1JUKA

Indole-3-glycerolphosphate synthase from sulfolobus solfataricus in a trigonal crystal form
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PRYLKGWLKDVVQLSLRRPSFRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKSPSGLDVERDPIEYSKFMERYAVGLSILTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMKDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIEINDENDLDIALRIGARFIGINSRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAESGISERNEIEELRKLGVNAFLIGSSLMRNPEKIKEFIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords INDOLE-3-GLYCEROL PHOSPHATE SYNTHASE
publication title The crystal structure of indole-3-glycerol phosphate synthase from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus solfataricus in three different crystal forms: effects of ionic strength.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 95
structure length 247
sequence length 247
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 1996-05-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1jukA00
1JQVA 1YLVA 1X7FA 3O8AA 3LXBA 3TMLA 1FWSA 1TPEA 4CNOA 3E96A 3FOKA 3A5FA 4HNUA 3LHYA 3OA3A 1SW0A 1P1XA 1KLYA 5GVJA 4GRSA 5A5WA 1FCBA 4WXYA 1QPNA 4UTTA 3ABRA 3W2UA 1XDLA 3CEUA 4CCEA 2QCEA 1LYXA 1L2UA 2GJNA 1OFOA 3P80A 4DQWA 2ZRYA 2J9ZA 4WZHA 1VC4A 2X16A 2QUVA 3GDLA 3O1NA 3NPXA 1IF2A 4ZMGA 2A21A 2CLFA 2OT0A 5D32A 3LCGA 1I2PA 2TRSA 1X8FA 2VOMA 3TQ0A 4N9DA 2QR6A 1S5VA 1FX6A 4N4PA 3WJYA 1HG3A 4H4IA 3DFOA 4OE7A 3L65A 3STFA 3FYPA 4UFLA 4N6EA 1FXQA 1KA9F 2Q3RA 2CLIA 5CPOA 2CLMA 3W1QA 4S2BA 3NYZA 3BG5A 3KAOA 4O1BA 3UY8A 3W1UA 1J5TA 3QZEA 5K3VA 2GVLA 1GPWA 3GKFA 4CQ9A 3N34A 2NLIA 2RFGA 1K8YA 1WQ5A 4DPPA 1G4PA 2J24A 1ICPA 3I65A 3STCA 1TREA 1HO4A 1Q6LA 3UQNA 1QR7A 1SZGA 4HSOA 2P0OA 4IPIA 4G1KA 3LXCA 1FY6A 4BWLA 1ME7A 3P8IA 3DFPA 1W0MA 3BPWA 4JTIA 1LROA 2FLIA 1SZFA 4N02A 3M5ZA 5I3HA 3C2VA 1OABA 3A5VA 3UWVA 1B4EA 2PURA 3NQGA 3U2OA 2ZDRA 3QH2A 2VFHA 3IVSA 1MXSA 4QISA 3EXSA 3MBFA 2C0AA 3FJLA 4MZYA 3GKAA 2NXIA 5D38A 1DL3A 1EX5A 2I9EA 3MP4A 3PB0A 3W1AA 3HOJA 2EAWA 2DZWA 3PSWA 1SZEA 3VCRA 4A2RA 3KVMA 3B0VC 4LUIA 