 1LROA 2AQWA 1XM3A 2WV8A 4O16A 4QJ1A 1JCNA 1XL9A 5LNSA 1X8FA 3L0GA 3LTSA 3PBYA 3G8EA 4J9JA 1ME9A 1XBVA 1KFEA 1QO5A 2Y63A 3TXZA 3W7IA 2H8ZA 2BSLA 3GDKA 3EX1A 5G4EA 2BWGA 3I6RA 1QFEA 3P62A 3QPZA 4N4PA 4B5NA 3W1XA 4JX5A 4A22A 2Y85A 4LC8A 2RH9A 3G0XA 3NQAA 2EGZA 3LHVA 3W75A 6TIMA 3TE9A 4BI5A 4XZ9A 1JQXA 3RNDA 3IVSA 3O05A 1MEIA 3IV3A 4OWGA 3STFA 1WX0A 1SSGA 3BW3A 4HPJA 2GQ8A 3W1NA 4UTWA 1JCXA 2VEMA 3OVPA 1YTKA 1FDJA 4FNTA 4LTSA 3DI0A 3PG8A 1OFRA 4NT0A 2RDWA 5LZLA 2V2CA 4IWWA 5F4WA 4Z1BA 3C52A 3RLVA 3T55A 1AW2A 2QUTA 1H60A 4GBUA 3UD6A 3G1FA 3KAOA 5AOUA 2Y89A 4FIRA 1G4TA 1ONRA 3B05A 4DQWA 2ZRUA 4DEFA 3VI2A 3HBLA 4AHOA 4RR4A 1XKYA 5HINA 3TW6A 1AK5A 1XBXA 3BLIA 1Z48A 4NJHA 4JD4A 6ALDA 1EUNA 3NXFA 1VHNA 3TC6A 5AC8A 1AW1A 1KBIA 1H7WA 1ZENA 3C2EA 3MMTA 1Q6LA 3BG9A 3UWQA 1JCYA 4Z1AA 3THAA 1K03A 5G2WA 4DXVA 2B7QA 3OBKA 3I7RA 3O6YX 3W7DA 4DBDA 1W5NA 4O1BA 5T26A 3PULA 2YDAA 1IXQA 1M7PA 5D04C 2Q8ZA 3SY5A 2YSWA 3LERA 3S9YA 1PL9A 2NLIA 4TX9A 4JTIA 1SZFA 3O06A 2WSRA 3MYPA 1NF7A 1PV8A 1JJKA 2ZZ4A 2E5DA 1F73A 4DF2A 4LOCA 1XCFA 4JTLA 4MFEA 1G7UA 4JIPA 5CKSA 2Q8LA 3L21A 3HPSA 3F03K 4C1LA 3NNTA 1H7PA 4FXRA 1EUAA 1W31A 3L2IA 1VLWA 4JS3A 1H51A 5DXXA 4NQ1A 1N7KA 1O95A 1VHCA 2LLEA 4RXFA 1HG3A 1LOLA 2WOQA 3EXSA 3OVQA 4IPJA 2BX7A 4XTDA 5E1QA 4JTKA 5BRBA 4DPPA 5KINA 5AB3A 1VQTA 1SW0A 3GB6A 1H1YA 2VEKA 3FS2A 3C2OA 1ZJIA 4FEZA 5D30A 4EVZA 5DY2A 1OJXA 1PE1A 1DVJA 2W6RA 3MWAA 4FHAA 3W7KA 1DJNA 5EMUA 2GUUA 3WJSA 4RCXA 1KM6A 2B7OA 4PA8A 3CEPA 1IXPA 3A21A 2ISWA 3G8RA 1KFKA 2WSQA 4O18A 5AYXA 3EKLA 1OFOA 1ZFJA 3SI9A 2QCEA 4O17A 1KM1A 1SFLA 4Y90A 3RU6A 4CNPA 1LOQA 3GAYA 4TR9A 4R53A 2BZNA 4RJEA 2B7NA 1SR9A 3VE9A 4P61A 1OFQA 2EHHA 4O14A 5J5DA 3DENA 2CZEA 2NV1A 3FFSA 1ADOA 2GPTA 3LCGA 4CLMA 2QUUA 1Q45A 3PSVA 3TSDA 4QAIA 3W2KA 3EKZA 4NZFA 4YMZA 2A2IA 2A85A 2Y70A 3GDRA 3M9YA 5C54A 2FQIA 3LHWA 4IMGA 4UFMA 3W6YA 1OK6A 3B03A 3BARA 3FJ6A 2C13A 2YFOA 4A2RA 4JY8A 1VGAA 5LHEA 1ICPA 4DPQA 2G97A 1KFBA 4RK8A 4Z1CA 3LHUA 3OG3A 3SFKA 1QPRA 4WOQA 4A21A 5K3VA 4PEKA 1QPQA 1OX6A 2ZZ1A 1EPXA 3F1QA 3VKJA 1W54A 2PRMA 3CIXA 3GK0A 1V5XA 2Y7EA 1VH7A 2HSAA 5TIMA 3TAOA 4GUHA 3UWUA 3S1UA 1UCWA 2V5LA 2VFEA 2CLKA 3PY2A 3VE7A 2H3BA 1FX6A 3M7WA 4O11A 5L9FA 1FCQA 3FA5A 1XI3A 1DQWA 5HR6A 1BWLA 2GJNA 4JTSA 5D32A 4E2BA 4P2VA 1YXDA 1FWWA 4Y96A 4JTGA 4O1AA 2VEIA 1L9WA 3OHIA 4IPIA 1KA9F 1TSIA 2BXVA 1LRNA 1G4SA 1KLYA 3UXDA 3TSMA 3T44A 4K8HA 1SZNA 2QKFA 2VFGA 3KVKA 3NQ2A 1S5TA 5CZJA 4FF7A 4RKAA 3W73A 1AG1O 3NL3A 3S6DA 3QW3A 4GUGA 5MHBA 1IIGA 4Z0SA 3P61A 5HMSA 1KTCA 2FDSA 1VYPX 3P60A 5HNRA 3CWNA 1CX9A 5A5WA 1O94A 5AHNA 4CNNA 5IBXA 5CGQA 1UUOA 5LKYA 1JCMP 3NZRA 4KKXA 1VR6A 4W9TA 1F5ZA 4NUWA 4WZHA 3UZJA 4EOUA 4FNSA 3L9CA 2Z2UA 5CSSA 1KM0A 3BLFA 3O63A 2EKCA 2EPHA 1LRTA 1JCLA 2JKAA 3LM7A 1R2SA 1L6YA 1XUUA 5AYYA 4MOZA 1IXNA 3WK1A 3OVRA 3S8HA 2XN0A 4U28A 1IGSA 3PM6A 3H54A 1JVNA 1M6JA 1A50A 2X2GA 2OZ0A 4KFOA 4GE8A 1FDZA 3IIZA 2J27A 2ZRZA 3ATYA 2CLLA 4NNAA 3TSBA 1DORA 1AL8A 3M1ZA 2JKEA 4ZMGA 1GVRA 2Q3RA 1WV2A 3GYEA 1GVFA 2V2HA 5EL1A 3W7RA 3K30A 3B0PA 3SECA 1R46A 1EB3A 4WXZA 4X9SA 1GYLA 3EX4A 1FY6A 3HF3A 3S42A 1H7RA 3W2UA 1KW1A 4M7SA 1H7XA 1LBLA 3HG5A 4UTLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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