4NRRA

Crystal structure of glycoside hydrolase family 5 mannosidase (e202a mutant) from rhizomucor miehei in complex with mannosyl-fructose
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
416
structure length
416
Chain Sequence
SEFAFVKIASDGKGFTRYGEPYLIRGANYWQGMNLGADDCSGGDRKRMELEIKQMAEMGINNLRVMASSEGPDDQPYRMRPSMMPQPGKYNEGVFVGLDYLLDTMDRYNMTAVMTLGNFWQWSGGFGQYVAWITGNQTIPYPVGDVTYDEFTQFAARFYNDSEIAPKANKLFKDHIYTVQNRRNTVNGKIYKEDPVIMSWQIANAPQEAPASWFEEISTFIKKGAPKHLVSAGLESKLDEYDFDRAHDHKNIDYTTCHCWVENWGIYDPADPDGLPHANEYMHDFLESRSKWAAQLNKPIVMEEFGMARDAWRNPEDETYKYLPSTPTSHKDEYYQKAFNQIVSLASNRSFSGSNFWAYGGEGRSTYPPNPYGMVWLGDPPHEPHGWYSVYSNDTTVQIIKDYNANLLKVQKELSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Exo-beta-1,4-mannosidase
publication title Structural insights into the substrate specificity and transglycosylation activity of a fungal glycoside hydrolase family 5 beta-mannosidase.
pubmed doi rcsb
source organism Rhizomucor miehei
total genus 166
structure length 416
sequence length 416
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.25: Beta-mannosidase.
pdb deposition date 2013-11-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4nrrA00
4CUCA 2VVNA 2D1ZA 4MAZA 3BSHA 3OLDA 1GQLA 1V0MA 4DM1A 3FAXA 3NSNA 4JKKA 6A3HA 1E40A 2YBTA 4QDMA 1BSIA 3M7SA 2WCSA 5BRQA 4ACZB 3WQ6A 1HKMA 3IAPA 1OIFA 4MADA 3T0AA 7CGTA 4J3SA 1JGIA 4ZE4A 4JFVA 1W9BM 3NYDA 4OUEA 2X1IA 3UEQA 1ECEA 1EHNA 1PZ2A 3CH9A 3MKKA 1CBGA 2WBKA 2W67A 2TAAA 4M8UA 3RM9A 3POCA 5DF0A 4P7OA 2FHBA 2BXYA 2VRQA 4H8VA 1BQCA 1R7OA 2OYKA 4UZSA 2PWHA 3JUGA 3O2LA 2J7CA 4NRSA 2XIIA 3K1DA 1MWOA 3VDBA 4HMEA 4QCEA 4B15A 2ZX7A 3SCOA 4P7RA 1TZ7A 3CTTA 4J27A 3RILA 3MV01 3RM4A 2E9BA 1UD2A 4WLCA 1HJVA 4NSBA 3THDA 2ZXAA 2VUYA 3QHNA 4V28A 4CD7A 2C8NA 3ZQ9A 1HVQA 1E3ZA 2X0HA 2XVGA 1UR8A 1UKOA 3VX0A 3T2OA 3MUAA 1HL8A 1V6YA 3F5LA 2YA1A 3AMDA 1I1XA 2GSJA 2O92A 4F9JA 6TAAA 8A3HA 4GQRA 4QLJA 2J47A 