1AW2A 1N8FA 5KSWA 1T0OA 3FEMA 3W87A 4PL2A 4LV4A 3ZWTA 4BR1A 4IMFA 4O1AA 5G2WA 2DZVA 4UTJA 2CZFA 2ZCGA 3C2RA 3NL2A 4FX7A 3LLDA 5HWNA 1QAPA 1X1OA 3W88A 2WNQA 1R2TA 2FPVA 3Q37A 4M6QA 3LERA 3S1UA 3NA8A 2GUUA 4NX5A 1LRNA 3EKZA 4LVAA 1QDSA 1A5SA 3UPWA 4IMCA 2VFEA 4N9BA 4UTHA 5LSMA 4MYAA 2A4AA 4MFDA 3TAKA 1PCKA 2H6RA 1WOAA 3SY5A 1PCWA 1I45A 1A5AA 3NO5A 5HR7A 5G4EA 2NWRA 1H7NA 5AYXA 2ZZ3A 2C19A 3EXRA 1LLWA 4Y6GA 1YADA 4RCXA 3RNDA 1EUNA 3C2FA 1OFAA 3QSRA 5K4XA 4NXSA 4CQ8A 4GNJA 1LORA 3T55A 4MKNA 1TMHA 3JS3A 3LDVA 4UTIA 2V2DA 5F2LA 2W0UA 3PUDA 3M0ZA 3S5OA 3DKJA 1RD5A 3PWAA 3OVRA 4ORMA 5DCBA 5CPLA 1NFBA 2VEIA 3GLCA 2ZRZA 1TQJA 1IXNA 1EUAA 4R7JA 4YL2A 1AK5A 5J5RA 1TCDA 2V0TA 3PR2A 3EXTA 5CKSA 1TPVA 3Q58A 4GUGA 2RH9A 4WOQA 2G5WA 1Z44A 3O6YX 1P0NA 2CZDA 3DFTA 1L9WA 2FIQA 1RQHA 4O1DA 1M6JA 1JR1A 4JY8A 1VCVA 4JN6A 5K7JA 3BLIA 3L67A 5FF2A 4GUJA 2RDTA 3DKLA 2BSLA 4HNVA 3LRLA 3FLUA 4ZQMA 5AC7A 4MFEA 1PL9A 4BK9A 3IIOA 1D9EA 4FXRA 4AAJA 4I7WA 4K6AA 1SUXA 4AWTA 2FQIA 1QCWA 2QJHA 2P10A 3NQ6A 3B8DA 4CQAA 1E51A 3TXZA 1ZAIA 4DO5A 1EPXA 1OJXA 1WYIA 2ZZ1A 4JX5A 1SPQA 3P5YA 2CU0A 2B7NA 4CNPA 4PA8A 4LC6A 1C8VA 1K3UA 4GUHA 3M9YA 1ZAHA 2ZA3A 2OX1A 1LLZA 2R14A 3IIXA 1J4EA 1PV8A 4UIOA 2CZ5A 1TRIA 4RV8A 3W7EA 4IXXA 4S2CA 5D2TA 1X6UA 3G1AA 1VLWA 5G5IA 4Y8FA 1SW7A 3C6CA 4JR5A 1SFJA 5HWJA 3P74A 4MPQA 3BW3A 2NWSA 1EP3A 4JXCA 1YTKA 3ZS4A 4I9AA 1FBAA 2NUXA 4ZZ9A 2BX7A 1TPUA 1YTDA 3RFAA 2EF9A 3HG4A 2A7PA 2AQWA 3JRKA 2H90A 5FEWA 3FA5A 4GWEA 1H60A 3LI1A 2B7PA 3C52A 5KZDA 3FYOA 3HGOA 3SR7A 5AHMA 5I3GA 4OQVA 5LZLA 2QCDA 4MYXA 1XBVA 3AJXA 4XTDA 1Y0EA 5FEZA 3STEA 4BF9A 4CNNA 4OT7A 1WBJA 3W70A 4IX0A 1OFRA 3W23A 2QAFA 5HJLA 4MLRA 5F2IA 2RDUA 2KZHA 3NM3A 3N9RA 1S3HA 3W1NA 4JIPA 1KM2A 5F4XA 1TYGA 4MY8A 3YPIA 3O07A 3NL3A 3O06A 1KFBA 1MEHA 1W37A 2JK2A 4LUJA 3OVPA 3W1RA 3W22A 1OX4B 2DZPA 1EWEA 4K37A 3CIXA 5HULA 2XN0A 5D02A 2VENA 3MW7A 1DOSA 2X1TA 3MHGA 2B7OA 3L21A 4RR4A 4DXVA 3W7DA 3ZFHA 2WV8A 1TV8A 4OGZA 3W7JA 5KZMA 2O7SA 3S9YA 1VLIA 1VHCA 3OIXA 1KM1A 5HUOA 5G1YA 3H53A 3EWUA 2V5BA 5A8GA 1YXYA 3C4UA 3DXIA 3HMJG 1WX0A 3W85A 1OG0A 4O11A 2ZRVA 