1ME9A

Inosine monophosphate dehydrogenase (impdh) from tritrichomonas foetus with imp bound
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
482
structure length
349
Chain Sequence
AKYYNEPCHTFNEYLLIPGLSTVDCIPSNVNLSTPLVKFQKGQQSEINLKIPLVSAIMQSVSGEKMAIALAREGGISFIFGSQSIESQAAMVHAVKNFKAHNELVDSQKRYLVGAGINTRDFRERVPALVEAGADVLCIDSSDGFSEWQKITIGWIREKYGDKVKVGAGNIVDGEGFRYLADAGADFIKIGIGGGSIITREQKGIGRGQATAVIDVVAERNKYFEETGIYIPVCSDGGIVYDYHMTLALAMGADFIMLGRYFARFEESPTRKVTINGSVMKEYWGEGSSRARNWFEEGVDSYVPYAGKLKDNVEASLNKVKSTMCNCGALTIPQLQSKAKITLVSSVSI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
publication title Crystal Structures of Tritrichomonas foetus Inosine Monophosphate Dehydrogenase in Complex with Substrate, Cofactor and Analogs: A Structural Basis for the Random-in Ordered-out Kinetic Mechanism
pubmed doi rcsb
source organism Tritrichomonas foetus
total genus 113
structure length 349
sequence length 482
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2002-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1me9A00
3B05A 2W6RA 1DHPA 3SI9A 3HBLA 1YDVA 2V5BA 2W79A 4UTUA 1MXSA 3W7NA 2FIQA 3H54A 4HKPA 2A1YA 5D38A 5I3JA 1A5SA 1QPRA 1T99A 3LRKA 4M7TA 4ORMA 4ZVJA 4UFIA 4FNTA 4Z0JA 1FWNA 1TQXA 2VFHA 3KOFA 4O1DA 4FF7A 5C5YA 5FF0A 2BSLA 2Y63A 4MFEA 4HN4A 4FX6M 1TJRA 1IGSA 2ATSA 1B4KA 3P82A 4IQLA 3NR0A 1OX6A 3LXBA 3P80A 3N2MA 5K7JA 1OFDA 4BI7A 3UWYA 4PA8A 3BW3A 4JIPA 3QMSA 3LHYA 4LU0A 2ZZ1A 1RPXA 1S5TA 3PG8A 3ATYA 1BWKA 3HGJA 1SQ7A 4O28A 4RX0A 4K37A 3W22A 2Q3OA 4FIRA 5LKYA 4FNSA 1QNVA 3W7RA 1EUNA 5LGZA 1KV5A 3FKRA 4RKAA 1LORA 1OF6A 3PBWA 1C8VA 3TCEA 3CHVA 2ZA3A 1FQ0A 1D9EA 2PC4A 3F1QA 5K4ZA 1N8FA 3G0UA 3W70A 1OHLA 3LLFA 3O8AA 3S5NA 1GVSA 2E5DA 3DGRA 5AHMA 5ABTA 2GVGA 4L4MA 3M43A 5D2XA 4D2JA 2GQ9A 4K7YA 1A5AA 2E6AA 4KFOA 4WZHA 3BARA 3MP4A 4LVFA 1HO1A 3VE7A 5DCDA 3RLUA 3S1UA 3W7LA 5DXXA 4B5NA 3E12A 3HB9A 2QCDA 3NG3A 3C2RA 3TU9A 1AG1O 4JIQA 2WNQA 3GYEA 2A0NA 2JBMA 4LRTA 5E0KA 4GWEA 3G1DA 4XTDA 4CLMA 4X9SA 2YDAA 3A5FA 5CG7A 1OYBA 1VS1A 3N2XA 5D02A 2V2CA 1TTPA 3OG3A 4MY1A 2GQAA 4A2RA 4UTWA 5G4WA 2R94A 1ME8A 