2DPEA 2YL5A 2V3DA 1GOKA 2X05A 3SCUA 5BXSA 3IJ9A 5JIPA 1UYQA 1JDDA 3VMPA 1ISVA 3SCRA 3VGHA 5CGMA 2J8GA 3UG5A 5DT7A 1JYWA 1QI2A 2DSZA 3AZRA 1WPCA 3CLWA 5JBDA 4S3JA 1FHDA 3ARRA 4JKMA 4JFUA 2EPKX 2XG9A 3NSXA 5EFDA 1HIZA 5D4YA 4J3VA 5M03A 5AYBA 3VMNA 1C3FA 5CPQA 4MNJA 2WANA 3VTRA 4W7VA 4XB3A 3IJ7A 2QMKA 3AIBA 3ARWA 2ZUVA 3WIJA 1U33A 1TVNA 3L4WA 5A6KA 1VBUA 5D9MA 4JCMA 3WDPP 4YHEA 2Z1SA 4UZUA 1AMYA 1WB0A 3VX1A 1E3XA 1QNRA 3WBAA 2WSKA 1PX3A 2D0HA 2XPKA 1NOUA 3B8SA 1BG4A 1E1EA 5GNYA 3N18A 2EPMX 3LPOA 3N04A 4AIUA 3ZSSA 3WD1A 2XSBA 3UR8A 3OLGA 1JF5A 3A4WA 2BY2A 3NUKA 1KCLA 5JIWA 1HKIA 4N42A 1DWIM 2JF7A 3OGRA 3WF0A 1TE1A 1QPKA 3A47A 1UR0A 4P8UA 4W7WA 5A94A 5CQ1A 4OOZA 2CYGA 1OWQA 5D9PA 4BQ2A 1V02E 3WSUA 3AXIA 3GBEA 1WZLA 2WMGA 1D7FA 4UQDA 3ARUA 3WUGA 1WDQA 3ARYA 1BPLB 4J3XA 2PC8A 2WW5A 1B0IA 3NSMA 5EBAA 2O9RA 3AHVA 3FNDA 2Q8XA 3ZT5A 5E9AA 4L4OA 3UR7A 5I6SA 2CKSA 1ZJAA 1R7AA 1D2KA 4PTVA 2V3GA 4HZ6A 2EPOA 3QHMA 1UKTA 2ZWZA 5KZ6A 1CXFA 2EJ1A 1EO5A 5TD4A 2YKKA 1WZKA 2D22A 1V0LA 1B3ZA 3FHAA 4DWSD 3B9DA 3AICA 1XCXA 1XD1A 4M80A 1F4AA 2FH8A 1UQZA 2GJPA 5DEZA 4MB4A 3GDBA 4D6JA 3WH9A 3OBAA 2VR5A 3MMWA 1W1PA 5I78A 3ZSTA 4Q7NA 3SUWA 2JEPA 3CO4A 3WNKA 3W26A 1IV8A 3VD5A 2XGBA 4S3KA 5KEZA 2CITA 1W1VA 1ISZA 4BZYA 1NARA 2ZXBA 1UH4A 2WC3A 2RGLA 4EK7A 3MUY1 4JIEA 4D1JA 3WF2A 1JZ6A 3G6MA 2E9LA 5CGTA 1UWRA 1M7XA 5A6AA 2J7BA 1FFQA 3ZR5A 7TAAA 2ZX6A 3AMGA 2AOSA 4Z2GA 1BG9A 4UNIA 3WQ5A 4BQ3A 2OWCA 5A8QA 3ARTA 1UZ4A 2WVUA 5A8MA 5A8OA 2EBNA 3W27A 4BQ4A 5BROA 4FLQA 2WKLA 4W85A 1X1NA 5I0DA 1C90A 3AXXA 1ZBCA 3AJ7A 3ZR6A 2ZUSA 4AZCA 1TR1A 1V3MA 3WMCA 1JFHA 1E6PA 2BVTA 4A4AA 2V38A 1D3CA 3QOKA 3AZSA 2WMIA 1G94A 2JIEA 1J10A 5IXEA 4P8VA 2VRJA 5A6BD 1B31A 4UFJA 2BY1A 4PTXA 1V0KA 1VEPA 3VD3A 2CETA 1J9YA 1NQ6A 1VAHA 2VURA 2QV4A 1CGTA 5BYWA 1Y7VA 3W38A 3W0KA 1J0YA 2EPNA 3S6TA 2J7FA 4P8XA 3B9AA 3AYSA 4TX8A 3WENA 4AZCB 4F79A 1R86A 1W9PA 1HT6A 5A6JA 1UWUA 4W5ZA 5DFAA 3AZTA 2WMIB 