4C1LA 1ZY9A 1JCNA 5EA9A 1WOBA 1ZENA 2DZUA 2QCLA 1FDYA 1LOSA 3N14A 5K4ZA 3L68A 3LHTA 3DZ1A 1H5YA 3G1YA 5D30A 2NV1A 4E2BA 3KRSA 4NJGA 1Z42A 3MP5A 1KTCA 5U4NA 4IMGA 3LTPA 2ALDA 5I3KA 5DELA 1TTIA 2QCFA 5C5YA 3G1DA 4DO6A 3EX6A 3PM6A 4RZ6A 3TQVA 4NZJA 3GYEA 5F1UA 2Y7FA 1UJPA 1G4EA 4LC8A 1EA0A 4U28A 1O5KA 3UXAA 2B7QA 1ME8A 2FPYA 2WSRA 2ZRUA 3OVQA 4AH7A 4AWUA 2QCGA 1F5ZA 3HPZA 2PE4A 3CHVA 3M5XA 4AWSA 5L9FA 2YYTA 3NPWA 4Z0JA 3TJLA 1MO0A 3SSJA 3N2MA 2GPTA 1H7PA 3W7PA 1G7UA 3IRDA 1W3NA 3TIMA 4JYDA 1DHPA 4LRSA 3NQFA 1V7YA 3W1MA 2VXNA 1RVGA 3CM4A 3RMJA 3B05A 3SFKA 4NX0A 1JUKA 5FF7A 2H8XA 1OFPA 3QMSA 3PB2A 4RKAA 1SW3A 4IJBA 4MVAA 3GDMA 3TC7A 2R91A 1GYNA 1KM5A 2NUYA 4MUZA 3GDTA 5F4SA 3LBCA 2YPIA 3TX9A 3GNDA 3L9CA 1YPFA 1T99A 5AHFA 2YYUA 1EEPA 1PIIA 4GJ1A 1QO5A 1ICQA 3KVJA 5E1QA 5G4WA 5CGQA 3S5NA 3TUUA 4JDYA 2QKFA 2J9YA 2HTMA 4QJ1A 4R33A 3DHDA 1G67A 3UPBA 1H7WA 3SIZA 1LP6A 4O28A 4FNQA 4YLWA 3M7WA 5AB3A 4L4LA 1C29A 2YR1A 4ADUA 1WDWA 4P2VA 4K36A 1PHWA 4Z1DA 3KHJA 2E5BA 1QPOA 4JTTA 4J9JA 4FNPA 3PF3A 2OJPA 4JYFA 5CZTA 3VFLA 3HPXA 4NUWA 3G8RA 3DFSA 3QM3A 1LOLA 3I7RA 5FF3A 1OF8A 2J88A 1JRBA 3CC1A 2YGYA 1OF6A 3IIZA 3S8HA 4BFAA 2ZZ2A 1PS9A 3OEXA 4B5NA 2X1RA 4LNYA 1BEUA 3PS7A 1P0KA 2YFNA 1V5XA 3W7MA 3TMQA 3GR8A 5FF0A 1G4SA 1AMKA 2FDSA 2PCQA 5LHFA 2H3DA 2PRHA 1XCFA 3LB0A 4QAIA 4ZQRA 4L4MA 3NQVA 1UCWA 3MHUA 4JX6A 1FCUA 4FEZA 4DF0A 5AYZA 5I3IA 4RK8A 2V9DA 3O6DA 5U7SA 1TPWA 3QJAA 5ABTA 2V82A 4QIUA 1F7BA 2DJXA 1R30A 4GFSA 4HHPA 2Z1BA 2A5HA 4UR7A 3MBDA 4NNAA 3F4WA 1R2RA 3FJ6A 4NU7A 4UTWA 4A21A 4DELA 2PRMA 3CU2A 5K2ZA 4UUIA 4EF9A 4ZQCA 3TW6A 3MHFA 3NNTA 2I14A 4N9CA 4TR9A 1VCGA 3M16A 3G1HA 2ISWA 3G1SA 3LXAA 1AW5A 4Y90A 3W84A 1GJPA 2Y88A 4O0ZA 3QPZA 2E6FA 7TIMA 1QOQA 5IBXA 3L5LA 2O7QA 3W71A 2Y62A 3FKKA 3W76A 4RXGA 2DZTA 3TJXA 1W3IA 2QJGA 1TPDA 1SFLA 1Q6QA 4LWWA 4JIQA 1GVFA 3BV4A 2A7RA 3E9AA 4TIMA 3U6WA 4O4VA 3M41A 3BW4A 5BMWA 3ZWSA 3I7QA 2H3BA 3W74A 3PAJA 4PTNA 2JKAA 1W56A 4O19A 1LDCA 2BLEA 1TQXA 1GOXA 5FI8A 3TFXA 3LCFA 3UNDA 2V81A 3N19B 3W83A 2ZZ5A 1XL9A 2VELA 1FDZA 2ZTKA 3LM7A 3G3MA 3HIJA 4POCA 1R47A 4O16A 5AC8A 3W73A 