1W0MA 3UWQA 3U2OA 4JS3A 4I7WA 1N55A 4DF1A 1EA0A 4XWUA 2JKEA 5FF4A 3FEMA 1EUAA 3CPRA 4R33A 4UFMA 3DENA 2V2HA 1GOXA 1Q6OA 4TU1A 1EP1A 4ZQMA 1LYXA 1E51A 3W2KA 2C13A 2ZZ3A 1EIXA 3NQGA 3SFKA 3W2MA 4CNNA 5LNRA 2NX9A 4Z1CA 1VLIA 3CLMA 4OBTA 3W3OA 5I3HA 4LT9A 3QM3A 4NJIA 2B0MA 1F5ZA 4Q32A 2YXGA 3MYOA 3STCA 1UB3A 2A5HA 2X30A 2ZA2A 4YCOA 3G3DA 1LOQA 4PODA 3W2NA 3FA5A 4DPPA 1GG0A 1XBZA 2OZ0A 3E0IA 2AQWA 3P61A 3BV4A 1YXCA 2RDUA 1OF8A 2H3BA 3NGJA 1G4SA 2QCCA 3M16A 3TW7A 2E09A 3TFCA 5I3FA 3TV8A 1UUMA 4WD0A 3W1AA 5I3IA 3O6YX 1MO0A 3N3MA 2CLOA 5FEWA 1OABA 4PTNA 3ABOA 2QAPA 1K8XA 3LERA 1TPDA 1VHNA 3LXAA 5FESA 3M0ZA 4K39A 1XFBA 4DF0A 4PFMA 3KFTA 1EWDA 3O05A 1YDOA 2E1DA 4POCA 3W7MA 3EX4A 3SZ8A 3P74A 3O63A 3TJXA 3HGOA 4HSOA 2B4GA 1HG3A 4I9AA 1H1YA 4FNRA 4N2YA 2Z6JA 2Z1BA 3SY5A 3DFPA 4BFAA 1TPB1 5AC6A 3TUUA 2ALDA 3W7DA 3FKKA 1O94A 5DBTA 1JCYA 4O50A 5K9DA 4NX5A 4N9CA 1KTBA 1M7OA 2JKAA 4O1CA 2QKFA 4HNVA 3MO7A 4LC8A 4M6QA 4BWLA 1LLZA 3C8FA 4XZ9A 3NYZA 2FPYA 3B0VC 5K2ZA 1AW1A 3RLVA 3HOJA 4AH7A 3CT7A 3IIZA 3WJWA 3DI0A 1KBIA 4ADTA 1L6WA 4Z1AA 1G6CA 1LBFA 2B7OA 1AK5A 1XBVA 1KM0A 1KW1A 1AW2A 3GDRA 4AEOA 4K36A 4LOCA 5FF7A 4G1KA 4CCDA 3NNTA 1A5CA 4A21A 2J6XA 3LHWA 3TC6A 2C19A 1VR6A 3PY2A 2QEZA 2WOQA 3C3NA 3C52A 2VFEA 3AO0A 4MZYA 5EL1A 4JN6A 1XKYA 3BO9A 4ZMGA 4UMCA 1ZFJA 5DCEA 1J5TA 4NT0A 1DV7A 2VFDA 1LM1A 4FNUA 4O4WA 1I2OA 4UFKA 2CZFA 2VOMA 1OG0A 4AWTA 1IXQA 1NFBA 3B0PA 4QIUA 3L9CA 3FOKA 1TRIA 1L6YA 3LHVA 3W1XA 5DY2A 2I9EA 4OHQA 1B4EA 3W23A 2GJNA 1LOSA 1FWSA 3KX6A 2VEPA 3GIYA 4O17A 1X8FA 4PL1A 1K8ZA 4WY0A 2YW4A 4CCEA 3C0JA 3TQ0A 1AMKA 1P0NA 3MBDA 5KZEA 3B0UX 3BGGA 4RZ5A 5C55A 1IXOA 3LB0A 3LX9A 2IQTA 2I14A 3LCFA 2ZTJA 2YSWA 4CNPA 1VYRA 3EKLA 3I65A 4LC6A 3W74A 1GEQA 1ICQA 3QRHA 2KZHA 4GJ1A 5A8GA 2DZUA 5AHFA 2QJGA 3GR8A 2C6QA 4WXYA 1K3UA 1GVQA 2A6NA 4JICA 2Z2UA 4NXKA 1TIMA 3SJ3A 2NV1A 1PIIA 1YADA 5D2WA 1W5QA 1DORA 1W1ZA 4JYFA 3DFNA 1FCBA 4A3UA 3FIGA 3S1XA 1QOPA 1F2JA 2CLLA 1JCJA 2FPTA 4EF9A 2HMCA 3W1TA 1X6UA 2F7FA 3NAVA 4LS1A 3P81A 1Q6RA 3L0NA 1G4PA 2ZBTA 1CI1A 3UNDA 3GLCA 2CLMA 4DQWA 4FXSA 3Q2DA 3S5ZA 1WX0A 4WY0B 3N14A 3M7WA 