4HPGA 1K6AA 3KWXA 3KE0A 3THCA 1CXKA 1RP8A 3SCWA 4CCCA 5JBEA 1XRVA 1UG6A 4OZOA 2HISA 1HN1A 2JEQA 2BS9A 4M56A 1WZAA 3WF4A 2WBGA 8CGTA 1US2A 1MW2A 3GYCA 2O9OA 4TX6A 4IPLA 4PCSA 2J74A 2J77A 1UWTA 3DHUA 2ZICA 3SURA 1QHOA 1GONA 5FL0A 2OYMA 1GW1A 3VOCA 1OT2A 2XFRA 2BHZA 3HMCA 3N9KA 2E8YA 3WEZA 1CENA 1HVXA 3F5JA 2WHLA 4JAWA 1KGWA 1WE5A 1BGGA 2WXDM 3ARXA 1MW3A 3AYRA 5AC4A 2VI0A 1EO7A 4UFIA 4JZ5A 2DEPA 3CZEA 5ABHA 3IANA 1EDQA 3BMVA 4R5EA 4ML4A 2G3NA 3AIVA 1R85A 1CXIA 4KMQA 3GBDA 2XM1A 1MW1A 1H0GA 4MPKA 1UKSA 5I77A 1XYZA 1ZB5A 3W28A 4LYQA 3VNZA 3MO4A 1AQMA 4QCFA 1HF6A 2VRKA 3PZUA 1TG7A 4WJXA 1OT1A 2WHMA 4XX6A 5BCAA 1G1YA 1GPFA 2VCBA 3W37A 2XM2A 1SR0A 1SMDA 2ZX8A 4Z2LA 3WL0A 2VX6A 3AS0A 5IDIA 1QHPA 1VFUA 2YIHA 4W89A 3WD4A 1BLIA 2W61A 1B3XA 3BLPX 3TTOA 3WF1A 1CYGA 1JFXA 2GJRA 1ITXA 3SCQA 1E9LA 3CIVA 2D0GA 1NP0A 1W3LA 4LXFA 3GH4A 1BYAA 3T0DA 4AZIA 2YLAA 3GNOA 2F2HA 3ZOAA 1E73M 5FCZA 2CBJA 1JDAA 1OD8A 1KXVA 2E40A 4RE4A 1B2YA 1JYXA 3WH5A 5IHSA 2PWDA 4UQEA 3FW6A 3VDCA 3WY1A 4TVDA 5CG0A 4HOWA 1IT0A 5LA0A 1RPKA 1E55A 3CZJA 2YLLA 3AS2A 1KWKA 2CERA 2NW0A 3ALFA 3D3AA 2VQTA 3IJ8A 1EQCA 3VIPA 3AS1A 3TOPA 2CCRA 4AD4A 2CHNA 1MFVA 2YOCA 5GNXA 2OSWA 1I75A 1XH0A 1DEDA 3ZMRA 5I2UA 3VGGA 2GFTA 4H2CA 2D23A 1KR0A 1KBKA 3GXIA 1A3HA 3VIGA 3CHCA 3RO8A 2BY0A 4HA3A 1VENA 4UFMA 3F4VA 1CEOA 2NSXA 1XC6A 1JZ4A 1E4MM 1CXLA 4K68A 2CPUA 1DWJM 3S2CA 4UTFA 1CPUA 2DIJA 2Y2WA 1JDCA 1V0NA 1Q6DA 2WZHA 2DT1A 2WAGA 1EDGA 1BYDA 5I79A 4WSJA 4FLRA 3VIJA 1ESWA 1W3JA 3K8MA 3LMYA 4PTMA 3WDJA 2XIBA 4M24A 1AVAA 3WELA 3M07A 3VKKA 1QW8A 3W6LA 3VD4A 2VZUA 5BRPA 3VVGA 1JZ5A 1GOOA 1EHAA 3B9EA 1H0IA 3RMEA 3VIOA 1UD4A 2XWEA 1Q6GA 4HU0A 1SFSA 2ZE0A 3CZ8A 2WZIA 2E8ZA 2E9MA 3NIYA 4PMRA 1NM9A 1J0JA 3J7HA 4UOQA 1E56A 1W2PA 1ZS2A 3WQWA 1H09A 1G9HA 5C8BB 1JNDA 1C7SA 1HX0A 1V03A 1OINA 1YQ2A 1CECA 2WVTA 2PWGA 3L4VA 3HJEA 3M46A 2W63A 2YL9A 5CLWA 2ZIDA 2G3IA 3T2QA 2DDXA 5A95A 4D72A 4OBRA 4ATWA 1WDPA 3WD0A 