4RXFA 2XFWA 4NZFA 1XFBA 4AF0A 1JVNA 3EWZA 2FPTA 3BG9A 1O4UA 1YPIA 4AVFA 3NZ1A 4K38A 2GQ8A 5EMUA 2C6QA 2Y85A 2VFFA 2WNZA 3B06A 3CPRA 5DXYA 5KMYA 1GG0A 4A2SA 4A29A 3C8FA 5DBTA 3UWQA 3O63A 2J6XA 2P1FA 3W7OA 2Q3OA 3V1PA 3EWWA 5J5DA 1JRCA 4TMCA 3B4UA 4BWLC 1K7EA 4O12A 3VE9A 4X9SA 5D03A 3W7QA 5DXXA 5BMXA 4JICA 4DO4A 3GIYA 4AEOA 5CG7A 3PUEA 2G97A 4XKYB 3HPSA 2X2GA 4O15A 3CT7A 1DBTA 3ATZA 1VPXA 1K02A 4MLJA 4FIQA 4M7TA 1YYAA 2QCDB 5F2MA 3LCIA 1ALDA 3W75A 2QCHA 3N9SA 2B0MA 1L6SA 1LBLA 4ZQOA 3S1VA 5AOUA 1SSDA 3EX4A 2RKXA 1KBIA 3R8RA 3QPYA 4UFMA 3G8EA 3IV3A 4NNBA 5L6UA 5DCEA 3F03K 1OK4A 3LRKA 1JUBA 2Y70A 1DVJA 4JTHA 4K7YA 3WK1A 4GBUA 3IEBA 2QCCA 4MY9A 3W2MA 5BOOA 4IPJA 5LNRA 1IIHA 1TPC1 3W72A 5C6MA 4MIMA 3DENA 5F4WA 4E2DA 3HB9A 1H7XA 3W07A 1QNVA 3USBA 2ZQ0A 4FB7A 4BI5A 3SJ3A 1O95A 3RLUA 1O5XA 2Y61A 3NQDA 5CZ0A 4IX2A 1QFEA 3DAQA 4UFIA 1TTPA 4LW7A 4IXHA 1KFKA 4O1CA 1BTMA 1A53A 1S5WA 4HN4A 3W3OA 3ZR4A 4X2RA 1J2WA 1H1YA 3QMRA 4LVFA 5K9XA 2IQTA 1FXPA 3GDKA 4JX4A 3ATYA 2WSYA 3EWBX 3W7NA 3M43A 1OHLA 3H55A 4O17A 1OX6A 2WO5A 3GAYA 5AC6A 1GEQA 4ZVJA 5C54A 4R34A 3TK7A 3NL6A 2OCZA 3NPVA 1TSIA 3LGEA 1TPH1 4MZ1A 2NX3A 1XDMA 4YWIA 2HS8A 1PE1A 3BK0A 4JTUA 1I4NA 3BARA 1AG1O 2C1HA 4AB4A 3PBUA 1F6PA 3TE9A 4D2JA 1IXPA 1GYLA 4FO4A 4ML9A 4M19A 2DP3A 1NSJA 5AYYA 4QQ3A 1WXJA 1LCOA 2DU2A 1VR6A 1W5PA 4KFPA 1LBMA 3F1QA 3PBVA 1UBSA 3P67A 1LBFA 1KTNA 3LCLA 4HPXA 3MI2A 2E68A 4ZQNA 4DEFA 4DPQA 3CQ0A 1NVMA 2YW4A 5EL1A 3G3DA 3C61A 4M6VA 3UYCA 2E6DA 3HBLA 4RZ4A 3DI1A 3G1XA 4Z08A 1GVRA 1T96A 1UUOA 3GX9A 4JYEA 5AHEA 3EWXA 5AHLA 2DZXA 4WD0A 4XKYA 3HG2A 4Z1CA 5D04C 3QSTA 1B3OA 1AL8A 5EYWA 3QRHA 4LS2A 2ABBA 4H3DA 2TSYA 3QQ0A 1QOPA 5HUPA 1GT8A 3R5EA 3G0SA 3MMTA 1PVNA 1JCLA 4O0KA 1JCJA 1P5BA 5KITA 1G4TA 1QMLA 4JS3A 3HF3A 3HGJA 4OWGA 4C1KA 2B4GA 3TA6A 3G18A 5C55A 1W3TA 3NVTA 1JCMP 3PBWA 1ICSA 5LGZA 3NZRA 3GDRA 2JBMA 1F2JA 4O50A 3HG3A 1FDJA 1F76A 1MZHA 4BI6A 5BW6A 2DZSA 4WX2A 4CLMA 1GG1A 2ZRXA 1VJIA 3EWYA 1H7RA 3M47A 2JKEA 2C16A 3DH7A 3LX9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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