3DU0A 4JD4A 3NM3A 2DORA 1ZAJA 2ATMA 2GQ8A 4O10A 1DQWA 4OGZA 1TCDA 1C9DA 1GVOA 3LTPA 3P60A 3OHIA 3TX9A 3DHFA 1Q6LA 2B7PA 4WY0F 3CC1A 2Z0IA 3C4UA 3SSJA 1FY6A 1THFD 3W83A 3Q58A 2PCQA 5AYXA 3UD6A 1F7BA 1SW7A 4DO4A 3EXRA 3WJSA 1GYLA 3HG2A 4UMAA 1KLZA 3W71A 4P61A 3RFAA 4ZZ9A 3W85A 3HIJA 3JR2A 3PG9A 4KKXA 5HNRA 1SO6A 3R89A 4HSNA 4MYAA 4IPJA 2NUWA 3DKLA 4ZQRA 4O0KA 1WAUA 2ZRZA 3FLUA 5CPLA 1VHCA 1TTQA 4JX4A 3PBVA 4NNBA 2CFFA 1TV8A 3FYPA 4OE7A 2BXVA 3DI1A 4E2BA 4K7VA 3M47A 4IXXA 3M5XA 3TK7A 5L6UA 2H3DA 1CW2A 1H1ZA 4WX2A 2GOUA 3QSTA 3UWWA 4OV9A 2BWGA 1OK4A 2Z6IA 1W5PA 4UR8A 3TSBA 1PL9A 1A5BA 3MP3A 2QDGA 1QWGA 3PWAA 3EXSA 5DBUA 2ZZ2A 3DKJA 3NQ7A 2Y70A 5F1UA 3HG3A 3PUEA 4PC8A 1XC4A 2GVLA 4GUJA 4JDBA 3L2IA 5HQEA 3TDFA 3W75A 4A22A 2XN1A 3MYPA 3W7HA 1JCMP 2BX7A 2J9XA 3TAKA 4M19A 3WK0A 3PM6A 4GUIA 1SO5A 4LV4A 4AWUA 3NM1A 2Y62A 3O06A 3N9RA 5F1VA 1UASA 3UWVA 1ZALA 3L5LA 5D32A 3TFXA 3E96A 5F4XA 3EX2A 5HUOA 3DFOA 5LSMA 1SU5A 5AOUA 3G22A 3DFTA 5DELA 4OU1A 3G8RA 3OVPA 1ZHAA 4DF2A 5BNKA 2V0TA 1BTMA 4JYDA 1KM2A 3STEA 2ZQ0A 3TQVA 3Q94A 2QJIA 2ZYFA 3BG5A 2O7SA 4YMZA 3C2OA 4LUIA 3QMTA 1L2UA 2C0AA 1W3NA 1K7EA 3W7EA 5AN7A 3I7RA 2E5BA 4BK9A 3O16A 1GTEA 1VJIA 1KLYA 1PE1A 2V8ZA 4K38A 4QJ1A 1I2RA 1F05A 2JK2A 3T44A 3CEPA 5CSSA 1XUUA 3NPUA 3GXNA 4IGHA 3LCLA 3P67A 1TPEA 3MJYA 3QYQA 1GZGA 3L21A 3GX9A 3DXIA 3W1UA 4IMDA 2NLIA 4JY8A 1F73A 1WDWA 3NOEA 1JR1A 2ZA1A 4MFDA 3FJ6A 4IX0A 1MEWA 4JX5A 4UR7A 1OX4B 5E93A 2VELA 4X2RA 5F2GA 5LNWA 1MZHA 1PCWA 1SZFA 4WXZA 3G1HA 2ZRUA 4MYXA 4NJKA 2EHHA 4UUIA 4FB7A 4LVBA 3HPSA 1KM6A 5K4XA 4HIBA 3TA6A 1PHQA 2G96A 1LLWA 2Q8ZA 3NZ1A 5CZ0A 3SW6A 1VYPX 1LCOA 4YWIA 3IGXA 2OT0A 5G5IA 2WQPA 4JTUA 1S3HA 4JDYA 5G1TA 4TMCA 2JKPA 3N19B 3M5ZA 3T78A 3B4UA 1VH7A 2QCGA 1GT8A 3HG4A 3EX3A 2PRMA 1T8XA 3EWZA 2QCLA 3HO8A 1Q6QA 1CX9A 5LHFA 4GUFA 3LOTA 3H55A 5SWUA 3LCWA 1D3GA 4WOZA 3LRMA 2HS8A 4IWWA 4EOUA 4W9TA 4UC5A 5D2VA 3P84A 4NVTA 2VKZG 1FX6A 2TPSA 4JY9A 4MY8A 1EP2A 4HHPA 1QPQA 1XUZA 2PRHA 5LNUA 1JCLA 5J5RA 3THQA 3SR7A 1EX5A 1KFCA 2Y7GA 2Q8LA 1F76A 3EXTA 3A22A 4KFNA 3C56A 3LBMA 1JUBA 2YFNA 1KM4A 4U4MA 4Y8FA 3WFAA 4CQ8A 