4AZBA 4GZJA 1EOKA 1FOBA 1E4NA 3AISA 4QFUA 3U7BA 2WB5A 2VCCA 1XSKA 1RH9A 1GNXA 1ODUA 3MU7A 1KXQA 2XFYA 4W5UA 5DMYA 3VIFA 5A8PA 3DC0A 4EKJA 2EO7A 3T09A 2J8FA 3WEMA 3TTSA 1KFWA 4GQQA 3SCPA 3SCVA 3MMUA 4HMDA 3EMQA 2VQUA 3WDHA 2W4XA 1JYVA 4W8BA 1QI0A 3RIKA 1GZJA 1UD5A 4BF7A 5E09A 2BY3A 3VGFA 4F8XA 4XZBA 1Z32X 5FIPA 4C7GA 3W6MA 1U30A 2A3HA 4V2XA 1LL7A 4LX4A 1RD6A 4U5IA 2AMGA 4U3CA 3PN8A 2QPSA 1E6QM 4PMYA 3PZVA 1K9DA 1C7TA 2G3JA 1J0ZA 2O9PA 2VZVA 5E70A 4CD4A 1EOMA 3RM8A 3MANA 1C8QA 3WD3A 3ZM8A 4DUVA 3MUIA 1DWHM 3SCSA 4ZXLA 2ESCA 3WNLA 2ZUUA 3PZMA 1CGVA 1GHSA 1UA3A 1V02A 4AD3A 2X09A 4GIAA 4GO9A 1UD3A 3WUEA 1V3IA 1KXTA 2JF6A 1X6LA 3K8KA 4E8CA 2WNWA 4RE2A 2ZXDA 4W8LA 5IFTA 2PB1A 3N12A 1UA7A 4DUWA 3OLEA 4KGLA 3AOFA 4GZIA 2OWWA 3CPUA 1MYRA 3DYMA 3UG3A 1LWHA 4C7DA 2XYLA 3SUUA 4AISA 4AWEA 1W32A 3T2PA 2OYLA 4CGTA 3KEHA 3E1F1 4TVUA 3EYPA 3PZQA 4UQCA 1JD9A 2CXGA 3AMKA 2UY2A 1V6XA 2DSKA 4HOXA 3AHYA 3I3BA 2Y8VA 3MMDA 4P8WA 3HN3A 4Z2KA 2WK2A 5BXTA 3BAJA 1QI5A 2PI6A 2GJXA 3AS3A 1VRXA 1JZ2A 1JF6A 2XWDA 2YL8A 3VGDA 3O9NA 3VIIA 3GNRA 1XHGA 3FAWA 3ZO9A 1BVNP 1L8NA 1QBAA 4PMUA 3BC9A 1M03A 3BCDA 3WN6A 3MSDA 2WHJA 4W86A 3KL5A 2XVPA 4B9YA 2VZOA 3L4XA 3M6DA 3N17A 1AQ0A 3EDFA 3OIHA 2RGMA 4CN6A 4M81A 2CBIA 5CPTA 1GOWA 2EPLX 4D6IA 4IISA 2GJXB 1LJYA 1V3HA 3CMGA 3SCNA 4AD2A 1H1NA 4NF7A 2CHOA 1FH9A 1LWJA 5M5DA 4D6HA 3N11A 1QI3A 2VR4A 2ZX5A 4E8DA 2VMFA 4L4PA 2GVYA 3PZNA 2NT1A 3I3DA 3L4ZA 5AYIA 3DYOA 3OB8A 3AQUA 2HVMA 1HKKA 3ZT6A 3CZLA 3CHFA 4QLLA 1W3HA 2NT0A 3EDJA 3NJ3A 5FL1A 5I3DA 2G41A 3BAKA 1MW0A 3WQ8A 5E6YA 2IXVA 3DECA 4OIFA 1JI2A 2WMKA 2DT3A 3ARPA 3AMLA 1CXHA 4D6CA 4LYRA 2B31A 3PHAA 1HJWA 1V3JA 1HJXA 1B30A 1WAWA 2VO5A 1PIFA 3K8LA 2FHFA 1AQHA 2VNCA 3VD7A 3VUPA 4IPNB 2WKGA 1TMQA 1H41A 1OB0A 4UFHA 3WH8A 1UWQA 3LPFA 2WVSA 5HNNA 3A3HA 1ODZA 1GJUA 3A4AA 4JL1A 2WMHA 1CGXA 1QNPA 2XSAA 3ALGA 2J25A 4OOUA 1NP2A 5JUVA 3L4YA 1C92A 2WZEA 1BF2A 1NOWA 1NWUA 5I24A 5A6LA 4YHGA 5CJ5A 1S46A 1O7AA 5C70A 3CUGA 4JL2A 3WNNA 4QLKA 1VJZA 4H8HA 3VM7A 2PBGA 3EDDA 2WHKA 4HMCA 1QNQA 3DHPA 4MDPA 4Y7EA 3CHEA 5IFPA 3AIRA 1JXJA 3CMJA 4UR9A 3BMWA 4CKQA 1WCGA 2G3MA 2PWEA 4U5KA 2W66A 1CXEA 4BA0A 3TA9A 3SIMA 3VM5A 2WMJA 4KRTA 4PSPA 1UR1A 1VFMA 3OLIA 1XCWA 2YA2A 1E70M 4F66A 3A4XA 1UKQA 1W9UA 1WDRA 3PZGA 4HOZA 2WLYA 1Q6FA 4WIWA 1TFVA 4U33A 2DT2A 2A3AA 1VB9A 4C7FA 3PZTA 4AMCA 4CD6A 1CGWA 3AI0A 1UR9A 3T08A 5BXRA 4OKDA 1PEZA 1LL4A 5HXMA 1TA3A 2CIPA 2DH3A 2QMJA 3EMCA 3OGVA 4MNLA 2J7EA 1KR1A 1QHZA 1KBBA 3K46A 2V3EA 1UD8A 2OSXA 5FD0A 4GI6A 4PCTA 4UQAA 1YHTA 1BVZA 3MV11 1GQIA 4JKLA 3AROA 4M82A 1MVYA 4AD5A 3TTQA 4UFLA 2VZSA 4Z2IA 3OZPA 1HXJA 2D3LA 2F8QA 3RPMA 4U31A 4U2YA 1TA3B 4HP5A 2ZXQA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4CUC A;  2VVN A;  2D1Z A;  4MAZ A;  3BSH A;  3OLD A;  1GQL A;  1V0M A;  4DM1 A;  3FAX A;  3NSN A;  4JKK A;  6A3H A;  1E40 A;  2YBT A;  4QDM A;  1BSI A;  3M7S A;  2WCS A;  5BRQ A;  4ACZ B;  3WQ6 A;  1HKM A;  3IAP A;  1OIF A;  4MAD A;  3T0A A;  7CGT A;  4J3S A;  1JGI A;  4ZE4 A;  4JFV A;  1W9B M;  3NYD A;  4OUE A;  2X1I A;  3UEQ A;  1ECE A;  1EHN A;  1PZ2 A;  3CH9 A;  3MKK A;  1CBG A;  2WBK A;  2W67 A;  2TAA A;  4M8U A;  3RM9 A;  3POC A;  5DF0 A;  4P7O A;  2FHB A;  2BXY A;  2VRQ A;  4H8V A;  1BQC A;  1R7O A;  2OYK A;  4UZS A;  2PWH A;  3JUG A;  3O2L A;  2J7C A;  4NRS A;  2XII A;  3K1D A;  1MWO A;  3VDB A;  4HME A;  4QCE A;  4B15 A;  2ZX7 A;  3SCO A;  4P7R A;  1TZ7 A;  3CTT A;  4J27 A;  3RIL A;  3MV0 1;  3RM4 A;  2E9B A;  1UD2 A;  4WLC A;  1HJV A;  4NSB A;  3THD A;  2ZXA A;  2VUY A;  3QHN A;  4V28 A;  4CD7 A;  2C8N A;  3ZQ9 A;  1HVQ A;  1E3Z A;  2X0H A;  2XVG A;  1UR8 A;  1UKO A;  3VX0 A;  3T2O A;  3MUA A;  1HL8 A;  1V6Y A;  3F5L A;  2YA1 A;  3AMD A;  1I1X A;  2GSJ A;  2O92 A;  4F9J A;  6TAA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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