2ISVA 3P7YA 4NNAA 3S9YA 2NXGA 1TJPA 3NL3A 3PVFA 3WJXA 4WQ6A 1LBLA 1UBSA 3KVJA 1GJPA 5FEPA 3GNDA 1RQHA 2DJXA 3NL6A 1B3OA 3EX6A 2ZZ5A 2QCFA 4IOTA 3DHDA 2DZWA 4FNPA 1V5XA 4IUOA 3NPVA 1RZMA 2ISWA 1KTNA 3GB6A 3QSRA 4FX7A 4MJZA 2EGZA 3P8JA 3CEUA 4EIVA 2CLFA 4O53A 1TYGA 4GE8A 4AXKA 2QAFA 3TR2A 1N7KA 4HNUA 2QR6A 1TO3A 1TTJA 1GWJA 2WNZA 1FXQA 3G1VA 4GUGA 4UFHA 2VEKA 2YR1A 1VYSX 1OFEA 3T4CA 2WSQA 3GDTA 3BGJA 1HFBA 1JVNA 3NPWA 1JUKA 4NQ1A 1YTEA 3STFA 2V30A 4YCPA 1OYCA 1VRDA 4UTJA 4RLIA 3RU6A 4N9DA 4UFJA 2J9ZA 1H62A 2QCDB 4XBKA 1W5OA 4JTFA 3UQNA 3L68A 3PF3A 3W7PA 3IIPA 3W1QA 1ME9A 1QPNA 1ZAIA 1W54A 3G1FA 3IEBA 4E2DA 1QFEA 3I68A 4QITA 4O14A 1I2NA 1KFEA 3LI1A 3G1SA 3HF3A 2O7QA 2RFGA 4LNYA 3PC0A 2I1OA 1I45A 2NWSA 4MPQA 1SO4A 4CNOA 3GAYA 1GVFA 3MP5A 4HNTA 2TSYA 4M6PA 2J88A 3W1PA 3NPXA 1Q45A 4ZQPA 3DFQA 2FTPA 3GR7A 4DO6A 1VCVA 2XN2A 3HJZA 1VPXA 1RVGA 1H7PA 4TMBA 1X7FA 2V9DA 5DY3A 4KWWA 3W7OA 4Y6GA 3TMLA 2DP3A 3M44A 4K6AA 1LRTA 3MBFA 4RR4A 2NX1A 1G7VA 4ZQNA 1KFLA 3S1VA 4GC4A 3A23A 5J5DA 3TMQA 1W3TA 7TIMA 3MI3A 1VCFA 3W87A 5AYZA 3WK3A 1KA9F 1OK6A 2QJHA 1LTDA 4O18A 5F2IA 5BMWA 6ALDA 2ABAA 2DZXA 2GVJA 4RCXA 3EWXA 3U6WA 1FDZA 3QMRA 4JX6A 1SR9A 1VCGA 1H60A 3MMTA 1SW0A 3L5MA 5D37A 4JGDA 4A2SA 1TSIA 3EWBX 3W07A 1VC4A 3OBKA 3UPBA 4QISA 1L6SA 3MWAA 4XKYA 1H7RA 1WXJA 1I2QA 3NDOA 5F2MA 1J4EA 2NXIA 4LTSA 3NA8A 4LUJA 1ZAHA 3TROA 5I3GA 1DJNA 4MVAA 3LI0A 4Y96A 2A6LA 5TIMA 5G2HA 4AB4A 3T40A 2P1FA 5AB3A 3B8DA 2Y7DA 2QCEA 3MW7A 1U5JA 3IVSA 2VEMA 1DQXA 3ATZA 5HWNA 1G69A 4JEQA 4UTHA 3PULA 1GG1A 2GPTA 3S8HA 4H4IA 3N9SA 2AGKA 1FWWA 5HWMA 1O4UA 1OYAA 3M1ZA 1A50A 4O19A 1NVMA 1T96A 2J24A 3TNOA 2A2IA 3GAKA 5EKYA 1TPC1 2LLEA 3UXAA 3HPXA 6TIMA 1UCWA 5CGQA 5AHIA 1QPOA 1G67A 1C29A 4O16A 1X1OA 2F84A 3K30A 2DZPA 2RDWA 2DZSA 3NZRA 4DBEA 1KM1A 4JTJA 5KMYA 1JULA 3LCGA 3HGSA 4O1AA 4ADUA 3YPIA 4R34A 2NZLA 1G4TA 1KV8A 5AC7A 1OFQA 2NV2A 1QDSA 3W7IA 4NJJA 1R2SA 2FB2A 2BZNA 5D30A 1TV5A 2Y85A 3VE9A 2CLEA 2CLHA 1FUYA 1KM5A 4NJGA 2QCNA 1G4EA 3C2EA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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